The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
|
sequence length |
109
|
structure length |
109
|
Chain Sequence |
SGAITKGVVLDSTEALCLAISRNSEQMASHSAVLEAGKNLYSFCVSYVDSIQQMRNKFAFREAINKLENNLRELQICPATAGSGPAATQDFSKLLSSVKEISDIVQRLE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ABL1
|
| publication title |
Structural Basis for the Cytoskeletal Association of Bcr-Abl/c-Abl.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Transferase
|
| total genus |
29
|
| structure length |
109
|
| sequence length |
109
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2005-06-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF08919 | F_actin_bind | F-actin binding |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | Nucleotidyltransferases domain 2 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4NQF A; 1K04 A; 1UFB A; 2KK1 A; 1V4A A; 3RQF A; 3B71 A; 2Q00 A; 3K7D A; 1PV3 A; 2L6G A; 4EBJ A; 3GM2 A; 1QVX A; 2PBE A; 4EBK A; 1OW7 A; 1OW8 A; 3C8G A; 3C8G B; 3C8G D; 3L8J A; 3GM3 A; 3MFN A; 1KTM A; 3JYY A; 2LK4 A; 3C18 A; 2JPU A; 2HSB A; 1K40 A; 2YWA A; 1O3U A; 3RQE A; 1WOL A; 3AJM A; 3JZ0 A; 4XEV A; 3O10 A; 3BRJ A; 3U0C A; 3RQG A; 2JX0 A; 3L8I A; 1ZZP A; 1OW6 A; 4XEF A; 1WWP A; 2L6F A; 4R32 A; 2L6H A; 1JOG A; 3U3F A; 1K05 A; 3GM1 A; 3S9O A; 4XEK A; 5F28 E; 1WTY A; 1KNY A; 3TUL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EQL F; 2QNL A; 3HNJ A; 2XLW A; 3LNR A; 4CX9 A; 1LI5 A; 1MMD A; 3U8V A; 4MVM A; 1D0Y A; 4J30 B; 3NMI A; 1RMV A; 2P61 A; 4U5F E; 5DS4 A; 2PNO A; 1Z7Q c; 3RKO F; 4JTC B; 4KC9 A; 3IQ6 A; 2IYL D; 4I3M A; 3E70 C; 3HLZ A; 3AQB A; 1VLT A; 2LP4 A; 4MVU A; 4JKV A; 1S7Z A; 2AWC A; 1OCO C; 2C03 A; 4OIN F; 5L0G A; 2G3V A; 3TJ6 A; 3EZH A; 5A6B D; 1C17 M; 3Q7L A; 2IOQ A; 5D91 A; 2FAP B; 2MWQ A; 2NUP A; 3RFY A; 3ZWI A; 5EGY A; 4CSA A; 1VYK A; 3GAN A; 4CDA A; 3KYJ A; 4P9T A; 3GM1 A; 3JYH A; 3EGD B; 5F28 E; 1J8Y F; 4EBB A; 4AE4 A; 2LCH A; 2W45 A; 2YHS A; 4N6C A; 4XPY A; 3NMK A; 2IM8 A; 3N2Z B; 1EQ1 A; 1GM5 A; 4JEB A; 2V26 A; 5BQG A; 3S90 A; 4PK4 A; 3ZTM A; 1G4U S; 3JTL O; 1OXB A; 2V3C C; 4DBQ A; 3O55 A; 5AGF A; 2A6E F; 3ZTZ A; 1LKX A; 3X2Q C; 1AVO B; 3AG1 C; 2OOC A; 1BDJ B; 3KKB A; 4EWC A; 2HSB A; 2EIL C; 5L0C A; 3V5Z A; 1I4Z A; 3NYM A; 1MMA A; 2EPO A; 4ULW A; 5F5H A; 3NKE A; 3RQG A; 1WGW A; 5KYN A; 3FAJ A; 1ZZP A; 1TFO B; 3JSZ A; 4LAC B; 1FMV A; 4NTB A; 4XEF A; 5EK0 A; 3TQO A; 4F4B A; 5KYW B; 4QI0 A; 1OCR C; 1I5N A; 1RKC A; 5JP7 A; 4K1O A; 4AX2 A; 1MND A; 3EH1 A; 1DOW A; 1XZQ A; 2HMQ A; 3CSK A; 2R02 A; 3ABL C; 3ZIB A; 3EGX B; 1MMG A; 4L6R A; 1CGM E; 1UFB A; 3GOD A; 4J7Y A; 1LPE A; 2Q00 A; 1D0Z A; 4C7O B; 1ZU4 A; 2FGY A; 4E0I A; 2YL3 A; 4KI2 A; 4WGZ A; 2PX3 A; 1Z23 A; 1LIH A; 3MLG A; 1RCP A; 1IW7 F; 3UGO A; 3MFN A; 3B9Q A; 4PFP A; 1NFO A; 1F1M A; 3AG3 C; 4N4W A; 4E17 A; 3ZQV A; 1Q0M A; 2XM0 A; 3IHU A; 1QLE C; 3EG9 B; 1T6I A; 2G3K A; 3DWW A; 4IGG A; 5B1B C; 4QI2 A; 2E87 A; 2AWY A; 2J45 A; 4LLE A; 4RDA A; 2Q7R A; 5JT4 A; 2AU5 A; 4MVQ A; 2X51 A; 1ZVZ A; 3PDM P; 3FAP B; 4IWB A; 2YKZ A; 5A6K A; 1OKK A; 2XLE A; 1OCZ C; 1OQC A; 1NU9 C; 3K66 A; 2KW3 C; 1Q0K A; 2OU6 A; 4HE8 D; 1LVK A; 1WAT A; 1L7C A; 3MBG A; 4PJL A; 1BR4 A; 4BJ6 C; 2R7W A; 3W8I A; 5GPG B; 5HV9 A; 4KNV A; 1CPR A; 4ER9 A; 4CBE A; 2Y39 A; 4JC7 A; 1YYX A; 2H7V C; 4C3B A; 1E2X A; 2KSF A; 2R7T A; 4EBK A; 4GEH A; 1U89 A; 1Z3I X; 4HFF B; 2IXN A; 3K6B A; 2HKV A; 1QSP A; 3IQT A; 1HW1 A; 4P6I C; 4CJO A; 4CIH A; 5L3V A; 3NDB B; 4N6H A; 1WOL A; 3NYL A; 4MQ9 F; 2A6H F; 2OKU A; 2Y3B A; 3AJM A; 3LLK A; 1MQV A; 2OEV A; 3TK0 A; 3U3B A; 5KYY B; 2NUT B; 3QVZ A; 3SXY A; 3EJN A; 3SP1 A; 1EA8 A; 3C63 A; 3O39 A; 1BR2 A; 3UMH A; 4Q5S F; 4N06 A; 3NYJ A; 4U5H A; 2OCC C; 3I4U A; 1PCX A; 3NG1 A; 4YT2 A; 2ASR A; 3EZI A; 4Z9I A; 2GAQ A; 3FXH A; 5AC4 A; 2IXM A; 3C7J A; 4NQF A; 4P9F A; 2HS5 A; 1FFT C; 3DJU B; 5CI9 A; 1C02 A; 2NSF A; 2M64 A; 4ULV A; 3FHD A; 3TOM A; 2LSE A; 1KU2 A; 2VH3 A; 2YQY A; 4C3D A; 1CGO A; 2H7B A; 1M2O A; 1E83 A; 2W9Y A; 4U5G A; 1RJ9 B; 2YRF A; 4XWJ A; 2R7R A; 2QTV A; 3C8G B; 2CNW A; 3G50 A; 3GM3 A; 4JTA B; 1H7I A; 1JR8 A; 3C18 A; 3NMJ A; 3M15 A; 5KYX B; 1H6G A; 2HFI A; 2R7S A; 2YWA A; 3EFO A; 1L3P A; 2J8W A; 3DE8 A; 4E7Z A; 1M2V A; 3WHN A; 1TR2 A; 3ASN C; 5HSW A; 3BRJ A; 3H65 A; 3K1I A; 1O87 A; 1NU7 D; 1JAF A; 4LER A; 4DRJ B; 3X1O A; 3FOP A; 1VTM P; 2DYS C; 2YZS A; 3JT1 A; 1NSG B; 4BJ1 A; 4CS9 A; 3W2W A; 4AK9 A; 4D4N A; 4EHP A; 1A0B A; 1K05 A; 3A11 A; 5JS5 A; 1YLM A; 3PCV A; 2QUP A; 2KGO A; 1G8X A; 4U5C E; 4X0R A; 1RKE B; 3ZVR A; 4YT8 A; 5K0I A; 3HTK C; 2OQM A; 2OEX A; 4KBL A; 2GFH A; 3DZA A; 3RIP A; 1N1C A; 1QVX A; 2A0U A; 2CDQ A; 2XLD A; 3ITF A; 3EH2 A; 1T9K A; 2JD3 A; 4BJ6 A; 2X0C A; 2VCC A; 3C8G D; 1A41 A; 1MMN A; 2C04 A; 3OA1 A; 1W2W A; 2LK4 A; 4JCH A; 3RF3 A; 4LDQ A; 3SEO A; 2EIJ C; 2QE9 A; 3U9J A; 4BEM J; 4ANJ A; 1Q0G A; 2J9U A; 1ORY A; 3RH3 A; 3UNG C; 5D92 A; 3RW0 A; 1U0B B; 2XLO A; 3DMD A; 5L0J A; 1S05 A; 3EPV A; 3NRH A; 3UR3 C; 4G7Z F; 1HW2 A; 2KQ9 A; 3WG7 C; 2I8B A; 1AUE A; 2YLG A; 3S29 A; 3DJN B; 2L6H A; 2OJE D; 1FFH A; 4DRH B; 1UG7 A; 2LFD A; 3CQZ A; 3Q6M A; 4CS8 C; 5JUA A; 2P1A A; 3WAQ A; 1J8M F; 3R2P A; 2R9R B; 3RQF A; 5BQI A; 3V7O A; 2MYS A; 1OCC C; 1SYQ A; 2YLI A; 3L0I A; 3LJB A; 3OWT A; 1FAP B; 2WZL A; 2XRH A; 2PFD A; 1OW7 A; 3JRT A; 4PJJ A; 1CGN A; 2A68 F; 4DVY P; 5B3S C; 3KH2 A; 3JYY A; 1FMW A; 3T4R A; 4IB4 A; 3B0P A; 4MVS A; 4B6I A; 5T3W A; 4BG0 A; 2Q3T A; 1V55 C; 4XLP F; 3PHF 2; 2HZ8 A; 4CDV A; 3U0C A; 3CZ6 A; 2WL8 A; 4OIO F; 1WWP A; 4EUK B; 1ZHT A; 3HNI A; 3AOU A; 4Q4Z F; 5CI8 A; 2AP3 A; 5DQT A; 3EHM A; 2AVK A; 2H7O A; 2NG1 A; 4LDK A; 4MTG A; 1VYI A; 4JJG A; 1D1A A; 3HKK A; 3LES A; 3R7C A; 4IJJ A; 2LIG A; 2PF4 E; 4XPW A; 5COG A; 3S0X A; 3AQC A; 4DRI B; 4H54 A; 2W4M A; 3BEH A; 4YL1 A; 5A69 A; 2LQG A; 4BJ5 A; 3MYI A; 2RSE B; 4IAO A; 4JVS A; 2WVQ A; 2R7X A; 1JRA A; 2LFF A; 3W8H A; 2DB4 A; 5DQZ A; 3HJC A; 3ZC4 A; 3U2M A; 3RVY A; 1YJG A; 5COF A; 3FOO A; 5IY5 C; 1XZP A; 4MW3 A; 2ETS A; 3JZ0 A; 3V5Y A; 3SNH A; 5BUO A; 2J46 A; 4BEJ A; 3S84 A; 1E85 A; 2WVN A; 1GS9 A; 1R5I D; 3DD7 A; 5JLI A; 2NUP B; 5A6J A; 2J7P A; 3S28 A; 1JOG A; 1LI7 A; 1APC A; 1R4T A; 4CIP A; 1LE4 A; 2J0W A; 3H2V A; 4FWV A; 1T6U A; 2KNH A; 3DM9 B; 3UMK A; 5E3A A; 2CGE A; 5JSL A; 4AE4 B; 1VLS A; 3I5P A; 1HE9 A; 2HV6 A; 4E0H A; 4J32 B; 4U5E E; 1GQA A; 3IQ5 A; 4YWQ A; 1BR1 A; 4PFO A; 5B3I A; 4XTK A; 3DKA A; 3E9V A; 3I5Q A; 4LDR A; 4DOZ A; 4E7S A; 2J9B A; 2EIN C; 2VCB A; 4Z9H A; 3M4C A; 2D5R B; 4I44 A; 1EI7 A; 5KYU A; 2XLH A; 2EIK C; 3KL4 A; 2IBF A; 3N24 A; 4ONS A; 1YA9 A; 1ZHZ A; 2HJ3 A; 2L6F A; 2A0B A; 3DAG A; 3GWN A; 3JCU Q; 3KMI A; 1YDI A; 5DLJ A; 4FES A; 1HE1 A; 2J9V A; 2CCY A; 2XXA A; 3DE9 A; 3GEI A; 2WVO A; 3LS0 A; 2XLM A; 1GGQ A; 2ZXO A; 3W4Y A; 1V4A A; 3ECS A; 2EPN A; 3B71 A; 3QW0 A; 3ZDL A; 1PV3 A; 1OR2 A; 2L6G A; 4IRU A; 2PBE A; 4JE9 A; 1SMY F; 3DAF A; 4MW8 A; 4EKW A; 2GDC A; 3AGT A; 2I15 A; 4JZA A; 2EPK X; 3CAX A; 1NG1 A; 4W8P A; 3LEV A; 4W8K A; 2BC5 A; 3W2V A; 3IPM O; 2Q9C A; 2HSQ A; 3CEX A; 2KJG A; 1WAS A; 2HJM A; 2R03 A; 2VCA A; 3DM5 A; 3H2U A; 4YK5 A; 3LNM B; 5L0F A; 5F5F A; 1ZHX A; 2XM4 A; 4LLC A; 4JCZ A; 4EIY A; 2QY9 A; 4DJ9 A; 1Z6A A; 5E3C A; 1FNT c; 4G7O F; 4PJM A; 1ORJ A; 2D4U A; 1QKR A; 2NSG A; 3EGD A; 3ABK C; 1WTY A; 2J0X A; 3B0U X; 1TWG A; 1XWJ A; 2KYH A; 3VYW A; 2WB7 A; 3L1M A; 4O6Y A; 3VAY A; 4DVZ A; 3QTH A; 3GM2 A; 1HMO A; 3MYF A; 4NY3 A; 3TOL A; 1YVI A; 4FX5 A; 4G7H F; 1Q0D A; 1KTM A; 4NCQ A; 1ZU5 A; 3L8J A; 4ZLD A; 4RD9 A; 2YL7 A; 2UUI A; 4WJ0 A; 3L34 A; 2BE5 F; 1YAR O; 3GWL A; 3QVY A; 3QW1 A; 1VOM A; 2DGJ A; 1O3U A; 1CPQ A; 3K33 A; 5L0I A; 1TWH A; 3TD7 A; 2XS1 A; 4E18 A; 1OR3 A; 1WN0 A; 3FVY A; 3C62 A; 3O10 A; 3LAY A; 3US6 A; 4NTF A; 3L8I A; 5AC5 A; 4UDV A; 4OIP F; 5KYW A; 4U5B E; 1OKK D; 3B0V C; 4JW1 A; 3U3F A; 1ORS C; 2P6V A; 1JMW A; 4A2N B; 2XS8 A; 4XPX A; 3FMS A; 3QMK A; 4XEK A; 3TUL A; 4D4X A; 3A9C A; 3EGX A; 2GWW A; 1KNY A; 5DS6 A; 4MVR A; 1LS1 A; 2O9X A; 3U5S A; 1TQG A; 4MVZ A; 2H8A A; 2M4E A; 5DS5 A; 1TKN A; 3K7D A; 3SXK A; 3SXM A; 4BPM A; 4C7O A; 3FDQ A; 4CDY A; 1HY5 A; 3MX3 A; 1VMA A; 3AG2 C; 1OW8 A; 1M57 C; 2XLV A; 5JRA A; 1I4Y A; 1G5Z A; 4OD4 A; 1VK5 A; 1FR0 A; 4YT4 A; 2JPU A; 2NPU A; 3EG9 A; 4H4K C; 5A6A A; 1QPU A; 3DXJ F; 3EFO B; 5COM A; 3RQE A; 1M2V B; 2Q4F A; 2IXP A; 5T1D B; 4CS7 A; 2JX0 A; 4IAQ A; 2ZXR A; 3LLI A; 2XL4 A; 4O79 A; 4PAC A; 5L0H A; 4OIR F; 4YL3 A; 5B1A C; 1M56 C; 2R25 A; 4XLN F; 4JIO A; 1MNE A; 2OG2 A; 3C8Z A; 2XL8 A; 5E2Q A; 4O7G A; 1K04 A; 3RYL A; 1U6H A; 2A1D D; 3F46 A; 3AGU A; 2R05 A; 2YVK A; 2G62 A; 2MHR A; 5JVE A; 2UUH A; 2LD6 A; 2ZD9 A; 1LE2 A; 4Q7C A; 3M1C B; 4Z9J A; 4RBN A; 3DI5 A; 4YL0 A; 2CNW D; 3LEO A; 3ATP A; 3NKD A; 1YAU O; 4I1O B; 2L7A A; 4MVO A; 5T3T A; 3J06 A; 1YZA A; 3IQC A; 3JSE O; 1EKY A; 2R7U A; 3G4X A; 2Q9A A; 2HUJ A; 4JUR I; 4AL0 A; 4MTO A; 1TWA A; 4JRZ A; 1D1B A; 2R7V A; 2NUT A; 4DBR A; 3GOR A; 1DOV A; 1LM3 B; 2CW0 F; 3EHN A; 4BJT A; 3SXZ A; 1SZI A; 2OJQ A; 3SZR A; 2CYD A; 3V5X A; 2YL1 A; 2DYR C; 2ZPA A; 1RXQ A; 1BZ4 A; 1V74 B; 3ZQY A; 1NLX A; 2HMZ A; 4K0D A; 3HNL A; 1PD1 A; 4HEA J; 5KYY A; 2KK1 A; 2VB6 A; 1G4W R; 1ZHW A; 1ZW3 A; 1AEP A; 4MS2 A; 3S27 A; 1OXK A; 3TJ5 A; 4AL1 A; 5FCL A; 1HMD A; 3GEH A; 2B0H A; 2L81 A; 2L9J A; 3T6B A; 3K1I C; 3POV A; 1RJ9 A; 1A7V A; 3KPH A; 2GA0 A; 3B29 A; 4JTD B; 3C8G A; 5DVW A; 4YJW A; 4CS8 A; 1NBB A; 4CS9 C; 3U2L A; 4WAB A; 3T9O A; 4K7B A; 5KYX A; 4OIQ F; 2YLD A; 5L3Q A; 3K1H A; 2TMV P; 4DXW A; 2KC3 A; 1V54 C; 4HFK B; 4XEV A; 2DI3 A; 4PR9 A; 1BBH A; 1SR2 A; 5A6B A; 1OW6 A; 2B0J A; 3ZSU A; 1YA7 O; 2W4B A; 4XQ1 A; 5TJ5 E; 3Q6N A; 1ST6 A; 1H9G A; 1Y6D A; 3UMI A; 3OEO A; 4YN0 B; 2Z15 A; 4J7T A; 3O6X A; 4A4A A; 1FTS A; 2F22 A; 2ICW G; 4M63 A; 1M6T A; 1PD0 A; 1RKE A; 2HV7 A; 4ZLC A; 1T01 A; 2YEV A; 4JJF A; 4MND A; 3G4Z A; 2ZXW C; 2IXO A; 2WZG A; 3LUT B; 4I1M A; 4O6N A; 2XSE A; 2BL2 A; 1A7E A; 1YZC A; 4QDL A; 3ASO C; 1JPN A; 2EPM X; 4CSA C; 2A69 F; 2EPL X; 2R7Q A; 1C03 A; 2RD9 A; 4MTF A; 2J9W A; 1B68 A; 1H9T A; 1QQ3 A; 3ABM C; 1ZHY A; 5BQH A; 1IZM A; 2Y3D A; 3KYI A; 1T5O A; 1ZYR F; 1D1C A; 5EHH A; 3PMR A; 4GYT A; 4U9E A; 4PJN A; 4JEA A; 1E84 A; 4CJG A; 3RVZ A; 3T6J A; 1D0X A; 2PP4 A; 3IEE A; 4U9D A; 1ZW2 A; 4YT5 A; 2P0N A; 2PX0 A; 3QZC A; 4G0H A; 2Y69 C; 5E33 A; 3S9O A; 3T6G B; 3VRC A; 5FZT A; 2WZF A; 2ZXP A; 4NC3 A; 1Z5Z A; 3GEE A; 4GQH A; 1YYJ A; 4EBJ A; 4FAP B; 1JPJ A; 1QZX A; 4U5D E; 1Q0F A; 2FFH A; 4OD5 A; 3U9M A; 3JRM O; 3UGP A; 3M4B A; 256B A; 4C3E A; 4WGY A; 3AG4 C; 2Y3G A; 3N0T A; 4KNW A; 2VAS A; 2R7O A; 3LS1 A; 2Y3H A; 1E86 A; 1K40 A; 2VC9 A; 1TWC A; 1T6Q A; 2XL6 A; 2YL0 A; 3F47 A; 3SYN A; 1LS4 A; 3Q7G A; 3WOD F; 4G78 A; 3VF0 A; 5KYU B; 1O5H A; 1NFN A; 1Z63 A; 4IAR A; 3M79 A; 3ZG1 A; 3U8P A; 4BJ5 C; 1A7D A; 3HNK A; 2J7P D; 1Y4C A; 2Q9B A; 4R32 A; 2P7V A; 3VM6 A; 1SF8 A; 4NTA A; 1TFK B; 1NZE A; 1VB5 A; 2EIM C; 4O6M A; 5L0D A; 2XXA B; 2QLA A; 5CIV A; #chains in the Genus database with same CATH homology 4NQF A; 1K04 A; 1UFB A; 2KK1 A; 1V4A A; 3RQF A; 3B71 A; 2Q00 A; 3K7D A; 1PV3 A; 2L6G A; 4EBJ A; 3GM2 A; 1QVX A; 2PBE A; 4EBK A; 1OW7 A; 1OW8 A; 3C8G A; 3C8G B; 3C8G D; 3L8J A; 3GM3 A; 3MFN A; 1KTM A; 3JYY A; 2LK4 A; 3C18 A; 2JPU A; 2HSB A; 1K40 A; 2YWA A; 1O3U A; 3RQE A; 1WOL A; 3AJM A; 3JZ0 A; 4XEV A; 3O10 A; 3BRJ A; 3U0C A; 3RQG A; 2JX0 A; 3L8I A; 1ZZP A; 1OW6 A; 4XEF A; 1WWP A; 2L6F A; 4R32 A; 2L6H A; 1JOG A; 3U3F A; 1K05 A; 3GM1 A; 3S9O A; 4XEK A; 5F28 E; 1WTY A; 1KNY A; 3TUL A;
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait... #similar chains, but unknotted ...loading similar chains, please wait... #similar chains in the pdb database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait...
