The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
93
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sequence length |
219
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structure length |
219
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Chain Sequence |
MYLRITNIVESSFFTKFIIYLIVLNGITMGLETSKTFMQSFGVYTTLFNQIVITIFTIEIILRIYVHRISFFKDPWSLFDFFVVAISLVPTSSGFEILRVLRVLRLFRLVTAVPQMRKIVSALISVIPGMLSVIALMTLFFYIFAIMATQLFGERFPEWFGTLGESFYTLFQVMTLDDWSNGIVRPLMEVYPYAWVFFIPFIFVVTFVMINLVVAICVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis for Ca2+ selectivity of a voltage-gated calcium channel.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Ion transport protein
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| molecule tags |
Metal transport
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| source organism |
Arcobacter butzleri
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| total genus |
93
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| structure length |
219
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| sequence length |
219
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-09-18 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins | ||
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | Voltage-gated potassium channels. Chain C |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4H33 A; 1OCC C; 1ZWI C; 3LDD A; 2JK5 C; 3LDC A; 3LUT B; 2HVK C; 2IH3 C; 2HVJ C; 3T4D A; 1ORQ C; 3EFF K; 2ZXW C; 4MW3 A; 2P7T C; 2WLI A; 4GX5 A; 4PDM A; 3OR6 C; 2EIK C; 3T4Z A; 3STZ C; 3LNM B; 4MTO A; 5EBL C; 4X89 A; 4R50 A; 4MW8 A; 4MTG A; 3SPJ A; 4CBC A; 1OCO C; 3OUS A; 4RUF A; 4BW5 A; 2WLM A; 5J9P C; 1R3L C; 2YEV A; 4WFF A; 5EC1 C; 2DYR C; 2R9R B; 3ASO C; 3E89 A; 2QKS A; 4HZ3 A; 3HPL C; 4QE7 A; 4X8A A; 1G4Y B; 2HJF C; 2EIN C; 2ITC C; 3K0D A; 3RVY A; 1ORS C; 2KYH A; 2Q6A A; 3F5W C; 4OXS A; 3STL C; 4RO2 A; 3FB5 C; 4PA7 A; 4TWK A; 4X88 A; 4P9P A; 3K04 A; 3E8G A; 3K03 A; 3FB8 C; 2HFE C; 3FB6 C; 3SYO A; 3UKM A; 3F7V C; 3AG2 C; 2WLL A; 2WLN A; 2Q67 A; 2Q69 A; 2NLJ C; 4MS2 A; 3VOU A; 3IGA C; 4GX2 A; 1R3I C; 2AHZ A; 3AG1 C; 4DXW A; 2Y69 C; 4XDK A; 2DYS C; 3OUF A; 3UM7 A; 3SYQ A; 4R7C A; 5IY5 C; 1BL8 A; 4ZBM A; 2AHY A; 2HG5 C; 3OR7 C; 4UUJ C; 3TCU A; 3E83 A; 3R65 A; 3FB7 C; 4LP8 A; 4P9O A; 4R8C A; 4WFG A; 3ZRS A; 3GB7 C; 4H37 A; 4R6Z A; 4GX0 A; 3SPC A; 3ABL C; 4XDJ A; 4F4L A; 4LCU C; 3E8F A; 3RVZ A; 3SPG A; 3BEH A; 2Q68 A; 3X2Q C; 4JTD B; 4PA9 A; 4QE9 A; 3SYC A; 3F7Y C; 5B1B C; 4MVQ A; 4PDL A; 3E86 A; 1QLE C; 4P30 A; 2EIM C; 2WLK A; 3TET A; 4GX1 A; 4KFM A; 4PDR A; 4JTC B; 2W0F C; 4RUE A; 1XL4 A; 1P7B A; 1S5H C; 2WLH A; 3PJS K; 4PA4 A; 3WG7 C; 1V55 C; 4MSW C; 4G27 B; 3SPI A; 2IH1 C; 4MVS A; 3SYP A; 2K1E A; 2BOB C; 1OCZ C; 4MVM A; 3ABM C; 4MVR A; 4XDL A; 3RW0 A; 2EIJ C; 3AG4 C; 5CBH A; 1M56 C; 4P2Z A; 5B1A C; 1KKD A; 3K0G A; 4I9W A; 2X6B A; 5KUM A; 1LNQ A; 2ZD9 A; 3LDE A; 4RAI A; 5BZB A; 3KG2 A; 1XL6 A; 3JYC A; 3OGC C; 2BOC C; 2KB1 A; 2DWD C; 2WLL B; 4PA6 A; 2A0L A; 2WLI B; 4EKW A; 1V54 C; 1K4C C; 3K08 A; 3K06 A; 1OCR C; 2ATK C; 1K4D C; 5EBM C; 1R3J C; 2QTO A; 5EC2 C; 2X6A A; 1M57 C; 2H8P C; 1JVM A; 5CBF A; 4QNH B; 4PDV A; 3IFX A; 1J95 A; 2X6C A; 3AG3 C; 3E8B A; 3E8H A; 4J9Y B; 3T2M A; 3SJQ C; 4MVZ A; 4HYO A; 3SPH A; 4MVO A; 3ASN C; 5KUK A; 4PA3 A; 1R3K C; 4MVU A; 2WLJ A; 5B3S C; 4JTA B; 4J9Z B; 4LBE C; 4MTF A; 3ZJZ A; 2OCC C; 3ABK C; 3SYA A; 3T1C A; 5EK0 A; 4WFH A; 5E1A C; 2DWE C; 2A79 B; 2EIL C; 5CBG A; 4G28 B; 4WFE A; 2ITD C; 5EBW C; 3RBZ A; 2A9H A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4N21 A; 2L6F A; 4X66 B; 4YWQ A; 4PJN A; 2XL8 A; 3ZS8 C; 4JI3 B; 1M90 W; 2QWO B; 1Y67 A; 3QG5 A; 3CWB H; 1RPO A; 3CSX A; 5A6K A; 4MW8 A; 1G4U S; 5DN6 G; 1F23 A; 3CAX A; 1WN7 A; 1QNM A; 1JOY A; 2H7O A; 1HP8 A; 5JJJ B; 2HJF C; 5LP6 A; 4ASU G; 3EH1 A; 3K59 A; 4ZLC A; 4OXS A; 5JQG B; 1R5I D; 3ABM B; 3KZI Z; 4X88 A; 4QPK A; 1N1C A; 2P90 A; 1NTZ H; 2RDC A; 1GH6 A; 4DV0 O; 3IGA C; 3TGU H; 3KMI A; 2Q5Z A; 1Q3E A; 2VH3 A; 5L3G A; 3ZVR A; 4X1Y B; 4LF8 O; 5LA6 B; 1ZW3 A; 4DOZ A; 4UUJ C; 2DGJ A; 2YL0 A; 3DC5 A; 2X51 A; 4EBK A; 4DRX B; 3CCS V; 2UXD O; 2NSG A; 4DV2 B; 4CIH A; 3X2Q C; 4CH5 A; 5HSW A; 4NYK A; 2J46 A; 3DM9 B; 5B1B C; 3E22 B; 5KYX A; 4WGY A; 4DJ9 A; 1SES A; 1NTK H; 4IB4 A; 3W7W A; 4IHJ B; 3WG7 C; 2F43 G; 2PYJ A; 2IH1 C; 4D4N A; 2YL7 A; 2PTM A; 1YZC A; 2P61 A; 1QZX A; 5L0F A; 4B3M O; 3K0G A; 1VAR A; 4LLC A; 5BZB A; 4RAI A; 2XS1 A; 2OIG A; 4DR5 B; 4LER A; 4I50 B; 3J06 A; 1HNZ B; 2AWC A; 4D7T A; 1H8E G; 3JCU Q; 2CTR A; 3MHS C; 5F28 E; 3JCZ A; 3RYC A; 3CCQ V; 3B8N A; 2Q73 A; 1LR1 A; 1I08 A; 3EZH A; 3ZHQ A; 3FAJ A; 2QA4 V; 3TJ6 A; 1C02 A; 3GEH A; 1J95 A; 3JAT B; 3W8I A; 3T2M A; 4BEM J; 1GMG A; 2N04 A; 1Q6U A; 2WLJ A; 3ETG A; 5KAI Z; 3KL4 A; 2IM9 A; 4LF8 B; 3GWK C; 3ZJZ A; 1IX9 A; 1VF5 B; 2HJM A; 3B8M A; 3U8P A; 4X65 B; 1JX9 A; 1YAU O; 2XL4 A; 5CBG A; 2H3O A; 4N6H A; 2RCV A; 1VYI A; 3S84 A; 2J9W A; 5JVD B; 1G4W R; 4TUY A; 1ZHX A; 4MW3 A; 1LS4 A; 4GX5 A; 2NPU A; 3DGE A; 2LQG A; 5E79 Z; 3DJU B; 1U96 A; 3BHP A; 1S77 D; 1ZVZ A; 3LNM B; 4O79 A; 1N36 O; 4R50 A; 4CDV A; 1WAZ A; 4RUF A; 1BT8 A; 1F4M A; 3TK1 A; 1E2X A; 1S7Z A; 4HZ3 A; 3RYF B; 1US6 A; 4X20 A; 3UCS C; 2J8W A; 1V9P A; 4DW1 A; 1UFI A; 4OX9 O; 2JGU A; 3K03 A; 1AJQ A; 2QDO A; 4U7N A; 1KNY A; 3UKM A; 2Q67 A; 3OA1 A; 5A6A A; 1WA8 B; 1TUB B; 2BCC H; 4B6I A; 1MND A; 4JYA O; 4EWC A; 5K1X A; 5AC5 A; 1AP5 A; 4UXN A; 5EIB C; 3DSQ A; 4UCO A; 5DEC A; 4GX0 A; 1EI7 A; 3VAY A; 3L73 H; 4DV6 B; 4AQY O; 4I1O B; 3IHU A; 1PPJ H; 2P4K A; 2XLE A; 3U8V A; 2XSE A; 4X1K A; 2I8B A; 2QLA A; 1NTM H; 4J7Z A; 4LC1 A; 4JI8 B; 1V55 C; 1EZV H; 1K34 A; 5JH7 B; 5K1P A; 4J7K A; 3HKD A; 3V5X A; 2BOB C; 3LLK A; 1J5E B; 1TWA A; 2W0X A; 3AG4 C; 3CRM A; 3CMA V; 3UMI A; 2B1G A; 2EZO A; 4LNU B; 3AK1 A; 4J32 B; 1OCC B; 4TQF A; 1N36 B; 4JGS A; 4PI2 A; 1N33 O; 3T1Y B; 3L75 H; 4K7B A; 5L3V A; 2WZG A; 1YDI A; 2BOC C; 1GRJ A; 1M5I A; 2XAG A; 2Q4F A; 3N2K A; 1K92 A; 4JJG A; 4L8J A; 3O10 A; 4LFA B; 3NG1 A; 3K57 A; 2XRH A; 4KC9 A; 2QWP B; 4DUY O; 5GON B; 4I55 A; 2LSE A; 1JVM A; 3K33 A; 4LAC B; 3LAY A; 4HNA A; 3CRC A; 2R7T A; 3I5Q A; 5KHG A; 1ZYR F; 4EIY A; 3K1I C; 4EHP A; 3FAP B; 3CXH F; 1BR2 A; 2LFD A; 4YHH B; 2KG7 B; 4JAS A; 3JD2 A; 1NFO A; 2J7P A; 5LHH A; 1AI6 A; 1MZE A; 2IU3 A; 2R72 A; 4DR7 O; 4FM0 A; 4JC7 A; 5CA0 B; 4LFB O; 5CIV A; 2VAS A; 4JZ2 A; 1JRA A; 5LOV A; 4DR1 O; 1ZWI C; 1IBK O; 2L7A A; 2HVK C; 3ZRW B; 2HV6 A; 3M1C B; 4PDM A; 4L6R A; 1IVS A; 1XNQ O; 5LXT B; 5COM A; 3G6B A; 4LDR A; 4H4K C; 1I94 O; 3M4C A; 2JS3 A; 3WB2 A; 1PM9 A; 2EZP A; 2NSF A; 3CPW U; 3UNG C; 2ZT9 B; 1FD9 A; 5BQI A; 4FZ0 A; 3HKE B; 3OM3 B; 3STL C; 1KQS U; 3B77 A; 1ZAU A; 1C03 A; 2HS5 A; 2DI3 A; 4CJO A; 4JI4 O; 1RXQ A; 2Y3H A; 1HMO A; 1YYX A; 1MG1 A; 3CX5 F; 2NUP B; 1V54 B; 2V1D A; 2GTA A; 3OMA B; 1MZF A; 4P9O A; 4N23 A; 4H37 A; 2RJZ A; 1W2W A; 4XDJ A; 1K04 A; 4U9D A; 2W45 A; 4O4L A; 3ZHV A; 2VCC A; 3TD7 A; 3BEH A; 2NR5 A; 4N06 A; 1TWG A; 3DXR B; 1SA0 A; 1XBL A; 3CCJ V; 1LI5 A; 2KK1 A; 3M99 B; 2AGA A; 2CGO A; 1N32 O; 4DR7 B; 2IXM A; 4JI1 B; 1TQG A; 3QO8 A; 2R7W A; 1Q86 W; 3CCE V; 2Y0I A; 2UUH A; 4DR1 B; 5EGY A; 1M4U A; 5KHH A; 1OCZ C; 4MVR A; 1K8A W; 2Q7E A; 4PD4 F; 5LP6 B; 4X64 B; 3OW2 U; 3O39 A; 4RD9 A; 4GYC B; 4LWS B; 1VQP V; 5KYY B; 1VYK A; 3U0Z A; 2YIC A; 1GM7 A; 2G38 A; 4DV3 O; 2PX0 A; 5JJN B; 5C93 A; 4BJ6 C; 2ZD9 A; 1O9G A; 1QR9 A; 1N4C A; 4FLZ A; 4UB8 Z; 1FS0 G; 4E4E A; 5ITZ B; 1K4D C; 3J81 N; 3M4B A; 4DR4 B; 3L0I A; 1R3J C; 3P3P A; 4DRJ B; 1UJW B; 4LF6 O; 3T4R A; 2FGY A; 3GOR A; 3E8H A; 2PFD A; 1S05 A; 1B6Q A; 5KX5 A; 3SPH A; 4U5D E; 3L9D A; 3GVM A; 1VQ7 V; 3NKE A; 4JI4 B; 4DVZ A; 4A5U B; 4X1I A; 2BL2 A; 2NUT A; 1THZ A; 1HNW O; 1KYO F; 4J80 A; 3DD7 A; 3W4Y A; 4PJ0 Z; 1B3Q A; 4DW0 A; 2R9I A; 1Q5O A; 4DV7 B; 3GAN A; 2R9A A; 2HLD G; 1K5S A; 2A6H F; 3SXY A; 2HMZ A; 1Y74 A; 4DV5 O; 2HV7 A; 3GM3 A; 2Y3B A; 1ORQ C; 4C7U A; 1N32 B; 2Q7R A; 3M8A A; 1HY5 A; 4O4H A; 1AEP A; 3AOU A; 4DRH B; 1VF6 A; 2VQF O; 1YDX A; 2HR3 A; 2E5L O; 3W2V A; 3X2Q B; 3RF3 A; 1KEC A; 5B1B B; 5JLI A; 3PN1 A; 4MTG A; 3LS1 A; 1GM8 A; 1OCO C; 3K9S A; 4BW5 A; 1NU1 H; 2CTQ A; 1MSW D; 2ZE6 A; 4WFF A; 1NFN A; 4CBE A; 5COF A; 4NTA A; 5LMN O; 2QKS A; 4JF3 A; 3WG7 B; 2UU9 B; 1DF5 A; 1ORS C; 3KYI A; 5A69 A; 2JGD B; 1U97 A; 3U9J A; 1I5Y A; 3FVY A; 1E83 A; 2X0L A; 1VB5 A; 2CGE A; 1LUV A; 4B3S B; 4U7O A; 4QJF B; 4J30 B; 3FOP A; 3BPZ A; 2WLL A; 2Q69 A; 4RDA A; 1XNR O; 3IQC A; 3KPH A; 3D36 C; 4XDK A; 2OOC A; 4UDV A; 1YJN V; 1QR8 A; 1DOW A; 3QVY A; 3OE7 G; 3D8C A; 2Y3D A; 3OR7 C; 2R7R A; 3FB7 C; 1ZHT A; 4JPR A; 4TUY B; 2UUA B; 1JFF A; 1U0B B; 4PEL A; 3T6J A; 3S90 A; 2QR4 A; 2FYU H; 3ECS A; 3JSE O; 2PI4 A; 5IYZ B; 1WGW A; 1AJP A; 4NR1 A; 2M6Y A; 3AGU A; 1XEQ A; 1HW1 A; 2YUA A; 1NH2 B; 4RUE A; 2H8A A; 4LH6 A; 4KI2 A; 2GUZ A; 4JYC A; 3UMH A; 3GOD A; 4FLU A; 3W7S A; 4G27 B; 3D36 A; 4UB6 Z; 3Q4H B; 4GZR B; 1H6G A; 1TVK B; 4FLT A; 4MVM A; 1LI7 A; 4G7Z F; 2ZXP A; 1NJI W; 1D1A A; 2G62 A; 1AR5 A; 4HEA J; 4X20 B; 1QQ3 A; 3LJB A; 2ZIM A; 4Z9H A; 3E35 A; 4NTF A; 2H7V C; 3LDE A; 2ASR A; 2EPO A; 1YYJ A; 1OQC A; 1YA7 O; 3JD3 A; 4J7Y A; 5IDJ A; 4FJC C; 5A6J A; 3J7A U; 5TIS Z; 1IXB A; 4UCT A; 1IZ3 A; 4I7Z B; 1ZHW A; 2M4E A; 1XQ8 A; 2WZL A; 3B4S A; 4TOI A; 2E87 A; 1AVM A; 4JEA A; 2IXN A; 2R7V A; 3MDS A; 1VMG A; 3K66 A; 4U3J A; 2QUP A; 4YJ2 A; 2WA4 A; 3M15 A; 4PA3 A; 1XI1 A; 3TXQ A; 1VIB A; 2A3Q A; 4YY3 O; 5CA3 A; 4X1K B; 3SJB C; 1VLT A; 5DED A; 2ICW G; 2XLW A; 5FPR A; 2P6J A; 1UFB A; 3B0P A; 3HNJ A; 5E1A C; 2A7W A; 3HKD B; 2IBF A; 1NKD A; 2A9H A; 4H13 B; 2YZS A; 1FXH A; 3AG7 A; 3VQV A; 1COW G; 2XUM A; 1OHH G; 2ZXW C; 3EFF K; 4R32 A; 4AL1 A; 1FFH A; 1K9M W; 1APC A; 1DOV A; 2H94 A; 5DS5 A; 4M63 A; 4IAQ A; 2EIK C; 4I44 A; 1H38 A; 4X89 A; 4CBC A; 2LQT A; 4IGG A; 3OUS A; 3ABT A; 2YEV A; 1AB3 A; 3CD6 V; 4FES A; 5AGF A; 5HV9 A; 5L0I A; 2B0H A; 4QE7 A; 1V55 B; 3RVY A; 1EQ1 A; 1SR2 A; 4JI5 B; 4CS8 A; 1NS1 A; 2KC3 A; 4I55 B; 4GCZ A; 3FB5 C; 2ADP A; 3H2V A; 1YJG A; 3AG4 B; 4CS9 C; 2YC0 A; 4NTY A; 3T1H B; 1FAF A; 1SC5 B; 2A06 H; 1FFX A; 4BIO A; 4GKK B; 2GTS A; 5H6R A; 1M2V A; 2IYL D; 5GTH Z; 3EJN A; 2NLJ C; 1PKX A; 4KHP O; 2N74 A; 2X7R B; 2Q4P A; 3ZQY A; 1Y4C A; 5LYJ A; 5F5F A; 4JI6 O; 4FVM A; 4Z1M G; 1BL8 A; 4JJF A; 5H9C A; 4LFC O; 4TV9 B; 1VQM V; 1I4Z A; 5LOV B; 3U3B A; 1K40 A; 3BCC H; 1CGM E; 4FX5 A; 3CXC U; 2FML A; 4JTD B; 2ETN A; 1YTF B; 2IU0 A; 3IC7 A; 1QKR A; 2HP8 A; 4DV4 B; 1RPR A; 5D91 A; 3RT3 C; 5L3B A; 2EJ7 A; 1J8M F; 4Z2W A; 4NTW A; 4I9Q A; 5CB4 B; 4X62 B; 1FJG B; 1GN4 A; 4KXR A; 1BR1 A; 4NC3 A; 2WVN A; 1AR1 B; 4DYL A; 3OT7 A; 4TV8 B; 2ZIO A; 2MWQ A; 3TK0 A; 1TFK B; 1ROP A; 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