4AVBA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 in complex with acetyl coa and camp
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
GARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSARVPSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 90
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avbA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avbA02
2Q0YA 2D40A 2R8VA 3G8WA 3O14A 4LTAA 2D4PA 2OZUA 4EV0A 1IB1E 5BUVA 2EA7A 1XRUA 2BEIA 2Q04A 3K9UA 4IEYA 2ZCWA 3NVCA 2Q30A 3NW4A 2OU2A 3E97A 4PIZA 1Y9WA 4HVOA 3FHIB 4PJYA 2P6FA 4NXYA 1BO4A 5KTAA 3OGJA 4AG7A 2P17A 2PRBA 4FD4A 4B29A 5FCCA 2NMTA 3BLNA 5BPXA 3USSA 2JDCA 2ZW7A 2P0WA 4CRZB 2CNTA 2OA2A 4UXAA 2D4OA 1RO5A 2GIVA 4QUSA 4LX9A 3TO7A 2PQQA 2OZGA 4ZU5A 2H5MA 3ZJ0A 1ZRDA 2BSWA 4H6UA 5E96A 3TOBA 2B9UA 4LULA 3W6SA 4JXQA 4YFJA 4MX3A 1ZZ7A 2QNKA 2G0BA 3RDIA 4H7LA 3EBRA 4JLYA 4Q29A 2FIAA 4KOUA 1XF8A 1YFYA 1KUYA 5KHHA 4R3LA 4KVXA 1QY4A 4H89A 2ZW4A 4FD5A 4CAVA 1QSTA 1O5UA 1NE4A 3BCWA 2K0GA 1JUHA 3FNCA 4DNCA 1ZX5A 2H6CA 4Z07A 2CNSA 4M3SA 2IXLA 1YFUA 4IETA 2PR8A 1U6MA 3ETQA 1DGWA 4IEZA 4O9EA 5LEKA 4RD7A 3DL3A 2B5GA 3E5UA 2PYTA 4EROA 2DXQA 5IB0A 1O3SA 2XGXA 3HT2A 3OWCA 3EJKA 4OAEA 4EWAA 4MHDA 1M4GA 1Y7RA 4MZUA 2O1QA 4XETA 5AVPA 3I54A 4KOXA 3R9GA 5KTDA 1U12A 4AQ2A 5FQ0A 1OD5A 1J4JA 1FI2A 5KBFA 1ZRCA 3F0AA 2GC3A 4KL1A 4N9HA 4XF3A 1X7NA 2CAUA 3SMHA 1S7LA 1WWZA 1CAXB 2VBQA 3CXSA 2C27A 4R3KA 4XF9A 4HVRA 3GBFA 4I2OA 3L2HA 1ZZCA 2VZZA 3D3SA 2ZW5A 4HSJA 1UIKA 3TOAA 2P6GA 4Y49B 5I8TA 5DWMA 2AJ6A 2REEA 5JSPA 3C26A 4QB9A 1QWRA 1ZZ9A 2KXLA 4XFBA 1X8EA 3H3UA 5K8SA 4NSQA 4UWJA 1NSLA 5EZWA 4XF4A 3EFAA 3PGPA 2Z2SB 2V09A 4R52A 3RNSA 4XPDC 2J8RA 1DGRA 1I5ZA 4I02A 4XFIA 4WZCA 2F4PA 3UY5A 4QMAA 4K8FA 1QSMA 3PZJA 1PUAA 2HKXA 3CF6E 4I01A 3BJ7A 1YUDA 1XE7A 2Q4YA 2FMYA 3HQXA 1Y9KA 2O28A 4EVYA 1MJBA 5BXXA 1ZNPA 2GC1A 3GKRA 1S5KA 2PDOA 5FLJA 4U9ZA 4PSWA 4IEXA 2QJVA 1P4NA 2ZXVA 2WC2A 2OYZA 4RI1A 3WR7A 5I0SA 4RS2A 2FT0A 2RC4A 3CLPA 2XKPA 2UY8A 2B4DA 3GY9A 4DINB 5F1RA 3LWCA 4KVOE 3LA3A 4E2QA 4B5OA 4E8OA 2IXJA 4OFGA 4QGNA 5JPHA 1PU9A 1OMIA 4Y49C 1J58A 1WGPA 4KWJA 5CVRA 1YR0A 1YREA 3FRMA 3JVNA 1XE4A 4L8AA 2BGCA 2GU9A 3FJSA 3MPBA 3SCHA 4YGOA 4KOVA 1KZFA 2OZ6A 5I8YA 1H1IA 4HMZA 5IV0A 2JLMA 3H7JA 3R95A 5FPZA 5LEJA 1ON0A 4PK3A 3TCVA 1DZTA 2FQPA 3TFYA 1UW8A 2I79A 4FT8A 3ZDSA 2Z11A 4XF0A 1VJ2A 2Q4VA 1TQ5A 3ES4A 3IIAA 3RYKA 2B4BA 4FBFA 1QSOA 2QMLA 3DN7A 4YNIA 2EVXA 5I0TA 3G7DA 1Z4EA 4HSLA 1I21A 2JDDA 3CXPA 4JD6A 1VP6A 4D7TA 2PAEA 1PM7A 4E2SA 2E9QA 3CJXA 4JV4A 1M44A 3R96A 1ZRFA 5J8CA 3BALA 1X82A 4I3PA 1ZREA 1DZRA 4QC6A 1I12A 1O3TA 3H8UA 1J3RA 1O3QA 4YARA 1CAWB 4D7SA 4MH0E 2BL1A 3FZ3A 2B8MA 3I3GA 3LODA 3EO6A 3ACLA 3IBMA 2BNNA 3QOPA 2FXFA 4LLOA 3FX3A 4HN0A 4KWLA 4FD6A 3BU7A 4AVAA 4UBRA 4XPDB 2Z10A 2QVSB 2Z69A 1S7KA 2Q4SA 3H1MA 5I91A 5KHKA 1QXJA 1ZZ6A 1YGHA 4J3GA 2ZPAA 3CEWA 3VWDA 3S6HA 1UFHA 4GULA 3D0JA 5J8FA 4L11A 3KGZA 2PQ8A 1WA4A 5DWNA 4J1XA 2REFA 3S7EA 4KLWA 3TNPB 4I0BA 4FAGA 2WPXA 3ST7A 4KVME 3QAHA 2ETEA 1YFXA 3LA2A 3PLQA 4LUMA 2VQAA 3H9AA 4XFHA 4YRDA 5JR7B 5FDBA 3S6FA 4ORFA 4XFCA 1KUVA 4UWIA 4EWDA 3B8GA 4LUKA 4YRHA 5HI0A 4YYOA 1TIQA 4ONUA 4META 3HT1A 1CJWA 4Q0QA 1K4JA 4BH9A 4QVTA 4XF1A 4OADA 2FSRA 1EP0A 4QGMA 3WW4A 1SQHA 2HQYA 2PAMA 3RZZA 3QB8A 3ROUA 5EBVA 5HMNA 4CAWA 1Y9QA 3OD0A 1LRZA 5LRSA 4KUBA 2PAKA 1IPJA 3TO6A 5C82A 1QXRA 3E6CC 2A4NA 2ATRA 2B58A 2X7BA 4Q0SA 3R1KA 4KOWA 1S60A 1UIJA 2PHLA 3KGLA 5F49A 1IIDA 4HKFA 3TTHA 3ELNA 4MGIE 4UBGA 3FWEA 2Q44A 2Q1ZB 2CNMA 1Q3EA 1CAUA 1XE8A 3H3ZA 4Q0VA 3H1YA 3TNQA 4JTOA 5JSRA 3S0MA 3G3SA 3U0ZA 5KHIA 3D2PA 3D0SA 3VHRA 2EVNA 2CGPA 4PK2A 1Z4RA 1GHEA 3RPQA 4F7ZA 1UD1A 2Q0AA 3MDPA 2JEVA 3DNSA 1L0CA 1MJAA 1SFNA 4Q0UA 2PHDA 2R98A 1H1MA 1CAXA 4MUVA 4AG9A 2P6EA 4HLTA 5FQ0B 1YWKA 1GQHA 4X6QB 3C3VA 2H6BA 2IXCA 4AXOA 4XPLA 4WBBA 3E5QA 5D1IA 1RL3A 4B5PA 1YK3A 2BNOA 3E0KA 4IERA 3TT2A 5J3UA 2B5HA 3PVBB 2BNMA 4AQ6A 5T3NA 1R57A 1MJ9A 1EY2A 4NVPA 3DKWA 5IX3A 3E6BA 5F47A 3U10A 5I93A 4QXKA 2B3UA 3FIXA 4MBUA 1B6BA 2HV2A 1QSRA 4R9MA 2GH2A 1CGPA 1CAVA 4UA3A 5E1RA 5KTCA 3GYDA 2CV6A 3I9SA 3MYXA 4KWKA 1PMIA 3IDBB 4UBHA 1V0CA 5EC4A 4XFFA 4F0YA 3UKNA 3CL1A 4KZTA 4CRYB 1ZVFA 4LUAA 4IEPA 5BY5A 2EAAA 1IPKA 4IEOA 3DSBA 2Q7BA 3LA7A 2QECA 2XLAA 2ARHA 1GQGA 1OFNA 5BV6A 3BB6A 3GYAA 1G6NA 2FL4A 3S7IA 4PV6A 3I59B 4R8HA 3D8PA 1V70A 2MNGA 3E5XA 3WW2A 3DDDA 3JUWA 2XHKA 4IESA 1WLTA 1YX0A 4E2GA 1YVOA 2CAVA 3P2HA 2ET7A 4MGYE 1O3RA 2ZKLA 1UPIA 2UYAA 5F46A 3D2MA 3V8IA 4E2AA 2IXHA 4HNWB 4M85A 3MGDA 3B02A 2PSWA 4XEZA 3WW3A 1N71A 3FBUA 3RYPA 4MY3A 4L89A 1EPZA 2GE3A 4HVQA 3NJZA 4KOSA 1HW5A 1CM0A 4F8AA 4JJXA 4NCZA 3FXTA 2FS5A 3QACA 3NSTA 3SHRA 1LKNA 2IC1A 2C0ZA 4QBJA 1S7FA 3D82A 1RUOA 1J3PA 3BPZA 5J7MA 4FD7A 4HZFA 2IXIA 4KU7A 4QM9A 4IUSA 2ET1A 2QCSB 3JZVA 4F6AA 4GS4A 4LA3A 2J8NA 2OH1A 1Q43A 4OLLA 2ATFA 1CAWA 5JSOA 2VZYA 4U9YA 1SEFA 1IYLA 4EWEA 3W91A 5I0CA 2I00A 2IL4A 3CXQA 2XL7A 3LD2A 3CO2A 3IGRA 4MGKE 4QM8A 4AVBA 4MGZE 3IWGA 3OF1A 2N7GA 3OTFA 2G3TA 2DCTA 4X6RB 2MHFA 2PC1A 3EY5A 4ZU4A 3H1WA 5CNPA 1L3JA 3R9FA 4QGLA 4O9GA 2F5IA 3RYRA 1RGSA 3EHKA 1I6XA 2GC2A 5FPXA 3M3IA 1Q2DA 4JWPA 5C6CA 5H86A 3T90A 2H0VA 5FLIA 2QIRA 2FE7A 2D5HA 1RC6A 2OB0A 5JQ4A 2QDRA 3MZHA 4HNXB 4MV2A 2UYBA 2D5FA 1O4TA 4QX5A 4R87A 2R1IA 4ZBGA 4KOYA 1OI6A 1J59A 5CADA 2VXKA 2HUZA 4IEVA 2GZWA 4CAXA 2Z0ZA 1P0HA 3NE7A 1LB2A 5C88A 3TE4A 4J1WA 3F5BA 3RYOA 1J1LA 3OCPA 5EFUA 4CYDA 1YHFA 2XL9A 4IEUA 2OZHA 3VWEA 4XFAA 4XFGA 5LRRA 2BUEA 4NEXA 4U5YA 4ZU7A 1NMTA 1KUXA 2R7HA 3EQEA 3KSCA 2BYVE 2HJIA 3FFQA 5FLHA 2B5GB 2GAUA 4KORA 5KHJA 3LZZA 1O5LA 4IEQA 4P9GA 5I0RA 3H7YA 4AVCA 2VECA 3ES1A 1M4IA 4HN1A 3F8KA 1OZPA 3DR8A 5I8SA 5F48A 2BEOA 3PP9A 3DV8A 4XNHB 3U11A 1CAUB 4N9IA 3FYNA 5C8WA 1LRHA 4MY0A 5KHGA 4KU8A 2OZJA 2D93A 3UKTA 1I1DA 4LEJA 2PFWA 1RTVA 5CU1A 5JAXA 3SXOA 4KUAA 5ISVA 1X8MA 3FB3A 1QSNA 4K30A 4A2UA 3SXWA 3EC4A 1VR3A 3SHPA 3H50A 3IDCB 4BYYA 1IICA 4IF5A 5FVJA 4B5PB 1YFWA 1NE6A 3H4QA 1WK4A 1NE9A 1IYKA 4NF1A 3UKVA 1RXTA 1YLEA 3TO9A 2UY9A 5JCTA 2GANA 3S6GA 4PIYA 5GCNA 3N7ZA 1J3QA 2CY2A 4XPKA 3IWZA 2PA7A 3N4MA 2J8MA 3KKWA 1CAVB 4LA2A 4Q0PA 3PNAA 4BIFA 2VI7A 4I49A 4MI4A 3R9EA 3E6DA 2O8QA 3SCFA 5J48A 2VEZA 5E16A 2Y0MA 4XNHC 4CS0B 4E0AA 3HIFA 4PIXA 1O7FA 2XLFA 1S7NA 4JVAA 4H6ZA 4HNYB 4Z82A 4I09A 4MJ8A 1S3ZA 5H84A 3NKTA 1NZCA 1Y3TA 2B4DB 3EXNA 2EUIA 2ZW6A 1FY7A 2G3AA 3LAGA 1SQ4A 1EYBA 3I59A 1VKCA 3NL1A 1FXZA 1ZRRA 1BOBA 1NYWA 4II9A 2VPVA 2XLGA 4BHPA 4I0AA 1RUNA 4X5KA 3M70A 4KLVA 1Q5OA 1YLLA 2IXKA 2GC0A 3FE5A 1NXMA 4YSFA 1ZZBA 2KCWA 3W6XA 2WPWA 3LOIA 3I7DA 2PR1A 1LR5A 3EO4A 4TLFA 3KCCA 5I0UA 2XKOA 2AE6A 2VQYA 4BMHA 2B3VA 2FCKA 1UCXA 4JXRA 2PTMA 1MK4A 3R6SA 1FT9A 1M1DA 3ZZIA 1VHSA 4WVZA 2OPKA 1M4DA 1XMTA 5HH1A 1YVKA 3DR6A 4R57A 3SXNA 1ZZ8A 1CX4A 1XIXA 3S6KA 2WFPA 1XEBA 3WW1A 3T9YA 4HBNA 4L2NA 4PSXA 2K9ZA 4IEWA 3P2FA 3KMHA 3BJ8A 2Y0OA 1Z9UA 3SCGA 1Q2YA 2I45A 4KOTA 2FIWA 2MPFA 4AB7A 4FAHA 1B87A 1Q2CA 2K5TA 4JTNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JPNB 3VBRA 2GLJA 4NXYA 4FD4A 5BPXA 3POFA 4QUSA 2PQQA 3MW4A 5CG9A 4ZU5A 3SEPA 5EV7A 4QQLA 4MX3A 1OLMA 4H14A 3MEPA 2ZW4A 1QSTA 3BCWA 3PB8X 3ZSLA 2PR8A 2HWF2 1OOPA 1QJU1 3WDXA 2F7VA 4RN5A 5FP3A 3NE8A 5HPOA 4GH4A 3C2UA 3F0AA 5KBFA 1F5FA 2YMZA 1C5IA 2WS91 4RGAA 5IVVA 3DEMA 3GBFA 2C5DA 2VZZA 4GB33 4KS9A 4AF9A 4YW3A 1IPSA 4HKOA 1UOJA 3RNSA 3P6BA 1NLQA 3RZGA 3PZJA 3U78A 4QXHA 2HKXA 3CF6E 5C4WB 2V77A 3WY6A 5F09A 3ECQA 2PJ7A 4FOYA 2VE1A 2OYZA 1US3A 4URAA 2SBAA 3GY9A 1X50A 3K2OA 4KVOE 5IVFA 3HQUA 4B14A 3KR5A 5ISLA 1W8TA 3AP6A 2V5DA 1NA1B 1W2TA 3LCPA 2JLMA 3MO4A 3NJYA 3N7MA 2FQPA 4OC1A 2JG8C 4NRPA 3B3QE 2YDEA 3AB0A 1GWMA 4DY5A 1Z4EA 3ZPOA 4LBQB 1J3RA 4CDWB 5FREA 3V0BA 4YZ1A 4MH0E 4Y22B 4DS0A 3LPGA 4LLOA 4CXWA 3ZXKA 1PYTB 2JG9A 3K48A 3UJQA 1QXJA 1XNKA 1JXNA 2D3SA 4YM2A 2Y6FA 2E7TA 3KF5A 1YLOA 4MHZA 1V6NA 3ZX7A 1KUVA 4LO8A 4M0HA 2JWPA 4XF1A 4OADA 1A34A 3SLIA 1HJGA 2HQYA 2PAMA 3RZZA 5FZ8A 4JKMA 1LRZA 2Q43A 2FVGA 1UAIA 3E6CC 4KOWA 2PHWA 3IAQA 5FTTC 3GJBA 3WF2A 2R32A 5IVEA 1YIPA 1TNRA 2WT1A 2BDRA 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1CN1A
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2Q0Y A;  2D40 A;  2R8V A;  3G8W A;  3O14 A;  4LTA A;  2D4P A;  2OZU A;  4EV0 A;  1IB1 E;  5BUV A;  2EA7 A;  1XRU A;  2BEI A;  2Q04 A;  3K9U A;  4IEY A;  2ZCW A;  3NVC A;  2Q30 A;  3NW4 A;  2OU2 A;  3E97 A;  4PIZ A;  1Y9W A;  4HVO A;  3FHI B;  4PJY A;  2P6F A;  4NXY A;  1BO4 A;  5KTA A;  3OGJ A;  4AG7 A;  2P17 A;  2PRB A;  4FD4 A;  4B29 A;  5FCC A;  2NMT A;  3BLN A;  5BPX A;  3USS A;  2JDC A;  2ZW7 A;  2P0W A;  4CRZ B;  2CNT A;  2OA2 A;  4UXA A;  2D4O A;  1RO5 A;  2GIV A;  4QUS A;  4LX9 A;  3TO7 A;  2PQQ A;  2OZG A;  4ZU5 A;  2H5M A;  3ZJ0 A;  1ZRD A;  2BSW A;  4H6U A;  5E96 A;  3TOB A;  2B9U A;  4LUL A;  3W6S A;  4JXQ A;  4YFJ A;  4MX3 A;  1ZZ7 A;  2QNK A;  2G0B A;  3RDI A;  4H7L A;  3EBR A;  4JLY A;  4Q29 A;  2FIA A;  4KOU A;  1XF8 A;  1YFY A;  1KUY A;  5KHH A;  4R3L A;  4KVX A;  1QY4 A;  4H89 A;  2ZW4 A;  4FD5 A;  4CAV A;  1QST A;  1O5U A;  1NE4 A;  3BCW A;  2K0G A;  1JUH A;  3FNC A;  4DNC A;  1ZX5 A;  2H6C A;  4Z07 A;  2CNS A;  4M3S A;  2IXL A;  1YFU A;  4IET A;  2PR8 A;  1U6M A;  3ETQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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