The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
|
sequence length |
100
|
structure length |
100
|
Chain Sequence |
ELIRVAILWHEMWHEGLEEASRLYFGERNVKGMFEVLEPLHAMMERGPQTLKETSFNQAYGRDLMEAQEWCRKYMKSGNVKDLTQAWDLYYHVFRRISKQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The FRB Domain of mTOR: NMR Solution Structure and Inhibitor Design.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
FKBP12-rapamycin complex-associated protein
|
| total genus |
24
|
| structure length |
100
|
| sequence length |
100
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2006-03-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF08771 | FRB_dom | FKBP12-rapamycin binding domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | FKBP12-rapamycin binding domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FAP B; 2FAP B; 4FAP B; 1NSG B; 3FAP B; 5GPG B; 2GAQ A; 4DRI B; 4DRH B; 1AUE A; 2NPU A; 2RSE B; 4DRJ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1HMD A; 2X51 A; 1I4Y A; 3U5S A; 3UMI A; 2HJM A; 2XRH A; 3GWL A; 4U5C E; 3EHN A; 4O7G A; 4JTD B; 1W2W A; 1FR0 A; 2KGO A; 2Q3T A; 2YL7 A; 2XS8 A; 1MMN A; 2HV7 A; 1LS4 A; 1ZHZ A; 1A7D A; 2J45 A; 3NRH A; 4O79 A; 3AGU A; 3M79 A; 4XQ1 A; 2PX0 A; 2EIK C; 3GEH A; 5T3T A; 3KYI A; 3Q6N A; 4U9E A; 1HMO A; 4MVR A; 4DBQ A; 4CBE A; 2QTV A; 1Q0D A; 4U5E E; 2C03 A; 2CNW A; 5TJ5 E; 3RQF A; 4A2N B; 4E7S A; 1K40 A; 1A0B A; 2NUP B; 2WZG A; 2CCY A; 4JEB A; 5EK0 A; 3T9O A; 5CI9 A; 3W8I A; 3W2W A; 2V3C C; 3C18 A; 1BDJ B; 3HNJ A; 1A41 A; 2EPK X; 3C7J A; 3DJN B; 3EFO A; 3LES A; 1ORY A; 4KBL A; 1VYI A; 4QI0 A; 1BR4 A; 3RVY A; 3U0C A; 5JVE A; 3JYY A; 1KNY A; 4D4X A; 5DS6 A; 2WB7 A; 2OU6 A; 3NMJ A; 5A6B A; 5KYY A; 1J8Y F; 2G3K A; 1NSG B; 3IQ5 A; 3K1I C; 4EHP A; 1E86 A; 1XZP A; 2NPU A; 4I1M A; 4JE9 A; 1YAU O; 3U2L A; 3U3B A; 3DKA A; 4Q4Z F; 4CDV A; 2A1D D; 3EGD B; 3PHF 2; 3UR3 C; 3HJC A; 3RQE A; 5AC5 A; 1UFB A; 1YZA A; 4XWJ A; 3O39 A; 1O5H A; 1ZYR F; 2W9Y A; 4WGY A; 1T6U A; 4LDQ A; 2CYD A; 4Z9I A; 3SP1 A; 4CX9 A; 2A0U A; 3RVZ A; 5BQH A; 1Q0M A; 3Q6M A; 4I44 A; 3S0X A; 4E17 A; 5KYU A; 4C7O B; 1OKK A; 1QPU A; 1ZW3 A; 1J8M F; 2R7W A; 4E0I A; 2J46 A; 2Y3G A; 1VB5 A; 2O9X A; 3GM2 A; 4NTA A; 4PR9 A; 2OQM A; 3O6X A; 4A4A A; 4GQH A; 3K7D A; 5A69 A; 3KH2 A; 4DOZ A; 2A0B A; 1V55 C; 1G4U S; 2L7A A; 3KKB A; 4AL0 A; 3H2U A; 4IAR A; 3LLK A; 2QUP A; 3F47 A; 1ORS C; 3BRJ A; 4P6I C; 1FMW A; 2L81 A; 4FX5 A; 5D92 A; 5DLJ A; 3FDQ A; 4OIQ F; 3ABK C; 2AWC A; 4OD4 A; 2Y3B A; 2NUT A; 1Q0F A; 2AU5 A; 1T5O A; 2R02 A; 1YVI A; 3C8G A; 2FAP B; 2ICW G; 4JKV A; 3DAF A; 3GOD A; 1LE4 A; 2KK1 A; 2HZ8 A; 2VC9 A; 2AP3 A; 1A7E A; 2XM0 A; 4JZA A; 3AG4 C; 256B A; 2EIN C; 5A6K A; 5HV9 A; 5JRA A; 5L3V A; 1GGQ A; 1DOW A; 1E2X A; 3T6J A; 1LI5 A; 5EGY A; 2HUJ A; 3VM6 A; 1NU7 D; 3O55 A; 2CDQ A; 3T6B A; 4AE4 A; 4K7B A; 4R32 A; 4CS8 C; 4MVZ A; 5A6A A; 4CSA A; 3IPM O; 4UDV A; 3EH2 A; 5BQI A; 2UUH A; 1QKR A; 1MND A; 2VCC A; 1VMA A; 3EHM A; 4LLC A; 5B1B C; 3WOD F; 5L0I A; 4MVS A; 2XLM A; 1K05 A; 3C8G B; 4OIO F; 5E3A A; 4MVM A; 5JT4 A; 1LVK A; 4O6M A; 1ZHT A; 1UG7 A; 4LAC B; 1WTY A; 1ZU4 A; 4K0D A; 4C3E A; 1OW8 A; 2VCA A; 1BR1 A; 1TFK B; 3S9O A; 2NSF A; 3CZ6 A; 2OEX A; 5L3Q A; 3RW0 A; 1AVO B; 1FFT C; 3MFN A; 5DQZ A; 3V5Z A; 4MVQ A; 3QVZ A; 1GQA A; 1LE2 A; 1Q0K A; 3B71 A; 3TD7 A; 2W45 A; 3JCU Q; 4JUR I; 3ZSU A; 4U9D A; 4MTG A; 1OW7 A; 2LK4 A; 2B0H A; 4EKW A; 4DBR A; 3QZC A; 4JVS A; 4EUK B; 1XZQ A; 3JSZ A; 3FXH A; 1I5N A; 4PJN A; 4B6I A; 4YWQ A; 2Q9A A; 3FOP A; 4YK5 A; 3I5P A; 3ZWI A; 2JPU A; 4BPM A; 4N06 A; 1TFO B; 3ZC4 A; 5B3I A; 3Q7L A; 2PFD A; 1QQ3 A; 1SYQ A; 5HSW A; 3C8Z A; 1NBB A; 2H7V C; 2J0W A; 3RH3 A; 1JAF A; 2R05 A; 2EIM C; 2Q7R A; 3GEI A; 2GAQ A; 2EPL X; 2W4B A; 3IQT A; 5BQG A; 1TR2 A; 3L0I A; 2KQ9 A; 3K66 A; 3M4B A; 5AGF A; 2PNO A; 2X0C A; 3S27 A; 2XL6 A; 4J7Y A; 4L6R A; 2P61 A; 1SF8 A; 2HS5 A; 3ASO C; 3LEV A; 3R7C A; 1Z23 A; 1YYX A; 5BUO A; 4MW8 A; 3JRT A; 2R7T A; 1E85 A; 1MNE A; 3S28 A; 4U5B E; 2NUP A; 5JP7 A; 3AGT A; 1EA8 A; 4QDL A; 1ZHX A; 3B0U X; 1BZ4 A; 1U6H A; 2PBE A; 2QY9 A; 2A6H F; 2GDC A; 2HFI A; 2MWQ A; 3L8J A; 3TJ6 A; 1Q0G A; 1RXQ A; 1GS9 A; 5T3W A; 1ORJ A; 2I8B A; 3RYL A; 3TQO A; 2ZXR A; 3UMH A; 2R7S A; 3CEX A; 2TMV P; 1OCC C; 4JC7 A; 1NLX A; 1O87 A; 1JPJ A; 1GM5 A; 5JSL A; 1WWP A; 1Z5Z A; 4IWB A; 3SXK A; 3H2V A; 4H54 A; 4BJT A; 1TWG A; 2AWY A; 2LD6 A; 1MMD A; 3EGD A; 3J06 A; 2H7O A; 3B0P A; 2YLI A; 3SEO A; 4C3B A; 5CIV A; 3RQG A; 1D1C A; 1NU9 C; 4HFK B; 4J32 B; 1ZU5 A; 2OJQ A; 4XEV A; 2BC5 A; 1SMY F; 2QE9 A; 4N6C A; 3G4X A; 4OIR F; 3ASN C; 4WAB A; 1T6I A; 1MQV A; 4YT4 A; 5FCL A; 2HV6 A; 1S7Z A; 2J9W A; 2YLG A; 2VB6 A; 4C7O A; 2Q4F A; 2B0J A; 1VK5 A; 3AQB A; 3QW1 A; 1T01 A; 2UUI A; 2XLH A; 4BJ5 A; 1H9T A; 2LQG A; 2M4E A; 3HNK A; 1H7I A; 4CS9 A; 1C17 M; 3MX3 A; 1HW2 A; 1JMW A; 3EH1 A; 2LIG A; 3ZG1 A; 1TKN A; 1M2O A; 4H4K C; 3K33 A; 4P9T A; 1E84 A; 2R7X A; 3DM5 A; 4ER9 A; 4PAC A; 2HMQ A; 1OCR C; 4JEA A; 3GM3 A; 3V7O A; 2G3V A; 4MVO A; 1A7V A; 3UNG C; 3AJM A; 4XPX A; 3EG9 B; 4YJW A; 2J8W A; 3POV A; 5B1A C; 3LS1 A; 3EQL F; 2KYH A; 1M6T A; 2WZF A; 1OCZ C; 2GWW A; 1WAS A; 2DB4 A; 3B9Q A; 3GWN A; 4YL0 A; 4EIY A; 3NDB B; 4O6N A; 2XM4 A; 4I3M A; 4MTO A; 4ONS A; 4PK4 A; 4CJO A; 2GA0 A; 1G5Z A; 1R5I D; 1FTS A; 4HFF B; 4U5H A; 3V5X A; 3IQ6 A; 4MTF A; 2LSE A; 2EPN A; 1PCX A; 2Y3H A; 3DI5 A; 3W4Y A; 2XL8 A; 1G8X A; 4JCH A; 3DMD A; 3Q7G A; 4GEH A; 1LS1 A; 2WVO A; 3DE8 A; 2CNW D; 3ZQY A; 3OA1 A; 2ASR A; 2XLD A; 4YL3 A; 4J7T A; 3AG2 C; 2P6V A; 1HY5 A; 1VLT A; 2QNL A; 3FHD A; 4G78 A; 3GAN A; 5COG A; 5FZT A; 3VRC A; 2P0N A; 2A69 F; 3GM1 A; 3LNR A; 4G0H A; 3FVY A; 2HJ3 A; 2A68 F; 1O3U A; 1WGW A; 2OG2 A; 2JX0 A; 4G7Z F; 1Z3I X; 3T4R A; 2FGY A; 4JW1 A; 1S05 A; 4ZLC A; 3KMI A; 3L1M A; 4MS2 A; 5COM A; 3N2Z B; 2IXP A; 3ZIB A; 1EQ1 A; 1WN0 A; 4E18 A; 4JIO A; 3HTK C; 4NQF A; 2WL8 A; 2HSQ A; 4YT5 A; 4AK9 A; 4DRH B; 3NKE A; 4LER A; 1Z63 A; 1R4T A; 2BE5 F; 3I4U A; 4XTK A; 2OEV A; 3MBG A; 2FFH A; 3ABM C; 3HNI A; 2JD3 A; 1BBH A; 3LS0 A; 2XLO A; 2YEV A; 1TWC A; 3AOU A; 2IXO A; 4M63 A; 3NYJ A; 1FNT c; 2EPO A; 4NY3 A; 1OR2 A; 4DRJ B; 2IBF A; 3BEH A; 3ATP A; 3H65 A; 4K1O A; 4BEM J; 4XLN F; 5K0I A; 2HMZ A; 1D1B A; 3U9M A; 4YL1 A; 4KNW A; 3LLI A; 3US6 A; 1JR8 A; 1OKK D; 3F46 A; 1PD0 A; 2IXM A; 4WGZ A; 4CIP A; 3TUL A; 4YT8 A; 2YLD A; 5CI8 A; 2P1A A; 1RCP A; 3EPV A; 3IEE A; 2ZXO A; 4AX2 A; 1C02 A; 3EZH A; 1I4Z A; 3GEE A; 3O10 A; 4MW3 A; 3N0T A; 3VAY A; 3AG3 C; 1NZE A; 2VCB A; 1YZC A; 4MVU A; 3ITF A; 1TQG A; 1AEP A; 2M64 A; 2PF4 E; 1FAP B; 4GYT A; 1LKX A; 3G4Z A; 1SZI A; 5T1D B; 3JRM O; 3MYF A; 2XLV A; 4PFO A; 4JCZ A; 3S84 A; 3KL4 A; 2YHS A; 3W8H A; 1JRA A; 3DJU B; 5B3S C; 4O6Y A; 4FES A; 1VYK A; 2MYS A; 1CPQ A; 4OIN F; 5E3C A; 1VOM A; 1CPR A; 2J7P D; 3JTL O; 1U89 A; 3JYH A; 3NKD A; 3TOM A; 2OKU A; 1OXK A; 1ZHW A; 2Y3D A; 3TK0 A; 3ECS A; 4CJG A; 4IGG A; 2J9B A; 1IZM A; 5F5F A; 3M15 A; 2H7B A; 4U5F E; 4CDA A; 4I1O B; 1YDI A; 4DVZ A; 3HLZ A; 4W8K A; 2DYR C; 3U2M A; 1L3P A; 3HNL A; 3G50 A; 3PDM P; 1CGO A; 1PV3 A; 4EBJ A; 1OR3 A; 1M2V B; 1WAT A; 2YRF A; 4IAQ A; 4XPY A; 4BJ6 A; 2KNH A; 4EWC A; 2I15 A; 2HSB A; 1T9K A; 3FOO A; 4DJ9 A; 2R7O A; 4PJL A; 4U5G A; 3C63 A; 5DS4 A; 1V4A A; 3X1O A; 2YL3 A; 3U3F A; 4PFP A; 3UMK A; 1N1C A; 3JSE O; 4BJ5 C; 4E7Z A; 4W8P A; 4FWV A; 3SXZ A; 4CS9 C; 2EPM X; 2VH3 A; 3LJB A; 1DOV A; 2YVK A; 4XLP F; 4PJJ A; 2J0X A; 3RIP A; 1VLS A; 2L9J A; 3T6G B; 4EBK A; 4EBB A; 2ETS A; 1IW7 F; 2YZS A; 3NYL A; 4CIH A; 1BR2 A; 3B29 A; 4JTA B; 3S29 A; 3VYW A; 3EG9 A; 4ANJ A; 3UGP A; 5JLI A; 2RD9 A; 3X2Q C; 2AVK A; 3CAX A; 4JJG A; 2R7Q A; 1OW6 A; 4ULW A; 4JRZ A; 4CDY A; 1YAR O; 2GFH A; 3A11 A; 4QI2 A; 2C04 A; 2J9V A; 1C03 A; 3EGX A; 4U5D E; 1RJ9 B; 2QLA A; 3NMK A; 1M56 C; 2WVQ A; 1B68 A; 4YN0 B; 2Y39 A; 3AG1 C; 1D1A A; 1JOG A; 1LIH A; 1SR2 A; 3L8I A; 3NG1 A; 4MQ9 F; 5EHH A; 2IM8 A; 5L0C A; 4DRI B; 2NG1 A; 2LP4 A; 2KJG A; 3JT1 A; 4BEJ A; 4AL1 A; 4F4B A; 1YA9 A; 1RKE A; 2R9R B; 3FAP B; 4XEK A; 4N4W A; 2BL2 A; 4LDR A; 1OCO C; 3DWW A; 4Z9J A; 1G4W R; 2CW0 F; 3WAQ A; 2R7V A; 2D5R B; 1LI7 A; 3PCV A; 4IB4 A; 1OQC A; 3I5Q A; 3WHN A; 2XLE A; 3EGX B; 3U8P A; 1ZHY A; 5KYN A; 4JTC B; 2A6E F; 4DVY P; 2LFF A; 2R7U A; 4KI2 A; 1ST6 A; 4OIP F; 4E0H A; 2KW3 C; 1NFN A; 4NCQ A; 2EIL C; 3LNM B; 2H8A A; 2R25 A; 1D0Y A; 5L0G A; 2YQY A; 3DXJ F; 3E70 C; 1XWJ A; 2PP4 A; 4Z9H A; 1RKE B; 3EFO B; 3RKO F; 3SXM A; 2G62 A; 2YL0 A; 5E33 A; 3WG7 C; 5JS5 A; 1CGM E; 4CSA C; 3ZTZ A; 4G7O F; 3W2V A; 3FMS A; 3SZR A; 4J30 B; 3ZTM A; 3K1I A; 3DD7 A; 5KYY B; 1EI7 A; 2YL1 A; 1RMV A; 2V26 A; 2ZXW C; 2KC3 A; 4IRU A; 2ZPA A; 5JUA A; 1E83 A; 2LFD A; 3DM9 B; 5COF A; 1HE1 A; 1YJG A; 3ZVR A; 3SNH A; 1K04 A; 2NSG A; 2W4M A; 1JPN A; 3ZQV A; 4CS7 A; 5A6B D; 3QTH A; 2DGJ A; 1APC A; 1MMG A; 1QLE C; 3VF0 A; 3B0V C; 5E2Q A; 2RSE B; 2L6H A; 3ABL C; 4LLE A; 1M57 C; 1WOL A; 3LAY A; 1CGN A; 1T6Q A; 3R2P A; 2DYS C; 4KNV A; 5DS5 A; 2IOQ A; 5GPG B; 1QVX A; 1Y4C A; 2Z15 A; 2XSE A; 3QW0 A; 3PMR A; 4PJM A; 5KYU B; 4NC3 A; 3TJ5 A; 2IYL D; 2L6G A; 1V54 C; 4YT2 A; 4ZLD A; 4NTF A; 3JZ0 A; 4HEA J; 4FAP B; 1Z6A A; 4JJF A; 5KYW A; 2KSF A; 3U8V A; 2VAS A; 5L0F A; 2J7P A; 2XLW A; 3OEO A; 5L0D A; 3IQC A; 2R03 A; 4RD9 A; 4WJ0 A; 1F1M A; 1H9G A; 5DQT A; 2Q00 A; 3NMI A; 1H6G A; 3M1C B; 2HKV A; 2WVN A; 3C62 A; 1KU2 A; 3ZDL A; 2OOC A; 1YA7 O; 4BG0 A; 1ZZP A; 1MMA A; 3IHU A; 1YYJ A; 2NUT B; 3LUT B; 2P7V A; 1D0X A; 1AUE A; 3DAG A; 3FAJ A; 4P9F A; 2Y69 C; 2WZL A; 3V5Y A; 3RFY A; 4BJ1 A; 4Q5S F; 5A6J A; 4XPW A; 1V74 B; 5F28 E; 1HW1 A; 2EIJ C; 3K1H A; 1TWH A; 2PX3 A; 3NYM A; 3AQC A; 2R7R A; 1FFH A; 2OJE D; 3A9C A; 3L34 A; 5KYW B; 3RF3 A; 3MYI A; 2F22 A; 2DI3 A; 3U9J A; 1FMV A; 3C8G D; 1HE9 A; 4IJJ A; 1M2V A; 2XXA A; 3TOL A; 1NG1 A; 2YKZ A; 4HE8 D; 4RDA A; 3GOR A; 3OWT A; 4AE4 B; 4CS8 A; 1KTM A; 3KPH A; 2YWA A; 4BJ6 C; 2D4U A; 2XL4 A; 1TWA A; 5KYX A; 4C3D A; 1Z7Q c; 4ULV A; 5L0H A; 1PD1 A; 2OCC C; 1YLM A; 4XEF A; 3CQZ A; 5L0J A; 4NTB A; 2Q9B A; 1LM3 B; 1LPE A; 1Y6D A; 2ZD9 A; 3QVY A; 2Q9C A; 4N6H A; 1U0B B; 1NFO A; 3DE9 A; 4OD5 A; 4X0R A; 3CSK A; 1VTM P; 1L7C A; 3KYJ A; 3SXY A; 5D91 A; 3N24 A; 5F5H A; 1EKY A; 2ZXP A; 2XXA B; 1ZW2 A; 3HKK A; 5IY5 C; 2LCH A; 1D0Z A; 1ZVZ A; 2L6F A; 2MHR A; 2XS1 A; 3EJN A; 3QMK A; 4MND A; 3SYN A; 4DXW A; 4Q7C A; 1QZX A; 5KYX B; 3S90 A; 3DZA A; 1RKC A; 2CGE A; 2IXN A; 3E9V A; 1OXB A; 2E87 A; 3UGO A; 4KC9 A; 1RJ9 A; 3EZI A; 3M4C A; 5DVW A; 4D4N A; 4G7H F; 5AC4 A; 3MLG A; 4LDK A; 1QSP A; 2J9U A; 3LEO A; 4IAO A; 4RBN A; 3K6B A; #chains in the Genus database with same CATH homology 1FAP B; 2FAP B; 4FAP B; 1NSG B; 3FAP B; 5GPG B; 2GAQ A; 4DRI B; 4DRH B; 1AUE A; 2NPU A; 2RSE B; 4DRJ B;
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