The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
37
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sequence length |
104
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structure length |
102
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Chain Sequence |
EDDLSVEAEIAHQIAESFSKKYKFPSRSILLYNFEQLKMNLDDIVKEAKNVPGVTRLARDGSKLPLRCVLGWVALANSKKFQLLVESNKLSKIMQDDLNRYT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of phosphoprotein/Protein P/Protein M1 residues 69-297
from Rabies virus reveals degradation to C-terminal domain only
rcsb |
| molecule tags |
Chaperone
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| source organism |
Rabies virus strain pasteur vaccin
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| molecule keywords |
Phosphoprotein
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| total genus |
37
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| structure length |
102
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| sequence length |
104
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-08-04 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3OA1 A; 1VYI A; 2WZL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1BR1 A; 1YYX A; 1M2O A; 2HUJ A; 2RD9 A; 3AQB A; 2J46 A; 2OOC A; 1OW7 A; 3DKA A; 3JT1 A; 4K1O A; 4O6Y A; 3UMH A; 2QUP A; 3W4Y A; 3L1M A; 4JVS A; 5E2Q A; 1Z7Q c; 1I5N A; 4XLN F; 3V7O A; 1Z23 A; 4ER9 A; 2OEX A; 4IAO A; 1TKN A; 4XPX A; 5COF A; 3TQO A; 1BDJ B; 3MLG A; 1OXK A; 4JTC B; 5KYX B; 2J9U A; 3CQZ A; 1QLE C; 2YQY A; 4IRU A; 3QVY A; 2WB7 A; 4PAC A; 5GPG B; 2CNW A; 2Y3G A; 4E7Z A; 1E86 A; 2XXA A; 3M1C B; 1FFT C; 3C8Z A; 1Q0D A; 4HE8 D; 2NPU A; 3DAF A; 3QZC A; 1LE2 A; 3B0V C; 3US6 A; 4CIP A; 2XRH A; 2I8B A; 4CS8 C; 4KBL A; 4MTF A; 3L34 A; 3PMR A; 1HE1 A; 1ORJ A; 1TWG A; 2GWW A; 2WL8 A; 3A11 A; 1Y6D A; 3C18 A; 3FHD A; 3RFY A; 3U3B A; 4OD4 A; 3QW0 A; 4L6R A; 3H65 A; 5B1B C; 3VYW A; 2HMQ A; 3OEO A; 1OW8 A; 4NCQ A; 4EKW A; 3DM9 B; 1UFB A; 3T4R A; 3RVY A; 1FFH A; 3GEE A; 4PFP A; 3DXJ F; 4E17 A; 1AEP A; 1O3U A; 1Q0K A; 4QDL A; 2HMZ A; 4JJF A; 4E0H A; 1MMG A; 1QQ3 A; 2HV7 A; 4XPY A; 4DBQ A; 3NMJ A; 2LP4 A; 1MND A; 4RD9 A; 1EA8 A; 3M4B A; 3POV A; 3MFN A; 3I4U A; 3B71 A; 1Q0F A; 2C03 A; 2A68 F; 2PNO A; 4NTB A; 2XLW A; 3TJ6 A; 3HNL A; 1N1C A; 1T6U A; 2V26 A; 4MVQ A; 1Z3I X; 3HNK A; 1JAF A; 3JCU Q; 4KC9 A; 4EIY A; 3JYH A; 1U0B B; 5A69 A; 3DD7 A; 4U5G A; 3B0P A; 5JVE A; 3ZIB A; 4MTO A; 3W2V A; 2R9R B; 3JSZ A; 4CSA C; 3O39 A; 2HS5 A; 4CS8 A; 5JP7 A; 3F47 A; 4PJJ A; 4XTK A; 1FNT c; 5COM A; 3TD7 A; 2NUT A; 3O6X A; 1Z6A A; 1JOG A; 1D0Z A; 3JZ0 A; 3LLI A; 1LI5 A; 1ZU5 A; 1ZHT A; 5AGF A; 3EHM A; 2V3C C; 3DE9 A; 3F46 A; 1DOV A; 2EIM C; 3K1I C; 3K33 A; 4G7Z F; 1I4Z A; 1M2V A; 3FDQ A; 3UNG C; 3O10 A; 2JPU A; 4OIO F; 4QI2 A; 2ZPA A; 3LES A; 2P1A A; 3KYJ A; 3VF0 A; 1M57 C; 3KH2 A; 3ABL C; 4HFF B; 1SF8 A; 2H7O A; 4NTA A; 3B0U X; 3EFO A; 1WN0 A; 2ICW G; 4X0R A; 4OIR F; 3Q6N A; 3GEI A; 2R7S A; 4BPM A; 4ULW A; 2NUP B; 3NRH A; 1ST6 A; 2OKU A; 3RVZ A; 5EGY A; 2A0U A; 1D0Y A; 5FCL A; 1J8Y F; 2G62 A; 5A6B A; 1CGO A; 4BJ1 A; 1VB5 A; 3S9O A; 4DRH B; 3UGO A; 1NU9 C; 4YT8 A; 4CSA A; 3LS0 A; 3U5S A; 3DE8 A; 3FOO A; 4MVM A; 1APC A; 1FAP B; 1OKK D; 3NYJ A; 4ONS A; 4RBN A; 3W8I A; 5BQH A; 3SXM A; 2FGY A; 2ZXR A; 4FX5 A; 3B9Q A; 4U9D A; 4BEM J; 4RDA A; 4CBE A; 1XZQ A; 3KPH A; 4M63 A; 3U9J A; 4BEJ A; 1RKE B; 1M56 C; 1FTS A; 2G3K A; 3A9C A; 3B29 A; 4KNW A; 4MTG A; 4XQ1 A; 3ASO C; 3H2V A; 2HJ3 A; 3K1I A; 2BL2 A; 2J0X A; 5D91 A; 3AQC A; 2BC5 A; 4OIP F; 5KYY A; 3J06 A; 1A7V A; 1Y4C A; 2EPN A; 2L9J A; 4JEB A; 4CS9 C; 1B68 A; 5A6J A; 2F22 A; 2HJM A; 3Q7G A; 1L3P A; 3IQT A; 2A6H F; 1TQG A; 2H8A A; 3U2M A; 2TMV P; 2NG1 A; 2P0N A; 4U5C E; 2X0C A; 5F28 E; 1ZHZ A; 5L0I A; 1H9G A; 1OCR C; 2P61 A; 4IJJ A; 5IY5 C; 4C7O B; 1TWH A; 2IM8 A; 3DJU B; 4H4K C; 3HNI A; 4C3D A; 5B3I A; 3UGP A; 1E2X A; 1LPE A; 3MYI A; 3AGU A; 4JJG A; 4BJ5 C; 4CJG A; 1GGQ A; 1BZ4 A; 3L8J A; 2WZL A; 5HV9 A; 3HTK C; 2PBE A; 1EQ1 A; 1H7I A; 1ZU4 A; 2YHS A; 3MYF A; 2CYD A; 3AG1 C; 1RXQ A; 3AG4 C; 4F4B A; 5D92 A; 2H7B A; 3GAN A; 3FXH A; 2YWA A; 3OWT A; 2YZS A; 2CCY A; 4XEK A; 5E3C A; 1C02 A; 1LM3 B; 1DOW A; 1OCO C; 1R5I D; 2JD3 A; 1LKX A; 2ZXO A; 2YKZ A; 3EZH A; 4N6H A; 2D4U A; 5DS4 A; 1BBH A; 5L3V A; 1ZYR F; 1QKR A; 2KQ9 A; 4CS9 A; 4R32 A; 4W8K A; 2XLD A; 4YWQ A; 2W4M A; 4QI0 A; 2EIL C; 1MMA A; 1FR0 A; 2Q00 A; 1NZE A; 4MS2 A; 2Y69 C; 5K0I A; 2LFF A; 1A7E A; 3N2Z B; 4LDR A; 1M6T A; 5CI9 A; 1G4W R; 3RW0 A; 2XLH A; 3TK0 A; 4MVR A; 1D1A A; 5JLI A; 2J9V A; 4G7O F; 1ZHY A; 5A6B D; 3GM1 A; 3NKD A; 4BJ5 A; 2ZXP A; 1TWA A; 2LFD A; 1VLS A; 2OJE D; 3EZI A; 1IZM A; 3ZQV A; 1ZZP A; 4YT5 A; 1T01 A; 2LIG A; 1OXB A; 2OEV A; 2VB6 A; 5E3A A; 5A6A A; 5DS5 A; 4GYT A; 4J7T A; 2ZD9 A; 1OKK A; 2E87 A; 3QMK A; 3L0I A; 1CPR A; 4HFK B; 5KYN A; 1LS1 A; 4AX2 A; 1OR2 A; 1MNE A; 1AVO B; 3ATP A; 3C7J A; 2KK1 A; 3EGX A; 1TR2 A; 1C03 A; 2Q9A A; 3U2L A; 5L0C A; 2YLI A; 5L3Q A; 2Q7R A; 1T6Q A; 2A1D D; 2J0W A; 2LSE A; 4U5D E; 2R05 A; 1D1B A; 3CEX A; 3IPM O; 2IXN A; 3HJC A; 4O7G A; 4NC3 A; 4OIN F; 3U3F A; 5L0J A; 5E33 A; 3LUT B; 4EHP A; 3VAY A; 5BUO A; 3VM6 A; 1JRA A; 2HV6 A; 2QE9 A; 2R7O A; 3EHN A; 2R7W A; 2NUT B; 2FFH A; 3PDM P; 1RCP A; 3GM3 A; 4JEA A; 1YA7 O; 3HNJ A; 5A6K A; 2KYH A; 2XL8 A; 2CW0 F; 5KYX A; 3ZVR A; 1D1C A; 3RF3 A; 4YT2 A; 3EPV A; 3K6B A; 1T9K A; 3M15 A; 4KNV A; 4PK4 A; 1K04 A; 3V5Z A; 3C8G A; 256B A; 3NMK A; 4O79 A; 4XPW A; 4E18 A; 2VH3 A; 3IQC A; 1M2V B; 3ASN C; 2W45 A; 5AC5 A; 3QW1 A; 1Z5Z A; 1QZX A; 1QVX A; 3EJN A; 3R2P A; 4MND A; 5F5H A; 2QLA A; 1SR2 A; 1JPJ A; 1E85 A; 4UDV A; 3DM5 A; 3I5P A; 4MW8 A; 5CIV A; 1JMW A; 3EFO B; 2EPK X; 3LS1 A; 4LDQ A; 2HFI A; 3RQG A; 1SYQ A; 4DVZ A; 3JYY A; 4N06 A; 3BEH A; 3FAP B; 1Q0G A; 2Y39 A; 3LEO A; 3S27 A; 5JSL A; 3FOP A; 3IQ6 A; 3NMI A; 3O55 A; 4JKV A; 5CI8 A; 1XZP A; 1YJG A; 4PR9 A; 1I4Y A; 2EPO A; 2C04 A; 1K40 A; 3C62 A; 1V4A A; 2NSG A; 5KYU A; 5L0H A; 4AL1 A; 1U6H A; 1CPQ A; 2YVK A; 3IQ5 A; 4I3M A; 3ZDL A; 2M64 A; 2M4E A; 1E83 A; 3FVY A; 1ZW2 A; 1LIH A; 3MX3 A; 1RJ9 A; 2B0J A; 1PV3 A; 1TFO B; 3AJM A; 3CAX A; 3S90 A; 3S29 A; 1KNY A; 3LNR A; 4IAR A; 2IXO A; 3KL4 A; 4DVY P; 2OU6 A; 3X2Q C; 4LLE A; 4ULV A; 4YK5 A; 4ANJ A; 5JS5 A; 3EQL F; 2B0H A; 3QTH A; 2ETS A; 4XEV A; 3LAY A; 1T5O A; 3T6J A; 3U9M A; 4EWC A; 2VAS A; 2IYL D; 4N6C A; 4BJT A; 4CJO A; 2HSQ A; 1V55 C; 3Q7L A; 4IB4 A; 4JUR I; 4WGY A; 4Z9J A; 3UMI A; 4EBB A; 5DS6 A; 2R7T A; 2XL6 A; 1OCC C; 4MVU A; 2WVN A; 2RSE B; 4YJW A; 2YLD A; 4XWJ A; 3WG7 C; 4CS7 A; 5HSW A; 2DGJ A; 3RIP A; 2AP3 A; 2VC9 A; 2Y3B A; 3KYI A; 4LAC B; 4CDY A; 3W8H A; 1PD0 A; 2R7R A; 2KSF A; 4JCH A; 3GOR A; 2YRF A; 2YEV A; 5B3S C; 2LQG A; 3DWW A; 2NSF A; 4PJN A; 1VTM P; 1V74 B; 3AGT A; 3PCV A; 2LCH A; 2GA0 A; 3SZR A; 1NG1 A; 4AE4 A; 2AWC A; 5KYW B; 4AL0 A; 1K05 A; 1R4T A; 2Q4F A; 3C8G D; 5T1D B; 4DBR A; 4DRI B; 1TWC A; 2R03 A; 2LD6 A; 4J30 B; 3GM2 A; 4GQH A; 4CX9 A; 4C3E A; 3G4Z A; 3ECS A; 1FMV A; 4D4X A; 2R02 A; 1NSG B; 4LLC A; 4NTF A; 4WAB A; 1AUE A; 1BR4 A; 1WWP A; 2EIJ C; 3EGD A; 3AOU A; 3E70 C; 4J7Y A; 5T3T A; 3UMK A; 5DVW A; 2KC3 A; 3T6G B; 1YYJ A; 3UR3 C; 3CSK A; 3WHN A; 1LE4 A; 4PFO A; 4YL0 A; 2IXP A; 2A6E F; 2R7U A; 1G4U S; 2W9Y A; 3M79 A; 4P9F A; 3L8I A; 1YAR O; 3FAJ A; 2Y3D A; 1YDI A; 3M4C A; 1YVI A; 4FWV A; 1D0X A; 5L0D A; 3E9V A; 1JPN A; 2EIK C; 4G78 A; 2GFH A; 4A4A A; 1EI7 A; 2XXA B; 2PP4 A; 3OA1 A; 2DYR C; 4LDK A; 4IWB A; 2MYS A; 2P7V A; 3RH3 A; 1OW6 A; 1A41 A; 1QSP A; 2L6F A; 4OD5 A; 2P6V A; 3U0C A; 2KW3 C; 1NBB A; 1PCX A; 2YL7 A; 4P9T A; 3WOD F; 2PF4 E; 5DQT A; 2OG2 A; 3GEH A; 3QVZ A; 4E0I A; 1Q0M A; 4ZLC A; 1O5H A; 1O87 A; 3EGX B; 4N4W A; 1YZC A; 4Z9H A; 3NYM A; 3N24 A; 2EPM X; 1LS4 A; 3TJ5 A; 4YL3 A; 5L0G A; 2CGE A; 2XL4 A; 3ZWI A; 2XS8 A; 4MVZ A; 1NLX A; 2J9W A; 2QY9 A; 2OJQ A; 2IXM A; 1HW1 A; 3RQF A; 4AK9 A; 3G4X A; 2Y3H A; 2ASR A; 3ITF A; 1IW7 F; 4NQF A; 3W2W A; 3RYL A; 2VCB A; 3T6B A; 4JCZ A; 1CGN A; 1MMN A; 2HKV A; 2LK4 A; 1RKC A; 3KKB A; 3EG9 A; 2J8W A; 4BG0 A; 2VCA A; 2XLE A; 3SYN A; 4CIH A; 2DI3 A; 3IEE A; 1WAS A; 1MQV A; 1VLT A; 3WAQ A; 1VMA A; 3C8G B; 4JTD B; 3TOL A; 2YL3 A; 1Z63 A; 4I1M A; 2YL0 A; 2L81 A; 1ORS C; 3K66 A; 1CGM E; 4MW3 A; 1VYK A; 5JUA A; 1W2W A; 3CZ6 A; 3LJB A; 4MQ9 F; 5BQG A; 1NU7 D; 3SXY A; 2PFD A; 2MHR A; 4I1O B; 1MMD A; 2HZ8 A; 3LLK A; 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5AC4 A; 3BRJ A; 2FAP B; 3X1O A; 1H6G A; 4JIO A; 2G3V A; 1S05 A; 5FZT A; 2WZF A; 1SMY F; 3ABM C; 3JRT A; 4AE4 B; 1ZVZ A; 4P6I C; 3ABK C; 1ORY A; 2H7V C; 3VRC A; 3ZTM A; 2CNW D; 4A2N B; 5DLJ A; 1V54 C; 1G5Z A; 1YZA A; 2XLM A; 3DZA A; 1HMO A; 4G7H F; 1VOM A; 5F5F A; 2JX0 A; 1ZHX A; 2W4B A; 2ZXW C; 4K0D A; 4DJ9 A; 3N0T A; 1OR3 A; 1HW2 A; 3K7D A; 1LVK A; 5EHH A; 3NKE A; 3EGD B; 3NYL A; 3TOM A; 1J8M F; 1NFN A; 1JR8 A; 2NUP A; 3U8P A; 1H9T A; 4U5E E; 3LEV A; 3S84 A; 2AU5 A; 2IBF A; 2J9B A; 4FES A; 1A7D A; 1ZHW A; 1C17 M; 4I44 A; 3RQE A; 2UUI A; 4YL1 A; 1PD1 A; 4OIQ F; 1S7Z A; 1T6I A; 4PJL A; 4EBK A; 2R25 A; 3SNH A; 3AG2 C; 5BQI A; 3ZTZ A; 2QTV A; 1F1M A; 1QPU A; 3MBG A; 1RKE A; 4YT4 A; 2IOQ A; 1YLM A; 2L6H A; 1TFK B; 1E84 A; 2GDC A; 5EK0 A; 2YLG A; 1U89 A; 3NDB B; 2DB4 A; 5COG A; 1HMD A; 2UUH A; 2OCC C; 2KJG A; 2R7Q A; 1L7C A; 2AVK A; 1NFO A; 3S28 A; 3KMI A; 2PX0 A; 4G0H A; 4CDA A; 2DYS C; 3G50 A; 2Q9B A; 1RMV A; 2XLO A; 4MVO A; 4EUK B; 3EH2 A; 4JRZ A; 2YL1 A; 4IAQ A; 4CDV A; 4ZLD A; 2J7P A; 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