The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
41
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sequence length |
184
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structure length |
177
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Chain Sequence |
DFPYDLNALFPERISVLDSNLSRPDPLPQVTTVIDELGKASSKAQQLPAPITSAAKLQANRHHLYLLKDGEQNGGRGVIVGFLKVGYKKLFLLDQRGAHLETEPLCVLDFYVTETLQRHGYGSELFDFMLKHKQVEPAQMAYDRPSPKFLSFLEKRYDLRNSVPQVNNFVVFAGFFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of DrMEC-17 residue 2-185 at 2.85 Angstroms resolution
rcsb |
| molecule keywords |
Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1
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| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Danio rerio
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| total genus |
41
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| structure length |
177
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| sequence length |
184
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
2.3.1.108: Alpha-tubulin N-acetyltransferase. |
| pdb deposition date | 2015-03-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF05301 | Acetyltransf_16 | GNAT acetyltransferase, Mec-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Aminopeptidase | Aminopeptidase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3R9E A; 1IIC A; 4OAD A; 2B5G B; 3GYA A; 2HV2 A; 3SHP A; 4K30 A; 2Q4V A; 3FYN A; 2R8V A; 3CXQ A; 5JPH A; 3PGP A; 1VHS A; 1Y9K A; 3S6G A; 2JDD A; 4U9Y A; 5H86 A; 3D2M A; 4YGO A; 2G3T A; 4X5K A; 1YX0 A; 3F8K A; 5I0C A; 4Y49 C; 3BLN A; 2KCW A; 1M4G A; 1U6M A; 3BJ7 A; 2IL4 A; 3K9U A; 2I79 A; 4XPD C; 5H84 A; 2BSW A; 2R7H A; 2Q0Y A; 2GE3 A; 5J8F A; 4KZT A; 1L0C A; 3FRM A; 4YRH A; 4AVB A; 1YVK A; 1BO4 A; 5DWM A; 4M85 A; 3S6F A; 3FXT A; 3JUW A; 4E8O A; 2CNM A; 4XNH B; 1S7L A; 5C88 A; 4B5P A; 4CAV A; 3H4Q A; 1NMT A; 2B4D A; 2HUZ A; 3CXP A; 3EC4 A; 2F5I A; 5EBV A; 4R9M A; 2O28 A; 4JXQ A; 3GKR A; 4J3G A; 4FD6 A; 1Q2C A; 2G3A A; 4NSQ A; 1S7F A; 1I21 A; 3G3S A; 4AB7 A; 4CRZ B; 2FT0 A; 4FD7 A; 1BOB A; 1UFH A; 2QIR A; 3W6S A; 4JXR A; 2WPW A; 3FIX A; 4MHD A; 2Z0Z A; 1KUV A; 4PK2 A; 2FXF A; 3VWD A; 1Z9U A; 2D4P A; 4QB9 A; 4QUS A; 3DR6 A; 3B8G A; 4AG7 A; 1XEB A; 2B58 A; 2FL4 A; 2C27 A; 4H89 A; 2ZPA A; 2J8M A; 4CAW A; 2Q7B A; 1M1D A; 4PSW A; 2ZW5 A; 3RYO A; 1NSL A; 3TTH A; 1MK4 A; 4CS0 B; 4KVO E; 3C26 A; 1Q2Y A; 2JLM A; 2A4N A; 3SXN A; 1RO5 A; 3R95 A; 3ZZI A; 5ISV A; 3TOA A; 5KTC A; 5F47 A; 3JVN A; 3LD2 A; 4JJX A; 2GIV A; 1YRE A; 4DNC A; 5C82 A; 1M44 A; 4NCZ A; 2CNT A; 4MJ8 A; 3I3G A; 2CY2 A; 2REF A; 4L8A A; 1TIQ A; 1IYK A; 3TFY A; 2K5T A; 2RC4 A; 1P0H A; 3TE4 A; 3EXN A; 3V8I A; 4H6U A; 2ARH A; 4NXY A; 3R1K A; 3G8W A; 4XPK A; 4E2A A; 4U5Y A; 2I00 A; 4QVT A; 4ONU A; 4AVC A; 4I49 A; 4MBU A; 3D3S A; 4B5O A; 2EUI A; 4KOY A; 2QEC A; 3IGR A; 4ORF A; 4KOW A; 1NE9 A; 3QAH A; 4IUS A; 1KUY A; 4LUA A; 4OLL A; 1YK3 A; 5IX3 A; 2PQ8 A; 2VQY A; 1IID A; 2FIA A; 1XIX A; 2ZW7 A; 4OAE A; 1SQH A; 5IB0 A; 2P6G A; 2OZH A; 2BL1 A; 1MJA A; 4R3L A; 1WWZ A; 4HNY B; 2CNS A; 1QSO A; 1FY7 A; 3TCV A; 3VWE A; 1S3Z A; 1I1D A; 4HNX B; 1R57 A; 4KLW A; 4BMH A; 5IV0 A; 1Z4E A; 3TT2 A; 1S5K A; 2FE7 A; 1N71 A; 4UWI A; 4II9 A; 2AE6 A; 2OZG A; 2R1I A; 3P2F A; 2Q04 A; 4MY3 A; 4PSX A; 2Z11 A; 2OZU A; 4AVA A; 3FNC A; 4UWJ A; 3UY5 A; 2ZXV A; 2PR8 A; 4KOS A; 4AG9 A; 1XMT A; 2AJ6 A; 3R9F A; 2Y0M A; 2FSR A; 3I9S A; 4IF5 A; 3E0K A; 4Y49 B; 5F48 A; 3PZJ A; 2Q4Y A; 3FBU A; 3LOD A; 4XPD B; 2VBQ A; 4MI4 A; 1XE4 A; 5CNP A; 4EVY A; 5DWN A; 4HNW B; 1P4N A; 1K4J A; 3CXS A; 5F49 A; 3W91 A; 4NEX A; 1MJB A; 2GAN A; 3T9Y A; 1KZF A; 4UA3 A; 4KOX A; 5KTD A; 3GY9 A; 2P0W A; 1Z4R A; 3EFA A; 3W6X A; 1IB1 E; 4HKF A; 2VXK A; 2PDO A; 4KLV A; 3KKW A; 2VEZ A; 2FCK A; 2REE A; 1J4J A; 4XPL A; 3R96 A; 5F46 A; 3WR7 A; 1KUX A; 2Z10 A; 1M4I A; 1XF8 A; 4XNH C; 2PC1 A; 1IYL A; 2G0B A; 4F0Y A; 2NMT A; 1S7K A; 2VZY A; 2DXQ A; 5GCN A; 1PU9 A; 4RI1 A; 1VKC A; 1LRZ A; 2EVN A; 3DSB A; 3DNS A; 2OB0 A; 1YLE A; 1M4D A; 3TO7 A; 1OZP A; 4R87 A; 2J8R A; 2HQY A; 1CJW A; 4R3K A; 1I12 A; 1YGH A; 2D4O A; 1PUA A; 5EC4 A; 4NF1 A; 1YVO A; 4UBR A; 2JEV A; 4JWP A; 4LX9 A; 4GS4 A; 1B6B A; 2ZW6 A; 1V0C A; 2B3V A; 4KUB A; 4R57 A; 1QST A; 2VI7 A; 2X7B A; 2J8N A; 2B3U A; 3TO6 A; 3D2P A; 4JLY A; 3D8P A; 1Q2D A; 2JDC A; 5J8C A; 3F0A A; 3TOB A; 4KVX A; 4JD6 A; 4CRY B; 1Y7R A; 4H6Z A; 5E96 A; 5HMN A; 4KOU A; 4PK3 A; 2Q44 A; 4PV6 A; 5KTA A; 4ZBG A; 2H5M A; 2PRB A; 3NE7 A; 3MGD A; 4KOR A; 1WK4 A; 3QB8 A; 4MY0 A; 1MJ9 A; 1QSR A; 4KOT A; 4B5P B; 3DR8 A; 3P2H A; 3FB3 A; 4F6A A; 1YR0 A; 3R9G A; 2WPX A; 1Y9W A; 3ZJ0 A; 2B4D B; 2FIW A; 4QC6 A; 1S60 A; 3F5B A; 1ON0 A; 2R98 A; 1GHE A; 4RS2 A; 1CM0 A; 2PR1 A; 5HH1 A; 2VZZ A; 4FD4 A; 3IWG A; 2ZW4 A; 4KVM E; 3EY5 A; 2BUE A; 4KOV A; 4QBJ A; 2B4B A; 4U9Z A; 3N7Z A; 2OU2 A; 4L89 A; 4M3S A; 2FS5 A; 1QSM A; 3OWC A; 4CAX A; 2PSW A; 2ATR A; 3S6K A; 3DDD A; 3S6H A; 4YFJ A; 3SXO A; 1S7N A; 3TO9 A; 3T90 A; 3EO4 A; 2QML A; 3PP9 A; 2B5G A; 2OH1 A; 4E0A A; 4KUA A; 1RXT A; 2P6E A; 4FD5 A; 5FVJ A; 3BJ8 A; 1B87 A; 2P6F A; 5JQ4 A; 1QSN A; 2BEI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1XJO A; 3R9E A; 1IIC A; 4OAD A; 2B5G B; 4UFW A; 3GYA A; 2GRE A; 2HV2 A; 3SHP A; 4K30 A; 2Q4V A; 1ELM P; 5K8O A; 3FYN A; 2R8V A; 3CXQ A; 5JPH A; 3PGP A; 2PRQ A; 4OC5 A; 1VHS A; 1Y9K A; 3S6G A; 2JDD A; 4OC1 A; 4A32 A; 2XEI A; 4U9Y A; 1KWM A; 5H86 A; 4A39 A; 4P4I A; 3D2M A; 4P4E A; 3WC6 A; 2G9D A; 1JWQ A; 2NSM A; 3NA6 A; 4YGO A; 3BXM A; 1XFO A; 1IOF A; 2G3T A; 3HUV A; 3FEC A; 4X5K A; 1YX0 A; 2YNC C; 2V8V A; 3B7I A; 2GFQ A; 3F8K A; 4KSA A; 5I0C A; 1IGB A; 1AMP A; 4Y49 C; 2PJ4 A; 1XOV A; 3BLN A; 2KCW A; 1M4G A; 1U6M A; 1Y0Y A; 2IL4 A; 3BJ7 A; 2CTB A; 2I79 A; 3K9U A; 2C6C A; 3KQX A; 4MFQ A; 2BSW A; 2R7H A; 4XPD C; 2Q0Y A; 2ZEE A; 1NSA A; 4IHM A; 2GE3 A; 5J8F A; 4KZT A; 5D29 A; 4RN7 A; 3D7F A; 1GYT A; 1L0C A; 4KS9 A; 4M6H A; 2AFX A; 4DYO A; 2QYV A; 3H5Z A; 1AYE A; 3PBE A; 3FRM A; 3PFE A; 2PJ2 A; 4MFK A; 4P6Y A; 4R8F A; 4YRH A; 3PB7 X; 4AVB A; 3WC5 A; 1YVK A; 1Z8X A; 1BO4 A; 2PJ9 A; 5DWM A; 4M85 A; 5G20 A; 3S6F A; 3FXT A; 2Z3K A; 3JUW A; 4E8O A; 3TC8 A; 5HVG A; 2CNM A; 3ISX A; 3RZA A; 4CGL A; 3VAT A; 5LRG A; 3D67 A; 2DF5 A; 2AFS A; 2BOA A; 4XNH B; 4OC4 A; 1S7L A; 1XRY A; 5C88 A; 4B5P A; 4EWT A; 1LCP A; 4CAV A; 1FT7 A; 3H4Q A; 4ZX8 A; 4PXD A; 1YW6 A; 2NYQ A; 2PJ3 A; 3V38 A; 1NMT A; 2B4D A; 2HUZ A; 3CXP A; 3EC4 A; 2F5I A; 5EBV A; 4M6G A; 4R9M A; 2O28 A; 4JXQ A; 3GKR A; 4A31 A; 4J3G A; 1VHE A; 4A37 A; 4UFX A; 3IWE A; 4MFP A; 2CXA A; 4FD6 A; 1Q2C A; 2G3A A; 2F7V A; 4NSQ A; 3IWW A; 5H84 A; 1S7F A; 2Q51 A; 1I21 A; 1TXR A; 3G3S A; 4AB7 A; 4CRZ B; 2FT0 A; 3B3S A; 3B3W A; 1R3N A; 1HEE A; 1BOB A; 3IU1 A; 4FD7 A; 1UFH A; 2QIR A; 2AFU A; 3W6S A; 4X3R A; 4JXR A; 2WPW A; 1ARL A; 4DUK A; 2PE3 A; 3PEI A; 4ZY1 A; 2Z3L A; 4NGN A; 2CF4 A; 3FIX A; 1BPM A; 1IU8 A; 1CPS A; 4MHD A; 2Z0Z A; 3PRT A; 4P45 A; 1KUV A; 4PK2 A; 2FXF A; 1R43 A; 3VWD A; 1Y0R A; 1JQG A; 2XEF A; 3ISZ A; 2YNE A; 5A28 A; 2ABZ A; 1Z9U A; 2D4P A; 4MXU A; 3SJX A; 4NGQ A; 4QB9 A; 3DR6 A; 4QUS A; 1HDU A; 3IJ3 A; 3B8G A; 3PB9 X; 2DPT A; 2Q7S A; 2YND A; 4AG7 A; 4PXC A; 3WAB A; 1XEB A; 3JTK A; 1XMB A; 2B58 A; 2FL4 A; 2C27 A; 2Q43 A; 4H89 A; 4W9Y A; 2O53 A; 2ZPA A; 2J8M A; 2Z3N A; 4CAW A; 1LOK A; 2HC9 A; 2Q7B A; 1M1D A; 3DGV A; 2ZW5 A; 4PSW A; 3RYO A; 3SJG A; 1NSL A; 2IMO A; 3TTH A; 4B13 A; 4CYP A; 4UIA A; 5HVH A; 2PJ0 A; 1MK4 A; 5JM6 A; 4CS0 B; 5D8N A; 1PCA A; 4KVO E; 3C26 A; 1Q2Y A; 4FBE A; 3H8E A; 4FUU A; 4JYW A; 5LRK A; 2JLM A; 2A4N A; 2HB6 A; 3SXN A; 1RO5 A; 2QVP A; 3R95 A; 2PJ6 A; 3KR5 A; 4OC0 A; 4ZX9 A; 3ZZI A; 5ISV A; 3TOA A; 5KTC A; 5F47 A; 1Y7E A; 3JVN A; 3LD2 A; 5IB9 A; 4JJX A; 2GIV A; 1YRE A; 2WSA A; 3RAM A; 4DNC A; 3SI0 A; 2EK9 A; 5C82 A; 1M44 A; 4NCZ A; 5DS0 A; 2CNT A; 5LRJ A; 4X2T A; 4MJ8 A; 2Z3M A; 2ZEF A; 4A38 A; 1Z2L A; 4KSI A; 3I3G A; 2CY2 A; 2REF A; 3D7H A; 4L8A A; 1TIQ A; 1IYK A; 4WWV A; 5EMI A; 3TFY A; 2K5T A; 4GM5 A; 4HPS A; 2CIJ A; 4MCR A; 4CYO A; 4Q36 A; 2RC4 A; 3PB6 X; 3IC1 A; 1P0H A; 2WYR A; 3SI1 A; 3VH9 A; 3TE4 A; 3EXN A; 3V8I A; 2ZED A; 4PPZ A; 4H6U A; 1F57 A; 2ARH A; 4NXY A; 2ZOG A; 3R1K A; 4EFD A; 3G8W A; 4XPK A; 2GLF A; 4E2A A; 4U5Y A; 5K8M A; 2I00 A; 4C2X A; 4QVT A; 3V7Z A; 4ONU A; 3FF3 A; 4I49 A; 4AVC A; 4ONW A; 4MBU A; 3D3S A; 4B5O A; 1ARM A; 4H2K A; 1CG2 A; 1X10 A; 3D68 A; 2EUI A; 4KOY A; 2QEC A; 3IGR A; 4A95 A; 4ORF A; 4KOW A; 1NE9 A; 2CTC A; 3NH4 A; 3SI2 A; 3QAH A; 4IUS A; 4UEZ A; 1KUY A; 4LUA A; 1BAV A; 2ZOF A; 4B11 A; 4OLL A; 1YK3 A; 2POK A; 4G1P A; 5IX3 A; 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3E0K A; 4UEF A; 3PB8 X; 4Y49 B; 5F48 A; 3PZJ A; 4UCP A; 2Q4Y A; 3FBU A; 2PIY A; 3LOD A; 4XPD B; 2VBQ A; 1YQE A; 4C2Z A; 4MI4 A; 1XE4 A; 4LQ6 A; 5CNP A; 4RUH A; 2BCO A; 3CZX A; 3NH5 A; 3PBB A; 2AFW A; 4EVY A; 5DWN A; 4IK2 A; 4CGN A; 2DEA A; 3K9T A; 1BPN A; 3FEE A; 4HNW B; 1VGY A; 1P4N A; 2ZEG A; 4R7M A; 3WC7 A; 4MCS A; 2V8G A; 1DE4 C; 4A94 A; 2XEJ A; 3B3V A; 1K4J A; 3NH8 A; 3CXS A; 2V8H A; 5F49 A; 3W91 A; 4NEX A; 1MJB A; 2GAN A; 3T9Y A; 2RB7 A; 1KZF A; 4F9V A; 4UA3 A; 4OID A; 4KOX A; 4M6I A; 5KTD A; 3GY9 A; 2P0W A; 4ZGY B; 5G22 A; 1Z4R A; 2ZEH A; 3EFA A; 3LAC A; 3W6X A; 3PB4 X; 4GXH A; 1H8L A; 1IB1 E; 3KI9 A; 5J1Q A; 1YLO A; 4HKF A; 2VXK A; 3KHX A; 2PDO A; 4MCQ A; 4PXB A; 4KLV A; 3SJE A; 3KKW A; 2VEZ A; 2FCK A; 2REE A; 1J4J A; 4XPL A; 2RFH A; 3R96 A; 4ZI6 A; 5F46 A; 3QNV A; 3WR7 A; 2ODF A; 4Q7A A; 1TF8 A; 2OR4 A; 1KUX A; 1X12 A; 2AFZ A; 2Z10 A; 4CYN A; 1ELL P; 2PJA A; 3B35 A; 3KHZ A; 2PJC A; 1M4I A; 3D66 A; 2JBJ A; 3GB0 A; 2PCU A; 3FX6 A; 1XF8 A; 4XNH C; 1IOI A; 2PC1 A; 4MFJ A; 4C68 A; 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