4AVCA

Crystal structure of protein lysine acetyltransferase rv0998 in complex with acetyl coa and camp
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
TGARVEDLAGMDVFQGCPAEGLVSLAASVQPLRAAAGQVLLRQGEPAVSFLLISSGSAEVSHVGDDGVAIIARALPGMIVGEIALLRDSPRSATVTTIEPLTGWTGGRGAFATMVHIPGVGERLLRTARQRLAAFVSPIPVRLADGTQLMLRPVLPGDRERTVHGHIQFSGETLYRRFMSARVPSPALMHYLSEVDYVDHFVWVVTDGSDPVADARFVRDETDPTVAEIAFTVADAYQGRGIGSFLIGALSVAARVDGVERFAARMLSDNVPMRTIMDRYGAVWQREDVGVITTMIDVPGPGELSLGREMVDQINRVARQVIEAVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cyclic AMP Regulation of Protein Lysine Acetylation in Mycobacterium Tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSINE ACETYLTRANSFERASE
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 77
structure length 326
sequence length 326
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00027 cNMP_binding Cyclic nucleotide-binding domain
A PF13302 Acetyltransf_3 Acetyltransferase (GNAT) domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4avcA01
3.40.630.30 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Aminopeptidase Aminopeptidase 4avcA02
4UWIA 4QXKA 5EZWA 2G3AA 3D3SA 3LD2A 4XFFA 2PR8A 1PMIA 4LA2A 3DSBA 1VR3A 1YFUA 2R8VA 4E2QA 4MBUA 5BV6A 5HH1A 3FNCA 3U11A 3KGLA 2KCWA 3ETQA 1CAXB 2K5TA 3KKWA 1Q2CA 1ZRDA 3TE4A 1ZZCA 4NVPA 3VWDA 4CAXA 4FAHA 2DXQA 4L2NA 5LRRA 3D8PA 1ZRFA 3FB3A 1IPJA 4QGNA 4AQ6A 1Y3TA 1P4NA 2ZW7A 1YLLA 5BPXA 4LEJA 4HVQA 1YVOA 1CAWA 4KU7A 1DGRA 4I0BA 4JWPA 1OMIA 4E2GA 1RUOA 4F6AA 2Z11A 4AQ2A 3V8IA 4JXQA 1Q3EA 4KOVA 1VP6A 3H1WA 3I9SA 4KU8A 2B5GA 1S3ZA 2BSWA 2OU2A 1HW5A 4Y49B 3EHKA 3SXOA 5KHHA 5J8CA 1UD1A 5BY5A 3EFAA 4FD6A 3D82A 2H5MA 3BLNA 4IF5A 1XMTA 2P6EA 1QSMA 3TFYA 4MGIE 2PR1A 1SEFA 2PA7A 1YFXA 4J1XA 3RNSA 5I8YA 1J4JA 3OWCA 4KOXA 1GHEA 3G7DA 2PFWA 3D0JA 4QX5A 3OGJA 4KL1A 1CM0A 2Q0AA 3FBUA 3RYPA 3FE5A 4H89A 3C26A 4XETA 2HQYA 4CRZB 2D4OA 5HI0A 4KORA 2IXHA 2MPFA 1PM7A 4AVCA 5BUVA 4BMHA 5I0SA 4QM8A 4XF9A 3PNAA 2NMTA 5FLHA 4AG9A 3TOAA 4L8AA 3HT1A 1Y9WA 1EYBA 4I02A 1YR0A 5I0UA 3R95A 5AVPA 2BNNA 3FWEA 4IEQA 4D7SA 4KVXA 5F46A 1CX4A 5JPHA 1VKCA 3LA3A 1CAUB 3M70A 4BYYA 3S0MA 4Z07A 1NSLA 1RGSA 3CJXA 1SFNA 1X7NA 3WW2A 2JDCA 2Z0ZA 4R52A 5H86A 4I49A 1O3SA 4PK3A 1L0CA 2BNOA 2B58A 4Q0SA 2XL9A 3ES1A 3QACA 3R9EA 3R6SA 2BGCA 3G3SA 2P17A 1LKNA 2HKXA 2EUIA 3HT2A 1X8MA 1IYKA 1UCXA 2IXLA 3JZVA 3RDIA 4DNCA 2OPKA 5FVJA 1ZZ7A 2D40A 3MDPA 4YRHA 3UKNA 3E6BA 3QB8A 4QVTA 3TO6A 2H6CA 2C27A 5F1RA 2ZKLA 5JSPA 2HV2A 5EBVA 3LOIA 1YHFA 3S7EA 3USSA 5JCTA 2FL4A 2J8NA 2GE3A 4NCZA 4ZU7A 2CNTA 5DWMA 1SQHA 4K30A 4R3LA 2FIWA 4IEXA 3I54A 3FXTA 4GULA 2VZYA 5J7MA 3WW1A 5I0RA 5EFUA 1S7NA 5I8SA 1CAWB 4QGMA 1WGPA 1Y9KA 3OF1A 3QAHA 5C88A 4ZU4A 1M4IA 3DKWA 3HQXA 3E6DA 3U10A 3H7YA 2PHDA 4PJYA 2Q4VA 2ZW4A 1GQGA 5CADA 1EPZA 1WLTA 2B5GB 4KUAA 5F49A 4YFJA 3MZHA 1BOBA 1KZFA 2JEVA 4H6UA 2N7GA 4UXAA 3NSTA 2FQPA 4NEXA 4I0AA 4JD6A 3NL1A 1S7FA 4IEZA 1FY7A 2O8QA 5I93A 2ARHA 4MX3A 3IWZA 3S6GA 3DV8A 3TTHA 3C3VA 2J8MA 4FT8A 4LUKA 4XPDC 3VHRA 3EQEA 1QWRA 1O7FA 1CJWA 3GYAA 2PRBA 4RS2A 3S6FA 1CAVB 2D5HA 4XPKA 4I01A 2Y0OA 1IIDA 4KOYA 2QDRA 2OB0A 4XFCA 2Q04A 3DDDA 3H7JA 3M3IA 4EROA 5KHIA 2Q7BA 4FD7A 2B9UA 3OCPA 5C82A 1GQHA 3BALA 4XEZA 5KBFA 2FIAA 3RYOA 4E2AA 2EVXA 1WA4A 4MGKE 5KTAA 3PLQA 4FD5A 4UA3A 2PYTA 3CEWA 4U5YA 5LRSA 4EV0A 2WC2A 2B5HA 2ET7A 4KLWA 4R9MA 1TQ5A 5I91A 3T90A 5F48A 1YK3A 4IERA 2HUZA 2Q44A 3IBMA 3R9GA 2BNMA 4KVME 4UBGA 1XE4A 4X5KA 4Y49C 2EVNA 4MGZE 5FPXA 3TNPB 3GYDA 4HSLA 3ACLA 3GKRA 2ETEA 4RI1A 2ATRA 2I45A 3FJSA 4YYOA 2VEZA 2GC0A 2MNGA 1Z9UA 1FXZA 3O14A 4PIXA 3BJ7A 3H1YA 4JLYA 3ZZIA 1UIJA 1XIXA 3MGDA 4P9GA 4HNXB 4X6QB 3EC4A 2WFPA 4HBNA 1O3RA 4QUSA 2OZHA 2B4BA 3EXNA 3E5QA 2F4PA 3SMHA 4BH9A 1I6XA 2IXCA 3BCWA 4MUVA 4F8AA 4YARA 4FD4A 4WZCA 4PSWA 4U9YA 3NVCA 2RC4A 4KWJA 2GU9A 4QC6A 4OLLA 3OD0A 1I12A 4H7LA 1OI6A 3KMHA 5FCCA 4R8HA 1KUXA 2FE7A 3SCFA 3D0SA 1YLEA 2PAMA 2CY2A 5C6CA 1RTVA 4YGOA 5I0TA 4LUAA 1Y9QA 3FX3A 1MJBA 2O1QA 5E16A 2FT0A 2VI7A 1QSRA 4IUSA 1YVKA 1IYLA 1RO5A 4RD7A 4IEYA 1S7KA 3P2FA 1EP0A 4L89A 1ZVFA 4NF1A 1XF8A 3FYNA 3JUWA 2BYVE 2QECA 2Q1ZB 1V0CA 4HZFA 3WW4A 2R1IA 3IIAA 2VQYA 5FPZA 3CL1A 4HKFA 4B5PB 2R7HA 2D93A 3DR8A 3DNSA 2GH2A 1J1LA 4IEUA 1CGPA 1IPKA 2OYZA 3ROUA 2P6GA 2REEA 4CAVA 2PAKA 1ZZ8A 3S6HA 1M1DA 5I0CA 3L2HA 2WPXA 3F8KA 1J3RA 5J48A 2MHFA 3EY5A 3QOPA 1B87A 1NYWA 2XLGA 3RZZA 2JDDA 2O28A 3FIXA 4J3GA 1WWZA 3IDCB 4ORFA 3FRMA 3WR7A 2AJ6A 1UPIA 2B4DA 5KTCA 4LULA 3I59A 2QMLA 4HNYB 3I7DA 5T3NA 3KGZA 3E0KA 3S7IA 3NE7A 1OD5A 2ZXVA 4EWEA 1RUNA 1UIKA 2Z10A 1S60A 5FQ0A 3FFQA 5LEJA 1Z4EA 1S5KA 2K9ZA 2VECA 1YREA 4E0AA 2P6FA 1O4TA 1ZREA 4Q0QA 5IV0A 1NXMA 4HNWB 2Z69A 4IEOA 5FDBA 4Q0VA 5KHGA 1ON0A 4FAGA 1CAXA 3UKTA 2AE6A 4AVBA 2XGXA 4JXRA 3BU7A 1YGHA 3EJKA 1Q5OA 3FHIB 2EA7A 3S6KA 2QIRA 1Q43A 1XE7A 2QJVA 3E6CC 2PC1A 3G8WA 3IWGA 2XLAA 2PDOA 1KUYA 3GBFA 4JJXA 1UFHA 1Z4RA 4DINB 5H84A 5ISVA 4AG7A 4CRYB 1DZTA 4CS0B 1MJ9A 2VZZA 3TO7A 2OH1A 1DGWA 4Q29A 2XKPA 1NE9A 2UY8A 4K8FA 3H1MA 4PIYA 4LTAA 2D5FA 2CNSA 3H3ZA 1QY4A 3PVBB 4HVRA 2PTMA 4F7ZA 4EWDA 2PQ8A 4KVOE 3OTFA 2GC1A 1G6NA 3RYKA 2B3UA 3PZJA 5IX3A 4I2OA 4QBJA 4FBFA 3IDBB 4OAEA 3SHPA 1I5ZA 3VWEA 3ZJ0A 3LZZA 1S7LA 1J59A 2UY9A 1IB1E 5EC4A 5JQ4A 1O3QA 4NXYA 4MY3A 4KOTA 2QCSB 2GIVA 4R57A 3NJZA 2IXJA 2PQQA 1Q2YA 4LLOA 4MV2A 4UBRA 1NE4A 1NZCA 4A2UA 4GS4A 1O5UA 3ST7A 1YX0A 1LRHA 4HLTA 4XF0A 4YNIA 5J3UA 3NKTA 3BJ8A 2XL7A 1QSNA 1VHSA 2ZW6A 3EO4A 4KZTA 1BO4A 2IXKA 1TIQA 1P0HA 3LA2A 1ZZ9A 2DCTA 4O9EA 4HMZA 3PP9A 4KOSA 1IICA 3H4QA 1MK4A 4CAWA 2WPWA 5JSOA 5C8WA 2V09A 2C0ZA 4JTOA 4Z82A 4H6ZA 3LAGA 4PSXA 4IETA 5KHJA 2B4DB 4EWAA 2PHLA 2UYAA 1RXTA 4XFIA 2FMYA 1R57A 4XFHA 4E8OA 3CXSA 3EBRA 4BIFA 1SQ4A 4N9IA 4O9GA 1YFWA 1QXJA 2BEOA 4HVOA 5FQ0B 1RL3A 3H50A 4YSFA 5K8SA 5CNPA 1M44A 2H6BA 2Y0MA 1LR5A 4ZU5A 3MYXA 3B02A 3ES4A 4U9ZA 3E97A 4ONUA 4JV4A 5JSRA 4PV6A 5D1IA 2ET1A 4R3KA 4IEPA 1M4DA 2CAVA 1L3JA 3CXQA 1H1IA 2G3TA 2UYBA 2K0GA 2Q4SA 2Z2SB 4KUBA 5GCNA 2B3VA 1O3TA 3HIFA 3LWCA 2OA2A 1ZNPA 3UKVA 2QVSB 4J1WA 2GC3A 2ATFA 4EVYA 3R96A 3UY5A 2D4PA 2EAAA 3SXWA 2G0BA 5CVRA 3F5BA 2A4NA 4MJ8A 5CU1A 4PIZA 1UW8A 2PAEA 1K4JA 2X7BA 2Q30A 4IESA 2CV6A 3LA7A 5I8TA 4Q0PA 2Q0YA 4E2SA 2R98A 2VBQA 5KHKA 4MI4A 4QB9A 1ZZ6A 4XFGA 1EY2A 1XRUA 1B6BA 2XKOA 4XF1A 1I21A 2J8RA 2BL1A 4CYDA 2VQAA 3BPZA 4IEWA 1ZRCA 4OADA 3SCGA 1FI2A 4KWKA 5E96A 2KXLA 1PU9A 4XF4A 2Q4YA 4LX9A 3W6SA 1O5LA 3SCHA 3H8UA 3FZ3A 1MJAA 1U6MA 3IGRA 1CAVA 1ZX5A 4MGYE 5BXXA 4XFBA 2I79A 2IXIA 4OFGA 4B5OA 3SXNA 3B8GA 1NE6A 3CF6E 2GAUA 4HN1A 3N4MA 3R1KA 3ELNA 5DWNA 4JVAA 2XHKA 4QGLA 3E5XA 4ZBGA 1QXRA 5E1RA 4MH0E 3F0AA 3D2PA 2JLMA 2ZCWA 3N7ZA 1I1DA 2PSWA 4HSJA 1OZPA 2IC1A 5HMNA 2CAUA 1FT9A 4M3SA 2B8MA 1H1MA 2BEIA 1X82A 4MY0A 3WW3A 2OZUA 4QMAA 1J58A 4TLFA 1XEBA 4PK2A 3RYRA 4L11A 5JR7B 1Y7RA 1PUAA 3H3UA 4KWLA 4WBBA 4KLVA 4AXOA 2VXKA 3MPBA 2OZ6A 1WK4A 4N9HA 3CLPA 3CXPA 1QSOA 4XPLA 4LUMA 2FXFA 4B29A 1YFYA 2E9QA 1OFNA 2GANA 2ZW5A 2FS5A 4UWJA 4I09A 4R87A 2GC2A 2F5IA 3K9UA 4MZUA 3TCVA 1U12A 2HJIA 3EO6A 4X6RB 2FCKA 3GY9A 1YUDA 4XFAA 1LRZA 4QM9A 3RPQA 3KCCA 1J3PA 2GZWA 4XNHC 3H9AA 5FLJA 1V70A 1LB2A 3TNQA 4YRDA 4HN0A 4BHPA 2XLFA 1J3QA 1DZRA 2H0VA 1M4GA 1ZZBA 5J8FA 3KSCA 3ZDSA 4XNHB 5KTDA 2IL4A 3I3GA 3TOBA 4Q0UA 3U0ZA 3P2HA 3JVNA 3W91A 1JUHA 1VJ2A 4NSQA 3NW4A 1RC6A 5JAXA 2I00A 3SHRA 4XF3A 4MHDA 3TT2A 4UBHA 1N71A 4AB7A 2FSRA 3CO2A 4B5PA 2CGPA 3DN7A 4II9A 1Q2DA 5IB0A 2REFA 4M85A 1CAUA 2CNMA 1QSTA 4KOUA 3LODA 2OZJA 1YWKA 2P0WA 3W6XA 4JTNA 2OZGA 3T9YA 1X8EA 1KUVA 3TO9A 3D2MA 3E5UA 2QNKA 4AVAA 3DL3A 1XE8A 4IEVA 4WVZA 1ZRRA 4META 4LA3A 3R9FA 3DR6A 3I59B 2BUEA 4F0YA 4XPDB 2ZPAA 3PGPA 1NMTA 4D7TA 2VPVA 4KOWA 5LEKA 5FLIA 5F47A 3BB6A 4I3PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Y9MA 4C0HA 5H9QA 1CWPA 1VR3A 2R8VA 4MBUA 5HH1A 4Q4Y1 3ZX7A 1LGCA 4QQ2A 4NVPA 3ISZA 4QPIB 2JKBA 3UGHA 1HXS1 4E2GA 1BYHA 4LBMA 4LHKA 4CE8A 3N9PA 2Q5TA 1YXWA 3K9TA 2VCCA 4M01A 3HR9A 1X10A 5I8YA 5IVJA 2OOTA 3IMMA 1IS5A 4F83A 1RUC1 3C26A 3CT9A 5HI0A 4AVCA 5BUVA 2VZPA 2DPTA 2NMTA 1O8SA 4L8AA 1XJOA 4YZ3A 3LA3A 2RS51 1S0DA 1RTQA 1OLMA 3WABA 2PJ3A 2EIEA 2VC9A 1NA1C 2VTXJ 2BGCA 1COV2 5AC93 1IYKA 4UW5A 3JZVA 4LBQB 5FZ0A 4RS5A 4CXXA 1UOJA 3AYDA 3VL9A 1VLNA 2FL4A 4R3LA 4JC1A 1PZ8A 5I8SA 4G9SB 1UX7A 1PIV2 2DPSA 2YC2A 3H7YA 4FFFA 4YW2A 1KZFA 4UFVA 5G20A 1JXNA 4ES8A 3TEXA 1UU6A 2ARHA 4UF0A 3HBZA 3ECQA 1MPXA 2D5HA 5ERLA 4CCKA 2DWRA 2IQ6A 3NV2A 4A38A 3W5MA 3CHXA 3C7FA 2PYTA 3AZZA 3SH5A 4KSFA 3BVCA 3SH3A 3BODA 4KS9A 4XACA 1HRV2 3KGQA 3ZZIA 2WFPA 1RMU1 4CCLA 1LECA 4QC6A 4AR2A 3O1MA 4FTSA 3H8FA 4AEKA 2XR4A 5FP3A 1YVKA 4L89A 2YFZA 1UAIA 3KQRA 2HWF3 1VRH3 4K3UA 1UKGA 5FTTC 4A7YA 5IFPA 1N47A 2WWSA 3NJYA 1WWZA 3ZMNA 3I59A 4Y1ZA 5C8CC 5T3NA 2AFXA 1V6LA 2GN7A 2R062 1JZ2A 5CFDA 1BMV2 5FDBA 1JW6A 4ZXEA 4AVBA 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2XB6C
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4UWI A;  4QXK A;  5EZW A;  2G3A A;  3D3S A;  3LD2 A;  4XFF A;  2PR8 A;  1PMI A;  4LA2 A;  3DSB A;  1VR3 A;  1YFU A;  2R8V A;  4E2Q A;  4MBU A;  5BV6 A;  5HH1 A;  3FNC A;  3U11 A;  3KGL A;  2KCW A;  3ETQ A;  1CAX B;  2K5T A;  3KKW A;  1Q2C A;  1ZRD A;  3TE4 A;  1ZZC A;  4NVP A;  3VWD A;  4CAX A;  4FAH A;  2DXQ A;  4L2N A;  5LRR A;  3D8P A;  1ZRF A;  3FB3 A;  1IPJ A;  4QGN A;  4AQ6 A;  1Y3T A;  1P4N A;  2ZW7 A;  1YLL A;  5BPX A;  4LEJ A;  4HVQ A;  1YVO A;  1CAW A;  4KU7 A;  1DGR A;  4I0B A;  4JWP A;  1OMI A;  4E2G A;  1RUO A;  4F6A A;  2Z11 A;  4AQ2 A;  3V8I A;  4JXQ A;  1Q3E A;  4KOV A;  1VP6 A;  3H1W A;  3I9S A;  4KU8 A;  2B5G A;  1S3Z A;  2BSW A;  2OU2 A;  1HW5 A;  4Y49 B;  3EHK A;  3SXO A;  5KHH A;  5J8C A;  1UD1 A;  5BY5 A;  3EFA A;  4FD6 A;  3D82 A;  2H5M A;  3BLN A;  4IF5 A;  1XMT A;  2P6E A;  1QSM A;  3TFY A;  4MGI E;  2PR1 A;  1SEF A;  2PA7 A;  1YFX A;  4J1X A;  3RNS A;  5I8Y A;  1J4J A;  3OWC A;  4KOX A;  1GHE A;  3G7D A;  2PFW A;  3D0J A;  4QX5 A;  3OGJ A;  4KL1 A;  1CM0 A;  2Q0A A; 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 2A4N A;  4MJ8 A;  5CU1 A;  4PIZ A;  1UW8 A;  2PAE A;  1K4J A;  2X7B A;  2Q30 A;  4IES A;  2CV6 A;  3LA7 A;  5I8T A;  4Q0P A;  2Q0Y A;  4E2S A;  2R98 A;  2VBQ A;  5KHK A;  4MI4 A;  4QB9 A;  1ZZ6 A;  4XFG A;  1EY2 A;  1XRU A;  1B6B A;  2XKO A;  4XF1 A;  1I21 A;  2J8R A;  2BL1 A;  4CYD A;  2VQA A;  3BPZ A;  4IEW A;  1ZRC A;  4OAD A;  3SCG A;  1FI2 A;  4KWK A;  5E96 A;  2KXL A;  1PU9 A;  4XF4 A;  2Q4Y A;  4LX9 A;  3W6S A;  1O5L A;  3SCH A;  3H8U A;  3FZ3 A;  1MJA A;  1U6M A;  3IGR A;  1CAV A;  1ZX5 A;  4MGY E;  5BXX A;  4XFB A;  2I79 A;  2IXI A;  4OFG A;  4B5O A;  3SXN A;  3B8G A;  1NE6 A;  3CF6 E;  2GAU A;  4HN1 A;  3N4M A;  3R1K A;  3ELN A;  5DWN A;  4JVA A;  2XHK A;  4QGL A;  3E5X A;  4ZBG A;  1QXR A;  5E1R A;  4MH0 E;  3F0A A;  3D2P A;  2JLM A;  2ZCW A;  3N7Z A;  1I1D A;  2PSW A;  4HSJ A;  1OZP A;  2IC1 A;  5HMN A;  2CAU A;  1FT9 A;  4M3S A;  2B8M A;  1H1M A;  2BEI A;  1X82 A;  4MY0 A;  3WW3 A;  2OZU A;  4QMA A;  1J58 A;  4TLF A;  1XEB A;  4PK2 A;  3RYR A;  4L11 A;  5JR7 B;  1Y7R A;  1PUA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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