The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
46
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sequence length |
123
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structure length |
123
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Chain Sequence |
MRHISPEELIALHDANISRYGGLPGMSDPGRAEAIIGRVQARVAYEEITDLFEVSATYLVATARGYIFNDANKRTALNSALLFLRRNGVQVFDSPELADLTVGAATGEISVSSVADTLRRLYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Doc of Prophage P1 Is Inhibited by Its Antitoxin Partner Phd through Fold Complementation
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Ribosome inhibitor
|
| source organism |
Enterobacteria phage p1
|
| molecule keywords |
Death on curing protein
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| total genus |
46
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| structure length |
123
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| sequence length |
123
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2008-06-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02661 | Fic | Fic/DOC family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3KH2 A; 3DD7 A; 3K33 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1WAT A; 3X2Q C; 3FVY A; 4IAR A; 4PJM A; 2O9X A; 4U5F E; 5T3T A; 4Z9I A; 2AWC A; 1T6Q A; 4U9D A; 4W8P A; 1MQV A; 3EG9 B; 4ONS A; 3U2L A; 3NG1 A; 3JYH A; 2A0B A; 1T6U A; 1EI7 A; 2LD6 A; 4PJL A; 4YL0 A; 2W45 A; 1QLE C; 2CCY A; 4JUR I; 5JP7 A; 4DVY P; 4CX9 A; 4IGG A; 3NDB B; 1SF8 A; 4KNV A; 4BJ6 C; 1RKC A; 4U5D E; 4NC3 A; 5KYY A; 3ASN C; 2QTV A; 2DB4 A; 3CEX A; 3T9O A; 4AE4 B; 4EHP A; 4WJ0 A; 4Z9J A; 4EWC A; 4ER9 A; 2OOC A; 1V74 B; 1LS1 A; 4D4N A; 1GQA A; 3FOP A; 3HNL A; 4YN0 B; 4MTG A; 3DE9 A; 5HSW A; 1UFB A; 2WVN A; 2XS1 A; 4ULW A; 1GM5 A; 3T6G B; 3UMI A; 4U5C E; 2AP3 A; 3EHN A; 2DGJ A; 2MYS A; 3TUL A; 2XLV A; 3G4Z A; 1E83 A; 3SXM A; 2H7O A; 4JTC B; 1FTS A; 1N1C A; 1V4A A; 1ZHZ A; 3B71 A; 4LDR A; 2IOQ A; 3LLK A; 3GM2 A; 4KBL A; 2EIJ C; 3RKO F; 2NSF A; 1BR1 A; 2PF4 E; 2FFH A; 2DYS C; 2WZF A; 1U6H A; 1WOL A; 4R32 A; 4U5H A; 4J32 B; 2AWY A; 3NMI A; 4H4K C; 5KYU A; 1TWC A; 1A7E A; 2J9U A; 2WVQ A; 3K1I C; 2LQG A; 4JC7 A; 3S90 A; 1FR0 A; 3U9J A; 4I44 A; 2FGY A; 1T6I A; 4BPM A; 2KW3 C; 3FAP B; 3Q6M A; 1CPR A; 2Y39 A; 2Q9C A; 4CS7 A; 2XLO A; 5T1D B; 2LFD A; 3L0I A; 4CIP A; 4YL1 A; 1G4U S; 3ZDL A; 3K1I A; 3HLZ A; 1HE1 A; 1LE4 A; 3T6J A; 2UUI A; 1MMN A; 2LSE A; 3ZTM A; 4NTA A; 3IQ6 A; 4BEJ A; 3LS1 A; 5D92 A; 2W9Y A; 4Q4Z F; 3LEV A; 3NRH A; 4OIQ F; 3C18 A; 4YWQ A; 2RSE B; 4BJ5 A; 1IW7 F; 3UGO A; 2J9W A; 2ZD9 A; 4N4W A; 1E85 A; 4MTF A; 4LDK A; 3K1H A; 2Q3T A; 1HW2 A; 1D0X A; 3JYY A; 2M64 A; 1CGN A; 2YLG A; 3DAG A; 3K66 A; 2IBF A; 4C7O B; 3JSE O; 1DOV A; 2XS8 A; 2L6H A; 2P6V A; 4E0H A; 1LPE A; 2NUT B; 1QZX A; 5L0C A; 2XL4 A; 1Q0D A; 1VTM P; 1M2V A; 4Q5S F; 2A6E F; 5B3I A; 3GWN A; 3QW0 A; 1Q0G A; 2J46 A; 1Q0F A; 2PNO A; 4CS8 C; 2KNH A; 4H54 A; 3H2U A; 2C03 A; 2LP4 A; 2F22 A; 1EQ1 A; 1XZP A; 2L81 A; 3FHD A; 1VYK A; 3NMJ A; 3TJ6 A; 2G62 A; 3EHM A; 4NY3 A; 3RH3 A; 2G3K A; 2Y3B A; 2YEV A; 3Q7G A; 2EIL C; 1TFK B; 4RBN A; 4CS8 A; 2BL2 A; 4DRI B; 2I8B A; 2IM8 A; 2XL8 A; 4XEV A; 5E3C A; 3GM1 A; 3L8J A; 4JJF A; 5DS4 A; 1MND A; 1TFO B; 4O6N A; 1BR4 A; 3B0V C; 3BEH A; 2A6H F; 2R05 A; 4LAC B; 2YLI A; 3E70 C; 3US6 A; 3FOO A; 1TQG A; 3UR3 C; 3QZC A; 2H7B A; 4KI2 A; 2ETS A; 3S29 A; 3UGP A; 1OW8 A; 1V55 C; 1K04 A; 3IPM O; 3MLG A; 4BJ6 A; 2PX0 A; 2BC5 A; 3NKD A; 1ZW2 A; 4QDL A; 3EGD A; 2A69 F; 3RQF A; 1YDI A; 4JE9 A; 2WVO A; 3OEO A; 3K33 A; 3UMH A; 3JRT A; 5A6K A; 4CDA A; 3AG2 C; 2IYL D; 3HNJ A; 1FMW A; 5HV9 A; 1RJ9 B; 5IY5 C; 256B A; 1HMO A; 4DJ9 A; 1VYI A; 3BRJ A; 3RFY A; 1ZHW A; 3LJB A; 4W8K A; 1G4W R; 1GS9 A; 4IAQ A; 3K7D A; 4XLN F; 2HMQ A; 2W4M A; 4JTD B; 1QVX A; 3U0C A; 3OA1 A; 1I5N A; 4KC9 A; 3ABL C; 4P9F A; 4YT4 A; 5A6J A; 2E87 A; 5COM A; 2ZPA A; 1RCP A; 2R7O A; 3N0T A; 3RYL A; 4YT2 A; 3AG3 C; 2R25 A; 3DJU B; 1A7D A; 2GWW A; 1KNY A; 1JOG A; 2XLE A; 3IEE A; 5B1A C; 1OQC A; 4CDY A; 1NU9 C; 2YHS A; 1YVI A; 4WGZ A; 4G7H F; 3L34 A; 3C8G A; 4WGY A; 3R7C A; 5COG A; 3RIP A; 2KC3 A; 1PD1 A; 2Y3G A; 3G50 A; 3LES A; 1Z5Z A; 3NYM A; 5T3W A; 1RMV A; 3TOM A; 3EGX B; 1ZYR F; 4Z9H A; 1LI7 A; 4U5B E; 2LCH A; 3ABM C; 2YRF A; 3S27 A; 4MVM A; 3SZR A; 3HNI A; 1C03 A; 2EIK C; 2Y3H A; 1YA7 O; 3Q7L A; 4E7S A; 3U5S A; 3X1O A; 1ZHT A; 4XPY A; 4G7O F; 3I4U A; 4HFK B; 4N6H A; 4PFO A; 3A9C A; 1ZHX A; 3JRM O; 3U9M A; 4EBB A; 3QVY A; 2HJ3 A; 3JTL O; 3B9Q A; 2L7A A; 1FAP B; 2HZ8 A; 4LLC A; 4NCQ A; 5BQH A; 5L0D A; 2XXA A; 4CDV A; 3U3B A; 3ASO C; 2ZXO A; 3TK0 A; 1T5O A; 3MX3 A; 2CYD A; 1D1A A; 1YAR O; 1SZI A; 1NG1 A; 2OKU A; 2P1A A; 1OXB A; 4IJJ A; 4IRU A; 3ABK C; 2XLM A; 3V5Y A; 2EIM C; 3ZC4 A; 4ANJ A; 4YT8 A; 2QLA A; 3C62 A; 3GWL A; 2KYH A; 3DE8 A; 1J8M F; 4PK4 A; 4EKW A; 2CNW D; 2IXP A; 2NUP A; 2VCA A; 4XTK A; 1PD0 A; 3RQG A; 1WGW A; 2YL1 A; 1D1B A; 1TWG A; 2P0N A; 3FMS A; 1XZQ A; 1OXK A; 4IB4 A; 4J30 B; 4JEB A; 4JZA A; 4NQF A; 4BJT A; 2EPL X; 5AC5 A; 3B0U X; 3CZ6 A; 3EJN A; 3K6B A; 5KYX A; 2R02 A; 2WB7 A; 5F5H A; 1OR2 A; 4P9T A; 2KGO A; 1KTM A; 4I1O B; 4K1O A; 2WZL A; 3MYF A; 3N2Z B; 1OCC C; 2KJG A; 3W2W A; 1K05 A; 3M15 A; 4C3E A; 3LNM B; 1JPN A; 1L7C A; 1TKN A; 2H8A A; 2MWQ A; 3O6X A; 2CNW A; 3V5X A; 1RKE B; 3SP1 A; 1Z23 A; 1C17 M; 5KYW B; 1FMV A; 3C63 A; 1ST6 A; 1TR2 A; 2VAS A; 4PAC A; 1JAF A; 1OCO C; 2X0C A; 5A6A A; 1YAU O; 1D1C A; 4G7Z F; 4BJ5 C; 3W4Y A; 2PX3 A; 1G5Z A; 2RD9 A; 2YVK A; 1L3P A; 1OCR C; 4CIH A; 1OW7 A; 3VYW A; 1OKK D; 3VM6 A; 4EBJ A; 1LE2 A; 5CI8 A; 4JEA A; 4O79 A; 4DOZ A; 3B29 A; 3LLI A; 1MMD A; 3ATP A; 2C04 A; 3WOD F; 5JVE A; 2FAP B; 3I5Q A; 1BR2 A; 2XLH A; 4DRH B; 1KU2 A; 2LIG A; 2YL0 A; 1M56 C; 3QVZ A; 4U9E A; 4NTF A; 4XQ1 A; 3TQO A; 5KYY B; 4DBQ A; 3UMK A; 3PCV A; 4GQH A; 2KSF A; 4MVQ A; 5TJ5 E; 1OKK A; 3DKA A; 4HE8 D; 1QSP A; 2A68 F; 1A7V A; 4IWB A; 4LLE A; 2A0U A; 2JPU A; 1CGO A; 2OEV A; 3U3F A; 3B0P A; 1R4T A; 3KMI A; 3UNG C; 1FNT c; 1CGM E; 1YJG A; 2V26 A; 4MW3 A; 4N06 A; 4GYT A; 1Z6A A; 4X0R A; 2NSG A; 1RJ9 A; 1E86 A; 3O55 A; 1A41 A; 4AL1 A; 3E9V A; 1ORY A; 3IQ5 A; 3JZ0 A; 4JRZ A; 1VB5 A; 2Y3D A; 4CJO A; 1M6T A; 3MFN A; 4IAO A; 4OIO F; 1MMA A; 1NFO A; 1ORS C; 2H7V C; 2J7P D; 2VCC A; 2YWA A; 2Q00 A; 3CQZ A; 3QW1 A; 4LER A; 1LM3 B; 5B3S C; 1K40 A; 4MND A; 3S0X A; 2R7Q A; 4RD9 A; 4AL0 A; 4YL3 A; 1EKY A; 1ZU4 A; 1AUE A; 3KYI A; 1WN0 A; 2YZS A; 4XPW A; 3ITF A; 3EFO A; 1Z7Q c; 1MNE A; 1APC A; 4F4B A; 1VMA A; 4EBK A; 3HKK A; 2J8W A; 3EH1 A; 3NMK A; 1HMD A; 2Y69 C; 4WAB A; 5JRA A; 2XM0 A; 3DD7 A; 5L0H A; 3LNR A; 3GAN A; 3Q6N A; 2R7T A; 1VK5 A; 2J7P A; 1NLX A; 2BE5 F; 4G0H A; 1EA8 A; 1NZE A; 1HW1 A; 4J7T A; 2CDQ A; 4DBR A; 1LI5 A; 1Y4C A; 1OCZ C; 3DMD A; 3TJ5 A; 5EGY A; 3WG7 C; 1YYX A; 5EK0 A; 2XSE A; 2M4E A; 3EG9 A; 2LFF A; 3QMK A; 1YA9 A; 1BDJ B; 1NSG B; 1Z3I X; 3S28 A; 2J0X A; 2HV6 A; 1ZW3 A; 3TD7 A; 3ZWI A; 5DQZ A; 2TMV P; 4U5G A; 4ZLD A; 1E2X A; 1GGQ A; 4HEA J; 2DYR C; 4AX2 A; 1J8Y F; 1OR3 A; 1OW6 A; 2XLW A; 4OIR F; 4AE4 A; 4OIN F; 2OJE D; 3U2M A; 2YKZ A; 4YK5 A; 1VLS A; 2IXN A; 3POV A; 2WZG A; 5COF A; 1S05 A; 4O6Y A; 2L6F A; 3HNK A; 1A0B A; 1T9K A; 2PP4 A; 3EQL F; 4JCZ A; 4JJG A; 4DRJ B; 2J45 A; 1QKR A; 4BG0 A; 3ZG1 A; 2P7V A; 1TWA A; 3M1C B; 2D5R B; 2J0W A; 2Q7R A; 1SMY F; 2GDC A; 3JCU Q; 3T4R A; 1I4Z A; 1LS4 A; 4AK9 A; 2Q9A A; 1U89 A; 2JD3 A; 2VB6 A; 3HJC A; 3AOU A; 2ICW G; 3T6B A; 3MYI A; 4D4X A; 3RVZ A; 3G4X A; 4JTA B; 4EIY A; 1DOW A; 3M4C A; 3ZSU A; 5KYN A; 2PBE A; 2GFH A; 4FX5 A; 3WAQ A; 3LUT B; 4QI2 A; 2NPU A; 2ZXW C; 4PR9 A; 5KYW A; 5AGF A; 3AQB A; 4NTB A; 1JMW A; 1H7I A; 4O7G A; 3EGD B; 4L6R A; 3ZIB A; 3CSK A; 5DQT A; 1IZM A; 2QNL A; 3KKB A; 2NG1 A; 2R03 A; 3KPH A; 3PMR A; 3SXZ A; 2P61 A; 3M79 A; 4MVO A; 3ZQV A; 4XEK A; 2B0J A; 2IXM A; 4JCH A; 4FAP B; 4OD4 A; 2HJM A; 2OEX A; 2VH3 A; 3DM5 A; 4O6M A; 5A69 A; 4Q7C A; 4UDV A; 4BJ1 A; 3GOR A; 2CGE A; 2YQY A; 5L3V A; 3ZTZ A; 2YLD A; 1WWP A; 3J06 A; 3EZH A; 2HV7 A; 2WL8 A; 3AG1 C; 3ECS A; 5F5F A; 4E7Z A; 2W4B A; 1M57 C; 5B1B C; 4C7O A; 2B0H A; 3FAJ A; 1B68 A; 1AVO B; 1M2O A; 1YZA A; 4G78 A; 2NUT A; 3W8H A; 1NBB A; 3S9O A; 5EHH A; 1ZZP A; 1NU7 D; 4YJW A; 4CS9 C; 2Z15 A; 2HFI A; 3A11 A; 4EUK B; 3C8G B; 1PV3 A; 3C7J A; 5JT4 A; 4E0I A; 5JLI A; 3V5Z A; 4DXW A; 4PFP A; 4LDQ A; 1Q0K A; 2EPO A; 2EPK X; 1V54 C; 2A1D D; 2Q4F A; 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3LEO A; 3H65 A; 3ZQY A; 2XL6 A; 3RQE A; 5DS6 A; 5BQI A; 5L0I A; 1XWJ A; 3L1M A; 5DVW A; 2YL3 A; 3F47 A; 3AG4 C; 3SXK A; 2HKV A; 5CIV A; 4MTO A; 4XLP F; 3EZI A; 3MBG A; 3TOL A; 4XWJ A; 1RXQ A; 2XLD A; 4N6C A; 3EGX A; 1JRA A; 3LS0 A; 1CPQ A; 1FFT C; 2J9V A; 2R9R B; 3F46 A; 5E2Q A; 5F28 E; 5A6B D; 1JR8 A; 1LIH A; 1ZHY A; 1F1M A; 5JUA A; 4CSA A; 2R7V A; 2UUH A; 3N24 A; 3NYJ A; 1ZVZ A; 4A4A A; 2EPM X; 1D0Y A; 3W2V A; 4XEF A; 2HUJ A; 4JVS A; 2L9J A; 1JPJ A; 3DZA A; 2OG2 A; 4CJG A; 4E17 A; 1C02 A; 2KQ9 A; 4P6I C; 3AGT A; 3JT1 A; 4B6I A; 2R7S A; 2R7U A; 3NKE A; 1LKX A; 1M2V B; 2LK4 A; 3DAF A; 3I5P A; 5E33 A; 4K0D A; 3U8P A; 4A2N B; 4DVZ A; 3RVY A; 2KK1 A; 3NYL A; 1QQ3 A; 2HSQ A; 2ZXP A; 4MVR A; 4C3D A; 5AC4 A; 5A6B A; 3RW0 A; 1LVK A; 4JIO A; 4JW1 A; 3C8Z A; 4M63 A; 5BUO A; 2VCB A; 1H6G A; 3SNH A; 2PFD A; 5L0F A; 2R7R A; 1T01 A; 1BBH A; 1O3U A; 1YZC A; 4CBE A; 3HTK C; 3KH2 A; 1R5I D; 5L0G A; 4OIP F; 1G8X A; 3C8G D; 3O10 A; 3VF0 A; 3VAY A; 1U0B B; 3L8I A; 2OCC C; 4FES A; 5JS5 A; 1HE9 A; 4ULV A; 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