The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
111
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sequence length |
431
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structure length |
431
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Chain Sequence |
b'RQTIVQLLSHMRDGKEIREYLHRFSGIDQERFAVIKVGGAVIQDDLPGLASALAFLQTVGLTPVVVHGGGPQLDAALEAADIPTERVDGLRVTRDEAMPIIRDTLTQANLALVDAIRDAGGRAAAVPRGVFEADIVDADKLGRVGEPRHIHLDLVGSAARAGQAAILACLGETPDGTLVNINADVAVRALVHALQPYKVVFLTGTGGLLDEDGDILSSINLATDFGDLMQADWVNGGMRLKLEEIKRLLDDLPLSSSVSITRPSELARELFTHAGSGTLIRRGERMVATDDKSSLDLGRLDNLVKAAFGRPAVEGYWDRLRVDRAFVTESYRAAAITTRLDGWVYLDKFAVLDDARGEGLGRTVWNRMVDYAPQLIWRSRTNNPVNGFYFEECDGAVRRDEWTVFWRGEMGPVEVADVVEKAFALPPTLEA'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of N-acetyl-L-glutamate synthase/kinase from Maricaulis maris with the allosteric inhibitor L-arginine bound.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
N-acetylglutamate kinase / N-acetylglutamate synthase
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| source organism |
Maricaulis maris
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| molecule tags |
Transferase/transferase inhibitor
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| total genus |
111
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| structure length |
431
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| sequence length |
431
|
| chains with identical sequence |
B, X, Y
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| ec nomenclature |
ec
2.3.1.1: Amino-acid N-acetyltransferase. |
| pdb deposition date | 2013-05-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00696 | AA_kinase | Amino acid kinase family |
| A | PF04768 | NAT | NAT, N-acetyltransferase, of N-acetylglutamate synthase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Aminopeptidase | Aminopeptidase | ||
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Carbamate kinase | Acetylglutamate kinase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Z9D A; 2B4B A; 2FIA A; 3ZZF A; 3LL5 A; 3K9U A; 3C26 A; 3PGP A; 1RO5 A; 2B3V A; 3EO4 A; 3N7Z A; 3S6K A; 1RXT A; 2IL4 A; 2OH1 A; 2REE A; 5EC4 A; 4QBJ A; 2Q7B A; 2R98 A; 1GS5 A; 3AB2 A; 5FVJ A; 4NCZ A; 4H89 A; 3F8K A; 2B3U A; 4Q1T A; 4QC6 A; 3QB8 A; 4H6Z A; 4MI4 A; 3UY5 A; 1SQH A; 3AB4 A; 1QSM A; 2K5T A; 3D41 A; 3LOD A; 1XIX A; 5IX3 A; 4NF1 A; 1OHA A; 4FD5 A; 1V0C A; 3EFA A; 1VHS A; 5F48 A; 3TE4 A; 2EUI A; 4AXS A; 4PK2 A; 1YR0 A; 3F5B A; 3KZF A; 2HQY A; 2JJ4 A; 4XPD B; 4U9Y A; 2PRB A; 4QB9 A; 1N71 A; 1E19 A; 3IWG A; 5KTC A; 2PR1 A; 1MJA A; 4M3S A; 4MJ8 A; 1KUX A; 1YRE A; 2J0W A; 4OAE A; 2I00 A; 3I3G A; 2A1F A; 3K4O A; 4ONU A; 3VWE A; 2ARH A; 4K30 A; 1IID A; 3GY9 A; 3C1N A; 3R9G A; 1KUV A; 2G0B A; 2BSW A; 1WK4 A; 2FXF A; 2WPW A; 3FB3 A; 4ZBG A; 4AVC A; 2BUF A; 4KOS A; 3FIX A; 4RS2 A; 1Q2D A; 2B58 A; 2AP9 A; 4F6T A; 4F6T B; 4UWI A; 4FD7 A; 3R9F A; 3NE7 A; 3KKW A; 5DWM A; 5F49 A; 4AG7 A; 4Y49 C; 1YLE A; 2Z11 A; 2ZXV A; 3WWM A; 4XNH C; 3PP9 A; 2P0W A; 3SXO A; 5HH1 A; 4JLY A; 4R57 A; 5ISV A; 4RI1 A; 3EY5 A; 4F6A A; 4B5P B; 2OZH A; 2GAN A; 2CY2 A; 1OZP A; 3K4Y A; 1Q2Y A; 4NDP A; 2PDO A; 3AAW A; 2J0X A; 3V8I A; 1L0C A; 4NDP B; 3JVN A; 4A7X A; 3L76 A; 3TVI A; 3TT2 A; 2ZW5 A; 2X7B A; 2JJX A; 2OB0 A; 1TIQ A; 3JUW A; 1S7K A; 3DR8 A; 4MY0 A; 3TTH A; 4KOW A; 3D40 A; 5I0C A; 4JXQ A; 4KOU A; 1KZF A; 2BUE A; 5DWN A; 5CNP A; 2FCK A; 1B87 A; 2VQY A; 1Z4R A; 1I12 A; 2R7H A; 1Y9W A; 3RYO A; 3D2P A; 4R3K A; 5F46 A; 1S7L A; 4KZT A; 3S6H A; 4BMH A; 1LRZ A; 1MK4 A; 1Y9K A; 1Z9U A; 3QAH A; 1YX0 A; 2D4O A; 1K4J A; 1MJB A; 2J8M A; 3R1K A; 3FBU A; 3ZZH A; 2BNF A; 3TO9 A; 1CJW A; 2FL4 A; 2A4N A; 3QVF A; 1XF8 A; 2OU2 A; 2QML A; 1XEB A; 2KCW A; 3DNS A; 4R9M A; 4PV6 A; 1U6M A; 2B4D A; 3EC4 A; 2Q04 A; 5IB0 A; 4OLL A; 2B4D B; 2CNS A; 4NXY A; 2RD5 A; 4JZ9 A; 2IJ9 A; 2QEC A; 5GCN A; 2RC4 A; 4MHD A; 2DXQ A; 2J4K A; 2WE5 A; 4I49 A; 3LD2 A; 3MGD A; 1YGH A; 1NSL A; 2AKO A; 3B8G A; 2Y0M A; 3ZJ0 A; 4AB7 A; 2JDC A; 1P4N A; 2BL1 A; 1Z4E A; 2R1I A; 2CDQ A; 1MJ9 A; 2I79 A; 1YVO A; 4JJX A; 2Q4Y A; 4JWP A; 4R3L A; 4MY3 A; 2REF A; 4AVA A; 2B5G A; 2D4P A; 2B5G B; 1NE9 A; 1OH9 A; 1CM0 A; 4L89 A; 4KVX A; 3GKR A; 3K56 A; 3G8W A; 4F0Y A; 4QVT A; 2NMT A; 2J4J A; 4AVB A; 4M85 A; 2VEZ A; 1GSJ A; 2FE7 A; 1QSN A; 1J4J A; 2GIV A; 3L86 A; 4CS0 B; 3K52 A; 1IIC A; 5C88 A; 3T7B A; 1IYL A; 4LUA A; 5IV0 A; 3D8P A; 3FNC A; 1BO4 A; 4R87 A; 3F0A A; 3I9S A; 4CRZ B; 3WWN A; 4Y49 B; 4CAX A; 3S6F A; 1B7B A; 3OWC A; 1PUA A; 4XNH B; 2W21 A; 3P2H A; 4X5K A; 2G3T A; 3G3S A; 4KVM E; 1M44 A; 2V4Y A; 2EVN A; 3C20 A; 1S5K A; 2V5H A; 4KVO E; 4EVY A; 4U9Z A; 2HMF A; 1GHE A; 2P6G A; 3C1M A; 5HMN A; 1Q2C A; 3FYN A; 4IUS A; 4HNX B; 3LKK A; 3QUO A; 1I21 A; 2JEV A; 3EXN A; 3ZZI A; 2PSW A; 4AG9 A; 2FSR A; 2P6F A; 1PU9 A; 2HV2 A; 4FD6 A; 3EK6 A; 3PZJ A; 1M1D A; 3SXN A; 2C27 A; 1XE4 A; 3R95 A; 3EK5 A; 2QIR A; 2Z10 A; 4H6U A; 1YK3 A; 2BMU A; 2E9Y A; 2CNM A; 4NEX A; 4KLW A; 5EBV A; 1OHB A; 4YRH A; 3H4Q A; 2J8N A; 3QUR A; 2F5I A; 4XPL A; 1BOB A; 4KOV A; 2G3A A; 4KUA A; 2WPX A; 3BJ7 A; 4KUB A; 2ZW6 A; 3S6G A; 3ZZG A; 3U6U A; 3LL9 A; 3SHP A; 3WR7 A; 3T9Y A; 4A7W A; 4KOT A; 4II9 A; 5JPH A; 2FIW A; 3VWD A; 4CRY B; 2OGX A; 1WWZ A; 2OGX B; 1QST A; 3TO7 A; 1S3Z A; 3GYA A; 3DR6 A; 4E2A A; 4GS4 A; 3TO6 A; 2OZG A; 3T90 A; 3QVH A; 1I1D A; 2PQ8 A; 3W6X A; 1QSO A; 3TOB A; 3D2M A; 1S60 A; 2Q4V A; 4IF5 A; 2VZY A; 3QUN A; 4MBU A; 1ON0 A; 3FRM A; 2O28 A; 5JQ4 A; 4L8A A; 4NDR A; 2WXB A; 3R96 A; 2BRX A; 4NDR B; 1QSR A; 1M4I A; 5KTD A; 2OZU A; 3P2F A; 2CNT A; 2VXK A; 3R9E A; 4UBR A; 2VI7 A; 4NDO A; 1IYK A; 2BRI A; 4XPD C; 4JXR A; 4U5Y A; 4NDO B; 3TCV A; 5C82 A; 4OLC A; 3IGR A; 3DSB A; 4E0A A; 2ZPA A; 3CXS A; 2JI5 A; 3DDD A; 4ORF A; 4YFJ A; 2J5T A; 2ZW4 A; 5KTA A; 4UA3 A; 4NDQ A; 1UFH A; 4NDQ B; 4KLV A; 4UWJ A; 2VA1 A; 1NMT A; 4FD4 A; 2JDD A; 2R8V A; 4OAD A; 1M4D A; 2J5V A; 4HNY B; 4USJ A; 1S7F A; 3CXQ A; 3FXT A; 1FY7 A; 4J3G A; 4LX9 A; 2Z0Z A; 4B5O A; 3TFY A; 4HKF A; 1YBD A; 5F47 A; 4DNC A; 3NWY A; 1B6B A; 2ZW7 A; 2BND A; 4YGO A; 2VZZ A; 2BTY A; 2WE4 A; 1P0H A; 1Y7R A; 1IB1 E; 2GE3 A; 2AE6 A; 2X2W A; 2P6E A; 2FT0 A; 4JD6 A; 5E96 A; 2Q44 A; 2BEI A; 3W91 A; 1YVK A; 4JZ7 A; 4B5P A; 2VBQ A; 1VKC A; 2JLM A; 2Q0Y A; 2FS5 A; 4PSW A; 5H84 A; 2PC1 A; 3CXP A; 4QUS A; 5J8F A; 4JZ8 A; 1M4G A; 4KOX A; 4PSX A; 3W6S A; 1S7N A; 3BLN A; 3BJ8 A; 2BNE A; 1R57 A; 2J4L A; 1XMT A; 4PK3 A; 5H86 A; 4KOR A; 2ATR A; 3E0K A; 2AJ6 A; 4NSQ A; 4HNW B; 3TOA A; 4CAW A; 2HUZ A; 3D3S A; 4KOY A; 4E8O A; 1KUY A; 2H5M A; 2PR8 A; 5J8C A; 2J8R A; 4CAV A; 4XPK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2NSM A; 1Z9D A; 2B4B A; 2FIA A; 2POK A; 3D7H A; 5LRK A; 3ZZF A; 3LL5 A; 2RFH A; 3K9U A; 4P45 A; 3I1U A; 3C26 A; 3PGP A; 4PXD A; 4EWT A; 1RO5 A; 1F2O A; 2B3V A; 3EO4 A; 3N7Z A; 1RXT A; 3PB4 X; 4UIB A; 4WJB A; 3S6K A; 2IL4 A; 2OH1 A; 2PJ0 A; 2REE A; 2V8V A; 5EC4 A; 4QBJ A; 3FF3 A; 2Q7B A; 2R98 A; 5K8N A; 3NH5 A; 1GS5 A; 5FVJ A; 3AB2 A; 3LMS A; 3GIU A; 4NCZ A; 3MRU A; 2GRE A; 3FX6 A; 1TF9 A; 4H89 A; 3F8K A; 2B3U A; 4GXH A; 4Q1T A; 4QC6 A; 1TKJ A; 2Q51 A; 2ZED A; 3KQX A; 3QB8 A; 1M4L A; 4H6Z A; 4MI4 A; 1SQH A; 3UY5 A; 5AGE A; 2DEA A; 4MFZ A; 3AB4 A; 1QSM A; 2K5T A; 2Z3P A; 3D41 A; 3LOD A; 1QMU A; 1XIX A; 2FVG A; 5IX3 A; 2XEJ A; 4NF1 A; 2Q4Z A; 5HXD A; 1OHA A; 4FD5 A; 1V0C A; 3CT9 A; 3EFA A; 3H8E A; 5G21 A; 1VHS A; 5F48 A; 3TE4 A; 2EUI A; 4AXS A; 4PK2 A; 1YR0 A; 1R43 A; 3F5B A; 3KZF A; 2HQY A; 2C6G A; 2GFQ A; 3SJF A; 4XPD B; 2JJ4 A; 1CP6 A; 4U9Y A; 2PRB A; 3NA6 A; 4QB9 A; 3SJG A; 1N71 A; 4IAV A; 5G20 A; 1EE3 P; 4A37 A; 1E19 A; 3IWG A; 4HPS A; 3BI0 A; 3FED A; 3B35 A; 5KTC A; 2PR1 A; 1MJA A; 2V8H A; 2EO8 A; 4M3S A; 4R8F A; 4MJ8 A; 1KUX A; 2PVV A; 4YWY A; 4M6I A; 1YRE A; 2J0W A; 4OAE A; 2I00 A; 3I3G A; 2A1F A; 3K4O A; 4ONU A; 3DLJ A; 4Q7A A; 1LOK A; 1ZG9 A; 3RAM A; 2ZEO A; 3VWE A; 1HDU A; 2ARH A; 4K30 A; 1IID A; 4NJQ A; 3GY9 A; 4OIW A; 3C1N A; 3FVL A; 2YNE A; 3K9T A; 1FT7 A; 1KUV A; 3R9G A; 2G0B A; 4C2Y A; 4PPZ A; 4R76 A; 2BSW A; 1WK4 A; 2FXF A; 2WPW A; 2PJ7 A; 3FB3 A; 4ZBG A; 2C6P A; 4AVC A; 4KOS A; 2BUF A; 3FIX A; 3NE8 A; 4RS2 A; 1Q2D A; 2PJ2 A; 2Q43 A; 2B58 A; 1Z8T A; 2YND A; 1XRY A; 4FUU A; 4UEF A; 2AP9 A; 4F6T A; 4F6T B; 5HVH A; 4ZY1 A; 2ZEL A; 3KQZ A; 4M6H A; 3IU2 A; 4UWI A; 4FD7 A; 3R9F A; 4UCP A; 3NE7 A; 3KKW A; 5DWM A; 5F49 A; 2DF5 A; 5HVF A; 4AG7 A; 1X10 A; 4Y49 C; 3VAT A; 1YLE A; 1Y7E A; 2Z11 A; 4OC0 A; 2ZXV A; 3PRT A; 3RZA A; 2XEG A; 4XNH C; 1VIX A; 3WT4 A; 3WWM A; 3PP9 A; 3T8W A; 4UEE A; 2P0W A; 3SXO A; 3B3W A; 1VHE A; 1Z8X A; 3H8G A; 5HH1 A; 4JLY A; 1PCA A; 4JYW A; 4R57 A; 3B7I A; 3BI1 A; 3KR5 A; 2ZOF A; 3EY5 A; 4MCS A; 4RI1 A; 1Z2L A; 4A95 A; 4B5P B; 4F6A A; 2OZH A; 1ELM P; 2GAN A; 3D7G A; 3V38 A; 2CY2 A; 2PJ6 A; 2I3C A; 2JBK A; 1OZP A; 4BIN A; 3K4Y A; 1Z8L A; 2O53 A; 1Q2Y A; 2PIZ A; 4NDP A; 2PVW A; 4FWU A; 3KZW A; 2PDO A; 3AAW A; 2J0X A; 3V8I A; 1L0C A; 4NDP B; 2DPS A; 3JVN A; 3L76 A; 4A7X A; 3WC6 A; 3TVI A; 2PJA A; 3TT2 A; 2ZW5 A; 5J1Q A; 2X7B A; 1CBX A; 3PBE A; 3D7F A; 2JJX A; 2OB0 A; 1TIQ A; 3JUW A; 4TWE A; 1ZG7 A; 4Q36 A; 1Y0Y A; 1S7K A; 3DR8 A; 4MY0 A; 4F0X A; 3TTH A; 4KOW A; 3D40 A; 2EBJ A; 2ANP A; 5I0C A; 4JXQ A; 4KOU A; 1ZLH A; 4B11 A; 2YNC C; 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