The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
51
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sequence length |
162
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structure length |
162
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Chain Sequence |
RENLYFQGHMREHLKLFSLIFSYPDEDKLGKAIALAEGIGLTEIAQTLKQVDIEALQVEYTSLFISSHPSVPCPPYQSYFEEGSVYGKASLRAAELYSKYGLNYVYESEPPDHISVELEFLSMNPELLSDFRDWFLEFAKCVEEKSEIYATFARAFRKFLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
An extremely SAD case: structure of a putative redox-enzyme maturation protein from Archaeoglobus fulgidus at 3.4 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| source organism |
Archaeoglobus fulgidus
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| molecule keywords |
Reductase, assembly protein
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| total genus |
51
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| structure length |
162
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| sequence length |
162
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-12-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02613 | Nitrate_red_del | Nitrate reductase delta subunit |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | putative redox-enzyme maturation protein fold | putative redox-enzyme maturation protein domain | ||
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2O9X A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3LLI A; 2QY9 A; 1VB5 A; 2EIN C; 3EJN A; 3KL4 A; 4IRU A; 2GFH A; 3RFY A; 4BJ5 C; 1U0B B; 4MTO A; 3MX3 A; 2VH3 A; 2XLV A; 1OQC A; 3O39 A; 5KYU A; 1SR2 A; 3HNL A; 1I5N A; 4DBQ A; 2XSE A; 1Q0M A; 3DJN B; 4RBN A; 3AGT A; 1LIH A; 3PMR A; 3ITF A; 3TOM A; 3U8V A; 5BUO A; 4PFO A; 3DE8 A; 4BEJ A; 2AP3 A; 5A6B A; 1JOG A; 2XL8 A; 2LCH A; 3CQZ A; 2GDC A; 2WZF A; 3L34 A; 3CZ6 A; 5A6K A; 4E7S A; 1WAT A; 5L3V A; 3TJ5 A; 1LPE A; 1U6H A; 2H7O A; 3L0I A; 3RVY A; 3SXY A; 3TJ6 A; 1T6I A; 4BG0 A; 3ZSU A; 3M4B A; 3V5Y A; 4Q5S F; 1ORY A; 4HE8 D; 3K6B A; 4XPW A; 4I1O B; 1YYX A; 4OIO F; 2IXP A; 1TWA A; 2J46 A; 1LE4 A; 1W2W A; 2J9B A; 1HMO A; 2BC5 A; 3U9J A; 1VYI A; 4JZA A; 1H7I A; 1NFN A; 4PJL A; 4Q7C A; 2LK4 A; 4CS8 A; 5DVW A; 1C17 M; 4KNW A; 3JTL O; 4PK4 A; 1DOV A; 2ASR A; 1Q0K A; 1OXB A; 2UUI A; 3W4Y A; 1NU7 D; 1V54 C; 3EGX B; 1MMN A; 4GYT A; 4C7O B; 1EQ1 A; 3EZH A; 1VYK A; 3B0V C; 4PJJ A; 4MND A; 3FHD A; 2B0H A; 3PHF 2; 3EPV A; 2LQG A; 1RMV A; 2PFD A; 1OXK A; 3ZWI A; 1UFB A; 3RQG A; 4CJG A; 3IQ5 A; 2VC9 A; 2ZD9 A; 5EK0 A; 1LVK A; 2KQ9 A; 2G3V A; 5BQI A; 3L8I A; 4CBE A; 2P7V A; 1D1A A; 2KC3 A; 4BPM A; 1ORS C; 3PCV A; 2CW0 F; 2G3K A; 4LLE A; 3K1H A; 3RYL A; 3LES A; 4FWV A; 5HSW A; 4XQ1 A; 2NSF A; 1NU9 C; 4K7B A; 2WZL A; 4IGG A; 4C3E A; 1HE1 A; 1KNY A; 3C7J A; 2EPM X; 4Q4Z F; 3U2L A; 2B0J A; 2X0C A; 3POV A; 4JEA A; 1YZC A; 3AG2 C; 4HEA J; 1G4U S; 1VLT A; 2XXA A; 2CNW D; 4G7H F; 3JZ0 A; 2DB4 A; 1PCX A; 3ABL C; 2Q9A A; 3EH1 A; 1LE2 A; 1O87 A; 2H7V C; 4U5D E; 4K1O A; 2LFD A; 1JMW A; 5JP7 A; 2EIL C; 4OIQ F; 4J32 B; 2KJG A; 3R2P A; 2R7S A; 1ZHZ A; 4J7T A; 4NC3 A; 4JTD B; 3UNG C; 3VYW A; 4ONS A; 2Y3G A; 2J0W A; 3DKA A; 1T6Q A; 2Y69 C; 1BBH A; 5T1D B; 4AE4 B; 1RKE B; 2DGJ A; 2XLO A; 2M64 A; 2Y3H A; 4O6N A; 5KYW A; 2HMQ A; 4G7Z F; 1D1C A; 3L8J A; 1DOW A; 4JIO A; 1D0Y A; 1MNE A; 1K40 A; 3U2M A; 3DMD A; 2IXM A; 4W8P A; 2ZXR A; 3BRJ A; 3UGO A; 2HV7 A; 5E3C A; 4R32 A; 2YEV A; 3O55 A; 2JPU A; 1CGN A; 2R25 A; 4XLP F; 4MW8 A; 4WAB A; 1TFO B; 4DRJ B; 3LNR A; 2RD9 A; 2J7P A; 1PD1 A; 3TD7 A; 2M4E A; 4FES A; 2YVK A; 2MYS A; 3EFO B; 2YKZ A; 3VAY A; 4YJW A; 2QUP A; 3N24 A; 5DQZ A; 1SMY F; 1MMG A; 3F46 A; 3EHN A; 3L1M A; 4MS2 A; 3C62 A; 4EKW A; 2XRH A; 4GEH A; 4GQH A; 2XLH A; 4WGY A; 1OCC C; 3T6G B; 2WVN A; 2NUP A; 1BR2 A; 1M56 C; 2QLA A; 4QDL A; 3ECS A; 3IQC A; 1R5I D; 3MLG A; 5JVE A; 3UMI A; 4A4A A; 3DZA A; 1EKY A; 1D1B A; 5DS4 A; 2J9V A; 3ZDL A; 2XLD A; 4JCZ A; 3FXH A; 4LDR A; 1FR0 A; 2Q4F A; 4C3D A; 1WOL A; 4KNV A; 3SYN A; 5CI8 A; 5A6B D; 5KYY A; 4N4W A; 1M2V A; 3CEX A; 3HKK A; 3Q7L A; 2VCB A; 1AEP A; 2P1A A; 2Y39 A; 2C03 A; 3EZI A; 3R7C A; 4OIN F; 2MWQ A; 3X2Q C; 2A0U A; 2PX3 A; 4C7O A; 3B0U X; 1GS9 A; 1NZE A; 1ZHW A; 1ST6 A; 3JSE O; 1VOM A; 1G4W R; 1TFK B; 2L6G A; 4U5C E; 5D91 A; 3RQE A; 3NKE A; 2G62 A; 1QKR A; 2NSG A; 2WB7 A; 3GWN A; 3LEV A; 3MYF A; 3ZQY A; 4A2N B; 4QI0 A; 5T3T A; 1E86 A; 3KPH A; 5DLJ A; 2NG1 A; 3KYJ A; 1YAU O; 1OR2 A; 3JSZ A; 1Q0G A; 3JYH A; 5COG A; 1VMA A; 3KH2 A; 4DJ9 A; 3N2Z B; 4LAC B; 1NBB A; 1LI5 A; 3IQ6 A; 1Z6A A; 1QSP A; 2A69 F; 2OG2 A; 1VTM P; 3ZQV A; 4DBR A; 2BL2 A; 2J9W A; 4EBB A; 3K1I A; 3MFN A; 4MVU A; 1Z63 A; 4PFP A; 2KK1 A; 2CCY A; 2EIJ C; 4DOZ A; 2I15 A; 5AGF A; 4U5G A; 1ZHT A; 4BJ5 A; 4E0H A; 1E84 A; 1ZU5 A; 5CIV A; 3S29 A; 1BR4 A; 4DRH B; 3UMK A; 5K0I A; 2Q9B A; 1N1C A; 1CGM E; 4PJN A; 4N06 A; 2HKV A; 2WL8 A; 5B1B C; 4YK5 A; 3U3F A; 3US6 A; 4BJT A; 1FTS A; 5KYU B; 5JS5 A; 1PV3 A; 3BEH A; 1J8Y F; 4RD9 A; 2W4B A; 1YAR O; 3S9O A; 3ATP A; 3W8I A; 3SXM A; 5A69 A; 4DXW A; 1ZHY A; 2IOQ A; 3OWT A; 3TOL A; 3W2W A; 1Q0D A; 2XM4 A; 3JCU Q; 2WZG A; 5A6A A; 1Z23 A; 2R02 A; 256B A; 3CSK A; 3I5Q A; 4G0H A; 4PJM A; 5E3A A; 3JT1 A; 4CS7 A; 4EBJ A; 4EIY A; 5EGY A; 1IW7 F; 1OW8 A; 1JRA A; 3LS0 A; 1QZX A; 3K66 A; 1ZW3 A; 3NYM A; 3S90 A; 3HJC A; 1M57 C; 1Z7Q c; 4BJ1 A; 2DYS C; 4F4B A; 1UG7 A; 4JC7 A; 5F5F A; 3B0P A; 1WAS A; 4P6I C; 1G8X A; 4U9D A; 2HS5 A; 2XLE A; 3VM6 A; 1QVX A; 2PF4 E; 1YYJ A; 4IJJ A; 3S27 A; 2ICW G; 1Y4C A; 2QE9 A; 4JTC B; 3RF3 A; 4CS9 C; 1VK5 A; 3C63 A; 3LAY A; 4NTB A; 4ZLC A; 4YL1 A; 1T9K A; 3SP1 A; 4I44 A; 3JYY A; 5L0C A; 1LM3 B; 1LS1 A; 1O5H A; 2XS8 A; 4E0I A; 2HSQ A; 3M15 A; 2OQM A; 1RJ9 A; 3B29 A; 3C8G A; 3NMI A; 4U5E E; 4OIP F; 2IYL D; 4WGZ A; 3AG3 C; 3RIP A; 1K05 A; 1OKK D; 4XTK A; 2J7P D; 5BQH A; 5JRA A; 1ZHX A; 3DJU B; 3RQF A; 3EGD A; 3DAG A; 4EBK A; 2IM8 A; 1OCO C; 4E7Z A; 2H7B A; 2OEV A; 5DQT A; 4J7Y A; 3U8P A; 3JRM O; 3V5X A; 1QLE C; 3G4Z A; 4YT2 A; 5L0G A; 3GOD A; 4IB4 A; 1RKC A; 1ORJ A; 4DVZ A; 2Y3B A; 3NG1 A; 1K04 A; 4JJF A; 2MHR A; 3ZTZ A; 1YDI A; 3ABM C; 3F47 A; 4W8K A; 4YWQ A; 4MVZ A; 4H4K C; 3K33 A; 1Q0F A; 3EH2 A; 4WJ0 A; 3GAN A; 5DS5 A; 5KYX A; 2XXA B; 3U3B A; 1TWG A; 5IY5 C; 2IXN A; 5F5H A; 3EG9 A; 5L0F A; 3X1O A; 5KYN A; 1I4Y A; 2AVK A; 1YLM A; 1NSG B; 3OA1 A; 2A6E F; 3GOR A; 4P9F A; 2HV6 A; 1C03 A; 1RCP A; 4U5F E; 3U0C A; 3MBG A; 1E83 A; 2Z15 A; 4XLN F; 4CIP A; 1OKK A; 1S05 A; 4CSA C; 2R7U A; 3QW0 A; 2R03 A; 4H54 A; 2XM0 A; 3T9O A; 3QTH A; 3ASN C; 5KYW B; 2HZ8 A; 3NDB B; 4E18 A; 2J8W A; 3FAP B; 4ULV A; 5L0I A; 5COF A; 3EQL F; 4EHP A; 3K7D A; 2V3C C; 2A6H F; 1KTM A; 3IQT A; 2KW3 C; 3CAX A; 3FMS A; 2YRF A; 3GM3 A; 1ZZP A; 4OD5 A; 4JVS A; 4CDA A; 3S84 A; 1OR3 A; 3WAQ A; 4Z9I A; 3U9M A; 3PDM P; 3KKB A; 3LEO A; 4NY3 A; 2AU5 A; 3AOU A; 3QW1 A; 2NPU A; 4O6M A; 4XEF A; 2AWC A; 1A41 A; 2NUT A; 2L81 A; 3KYI A; 3ZG1 A; 4AK9 A; 3DM9 B; 2Q00 A; 2YLG A; 4BEM J; 4BJ6 A; 2YZS A; 4G7O F; 2F22 A; 2E87 A; 2HJ3 A; 3M1C B; 3HNK A; 2LFF A; 2WVQ A; 3JRT A; 4KC9 A; 5GPG B; 2C04 A; 4D4X A; 5FZT A; 1EA8 A; 4O79 A; 1WN0 A; 5HV9 A; 2GWW A; 4G78 A; 5JT4 A; 4KBL A; 4MVS A; 2NUP B; 3G50 A; 2D4U A; 3ZVR A; 2HMZ A; 2JX0 A; 2GA0 A; 2W9Y A; 3ZTM A; 1T5O A; 1OCZ C; 2HSB A; 4I3M A; 1R4T A; 2LSE A; 2YLI A; 4CIH A; 5TJ5 E; 4MTF A; 1HW2 A; 2R7V A; 3RKO F; 5BQG A; 2IBF A; 1M2O A; 4B6I A; 2W4M A; 1ZVZ A; 4CX9 A; 1FFH A; 1H9T A; 4FAP B; 5KYY B; 4JEB A; 4XPX A; 3VRC A; 3WHN A; 1JPN A; 2TMV P; 2QTV A; 1M2V B; 2HUJ A; 3AQC A; 4M63 A; 5T3W A; 2YLD A; 3NMK A; 1NFO A; 2PNO A; 3LNM B; 2L6H A; 2EPN A; 2ZPA A; 2I8B A; 3GM1 A; 3Q7G A; 2XL6 A; 4IWB A; 4P9T A; 1NLX A; 3ASO C; 2YQY A; 4N6C A; 4Z9H A; 4AL0 A; 3LS1 A; 1A7E A; 1YA9 A; 2O9X A; 1E85 A; 3QMK A; 3OEO A; 4DRI B; 2EPO A; 1XZQ A; 2GAQ A; 3AG4 C; 4IAR A; 4X0R A; 1IZM A; 3H65 A; 4E17 A; 3UGP A; 2XS1 A; 3WG7 C; 1YJG A; 1MMD A; 3RVZ A; 2R7W A; 1C02 A; 1L3P A; 4IAO A; 2W45 A; 2CDQ A; 4AL1 A; 2P0N A; 4MVO A; 1JAF A; 1V74 B; 5CI9 A; 3DWW A; 3VF0 A; 3ZIB A; 2R9R B; 3K1I C; 4J30 B; 5B3I A; 3G4X A; 1SZI A; 1A7V A; 3GEE A; 2Q7R A; 3C8G D; 3S0X A; 5AC5 A; 5E33 A; 1WWP A; 2VB6 A; 1GM5 A; 1XZP A; 4QI2 A; 1MND A; 4OD4 A; 4IAQ A; 2KSF A; 3T4R A; 4AX2 A; 1TWC A; 2YWA A; 3I5P A; 4DVY P; 1SYQ A; 2A0B A; 1A0B A; 4XWJ A; 2Y3D A; 1TQG A; 3DI5 A; 1M6T A; 2L7A A; 2KNH A; 3DE9 A; 2R05 A; 3DXJ F; 1NG1 A; 1YVI A; 4YN0 B; 2IXO A; 4CS8 C; 1GGQ A; 1A7D A; 3EGX A; 1LI7 A; 5A6J A; 3B71 A; 1QPU A; 3GWL A; 2AWY A; 1H9G A; 2P61 A; 3TK0 A; 1GQA A; 4MQ9 F; 2BE5 F; 2YL3 A; 3RH3 A; 3T6J A; 5L0D A; 1HW1 A; 4K0D A; 1BR1 A; 1CPR A; 1FAP B; 5B1A C; 2PX0 A; 5EHH A; 1FMV A; 1T6U A; 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1Z5Z A; 3UMH A; 3AG1 C; 5KYX B; 2YL1 A; 4LLC A; 1WGW A; 3SNH A; 3EG9 B; 5FCL A; 3NMJ A; 4FX5 A; 1PD0 A; 3SXZ A; 1SF8 A; 2DI3 A; 3S28 A; 4HFF B; 2OJE D; 5JSL A; 2OCC C; 3J06 A; 1TKN A; 2WVO A; 3UR3 C; 4CJO A; 1CPQ A; 3O6X A; 3HNI A; 3EFO A; 4CSA A; 2CYD A; 1JPJ A; 2JD3 A; 2PBE A; 2VCC A; 3IPM O; 4JKV A; 1H6G A; 4NCQ A; 3HLZ A; 2J9U A; 3QVY A; 4MTG A; 3EHM A; 3NYJ A; 4ULW A; 2R7T A; 1MQV A; 1MMA A; 3T6B A; 1ZU4 A; 2ZXO A; 2HFI A; 2Q9C A; 1FMW A; 1D0Z A; 4YT5 A; 4ANJ A; 4YT8 A; 5B3S C; 5JLI A; 1RXQ A; 1I4Z A; 1V4A A; 4LER A; 1APC A; 2CNW A; 3Q6M A; 1LS4 A; 2OKU A; 3C18 A; 3GEH A; 2L6F A; 1J8M F; 2XLM A; 2YL0 A; 4NQF A; 4NTF A; 1XWJ A; 3RW0 A; 4BJ6 C; 2FGY A; 2LP4 A; 2NUT B; 4JUR I; 1O3U A; 4N6H A; 1OW7 A; 4U5H A; 4CDY A; 3FVY A; 4MVR A; 2R7R A; 4JCH A; 3SXK A; 3HNJ A; 4C3B A; 2FAP B; 1CGO A; 2HJM A; 3SZR A; 4YL0 A; 2FFH A; 1VLS A; 2A1D D; 2EIK C; 2R7Q A; 2XL4 A; 3DD7 A; 1WTY A; 2VAS A; 4JE9 A; 3W2V A; 1L7C A; 4ZLD A; 2EPL X; 4ER9 A; 1OW6 A; 4OIR F; 1KU2 A; 3FDQ A; 1ZYR F; 2LD6 A; 1Z3I X; 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