The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
117
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sequence length |
300
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structure length |
300
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Chain Sequence |
FIIPKKEIHTVPDMGKWKRSQAYADYIGFILTLNEGVKGKKLTFEYRVSEAIEKLLALLNTLDRWIDETPPVDQPSRFGNKAYRTWYAKLDEEAENLVATVVPTHLAAAVPEVAVYLKESVGNSTRIDYGTGHEAAFAAFLCCLCKIGVLRVDDQIAIVFKVFNRYLEVMRKLQKTYRMEPAGSQGVWGLDDFQFLPFIWGSSQLIDHPYLEPRHFVDEKAVNENHKDYMFLECILFITEMKTGPFAEHSNQLWNISAVPSWSKVNQGLIRMYKAECLEKFPVIQHFKFGSLLPIHPVTS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of the Pp2A Phosphatase Activator: Implications for its Pp2A-Specific Ppiase Activity
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SERINE/THREONINE-PROTEIN PHOSPHATASE 2A REGULATORY SUBUNIT B
|
| molecule tags |
Hydrolase activator
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
117
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| structure length |
300
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| sequence length |
300
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| ec nomenclature |
ec
5.2.1.8: Peptidylprolyl isomerase. |
| pdb deposition date | 2006-07-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF03095 | PTPA | Phosphotyrosyl phosphate activator (PTPA) protein |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2G62 A; 4LAC B; 4NY3 A; 2HV7 A; 2IXN A; 2HV6 A; 2IXO A; 2IXM A; 2IXP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2W45 A; 4C3B A; 2AVK A; 1Y4C A; 4U5E E; 4MVS A; 3LEV A; 3IPM O; 3CSK A; 3S28 A; 5KYU A; 4P9T A; 1ST6 A; 2R7R A; 4FWV A; 4W8K A; 4YT5 A; 3R2P A; 4U5H A; 4G7Z F; 4DBR A; 4ULW A; 1Q0G A; 4CSA A; 3DD7 A; 5A6B D; 2XM0 A; 4NQF A; 1CPR A; 2W4M A; 5T3W A; 3CEX A; 1H6G A; 3EPV A; 4P6I C; 5GPG B; 3ECS A; 3JSE O; 1ZHT A; 4IAQ A; 4U9E A; 3RQF A; 4YWQ A; 1CGM E; 5BUO A; 2LP4 A; 1RMV A; 3L1M A; 4O6N A; 4U5G A; 1YLM A; 1WWP A; 3Q6N A; 1AUE A; 2VH3 A; 2J45 A; 3CAX A; 1OR3 A; 2C03 A; 2P0N A; 4JZA A; 3VYW A; 2R7S A; 2PX0 A; 5DQZ A; 3EGD A; 4A4A A; 4DRH B; 3L0I A; 1S05 A; 4MQ9 F; 3N2Z B; 3LS0 A; 5A6A A; 3UGO A; 3AG3 C; 2KGO A; 2CNW D; 4C3E A; 1BR1 A; 1EI7 A; 2NG1 A; 3GEE A; 3Q6M A; 1O5H A; 4N6H A; 4HEA J; 3KH2 A; 2XLM A; 3EG9 A; 1ZHY A; 2EPO A; 4J32 B; 4ONS A; 4YL1 A; 2WL8 A; 4E7S A; 3F47 A; 2NUP A; 5JP7 A; 4LER A; 4NY3 A; 1OCZ C; 2PNO A; 2XM4 A; 3JYY A; 3M4C A; 4MVQ A; 3ZTZ A; 1SYQ A; 1XZP A; 3H2U A; 3SEO A; 2Y3G A; 3SXY A; 1YAR O; 3EJN A; 5JRA A; 2V3C C; 1YZA A; 5KYX A; 5JLI A; 1I4Y A; 2P6V A; 2Q9C A; 3EHM A; 3FAJ A; 4I44 A; 1D1C A; 2OJQ A; 4IGG A; 4W8P A; 1S7Z A; 1C02 A; 5F28 E; 3C8Z A; 4MS2 A; 4U5B E; 4ZLD A; 1UG7 A; 2Q9B A; 4BG0 A; 4U5C E; 4MVM A; 3IQT A; 2HFI A; 4BEJ A; 2WZL A; 1U6H A; 3S29 A; 1QLE C; 5E2Q A; 3GEH A; 3SNH A; 3NKD A; 4IRU A; 2R9R B; 1WOL A; 1A41 A; 4YJW A; 2J0X A; 1FFT C; 3W8I A; 3UGP A; 1Z7Q c; 1Q0K A; 2Q9A A; 4HFK B; 1CGO A; 3NKE A; 4OD5 A; 1MMD A; 5L0I A; 1NFO A; 2ZXO A; 4JEA A; 5B3S C; 3ABM C; 4Z9H A; 5KYW B; 3FVY A; 3K66 A; 1WAS A; 3OEO A; 1BBH A; 4EHP A; 2HSQ A; 1A7V A; 3OWT A; 5KYX B; 4AK9 A; 4XPX A; 2YLI A; 1M2O A; 4QI0 A; 2OG2 A; 3TJ5 A; 5KYY A; 2OEX A; 3WAQ A; 5E33 A; 4Z9I A; 3EGX B; 3LEO A; 2BL2 A; 3U2L A; 1H9T A; 3T9O A; 1APC A; 2YEV A; 2OCC C; 2NPU A; 2R25 A; 3M15 A; 3O39 A; 2QLA A; 2R7X A; 1FMW A; 1YYJ A; 3HJC A; 4JRZ A; 4ER9 A; 1OXK A; 2L7A A; 2YWA A; 4JJG A; 2J0W A; 1F1M A; 4I1O B; 2OEV A; 4BEM J; 3NMK A; 1VK5 A; 2AWC A; 3S90 A; 4OIQ F; 3H2V A; 2XLV A; 2A6H F; 4JIO A; 3EFO A; 4QI2 A; 4KBL A; 2EIL C; 2DI3 A; 3K6B A; 2I15 A; 3AJM A; 2J8W A; 3FXH A; 1LVK A; 4K0D A; 1E83 A; 1EKY A; 1JMW A; 1GM5 A; 2L81 A; 2OU6 A; 1VLS A; 1Z23 A; 2BC5 A; 2IXO A; 3DM9 B; 2WVQ A; 4BJT A; 1HW1 A; 1LI7 A; 3HNK A; 1R5I D; 3U8P A; 2XXA B; 1H7I A; 1LE4 A; 1KU2 A; 1Q0M A; 1K05 A; 2KW3 C; 1V55 C; 2W9Y A; 3T6G B; 4BJ6 A; 1BR4 A; 1FMV A; 2L6G A; 3UMK A; 1AVO B; 3DJN B; 4AX2 A; 4PJM A; 3X2Q C; 1Q0D A; 1ZHX A; 4LLC A; 1GQA A; 4CDV A; 1KNY A; 2FGY A; 3GWL A; 1HY5 A; 4CS8 C; 3I5Q A; 5K0I A; 4XLP F; 1HW2 A; 3J06 A; 1E2X A; 1M2V A; 1G8X A; 5HV9 A; 5EK0 A; 4BJ1 A; 2C04 A; 3GEI A; 2R7T A; 3RVY A; 3FOO A; 3H65 A; 4KC9 A; 2XLD A; 4I3M A; 4DOZ A; 5F5H A; 2TMV P; 1OW8 A; 2XLH A; 4FES A; 2WVO A; 4PR9 A; 1IW7 F; 5A6K A; 1I4Z A; 1E86 A; 5T3T A; 1D1B A; 3DE8 A; 3JCU Q; 3KL4 A; 4JCZ A; 2HV7 A; 5CI8 A; 5COM A; 5CI9 A; 4FX5 A; 1TKN A; 4XTK A; 3RKO F; 2R7U A; 4XWJ A; 3M1C B; 4XEV A; 2UUI A; 1YJG A; 3HNL A; 2R7V A; 5BQG A; 1ZU4 A; 3QTH A; 3RF3 A; 4U9D A; 4CS8 A; 5FCL A; 1Z5Z A; 4J7Y A; 5DVW A; 4GEH A; 3FMS A; 1PCX A; 2QUP A; 4QDL A; 4DXW A; 1BR2 A; 2I8B A; 4DJ9 A; 4R32 A; 4OD4 A; 4PFO A; 3U3B A; 1E84 A; 3PHF 2; 1XWJ A; 4HFF B; 4LDK A; 3TUL A; 3WOD F; 1R4T A; 3EH1 A; 3UNG C; 3AQC A; 1Q0F A; 1IZM A; 2KYH A; 3NMI A; 1T01 A; 2HMQ A; 1Z3I X; 2HSB A; 5JSL A; 3KMI A; 1PD0 A; 4UDV A; 2IOQ A; 1TWG A; 1HE1 A; 3IQC A; 1KTM A; 1QZX A; 1NBB A; 4AL1 A; 5EGY A; 3KPH A; 1O87 A; 4C3D A; 1NU7 D; 3NDB B; 1SF8 A; 5BQI A; 1U89 A; 2B0H A; 3KYJ A; 3GOD A; 1BDJ B; 3RQE A; 1ZHZ A; 2W4B A; 1ORY A; 3GM2 A; 4HE8 D; 2CYD A; 3HNJ A; 4CJO A; 1CGN A; 5B3I A; 1FR0 A; 2YKZ A; 3GOR A; 1RKC A; 3O6X A; 3LLK A; 2QTV A; 3ZVR A; 2G3K A; 2H8A A; 2AP3 A; 2JPU A; 3SXM A; 2J9B A; 2NSF A; 1RXQ A; 2R03 A; 3U9J A; 4EIY A; 4JUR I; 4C7O A; 4O7G A; 4CS7 A; 5L3V A; 4NTF A; 2VB6 A; 3K33 A; 3M79 A; 1TWA A; 2IXM A; 3UR3 C; 3T6J A; 3JT1 A; 2R7Q A; 2AU5 A; 1MMN A; 3VRC A; 3NG1 A; 4U5F E; 5KYW A; 3ZDL A; 4WGZ A; 3Q7G A; 4O79 A; 2Y69 C; 2MHR A; 3W2V A; 2PFD A; 3V5Z A; 3JRM O; 3JZ0 A; 4OIN F; 2EIM C; 4E0H A; 2YL1 A; 3POV A; 4ULV A; 256B A; 2KQ9 A; 2LFF A; 2XSE A; 2Y3H A; 3EGX A; 3RVZ A; 5DQT A; 3ATP A; 3UMH A; 3KKB A; 1OCC C; 3B29 A; 3BRJ A; 3T4R A; 2JD3 A; 3B9Q A; 4CIP A; 2ETS A; 3MYI A; 3IQ5 A; 3SXK A; 4KNW A; 1YA9 A; 4E0I A; 3NYJ A; 2A1D D; 2A6E F; 5COF A; 2ZD9 A; 2CCY A; 2YLG A; 3C63 A; 4JCH A; 3Q7L A; 4YT8 A; 1K40 A; 2ASR A; 1NZE A; 1T6I A; 3R7C A; 3RFY A; 2Y3D A; 3QVY A; 3U9M A; 2H7B A; 4JC7 A; 3ABL C; 4G7H F; 2YVK A; 1T6Q A; 4K1O A; 3PMR A; 2P61 A; 1JPJ A; 3HTK C; 1G5Z A; 3W8H A; 4CDY A; 2XXA A; 2MWQ A; 1YAU O; 3WG7 C; 5AC5 A; 2KK1 A; 1ORJ A; 3FHD A; 3E70 C; 4PAC A; 3ZG1 A; 4GQH A; 3HKK A; 4NTA A; 3FDQ A; 3N24 A; 2HUJ A; 3LUT B; 4N4W A; 2X51 A; 1V74 B; 3C8G B; 2HZ8 A; 2QE9 A; 3DZA A; 4D4N A; 1RKE B; 3ZQY A; 3GM1 A; 4CS9 C; 2JX0 A; 4JEB A; 4IAR A; 2PX3 A; 2A68 F; 4KNV A; 1U0B B; 4EBJ A; 3JRT A; 3G4X A; 3V5Y A; 1RJ9 B; 1T5O A; 2HS5 A; 3S27 A; 4F4B A; 5L3Q A; 1OCR C; 2PBE A; 3L8I A; 5E3C A; 2WVN A; 5CIV A; 4H54 A; 3SZR A; 4J30 B; 4CJG A; 3KYI A; 1GGQ A; 2HMZ A; 1TWC A; 1C03 A; 1D0Y A; 3RH3 A; 2J9V A; 4U5D E; 1MMG A; 1LPE A; 2KNH A; 2L6F A; 3DE9 A; 4MW8 A; 3ZIB A; 3EZI A; 2X0C A; 4G0H A; 2EPK X; 2NUT B; 3DWW A; 3A9C A; 2OKU A; 3I4U A; 1JR8 A; 2XLE A; 4MVR A; 5F5F A; 4EWC A; 1FAP B; 4YL0 A; 3SYN A; 3MFN A; 2Q3T A; 2R7O A; 2GAQ A; 4NCQ A; 1EA8 A; 1B68 A; 4Q4Z F; 2P1A A; 1D0X A; 2LFD A; 2XL6 A; 2OOC A; 2VCC A; 2Y3B A; 1JPN A; 3LJB A; 1H9G A; 3GWN A; 3CQZ A; 1QKR A; 2RSE B; 4IJJ A; 1LKX A; 1PV3 A; 4JE9 A; 1YZC A; 1WGW A; 3TQO A; 1OKK A; 4JKV A; 4BJ6 C; 1TR2 A; 4LAC B; 1D1A A; 1E85 A; 3TOM A; 2R05 A; 4G7O F; 4MTF A; 5EHH A; 1JRA A; 2IXN A; 1TWH A; 2ICW G; 3DXJ F; 1FTS A; 2EIK C; 3U8V A; 4PJN A; 3VM6 A; 5DS4 A; 3RIP A; 4OIO F; 1T6U A; 2J7P A; 3TK0 A; 4RBN A; 1EQ1 A; 5BQH A; 4MVU A; 3BEH A; 4YL3 A; 4DVY P; 3LNM B; 3G50 A; 5L0D A; 4YT2 A; 1W2W A; 1C17 M; 3JSZ A; 2XRH A; 4WGY A; 2YHS A; 1OW7 A; 2RD9 A; 1J8M F; 3B71 A; 5DS5 A; 1T9K A; 4OIP F; 1OR2 A; 5TJ5 E; 3SP1 A; 4AL0 A; 3WHN A; 1ZYR F; 4DVZ A; 3ZSU A; 1GS9 A; 2M64 A; 1VOM A; 2LSE A; 2D5R B; 2A0B A; 3ABK C; 1LM3 B; 4J7T A; 4PJJ A; 3U2M A; 4ZLC A; 2LQG A; 1JOG A; 4RD9 A; 3F46 A; 3S84 A; 3K1H A; 4YT4 A; 4EBB A; 3DI5 A; 2GDC A; 3RYL A; 3PCV A; 4XEF A; 4BPM A; 4N6C A; 2AWY A; 2A0U A; 5T1D B; 2Q7R A; 3IHU A; 3O10 A; 4JJF A; 4MVO A; 1SZI A; 3V5X A; 2YRF A; 5L0G A; 1RCP A; 3U5S A; 4XPY A; 3LLI A; 3VF0 A; 4IAO A; 2WB7 A; 3NYM A; 2NSG A; 1WN0 A; 4MW3 A; 2PP4 A; 5A69 A; 2WZG A; 1A0B A; 2R7W A; 5A6J A; 4IB4 A; 5E3A A; 1NU9 C; 3HLZ A; 3ITF A; 2EPM X; 1ORS C; 2EIJ C; 1YYX A; 2CDQ A; 3S0X A; 3AOU A; 4C7O B; 1HMO A; 2LK4 A; 1M57 C; 1OW6 A; 2OQM A; 1NSG B; 2DYR C; 2XL8 A; 3ZWI A; 2F22 A; 1BZ4 A; 5JUA A; 1MNE A; 1OXB A; 5D92 A; 1FNT c; 2IM8 A; 2M4E A; 3E9V A; 3MLG A; 2GA0 A; 4K7B A; 3W4Y A; 3NYL A; 2KJG A; 1NFN A; 2O9X A; 2ZXR A; 5L0H A; 3ASO C; 1L7C A; 4WAB A; 1VMA A; 1O3U A; 3L8J A; 3LNR A; 4LDR A; 4AE4 B; 4KI2 A; 1SR2 A; 2Q00 A; 1ZW2 A; 2YLD A; 3DAF A; 3UMI A; 1L3P A; 1Y6D A; 3N0T A; 4G78 A; 4NTB A; 3MX3 A; 1ZZP A; 4JVS A; 1VTM P; 2YQY A; 1G4U S; 5KYU B; 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1TQG A; 4Z9J A; 3ZC4 A; 1NG1 A; 5L0F A; 4MVZ A; 1YA7 O; 2P7V A; 1M56 C; 2CW0 F; 2EIN C; 3K1I C; 1JAF A; 4XQ1 A; 3U3F A; 3QMK A; 5KYN A; 3FOP A; 4MTO A; 1DOW A; 1MND A; 4N06 A; 3RQG A; 3O55 A; 2HV6 A; 5FZT A; 3LS1 A; 4XPW A; 2LCH A; 1WAT A; 4I1M A; 3CZ6 A; 4CS9 A; 1M6T A; 3DM5 A; 2HJ3 A; 2IXP A; 3QVZ A; 2Y39 A; 4DRJ B; 3IQ6 A; 3IEE A; 2FAP B; 2R02 A; 2ZXP A; 4CIH A; 3EZH A; 4BJ5 C; 2UUH A; 3M4B A; 2VAS A; 5KYY B; 4MND A; 1TFK B; 3L34 A; 3C62 A; 3I5P A; 2KSF A; 4O6Y A; 4Q5S F; 3B0P A; 4XEK A; 4JTA B; 3US6 A; 5DLJ A; 4EBK A; 2HJM A; 4LLE A; 4PFP A; 4XLN F; 3TJ6 A; 3VAY A; 5IY5 C; 2EPL X; 3MYF A; 1HMD A; 3GM3 A; 2PF4 E; 1AEP A; 3MBG A; 3V7O A; 2VCB A; 3K1I A; 4DBQ A; 2D4U A; 3NRH A; 1VB5 A; 1G4W R; 3EFO B; 1QPU A; 4RDA A; 3HNI A; 1YVI A; 2LIG A; 3ZQV A; 3AG1 C; 3RW0 A; 3U0C A; 2E87 A; 1I5N A; 2B0J A; 5AC4 A; 4EUK B; 1NLX A; 3DMD A; 2Q4F A; 3G4Z A; 1LS4 A; 2Z15 A; 3AG4 C; 4DRI B; 2LD6 A; 3B0V C; 4CSA C; 4FAP B; 3EQL F; 3FAP B; 1LIH A; 4BJ5 A; 4MTG A; 2QNL A; 3AGU A; 4M63 A; 4P9F A; 1A7E A; 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