The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
41
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sequence length |
184
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structure length |
177
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Chain Sequence |
DFPYDLNALFPERISVLDSNLSRPDPLPQVTTVIDELGKASSKAQQLPAPITSAAKLQANRHHLYLLKDGEQNGGRGVIVGFLKVGYKKLFLLDQRGAHLETEPLCVLDFYVTETLQRHGYGSELFDFMLKHKQVEPAQMAYDRPSPKFLSFLEKRYDLRNSVPQVNNFVVFAGFFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of DrMEC-17 residue 2-185 at 2.85 Angstroms resolution
rcsb |
| molecule keywords |
Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1
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| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Danio rerio
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| total genus |
41
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| structure length |
177
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| sequence length |
184
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
2.3.1.108: Alpha-tubulin N-acetyltransferase. |
| pdb deposition date | 2015-03-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF05301 | Acetyltransf_16 | GNAT acetyltransferase, Mec-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Aminopeptidase | Aminopeptidase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5KTD A; 3EXN A; 3S6F A; 2R8V A; 2VQY A; 3PZJ A; 5I0C A; 2NMT A; 5JPH A; 2HUZ A; 2ZW7 A; 3FNC A; 1SQH A; 3R96 A; 4KLW A; 2VZY A; 2A4N A; 4UBR A; 1VHS A; 3DNS A; 5F48 A; 2ZW5 A; 5C82 A; 3PGP A; 4NF1 A; 1Q2Y A; 3QB8 A; 4R57 A; 2PR1 A; 1BO4 A; 1M4I A; 4MJ8 A; 1R57 A; 2FS5 A; 3F0A A; 4ZBG A; 2J8M A; 1Q2D A; 4ORF A; 3P2H A; 1KZF A; 1YVK A; 1YK3 A; 2PR8 A; 4KVX A; 2CNT A; 2ZPA A; 4HNW B; 4OLL A; 4NSQ A; 1M4D A; 3TCV A; 1Z4E A; 3TFY A; 4KZT A; 1YLE A; 1WK4 A; 3FRM A; 4CAV A; 3B8G A; 2JEV A; 5CNP A; 4JXQ A; 5H84 A; 3W6X A; 5J8F A; 3QAH A; 5ISV A; 4BMH A; 2JDD A; 2CY2 A; 2AJ6 A; 2B5G B; 5KTA A; 5F47 A; 2RC4 A; 1PUA A; 3R95 A; 2WPW A; 3TO9 A; 3UY5 A; 2CNS A; 1FY7 A; 4AVA A; 2ARH A; 3BJ7 A; 4LUA A; 4CRY B; 2KCW A; 3G8W A; 1M4G A; 1YR0 A; 4KOY A; 3W91 A; 2ZW4 A; 4XPD C; 3DR6 A; 3VWE A; 1WWZ A; 2P6E A; 1MK4 A; 3TOB A; 2VEZ A; 4NEX A; 2HV2 A; 4AG7 A; 1TIQ A; 3JUW A; 2Q4Y A; 5GCN A; 4FD6 A; 1MJA A; 1CM0 A; 3BLN A; 4KVM E; 4HKF A; 1KUV A; 1IYL A; 1I12 A; 1QSN A; 1QSR A; 4KLV A; 4KOT A; 4PV6 A; 5EC4 A; 1QSM A; 2REF A; 2ZXV A; 2EVN A; 4F0Y A; 2F5I A; 2QIR A; 5E96 A; 2OZU A; 1IB1 E; 2G0B A; 4PSW A; 3C26 A; 3D2M A; 2R7H A; 2R98 A; 2BL1 A; 1YVO A; 4QUS A; 2B3U A; 5H86 A; 3D3S A; 3SXO A; 4PSX A; 4YGO A; 3FBU A; 1OZP A; 3LD2 A; 3LOD A; 1V0C A; 2FIW A; 3I9S A; 5DWN A; 3JVN A; 2FSR A; 4B5O A; 1J4J A; 2Z0Z A; 3VWD A; 4FD7 A; 4YFJ A; 2Z11 A; 1XE4 A; 2OB0 A; 4UWI A; 5F49 A; 1YX0 A; 4J3G A; 3CXQ A; 1ON0 A; 2HQY A; 1XF8 A; 3TE4 A; 3TO6 A; 2PQ8 A; 1KUY A; 2J8R A; 4II9 A; 5KTC A; 4R3L A; 4AB7 A; 4RS2 A; 2BUE A; 3FB3 A; 4JLY A; 1S7L A; 3CXS A; 1S5K A; 4L8A A; 4FD4 A; 4NXY A; 1S60 A; 3BJ8 A; 4M3S A; 2FE7 A; 3EFA A; 5HMN A; 4JWP A; 5DWM A; 2P0W A; 4AVC A; 1VKC A; 2FXF A; 1GHE A; 1L0C A; 4JD6 A; 4CS0 B; 4AVB A; 4U9Z A; 5IX3 A; 3D2P A; 4U5Y A; 2R1I A; 4MHD A; 2BSW A; 2VXK A; 2D4P A; 4JXR A; 3EO4 A; 4K30 A; 2PSW A; 4Y49 B; 1NE9 A; 1NSL A; 2J8N A; 4RI1 A; 3TTH A; 4E0A A; 5J8C A; 2BEI A; 2JLM A; 3P2F A; 2Q0Y A; 1RXT A; 3GKR A; 4KVO E; 2B5G A; 4H6Z A; 5IV0 A; 1N71 A; 4ONU A; 3TOA A; 2DXQ A; 4MY3 A; 2GAN A; 3TT2 A; 4B5P B; 3WR7 A; 1QSO A; 4EVY A; 2D4O A; 3H4Q A; 2P6G A; 2Y0M A; 3I3G A; 4KOR A; 4MBU A; 4F6A A; 4XPK A; 3SHP A; 4HNY B; 2VZZ A; 3OWC A; 3S6H A; 1LRZ A; 1IIC A; 4KOV A; 3V8I A; 4XNH B; 1M1D A; 1BOB A; 3K9U A; 2Q7B A; 2IL4 A; 3PP9 A; 2CNM A; 1RO5 A; 1PU9 A; 2ZW6 A; 3S6G A; 4R87 A; 1UFH A; 3R9E A; 1S7F A; 4YRH A; 3DSB A; 1B87 A; 4OAE A; 2QEC A; 4H89 A; 2Q4V A; 1P0H A; 4KOU A; 4PK3 A; 3R9F A; 2Z10 A; 3F5B A; 3S6K A; 3IWG A; 2FIA A; 1MJ9 A; 1Y7R A; 4E8O A; 4KUA A; 1YRE A; 4QBJ A; 3N7Z A; 1I1D A; 4CAX A; 4IF5 A; 2FT0 A; 2EUI A; 2QML A; 3G3S A; 1CJW A; 2G3T A; 2OU2 A; 1XIX A; 4KUB A; 1YGH A; 4QVT A; 1Y9W A; 3DR8 A; 3IGR A; 3D8P A; 1XMT A; 4FD5 A; 4KOW A; 1Z9U A; 2C27 A; 2FL4 A; 2JDC A; 1S7N A; 5EBV A; 2I00 A; 3EC4 A; 4R3K A; 2X7B A; 5F46 A; 2OH1 A; 3FIX A; 2B3V A; 4U9Y A; 2VBQ A; 4GS4 A; 3R1K A; 4KOS A; 4NCZ A; 4QB9 A; 5FVJ A; 3T9Y A; 2Q44 A; 3CXP A; 4QC6 A; 4L89 A; 1B6B A; 3RYO A; 2GIV A; 5HH1 A; 2FCK A; 1Z4R A; 2PDO A; 4DNC A; 4IUS A; 4UA3 A; 2VI7 A; 3R9G A; 3GYA A; 2B4D B; 4I49 A; 3KKW A; 4Y49 C; 3ZJ0 A; 4MY0 A; 4UWJ A; 4XPD B; 2PC1 A; 1Q2C A; 3F8K A; 4LX9 A; 3FXT A; 4JJX A; 3ZZI A; 4CAW A; 1IID A; 4KOX A; 1S3Z A; 2GE3 A; 5C88 A; 1Y9K A; 2OZH A; 1NMT A; 2B4B A; 4PK2 A; 3SXN A; 4HNX B; 2G3A A; 3W6S A; 1I21 A; 2I79 A; 1K4J A; 4X5K A; 1QST A; 4R9M A; 1U6M A; 3EY5 A; 3MGD A; 2Q04 A; 2O28 A; 4E2A A; 2B4D A; 1XEB A; 2P6F A; 5IB0 A; 2REE A; 5JQ4 A; 4H6U A; 1P4N A; 4CRZ B; 2ATR A; 3TO7 A; 4XNH C; 1M44 A; 1S7K A; 3DDD A; 4MI4 A; 4B5P A; 4OAD A; 2PRB A; 2OZG A; 3FYN A; 4AG9 A; 2WPX A; 3GY9 A; 4XPL A; 2B58 A; 2H5M A; 2K5T A; 3NE7 A; 1IYK A; 3E0K A; 4M85 A; 3T90 A; 1KUX A; 1MJB A; 2AE6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5KTD A; 3EXN A; 1CP6 A; 2NSM A; 3S6F A; 2R8V A; 2VQY A; 2PJ3 A; 4MFZ A; 3SI2 A; 2ABZ A; 3IC1 A; 1ZG7 A; 1JQG A; 3PZJ A; 5I0C A; 2NMT A; 5JPH A; 1IOF A; 1XRY A; 2HUZ A; 3LAC A; 4F0X A; 3D7H A; 5AG7 A; 2ZW7 A; 3FNC A; 4UEE A; 2HB6 A; 3B3V A; 3B7I A; 1TXR A; 4ZGY B; 1SQH A; 3R96 A; 4KLW A; 1BLL E; 3RZA A; 2VZY A; 2A4N A; 4UBR A; 1VHS A; 2EO8 A; 3DNS A; 3IJ3 A; 4OC0 A; 3DGV A; 3PB9 X; 3H8G A; 5F48 A; 4PXC A; 2ZW5 A; 3KZW A; 5C82 A; 3PGP A; 2JEW A; 4NF1 A; 4P10 A; 1Q2Y A; 3QB8 A; 2Q43 A; 4R57 A; 4UIA A; 3SJE A; 4A33 A; 2PR1 A; 1BO4 A; 1M4I A; 4MJ8 A; 1Z5R A; 2AFU A; 3H5Z A; 1R57 A; 2FS5 A; 2WUU A; 4M6I A; 3F0A A; 4OP4 A; 2PIZ A; 3JRU A; 3PBE A; 1XMB A; 4ZBG A; 2J8M A; 4B10 A; 2PVW A; 5G20 A; 1Q2D A; 4ORF A; 3P2H A; 1KZF A; 1YVK A; 1YK3 A; 2PR8 A; 4KVX A; 2CNT A; 2ZPA A; 4HNW B; 4OLL A; 4NSQ A; 1BPM A; 1ZG8 A; 1M4D A; 2EK9 A; 3TCV A; 1Z4E A; 3TFY A; 4KZT A; 1YLE A; 1WK4 A; 4ZY0 A; 2PJC A; 3FRM A; 4CAV A; 4B13 A; 3B8G A; 2FVG A; 2JEV A; 5CNP A; 2GLJ A; 4JXQ A; 5H84 A; 1TF8 A; 2Z3N A; 2CTB A; 1TF9 A; 1VIX A; 1X10 A; 3W6X A; 5J8F A; 2GFQ A; 3QAH A; 5ISV A; 4BMH A; 3SI0 A; 4M6H A; 2JDD A; 4P4B A; 1ARM A; 2CY2 A; 2AJ6 A; 1AUG A; 3FED A; 2B5G B; 5A28 A; 5KTA A; 4MFL A; 5F47 A; 2PVV A; 5A27 A; 1PYT B; 2RC4 A; 4ZI6 A; 1PUA A; 1YLO A; 2PJA A; 4Q36 A; 2O53 A; 2Q4Z A; 4MRI A; 3R95 A; 4OC3 A; 3CZX A; 2WPW A; 1XFO A; 3TO9 A; 3ISX A; 2OR4 A; 4MCQ A; 3UY5 A; 2CNS A; 1FY7 A; 2AFM A; 4AVA A; 2ARH A; 3WC6 A; 3MRU A; 1F2P A; 1Z8X A; 1CG2 A; 3BJ7 A; 2PJ6 A; 4B11 A; 4LUA A; 4CRY B; 5LRK A; 2KCW A; 5K8O A; 3G8W A; 1M4G A; 4RUH A; 3RO0 A; 1YR0 A; 1ZLI A; 3FX6 A; 4KOY A; 4TNU A; 3W91 A; 2ZW4 A; 2V8D A; 4XPD C; 3DR6 A; 3VWE A; 1WWZ A; 3NH8 A; 2P6E A; 4OKO A; 1MK4 A; 2QVP A; 3V7Z A; 3HUV A; 2VEZ A; 3NH4 A; 2PJB A; 4NEX A; 3TOB A; 4A30 A; 2HV2 A; 4AG7 A; 2RB7 A; 4G1P A; 2PJ2 A; 1TIQ A; 2WYR A; 3JUW A; 2Q4Y A; 5GCN A; 4FD6 A; 4RN7 A; 4B6Z A; 1H8L A; 2POK A; 1MJA A; 5G21 A; 4YU9 A; 4CGM A; 1CM0 A; 3BLN A; 4KVM E; 4PPZ A; 4HKF A; 4NGM A; 1KUV A; 1IYL A; 1I12 A; 1QSN A; 2ZEG A; 1BPN A; 1QSR A; 4P45 A; 2GU2 A; 2PJ1 A; 4KLV A; 4DJL A; 4KOT A; 4PV6 A; 3IO1 A; 1CX8 A; 1AMP A; 5EC4 A; 1HEE A; 1LOK A; 1QSM A; 2REF A; 2ZXV A; 1YQE A; 2EVN A; 4F0Y A; 2F5I A; 3PEI A; 2QIR A; 4OC5 A; 5E96 A; 1LFW A; 1IB1 E; 1TKF A; 2OZU A; 2G0B A; 2PJ0 A; 4PSW A; 3PFO A; 4FAI A; 3C26 A; 3KQZ A; 3D2M A; 1TKH A; 5K8N A; 2DEA A; 1R43 A; 2R7H A; 2R98 A; 2BCO A; 2ANP A; 2BL1 A; 1YVO A; 4QUS A; 4YWY A; 2B3U A; 5H86 A; 2O4H A; 3D3S A; 3SXO A; 2YNE A; 4PSX A; 4EFD A; 4YGO A; 2Q7S A; 3D67 A; 1OZP A; 3FBU A; 3FJU A; 5LRJ A; 3LD2 A; 2Q51 A; 1V0C A; 3LOD A; 4NFR A; 2FIW A; 2ZEO A; 1F2O A; 3GUX A; 4UCP A; 5G22 A; 4WJB A; 3I9S A; 5DWN A; 4UEZ A; 3JVN A; 2FSR A; 2IMO A; 2C6P A; 3SJF A; 4B5O A; 4BIN A; 1J4J A; 4CGL A; 5CPA A; 2Z0Z A; 2YND A; 3H8F A; 2WZN A; 3VWD A; 4FD7 A; 4YFJ A; 2Z11 A; 4IAV A; 1XE4 A; 3B2Y A; 3WT4 A; 4R76 A; 2OB0 A; 2Z3L A; 4UWI A; 2NYQ A; 4R7M A; 1Z8W A; 1R3N A; 2EWB A; 3CPX A; 5HXD A; 4W9Y A; 5F49 A; 2YNC A; 2Z3M A; 1YX0 A; 1FNO A; 2CIJ A; 4P4I A; 4J3G A; 1LAM A; 1ON0 A; 2HQY A; 2Z3O A; 2I3C A; 3CXQ A; 5K8M A; 3TX8 A; 5JGF A; 4PXD A; 1XF8 A; 3TE4 A; 4KSA A; 4UFW A; 3TO6 A; 3BI1 A; 7CPA A; 2PQ8 A; 1CPS A; 1KUY A; 3VAR A; 4MFP A; 3VAT A; 3PRT A; 2J8R A; 4II9 A; 5KTC A; 2IJZ A; 3B3T A; 4OC4 A; 4R3L A; 2BO9 A; 2JBK A; 3B3C A; 4AB7 A; 3IU1 A; 3KI9 A; 4HPS A; 3PFE A; 4OME A; 3QNV A; 4RS2 A; 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1LAP A; 3GKR A; 4KVO E; 2B5G A; 4H6Z A; 2EK8 A; 5IV0 A; 2V8G A; 5ELY A; 4A2Z A; 1N71 A; 4ONU A; 3TOA A; 2DXQ A; 4JYW A; 2GAN A; 2V8H A; 4MY3 A; 3TT2 A; 4B5P B; 4P44 A; 4DUK A; 3WR7 A; 4F9U A; 2XEG A; 4A39 A; 1QSO A; 4EVY A; 2D4O A; 3JTK A; 4NJR A; 3DLJ A; 4PQA A; 3RAM A; 4LQG A; 3H4Q A; 2P6G A; 2Y0M A; 3I3G A; 4GXH A; 4KOR A; 2WSA A; 4MBU A; 4F6A A; 4XPK A; 3SHP A; 4HNY B; 2VZZ A; 3OWC A; 3S6H A; 1LRZ A; 5LYF A; 2DPS A; 1IIC A; 4MFQ A; 4AXV A; 2XEI A; 4KOV A; 3V8I A; 4XNH B; 4ZYQ A; 1M1D A; 4C2Y A; 1BOB A; 4MHN A; 3K9U A; 2PJ9 A; 2Q7B A; 2IL4 A; 3PP9 A; 3TC8 A; 1YSJ A; 2QJ8 A; 2CNM A; 1QQ9 A; 1PU9 A; 1RO5 A; 2C6G A; 2YNC C; 2ZW6 A; 3FF3 A; 4R87 A; 2C1C A; 5HVF A; 3S6G A; 4F9V A; 1HDQ A; 3KL9 A; 4C7H A; 1PCA A; 3LWU A; 1UFH A; 4O23 A; 3R9E A; 1S7F A; 3GIU A; 3PBB A; 4YRH A; 3DSB A; 1B87 A; 3QAY A; 4A31 A; 1DTD A; 3CT9 A; 3D7D A; 4OAE A; 4ONW A; 5CBM A; 4CGP A; 2ZED A; 1IGB A; 2QEC A; 2PRQ A; 3PB4 X; 4H89 A; 2Q4V A; 2V8V A; 1P0H A; 1TKJ A; 4KOU A; 4PK3 A; 3R9F A; 2Z10 A; 2GRE A; 3F5B A; 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