The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
87
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sequence length |
219
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structure length |
219
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Chain Sequence |
MYLRITNIVESSFFTKFIIYLIVLNGITMGLETSKTFMQSFGVYTTLFNQIVITIFTIEIILRIYVHRISFFKDPWSLFDFFVVAISLVPTSSGFEILRVLRVLRLFRLVTAVPQMRKIVSALISVIPGMLSVIALMTLFFYIFAIMATQLFGERFPEWFGTLGESFYTLFQVMTLDDWSNGIVRPLMEVYPYAWVFFIPFIFVVTFVMINLVVAICVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Ion transport protein
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| publication title |
Structural basis for Ca2+ selectivity of a voltage-gated calcium channel.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Arcobacter butzleri
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| molecule tags |
Metal transport
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| total genus |
87
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| structure length |
219
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| sequence length |
219
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-09-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins | ||
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | Voltage-gated potassium channels. Chain C |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4WFE A; 2BOC C; 3SPC A; 4I9W A; 4P30 A; 2ITD C; 4G28 B; 2HG5 C; 3ASO C; 5KUM A; 1XL6 A; 2QKS A; 2R9R B; 2WLM A; 5B1A C; 3AG4 C; 3GB7 C; 3SYA A; 3ZJZ A; 1G4Y B; 3FB7 C; 2EIM C; 2KB1 A; 2HVK C; 1R3I C; 4GX1 A; 4KFM A; 3AG1 C; 1R3K C; 4MVR A; 2WLJ A; 2AHZ A; 4P2Z A; 4PDL A; 2QTO A; 3UKM A; 4JTC B; 1M57 C; 2IH1 C; 3K0G A; 3RBZ A; 4ZBM A; 2DYS C; 4RUE A; 1LNQ A; 2AHY A; 3SYO A; 3F5W C; 3STZ C; 1S5H C; 4LP8 A; 4RO2 A; 2HJF C; 2OCC C; 1ORQ C; 3FB6 C; 4MVZ A; 4PA6 A; 2K1E A; 5EC2 C; 1ORS C; 3RVZ A; 3F7V C; 3AG2 C; 4XDK A; 3IGA C; 1M56 C; 3BEH A; 3OUS A; 4QE9 A; 4R8C A; 2BOB C; 4MVU A; 3LDC A; 4OXS A; 4QE7 A; 3E8F A; 4X88 A; 1K4C C; 3SPH A; 3ABK C; 3JYC A; 2WLL B; 1XL4 A; 4RAI A; 5BZB A; 5CBG A; 3T4Z A; 2JK5 C; 3SJQ C; 2A0L A; 2HVJ C; 4PA9 A; 4PA7 A; 5IY5 C; 2H8P C; 3IFX A; 4XDJ A; 2WLH A; 3SPJ A; 3VOU A; 5EBW C; 4MW3 A; 2X6A A; 3FB5 C; 5E1A C; 3X2Q C; 4QNH B; 3TET A; 1BL8 A; 2ITC C; 3SPG A; 3KG2 A; 3LUT B; 3SYQ A; 4PA4 A; 2A9H A; 3E8H A; 2WLI B; 3SYC A; 3T1C A; 2NLJ C; 2WLK A; 1K4D C; 2EIN C; 2X6C A; 2DYR C; 2IH3 C; 1OCZ C; 2WLN A; 4MS2 A; 1OCC C; 2DWE C; 3E8G A; 2Q67 A; 3K06 A; 3OR7 C; 4JTA B; 1KKD A; 4J9Y B; 4HZ3 A; 3RVY A; 4BW5 A; 1ZWI C; 3ABM C; 1V54 C; 2WLL A; 1V55 C; 3K04 A; 4H37 A; 4J9Z B; 4MTO A; 2Y69 C; 3LDD A; 3OGC C; 3SPI A; 4MVQ A; 4JTD B; 2W0F C; 4X8A A; 3HPL C; 4X89 A; 4MTF A; 4DXW A; 4R7C A; 3ASN C; 3E86 A; 5B3S C; 5B1B C; 3WG7 C; 4F4L A; 3SYP A; 4GX5 A; 4HYO A; 3E83 A; 3E89 A; 2WLI A; 2A79 B; 4P9P A; 4UUJ C; 4R50 A; 4R6Z A; 4EKW A; 4GX2 A; 4MTG A; 5CBF A; 3OUF A; 3F7Y C; 2ZD9 A; 4WFG A; 3T2M A; 1R3J C; 2EIJ C; 4PDM A; 4MVM A; 3ABL C; 3AG3 C; 5CBH A; 3E8B A; 5EBL C; 3STL C; 2X6B A; 4MVS A; 5J9P C; 4MVO A; 1P7B A; 3LDE A; 3T4D A; 4LBE C; 2KYH A; 2Q6A A; 3K03 A; 1OCO C; 5EBM C; 3RW0 A; 5EK0 A; 4RUF A; 4XDL A; 1QLE C; 3FB8 C; 4PDR A; 2P7T C; 4GX0 A; 4TWK A; 2ZXW C; 5KUK A; 1JVM A; 2HFE C; 2DWD C; 3PJS K; 4WFH A; 2EIK C; 2Q68 A; 2EIL C; 4WFF A; 3OR6 C; 3UM7 A; 4CBC A; 3K08 A; 3ZRS A; 3LNM B; 3TCU A; 2YEV A; 3EFF K; 4G27 B; 4MSW C; 1J95 A; 3K0D A; 4P9O A; 1OCR C; 2Q69 A; 4PDV A; 4LCU C; 4H33 A; 4MW8 A; 1R3L C; 4PA3 A; 2ATK C; 5EC1 C; 3R65 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3ZMV A; 4I9W A; 3G4X A; 4DV7 B; 3U8V A; 4OIR F; 1BBH A; 4HFF B; 2QM8 A; 1FD9 A; 3K5O A; 2X7R B; 1KU2 A; 4KFM A; 2Q4P A; 2E5L O; 1H8H G; 4JI8 B; 2XRH A; 3CZ6 A; 3WOD F; 1Q7Y W; 3CS5 A; 1NZ6 A; 3V5Y A; 2H3O A; 1FS0 G; 1WWP A; 2Y3H A; 5K1P A; 2HJF C; 5FLX N; 2Z5U A; 2G62 A; 5EYP A; 3BRJ A; 4Z9I A; 4H0L B; 1Q6U A; 3JAW B; 4XEF A; 3S28 A; 4QE7 A; 3ABL B; 2ADQ B; 5LXT B; 4O4J A; 1XNR O; 5LL6 Y; 4GYT A; 2WLL B; 3ZIB A; 2RSE B; 3PHF 2; 3S27 A; 3K7D A; 3SPJ A; 4ER9 A; 2ADP A; 4IIJ B; 3GOR A; 2VWJ A; 1U0B B; 2XTA A; 4YJ2 A; 4GEH A; 4ZLC A; 1K92 A; 2EPN A; 3N24 A; 1NFN A; 2HS5 A; 2ICW G; 3HJC A; 4PJJ A; 3VRC A; 4ULW A; 4TV8 B; 1XOU A; 4WGY A; 4JYB A; 4QIW F; 2HV7 A; 4LER A; 1GGQ A; 1IBK B; 1HW2 A; 1W59 A; 3OGC C; 4EBB A; 4FLV A; 3A2F A; 4N06 A; 2CYD A; 1BHA A; 2B1G A; 3K5N A; 3JAR B; 1NSG B; 3J7A U; 2XL6 A; 2PY5 A; 4QI0 A; 3OE7 G; 1VQ5 V; 3JAT B; 2G38 A; 3RQF A; 1XHX A; 2GBO A; 2L6G A; 3FYI B; 3GWK C; 2IU0 A; 3SP1 A; 1I5Y A; 3I5Q A; 1GM5 A; 2XLO A; 2LW1 A; 2RJZ A; 4MVO A; 1QVF U; 1XBL A; 4FFB B; 3SJB C; 4LDQ A; 2CTW A; 1E2X A; 1EZV H; 4DBR A; 3IQT A; 5LP6 A; 3D3I A; 3ZCC A; 1JVM A; 5A6K A; 3EH1 A; 3E9V A; 2UUH A; 2XLD A; 3H01 A; 1YDX A; 3V7O A; 2YL3 A; 2Z3Y A; 1H2M A; 1MMN A; 4CDV A; 3AK2 A; 4C7O B; 4H33 A; 4OPA A; 1M90 W; 5KYU A; 1TUB A; 1MND A; 1OQC A; 1SES A; 1FFX A; 1LVK A; 1F51 A; 4LF7 B; 3ZHR A; 3CCV V; 3B71 A; 5L0F A; 3SPC A; 1OCZ B; 3ZMZ A; 1R5I D; 5GON B; 1RKE B; 3AG4 C; 3B77 A; 4YIP A; 2F66 C; 2WWW A; 1WPX A; 2EIM C; 4IYH A; 2KB1 A; 2BSK A; 4EEQ A; 1QPU A; 1A32 A; 1W2B U; 4NR1 A; 4I55 B; 2K9P A; 1YJW V; 2JPU A; 4ULV A; 3UKM A; 2M64 A; 4CC5 A; 4IHJ B; 4DOZ A; 4TT3 G; 3ZBH A; 4CIP A; 4B3T B; 4YY3 O; 4IWB A; 2HKO A; 2HSB A; 2JGD B; 2W0X A; 3GM1 A; 5T1D B; 1BQ0 A; 1YTF D; 3UCS C; 2LJ2 A; 1Q0M A; 2YQY A; 2EIN B; 1S5J A; 1M9N A; 1WB7 A; 4WF9 V; 2R7X A; 1E79 G; 2ZR2 A; 1YJN V; 1AVO B; 2HJM A; 4CX9 A; 4N4W A; 4HEA J; 3RYC A; 3IFX A; 4XDJ A; 3CEI A; 3CWB H; 1RXQ A; 3ZTM A; 5LA6 B; 4LFC B; 4YT4 A; 5LMN O; 1H6G A; 2KK1 A; 2HHH B; 3HNL A; 2P06 A; 3DMD A; 1QVX A; 1I0H A; 3R2P A; 1ZL8 A; 4DV0 B; 1OKK A; 2OTL V; 4Q20 A; 3CRA A; 1H7I A; 4ZI7 A; 2WLN A; 2DWE C; 1SA0 A; 4E2L A; 4CS8 C; 4DVZ A; 1KQS U; 3ABM C; 4J9Z B; 4DK1 A; 1ZHW A; 4X20 A; 1HDJ A; 2QWQ B; 1EN4 A; 2W0F C; 3JTL O; 1GKF A; 3L71 H; 3HKB A; 3Q4H A; 1Q6H A; 1TUE B; 4DXW A; 4NYK A; 3DM9 B; 2EX3 A; 4I5S A; 4LF5 O; 2B1I A; 2XLV A; 3RH3 A; 1XZP A; 3JSL A; 1COW G; 4XBF A; 2A0U A; 1PV0 A; 2QA4 V; 5L3C A; 3QMK A; 4LFB O; 1BDJ B; 1JMK C; 4NC3 A; 1TFK B; 2GDC A; 4DV3 B; 1M6T A; 3K9S A; 1SQF A; 1VOM A; 4FWV A; 5L3E A; 4B7E A; 1DOW A; 3EZH A; 1H9G A; 1MAB G; 2YUA A; 1D0Y A; 3ZX6 A; 1RMV A; 1WOL A; 3G4S V; 2HMQ A; 5KMG B; 2IBF A; 3S84 A; 2UXC B; 1SZT A; 3PJS K; 3CCS V; 3DJU B; 1Z23 A; 1VEW A; 4JI3 O; 4RQE A; 4CSA A; 3UO2 A; 3D36 A; 3VM6 A; 1SKV A; 1QQ3 A; 5AC5 A; 4FJC C; 4FM0 A; 3CAX A; 1KMI Z; 1WLE A; 4XEK A; 1L3P A; 2V3C C; 4C3D A; 1SC5 B; 4E7S A; 2J8W A; 5A6B D; 1Z5V A; 1Q0F A; 1KYO F; 1D2D A; 4LWS B; 4W4K A; 4NTY A; 2GFH A; 4PDL A; 3RBZ A; 4DR1 B; 3DE9 A; 3W2W A; 3SYO A; 4GKJ B; 3ETE A; 1JPJ A; 2RD9 A; 4JI6 B; 3OT7 A; 3OM3 B; 2P4V A; 2OYQ A; 1CGM E; 1TWC A; 3MLG A; 1YI2 V; 2AU5 A; 4JGS A; 4X64 O; 3IAY A; 1WP8 A; 4E18 A; 1OR2 A; 1ORJ A; 4E0I A; 2P7V A; 3GEE A; 3HKC A; 3C8Z A; 4XLN F; 4DRH B; 1NLX A; 4DR3 O; 2P67 A; 1VB5 A; 2WLH A; 3JRT A; 3JRM O; 1KP3 A; 2L35 A; 1S5L Z; 1ZHY A; 5A9G A; 1UFI A; 1YF2 A; 1KP2 A; 1ZAU A; 2LO1 A; 1XWJ A; 4BIO A; 2BTQ A; 2LP4 A; 4I50 B; 5J2U A; 1U6H A; 4O2A A; 1M2V B; 4IRU A; 1MNE A; 2H94 A; 3E8G A; 2MWQ A; 4JTA B; 3QO5 A; 2AZ2 A; 4J9Y B; 5T3T A; 2JJ1 G; 4H37 A; 5B5E Z; 1AVM A; 1K34 A; 3JAS A; 1ZW3 A; 2D3O W; 4TV9 A; 1FKA O; 2WZL A; 3RQG A; 4JVS A; 3I56 V; 4ZIB A; 2QR4 A; 2EIM B; 3U5S A; 5KHK A; 2F4V O; 1R6K A; 4HAM A; 3RFY A; 1QQC A; 5B3I A; 2OTJ V; 2WL8 A; 1E84 A; 2GA0 A; 1MG1 A; 2IXP A; 4TSF G; 4EFE A; 4RWU A; 4FX5 A; 4ZKI A; 1BSM A; 3TK1 A; 4JPR A; 3EJN A; 3HLZ A; 1SF9 A; 1Y6D A; 3STL C; 2Q0A A; 5C93 A; 4FLT A; 2J7P D; 3SR2 C; 1M5I A; 1CPY A; 5JVD B; 4MTX A; 3L0I A; 4A5U B; 1HNZ O; 1HR0 O; 3UR3 C; 2ZNJ A; 3NR7 A; 4MQ9 F; 1XI1 A; 2DB4 A; 3B8N A; 2MW2 B; 5IJ9 B; 3M79 A; 3SDL A; 3F5T A; 4WFH A; 2OOC A; 3K08 A; 1T6U A; 3B0P A; 4J7Y A; 5DN6 G; 2A7W A; 1PM9 A; 4CS9 A; 2J0X A; 4KL1 A; 3CPW U; 3W7W A; 3O6X A; 4AIL C; 3G80 A; 5AC4 A; 2C2A A; 4PA3 A; 3LJB A; 1GO3 F; 1MOF A; 5FZT A; 1RP3 B; 5KYU B; 1TUB B; 3ZMT A; 4DYL A; 4BJ5 C; 1Q8I A; 2ITD C; 5BR8 O; 3DXR A; 3B0V C; 2CCY A; 3I5D A; 3ABM B; 1O9G A; 2A69 F; 1KD1 W; 3W8H A; 3ZDL A; 4LAC B; 3LES A; 3K0G A; 4JI7 B; 4Q5S F; 2RQ6 A; 3T6J A; 3QO8 A; 4JZ2 A; 1A0B A; 3ZQY A; 4PJM A; 4FES A; 1A7E A; 3WB1 A; 5J2T A; 4LP8 A; 4BR6 A; 1ORQ C; 1YCI A; 1P7G A; 5JSL A; 3A0R A; 4R8C A; 3S9O A; 3TJ5 A; 1AP6 A; 4O6M A; 2CW0 F; 3E8F A; 4J7T A; 2DYR B; 4AL0 A; 3S0X A; 2VB6 A; 3P30 A; 2QGN A; 1GM8 A; 2IXO A; 1AUE A; 4UCV A; 1D5A A; 4TQD A; 3K33 A; 2A0L A; 2XXA B; 2QNL A; 1JCH A; 2YL1 A; 1RKC A; 3N2K A; 5CI8 A; 1H2L A; 1QKR A; 2L9J A; 4AX2 A; 2ZKO A; 1TQG A; 5KA6 A; 5EIB D; 4U5C E; 3RYC B; 3K5M A; 2ZXP A; 3K59 A; 4DR2 O; 2XAG A; 3LNR A; 2WLK A; 5LMU O; 2UXB B; 4DV5 O; 2XM0 A; 4HZ3 A; 4B6I A; 1HP8 A; 4OIO F; 2WLL A; 4LF8 O; 3K6B A; 4B08 A; 1SA0 B; 4UCT A; 1LPE A; 2A0B A; 3LNN A; 2QM7 A; 1WJZ A; 3QVY A; 2ZQM A; 4IIJ A; 3JD0 A; 4H54 A; 3UGP A; 2AWY A; 5B1B C; 1FFT C; 1I5X A; 2VQF B; 3SYP A; 2LFF A; 2GHY A; 2RCV A; 3TQO A; 1BZK A; 2R05 A; 3QVZ A; 1XMQ B; 2ZXW B; 2A6H F; 5CBF A; 5L3G A; 3FXH A; 3MHH C; 3ETG A; 4TV8 A; 2Q7H A; 1JAF A; 1J5E B; 2R7Q A; 3GAN A; 4WAB A; 2KSD A; 4J10 A; 5BMV B; 5CBH A; 1T5O A; 4JI2 B; 1RJ9 B; 2A1D D; 1BS3 A; 4UXN A; 4BPM A; 3MD0 A; 4JJF A; 4DUZ O; 2R25 A; 4J7Z A; 4YJW A; 3PCV A; 4PDR A; 4PJ0 Z; 5CN0 A; 4GX0 A; 1G1X B; 1SET A; 5AG2 A; 3O10 A; 3JAT A; 3E2E A; 2P5O A; 2HFI A; 2PX3 A; 4G27 B; 3CJH A; 4P9O A; 3JAM N; 1OCR C; 2YID A; 2E74 B; 1R3L C; 2V7Q G; 1GH6 A; 1D1C A; 4R7C A; 1GN6 A; 1WN7 A; 5JJN B; 3KCY A; 4FFB A; 4X9Q A; 1Q86 W; 1E83 A; 4G28 B; 2HG5 C; 2YVK A; 5E3C A; 3V5X A; 1GN2 A; 1N36 B; 3U9J A; 1ORY A; 3CSX A; 3ZMS A; 2XL8 A; 3KKB A; 3DE8 A; 2ILM A; 1R3I C; 1DTO A; 1FR0 A; 2OKU A; 4XPY A; 3OEO A; 2YHS A; 4JZG A; 4C7O A; 3TK0 A; 1AEP A; 1GM9 A; 2JS5 A; 2OCC C; 4JW1 A; 3CME V; 3AQC A; 5IWA O; 1TVK B; 3HNK A; 2K1E A; 2L6H A; 3QTH A; 3CRR A; 4CS4 A; 1RKE A; 2BCC H; 3N2G B; 4DRX B; 3VAY A; 3E35 A; 2ZXO A; 2CTP A; 2IU3 A; 4DR4 B; 2QY9 A; 4I55 A; 1SQP H; 4DR5 B; 1N1C A; 2W6J G; 2WZG A; 3SJQ C; 2PF4 E; 1ZVZ A; 3H2V A; 3HKC B; 3LSU A; 2Y48 A; 3K58 A; 5IDJ A; 3FDQ A; 2ITC C; 3D3Q A; 2KQX A; 4LH7 A; 3PMR A; 4OGQ B; 5E3A A; 3EFO A; 2M4E A; 4LLC A; 5BQI A; 4U5G A; 3B0U X; 2BTQ B; 4LF6 B; 1AB3 A; 4O79 A; 2ZCE A; 2PNO A; 3U9M A; 2A68 F; 5J2U B; 2Y4U A; 3K06 A; 1GM7 A; 4EBJ A; 4X66 O; 2WA4 A; 4YJ3 A; 4NXN B; 2Q9A A; 2CE4 A; 1YSC A; 2LGQ A; 2Y69 C; 4LF9 O; 2CAZ C; 4XEV A; 5E79 Z; 1NVP D; 2CNW A; 2R02 A; 4PHZ A; 1YVI A; 2QKC A; 3C7J A; 3FHD A; 4KI2 A; 5B3S C; 3JCU Z; 2HZ8 A; 1PL4 A; 4RQF A; 4U9D A; 1QLE B; 4N6H A; 1HE1 A; 1OW6 A; 3AGU A; 4TUY B; 3UMK A; 4F6E A; 4CH6 A; 3C62 A; 1VQN V; 4YT2 A; 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