4ILFA

Crystal structure of dsbc r125a from salmonella enterica serovar typhimurium
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
AMDPEFMDAAIRQSLAKLGVQSTEIQASPVAGMKTVLTHSGVLYVTDDGKHIIQGPMYDVSGAHPVNVTNKLLMSQLNALEKEMIVYKAPDEKHVITVFTDITCGYCHKLHEEMKDYNALGITVRYLAFPAQGLESQAEQDMKSIWCAKDKNKAFDDAMAGKGVKPASCDVNIADHYALGVQLGVSGTPAIVLSNGYVVPGYQGPKEMKAFLDEHQKQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Crystal structure of the periplasmic disulfide-bond isomerase DsbC from Salmonella enterica serovar Typhimurium and the mechanistic implications.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbC
total genus 69
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 4ilfA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ilfA02
3ZIVA 2HRFA 2KLXA 2PN8A 2OE0A 3HVVA 3M8NA 2H6XA 4TR3A 2H76A 3UAPA 2GS3A 4POKA 2JU5A 1SD8A 3FK8A 5D8IA 1BYEA 17GSA 2DIYA 4ACSA 5JCUA 3VWWA 4KUNA 3LJRA 4TR1B 3H1NA 3F4RA 4O7HA 2KOKA 2FUG2 3FZAA 5CYYA 3S9FA 5A4WA 4RQXA 3UOMA 2IMKA 6GSYA 1NHYA 1THOA 2JZSA 4GQCA 4HJ2A 1GSQA 3TJJA 3GN3A 2VCTA 2CVKA 2VLUA 1ZL9A 3J7Yk 1OE8A 2G2QA 3L9VA 4KDYA 2I81A 4BWSA 1X9SB 5F05A 2EIOA 2YWMA 5EVOA 2HI7A 4XRDA 2HRNA 2DC5A 1T7PB 4MPFA 5FWGA 2L4QA 3VWUA 1GNEA 2C3TA 4DSRA 1PX6A 5ECMB 3QCPA 3BCKA 3FKFA 5ELAA 3EC3A 4MJEA 5D96A 4AJ8A 3MSZA 1I9DA 2GVPA 1K3LA 3IPZA 4FH8A 1C72A 3GA4A 14GSA 2O89A 4ZILA 4LLRA 6GSSA 4DSSB 4MZCA 5HFKA 3GFKA 3KGKA 2FGXA 2DJ1A 3F8UA 1DE2A 1OC9B 4TXOB 1UA5A 1B9YC 2XPDA 4MJCA 4TVEA 1SL1B 4FIWA 3FZ9A 4AGSA 3RPPA 3CSIA 5IOWA 4MF5A 1PQNA 3CRUA 3FRCA 3RHBA 3D6IA 1SKRB 2AHEA 1YJ6A 3ZITA 2X64A 1FOVA 3IV4A 3P2AA 2OADA 2JACA 2VCWA 1R4WA 3KCMA 2YN1A 1UVZA 3FYGA 1X9MB 1MTCA 3VK9A 3RPNA 2G0FA 1K0NA 2B6MA 6GSUA 3BD2A 5IMVA 1RW1A 3GNJA 4TR1A 1VGLA 1J0FA 5GAND 1AUCA 4ZBAA 1Z3EA 1ZMAA 2C4JA 1WE0A 3GL3A 1V40A 4V1Ap 2E7PA 3KTLA 5J4UA 2IYJA 2LJKA 3QMXA 3TB2A 1T1VA 4EKZA 1JZDA 2XBQA 1TDIA 3R2QA 2WULA 1M99A 1URMA 1XXUA 2C0DA 4MF7A 2JSYA 1OYJA 2B7JA 2P5RA 1DBYA 2YV9A 2QKEA 2HSHA 3KIJA 2RUEA 4EO3A 2PPTA 5KEJA 1TK5B 3P90A 3GYKA 5DDLA 1A8LA 3N9JA 2GLRA 2WRTA 2K9FA 1MD4A 3F6FA 2VD1A 4ZXGA 1B4QA 1YDKA 4EDZA 4G2EA 2DBCA 2C8UA 3GTUB 3CXGA 3HHVA 2YWNA 3ZVJD 2P31A 3WGDA 4MJAA 4DSQA 1ZCPA 2M80A 1HNBA 4KA0A 3GURA 3HVSA 3LSZA 2N5BA 3TGZA 3G7YA 1GUMA 4POMA 2FWGA 3C7MA 1XW5A 1K0CA 3LXZA 1VF3A 3TRPA 2R37A 2LKUA 1FB0A 4DSSA 1JZWA 3F0IA 3TKSA 4NPBA 4F2IA 3UVHA 5LCZA 1OC9A 3HJMA 1GSYA 3QFBC 1O8XA 3KD0A 5IOXA 2V32A 4OO5A 2LRNA 4RQRA 1PL2A 4JRRA 2H0HA 1AQVA 2X8CA 1PRXA 4I2UA 1SL2B 1GSSA 1XWBA 4HU9A 4WBJA 1GTAA 4YAVA 4TOPA 1AAZA 3HZ4A 5F07A 2K8VA 4K7NA 4I2TA 3W8JA 3KEBA 3Q74A 1X9WB 3HJPA 3TJKA 1AQXA 4KSOA 3DRNA 4XS6A 5G30A 1XWAA 2FHEA 4PQIA 3DVWA 1YEPA 3APOA 3F4TA 2F9SA 5IO2A 1XOBA 3H79A 3TRQA 1E2YA 5D73A 1FVJA 1XCCA 4O5RA 1SK0A 2BJXA 2VL9A 3GRXA 1FVKA 4EE0A 3P8WA 2C1YA 3IAS2 4XTSA 2REMA 5D9VA 3IRAA 1A2MA 5HR3A 2ON7A 2TRCP 4KDUA 3EU4A 4K2DA 3ZIJA 1TK8B 1O7UA 3KTBA 1YEXA 3GV1A 1SENA 4PXOA 4BVXA 3GTUA 3TKPA 5DBQA 2NBSA 20GSA 1K0BA 1V57A 1R26A 1N8JA 5KN1A 5DCHA 3QAWA 3KZQA 1R5AA 4O92A 3MWHA 3HXSA 1HYUA 2RIIA 1GWCA 4GXZA 4GTUA 3IR4A 2OKAA 2IJYA 3EWLA 1ABAA 1WOUA 16GSA 3EMPA 4MP4A 4XRAA 4D73B 1BEDA 3J7Yb 3M9KA 2YWOA 4G10A 1FB6A 3QD9A 1JLWA 1GTUA 3L4NA 4X43A 2AJQB 4L5OA 5B7CA 3KP8A 5HR2A 2L6CA 2B3SA 4PUAA 1GUHA 1KBNA 2GQKA 4TKYA 4IS0A 1A24A 2MMNA 3TOUA 1NHOA 2MMOA 4KH7A 2ZUPA 2JL4A 2PMTA 2I9HA 3D5JA 1XW9A 1V2AA 3TRXA 1YF0A 1ZZYA 3KP9A 5G1LA 3A3TA 1GUKA 3ISOA 2FD3A 2BMXA 4WR5A 3VWXA 2H73A 1ILOA 4JEDA 3WT2A 2YANA 3WD6A 1EWXA 3U5RE 4IGJA 1M0UA 1OKTA 4GSSA 4OMVA 1EP7A 5H5QA 1M2AA 1WIKA 4MMMA 2DIZA 2H1AA 2K18A 2J23A 3QFAC 1K3YA 4X0XA 2IMDA 3UMAA 3C71A 5D93A 4FO5A 5JWQB 3IOSA 3WGXA 3GX8A 4X1UA 2GTUA 2LTKA 2A2SA 6GSXA 2X8GA 2OJLA 2A2RA 4J56E 1YY7A 2NVLA 1KTEA 4OCEA 3D21A 4WXTA 5CRWA 1S3AA 2HZEB 1MEKA 2HLSA 2EC4A 4PGTA 1PX7A 5ABRA 3ZFBA 2WGRA 4L8EA 1ML6A 4JE1A 3Q19A 2KUCA 4FYCA 3ME7A 2H1DA 2PVQA 3MAKA 4CW9A 1ERUA 12GSA 1RQMA 4YQVA 5C00A 1Q4JA 2LQOA 4K9ZA 5ENUA 1X5DA 2H01A 2H8LA 1OC8A 1G6YA 4LA1A 2DLXA 2R6KA 4JU5A 1PSQA 2OBIA 4MH3A 1U3IA 5EPFA 3VI7A 4D73A 1M9AA 3LYKA 1ZYEA 4FYBA 5IPGA 1Z6NA 2O87A 3FEUA 3GSSA 3UARA 5GSSA 1U87A 1OAZA 2A4VA 1LJRA 3KXOA 2ZCTA 4HZ2A 3HKRA 2H66A 1LU4A 2CAIA 4PQHA 3KM6A 1F3AA 1VRSD 1V58A 2WZ9A 5CRDA 1EGOA 1Q98A 4IN0A 1A2LA 1K0MA 1SJ6A 2IN3A 3IE3A 3E0UA 3PGTA 3APQA 3BCIA 5D9TA 2JSZA 1Y6EA 4MCUA 1SJZA 3GKKA 3CSJA 1M2BA 11GSA 1UC7A 2FA4A 1MD3A 4KAEA 2YZHA 3ZVJA 1S3CA 2R4VA 3QR6A 5AGYA 1TI3A 2HZFA 2HXKA 2K8SA 3TDGA 3GH9A 3ED3A 3UL3A 1GSDA 1U88A 4L5LA 2VO4A 2GQMA 3A2VA 1PGTA 3W8SA 2E0QA 3Q18A 2RLIA 1GULA 5GSTA 2WB9A 4EVMA 2H70A 2C80A 2X99A 5EY6A 4YQMA 4OCFA 1R5PA 4Q5FA 4MJBA 4MH2A 3EURA 3QOUA 4ZIJA 2LS5A 1LBKA 2KHPA 4ID0A 1O81A 3RDWA 3TCOA 2FA8A 4IELA 4IQAA 2HZEA 2HE3A 2RUFA 1TW9A 5IO0A 1RK4A 2ZNMA 2DJ3A 1XWKA 3TKRA 3GIXA 2GSRA 5KN0A 4RI7A 5IMCA 4FYUA 3FR3A 2Z9SA 4MA9A 2F8FA 2ES7A 10GSA 3H4KA 1DUGA 2GT6A 2DJ0A 1F6MC 3BJ5A 22GSA 1W89A 1SK1A 1TTZA 4NWYA 4KCEA 1TU8A 1K0OA 2PUKC 2JZRA 1HQOA 3IA1A 2H72A 4EUYA 2LEGA 3TJFA 2HSYA 1A8YA 1BQ7A 3I69A 2GSQA 5JWRB 4EDYA 1KNGA 5IMZA 4ECIA 2H1GA 2VM2A 2H6YA 3TKQA 2CX3A 1SJIA 5DVBA 4POBA 3KH9A 1QMVA 2VL3A 5DALB 2I3YA 3GUSA 1QXHA 3KH7A 3M9JA 5ELGA 1IYIA 1SKSB 3L9UA 5J9CA 5H5SA 6GSVA 5F06A 1W4VA 4G9HA 4DEJA 5IM9A 1EV9A 5A4VA 2NPBA 4I6XA 1SU9A 2VLVA 4K7IA 5L71A 2VCXA 3CBUA 4K6XA 5J5NA 2R5GA 1Z9HA 3DWVA 5CRHA 6GSTA 4MABA 5IMFA 2ON5A 1GP1A 1QFNA 5H5RA 3HD5A 3MNGA 2GZYA 4V2NA 4Z7XA 5ID2B 2MYGA 2C0EA 4XCSA 5IMDA 1VF1A 1XZOA 3NZNA 4G19A 1PA3A 3VURA 3FY7A 4YQUA 1SYRA 1B4PA 2N5FA 2L5LA 5ECIB 2MBSA 4JR6A 1G7EA 2B1KA 3ZFLA 4ECBA 1EOHA 3D4TA 2QGVA 2YWIA 1N2AA 1NW2A 3LGCA 1J08A 1TRVA 3CMIA 4N0ZA 5GAPD 4NXIA 3WGEA 3EINA 4K1FA 1S3DA 3L0HA 1PKZA 2PGTA 1QQ2A 3IC4A 4MDCA 4JR4A 4NHWA 2O7KA 4GWRA 3FR9A 1F9MA 4TRXA 1GTBA 5G5FA 1EZKA 4K0NA 5J9BA 3ZLPA 2DJKA 1AW9A 3FR6A 3GX0A 3ZTLA 5HFIA 3TKSE 1ERVA 4GF0A 1SL0B 3F63A 4WETA 5B6MA 1SD9A 1Z7PA 2LUSA 1M2DA 4RUVA 5DALA 3PINA 2BTOT 4EXJA 1BG5A 4XIHA 1F3BA 2YJHA 5FT3A 1JZRA 3AY8A 3C1RA 1GLQA 3F4SA 4ILFA 3O3TA 1ON4A 1SK2A 4YH2A 5GZZB 3C73A 1XIYA 2LNTA 2NTOA 1M7TA 4OO4A 5CRGA 4WEYA 4KE3A 4AJ7A 4J57E 1AQWA 5J3RA 4PNFA 3M0FA 5AISA 3WT1A 2NDOA 1FO5A 3PH9A 4ZBDA 1TXXA 2L5OA 2C0GA 1JFUA 4XS4B 1KEBA 1E6BA 1GLPA 5F8BA 3LG6A 4HS1A 4L0WA 4QL7A 2WS2A 3DD3A 5G31A 8GSSA 2OE1A 5ID2A 3DMLA 1O73A 2FNOA 2C0FA 1R7HA 2YV7A 4IKHA 2WCIA 1AIUA 1WP0A 1DSBA 2VOCA 5C04A 1H75A 3ERGA 2FLSA 3EYTA 3LWAA 4CDOA 1OC3A 5D9WA 2H19A 2PBJA 1FHEA 3FHKA 3M3MA 3VWVA 5J41A 2FY6A 4NMUA 4PX1A 3TKSC 1JLVA 3ZRDA 1MDIA 3NOFA 2WDUA 4IW9A 4BPYA 1GSUA 1FAAA 2V6KA 3APSA 4N11A 1GL8A 5DJMA 1PN9A 3UVTA 2L4CA 3FZ5A 4HQZA 1BJXA 2GT5A 3ZREA 2JZTA 3E3EA 3I9V2 3LYPA 3HDCA 2EIRA 1YQ1A 2M72A 3FZ4A 2TIRA 1NSWA 2OACA 3C8EA 1YKAA 3LFLA 2LSTA 3IXRA 6GSWA 3GMFA 4IJ3A 2LV3A 1MDJA 1EP8A 4XHMA 5DAKB 5HR0A 5F0GA 2V2GA 2LRTA 2J9HA 4J2FA 1O6JA 1X5EA 3CSHA 4I97A 4QQ7A 1SYXA 3V1WA 5DCGA 2XHFA 1K3OA 4I8BA 1EOGA 1HD2A 3ZMLA 2MMAA 2B1LA 4HDEA 3SWLA 1PKWA 2CAQA 2H30A 2PU9C 1G0TA 4BVYA 4IHUA 2H74A 1B48A 3GH6A 4LL4B 1AXDA 1V9WA 2AAWA 3HCZA 5CO3A 1ACVA 3MDKA 2GDRA 4KCAA 2P0GA 3F3QA 1IYHA 3HJOA 1A2JA 3IDVA 3EMXA 2F51A 2QSIA 3L78A 4KSMA 3A2XA 2VL2C 4QL9A 1Z6MA 2XPEA 2YOIA 2IFQB 5JWOB 1T00A 2VCQA 2AYTA 4XS4A 3UJ1A 4Q5RA 3VFIA 1VF4A 2RM5A 3H93A 1T4YA 4WBRD 1GSFA 4TN8A 3QAVA 1PL1A 2LJAA 2IMEA 3P7XA 1XPVA 2MMZA 5CREA 2CA8A 3ERFA 1TOFA 3LEFA 1T8EB 1O85A 4ECCA 1EEJA 1AC1A 4F0BA 3DGQA 4ZL8A 2L59A 1T4ZA 5A4UA 2F8AA 1FG4A 3D4MA 3CTFA 5E59A 2YNXA 1GTIA 2IWTA 1TRUA 2VLTA 2B5YA 4PNGA 5HFGA 1U6TA 4YAPA 3QPMA 2LNSA 3IAM2 2I4AA 18GSA 4NV2A 4DVCA 2CVDA 3CTGA 3GL5A 5LNKe 1XOAA 3IK7A 2L57A 2DJJA 4MLYA 2GZPA 1A0FA 5G1KA 4KW6A 4K8MA 5COHA 3SBCA 19GSA 2QC7A 5E4WA 2H0IA 5CNWA 3ZMKA 1WRYA 1K0DA 1F2EA 3D0ZA 4TXVA 1USBA 2KP2A 5AIVA 2WJUA 5AN1A 4IQ1A 2AB6A 5DAKA 1TK0B 5HQPA 1CQHA 2YP6A 2OA7A 4PUFC 4OFTA 1XVQA 2H75A 2AV4A 1XWCA 4IJIA 4OFMA 4XS1A 5IMAA 4ZB8A 1TRWA 4KB3A 2YCDA 2HNLA 1JHBA 1TP9A 1GSEA 2VCZA 5EL8A 2FWEA 3D22A 4HJMA 4GCIA 4ZL9A 1BAYA 2CZ3A 1DE1A 5D9XA 2O85A 3DEXA 3F9UA 4KGIA 3FW2A 7GSSA 2GGTA 2B5XA 2VCVA 3C1SA 2IIYA 4ML6A 4ULXA 2IFQA 3ZL5A 3VI5A 1Z5YE 5LD0A 2KP1A 2MBTA 1JZOA 2N5AA 2E2GA 1XW6A 2X8HA 1EV4A 3JCML 3DKSA 3EU3A 3RBTA 2LQQA 4ZB9A 3GSTA 2FWHA 3OR5A 3WYWA 5ECHB 3UEMA 4IP6A 1H4OA 2PWJA 4ECJA 3CYNA 1YZXA 2K6VA 4Q5QA 5JCGA 3O76A 1NM3A 2VD0A 1I5GA 1T3BA 1WJKA 4EL1A 4PURA 2E2MA 1WMJA 3UBLA 3VLNA 2CV4A 2IMIA 3US3A 1SKWB 2XC2A 3G9BA 4K7OA 2IL3A 4ZL7A 4MK3A 2DJ2A 2EIQA 2GQLA 1M9BA 5ECSA 2GSTA 1GH2A 1HNAA 4AF2A 4HQSA 2JADA 4HUAA 3HY2A 1THXA 5DJLA 3HA9A 5ECKB 2DMLA 2LRCA 3A5WA 4PQ1A 5IPHA 4HI7A 5A5KA 3I6AA 3NIVA 1OKDA 1XWGA 4H86A 3RHCA 1WWJA 4Q5NA 3W6GA 4WF5A 3F6DA 1U3AA 1Z7RA 2DSAA 4ISDA 2O8VB 4GSTA 4ML1A 3ERWA 2WFCA 4IBPA 2VAFA 3F3RA 4NAXA 3LORA 2IY2A 4KDXA 3ZYWA 4BL7A 1TI1A 4MF6A 3TUEA 3IHQA 3L9SA 5IQYA 1BX9A 4MZBA 3GKMA 1ERWA 1UN2A 1ERTA 2R3XA 2GZZA 2ALBA 4TW5A 1XFLA 3A2WA 5ECPB 2V6OA 1F37A 4TXOA 3RAZA 4AJ6A 3K8NA 4MPGA 2OE3A 4IP1A 4MZWA 5KN2A 3G7JA 4F9ZA 5B8AA 1YKCA 2H0GA 5INYA 2CT6A 3DIEA 1YF1A 2FCHA 2VM1A 4E8HA 3UBKA 1PMTA 3O6TA 3N5OA 3LXTA 4KNDA 3HVXA 2HFDA 1B9XC 1XVWA 1QGVA 4WR4A 4GLTA 2H1BA 3GHAA 3QDNA 2HT9A 2OBKA 3Q6OA 2DMMA 1Y25A 2D2ZA 2V41A 4P3YB 5CP1A 4LMWA 2C3QA 1ST9A 3E9JB 3U6VA 2B7KA 4BA7A 3I43A 3G7IA 5CAXA 4JZQA 4GSNA 3GKXA 9GSSA 3BOAA 1OVNA 1QUWA 4CHSA 2AUVA 2IMFA 2PERA 4E8EA 1TRSA 3ZZXA 3VPQA 5KN3A 2GSSA 4F82A 1TU7A 4V2LA 4I5QA 3PR8A 4ZBBA 5B6NA 5B8BA 3ME8A 1OE7A 2VL2A 5DQYA 3TOTA 4OWYA 5ECLB 1ZGNA 4GQFA 1PD21 4OD7A 4O32A 4POLA 3KMNA 2H6ZA 4HOJA 4RI6A 5G2ZA 3EE2A 2H71A 2P5QA 3EVIA 3IBHA 4LMVA 2XBIA 2YPMA 4KX4A 3M1GA 4TR4A 1TKDB 2VIMA 1GNWA 5ECRB 1FW1A 2L6DA 4V1Ag 1A23A 4N10A 1GRXA 1MDKA 2YJ7A 3KMOA 2V1MA 5AIXA 13GSA 4GRFA 1B8XA 1A0RP 2TRXA 2F3MA 1EGRA 4K0GA 3DXBA 4N30A 4NV5A 2R2JA 1ZYQB 3QAGA 2M46A 4TR0A 2LJRA 1CQGA 3IK9A 4EF0A 1X5CA 4F0CA 3LQ7A 1ZOFA 2B5EA 4WF4A 4IVFA 1V98A 1G6WA 2I1UA 2FWFA 5HR1A 5ECOB 5G5EA 4LL1B 4JBBA 1X0RA 4HZ4A 2HYXA 2RM6A 3UIWA 1QK8A 2IPAA 1HNCA 4EC0A 2CVBA 3VPTA 2C3NA 5DQSA 2MZCA 4ZB6A 3TJGA 3HZ8A 3GKNA 4N0VA 3CRTA 5ECQB 1VF2A 3TJBA 4WKWA 4HU7A 1XBSA 2CQ9A 2CX4A 1WPIA 5IIZA 4L0UA 1EEMA 4NHZA 3KJYA 1K0AA 2PVOC 5FHIA 4BWQA 3BBYA 1G7OA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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