The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
67
|
sequence length |
147
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structure length |
137
|
Chain Sequence |
SNAMDHLHRKLRDHEAAMFQQGYLDDQFSQLQKLQDDTSPDFVIEVMLNNMSRALEQVPVNFKQIDAHAHQQKGSSASVGAARVKNVCGTFRNFCEAQNLEGCVRCLQQLQQEYSLLKNNLKYLFKLQQEIKTAGRS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Subatomic Resolution Crystal Structure of Histidine-containing Phosphotransfer Protein MtHPt2 from Medicago truncatula
rcsb |
| molecule keywords |
Histidine phosphotransfer protein
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Medicago truncatula
|
| total genus |
67
|
| structure length |
137
|
| sequence length |
147
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.3.-: |
| pdb deposition date | 2012-07-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01627 | Hpt | Hpt domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | HPT domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LD6 A; 2R25 A; 3MYF A; 1I5N A; 1OXK A; 1C02 A; 4EUK B; 1BDJ B; 1QSP A; 3KYI A; 2OOC A; 3U3B A; 1A0B A; 2LCH A; 1WN0 A; 1C03 A; 1FR0 A; 2Q4F A; 2LP4 A; 4PAC A; 1Y6D A; 3KYJ A; 3IQT A; 3US6 A; 1YVI A; 1OXB A; 1SR2 A; 4G78 A; 1TQG A; 2A0B A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4IJJ A; 5AC4 A; 2EPO A; 3SYN A; 3TJ5 A; 1RJ9 B; 3K1I A; 1OW6 A; 2DB4 A; 3VAY A; 2YL3 A; 5BQH A; 5KYW A; 4JZA A; 1EI7 A; 2LFF A; 5A6B A; 5TJ5 E; 1ORY A; 2R7T A; 2ZXP A; 3QMK A; 1LI7 A; 2X0C A; 2AWC A; 3AG1 C; 2VB6 A; 2J9W A; 1BBH A; 3EFO B; 1TWH A; 2XS1 A; 3J06 A; 4JRZ A; 2GAQ A; 4IWB A; 2Y39 A; 3DAG A; 3C8G D; 3EG9 B; 3KKB A; 3O6X A; 4ZLD A; 2PF4 E; 1G4U S; 2KJG A; 4EIY A; 1F1M A; 4XEV A; 2Q9B A; 3U5S A; 3M79 A; 5DQZ A; 4E7S A; 3RH3 A; 1KNY A; 3FMS A; 1FMW A; 2C04 A; 5L0G A; 2A6H F; 1BR2 A; 3HKK A; 2L6G A; 1OW8 A; 3VYW A; 2ZD9 A; 4JJG A; 2VCA A; 4MQ9 F; 4JIO A; 4G0H A; 3H65 A; 4BJ5 C; 2IXP A; 1ST6 A; 2PX3 A; 2V3C C; 2G62 A; 2J7P D; 1E84 A; 3DM5 A; 5KYY A; 3E9V A; 1Y4C A; 3AG2 C; 4Z9H A; 2LD6 A; 1UFB A; 1MMG A; 3GOR A; 3PHF 2; 4CIH A; 2Y3H A; 2XLW A; 3HLZ A; 2A69 F; 4Z9I A; 3HNJ A; 4C7O B; 3UMH A; 5A6J A; 1D1C A; 2HFI A; 3TOM A; 1Q0M A; 2P61 A; 1FTS A; 3AQB A; 1ZHY A; 3FAP B; 1HY5 A; 2J0X A; 1RJ9 A; 1EKY A; 1WWP A; 3L34 A; 4LER A; 1FNT c; 3GOD A; 4J7Y A; 3RVY A; 5L0F A; 2AU5 A; 4BEJ A; 3PCV A; 1O87 A; 4P9F A; 1PD1 A; 4YK5 A; 3EFO A; 1VOM A; 2UUI A; 3EHN A; 4JKV A; 5D92 A; 2QUP A; 4PJN A; 1OCC C; 3DXJ F; 4XEK A; 3EG9 A; 2MYS A; 2XLH A; 3OEO A; 1JMW A; 3C8Z A; 3TD7 A; 1E85 A; 2NSG A; 2QY9 A; 4W8K A; 2EIN C; 3ZC4 A; 3ZG1 A; 5JVE A; 3R2P A; 4GQH A; 1VLT A; 2WB7 A; 2EPL X; 1Z5Z A; 3IQC A; 3ZTZ A; 4MTG A; 3FAJ A; 3WOD F; 2Q7R A; 3I5Q A; 3QW1 A; 1JR8 A; 4BG0 A; 4MVO A; 4DRI B; 4DVY P; 1QSP A; 2KGO A; 2X51 A; 1TKN A; 1K40 A; 2F22 A; 3HNL A; 2KW3 C; 4MVR A; 1A0B A; 3V5X A; 2LCH A; 3NMJ A; 1WN0 A; 3L8J A; 4MW8 A; 3JT1 A; 4C7O A; 1ZW2 A; 2LFD A; 3IPM O; 4P6I C; 2J0W A; 1U0B B; 2LIG A; 1QPU A; 2FGY A; 3DJU B; 2VH3 A; 2J45 A; 2V26 A; 2Y3G A; 3RYL A; 3V5Z A; 3ZVR A; 1MMN A; 3JSZ A; 1SR2 A; 1A41 A; 2XL4 A; 3GM3 A; 2VCC A; 1OCO C; 2A0U A; 2NUT B; 4U9D A; 2ASR A; 3M4B A; 1CPQ A; 2JX0 A; 1OKK A; 1JPN A; 4NTB A; 3SP1 A; 2WZF A; 5KYN A; 1BR4 A; 3KH2 A; 1A7V A; 2DGJ A; 3QTH A; 4J32 B; 2DI3 A; 3NYL A; 3S90 A; 2EIK C; 1I5N A; 2KSF A; 4KNV A; 4UDV A; 1G5Z A; 3LEO A; 5KYX B; 1CGN A; 3AGT A; 3ZWI A; 3ZDL A; 4MW3 A; 2P0N A; 1L3P A; 1HW1 A; 3JCU Q; 3Q6M A; 4AL1 A; 2Q9A A; 1YZC A; 2D5R B; 1ZZP A; 3S9O A; 2H8A A; 3ZSU A; 1A7E A; 3QVZ A; 2C03 A; 1YJG A; 2AWY A; 2R03 A; 2NPU A; 2R7Q A; 2W9Y A; 4JUR I; 1GM5 A; 4PAC A; 1FFH A; 3CEX A; 4RDA A; 5HSW A; 3NYM A; 4O6M A; 1E86 A; 2OKU A; 1AVO B; 1WTY A; 4BJ1 A; 5COG A; 3WAQ A; 4XLP F; 1SF8 A; 5L0J A; 4HFK B; 1LVK A; 1MNE A; 2YQY A; 3EZI A; 3LES A; 2YL7 A; 1YAR O; 5BQI A; 1WOL A; 4O7G A; 5COF A; 1LIH A; 4AX2 A; 4U5D E; 2YWA A; 1BR1 A; 3Q7L A; 4ANJ A; 3PDM P; 5B1A C; 2NUT A; 2YRF A; 3OWT A; 1NFN A; 4CJO A; 1T9K A; 2J9V A; 3BEH A; 5AC5 A; 2CNW A; 1YLM A; 4K0D A; 1LI5 A; 1ZU4 A; 4IRU A; 1YYJ A; 3O10 A; 1JPJ A; 1MMD A; 1YAU O; 2YEV A; 4JCZ A; 1T6U A; 4YL3 A; 2NG1 A; 2WVO A; 5KYX A; 1TR2 A; 4AL0 A; 4YL1 A; 1Y6D A; 2HJM A; 2WZG A; 4I3M A; 1N1C A; 3IQT A; 4N6H A; 4YJW A; 4MVQ A; 3U9M A; 3QVY A; 4PR9 A; 4YWQ A; 2Z15 A; 3RW0 A; 3MYI A; 2KNH A; 4K7B A; 2QE9 A; 1G8X A; 2R7O A; 3ASO C; 4O6Y A; 4F4B A; 5K0I A; 3B0U X; 1NSG B; 1J8M F; 1YZA A; 1TFK B; 2A0B A; 2CCY A; 4Q4Z F; 3T6B A; 2JD3 A; 2UUH A; 3NMI A; 1Z63 A; 1SZI A; 2EPK X; 3EJN A; 1A7D A; 3DKA A; 2HS5 A; 4FES A; 2YVK A; 2L6H A; 4PFO A; 4LLC A; 1OXK A; 1KU2 A; 1U89 A; 4XWJ A; 2R7S A; 1H7I A; 2XLE A; 1OCR C; 4QI2 A; 2YL0 A; 5DS5 A; 4CSA C; 4MS2 A; 2VAS A; 1C03 A; 4KNW A; 3SNH A; 2B0J A; 3NYJ A; 4EBB A; 3UMK A; 4MTF A; 4RBN A; 1C17 M; 3UNG C; 3T4R A; 3W4Y A; 2G3V A; 3W8H A; 3R7C A; 3S84 A; 1LKX A; 4JTA B; 4YT4 A; 3VM6 A; 4HE8 D; 5CI8 A; 4MVS A; 4OD5 A; 1OR2 A; 5L0H A; 2YLI A; 2WZL A; 4IAQ A; 4U5B E; 5E33 A; 1M57 C; 1G4W R; 2R25 A; 3K1I C; 4CS7 A; 1JRA A; 1ZHT A; 3DE8 A; 2PFD A; 4XPX A; 4CDA A; 5HV9 A; 2HMQ A; 1Q0K A; 2PP4 A; 2YLG A; 3CSK A; 3L8I A; 1NU7 D; 1AEP A; 4DBQ A; 4G7Z F; 3U2M A; 2HSQ A; 5B3S C; 3TQO A; 4X0R A; 3H2U A; 3L1M A; 2IXM A; 1ZW3 A; 1OR3 A; 3FVY A; 1KTM A; 3MX3 A; 3DJN B; 1T01 A; 1NLX A; 1NU9 C; 2KQ9 A; 1QVX A; 1LPE A; 1VLS A; 3NDB B; 3FXH A; 4LDK A; 1HMO A; 1SYQ A; 3HTK C; 3RIP A; 3FDQ A; 3GEH A; 2XSE A; 2A6E F; 4N4W A; 1MND A; 2XRH A; 1TFO B; 3CAX A; 4QI0 A; 3US6 A; 4C3E A; 2OQM A; 4JC7 A; 5F5F A; 3RVZ A; 1IW7 F; 2H7V C; 5CI9 A; 2Y3B A; 5EK0 A; 2PBE A; 3B0V C; 4DJ9 A; 3GM2 A; 1ZHZ A; 2KYH A; 3C62 A; 3EZH A; 5E3A A; 2QNL A; 2Y69 C; 4HFF B; 1LE2 A; 4GEH A; 4EHP A; 1JAF A; 2BL2 A; 4U5F E; 2HUJ A; 3MLG A; 4Z9J A; 1APC A; 1V74 B; 3SXK A; 4KC9 A; 5FCL A; 4MVM A; 1LS1 A; 1T6Q A; 1YDI A; 3EQL F; 4ZLC A; 4JEA A; 3EH1 A; 4CBE A; 5KYU B; 1NG1 A; 1S05 A; 3JYY A; 4J30 B; 1NBB A; 3EGX B; 4U5C E; 3B9Q A; 1M6T A; 5FZT A; 2EPM X; 4JJF A; 1V55 C; 1RXQ A; 2P6V A; 3FOP A; 3LS1 A; 4H4K C; 5L0C A; 3I4U A; 2GDC A; 5A6B D; 3IQ6 A; 1WAS A; 4CDV A; 4CDY A; 3JTL O; 5IY5 C; 4G7H F; 1O3U A; 3JZ0 A; 4HEA J; 4QDL A; 4OIO F; 4G7O F; 4AE4 B; 3X1O A; 5A69 A; 3C8G B; 3HJC A; 2GA0 A; 5JT4 A; 3K33 A; 2RSE B; 4JW1 A; 3U8V A; 1H9T A; 3NG1 A; 4DRJ B; 5COM A; 2GFH A; 2M64 A; 3K7D A; 3X2Q C; 4E0H A; 4CIP A; 3F47 A; 1ZHX A; 3UGP A; 4WJ0 A; 3U2L A; 1H6G A; 3JRT A; 3WG7 C; 3UR3 C; 3HNK A; 1MQV A; 2HKV A; 3U0C A; 1LS4 A; 5EHH A; 4AK9 A; 1L7C A; 4DBR A; 4XPY A; 1Q0G A; 3T6J A; 4XTK A; 2LK4 A; 4U9E A; 3KYI A; 4KBL A; 4XEF A; 4XPW A; 1D0X A; 4PJJ A; 3M1C B; 4BPM A; 3LS0 A; 1R5I D; 4JCH A; 4JE9 A; 1RKC A; 4LDQ A; 4PJM A; 2HZ8 A; 5JS5 A; 3QW0 A; 2YKZ A; 4RD9 A; 4BJ6 C; 1H9G A; 1ORS C; 2FAP B; 1YYX A; 3A9C A; 3EGX A; 3HNI A; 3K1H A; 4IGG A; 1TWA A; 3RQG A; 1BZ4 A; 3IQ5 A; 4EKW A; 1GGQ A; 3DD7 A; 4I1O B; 3RFY A; 3EH2 A; 4AE4 A; 2OEX A; 5A6K A; 2IBF A; 2RD9 A; 3B71 A; 3C8G A; 1D1A A; 2LQG A; 2WL8 A; 4D4X A; 2MHR A; 4Q7C A; 4CX9 A; 3LJB A; 1VTM P; 3L0I A; 3F46 A; 2EPN A; 3DWW A; 3ASN C; 4BJT A; 4ULV A; 1MMA A; 2OJQ A; 4N6C A; 1Z23 A; 3S29 A; 3W8I A; 2IXO A; 4CS8 A; 5BUO A; 4GYT A; 3DM9 B; 5L3Q A; 1B68 A; 4EWC A; 4P9T A; 2P1A A; 3T6G B; 2L9J A; 3EGD B; 2IOQ A; 5T3W A; 2J7P A; 4D4N A; 4PK4 A; 3UGO A; 1CGM E; 2HSB A; 4CS9 A; 1WGW A; 2EIL C; 1VYI A; 3KMI A; 2W4M A; 1OXB A; 3CZ6 A; 3AG3 C; 4OIR F; 4DXW A; 3B29 A; 3SZR A; 1TQG A; 5CIV A; 2IM8 A; 3DE9 A; 3NKD A; 3S27 A; 4EBJ A; 1U6H A; 3C18 A; 4N06 A; 1IZM A; 1ORJ A; 2G3K A; 3G4X A; 1E2X A; 4PJL A; 3QZC A; 1QKR A; 2NSF A; 3M4C A; 4IB4 A; 2H7B A; 4LLE A; 5B3I A; 1WAT A; 4DVZ A; 3AG4 C; 2XS8 A; 2DYS C; 3C7J A; 3U3F A; 2KK1 A; 4ER9 A; 256B A; 2MWQ A; 3TK0 A; 4U5H A; 1OKK D; 2OU6 A; 1NFO A; 2R7W A; 4PFP A; 5F28 E; 4XLN F; 1TWG A; 2XM4 A; 4WGY A; 5DLJ A; 3MFN A; 2R7V A; 3U8P A; 2BC5 A; 3LNM B; 1QZX A; 1Z6A A; 1E83 A; 1OQC A; 3Q6N A; 2NUP B; 2XXA A; 1CGO A; 1I4Y A; 3N2Z B; 3LLI A; 2LP4 A; 2XLM A; 3OA1 A; 1DOW A; 2D4U A; 3GWL A; 2TMV P; 1RMV A; 1Q0F A; 3K66 A; 2JPU A; 2M4E A; 4OD4 A; 5GPG B; 3LAY A; 2J46 A; 4BJ5 A; 3ZIB A; 2J9B A; 3NRH A; 3AOU A; 3EGD A; 2OG2 A; 2YL1 A; 4YT8 A; 5BQG A; 1PCX A; 4NC3 A; 4ONS A; 1HW2 A; 1V54 C; 5DVW A; 4O79 A; 1J8Y F; 2KC3 A; 4E0I A; 1YA7 O; 2GWW A; 5EGY A; 5T3T A; 2IYL D; 3DMD A; 1HMD A; 1LM3 B; 1UG7 A; 2IXN A; 5JUA A; 3ZTM A; 3U3B A; 1VK5 A; 2XL8 A; 2LSE A; 5KYU A; 3A11 A; 4JVS A; 4WGZ A; 3V5Y A; 2A68 F; 1FFT C; 2R05 A; 5F5H A; 5L0I A; 2WVN A; 4EBK A; 3RQE A; 2O9X A; 5DS4 A; 1K04 A; 2L7A A; 4Q5S F; 2EIM C; 3E70 C; 1AUE A; 1GS9 A; 2CNW D; 2OJE D; 3GEI A; 5E2Q A; 4JEB A; 3KL4 A; 1PV3 A; 5B1B C; 4LAC B; 3ABM C; 2I15 A; 3ITF A; 2NUP A; 3IHU A; 4W8P A; 3LLK A; 3FOO A; 4BEM J; 3JSE O; 2A1D D; 1BDJ B; 3AGU A; 4YL0 A; 4A4A A; 1QQ3 A; 3RQF A; 1NZE A; 2XL6 A; 4E18 A; 2XLV A; 3I5P A; 1Q0D A; 3ABL C; 3TJ6 A; 2ETS A; 3MYF A; 1SMY F; 1ZHW A; 3JYH A; 5AGF A; 3Q7G A; 2B0H A; 2R7U A; 3DI5 A; 4NTA A; 1T6I A; 2CDQ A; 3JRM O; 4NY3 A; 1I4Z A; 3ECS A; 4MVU A; 4E7Z A; 3VF0 A; 4CJG A; 3C63 A; 2P7V A; 4O6N A; 1JOG A; 4U5E E; 4OIN F; 3W2W A; 2VC9 A; 1VB5 A; 3SXM A; 3K6B A; 1PD0 A; 2Q4F A; 4JTD B; 2QTV A; 3W2V A; 1FMV A; 3LEV A; 2BE5 F; 5DQT A; 3N0T A; 1TWC A; 3IEE A; 5L3V A; 3PMR A; 4U5G A; 4LDR A; 3RF3 A; 4E17 A; 3M15 A; 4MTO A; 5D91 A; 1K05 A; 4I1M A; 4L6R A; 4M63 A; 5JP7 A; 4FAP B; 3DAF A; 4OIP F; 3GM1 A; 2J8W A; 4OIQ F; 4WAB A; 5JSL A; 2VCB A; 4EUK B; 4H54 A; 2HMZ A; 1RCP A; 3O55 A; 1DOV A; 4NQF A; 3S28 A; 3WHN A; 2CYD A; 1YA9 A; 4IAO A; 4KI2 A; 5E3C A; 2AP3 A; 2HV7 A; 5L0D A; 3ABK C; 1EA8 A; 1W2W A; 2Q9C A; 2YLD A; 4IAR A; 4BJ6 A; 4R32 A; 2I8B A; 3NKE A; 3ATP A; 1FAP B; 1YVI A; 3EPV A; 4YN0 B; 2XLO A; 2H7O A; 2ZXO A; 3MBG A; 2L81 A; 1VYK A; 3TOL A; 1XWJ A; 3GAN A; 3S0X A; 1M2V B; 3POV A; 1HE1 A; 2AVK A; 4YT5 A; 1OW7 A; 3SXZ A; 3AJM A; 3T9O A; 2XXA B; 5JLI A; 1M56 C; 3EHM A; 3FHD A; 3LUT B; 1D1B A; 1RKE B; 4FWV A; 3U9J A; 2WVQ A; 2YZS A; 4B6I A; 1T5O A; 2E87 A; 1VMA A; 1XZP A; 1ZYR F; 2DYR C; 3CQZ A; 3O39 A; 3GWN A; 4I44 A; 2R02 A; 3G50 A; 2FFH A; 4C3D A; 3TUL A; 3SEO A; 2PX0 A; 5T1D B; 1Z7Q c; 2HJ3 A; 3GEE A; 2L6F A; 3KYJ A; 2ZPA A; 2OEV A; 1ZVZ A; 2R9R B; 3RKO F; 1HE9 A; 2QLA A; 2W4B A; 3LNR A; 3VRC A; 5KYW B; 1EQ1 A; 1R4T A; 4G78 A; 2J9U A; 1D0Y A; 4JTC B; 3ZQV A; 3B0P A; 4A2N B; 2CW0 F; 3N24 A; 1M2O A; 4XQ1 A; 3KPH A; 1GQA A; 3NMK A; 4DRH B; 4C3B A; 1O5H A; 2Y3D A; 3BRJ A; 4K1O A; 1QLE C; 2ZXR A; 4DOZ A; 3ZQY A; 2R7R A; 1V4A A; 2ZXW C; 5JRA A; 1C02 A; 1XZQ A; 1ZU5 A; 2Q3T A; 3DZA A; 1M2V A; 3SXY A; 3UMI A; 2OOC A; 1S7Z A; 4YT2 A; 1D0Z A; 1OCZ C; 2CGE A; 4NTF A; 3V7O A; 4CS8 C; 2XLD A; 2HV6 A; 3G4Z A; 3H2V A; 4MVZ A; 4CSA A; 4J7T A; 2ICW G; 1FR0 A; 4CS9 C; 2OCC C; 5DS6 A; 1RKE A; 5KYY B; 1CPR A; 4MND A; 2XM0 A; 4FX5 A; 1Z3I X; 2Q00 A; 4NCQ A; 2R7X A; 2W45 A; 2YHS A; 1LE4 A; 2PNO A; 3AQC A; 2EIJ C; 4ULW A; 5A6A A; #chains in the Genus database with same CATH homology 2LD6 A; 2R25 A; 3MYF A; 1I5N A; 1OXK A; 1C02 A; 4EUK B; 1BDJ B; 1QSP A; 3KYI A; 2OOC A; 3U3B A; 1A0B A; 2LCH A; 1WN0 A; 1C03 A; 1FR0 A; 2Q4F A; 2LP4 A; 4PAC A; 1Y6D A; 3KYJ A; 3IQT A; 3US6 A; 1YVI A; 1OXB A; 1SR2 A; 4G78 A; 1TQG A; 2A0B A;
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