The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
107
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structure length |
107
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Chain Sequence |
MTTEIKKLDPDTAIDIAYDIFLEMAGENLDPADILLFNLQFEERGGVEFVETADDWEEEIGVLIDPEEYAEVWVGLVNEQDEMDDVFAKFLISHREEDREFHVIWKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the highly acidic protein HI1450 from Haemophilus influenzae, a putative double-stranded DNA mimic.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Unknown function
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| source organism |
Haemophilus influenzae
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| molecule keywords |
Hypothetical protein HI1450
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| total genus |
16
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| structure length |
107
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| sequence length |
107
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-01-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF04269 | DUF440 | Protein of unknown function, DUF440 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, | dsDNA mimic, putative |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NNV A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1MWR A; 1RCK A; 3K5T A; 1FUW A; 1IV7 A; 4IPB A; 3MKI A; 2RNT A; 4KVH A; 4KT3 B; 2IA7 A; 1G02 A; 5G1K A; 1MGW A; 5IG3 A; 1JBR A; 3RGA A; 5IG0 A; 1HYF A; 3FLJ A; 2V1L A; 2W6J H; 1O7M B; 3JUN A; 2GU1 A; 1IVW A; 3LZA A; 3T0U A; 4WYK B; 3CC4 3; 2HMJ B; 1FGT A; 1KSI A; 1CQS A; 4AKY A; 1HKX A; 2L1S A; 3RDE A; 4GB5 A; 2F56 A; 2CX0 A; 1NDO B; 3URP A; 1LNH A; 2RSX A; 2CFL A; 1RLS A; 4FCZ A; 2W2C A; 4HM6 B; 3V92 A; 1PYL A; 1IQX A; 3KCH A; 5IEP A; 1K8A 4; 1QJG A; 3CC2 3; 3UB1 A; 3DMC A; 1V58 A; 2B1X B; 2K3D A; 4FR9 A; 4K1V A; 1ZO2 A; 2BMQ B; 2HML B; 3PCR A; 3M8C A; 3NBJ A; 4L7K A; 3KSP A; 1TFO A; 4KFD A; 4EBG A; 1CH0 A; 1NJI 4; 4JRF A; 1OHS A; 1BNJ A; 1X1Y A; 3AMO B; 3U97 A; 1Z1S A; 3AHW A; 3H3H A; 3JUQ A; 3QK9 A; 1A2K A; 4EXR A; 1W00 A; 4RNY A; 2Q07 A; 1FGR A; 3TDG A; 1BNF A; 1JRQ A; 1N9J A; 3FF2 A; 3GZX B; 4FMC A; 1VQ8 3; 3SYU A; 1LVN A; 1LOY A; 1G96 A; 2HMK B; 3VF1 A; 4EC6 A; 3CCE 3; 5EQL A; 1IV9 A; 1HZ1 A; 1K41 A; 1KD1 4; 1UCK A; 5IEN A; 1I3F A; 2KCD A; 3JUP A; 4XDV A; 3ROB A; 4CCV A; 4MMZ B; 5IG4 A; 3T8N A; 3NQY A; 2GEX A; 1VQP 3; 1A2P A; 2BT3 A; 3BB9 A; 2SAR A; 4J9A A; 4XM4 A; 1RGG A; 3CME 3; 3D3L A; 3FG1 A; 2CIU A; 2XH9 A; 4HM7 B; 1AVK A; 1JKG A; 3CNM A; 2D42 A; 4N6O B; 2FNQ A; 3EB8 A; 2GBX B; 4U13 A; 2HMO B; 1OGX A; 1JB4 A; 2PNC A; 1W02 A; 2W56 A; 1BRS A; 3JUO A; 3OV4 A; 3KFQ C; 1NU3 A; 3WA3 A; 3UJM A; 1RGC A; 3MG2 A; 4CDL A; 3G4S 3; 1WNH A; 1O7G B; 3G0K A; 1LQG C; 3WA2 X; 3HII A; 3EX9 A; 5A0O B; 2XR8 B; 3EHC A; 1X1U A; 1M90 4; 4MMY B; 5DRV A; 3Q2P A; 1I8V A; 1N5P A; 3FCS B; 1BGS A; 4HM0 B; 1N8R 4; 2SBL A; 3B4P A; 3N9H A; 1Q40 A; 2BIR A; 4HKV B; 1EEJ A; 1E3V A; 1YVB I; 2W0Q A; 3FH1 A; 3BU4 A; 2Z6B A; 5STD A; 3H51 A; 8CHO A; 2WGQ A; 1JV2 B; 2F4Y A; 8RNT A; 3PCS A; 1TRQ A; 1VQ4 3; 1RGE A; 4R4K A; 1SII A; 4N6U A; 1TTO A; 4WWU C; 3Q90 A; 3MWZ A; 2C10 A; 5AI1 A; 4BL3 A; 1IVU A; 2K0M A; 2D1W A; 2KRT A; 2LQV A; 3BNC A; 1STF I; 3ZFZ A; 5I97 A; 1Q81 4; 1BSD A; 3FZW A; 5D83 A; 3G16 A; 1RHL A; 4N6T A; 4WYK A; 2I9W A; 3CU3 A; 5IG5 A; 2W9P A; 5CF1 A; 3NUV A; 2QIY A; 5KP3 A; 2F99 A; 3CPW 2; 2JQ5 A; 2YFJ B; 3CPO A; 1IVV A; 2UX0 A; 1W5Z A; 1GD3 A; 1T2H A; 3SXX A; 5KP4 A; 3DY5 A; 3O8Y A; 4K61 A; 1KWI A; 3S27 A; 5IW9 A; 3OWU A; 2ML5 A; 4N6V 0; 1BSB A; 4GSP A; 4ORL A; 2Z7A A; 2QA4 3; 1BAN A; 3LTC A; 4J5G A; 2MC8 A; 1X1W A; 3KE7 A; 1YVS A; 2H0G A; 1JJ2 2; 1T2I A; 1BNS A; 3CCL 3; 1RKY A; 3AMO A; 2P38 A; 4ILF A; 1SAR A; 2BMR B; 3DGY A; 1KQS 2; 1N9E A; 2RCD A; 3BNB A; 1D6Y A; 2XSH B; 4WFO A; 5RNT A; 3DGN A; 3BNE A; 1WMN A; 2H0H A; 1TFK A; 2KF6 A; 2ZL8 A; 1W2B 2; 4BL2 A; 1VQQ A; 2JDI H; 5BVB A; 1PY3 A; 1RN7 A; 3QRD A; 2Z77 A; 1JN5 B; 1I2F A; 1YJ9 3; 5ELJ A; 3DM8 A; 2OOV A; 1GMQ A; 2LYX A; 1BRK A; 1LOW A; 1Q82 4; 1BRJ A; 1S5A A; 2STD A; 1VQM 3; 2ZA4 A; 1O7H B; 4K1U A; 5LC6 A; 2FGT A; 1TU5 A; 1QAK A; 4KZ1 A; 2AAD A; 2IYJ A; 1IVX A; 3WOE B; 1STD A; 3K0Z A; 4NHF A; 1LXE A; 2XEP A; 3EN8 A; 2M7O A; 2CW9 A; 4X2O A; 2J8X B; 1OH0 A; 3JVC A; 3D4A A; 1C7H A; 2CG1 A; 4RNZ A; 1B27 A; 1MWS A; 2WOH A; 2KF5 A; 2GSP A; 5IER A; 1YIJ 3; 3B4O A; 1T5Y A; 5GSP A; 4N6N B; 1OHO A; 1GOY A; 3A76 A; 3EN1 B; 3OWY A; 1RGF A; 1W4N A; 1YJW 3; 1EKM A; 1ASK A; 3EF8 A; 3FG4 A; 3T8U A; 1UGH I; 1C54 A; 1RDS A; 2Y73 A; 4NRE A; 4R80 A; 3SLU A; 3EE1 A; 1DVC A; 1NB3 I; 3EBY A; 3FGY A; 1MNL A; 3B8L A; 1ZGX A; 3NV0 B; 1BU4 A; 4J8T A; 3NM7 A; 4XBY A; 5CXO A; 1GMR A; 1R4C A; 3LH4 A; 3X3X A; 1IU7 A; 2C11 A; 3CCR 3; 1VQO 3; 1GSP A; 3CCS 3; 1LNI A; 2ZDJ A; 2OTL 3; 2IMJ A; 1PU4 A; 1SQW A; 3DGL A; 1SJW A; 5DRE A; 1CEW I; 3K7C A; 1K73 4; 3ALA A; 1UI8 A; 5BXQ A; 1OUN A; 1ZX2 A; 1GYB A; 1N5H A; 3SX1 A; 1W7C A; 1OAC A; 4BTX A; 3MSO A; 4QWT A; 2H0I A; 2XFS A; 4LYL B; 3VSY A; 5AIF A; 1B2Z A; 2HOH A; 3FSD A; 1GOU A; 1RN4 A; 2K54 A; 6RNT A; 3NQZ A; 3B7C A; 2CWT A; 4FMA A; 1RGL A; 1B2M A; 4I4K A; 1BUQ A; 1BSC A; 3WR2 A; 1MOL A; 2BNG A; 1JBS A; 1Q7Y 4; 3D5G A; 3KKG A; 2P09 A; 3PGB A; 2A15 A; 1PFP A; 1NB5 I; 1JBT A; 2XF3 A; 3DGO A; 4L8P A; 1I70 A; 1W6C A; 4EV5 A; 5HOH A; 1RNT A; 5JPP A; 1YJN 3; 4HM5 B; 4LEH A; 1SIH A; 1QVG 2; 3G71 3; 1S72 3; 1US1 A; 3ZG5 A; 4TX4 A; 2KAA A; 3Q1C A; 1LOX A; 3D5I A; 1I2G A; 1EA2 A; 1Q7H A; 5ELU A; 4HM3 B; 3GRD A; 1GOV A; 3SOA A; 4O8S A; 2HMM B; 1UW1 A; 3S5C A; 3CCV 3; 1TIJ A; 1FGQ A; 4EV2 A; 4HOH A; 3F14 A; 1FYS A; 4STD A; 4BTY A; 4CPK A; 1YHQ 3; 3RNT A; 1V57 A; 1JN5 A; 1U5O A; 2CFD A; 3EC9 A; 1SPU A; 3X40 A; 3X41 A; 1Q86 4; 3ECF A; 2CFG A; 1B3S A; 1LOV A; 1BRN L; 3LXU X; 3N8B A; 3GAX A; 1JB5 A; 3HX8 A; 1QVF 2; 2RFR A; 2GXF A; 4MJD A; 2O9U X; 1NNV A; 4X2H A; 1YNV X; 4LSO A; 4FCM A; 1IDP A; 1RSN A; 4ZM8 A; 3MYT A; 1LQM B; 3HI7 A; 1AVL A; 2RBI A; 2KF4 A; 1UGI A; 3X42 A; 1FA3 A; 1U8C B; 3GZB A; 1UUW B; 4I5Q A; 5AIG A; 2R4I A; 3LML A; 1FUS A; 4RBN A; 3STD A; 1M1K 4; 3HZP A; 3NXJ A; 2RGQ A; 5AEU B; 1BNI A; 1W6Y A; 1TJD A; 1VQK 3; 3MG1 A; 3IJE B; 1TP6 A; 3GWR A; 1DET A; 1DMQ A; 4HVN A; 3UNL A; 1K9M 4; 2CKF B; 2L4V A; 1RMS A; 4HZ9 B; 5JPU A; 1OHP A; 3F8H A; 1B21 A; 4N6L A; 4BU4 A; 4WP5 A; 2W04 A; 3NV0 A; 5BU4 A; 4XBX A; 1RNB A; 1IT8 A; 2F98 A; 4AKZ A; 2WO0 A; 3EBT A; 4HM2 B; 3DXO A; 1HU9 A; 3CMA 3; 3F40 A; 1UCJ A; 3PYJ A; 3WOF B; 1BAO A; 4N3V A; 4MEI A; 2GEY A; 1UCL A; 1YI2 3; 3S67 A; 1QAF A; 4LZI A; 4HM4 B; 3DGM A; 5AII A; 4HM8 B; 1ISK A; 4FMD A; 3LTB A; 3E99 A; 5JBS A; 3D9R A; 2O3O A; 3UL6 A; 1OF5 B; 1V74 A; 3FF0 A; 2CFW A; 4NPB A; 1IK3 A; 2CK3 H; 1M9G A; 3DUK A; 3HIG A; 1IQY A; 4JF8 A; 2UGI A; 3NBR A; 3Q3F A; 5M18 A; 1BRI A; 1RRL A; 3L0R A; 3WOD G; 3OX9 A; 5AYR B; 3LTA A; 1ZS7 A; 5EVH A; 2XFT A; 3S28 A; 2Y74 A; 1ULJ B; 3WDG B; 4HAA A; 3G8Z A; 3KZT A; 1BNE A; 5AYS C; 3SOY A; 3JUM A; 3WMD A; 4EYC A; 1DVD A; 1G0T A; 3OWS A; 5FW5 A; 4HJL B; 3OW2 2; 3EJV A; 2P05 A; 5BIR A; 1E3R A; 1Y4K A; 3NM2 A; 1B2X A; 1MWU A; 1W01 A; 4O3V A; 4LGQ A; 1LRA A; 1OGZ A; 1UDI I; 1OPY A; 3AHS A; 2B24 B; 3VGN A; 2R41 A; 2WOF A; 2IY2 A; 2CFK A; 4L8O A; 1UCI A; 3MPH A; 1YIT 3; 4K90 B; 1FGO A; 1BRG A; 4OUQ A; 1JB2 A; 5IEO A; 3CXC 2; 1F8N A; 1Q9E A; 1EG9 B; 1IYY A; 3NHX A; 1FUT A; 5LC7 A; 1D6Z A; 2YFI B; 3U1W A; 1RRH A; 1RTU A; 1N8Q A; 4XDW A; 3CCQ 3; 1A2V A; 4HYZ A; 1I2E A; 2OTJ 3; 5HGR A; 3AGO A; 3F8X A; 7RNT A; 4DKI A; 3CNX A; 3ER7 A; 3CD6 3; 1K28 A; 2P0X A; 4FCJ A; 3X3Z A; 3I55 3; 3NX0 A; 1DE3 A; 1GY6 A; 3IMA B; 3LT8 A; 1EUI C; 3N54 B; 4GHO A; 4H61 A; 1BNG A; 1RGH A; 5AIH A; 3DH2 A; 4EW5 A; 3I56 3; 3HK4 A; 4BTW A; 5KP1 A; 1AY7 A; 1DYU A; 3GZR A; 2CWU A; 2F5W A; 1J2B A; 1VQ7 3; 3EQQ B; 4IT7 A; 1MGR A; 5IF6 A; 4KFF A; 3S29 A; 3BIR A; 2XGN A; 1BUJ A; 1L5G B; 4MMX B; 3MHE A; 4BIR A; 1DMN A; 1GD4 A; 1UUG B; 1I3I A; 2BO9 B; 3KSE D; 1ROA A; 5CF2 A; 3CCM 3; 2GBW B; 3FKA A; 2Z76 A; 3CCU 3; 3A5E A; 4CJN A; 1WMP A; 3J7Y d; 4IIA A; 1Q42 A; 2CHC A; 2P0M A; 1FZU A; 1VZZ A; 2OWP A; 2OQE C; 1OF5 A; 3K9M C; 3ZG0 A; 1VQN 3; 1JNQ A; 2CX1 A; 2ML6 A; 1DMM A; 3HOH A; 3K63 A; 1VQ5 3; 1BIR A; 3DZL A; 3LT9 A; 3PXM A; 2UUG C; 2CC3 A; 3F7S A; 4GL6 A; 1GY5 A; 1O7W B; 4RZM A; 1QMA A; 4LMI A; 4R9L A; 5AEW B; 1QAL A; 3UL5 A; 3CC7 3; 1TUH A; 2CG0 A; 5CLK A; 1A67 A; 3LYG A; 1RCL A; 2E2V A; 1RGA A; 3G6E 3; 2IUJ A; 1BOX A; 3PZW A; 1ULI B; 3SED A; 2OQE A; 2E2U A; 2MF7 A; 5M19 A; 1E97 A; 1BVI A; 2XSO B; 1AQZ A; 1EQK A; 1A90 A; 4Q53 A; 2KXG A; 7STD A; 2W9Q A; 5D82 A; 1TRP A; 4O02 B; 5FGO A; 1CYU A; 1B2U A; 1JZD A; 1B20 A; 1IT7 A; 4R9K A; 5G2G A; 2E2T A; 3D79 A; 3LOY A; 3WHO A; 1I0X A; 2BMO B; 4OVM A; 6STD A; 2GU3 A; 1M1X B; 1W2Z A; 3F7X A; 9RNT A; 1YGW A; 1YGE A; 2FXT A; 2XRX B; 3GSP A; 4WHA A; 5TGN A; 5M1A A; 1AR0 A; 3LTD A; 1AV4 A; 2IUK A; 1RGK A; 4HZB B; 1VQL 3; 1W6G A; 2F5M A; 2AAE A; 1BSA A; 4OK0 A; 2QEX 3; 1GS3 A; 2QGU A; 1CYV A; 1I0V A; 5EEO A; 3BLZ A; 3I0Y A; 1BSE A; 4PEJ A; 2KF3 A; 2ZHX B; 1RN1 A; 3PS8 A; 1O7P B; 4R1K A; 5D81 A; 4G1M B; 2BU4 A; 2HMN B; 4O2H A; 1GMP A; 1R4Y A; 3KII A; 3SVA A; 1WQL B; 4N6M A; 1B2S A; 3AGN A; 1UUV B; 4J5K A; 1UI7 A; 2CH9 A; 2YX9 A; 5G1L A; 2BHM A; 3RGR A; 1FW7 A; 1GY7 A; 1D6U A; 1JKG B; 4HM1 B; 1FGM A; 1WTH A; 1X1X A; 4XBT A; 1JZO A; 2INX A; 2YFL B; 3FG3 A; 3MG3 A; 1VQ9 3; 1NWW A; 2PZV A; 2W56 B; 4KFE A; 2C4B A; 3F9S A; 2WGO A; 3X3Y A; 1KC8 4; 3KN4 A; 2XGL A; 1RJO A; 4XB5 A; 1O7N B; 3CCJ 3; 2OOV C; 1BNR A; 4AEQ A; 3BND A; 7GSP A; 3IPT A; 2CWV A; 1ROV A; 4RNT A; 3V99 A; 1OCV A; 4FMB A; 1BRH A; 1VQ6 3; 3GZY B; 1IQ8 A; 6GSP A; 4H3U A; 3OXA A; 3V98 A; 2F86 B; 2W03 A; 1WMO A; 1MWT A; 2OCT A; 1T3B A; 4HBR A; 1Q40 B; 1NO3 A; 5CK6 A; 3NBB A; #chains in the Genus database with same CATH homology 1NNV A;
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait... #similar chains, but unknotted ...loading similar chains, please wait... #similar chains in the pdb database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait...
