The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
48
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sequence length |
105
|
structure length |
105
|
Chain Sequence |
GSHMEYLGVFVDETKEYLQNLNDTLLELEKNPEDMELINEAFRALHTLKGMAGTMGFSSMAKLCHTLENILDKARNSEIKITSDLLDKIFAGVDMITRMVDKIVS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Helical Shifts Generate Two Distinct Conformers in the Atomic Resolution Structure of the CheA Phosphotransferase Domain from Thermotoga maritima.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Thermotoga maritima
|
| molecule keywords |
Chemotaxis protein cheA
|
| total genus |
48
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| structure length |
105
|
| sequence length |
105
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.13.3: Histidine kinase. |
| pdb deposition date | 2004-06-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | HPT domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LCH A; 2OOC A; 4EUK B; 1OXK A; 4PAC A; 3U3B A; 1I5N A; 1C02 A; 1SR2 A; 1BDJ B; 1OXB A; 1YVI A; 3MYF A; 3US6 A; 3KYJ A; 2Q4F A; 2R25 A; 2A0B A; 1Y6D A; 3KYI A; 1TQG A; 1A0B A; 4G78 A; 1QSP A; 2LP4 A; 1WN0 A; 2LD6 A; 1FR0 A; 1C03 A; 3IQT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4DRI B; 2PBE A; 2KNH A; 5B1B C; 4C3B A; 3M4C A; 3LS0 A; 2F22 A; 1HW2 A; 1RJ9 A; 2WL8 A; 2DYS C; 2MYS A; 3EGX A; 3NRH A; 1XZQ A; 1C02 A; 1YAU O; 3GEI A; 3ITF A; 3QTH A; 1F1M A; 2OU6 A; 3PHF 2; 3KYJ A; 2NSG A; 1NSG B; 3KH2 A; 1ZHW A; 3WOD F; 5A69 A; 4OD4 A; 5KYW A; 1M2O A; 1D1B A; 3NG1 A; 4BJ1 A; 1G4U S; 4CDV A; 1H7I A; 2EPK X; 2KC3 A; 3GOD A; 3I5P A; 3MBG A; 5GPG B; 2L81 A; 4CS7 A; 1Z63 A; 3K66 A; 1TKN A; 4P9T A; 4IJJ A; 3T4R A; 2I8B A; 1JR8 A; 4MW3 A; 5JP7 A; 1VB5 A; 2Q9C A; 3T6J A; 4DRJ B; 5AC5 A; 3LS1 A; 2V3C C; 3M1C B; 2YZS A; 1U6H A; 1V54 C; 3JSZ A; 3O39 A; 5A6B A; 3W2W A; 5KYY B; 4XWJ A; 2XLM A; 1UG7 A; 3GM2 A; 4IAQ A; 4LLC A; 3RKO F; 2XLO A; 4Q7C A; 1SYQ A; 1WGW A; 4Q4Z F; 2FFH A; 3DE8 A; 5L0D A; 1YAR O; 4JC7 A; 2VB6 A; 2XLD A; 1TWH A; 2HMQ A; 4KNV A; 5CI8 A; 5B3I A; 3DJN B; 2D4U A; 5K0I A; 2M64 A; 1C17 M; 4U5C E; 3K1I C; 2OG2 A; 3HNJ A; 3US6 A; 3NYM A; 4RD9 A; 1EA8 A; 2H7O A; 1O3U A; 3FDQ A; 2J9U A; 3VM6 A; 3U5S A; 3IEE A; 4MTF A; 3SXY A; 4BJ6 A; 1VMA A; 1WOL A; 4BEM J; 3IQC A; 4IWB A; 4N6C A; 3SXZ A; 3JT1 A; 1OR3 A; 4ZLC A; 3S0X A; 2MHR A; 3CAX A; 2Q3T A; 3CSK A; 3EH2 A; 2YKZ A; 3C62 A; 3X1O A; 3ZQV A; 1I4Z A; 2IXM A; 4EBJ A; 2J0W A; 3I4U A; 3J06 A; 2H8A A; 2KYH A; 2UUH A; 1IW7 F; 1BZ4 A; 3EJN A; 1VTM P; 4N4W A; 5JVE A; 3NMK A; 2HJ3 A; 2L9J A; 3DMD A; 4BPM A; 2G3K A; 2WVQ A; 3G4X A; 5DQZ A; 3S27 A; 4QI2 A; 2YL0 A; 5T1D B; 4MVU A; 3W8H A; 2H7B A; 1QZX A; 1S05 A; 2ZXO A; 2IM8 A; 3MFN A; 4YL0 A; 3LNM B; 4ER9 A; 4BJ5 C; 4PR9 A; 4LAC B; 2Y69 C; 2QNL A; 2EPM X; 3U9J A; 4DXW A; 1ORY A; 2XL6 A; 3ZG1 A; 2J9B A; 3Q7L A; 1OKK A; 3KPH A; 3TUL A; 1QPU A; 3G50 A; 3S84 A; 5BUO A; 1A7D A; 3S29 A; 2PX0 A; 3DXJ F; 3GOR A; 4NQF A; 4Z9H A; 1YLM A; 2Y3H A; 4FWV A; 1E2X A; 3WHN A; 3B0U X; 4DOZ A; 4U5H A; 4CIP A; 2EIK C; 3EH1 A; 4MS2 A; 1ZW2 A; 4YWQ A; 2XS1 A; 2EIN C; 1O5H A; 3OA1 A; 1LI7 A; 3EHN A; 2XLE A; 4KI2 A; 3C8G A; 1MMA A; 1SR2 A; 2HV7 A; 3K1H A; 3SXM A; 5FCL A; 3H2U A; 3MYF A; 1GGQ A; 4JCH A; 2EPO A; 1FTS A; 3DM5 A; 3DI5 A; 1NBB A; 2QE9 A; 1FMW A; 2R25 A; 4I3M A; 4BG0 A; 2Y39 A; 4CS9 C; 3DZA A; 1M2V B; 4IB4 A; 1OR2 A; 2NPU A; 2Q9B A; 1T6U A; 1ZZP A; 2RD9 A; 3JZ0 A; 4U9E A; 3V7O A; 2IYL D; 4G78 A; 2J46 A; 1V55 C; 2QTV A; 3AGT A; 1YZA A; 3HLZ A; 1MMN A; 1AUE A; 4H54 A; 3LJB A; 4JRZ A; 3IQT A; 4EKW A; 4MVR A; 1VYI A; 2JPU A; 3VYW A; 4JTD B; 3UGO A; 5EGY A; 3NYL A; 2IXN A; 1HY5 A; 3ZDL A; 2CYD A; 2ZD9 A; 3DE9 A; 3RQG A; 1K40 A; 1OXK A; 4PAC A; 2P6V A; 3FXH A; 2JX0 A; 4IAO A; 2MWQ A; 1RCP A; 3SYN A; 1GQA A; 2XM4 A; 1PD1 A; 5A6A A; 2KSF A; 2LFD A; 3GWN A; 1PCX A; 2L6F A; 5JT4 A; 3OEO A; 2OEV A; 3DKA A; 4NY3 A; 3F47 A; 2HMZ A; 1V4A A; 3KYI A; 3EFO B; 4FES A; 2P7V A; 4NCQ A; 4CS8 A; 2R9R B; 5T3T A; 3F46 A; 5JRA A; 4XQ1 A; 2C04 A; 1D1A A; 3S9O A; 2XM0 A; 1FAP B; 5F5F A; 1I4Y A; 2ICW G; 3ABL C; 3EG9 A; 1QQ3 A; 3GWL A; 3NYJ A; 2Q9A A; 2NUT A; 4F4B A; 3EGD A; 3TJ5 A; 3JCU Q; 1ST6 A; 4MQ9 F; 2HJM A; 1SMY F; 2WVO A; 3ABK C; 2DB4 A; 3K1I A; 3K33 A; 4E7Z A; 2NUP A; 3RW0 A; 4CBE A; 4CSA C; 3FAJ A; 1CGN A; 1Q0M A; 3UR3 C; 2A69 F; 3V5Y A; 1KTM A; 1Q0D A; 2VH3 A; 1OQC A; 256B A; 2J0X A; 1HMO A; 2YLG A; 1B68 A; 3BRJ A; 2UUI A; 4G7H F; 1O87 A; 2PX3 A; 3N2Z B; 1H9T A; 1CGO A; 1BR2 A; 4Z9I A; 4LDR A; 5COM A; 5EK0 A; 3POV A; 2WZG A; 2IOQ A; 1R4T A; 4PJM A; 3TK0 A; 5DS4 A; 2LK4 A; 3M4B A; 5CI9 A; 3LEV A; 4KBL A; 1FFT C; 4MVS A; 3N0T A; 4NTB A; 3QVY A; 3IHU A; 1IZM A; 1EKY A; 2A0U A; 5L0F A; 4G7Z F; 1H9G A; 3T9O A; 3ZWI A; 1HE1 A; 1RJ9 B; 2EIJ C; 3EGX B; 4E0H A; 1XZP A; 4OD5 A; 1FNT c; 3GAN A; 4CS8 C; 4YL3 A; 1WAT A; 1EI7 A; 1H6G A; 3PDM P; 4WAB A; 1JOG A; 2YL7 A; 1PV3 A; 3GM1 A; 2QUP A; 3JRM O; 3RVY A; 1WTY A; 5KYW B; 1JPN A; 4EUK B; 1LVK A; 1MNE A; 1T9K A; 2PFD A; 3GEH A; 2Y3D A; 4PFO A; 3UGP A; 2AVK A; 2YRF A; 3AG4 C; 2GAQ A; 3IPM O; 1I5N A; 1BBH A; 2EPL X; 3U3B A; 4E0I A; 1E85 A; 3AJM A; 2R7W A; 4BJ5 A; 5DS5 A; 4YJW A; 2VAS A; 3EZI A; 5T3W A; 3RYL A; 1TFO B; 2I15 A; 4GYT A; 1LE2 A; 2P1A A; 3Q6M A; 3UNG C; 3ZQY A; 1TWC A; 4DVY P; 1QKR A; 5A6B D; 1YDI A; 1ZHZ A; 3G4Z A; 3RVZ A; 3LES A; 2R7S A; 3DWW A; 1J8Y F; 2JD3 A; 3OWT A; 3PCV A; 3Q7G A; 3SZR A; 2J7P D; 4JVS A; 3W8I A; 4OIP F; 4E18 A; 3IQ6 A; 4C7O A; 2Q00 A; 2PNO A; 4U5B E; 1S7Z A; 5COG A; 2R7T A; 3WAQ A; 2OOC A; 4DBQ A; 4FAP B; 4JEB A; 2YHS A; 4CJO A; 1QLE C; 1WAS A; 1YJG A; 1EQ1 A; 5A6J A; 1ZHY A; 2LSE A; 5KYU A; 4JCZ A; 1GM5 A; 1N1C A; 4CDA A; 2KQ9 A; 2GFH A; 1A41 A; 2AU5 A; 2ASR A; 4CS9 A; 4O7G A; 1XWJ A; 3EQL F; 1LS4 A; 2V26 A; 2W9Y A; 2R05 A; 5CIV A; 2E87 A; 3GEE A; 1M6T A; 4EHP A; 2C03 A; 5AC4 A; 1ORJ A; 1BR1 A; 4NTA A; 3NKE A; 2LP4 A; 2OEX A; 3EHM A; 4U5D E; 1HE9 A; 4YN0 B; 3RIP A; 5DLJ A; 4FX5 A; 2D5R B; 4E7S A; 2GWW A; 5D92 A; 4U5F E; 4IGG A; 4JTC B; 4JUR I; 4PK4 A; 3CEX A; 4U5E E; 3V5Z A; 2ZXW C; 4ZLD A; 1OCC C; 1DOV A; 3FVY A; 1HMD A; 4JEA A; 4QDL A; 5JSL A; 1L7C A; 5AGF A; 2P0N A; 3NDB B; 4G7O F; 2CDQ A; 3HNI A; 3U0C A; 5L3V A; 2R02 A; 4MTG A; 3L1M A; 4JZA A; 5TJ5 E; 1OW8 A; 3QVZ A; 3RF3 A; 1ZU5 A; 3CQZ A; 1OXB A; 4EBB A; 2A6H F; 3FOO A; 2LIG A; 3BEH A; 1RKC A; 1RKE A; 1Z3I X; 2YLI A; 3HNL A; 2VCC A; 1R5I D; 2RSE B; 3FMS A; 2YLD A; 3QMK A; 4LDQ A; 3TOM A; 2HSQ A; 4AE4 A; 3A9C A; 2B0J A; 2J45 A; 3Q6N A; 3C8Z A; 4W8K A; 3ZTZ A; 1LIH A; 1TQG A; 1T6Q A; 1YYX A; 3HKK A; 2OCC C; 1OKK D; 1RXQ A; 3B29 A; 1JAF A; 3JYY A; 2WZF A; 4K1O A; 3TJ6 A; 1NZE A; 4ULW A; 4DRH B; 5L0J A; 2EIM C; 3C8G B; 2M4E A; 1T6I A; 3L8J A; 3RH3 A; 4CSA A; 5IY5 C; 3O10 A; 2EPN A; 4W8P A; 1YZC A; 3LLI A; 3C7J A; 3LAY A; 1TWG A; 3V5X A; 1ZU4 A; 2KW3 C; 3SNH A; 1TWA A; 1NU7 D; 3ABM C; 4C3D A; 5JUA A; 2OKU A; 4RBN A; 4HFK B; 2IBF A; 1A7E A; 4N06 A; 4XLP F; 1QVX A; 3SP1 A; 3VRC A; 2A1D D; 3ASO C; 5DVW A; 1LE4 A; 1Z5Z A; 2IXP A; 2Q4F A; 2NG1 A; 2XLV A; 1D0Z A; 2A6E F; 2CNW D; 1VYK A; 2AWC A; 3JTL O; 4XPW A; 4XLN F; 1E83 A; 2HSB A; 3U2M A; 2J9V A; 1NFO A; 2YVK A; 3U8V A; 4IRU A; 1JPJ A; 4MVZ A; 1VK5 A; 2HZ8 A; 3KKB A; 4AE4 B; 3DD7 A; 5B3S C; 1FR0 A; 4YT5 A; 5E33 A; 2XXA A; 4CIH A; 1Q0G A; 2XLH A; 4JIO A; 3AG1 C; 3MX3 A; 4UDV A; 1LI5 A; 1U89 A; 4I44 A; 4I1O B; 1Q0F A; 1FFH A; 2YL3 A; 1E84 A; 4QI0 A; 3HTK C; 4HE8 D; 1Y4C A; 4CJG A; 1LM3 B; 1TR2 A; 3IQ5 A; 5HV9 A; 4O6Y A; 5KYX A; 4BEJ A; 1HW1 A; 2X0C A; 4H4K C; 4CX9 A; 3S90 A; 3CZ6 A; 1D1C A; 1K05 A; 2G62 A; 5A6K A; 3ASN C; 3AG3 C; 4P6I C; 4YT2 A; 2ZXR A; 3ECS A; 2HKV A; 2A0B A; 3FHD A; 2HS5 A; 3H2V A; 3JSE O; 2NUT B; 3EG9 B; 4O79 A; 1E86 A; 2CCY A; 2DGJ A; 2YL1 A; 1A0B A; 3EGD B; 3KL4 A; 5L3Q A; 2R7X A; 2WZL A; 1NG1 A; 1PD0 A; 1LPE A; 4P9F A; 2NUP B; 4R32 A; 2XL4 A; 1FMV A; 2VCB A; 4AL0 A; 2P61 A; 4ULV A; 2O9X A; 4A4A A; 4OIO F; 5KYY A; 5L0C A; 1MQV A; 3B0P A; 3WG7 C; 4J7Y A; 5F28 E; 4XPX A; 3UMI A; 5BQH A; 3E70 C; 2R7V A; 3ATP A; 3MYI A; 3T6G B; 4MND A; 2L6G A; 3ZTM A; 3EPV A; 1Z7Q c; 1YYJ A; 1OCR C; 3B9Q A; 2YEV A; 2XS8 A; 3O55 A; 4U9D A; 3N24 A; 3L0I A; 1MMD A; 4D4X A; 4GEH A; 1NLX A; 3T6B A; 3TQO A; 2Q7R A; 3B0V C; 1ORS C; 1W2W A; 4HEA J; 4XEF A; 4LER A; 3FAP B; 2FGY A; 2Y3G A; 2PP4 A; 1D0Y A; 3VF0 A; 4IAR A; 2W45 A; 3U3F A; 5L0H A; 1SF8 A; 3NMJ A; 2DI3 A; 1K04 A; 4CDY A; 2VC9 A; 2KGO A; 3PMR A; 5F5H A; 1A7V A; 4MW8 A; 3ZSU A; 2Y3B A; 1CGM E; 4B6I A; 2J7P A; 5EHH A; 3GM3 A; 1SZI A; 3SEO A; 2EIL C; 1GS9 A; 3DM9 B; 2LCH A; 4PJN A; 3DJU B; 5E3A A; 4PFP A; 4DVZ A; 5L0I A; 2GDC A; 4YT4 A; 2CW0 F; 3AOU A; 3EZH A; 4KC9 A; 3E9V A; 2Z15 A; 4O6N A; 2WB7 A; 4AX2 A; 1T01 A; 2QLA A; 3DAF A; 3I5Q A; 4YL1 A; 4OIQ F; 1DOW A; 2IXO A; 4XEK A; 3H65 A; 4Q5S F; 4AK9 A; 2GA0 A; 3RFY A; 1MMG A; 2R7O A; 3QW0 A; 4JKV A; 2YQY A; 3B71 A; 1G8X A; 2B0H A; 5COF A; 3HNK A; 1CPR A; 1AEP A; 4LDK A; 2X51 A; 1Y6D A; 2W4B A; 2YWA A; 3U9M A; 4I1M A; 4C7O B; 1WN0 A; 1U0B B; 3UMH A; 1VOM A; 5JS5 A; 5DS6 A; 1C03 A; 4JE9 A; 4XEV A; 1NU9 C; 2AWY A; 1NFN A; 2J8W A; 4PJL A; 4XTK A; 3M15 A; 4LLE A; 2XRH A; 3ZIB A; 3QW1 A; 5KYU B; 1RMV A; 2H7V C; 3RQF A; 4JJG A; 3QZC A; 1ZHT A; 2R7Q A; 5JLI A; 2KK1 A; 2L7A A; 2WVN A; 3S28 A; 1T5O A; 4MVO A; 2LFF A; 1AVO B; 4EWC A; 1YVI A; 3L8I A; 5FZT A; 2BL2 A; 1M56 C; 1V74 B; 4PJJ A; 1OW7 A; 2OQM A; 5B1A C; 3HJC A; 2TMV P; 3LEO A; 3U2L A; 3K7D A; 5E3C A; 2ETS A; 3ZC4 A; 5DQT A; 3KMI A; 4WGY A; 3K6B A; 3UMK A; 1MND A; 3LUT B; 4BJ6 C; 2LD6 A; 2R03 A; 3W4Y A; 4HFF B; 4ANJ A; 3JRT A; 1YA7 O; 1VLS A; 2XLW A; 4YK5 A; 1J8M F; 1M2V A; 3FOP A; 5KYN A; 3O6X A; 3ZVR A; 3LLK A; 1LS1 A; 1BR4 A; 4NC3 A; 1RKE B; 2CGE A; 4M63 A; 3TOL A; 4WJ0 A; 1Q0K A; 2PF4 E; 2QY9 A; 4N6H A; 4WGZ A; 4EIY A; 5L0G A; 3DAG A; 3NMI A; 4OIN F; 3U8P A; 3C8G D; 3LNR A; 2BE5 F; 2LQG A; 4O6M A; 1G5Z A; 3C63 A; 2OJQ A; 1JMW A; 4K0D A; 5D91 A; 1CPQ A; 3AG2 C; 4A2N B; 4JW1 A; 4DJ9 A; 1Z6A A; 4G0H A; 4C3E A; 1ZW3 A; 4DBR A; 2XL8 A; 3C18 A; 1ZVZ A; 4E17 A; 2BC5 A; 2FAP B; 4D4N A; 3R2P A; 1L3P A; 2DYR C; 2CNW A; 4K7B A; 2HV6 A; 3MLG A; 3RQE A; 3AQC A; 4GQH A; 1QSP A; 2AP3 A; 3AGU A; 3NKD A; 1Z23 A; 4MVQ A; 1KNY A; 1OCZ C; 2KJG A; 1OCO C; 3M79 A; 1WWP A; 3TD7 A; 4L6R A; 4MVM A; 4ONS A; 3EFO A; 2HUJ A; 4NTF A; 1KU2 A; 2HFI A; 2R7U A; 4J32 B; 2G3V A; 2XSE A; 1JRA A; 4AL1 A; 4KNW A; 1UFB A; 2NSF A; 4XPY A; 1G4W R; 4EBK A; 3W2V A; 1BDJ B; 2OJE D; 4U5G A; 3L34 A; 1ZYR F; 5HSW A; 1D0X A; 4JJF A; 1OW6 A; 1TFK B; 2W4M A; 3AQB A; 3JYH A; 4J7T A; 3SXK A; 5BQI A; 4OIR F; 1M57 C; 3X2Q C; 2XXA B; 2L6H A; 5E2Q A; 4JTA B; 2R7R A; 2ZPA A; 1YA9 A; 1VLT A; 2ZXP A; 2VCA A; 4J30 B; 5BQG A; 3VAY A; 4RDA A; 2A68 F; 4Z9J A; 3A11 A; 4X0R A; 4MTO A; 2J9W A; 4BJT A; 5KYX B; 1LKX A; 1ZHX A; 4YT8 A; 1APC A; 3R7C A; #chains in the Genus database with same CATH homology 2LCH A; 2OOC A; 4EUK B; 1OXK A; 4PAC A; 3U3B A; 1I5N A; 1C02 A; 1SR2 A; 1BDJ B; 1OXB A; 1YVI A; 3MYF A; 3US6 A; 3KYJ A; 2Q4F A; 2R25 A; 2A0B A; 1Y6D A; 3KYI A; 1TQG A; 1A0B A; 4G78 A; 1QSP A; 2LP4 A; 1WN0 A; 2LD6 A; 1FR0 A; 1C03 A; 3IQT A;
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