The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
128
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structure length |
128
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Chain Sequence |
GSSGSSGMSEVTRSLLQRWGASLRRGADFDSWGQLVEAIDEYQILARHLQKEAQAQHNNSEFTEEQKKTIGKIATCLELRSAALQSTQSQEEFKLEDLKKLEPILKNILTYNKEFPFDVQPISGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of four helical up-and-down bundle domain of the hypothetical protein 2610208M17Rik similar to the protein FLJ12806
rcsb |
| molecule keywords |
2610208M17Rik protein
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
31
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| structure length |
128
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| sequence length |
128
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-06-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF08910 | Aida_N | Aida N-terminus |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | Axin interactor, dorsalization-associated protein, N-terminal domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UG7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2A0U A; 2XM4 A; 3UMI A; 3BEH A; 3QW0 A; 2G62 A; 3M4B A; 2XL6 A; 1JPJ A; 2HZ8 A; 1BZ4 A; 3AOU A; 1ORY A; 1TR2 A; 2EIM C; 3NRH A; 4H4K C; 3M1C B; 4U9E A; 1Z7Q c; 2LP4 A; 1VK5 A; 2Q3T A; 3CAX A; 3LLI A; 3T6B A; 1WAT A; 2XSE A; 1T6Q A; 1LS4 A; 1XWJ A; 2Y39 A; 3ASO C; 3HTK C; 1K05 A; 2LQG A; 4JJG A; 3IPM O; 4YT4 A; 2AP3 A; 3N24 A; 4LAC B; 4YT8 A; 2LSE A; 4C3B A; 3T6G B; 2EPO A; 4HFK B; 2DGJ A; 2GWW A; 4Q4Z F; 3ECS A; 3EG9 B; 1RMV A; 5A69 A; 2Y3D A; 3W8H A; 4D4X A; 4ANJ A; 3UNG C; 2IXM A; 3GWL A; 4NCQ A; 1V74 B; 4LDQ A; 1LI5 A; 1OCC C; 1YJG A; 2KNH A; 4YJW A; 2ZPA A; 3L8J A; 1RKE A; 3FHD A; 4MVS A; 5EGY A; 2XXA A; 3NYL A; 2ZD9 A; 3NMJ A; 5DLJ A; 1C17 M; 1CGO A; 1T01 A; 4JC7 A; 4K7B A; 3NDB B; 1TQG A; 3M79 A; 1H6G A; 2C04 A; 1K04 A; 2HJ3 A; 2J8W A; 5A6J A; 3RQE A; 3N0T A; 4JTA B; 4ULW A; 4EBJ A; 2J0X A; 3EG9 A; 1A7E A; 4EUK B; 1NU7 D; 3FMS A; 3EGD A; 2R03 A; 3WHN A; 1AVO B; 3RIP A; 5L0F A; 3ITF A; 4DVZ A; 4JCZ A; 2G3K A; 4EBB A; 2R02 A; 2NUT A; 4OIP F; 2HJM A; 1EA8 A; 2ZXP A; 1OXB A; 3CSK A; 2Q00 A; 3QZC A; 1F1M A; 1Z3I X; 2JD3 A; 3C7J A; 5IY5 C; 5KYX B; 5E3A A; 4BEJ A; 2IXO A; 1GM5 A; 2YKZ A; 1D1A A; 1Y6D A; 3G4X A; 4JE9 A; 4DOZ A; 3SXY A; 1O3U A; 3GWN A; 4W8P A; 1DOW A; 1HE9 A; 1RKC A; 3T6J A; 1D1B A; 1KU2 A; 2P1A A; 5HSW A; 4JEB A; 3LNR A; 2LIG A; 2YVK A; 3I5Q A; 2Q4F A; 1BR4 A; 4PAC A; 2XLD A; 1WN0 A; 5DS4 A; 1CGM E; 1LI7 A; 1C03 A; 4NQF A; 2PP4 A; 2M4E A; 4BJ6 A; 1VYI A; 2IOQ A; 4O79 A; 2AVK A; 3MYI A; 2TMV P; 3UMK A; 3FAP B; 1W2W A; 4N4W A; 3RFY A; 3U3F A; 2MWQ A; 4GQH A; 2X51 A; 3HLZ A; 3JCU Q; 3MBG A; 1ZHY A; 5A6B D; 1VB5 A; 3AGU A; 3J06 A; 3US6 A; 2LFD A; 3WG7 C; 1YAU O; 2NG1 A; 3C18 A; 1C02 A; 4JUR I; 4IWB A; 2JX0 A; 5L0C A; 4F4B A; 4CX9 A; 3U2L A; 2L7A A; 2HKV A; 2XLM A; 1VTM P; 1DOV A; 4OIR F; 1EKY A; 4IB4 A; 4OD4 A; 4JCH A; 3ZIB A; 1NU9 C; 4XLP F; 3S27 A; 4NTF A; 3R2P A; 4BPM A; 5KYU B; 2EIL C; 4WGY A; 1FNT c; 3RKO F; 5JS5 A; 3B29 A; 3ZSU A; 3RVY A; 5DQZ A; 1QVX A; 4RBN A; 2L6F A; 2XLO A; 2VC9 A; 4K0D A; 3RVZ A; 2R7S A; 1EQ1 A; 3TOL A; 1HE1 A; 4G7H F; 3S28 A; 4EHP A; 2ETS A; 1H9G A; 3VM6 A; 1YDI A; 2PX0 A; 2NPU A; 3W2V A; 1T5O A; 4PJL A; 3RQF A; 3VF0 A; 2RSE B; 3W8I A; 3E9V A; 3ATP A; 5E33 A; 1ZZP A; 2FGY A; 1SR2 A; 1QZX A; 4IGG A; 4MVU A; 3U8V A; 2PX3 A; 2V3C C; 3GOD A; 2UUI A; 3LAY A; 3FOO A; 3X2Q C; 3O39 A; 4U9D A; 1ZU4 A; 2DI3 A; 5KYU A; 3AG2 C; 256B A; 3DE9 A; 4MVZ A; 3JYY A; 1ZW2 A; 4MTG A; 4PFP A; 2J9W A; 5EK0 A; 4CDY A; 5F5F A; 2AWC A; 2FAP B; 4C7O B; 1QLE C; 3ABM C; 1UG7 A; 1RJ9 B; 1U6H A; 4HFF B; 4MND A; 4MW8 A; 1HW2 A; 2KK1 A; 3EZI A; 2P6V A; 3PMR A; 3QVZ A; 2OQM A; 3K1I C; 4MS2 A; 4U5F E; 1T9K A; 2BC5 A; 4CDA A; 2QY9 A; 3KL4 A; 2MHR A; 2YHS A; 3HKK A; 4FWV A; 4U5E E; 1R4T A; 3MLG A; 4BJ1 A; 3S84 A; 2QNL A; 5EHH A; 3K33 A; 2ZXR A; 1Q0D A; 1WWP A; 1ORS C; 3KKB A; 1R5I D; 5L3Q A; 2AWY A; 5BQG A; 4IAO A; 3IQC A; 2KC3 A; 1OCZ C; 3LES A; 5CIV A; 3B0V C; 5BUO A; 2FFH A; 3N2Z B; 1WAS A; 4KBL A; 1Z5Z A; 1SZI A; 3ZDL A; 5JLI A; 2IXN A; 2ZXW C; 3CEX A; 3SZR A; 5COF A; 2YQY A; 1OR2 A; 1BR2 A; 5F5H A; 4LER A; 2W4B A; 1RKE B; 3AG3 C; 3HNL A; 4MVR A; 1ZHT A; 3IHU A; 3SXM A; 1BR1 A; 4W8K A; 4K1O A; 2XXA B; 1A7V A; 1JOG A; 1S05 A; 2OEV A; 4J7T A; 4E7S A; 1N1C A; 3S29 A; 4YL3 A; 1VMA A; 3EZH A; 2G3V A; 4NTB A; 1MMG A; 4I44 A; 4P9F A; 4C3D A; 2L9J A; 2R7V A; 2R7T A; 1GGQ A; 4LLE A; 5L0G A; 1G4U S; 3CZ6 A; 4DRH B; 3SEO A; 5GPG B; 3VRC A; 3ZG1 A; 3GOR A; 5KYN A; 2IYL D; 1LKX A; 2KQ9 A; 3EGD B; 3GM2 A; 4A4A A; 4ZLD A; 2YLI A; 2VCB A; 4D4N A; 4O6Y A; 5JUA A; 4O6N A; 2WVO A; 4R32 A; 2NUT B; 3B71 A; 1Y4C A; 3ZQV A; 5FZT A; 3F46 A; 1LPE A; 3LUT B; 4CIP A; 1GQA A; 2EIJ C; 1YA7 O; 1U0B B; 4N6H A; 4DVY P; 4YK5 A; 5B3I A; 4LLC A; 4I1O B; 2OJE D; 1YYJ A; 2YL7 A; 1JPN A; 1RXQ A; 3JRT A; 3EPV A; 3SNH A; 1NFO A; 5DQT A; 4Z9I A; 2WZG A; 4J30 B; 3NG1 A; 1M2V A; 2OOC A; 3EFO A; 2YLD A; 4MW3 A; 1M56 C; 3U2M A; 5A6B A; 2UUH A; 2XS1 A; 1E83 A; 3W2W A; 2CW0 F; 5K0I A; 3IQ5 A; 4XPX A; 3WOD F; 1E2X A; 4HEA J; 1KTM A; 1TWC A; 1FMV A; 2AU5 A; 2NSF A; 1MMD A; 3SXZ A; 3EH1 A; 1ST6 A; 2VCA A; 2OG2 A; 3DMD A; 2EPK X; 1ZVZ A; 4RD9 A; 1AEP A; 2DYS C; 1G5Z A; 1ZW3 A; 2J0W A; 1A41 A; 4PJN A; 4YT2 A; 4YL1 A; 2J45 A; 2HFI A; 4JKV A; 5COM A; 4EKW A; 4XWJ A; 1O5H A; 5BQH A; 1V54 C; 3K6B A; 3QMK A; 3TQO A; 3IQ6 A; 1S7Z A; 3EGX A; 1OR3 A; 2R25 A; 2EPM X; 2VCC A; 3FXH A; 3Q6M A; 4XLN F; 3NYM A; 1YAR O; 4CSA C; 4BJ5 A; 3GEH A; 1NG1 A; 2J7P A; 3V7O A; 5L0D A; 3VYW A; 3MX3 A; 5D92 A; 2EIK C; 3K1I A; 1HMO A; 2Q9A A; 3ASN C; 1H7I A; 4Z9J A; 5AC4 A; 1J8M F; 2YLG A; 4J32 B; 1ZHW A; 1E86 A; 4JZA A; 2VAS A; 4WGZ A; 3LEV A; 5DVW A; 1YVI A; 4PR9 A; 1TKN A; 4KC9 A; 2L81 A; 4AE4 A; 3U3B A; 2B0J A; 4O7G A; 1LE4 A; 3K7D A; 2OKU A; 1FR0 A; 4EIY A; 4QI0 A; 1T6I A; 3E70 C; 2Y3H A; 5B1A C; 3A11 A; 1QQ3 A; 3DE8 A; 2R05 A; 5D91 A; 3HNI A; 3U9M A; 1WOL A; 3UGO A; 1L7C A; 2HS5 A; 3DXJ F; 1PD0 A; 3ABL C; 3LS1 A; 3UMH A; 2CGE A; 2P61 A; 4LDR A; 4MTO A; 4PJJ A; 2DYR C; 2XLE A; 5JT4 A; 1KNY A; 2H8A A; 2DB4 A; 3HNK A; 3U5S A; 3K1H A; 4MVQ A; 4AK9 A; 1OXK A; 4KNW A; 2VB6 A; 3AG1 C; 5HV9 A; 1JAF A; 2W45 A; 2WVN A; 2NUP B; 1QKR A; 1SYQ A; 1ZU5 A; 3JSE O; 3EH2 A; 2OJQ A; 4Z9H A; 1J8Y F; 1Q0K A; 1NBB A; 2I8B A; 2J7P D; 2P7V A; 4CJG A; 3JZ0 A; 1T6U A; 3IQT A; 3ZTZ A; 1D0Z A; 1LVK A; 2A1D D; 2J9U A; 2M64 A; 3PCV A; 4U5G A; 1LS1 A; 4WAB A; 5CI8 A; 3FAJ A; 3DD7 A; 3I4U A; 1NLX A; 3TD7 A; 3B0U X; 2OEX A; 4N6C A; 4FX5 A; 4MVO A; 1O87 A; 2IBF A; 1Z6A A; 3R7C A; 3SXK A; 3ZQY A; 4CSA A; 4OIQ F; 5DS6 A; 1M2O A; 3SYN A; 1LE2 A; 4YWQ A; 2NUP A; 4BJ5 C; 4J7Y A; 3POV A; 2YL3 A; 1AUE A; 1V55 C; 4JIO A; 2ICW G; 5L3V A; 1FMW A; 3C8G A; 5KYW A; 1G4W R; 3T4R A; 4BEM J; 2PF4 E; 3KYJ A; 3S0X A; 3C8Z A; 4Q5S F; 1G8X A; 1NSG B; 1FTS A; 1Q0F A; 4U5D E; 4DXW A; 2Q9B A; 3HNJ A; 1OW6 A; 2A68 F; 1A7D A; 4IAQ A; 4MTF A; 1SF8 A; 1YA9 A; 3GAN A; 2VH3 A; 4CS7 A; 4LDK A; 3V5X A; 5T3T A; 3Q7L A; 4XEV A; 3ZTM A; 3KPH A; 2WZL A; 3KMI A; 2WL8 A; 4DRJ B; 4OIO F; 3DWW A; 4B6I A; 5A6K A; 3AG4 C; 2PNO A; 2IM8 A; 4U5C E; 1A0B A; 3M4C A; 2W4M A; 2J9V A; 4U5B E; 2A6E F; 2Y3B A; 3O6X A; 2CNW A; 2B0H A; 3QTH A; 4JTD B; 4E17 A; 5BQI A; 1HY5 A; 4QDL A; 5T1D B; 2GDC A; 4XTK A; 5KYY A; 1FAP B; 1Q0G A; 1D0Y A; 3UGP A; 4E7Z A; 4JVS A; 2Z15 A; 2EIN C; 2P0N A; 1MQV A; 5L0J A; 4IRU A; 3C8G D; 3UR3 C; 1E85 A; 2QLA A; 2A6H F; 3QVY A; 4PFO A; 4XPW A; 4DBR A; 4CJO A; 2YRF A; 4ZLC A; 1IZM A; 2BL2 A; 1TFO B; 2L6H A; 4JW1 A; 3TK0 A; 3JYH A; 1ZHZ A; 1CPR A; 3JSZ A; 1M2V B; 3EFO B; 4G0H A; 4Q7C A; 3V5Z A; 1OCR C; 1VYK A; 3TUL A; 3DI5 A; 3EHM A; 3I5P A; 2XL8 A; 5T3W A; 3RH3 A; 3ZWI A; 3ZVR A; 3NMK A; 3WAQ A; 1U89 A; 1RCP A; 2C03 A; 2HV7 A; 2O9X A; 2R7X A; 3MFN A; 3JRM O; 4ER9 A; 1E84 A; 2BE5 F; 4JRZ A; 4YT5 A; 1BDJ B; 1YZC A; 1LM3 B; 1Q0M A; 3RQG A; 3TJ6 A; 2ASR A; 2WZF A; 3DM5 A; 2CNW D; 2D4U A; 2A0B A; 3TJ5 A; 1MMN A; 3ABK C; 3LLK A; 2QTV A; 3EQL F; 3S90 A; 3FDQ A; 1V4A A; 1XZP A; 1OKK A; 1VOM A; 1B68 A; 1Z23 A; 2KW3 C; 1TWG A; 1L3P A; 2YEV A; 3L8I A; 4OIN F; 3C63 A; 3EGX B; 4GEH A; 4CS8 A; 3BRJ A; 2A69 F; 3AQC A; 4CDV A; 5L0H A; 2IXP A; 2R7R A; 3K66 A; 3U8P A; 2KJG A; 3NYJ A; 2GAQ A; 4CS9 C; 4XEF A; 5B1B C; 2XRH A; 4AX2 A; 2I15 A; 4P9T A; 2R7W A; 3GM1 A; 1OQC A; 2PBE A; 2R7U A; 4AE4 B; 3VAY A; 2XLH A; 3S9O A; 5AC5 A; 1VLT A; 2RD9 A; 3PDM P; 4AL0 A; 2XM0 A; 1TWA A; 2L6G A; 3F47 A; 1YYX A; 3ZC4 A; 3CQZ A; 3OA1 A; 2R7O A; 3O10 A; 5JP7 A; 4IAR A; 3OWT A; 4NC3 A; 4HE8 D; 4KI2 A; 4BG0 A; 1JMW A; 1QSP A; 2KSF A; 2ZXO A; 3FVY A; 1OW8 A; 1D1C A; 1CGN A; 4GYT A; 1NZE A; 1OKK D; 2LD6 A; 3LNM B; 2J9B A; 3DM9 B; 3C62 A; 3OEO A; 1UFB A; 2PFD A; 1YLM A; 3B0P A; 4YN0 B; 4P6I C; 3RF3 A; 4I3M A; 4A2N B; 1IW7 F; 3M15 A; 1MMA A; 2OCC C; 4I1M A; 4PJM A; 5L0I A; 4PK4 A; 2HMZ A; 3RW0 A; 4JTC B; 4OD5 A; 4M63 A; 2QE9 A; 5B3S C; 1M57 C; 2LCH A; 4X0R A; 1MND A; 2Q7R A; 2WVQ A; 3AQB A; 3HJC A; 2X0C A; 4G7O F; 2WB7 A; 4DRI B; 4U5H A; 2KYH A; 5KYX A; 2XLV A; 4IJJ A; 2HUJ A; 5A6A A; 4MVM A; 2Q9C A; 1TWH A; 3H2U A; 2NSG A; 4CS8 C; 4CIH A; 4RDA A; 5JRA A; 4G7Z F; 5DS5 A; 1ZYR F; 1PCX A; 3NKE A; 2EPL X; 3C8G B; 3QW1 A; 4NTA A; 5KYW B; 1Z63 A; 4L6R A; 1PV3 A; 3O55 A; 3KYI A; 1HMD A; 2CCY A; 3NKD A; 5CI9 A; 1APC A; 5E2Q A; 3NMI A; 3U9J A; 3GEI A; 3MYF A; 5JVE A; 3L1M A; 2YWA A; 3V5Y A; 1SMY F; 2R7Q A; 4YL0 A; 3L0I A; 3DAF A; 5TJ5 E; 1CPQ A; 1HW1 A; 1JR8 A; 1M6T A; 2F22 A; 2E87 A; 3B9Q A; 1BBH A; 3LJB A; 3AJM A; 4H54 A; 4JEA A; 4MQ9 F; 4ULV A; 1XZQ A; 4XPY A; 1FFH A; 2LFF A; 3EJN A; 4N06 A; 2CDQ A; 5FCL A; 3JT1 A; 1EI7 A; 1H9T A; 2YZS A; 3Q7G A; 3G50 A; 3DZA A; 3Q6N A; 3DJN B; 4O6M A; 4G78 A; 4EWC A; 5JSL A; 4AL1 A; 4FAP B; 2GFH A; 2YL0 A; 3X1O A; 3GM3 A; 2QUP A; 3RYL A; 2EPN A; 3DJU B; 2YL1 A; 1JRA A; 1ZHX A; 3L34 A; 3SP1 A; 1FFT C; 4FES A; 2HV6 A; 4DJ9 A; 5KYY B; 5E3C A; 2MYS A; 3FOP A; 1NFN A; 3W4Y A; 2XL4 A; 3TOM A; 3PHF 2; 2LK4 A; 3IEE A; 1MNE A; 1ORJ A; 1TFK B; 2V26 A; 2XS8 A; 2GA0 A; 3AGT A; 3EHN A; 4XQ1 A; 4E0H A; 2Y69 C; 1LIH A; 4ONS A; 1I4Z A; 3JTL O; 3T9O A; 1QPU A; 1OCO C; 2D5R B; 4BJT A; 2KGO A; 3H2V A; 4NY3 A; 5COG A; 3DKA A; 1VLS A; 2XLW A; 4UDV A; 3LEO A; 5AGF A; 2H7B A; 4EBK A; 1YZA A; 1I4Y A; 1WGW A; 2W9Y A; 4BJ6 C; 1GS9 A; 4E18 A; 1D0X A; 4CBE A; 2CYD A; 1K40 A; 4QI2 A; 4CS9 A; 4KNV A; 3DAG A; 3U0C A; 3H65 A; 3KH2 A; 2R9R B; 4E0I A; 2HMQ A; 1I5N A; 2JPU A; 2Y3G A; 1OW7 A; 3GEE A; 2OU6 A; 3LS0 A; 4XEK A; 2H7V C; 4DBQ A; 4JJF A; 3A9C A; 1WTY A; 5F28 E; 2H7O A; 2HSB A; 4C3E A; 4C7O A; 3G4Z A; 2J46 A; 1PD1 A; 4WJ0 A; 1RJ9 A; 2HSQ A; #chains in the Genus database with same CATH homology 1UG7 A;
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait... #similar chains, but unknotted ...loading similar chains, please wait... #similar chains in the pdb database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait...
