4ILF | Genus

Total Genus 69

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	69
sequence length	219
structure length	219
Chain Sequence	b'AMDPEFMDAAIRQSLAKLGVQSTEIQASPVAGMKTVLTHSGVLYVTDDGKHIIQGPMYDVSGAHPVNVTNKLLMSQLNALEKEMIVYKAPDEKHVITVFTDITCGYCHKLHEEMKDYNALGITVRYLAFPAQGLESQAEQDMKSIWCAKDKNKAFDDAMAGKGVKPASCDVNIADHYALGVQLGVSGTPAIVLSNGYVVPGYQGPKEMKAFLDEHQKQT'

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	Thiol:disulfide interchange protein DsbC
publication title	Crystal structure of the periplasmic disulfide-bond isomerase DsbC from Salmonella enterica serovar Typhimurium and the mechanistic implications. pubmed doi rcsb
source organism	Salmonella typhimurium
molecule tags	Isomerase
total genus	69
structure length	219
sequence length	219
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-12-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF10411	DsbC_N	Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A	PF13098	Thioredoxin_2	Thioredoxin-like domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.450.70	Alpha Beta	Roll	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal	4ilfA01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4ilfA02

4ZILA 1C72A 12GSA 3HJPA 4JBBA 1WMJA 2O87A 5J4UA 4GF0A 1EV4A 1ERWA 1XXUA 4KB3A 3ERWA 3A2XA 3ZFBA 1V2AA 2CT6A 2TRXA 2MMNA 5DAKA 3GRXA 1FVJA 2C0FA 4N30A 2H1DA 1R26A 1QMVA 2DJ0A 1XOAA 4F0BA 4FYUA 3VI7A 3QMXA 5CAXA 1MD3A 2I1UA 2J23A 19GSA 2O8VB 3M8NA 5F07A 3ZMKA 1XIYA 5ECLB 6GSWA 3HVVA 4LMWA 1KTEA 3QFBC 1T1VA 5IO2A 2YJHA 2CZ3A 1AUCA 5GAND 1QFNA 4OCFA 2GTUA 2QSIA 1PX7A 4MK3A 2V6KA 2Z9SA 4GTUA 4EDYA 1ERVA 2C3TA 3I9V2 1GSUA 4X1UA 1K0AA 5JWQB 4POMA 3G7IA 1A2JA 2N5FA 1ZYEA 2WB9A 1A2MA 3MDKA 2B3SA 4RQXA 3UARA 5HFIA 1ACVA 2FGXA 4OO4A 3IAS2 2I4AA 3TB2A 1XW6A 3GSSA 1WJKA 5JWRB 5DAKB 1VGLA 3TJJA 3Q6OA 2C1YA 1UA5A 1NHYA 4K0GA 1GTIA 1R5PA 3G7YA 3IK7A 3OR5A 4KCAA 3WGXA 1TRSA 4O92A 4JU5A 5EPFA 2L6DA 1Z5YE 1TRWA 1EWXA 3GKNA 1VRSD 1B48A 3TRPA 2AJQB 3ERFA 5J9CA 5GSSA 1U3IA 4MH3A 2F8AA 3GX8A 1YKCA 1XWGA 1XVQA 5INYA 3EYTA 1JLVA 5F05A 4ECCA 3ZYWA 1V58A 2B7JA 4PNFA 5D9WA 3ED3A 1R7HA 1GH2A 4EDZA 1ON4A 4MPFA 1J08A 5G5EA 1M99A 5L71A 2F9SA 1GUHA 1A8LA 2DJKA 2EIQA 1UN2A 4O7HA 1K0DA 4IN0A 1TP9A 3EU3A 3VURA 3QCPA 2RUFA 2VIMA 4F0CA 5LNKe 1SD9A 4HU9A 4ILFA 1O7UA 2FY6A 5E4WA 1OKDA 2J9HA 3M9KA 5IPGA 5FT3A 4IHUA 2DJ2A 3HJMA 4GCIA 3GURA 4MJCA 1J0FA 1GUMA 1W4VA 2V6OA 3C8EA 4OO5A 6GSXA 5IOWA 2IMIA 1T00A 4LMVA 5D73A 3A2WA 3R2QA 2IMFA 2P5QA 2V1MA 4KDXA 3HYPA 2LV3A 4TW5A 3IXRA 1MD4A 5AISA 1SKSB 4BPYA 3KMNA 1MDKA 2DJ3A 1BAYA 2K9FA 2V32A 4O5RA 4ZBBA 3APSA 2H74A 10GSA 3US3A 2LRTA 2KUCA 3D4TA 2B6MA 2WJUA 1HNAA 4MJAA 1H75A 3LWAA 3CSIA 3N9JA 4WBRD 2NBSA 2A2RA 1XVWA 4JE1A 2DJ1A 1F6MC 1JLWA 2LJAA 3EINA 2XPEA 3UL3A 1VF3A 3WYWA 3F6FA 1MTCA 1KBNA 3Q18A 1O8WA 5D9TA 4EKZA 5ELAA 1SYRA 4Q5NA 3KH9A 2K6VA 1DE1A 4PXOA 2ON7A 4OFNA 3C73A 2F51A 1ZL9A 3P7XA 3HD5A 3RAZA 1U6TA 1GSDA 5A5KA 3ZLPA 4PURA 1XFLA 2GZZA 1E2YA 3F4RA 3LXZA 4CDOA 2CQ9A 5ECPB 2LJRA 3QDNA 1GL8A 3ZIVA 5C04A 1LJRA 2OBIA 3I6AA 2GZYA 1M2DA 5HR1A 4WKWA 2AAWA 1O73A 5H5RA 2F3MA 1ZGNA 4MCUA 1CQGA 4POLA 3DIEA 4IW9A 3GHAA 4TXOA 4OD7A 2XBQA 4XS1A 1R4WA 2HE3A 1PX6A 3GTUA 4BVYA 2ZUPA 2KOKA 4MDCA 3F4TA 1OC8A 3HJOA 2H19A 4K0NA 5DVBA 2PWJA 3QAWA 1YF0A 4MLYA 1PRXA 1TTZA 3FR6A 2CZ2A 1R5AA 5ECNB 4ML1A 3VPQA 1YDKA 3Q74A 4MF7A 3TCOA 1M9AA 4GSNA 2JACA 4LL1B 1TJDA 3D0ZA 1A8YA 2ALBA 4WETA 3F4SA 4N10A 3VLNA 2NTOA 1OVNA 2PGTA 2IWTA 3ZVJD 1BQ7A 1PN9A 3GIXA 1GSQA 3FZ9A 1PL2A 5D96A 2TIRA 2VM2A 3FZ5A 4OFMA 2C0GA 2GQKA 18GSA 1ERTA 3LXTA 1FOVA 1PSQA 1EGOA 5KN1A 3P90A 3IE3A 1O8XA 2CX4A 3O76A 3BCKA 5CREA 3E0UA 5H5SA 1QGVA 2R6KA 3C1RA 3HZ8A 5KEJA 5DJMA 1TK0B 3L9VA 2HI7A 4ZB6A 2WRTA 2I3YA 3I43A 2H1AA 2FA4A 3D6IA 1TU8A 4KX4A 1DSBA 3DXBA 1YJ6A 2DBCA 1BX9A 4TXOB 3IPZA 2X8CA 4RUVA 3GTUB 1JZOA 1G0TA 2FWGA 4WXTA 2FCHA 2B5XA 4I2UA 4FYCA 4KSOA 2K18A 1SENA 4IS0A 1EP7A 3WT1A 2VLTA 2H0IA 2C4JA 3PINA 1AAZA 3KD0A 2REMA 4L0UA 1HYUA 2C3QA 4ECIA 3ZRDA 1LBKA 3RHCA 3MSZA 1BYEA 3IBHA 1QQ2A 3UIWA 3ZL5A 4IELA 1A0FA 3FW2A 2ON5A 4HU7A 5CRGA 5IQYA 3GA4A 4KCEA 2L57A 3ZREA 1G7EA 2VCTA 1MEKA 2E2MA 4ZL7A 1GTUA 5AIXA 4J56E 4IJIA 1AQVA 4ID0A 1BG5A 4JRRA 1T4ZA 2NPBA 4GWRA 3A2VA 4V1Ap 5B8BA 5HQPA 3D5JA 3HDCA 4K8MA 4KW6A 2PUKC 3FR9A 4JEDA 2CAIA 2JSZA 3SWLA 4IQ1A 4MABA 3IC4A 1ZZYA 1F3AA 2H72A 3CMIA 3LQ7A 1VF4A 2H73A 5IM9A 4LL4B 1SU9A 1K3YA 4MF5A 3TKQA 4YQVA 1FG4A 1Z9HA 2OADA 3G9BA 3FZAA 2MMOA 5COHA 1Q4JA 1M9BA 4TOPA 1N8JA 2LTKA 2C0EA 2PPTA 2LRNA 3CSJA 4YQMA 3TRQA 4X43A 3TRXA 1OYJA 4XTSA 2IPAA 5J9BA 2YPMA 5A4VA 2IJYA 2MYGA 4DSRA 2IMKA 3ERGA 4MF6A 4K2DA 5FHIA 3KCMA 4ZXGA 2O89A 3EE2A 1WPIA 2EIRA 2BJXA 5IPHA 3Q19A 2RM5A 1SK2A 1YKAA 1UC7A 2OE1A 1XWKA 4QQ7A 3GX0A 3BOAA 5IOXA 1YY7A 3ZFLA 2HYXA 4L8EA 2YZUA 3D22A 2K8SA 2VCWA 1KNGA 4HI7A 3MAKA 2KLXA 2DIZA 4V2MA 3GKMA 3RHBA 1CQHA 3QAVA 4KA0A 4N0ZA 4AGSA 5CNWA 2ZCTA 4ZL8A 1USBA 5IMAA 4DEJA 3WGDA 3D4MA 4I2TA 1MDIA 3DVWA 3EVIA 3FR3A 2VM1A 4IBPA 1QK8A 1ML6A 1JZWA 3M3MA 3DMLA 4N11A 1WIKA 3W8JA 5CYYA 5IIZA 3U5RE 2AYTA 1YZXA 2VD1A 2H1GA 5CRDA 1SYXA 5ECHB 3TOUA 2OBKA 1T8EB 1OAZA 3EC3A 2LS5A 2C3NA 2D2ZA 4NV2A 3ZIJA 1X9MB 3HKRA 4QL7A 3MNGA 2QC7A 4KDUA 4D73A 2L5OA 3ZITA 2JSYA 2RIIA 1FO5A 3UVTA 3F63A 1XOBA 4G9HA 2R2JA 5DALA 3QFAC 2YCDA 4YAVA 4HZ2A 2V41A 2DMMA 2JL4A 3KGKA 4MZCA 1GRXA 1H4OA 1PL1A 2A2SA 4MPGA 1DBYA 2IMDA 4G10A 3P2AA 2X99A 1BJXA 5DJLA 2FUG2 2L59A 4ULXA 2H6ZA 2HRNA 3HA9A 2YV7A 2TRCP 4JR4A 3F9UA 5HFGA 1FHEA 5IMFA 2MZCA 5AN1A 5E59A 2OACA 1A24A 3L0HA 5ECMB 3L78A 3L9SA 1AQXA 3LORA 3D21A 3F6DA 2MMZA 2CVKA 5F0GA 4HJMA 3PH9A 4OMVA 4K7NA 4RI6A 1HD2A 3UJ1A 3FZ4A 2H0HA 2L4QA 3WGEA 4N0VA 1ZMAA 4V1Ag 1SJ6A 4FH8A 3SBCA 3GH6A 3ZMLA 3EWLA 2V2GA 2H01A 2VLUA 2B5EA 2OA7A 4D73B 1K0BA 22GSA 5IMVA 1A23A 3WT2A 4NWYA 4AJ7A 2YWOA 3H93A 1SKWB 3GL5A 5DALB 5ECOB 3NZNA 3FY7A 5B8AA 4KAEA 1TXXA 3GUSA 2QGVA 1XBSA 3FRCA 1TU7A 4PGTA 3O3TA 3RPPA 2GZPA 1QUWA 2VL2A 3GFKA 4F82A 1YQ1A 3NIVA 2FNOA 1SL2B 3CTGA 3WD6A 5CRHA 4HQSA 1QXHA 1LU4A 3CRTA 3APQA 3J7Yk 1TOFA 4OFTA 1AW9A 2CVDA 3W8SA 4J57E 2DJJA 4MMMA 4IP6A 3CTFA 5EY6A 1OE7A 4L5OA 2VO4A 4MZBA 8GSSA 4YAPA 4KNDA 4EC0A 5F06A 2JZRA 5CO3A 2H30A 5ECKB 4BWSA 4TR1A 3C7MA 3M0FA 1F3BA 3HXSA 4YQUA 2N5BA 5G30A 4MJEA 1GUKA 3TJGA 2EC4A 1GLQA 2A4VA 2YWIA 4K9ZA 2AV4A 2VCXA 3RDWA 1B9YC 3GKKA 5GSTA 4LA1A 6GSVA 3UVHA 1ZOFA 6GSUA 2R5GA 3DEXA 1A2LA 1F37A 2JADA 1OC9A 2PU9C 4KSMA 2GT5A 5F8BA 3VPTA 4GSTA 5D93A 1DE2A 5DCGA 2QKEA 1OKTA 2DMLA 2E7PA 3KIJA 5B7CA 5ELGA 3QOUA 1TKDB 1YF1A 2HLSA 2HZEA 2VAFA 1S3AA 2GT6A 5JCUA 4NHWA 2F8FA 4DSSA 4FIWA 5J3RA 1B4QA 4NMUA 4QL9A 2VLVA 1GTBA 1EP8A 2VCQA 1K0CA 1NW2A 4H86A 5LD0A 3JCML 3A5WA 5HR2A 3TKSA 3KTLA 6GSSA 3DWVA 4HZ4A 3FEUA 5ECIB 2C8UA 2WS2A 3GNJA 1RK4A 4KGIA 4TR1B 2FLSA 4WEYA 4WR4A 2IFQA 4XIHA 4F9ZA 4TR0A 17GSA 2R3XA 5C00A 3DD3A 3GH9A 5DQYA 1THOA 3L4NA 4G2EA 2LUSA 3E3EA 3PR8A 1I9DA 3VWUA 2L5LA 2OE3A 1XCCA 4IKHA 4K7OA 1OC9B 2B5YA 4RI7A 4TKYA 3UAPA 2IN3A 4KDYA 2NDOA 3KXOA 3KJYA 3FHKA 2PN8A 4TXVA 1AC1A 4IGJA 3QPMA 5ECSA 5IMZA 4WR5A 3UMAA 4NXIA 3G7JA 4CHSA 1V40A 2LNTA 4WF5A 5G2ZA 2GSQA 3KP9A 2B1LA 3UBKA 2HZEB 3N5OA 5HR3A 4L5LA 2K8VA 4AF2A 4TVEA 1ILOA 3FYGA 3HVSA 1PQNA 1TI3A 1F2EA 1GSSA 3F8UA 4DSSB 3GMFA 1TK8B 2RLIA 1TDIA 4KH7A 1HNCA 2HFDA 5ECRB 2LJKA 4AJ6A 1THXA 3IRAA 3DYRA 2NVLA 2L4CA 4F03A 2HXKA 4GLTA 1PKZA 3GSTA 4J2FA 3VI5A 1SL1B 3CBUA 3RBTA 4ZBAA 4PUAA 4G19A 3QR6A 5FWGA 2O7KA 1Z7RA 3HY2A 3H4KA 2IFQB 2LKUA 5IO0A 3DVXA 4PQ1A 2C80A 2X8GA 1W89A 4EF0A 5EVOA 3BJ5A 3IV4A 1PKWA 1OE8A 4YH2A 3GKXA 4EO3A 2H66A 4XRDA 5H5QA 4K7IA 1XPVA 2DSAA 1IYIA 4MP4A 4V2LA 2E0QA 1Y25A 3CSHA 5HFKA 4MJBA 3DGQA 4K6XA 1TRUA 1BEDA 2JZSA 2KP1A 2GGTA 4WBJA 2CVBA 1T4YA 2O85A 3CXGA 3IA1A 2VCVA 3LSZA 4TN8A 4GQFA 5DDLA 2X8HA 2OKAA 5G1LA 3C71A 2R4VA 3TKRA 2YWNA 2EIOA 1KEBA 2H71A 1K0OA 2H76A 3KMOA 1M0UA 4ZB9A 2H75A 2GS3A 1GNWA 4ML6A 1GNEA 1U88A 1Z6NA 1GULA 3MWHA 2LEGA 4HUAA 5ENUA 1NM3A 4V2NA 1X9SB 2KHPA 2P31A 2XC2A 1K3LA 1I5GA 2B7KA 2GSSA 1EOHA 3F0IA 3UBLA 3HVXA 4ECBA 3M1GA 1FB0A 5ID2A 2IY2A 4XRAA 1K0MA 1N2AA 4OWYA 4PNGA 11GSA 1O81A 5KN2A 3P8WA 1M2AA 5DCHA 4NPBA 4K1FA 2BTOT 1G7OA 3NOFA 2CA8A 2I9HA 1SK1A 4POKA 4E8EA 2VL3A 3TKPA 4ZL9A 4JZQA 1EV9A 4ACSA 4EUYA 3H1NA 4EVMA 3VK9A 2IIYA 2H0GA 1K3OA 9GSSA 1SJZA 1HNBA 1X9WB 3ISOA 1V98A 4XS6A 5KN0A 4HQZA 1ZYQB 2YN1A 3I69A 1X0RA 2HRFA 5J5NA 3VFIA 1PD21 3KZQA 1Z6MA 2PVOC 2H1BA 2VL9A 2GLRA 1EOGA 6GSYA 4FYBA 5D9XA 2M46A 4XCSA 3EURA 2HT9A 2YNXA 2C0DA 5JCGA 3RPNA 2R37A 5AGYA 2H6XA 2GVPA 4Z7XA 5ID2B 1AXDA 1ZCPA 3IOSA 4Q5RA 1WP0A 1XWAA 2FWEA 4MZWA 4XHMA 2HNLA 3W6GA 1WOUA 4MA9A 4P3YB 3DKSA 3LG6A 2YV9A 2H8LA 2IYJA 5HR0A 5IMCA 4BVXA 4ISDA 3ZVJA 2WGRA 1MDJA 4BWQA 2LQOA 4RQRA 2HZFA 4EXJA 4KE3A 4Q5QA 1DUGA 1J9BA 3K8NA 5G1KA 3ME8A 1O85A 5DQSA 2AHEA 3BD2A 1FB6A 1PMTA 1G6WA 2AB6A 1SL0B 4TRXA 2IL3A 4F2IA 13GSA 4NV5A 1EZKA 5KN3A 4GQCA 4NAXA 4PQIA 4DVCA 1XW5A 3BBYA 5EL8A 2DIYA 2RUEA 5AIVA 2YP6A 2CAQA 1M2BA 1RW1A 4BL7A 3A3TA 4NHZA 5B6NA 2DC5A 2MMAA 3HZ4A 3V1WA 1X5DA 3L9UA 1K0NA 2LQQA 1S3DA 3APOA 3IAM2 5D9VA 1FVKA 2OE0A 2VD0A 4HDEA 4I5QA 2I81A 1GTAA 3GN3A 2PERA 2P5RA 5CP1A 5ECQB 1TRVA 3U6VA 1A0RP 2YZHA 5ABRA 1F9MA 1PGTA 2FA8A 1PA3A 2L6CA 1M7TA 3IR4A 3TJKA 1URMA 3KM6A 2WDUA 1TI1A 3TJFA 4FO5A 3FKFA 3KP8A 3F3QA 2VUPA 3CYNA 4TR4A 3TGZA 4PX1A 4AJ8A 20GSA 1GWCA 2ZNMA 2XHFA 5GAPD 2KP2A 5IMDA 3O6TA 1JZRA 3VWWA 3LFLA 2LNSA 2XPDA 1GSEA 2GQLA 1ERUA 2JU5A 4XS4A 1G6YA 3S9FA 4O32A 4JR6A 2BMXA 2WFCA 1SK0A 2CX3A 2LRCA 1TK5B 1UVZA 2MBTA 2YANA 4I8BA 5A4WA 4X0XA 2E2GA 3M9JA 1IYHA 1AIUA 1Q98A 3GV1A 2CV4A 2YJ7A 4OCEA 2M72A 4DSQA 1VF1A 1ST9A 2B1KA 3QAGA 5G31A 1U87A 5B6MA 2WULA 2GSRA 2M80A 2RM6A 4ECJA 3F3RA 4POBA 3AY8A 3ME7A 4IQAA 3TOTA 16GSA 1EEMA 3UOMA 4I6XA 1V57A 1OC3A 1WRYA 2P0GA 1FAAA 3KTBA 3UEMA 3HCZA 2H70A 3TUEA 3LYPA 1TW9A 2G2QA 1B4PA 2MBSA 4I97A 4Q5FA 2VL2C 5JWOB 2FD3A 4ZB8A 2X64A 2HSHA 4IJ3A 4ZIJA 4BA7A 4GRFA 2LSTA 4HEA2 1XWBA 1SJIA 3H79A 2ES7A 3E9JB 3IHQA 1B9XC 3LGCA 1GSYA 3EMXA 4HS1A 6GSTA 1O6JA 5DBQA 4XS4B 1JHBA 4LLRA 2PVQA 1WWJA 1X5EA 2DLXA 2GQMA 1T3BA 2GDRA 1U3AA 1Z7PA 4WF4A 3C1SA 3ZZXA 4L0WA 2WCIA 3PGTA 3ZTLA 1JFUA 4E8HA 4GSSA 4HOJA 2PMTA 5CRWA 1T7PB 14GSA 2YWMA 4PUFC 2FHEA 3GL3A 5G5FA 3DRNA 2VOCA 1EEJA 1V9WA 1GP1A 1NSWA 1GSFA 2IMEA 3VWVA 1AQWA 2VCZA 1NHOA 1WE0A 2HSYA 2JZTA 3BCIA 3FK8A 1SKRB 1B8XA 4EE0A 2XBIA 1HQOA 3TKSE 2PBJA 4IVFA 1SD8A 2G0FA 2GSTA 1S3CA 4IP1A 3CRUA 3J7Yb 2AUVA 1XW9A 2FWHA 2H6YA 1Z3EA 3EU4A 2YOIA 3VWXA 2N5AA 3LYKA 5GZZB 1EGRA 3KEBA 7GSSA 3HHVA 1X5CA 1GLPA 5LCZA 4HJ2A 3IDVA 3KH7A 4GXZA 2FWFA 1ABAA 3H8QA 3IK9A 3LEFA 2WZ9A 4EL1A 4PQHA 5A4UA 4MH2A 3QD9A 5JCWA 1RQMA 1YEXA 3TKSC 4ZBDA 2OJLA 1XWCA 1VF2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4ILFA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations