The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
46
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sequence length |
158
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structure length |
158
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Chain Sequence |
DFTLRNARMDDIDQIIKINRLTLPENYPYYFFVEHLKEYGLAFFVAIVDNSVVGYIMPRIEWGFSNIKQLPSLVRKGHVVSIAVLEEYRRKGIATTLLEASMKSMKNDYNAEEIYLEVRVSNYPAIALYEKLNFKKVKVLKGYYADGEDAYLMARPLH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Multiple Conformations of the Loop Region Confers Heat-Resistance on SsArd1, a Thermophilic NatA.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Uncharacterized N-acetyltransferase SSO0209
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| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Sulfolobus solfataricus strain p2
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| total genus |
46
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| structure length |
158
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| sequence length |
158
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
2.3.1.255: N-terminal amino-acid N(alpha)-acetyltransferase NatA. |
| pdb deposition date | 2015-06-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00583 | Acetyltransf_1 | Acetyltransferase (GNAT) family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Aminopeptidase | Aminopeptidase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4K30 A; 1Y9W A; 4KOY A; 2I79 A; 1BO4 A; 3K9U A; 4JLY A; 4KOS A; 4UBR A; 2Z10 A; 1IIC A; 1YK3 A; 1UFH A; 1S5K A; 1VHS A; 4MJ8 A; 1S60 A; 3GY9 A; 2B5G A; 4HNY B; 4IUS A; 3E0K A; 2ARH A; 2QEC A; 1QSO A; 4QB9 A; 1YR0 A; 3EFA A; 2FXF A; 4HNW B; 4R3L A; 4CRY B; 4ZBG A; 5H84 A; 3CXP A; 4JXR A; 1Z4E A; 4J3G A; 1IID A; 2R8V A; 2D4P A; 4UWJ A; 4KVO E; 3T90 A; 3VWE A; 1TIQ A; 1XMT A; 3G8W A; 2BEI A; 3CXQ A; 4NSQ A; 1Z4R A; 2BL1 A; 4XPK A; 4E0A A; 4YFJ A; 1XF8 A; 4XPL A; 4OAE A; 4KVX A; 4PSW A; 2HQY A; 3V8I A; 3LD2 A; 1V0C A; 3FBU A; 3R1K A; 5EBV A; 3UY5 A; 2B58 A; 4U5Y A; 4R3K A; 4QBJ A; 4B5O A; 5IX3 A; 2ZXV A; 1MK4 A; 4AB7 A; 1YVK A; 3B8G A; 4UA3 A; 5C82 A; 2VI7 A; 2FSR A; 5IV0 A; 4AVC A; 4XNH C; 5JQ4 A; 1S7L A; 2VBQ A; 4B5P A; 1S7K A; 2VXK A; 5KTA A; 4AG9 A; 2I00 A; 3T9Y A; 3F8K A; 4B5P B; 2OZH A; 1P0H A; 3R9F A; 4XPD C; 5F48 A; 2F5I A; 2CNT A; 2G3T A; 1B6B A; 1FY7 A; 4QC6 A; 1WK4 A; 4YRH A; 2P6E A; 3JUW A; 4Y49 B; 5CNP A; 1B87 A; 5J8C A; 4U9Z A; 2JDD A; 4KUA A; 1OZP A; 2VQY A; 3R96 A; 2G0B A; 4KOW A; 3S6H A; 2EUI A; 2WPW A; 2OH1 A; 3TTH A; 1QSN A; 2R1I A; 4FD5 A; 2AJ6 A; 1ON0 A; 1NSL A; 1SQH A; 3SXN A; 4CAX A; 1NE9 A; 2R7H A; 4AVB A; 2R98 A; 3W6X A; 3H4Q A; 4NF1 A; 4JJX A; 4KOV A; 3R9G A; 2FIW A; 3DSB A; 2H5M A; 4R9M A; 1RO5 A; 3LOD A; 3W91 A; 4GS4 A; 3FB3 A; 2WPX A; 3GYA A; 5KTC A; 3P2F A; 2BUE A; 3PGP A; 5JPH A; 2GIV A; 4KOX A; 4BMH A; 4MI4 A; 2P6F A; 3MGD A; 4FD6 A; 5F47 A; 3FRM A; 2ZW7 A; 5H86 A; 5C88 A; 1M1D A; 2PDO A; 5HH1 A; 2B3U A; 3BJ8 A; 1NMT A; 2ZW5 A; 1LRZ A; 3FXT A; 5E96 A; 2Q7B A; 1Y9K A; 2D4O A; 2Y0M A; 2Z11 A; 4CAV A; 2ATR A; 1MJB A; 4H6U A; 3TT2 A; 3W6S A; 2B3V A; 4QUS A; 5F49 A; 4NEX A; 3EC4 A; 1S3Z A; 3FIX A; 1YVO A; 2PR8 A; 2PSW A; 4KVM E; 4PV6 A; 3BLN A; 1K4J A; 4RS2 A; 2FIA A; 3DNS A; 3NE7 A; 4EVY A; 4I49 A; 2QIR A; 4CS0 B; 2FS5 A; 4PK2 A; 2C27 A; 3BJ7 A; 5DWM A; 4E2A A; 2P6G A; 3DDD A; 2J8M A; 2REF A; 2Q4Y A; 4OAD A; 4AG7 A; 4MY0 A; 1QSR A; 2O28 A; 4KUB A; 4DNC A; 3SXO A; 3I3G A; 1S7N A; 1I12 A; 4L8A A; 2CY2 A; 2PR1 A; 4IF5 A; 3D2M A; 3D3S A; 5HMN A; 1M44 A; 2QML A; 3WR7 A; 1YGH A; 4LX9 A; 5IB0 A; 3I9S A; 2VEZ A; 3TFY A; 1M4I A; 3OWC A; 1QSM A; 5GCN A; 2PRB A; 4KLV A; 4U9Y A; 4KZT A; 2GE3 A; 1M4G A; 2OU2 A; 3EY5 A; 3S6F A; 1RXT A; 1KUX A; 3N7Z A; 2RC4 A; 4FD7 A; 2HV2 A; 4ONU A; 4F0Y A; 2JDC A; 1XEB A; 3ZJ0 A; 3KKW A; 4MBU A; 4H6Z A; 4XNH B; 2REE A; 1M4D A; 3PZJ A; 2FCK A; 5ISV A; 2EVN A; 2B4D B; 3VWD A; 2CNM A; 3C26 A; 4KOU A; 1J4J A; 2DXQ A; 3TO7 A; 4JXQ A; 3CXS A; 1MJ9 A; 3EO4 A; 2P0W A; 2PQ8 A; 2AE6 A; 5FVJ A; 3FNC A; 4L89 A; 4CAW A; 1PU9 A; 1I21 A; 2BSW A; 2ZW4 A; 2JEV A; 3P2H A; 3TOB A; 1IB1 E; 4CRZ B; 4XPD B; 1IYL A; 3DR6 A; 4NXY A; 3D2P A; 3QB8 A; 4LUA A; 1IYK A; 1I1D A; 4OLL A; 1WWZ A; 1BOB A; 4PK3 A; 1Y7R A; 3D8P A; 4AVA A; 4KOR A; 2X7B A; 3F5B A; 2FT0 A; 2B5G B; 1R57 A; 1VKC A; 2VZZ A; 4M3S A; 5DWN A; 1YRE A; 2A4N A; 2Q4V A; 2G3A A; 5KTD A; 2J8R A; 2JLM A; 4YGO A; 4JD6 A; 3EXN A; 1MJA A; 4HKF A; 2K5T A; 4NCZ A; 1L0C A; 2CNS A; 2Z0Z A; 1YX0 A; 4MY3 A; 4ORF A; 3FYN A; 4Y49 C; 1KUY A; 1YLE A; 4KLW A; 1Q2C A; 2FL4 A; 3TO9 A; 2Q44 A; 3TE4 A; 1QST A; 4QVT A; 4R57 A; 3DR8 A; 3PP9 A; 4M85 A; 2B4B A; 3IGR A; 2OZG A; 4RI1 A; 4X5K A; 1Q2Y A; 1XIX A; 2OB0 A; 3GKR A; 1N71 A; 2PC1 A; 3SHP A; 4PSX A; 5J8F A; 5F46 A; 1S7F A; 1Z9U A; 2J8N A; 1CM0 A; 1P4N A; 5EC4 A; 3R9E A; 4JWP A; 3TO6 A; 2NMT A; 2KCW A; 3F0A A; 3R95 A; 1Q2D A; 2GAN A; 3S6K A; 2ZPA A; 3G3S A; 2IL4 A; 4II9 A; 1KUV A; 2VZY A; 4MHD A; 3S6G A; 2B4D A; 2FE7 A; 2OZU A; 4R87 A; 1KZF A; 3RYO A; 3TCV A; 1GHE A; 1U6M A; 4FD4 A; 3ZZI A; 4E8O A; 2HUZ A; 4KOT A; 1CJW A; 2Q0Y A; 3QAH A; 2Q04 A; 2ZW6 A; 1PUA A; 3JVN A; 4H89 A; 4HNX B; 1XE4 A; 4F6A A; 3TOA A; 5I0C A; 4UWI A; 3IWG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1BPM A; 4C68 A; 4K30 A; 1Y9W A; 4KOY A; 2I79 A; 1BO4 A; 5AGE A; 3K9U A; 4JLY A; 4KOS A; 4UBR A; 5F09 A; 2Z10 A; 4OC5 A; 4EFD A; 4NGM A; 1IIC A; 3FMC A; 1DE4 C; 1UFH A; 1YK3 A; 1S5K A; 1VHS A; 5CPA A; 1ARL A; 4OKO A; 3IC1 A; 4PPZ A; 5LYI A; 3A9L A; 4MJ8 A; 2DF5 A; 1S60 A; 3GY9 A; 5HXD A; 2B5G A; 4HNY B; 4IUS A; 1Y7E A; 1BAV A; 3E0K A; 5AG6 A; 2ARH A; 2QEC A; 4M6G A; 1QSO A; 4MCP A; 1XRY A; 4QB9 A; 3CDX A; 1YR0 A; 3EFA A; 1OBR A; 2FXF A; 4HNW B; 4R3L A; 4ZI6 A; 1YQE A; 4Q36 A; 2IMO A; 4CRY B; 4CYQ A; 1Z8W A; 4PXC A; 2EK9 A; 3H5Z A; 4ZBG A; 3KZW A; 4BBH A; 5H84 A; 3CXP A; 4JXR A; 1Z4E A; 2JBJ A; 3LAC A; 4J3G A; 1IID A; 1LCP A; 2R8V A; 2D4P A; 4UWJ A; 3V7Z A; 4KVO E; 3T90 A; 3VWE A; 1TIQ A; 2AFM A; 1YME A; 1XMT A; 3G8W A; 2BEI A; 2GU2 A; 3CXQ A; 4MMO A; 4NSQ A; 1Z4R A; 2BL1 A; 4XPK A; 2PJ6 A; 4UF4 A; 4MRI A; 2I3C A; 4FWU A; 4R76 A; 4E0A A; 4JZ0 A; 4YFJ A; 1XF8 A; 4XPL A; 3PBE A; 3D7D A; 2QJ8 A; 4OAE A; 3LWU A; 1HEE A; 1HDU A; 1ZG9 A; 4KVX A; 3IFE A; 2RB7 A; 3QAY A; 4PSW A; 2HQY A; 3V8I A; 4CGM A; 3LD2 A; 3WC6 A; 1V0C A; 4UIB A; 4DYO A; 4C7H A; 3FBU A; 4CYO A; 4NGS A; 2HB6 A; 4FAI A; 3R1K A; 2EK8 A; 2V77 A; 5EBV A; 3UY5 A; 5JGF A; 2B58 A; 4U5Y A; 2YNC C; 2AFU A; 2XEI A; 2PJ0 A; 4R3K A; 2OR4 A; 4QBJ A; 2Q4Z A; 4B5O A; 5IX3 A; 1LAP A; 1R43 A; 1KWM A; 2ZXV A; 5JM6 A; 1MK4 A; 4AB7 A; 2ZEO A; 2Z3P A; 3FEC A; 2Q51 A; 1YVK A; 2CTC A; 2C1C A; 5THW A; 3B8G A; 4UA3 A; 3BI0 A; 2VI7 A; 2FSR A; 4A95 A; 5C82 A; 5IV0 A; 1Y0R A; 4XNH C; 4AVC A; 1IGB A; 1F2P A; 4NGP A; 2PJC A; 1X10 A; 1F2O A; 5JQ4 A; 1S7L A; 3S9L A; 1YSJ A; 4A30 A; 3KI9 A; 4PXD A; 4P6Y A; 2AFS A; 2VBQ A; 4B5P A; 3DGV A; 4X3R A; 5K8N A; 2ODF A; 2PJA A; 4OP4 A; 5G21 A; 2YND A; 1S7K A; 2VXK A; 5KTA A; 2PJ4 A; 3ISX A; 6CPA A; 4AG9 A; 3FH4 A; 1VIX A; 5A28 A; 1IU8 A; 4C2Y A; 5HVF A; 2I00 A; 1IOI A; 2PIZ A; 2AFO A; 2EO8 A; 3T9Y A; 3WC7 A; 3IU2 A; 3F8K A; 4B5P B; 1JQG A; 2OZH A; 1VHE A; 1P0H A; 2AFX A; 2ZEN A; 3H8G A; 3KQX A; 3LMS A; 1GYT A; 1TKF A; 4R8F A; 3R9F A; 4UIA A; 4XPD C; 5F48 A; 2F5I A; 3V38 A; 4ONW A; 2CNT A; 2G3T A; 2PCU A; 1B6B A; 1TF9 A; 4ZY2 A; 5DS0 A; 1FY7 A; 1M4L A; 1WK4 A; 4QC6 A; 4YRH A; 1HDQ A; 2J9A A; 3FF3 A; 2P6E A; 2BO9 A; 4OC1 A; 2BOA A; 3PB7 X; 4OC0 A; 4NJR A; 3JUW A; 4Y49 B; 5CNP A; 2CTB A; 1B87 A; 4UFX A; 5J8C A; 1Z8L A; 3NE8 A; 1PYT B; 4U9Z A; 3NH5 A; 2JDD A; 3IWW A; 1YW6 A; 2PJ7 A; 4KUA A; 4P4E A; 1EE3 P; 1OZP A; 5AG5 A; 3PB9 X; 2VQY A; 3R96 A; 2G0B A; 4KOW A; 3BI1 A; 3S6H A; 2PJB A; 2EUI A; 2WPW A; 3B35 A; 2OH1 A; 2Z3N A; 4F0X A; 3TTH A; 1QSN A; 1Q7L A; 2R1I A; 3SI0 A; 4FD5 A; 2AJ6 A; 1ON0 A; 1BLL E; 1RTQ A; 1SQH A; 3BHX A; 3GB0 A; 1NSL A; 3RBU A; 3KHZ A; 3PB8 X; 3SXN A; 4CGO A; 4F9U A; 4CAX A; 1NE9 A; 3JRU A; 2R7H A; 4LQ6 A; 4NGR A; 1ZLH A; 4AVB A; 2R98 A; 2PJ3 A; 1Z8T A; 4A94 A; 3W6X A; 4NGT A; 2Z3K A; 3H4Q A; 4NF1 A; 3D4U A; 3KR5 A; 4JJX A; 2PJ5 A; 4KOV A; 3R9G A; 5AG7 A; 5G1Z A; 2FIW A; 2PJ9 A; 2WZN A; 3DSB A; 2H5M A; 2GLF A; 2V8H A; 4F8Z A; 8CPA A; 5I4M A; 4R9M A; 4JYW A; 1RO5 A; 3LOD A; 4YU9 A; 3W91 A; 4GS4 A; 4PQA A; 3FB3 A; 1FNO A; 2WPX A; 3GYA A; 5KTC A; 4FBE A; 4MCS A; 2Q7S A; 3P2F A; 2BUE A; 4K3N A; 2DPS A; 4MFK A; 4Q7A A; 3PGP A; 4X8I A; 5JPH A; 2GIV A; 4KOX A; 4BMH A; 3S9N A; 1CG2 A; 4MI4 A; 1CPS A; 3S9M A; 4MHY A; 3PB4 X; 2P6F A; 3MGD A; 3KR4 A; 4FD6 A; 1H8L A; 3FRM A; 2ZW7 A; 3FED A; 3IWE A; 5F47 A; 5H86 A; 4TNU A; 5C88 A; 1M1D A; 2WSA A; 2PDO A; 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