The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
90
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sequence length |
240
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structure length |
240
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Chain Sequence |
MTTFHDLPLEERLTLARLGTSHYSRQLSLVDNAEFGEHSLLEGWTRSHLIAHVAYNAIALCNLMHWANTGEETPMYVSPEARNEEIAYGSTLNPDALRNLHEHSVARLDVAWRETSEDAWSHEVLTAQGRTVPASETLWMRSREVWIHAVDLGAVATFGDIPEVILRTLAAEITQKWTSQGAGEGLVLLDEPSSTRYPAAPGQDEVVVSGSLAGIVRYAAGRGSDGVTSSTGEVPEPPRW
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structures and Site-directed Mutagenesis of a Mycothiol-dependent Enzyme Reveal a Novel Folding and Molecular Basis for Mycothiol-mediated Maleylpyruvate Isomerization
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical protein Cgl3021
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| molecule tags |
Isomerase
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| source organism |
Corynebacterium glutamicum
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| total genus |
90
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| structure length |
240
|
| sequence length |
240
|
| ec nomenclature |
ec
5.2.1.4: Maleylpyruvate isomerase. |
| pdb deposition date | 2006-11-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF11716 | MDMPI_N | Mycothiol maleylpyruvate isomerase N-terminal domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | dinb family like domain | ||
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nonspecific Lipid-transfer Protein; Chain A | Nonspecific Lipid-transfer Protein; Chain A |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RD9 A; 5COM A; 2OU6 A; 4N6C A; 2P1A A; 3QTH A; 5COG A; 1RXQ A; 2QNL A; 2F22 A; 2YQY A; 2NSG A; 3GOR A; 2QE9 A; 3DKA A; 5COF A; 5CIV A; 2NSF A; 2OQM A; 3DI5 A; 3CEX A; 2HKV A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4MTO A; 5L0I A; 3B71 A; 2G62 A; 4ULW A; 3SXY A; 1ZHY A; 4BJ1 A; 2H7O A; 2VCB A; 2XL8 A; 3FMS A; 3S27 A; 4E17 A; 5DVW A; 2G3K A; 3GWN A; 4OIN F; 3T9O A; 2LK4 A; 1Z7Q c; 1ZU4 A; 3ZIB A; 4EKW A; 3R2P A; 1LM3 B; 1TFK B; 1EKY A; 1Q0K A; 4O6N A; 4Z9H A; 4CS9 A; 4DRJ B; 4JUR I; 1BR1 A; 4NCQ A; 4MQ9 F; 3FHD A; 5A6A A; 2XLV A; 3H2V A; 4O7G A; 4JZA A; 2UUH A; 5TJ5 E; 4CS9 C; 2AWY A; 2IM8 A; 3U9M A; 3W8I A; 1RMV A; 5A23 A; 1OCO C; 1ZW2 A; 2A68 F; 3SXK A; 3SXZ A; 1LI7 A; 2Q3T A; 3JRM O; 3CEX A; 3R7C A; 3S9O A; 5D91 A; 1JAF A; 3IQ6 A; 4ZLD A; 1Z5Z A; 2Z15 A; 2R7Q A; 3LNR A; 2NUP A; 1TWA A; 5KYY A; 2KGO A; 4YN0 B; 1BZ4 A; 1XZQ A; 2D4U A; 3K33 A; 4EIY A; 1HMO A; 3HLZ A; 3MYI A; 2DYS C; 3DJN B; 4JGX A; 3SSO A; 4XEF A; 1FFH A; 2IXO A; 3L1M A; 1YYX A; 5KYW A; 3SEO A; 5EGY A; 1ZU5 A; 2M4E A; 2BC5 A; 1WOL A; 2F22 A; 4E7Z A; 3MLG A; 1FFT C; 3K6B A; 4LDK A; 3G4X A; 3PHF 2; 2CNW D; 2R9R B; 2Y3D A; 1LKX A; 3T6J A; 4PJN A; 3M15 A; 2QE9 A; 3AQB A; 3BDQ A; 2J0W A; 3EH1 A; 5COF A; 5JUA A; 1PV3 A; 1GS9 A; 1YJG A; 4IJJ A; 3TD7 A; 1NZE A; 4PFP A; 1L7C A; 3L8J A; 3KKB A; 1SF8 A; 3NMI A; 4JC7 A; 4PK4 A; 1JRA A; 4JW1 A; 3EH2 A; 5AC5 A; 3G4Z A; 3DI5 A; 3MFN A; 4BJ5 A; 5DS6 A; 1LE4 A; 2KNH A; 2HMQ A; 3IPM O; 3GEH A; 2OG2 A; 3PDM P; 4BPM A; 3LLK A; 1MNE A; 2PNO A; 4EWC A; 4G7H F; 2NBN A; 2OKU A; 1APC A; 4BJ5 C; 2M64 A; 3FAP B; 3DD7 A; 3FOO A; 3NMJ A; 2Y3G A; 2ZXW C; 4XWJ A; 5L0H A; 1QQ3 A; 2NUT B; 5CI8 A; 3NMK A; 4JE9 A; 2BL2 A; 3ZDL A; 2D5R B; 1TFO B; 2I00 A; 1LPE A; 2ETS A; 2XS8 A; 2YLI A; 4O79 A; 3I5Q A; 3SZR A; 1G4U S; 5F5H A; 2IOQ A; 2WVQ A; 2MYS A; 2NSG A; 2YLG A; 2YEV A; 3ABL C; 3ATP A; 3HTK C; 5L3Q A; 4OIP F; 1BR2 A; 2I15 A; 3DWW A; 4R32 A; 1WAT A; 1IW7 F; 4NY3 A; 3UMI A; 2HV6 A; 1YYJ A; 3GM3 A; 1CGM E; 1M57 C; 4C3E A; 2NBM A; 2V26 A; 4KNV A; 2XLM A; 2YVK A; 3WOD F; 3LUT B; 5CI9 A; 2HV2 A; 4YT2 A; 4MVO A; 4Z9J A; 1T6U A; 4CJO A; 1LS1 A; 2KC3 A; 2YL0 A; 3TOM A; 3UMK A; 5DS5 A; 4E18 A; 5A6K A; 3KYJ A; 3QZC A; 1IZM A; 1QSP A; 2LP4 A; 3I4U A; 2R03 A; 4IAR A; 2R7O A; 4WAB A; 4YK5 A; 1H9G A; 1R5I D; 1FMV A; 3GM1 A; 4CS7 A; 2EPN A; 4WGY A; 4GQH A; 2NG1 A; 1G5Z A; 4YJW A; 2Q9A A; 4AL0 A; 1MND A; 4U5G A; 5KYN A; 3LES A; 4C7O B; 3FOP A; 2GDC A; 2CDQ A; 2XSE A; 2YLD A; 2WB7 A; 4YWQ A; 1BBH A; 3PMR A; 3X2Q C; 2HSB A; 5B3I A; 3SP1 A; 2EIL C; 4E7S A; 3AGU A; 3EJN A; 5JLI A; 5F5F A; 3Q7L A; 1JPN A; 4EBJ A; 3S90 A; 1ORJ A; 4JIO A; 4I3M A; 5L0J A; 2W4B A; 3MBG A; 4U9E A; 2HV7 A; 2KSH A; 3NDB B; 3M1C B; 1LIH A; 4PJJ A; 2UUI A; 2Q4F A; 2Y3B A; 4IAO A; 4NTB A; 4BEJ A; 1NBB A; 3CQZ A; 4EBB A; 5JS5 A; 1T01 A; 3H65 A; 1YVI A; 1E2X A; 4BG0 A; 2QLA A; 2A69 F; 4K1O A; 4AXH A; 1Y4C A; 4YL3 A; 1MMN A; 4CIH A; 3S29 A; 1YA7 O; 4JCH A; 4U9D A; 1RKC A; 3B9Q A; 4MS2 A; 2R7U A; 256B A; 2E87 A; 3E70 C; 3LS0 A; 1M2V A; 4JVS A; 3DMD A; 2OEV A; 3KYI A; 4ANJ A; 2QUP A; 4KI2 A; 3IQT A; 3NKE A; 4NTA A; 1WN0 A; 1NU9 C; 2AWC A; 3Q6M A; 4YL1 A; 3HJC A; 5A6B D; 2GWW A; 4FX5 A; 4E0H A; 5BUO A; 1O5H A; 3ASO C; 5DS4 A; 1A7E A; 2J7P D; 1AEP A; 3J06 A; 4DVY P; 1ZVZ A; 3JZ0 A; 3ZTM A; 5EK0 A; 3RQE A; 4JKV A; 1C02 A; 2ASR A; 1HE9 A; 2Q9C A; 1A7V A; 3CNU A; 4N6C A; 3SXN A; 2J9W A; 2R25 A; 4MVU A; 4XQ1 A; 3RQG A; 1TQG A; 5L0D A; 3RQF A; 3BN8 A; 1T6Q A; 3EGD B; 1QVX A; 1U89 A; 4MVZ A; 3ABK C; 2CCY A; 3KMI A; 1JPJ A; 3VF0 A; 4CDV A; 1BDJ B; 1ZHX A; 3DM9 B; 2WL8 A; 1ZHW A; 4H54 A; 2G3V A; 3JTL O; 3N24 A; 4HFF B; 4QB9 A; 4YT4 A; 4D4N A; 1CPR A; 4CSA C; 2PP4 A; 4MY0 A; 2HFI A; 2XLD A; 3DKA A; 2R7T A; 4XPW A; 2HUJ A; 3UNG C; 3SYN A; 4KBL A; 5BQG A; 1A0B A; 1OW7 A; 3SXO A; 1EQ1 A; 2OOC A; 2VC9 A; 3KL4 A; 3U2M A; 4CIP A; 2CYD A; 1ZHT A; 1RCP A; 2XLE A; 3S28 A; 4JCZ A; 4JD6 A; 1VK5 A; 1O3U A; 1OR3 A; 2TMV P; 3HKK A; 3EFO A; 3POV A; 3G50 A; 4AL1 A; 3CZ6 A; 3UMH A; 3EPV A; 4JTD B; 3AG4 C; 2IXN A; 1AUE A; 1Q0G A; 4J32 B; 1RJ9 A; 3JSE O; 3EGX A; 3X1O A; 5EBV A; 1HMD A; 3GOD A; 2Y69 C; 4AE4 B; 4FES A; 2QNL A; 5L0F A; 4U5F E; 4YT5 A; 2YHE A; 3NYM A; 3LLI A; 3B0U X; 3AJM A; 4IGG A; 1K04 A; 3GOR A; 4FWV A; 5BQI A; 3S84 A; 2WZG A; 4MTF A; 1V54 C; 3LS1 A; 4CS8 A; 3RYL A; 3LEV A; 4XEK A; 2XM0 A; 1VLT A; 2L9J A; 1TWG A; 4YL0 A; 3US6 A; 1FMW A; 1QKR A; 3AG1 C; 1FR0 A; 5AIJ A; 2P6V A; 4KNW A; 2YRF A; 4CS8 C; 4CJG A; 5KYU B; 4WJ0 A; 4ZY7 A; 2KW3 C; 4NTF A; 1OR2 A; 1E85 A; 4J30 B; 2IBF A; 3B0P A; 3ZC4 A; 1KTM A; 4G0H A; 1NLX A; 2QTV A; 3I5P A; 5B3S C; 4KC9 A; 3TOL A; 5B1A C; 5B1B C; 4Q4Z F; 3C8G B; 4QI2 A; 1CPQ A; 3C8G D; 2Q7R A; 1NG1 A; 2CW0 F; 1PD1 A; 2HMZ A; 5GPG B; 3FXH A; 3JCU Q; 1XZP A; 3Q6N A; 4F4B A; 2QY9 A; 2YZS A; 4LAC B; 1L3P A; 3RVY A; 3DE9 A; 5E3C A; 3ZTZ A; 4A2N B; 2DGJ A; 2J9U A; 2PBE A; 3NYL A; 1JOG A; 3U2L A; 3IQ5 A; 2B0H A; 3DE8 A; 2JPU A; 1M2O A; 2JD3 A; 2OEX A; 2Y39 A; 1PD0 A; 3V5Z A; 3RIP A; 2R7V A; 3ASN C; 1QZX A; 1S7Z A; 3TQO A; 3U3F A; 2GAQ A; 1HW2 A; 1JR8 A; 5AGF A; 4JEB A; 1OKK D; 3QVZ A; 3U3B A; 2AU5 A; 2HJM A; 4G7O F; 5IV0 A; 1TR2 A; 4DRH B; 4W8K A; 3EQL F; 2R7S A; 5KYX B; 5T1D B; 3U0C A; 4B6I A; 5A69 A; 4MW8 A; 3DAF A; 4OIO F; 4G78 A; 3SSM A; 2EPM X; 1SYQ A; 2XL4 A; 2EIJ C; 2YQY A; 2B0J A; 3O55 A; 4HEA J; 4M63 A; 4OD5 A; 4MVM A; 2MWQ A; 3HNI A; 4PJM A; 4XEV A; 2KJG A; 2L81 A; 2A0B A; 5L0G A; 3NG1 A; 2VCC A; 2C04 A; 5DLJ A; 1WGW A; 1YA9 A; 1PCX A; 4OIR F; 3RW0 A; 3W2W A; 1HY5 A; 4A4A A; 1HE1 A; 2CGE A; 5T3T A; 2V3C C; 1QND A; 2IXM A; 4DBR A; 1LI5 A; 4EBK A; 1OW6 A; 4MW3 A; 1PZ4 A; 1C03 A; 4QDL A; 1J8Y F; 1TWC A; 2H7V C; 3LAY A; 1M56 C; 3WAQ A; 5T3W A; 3C63 A; 3O39 A; 2CG2 A; 1I5N A; 3L8I A; 3NYJ A; 1E83 A; 4CDA A; 2A1D D; 2FAP B; 3E9V A; 4LLC A; 3EHN A; 1D0Z A; 2NUT A; 4K0D A; 2DI3 A; 4Q5S F; 3F47 A; 1KNY A; 2VCA A; 3QW1 A; 3OWT A; 4PDX A; 1B68 A; 3MYF A; 3UGP A; 2I8B A; 1MMA A; 2LQG A; 3RKO F; 2YKZ A; 2R7X A; 2XL6 A; 3RFY A; 2XS1 A; 4DVZ A; 3DXJ F; 2OJE D; 3KPH A; 4XPX A; 2AVK A; 3RF3 A; 1ZHZ A; 3JT1 A; 4MVR A; 4N4W A; 1H6G A; 4RBN A; 4K7B A; 1G8X A; 2ZD9 A; 3EG9 B; 4IB4 A; 4XPY A; 5AJL A; 5EC4 A; 2EIM C; 3A9C A; 4GEH A; 3VM6 A; 4LLE A; 2C03 A; 4NSS A; 2BE5 F; 2XLW A; 3UY5 A; 1MMG A; 2RD9 A; 3HNJ A; 1ZZP A; 1WAS A; 4EUK B; 3MX3 A; 2H7B A; 4ZLC A; 4CX9 A; 2YL3 A; 2L6H A; 3JRT A; 1TKN A; 3NRH A; 3ECS A; 5COG A; 4U5C E; 2KK1 A; 2NUP B; 2J0X A; 2ZXR A; 5KYY B; 2C0L B; 3DM5 A; 1E84 A; 1R4T A; 3EZI A; 3TK0 A; 4CSA A; 3W2V A; 3LJB A; 3W4Y A; 1A41 A; 4C7O A; 4J7T A; 5E2Q A; 5KYW B; 5JVE A; 1T9K A; 3GEI A; 4OIQ F; 2IXP A; 1Y6D A; 1WWP A; 3JYH A; 3TJ5 A; 2R7R A; 3UGO A; 4PAC A; 2ICW G; 2A0U A; 2EPL X; 4Z9I A; 3GAN A; 2JX0 A; 5AC4 A; 2NSF A; 2ZXO A; 5IY5 C; 2HSQ A; 4N6H A; 4ONS A; 3V7O A; 2J8W A; 3OA1 A; 2P7V A; 3U5S A; 1Z6A A; 1YAU O; 1O87 A; 3EHM A; 3L0I A; 2J9B A; 1Q0D A; 2L7A A; 3Q7G A; 5EHH A; 2QZT A; 1T6I A; 1V74 B; 2LD6 A; 3FDQ A; 1QPU A; 1SZI A; 3ZWI A; 4WGZ A; 1GQA A; 3CAX A; 5BQH A; 3BKS A; 1H7I A; 1OCZ C; 3SXM A; 4G7Z F; 3M4B A; 4JJF A; 3ZVR A; 3PCV A; 3A11 A; 1LVK A; 2OJQ A; 4FAP B; 3ZQY A; 4P6I C; 3U9J A; 1OXB A; 3GWL A; 1ORS C; 1VYI A; 1SR2 A; 2ZPA A; 4JRZ A; 5K0I A; 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3F46 A; 2O9X A; 1FTS A; 4C3B A; 3AG2 C; 4X0R A; 1U0B B; 1HW1 A; 1FAP B; 3M79 A; 1D1A A; 4IAQ A; 3ZSU A; 4AE4 A; 2XXA A; 3AQC A; 3N0T A; 4HE8 D; 4U5B E; 3VYW A; 2WZF A; 1W2W A; 1N1C A; 2CNW A; 3FVY A; 3N2Z B; 1AVO B; 3K1I A; 2CFZ A; 4PFO A; 1K05 A; 1KU2 A; 3O10 A; 3OEO A; 2Q00 A; 2AP3 A; 1RKE B; 2KSF A; 2X51 A; 3ABM C; 4MVS A; 5E3A A; 4E0I A; 5FCL A; 2VH3 A; 3TUL A; 1ZYR F; 2EPO A; 1ST6 A; 3LNM B; 3K1I C; 1M2V B; 3QW0 A; 3R1K A; 3T6B A; 2CFU A; 4AK9 A; 3K7D A; 3BKR A; 3BRJ A; 3DAG A; 3WG7 C; 4L6R A; 1GGQ A; 2EIK C; 2YWA A; 3B29 A; 5KYU A; 4OD4 A; 2HKV A; 2IYL D; 3DZA A; 3QVY A; 3AG3 C; 3DJU B; 2YL1 A; 3IEE A; 2R7W A; 4JJG A; 5HV9 A; 4HFK B; 1OW8 A; 3CSK A; 3C8G A; 4GYT A; 5JRA A; 5JP7 A; 1E86 A; 1V4A A; 2ZXP A; 4NQF A; 4PJL A; 1JMW A; 1OXK A; 3U8V A; 5JT4 A; 4Q7C A; 2W45 A; 1RXQ A; 4U5D E; 3RVZ A; 1VLS A; 1EA8 A; 1SMY F; 2RSE B; 2WVO A; 3FAJ A; 1NU7 D; 4XTK A; 4ULV A; 1IKT A; 2LCH A; 2CX7 A; 2LFF A; 4IWB A; 3ZQV A; 3AOU A; 2R05 A; 1XWJ A; 3LEO A; 1F1M A; 4LDR A; 4AX2 A; 2W4M A; 2W9Y A; 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