4AVCA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 in complex with acetyl coa and camp
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
TGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSARVPSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 77
structure length 326
sequence length 326
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avcA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avcA02
3D8PA 4WBBA 4I3PA 4H6ZA 3SXNA 2G3AA 1Z4EA 2JDCA 2VQAA 3ETQA 5LRSA 1YUDA 1ON0A 2R7HA 2VI7A 4D7SA 3LZZA 3PZJA 2GAUA 3PLQA 5FQ0B 2P6FA 4F7ZA 1N71A 2EAAA 3I7DA 3NSTA 4HZFA 2GC0A 4XEZA 2UYAA 2D5FA 4DINB 3H3UA 1M4GA 3BB6A 5BUVA 4YSFA 4AXOA 2UY9A 3O14A 4E2QA 3JUWA 3TO7A 2VBQA 2OB0A 4PSXA 2D4PA 2EVNA 4EV0A 3TE4A 3EO6A 5I8SA 3JVNA 4FT8A 4AQ6A 2Z11A 1PMIA 1YREA 4XF0A 2JDDA 4AG9A 3TO6A 4AVAA 3DL3A 1ZZ9A 1JUHA 1LB2A 1L0CA 4JD6A 1VR3A 4KOXA 2IXIA 2MPFA 4I0BA 1V0CA 2VQYA 3IDBB 4R3KA 2XHKA 4FD4A 4KUAA 1WWZA 4XFIA 3KSCA 4KU8A 4UWJA 3VWDA 2ARHA 2FCKA 3GYDA 4JVAA 4K8FA 2BNNA 4XF1A 2Q04A 2Q44A 4H6UA 3D0JA 4MJ8A 2BYVE 3TOBA 1EPZA 2B4DA 2N7GA 3E0KA 2Q0YA 3I3GA 3SHPA 3VHRA 1B87A 2P6EA 4FAGA 1XF8A 4UXAA 2GIVA 1YVKA 1M4DA 2PA7A 5F48A 3U11A 2FE7A 5IB0A 5KHGA 1PM7A 1ZZBA 4XFHA 3ZJ0A 4HVOA 2Z0ZA 1UCXA 4QUSA 2EA7A 2IXLA 1QSOA 2ZW6A 3EFAA 1XE4A 1CAUB 3E97A 1IPJA 3OGJA 4OLLA 3QAHA 4YRHA 3G7DA 4HN1A 5BY5A 3D2PA 3S6GA 3EBRA 3H1WA 1YX0A 4B5PA 4LA2A 1SQ4A 3DR8A 4EWEA 5KHHA 3BPZA 5LEKA 4QGLA 1H1MA 2B4DB 4XF3A 2Q30A 2BGCA 4BHPA 4KZTA 1X7NA 4ZU5A 3TO9A 2Q0AA 3CJXA 3UKNA 2H0VA 2GANA 5E16A 5JR7B 3MDPA 2R1IA 4Q0QA 2VXKA 4R3LA 3R96A 2IXKA 2O8QA 3EXNA 2IC1A 3UKTA 1QSTA 4AB7A 4E2SA 1S7FA 2Q4YA 4N9HA 2PR8A 5E1RA 4IESA 3EJKA 3RYPA 3TNQA 3GBFA 3I54A 1RXTA 3MPBA 4QC6A 4UA3A 3R9EA 4NEXA 1O3TA 4CRZB 3ROUA 1XE7A 4PIXA 5H86A 3ELNA 5I91A 3HIFA 4QM8A 2FS5A 1UD1A 1M1DA 2B5GB 2G3TA 4HSLA 4IEWA 1YGHA 3S7IA 4YGOA 2PAMA 5AVPA 1J4JA 1UPIA 4MGZE 1OI6A 2HQYA 1RO5A 3P2HA 3OD0A 2OZ6A 3WW2A 1LRZA 1Q2YA 2OU2A 3F5BA 4Q0SA 1OZPA 2B9UA 2GC3A 4UWIA 4UBGA 3E6BA 4IEUA 5I0TA 1XE8A 3H7JA 4PIYA 1P0HA 1M4IA 1QY4A 2ET7A 5JSRA 2H6BA 5JCTA 2PQ8A 4XFCA 1NE4A 1IIDA 5F47A 2EVXA 4ONUA 1WA4A 2AE6A 1Y9QA 3NKTA 2B58A 2P17A 2PC1A 1FI2A 4OAEA 4EWAA 4Q0UA 2QCSB 4CS0B 4RD7A 1OMIA 3FWEA 1BOBA 4IERA 4XNHC 4KUBA 3D0SA 2BNOA 4PK2A 4JXQA 3T9YA 1RUOA 2J8NA 3PNAA 2JLMA 1NXMA 1OD5A 3TOAA 1YFWA 2Y0OA 1UIKA 4WZCA 4E2GA 4R57A 3FJSA 5F49A 1GQHA 1ZVFA 2XKOA 1B6BA 2QECA 4MX3A 4FD7A 2GC1A 3E5QA 5IX3A 4KOYA 4YNIA 5FQ0A 2GZWA 3SCFA 2B4BA 4I2OA 4KLWA 5GCNA 2IL4A 1Z4RA 2B3UA 5J3UA 5FLIA 5H84A 3H9AA 5F46A 1YHFA 3R1KA 3GYAA 4LULA 1X82A 1YVOA 3WR7A 4KOVA 3S6HA 4CAVA 1MK4A 1ZZCA 4PSWA 3S6KA 4HKFA 1FXZA 5T3NA 2J8MA 4EVYA 2HKXA 3RYRA 2QIRA 4LUAA 1Q2CA 5F1RA 3H1MA 3BLNA 2D40A 4HN0A 3BU7A 2I00A 2FL4A 3RNSA 3MYXA 5FCCA 5KHKA 2OH1A 5J8CA 4IEYA 5J48A 1VKCA 5I8YA 4F6AA 2Q1ZB 1BO4A 4XPDB 5C88A 3EHKA 4KVXA 5ISVA 4Z82A 2CGPA 4KWLA 1XEBA 1CAXB 3F8KA 3SCGA 4NCZA 3ES1A 2XGXA 2FMYA 3S6FA 1X8MA 3QACA 1QSRA 2ZXVA 2QDRA 1NSLA 1Q5OA 3H4QA 3SMHA 4YRDA 3H1YA 3OWCA 1H1IA 4LA3A 4ZU7A 1J59A 3D2MA 1CAUA 4KOUA 3HT1A 4IUSA 2V09A 1IYKA 2ZW4A 3IBMA 3W6SA 4MGYE 1ZRCA 1ZRFA 1M44A 1QXJA 3U10A 1QXRA 4LEJA 2VZYA 2CAVA 5JPHA 4HVRA 1I12A 3E6DA 5K8SA 2XKPA 4XPDC 3OCPA 3USSA 5KHIA 5I0SA 2PR1A 3FIXA 4I02A 5C8WA 5JSOA 1S7NA 1ZZ6A 3B02A 1S7KA 2FXFA 2PDOA 4RI1A 5DWNA 3NJZA 2B3VA 4DNCA 1SEFA 2XL9A 2BSWA 4HSJA 3BJ8A 1XMTA 2D5HA 2Y0MA 2NMTA 4KOWA 2B8MA 4XF9A 4NVPA 2B5GA 4X5KA 3ZZIA 2IXCA 4LUMA 1S60A 2OYZA 2FQPA 2WPWA 4N9IA 2G0BA 2I79A 5JQ4A 4JTNA 2QMLA 2MHFA 3OTFA 4KVME 1O3RA 2VPVA 1KUVA 1ZNPA 3HT2A 3IDCB 4NSQA 2P6GA 2UY8A 5KHJA 4Y49B 1CX4A 4LUKA 2H6CA 4KWKA 4CAWA 5BV6A 2ATFA 4QXKA 1L3JA 4J1WA 4YFJA 2CAUA 1U6MA 2F4PA 4A2UA 2C27A 1IB1E 1DZTA 5EFUA 1ZX5A 2OZGA 2Q4VA 4XFBA 4FBFA 1HW5A 4AQ2A 4QGNA 3PGPA 1MJBA 3LA3A 3CF6E 2AJ6A 4XNHB 3E5XA 4AVBA 1NMTA 3N4MA 1ZRRA 1O5LA 4FD5A 3S0MA 4BYYA 2HV2A 3E6CC 3B8GA 3ZDSA 5CADA 4H7LA 5JSPA 1QSMA 2HUZA 2PSWA 3MGDA 1WLTA 4LX9A 1I21A 1YFUA 1EY2A 2E9QA 2ETEA 5CVRA 1G6NA 4JTOA 5I8TA 4I49A 1CJWA 4L8AA 1ZRDA 2WFPA 4JV4A 2X7BA 5IV0A 1CAWB 2PYTA 2ZW7A 3FRMA 3NVCA 4IF5A 4HMZA 4Y49C 2D93A 1J3PA 3CO2A 2CNSA 1Y9KA 4XETA 4X6RB 2CNTA 2FT0A 1Z9UA 3D82A 2J8RA 2VEZA 4GS4A 4M3SA 4IEZA 2I45A 5HH1A 3WW1A 4HLTA 1J1LA 4LLOA 2RC4A 4U5YA 3LAGA 1RTVA 3FBUA 3LA2A 3GKRA 3RYKA 2O1QA 1YLEA 3P2FA 1R57A 3BALA 5E96A 5C82A 2XLGA 3W6XA 1TIQA 2GH2A 2R8VA 4QM9A 4KWJA 1WGPA 2MNGA 1YFXA 1FY7A 1NE9A 3K9UA 4E0AA 4TLFA 3MZHA 1NZCA 1RGSA 4BH9A 3RPQA 2UYBA 4D7TA 3CXPA 4M85A 4E2AA 1NYWA 3EQEA 4II9A 5J7MA 2QJVA 2F5IA 4KOTA 4NF1A 4MBUA 1QWRA 4IETA 3N7ZA 4MY3A 1J3RA 3KMHA 4MUVA 2A4NA 2OZHA 4MY0A 3PVBB 2BEOA 1WK4A 4JJXA 1CAVA 1CAXA 4CAXA 3M70A 4KVOE 3OF1A 2WPXA 2Z69A 5JAXA 5EZWA 3H7YA 4I09A 1OFNA 4PJYA 1VHSA 1YR0A 3LODA 4H89A 1J58A 3HQXA 5FPZA 3BCWA 2GE3A 3SCHA 2FIWA 2PAEA 3KKWA 3NW4A 1LR5A 1PU9A 4FD6A 3FXTA 4ORFA 4META 3S7EA 3D3SA 2PTMA 3QOPA 3ES4A 3DV8A 1X8EA 3M3IA 2Z10A 4KORA 4ZU4A 3ST7A 2K0GA 1XRUA 3DDDA 4XPLA 2OZUA 1I5ZA 1ZZ8A 3LD2A 5I0CA 1Y7RA 1CAVB 2ET1A 3LWCA 3FNCA 3IIAA 4J3GA 3H8UA 4MGIE 4IEVA 2VZZA 2PRBA 2EUIA 4FAHA 1Q2DA 1FT9A 4Q0VA 4IEXA 5FLHA 1S7LA 2IXJA 4MGKE 4PK3A 3KGZA 1ZZ7A 4YYOA 2PAKA 3RZZA 4MV2A 4EROA 1O3SA 1MJ9A 3TCVA 5C6CA 3TT2A 4GULA 5KTCA 2DXQA 3CEWA 5EC4A 4CRYB 1TQ5A 1J3QA 3NL1A 4I01A 4MZUA 3R9FA 1O5UA 3RYOA 4CYDA 5BXXA 3SXWA 3DNSA 2QNKA 3VWEA 1EP0A 4F8AA 1XIXA 2BEIA 3IWZA 4MHDA 3H50A 3G8WA 3ACLA 3FYNA 3DSBA 3FE5A 5FPXA 3L2HA 1DGWA 4R9MA 5I0RA 1PUAA 1VP6A 3EO4A 4ZBGA 2P0WA 4B5OA 2ZW5A 3R95A 4AVCA 1MJAA 1IICA 2FIAA 4MH0E 2R98A 4EWDA 1Y9WA 5D1IA 4NXYA 4R87A 3TTHA 4E8OA 2VECA 4JWPA 2REFA 1RUNA 3LOIA 1CM0A 4UBHA 2K5TA 2XLFA 3KCCA 4L2NA 4MI4A 1K4JA 3R6SA 1S5KA 3IWGA 3DN7A 3CLPA 3E5UA 1YFYA 1O7FA 2GU9A 1VJ2A 2BNMA 4U9ZA 1ZREA 2H5MA 5KTAA 4HBNA 1LKNA 1LRHA 1CAWA 4IEQA 2OZJA 5I0UA 3UY5A 3I9SA 4QVTA 1SQHA 4X6QB 1YWKA 4AG7A 1RL3A 3I59A 2XL7A 5EBVA 1YLLA 3FB3A 2QVSB 2DCTA 4PIZA 5BPXA 2Z2SB 4B29A 1YK3A 4L89A 4P9GA 4QB9A 2Q7BA 5LRRA 1U12A 3UKVA 2JEVA 2B5HA 2GC2A 4L11A 3C3VA 3SXOA 1DZRA 4KL1A 4KU7A 2BL1A 3FZ3A 2Q4SA 3FX3A 4O9EA 2D4OA 4BMHA 4R52A 4Q0PA 1O3QA 3R9GA 1GHEA 1Q43A 1KZFA 1UFHA 2OA2A 1IPKA 5HI0A 1V70A 4RS2A 5FDBA 3KGLA 1KUYA 3RDIA 4IEPA 3W91A 4LTAA 4XFFA 3H3ZA 3I59B 4O9GA 2PHDA 2C0ZA 3WW3A 4JLYA 3FHIB 3G3SA 3DKWA 4K30A 3TFYA 2CV6A 4I0AA 2HJIA 1P4NA 4R8HA 1UW8A 5HMNA 1RC6A 3F0AA 3PP9A 4B5PB 4QGMA 3C26A 4HNWB 2PQQA 4OFGA 2CNMA 2PFWA 5CNPA 1SFNA 4IEOA 1I1DA 4KLVA 3SHRA 4HVQA 3BJ7A 3QB8A 3CL1A 4WVZA 4QX5A 5CU1A 4XFAA 2ATRA 3JZVA 4PV6A 1EYBA 2CY2A 3EC4A 5FLJA 3T90A 4YARA 4XF4A 4F0YA 2ZPAA 2OPKA 1IYLA 2REEA 3WW4A 1DGRA 4QBJA 4HNXB 2K9ZA 2KCWA 5I93A 4BIFA 3TNPB 1QSNA 3FFQA 2IXHA 1UIJA 1Q3EA 3GY9A 1S3ZA 5FVJA 2KXLA 1Y3TA 4XPKA 4HNYB 5DWMA 5KBFA 3LA7A 5LEJA 1O4TA 4QMAA 4JXRA 2ZKLA 4Q29A 4UBRA 5KTDA 3IGRA 4XFGA 4OADA 2WC2A 4Z07A 2O28A 4U9YA 5J8FA 2FSRA 4J1XA 1GQGA 2BUEA 3V8IA 2ZCWA 1NE6A 3DR6A 2XLAA 1CGPA 3CXSA 3NE7A 1I6XA 4KOSA 3U0ZA 2PHLA 3EY5A 3CXQA 1KUXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FOJB 1K5MB 4CEYA 1BK1A 2VZTA 4HZFA 5JWPA 3HJRA 3AMPA 3I3QA 1RUI2 4AXOA 4BK5A 4XIKA 2H0BA 5C33A 2MEV2 1V0CA 3IDBB 4R3KA 3VD4A 1PNFA 4V2VA 5JXJA 5KXBA 3CPXA 3QCWA 4LIUA 4LNVA 2FE7A 2XJQA 2LRPA 4XABA 1RUD2 3AKPA 4B5PA 1HQLA 4EWEA 1AR92 2IWGB 4GQ7A 2VUAA 1SCSA 3A22A 3WF0A 4E8CA 2RDNA 3WDYA 4PIXA 5FMDA 3ZSEA 1YGHA 1FPN3 2Y6KA 2WAOA 2WDBA 5D2AA 1HXS1 1RO5A 2OKXA 2B9UA 3X29B 5H9QA 1SFPA 1Y7BA 4AQSA 1ULCA 3S57A 4RD7A 3VN4A 2AFMA 3D0SA 2GDFA 2ORZA 4R4XA 1W6QA 4WVMA 4MX3A 4P9WA 1S1AA 1BMV1 4FAIA 3VDDC 3AZXA 1AJKA 1QJY1 1P8JA 5H84A 4QPIC 4HPKB 3J7LA 4ZKTB 1POV1 2ILMA 2VW2A 4LE4A 4AL9A 4B7EA 1XFOA 1RUJ2 4G4FA 2PMWB 3DYOA 2WNVB 4D6RA 5JOWA 1QSRA 2YYOA 2VZVA 1OT5A 3NNMA 5FKBA 3ZYRA 4ZU7A 5FMOL 2VZYA 2AEYA 4AOCA 4AHYA 1O8PA 1ZZ6A 3NJZA 2BSWA 2PHXA 2R7EB 3POWA 2IFRA 3BOWA 2IVIB 2I79A 2QMLA 4KVME 2YGLA 5FYVA 3VDDA 4QXKA 3GIUA 4BD9A 4CCOA 2Q5TA 1DZTA 4QPIA 4AQ2A 4FBFA 4A32A 3LA3A 1VMJA 1UKRA 3S0MA 1WKYA 1XNBA 1SG3A 2DVGA 2VQ0A 1NOVA 1AX1A 2VZUA 1UN1A 3HQUA 1I3HA 3T1LA 2L9LA 1UMIA 2EWBA 1XOVA 1AR73 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3D8P A;  4WBB A;  4I3P A;  4H6Z A;  3SXN A;  2G3A A;  1Z4E A;  2JDC A;  2VQA A;  3ETQ A;  5LRS A;  1YUD A;  1ON0 A;  2R7H A;  2VI7 A;  4D7S A;  3LZZ A;  3PZJ A;  2GAU A;  3PLQ A;  5FQ0 B;  2P6F A;  4F7Z A;  1N71 A;  2EAA A;  3I7D A;  3NST A;  4HZF A;  2GC0 A;  4XEZ A;  2UYA A;  2D5F A;  4DIN B;  3H3U A;  1M4G A;  3BB6 A;  5BUV A;  4YSF A;  4AXO A;  2UY9 A;  3O14 A;  4E2Q A;  3JUW A;  3TO7 A;  2VBQ A;  2OB0 A;  4PSX A;  2D4P A;  2EVN A;  4EV0 A;  3TE4 A;  3EO6 A;  5I8S A;  3JVN A;  4FT8 A;  4AQ6 A;  2Z11 A;  1PMI A;  1YRE A;  4XF0 A;  2JDD A;  4AG9 A;  3TO6 A;  4AVA A;  3DL3 A;  1ZZ9 A;  1JUH A;  1LB2 A;  1L0C A;  4JD6 A;  1VR3 A;  4KOX A;  2IXI A;  2MPF A;  4I0B A;  1V0C A;  2VQY A;  3IDB B;  4R3K A;  2XHK A;  4FD4 A;  4KUA A;  1WWZ A;  4XFI A;  3KSC A;  4KU8 A;  4UWJ A;  3VWD A;  2ARH A;  2FCK A;  3GYD A;  4JVA A;  4K8F A;  2BNN A;  4XF1 A;  2Q04 A;  2Q44 A;  4H6U A;  3D0J A;  4MJ8 A;  2BYV E;  3TOB A;  1EPZ A;  2B4D A;  2N7G A;  3E0K A;  2Q0Y A;  3I3G A;  3SHP A;  3VHR A;  1B87 A;  2P6E A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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