4ILFA

Crystal structure of dsbc r125a from salmonella enterica serovar typhimurium
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
AMDPEFMDAAIRQSLAKLGVQSTEIQASPVAGMKTVLTHSGVLYVTDDGKHIIQGPMYDVSGAHPVNVTNKLLMSQLNALEKEMIVYKAPDEKHVITVFTDITCGYCHKLHEEMKDYNALGITVRYLAFPAQGLESQAEQDMKSIWCAKDKNKAFDDAMAGKGVKPASCDVNIADHYALGVQLGVSGTPAIVLSNGYVVPGYQGPKEMKAFLDEHQKQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbC
publication title Crystal structure of the periplasmic disulfide-bond isomerase DsbC from Salmonella enterica serovar Typhimurium and the mechanistic implications.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
molecule tags Isomerase
total genus 69
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 4ilfA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ilfA02
1VF3A 2LTKA 1GULA 1JZWA 3F9UA 2DIYA 1M9AA 4K0GA 3ZREA 4ZXGA 1EV4A 4JRRA 2MZCA 2FLSA 2WS2A 3VPQA 4NV2A 4TR0A 2YN1A 2A4VA 4XHMA 5ECNB 5CP1A 1XCCA 2AUVA 1YEPA 2M46A 1XBSA 3KEBA 2MYGA 2TRXA 3IV4A 1EEJA 5DQSA 3KXOA 1EP7A 4JZQA 1H4OA 3DVXA 4I97A 3TRQA 3M9KA 2KLXA 4TVEA 3GNJA 1GSUA 2CV4A 2XHFA 5J9CA 4ZB6A 4BWQA 3C1SA 5EPFA 3G7JA 5H5QA 2GZZA 3LGCA 5FT3A 2O85A 2TRCP 4LA1A 1TRSA 1GNWA 5ECHB 3CXGA 2ON5A 1TXXA 3TKSA 4G19A 5E59A 1G6YA 2CZ2A 4IQAA 1W89A 5HQPA 3E3EA 2VM2A 5JWRB 4AJ7A 5IO0A 5G5FA 3FRCA 2LRNA 1B9XC 4HZ4A 1OC9A 1UC7A 19GSA 2L59A 4JEDA 1M2BA 1ILOA 2JZTA 3TUEA 3IR4A 4EDYA 1EOGA 3FR3A 1VF2A 2C4JA 4GSSA 4PGTA 5F05A 1SD9A 3KIJA 1ACVA 1YKCA 2FGXA 2H72A 4XIHA 1EP8A 1SJZA 2PN8A 3UIWA 1OYJA 2JSZA 1YQ1A 5DDLA 2PU9C 1M7TA 3VWVA 3E9JB 3H8QA 3NIVA 3M8NA 5DAKB 5ECKB 3QAGA 2N5BA 3ISOA 4N0ZA 4YH2A 3EU3A 2VIMA 4KGIA 1YJ6A 2B5XA 2OE3A 5DCGA 5JCWA 1U6TA 2R4VA 4KUNA 3VLNA 3J7Yb 1QK8A 2DJ0A 3LSZA 4TW5A 1BG5A 3ZIVA 4ZB9A 4BL7A 2F8AA 4WBJA 3I6AA 4IGJA 4N30A 4LLRA 3H4KA 4GLTA 1MD3A 2EIQA 2DSAA 2C0GA 1SJIA 3IHQA 5CO3A 1ZYEA 2Z9SA 1SKSB 2FUG2 4WF4A 1TI3A 5ECOB 3UBLA 1G7EA 3QAWA 3M3MA 3A2WA 3L78A 3FZ9A 2PBJA 2DBCA 2IL3A 2CX4A 4EO3A 3FKFA 3IK9A 3P90A 2O8VB 3O3TA 4NWYA 2O89A 4IP1A 4IJIA 3ME8A 4XS4B 4KW6A 2OE1A 3FW2A 1WMJA 1URMA 2H0IA 5DAKA 3L0HA 3SWLA 1EEMA 2JADA 2I3YA 5A5KA 4EL1A 2KOKA 1F6MC 2H70A 3DRNA 3DGQA 2IIYA 4N11A 3TGZA 3CSJA 2G0FA 2H74A 2L4QA 1PD21 2GLRA 3MAKA 2NPBA 2X8HA 3ERWA 3F4SA 2C0FA 1GSFA 2I1UA 1K0BA 1T4ZA 4QL9A 1MDIA 5ID2B 1F37A 2GGTA 2IWTA 5HR1A 2IMKA 2YWIA 3EMXA 2CAIA 3HA9A 1XW9A 3VWUA 4MP4A 2HLSA 3D0ZA 4NXIA 4V1Ag 3TJBA 3TOTA 2PWJA 1XFLA 4X1UA 3VWWA 3ZYWA 3LXZA 4F2IA 5ECRB 3MNGA 1YDKA 2YPMA 1X9SB 5IMFA 1KTEA 3KM6A 1DUGA 5DJLA 2X64A 4MH3A 1EZKA 5HR3A 4XS4A 3TKQA 1TK8B 2JSYA 2YWOA 1PL1A 3BBYA 4V2MA 2FCHA 4KA0A 2QKEA 3TB2A 2CVDA 4K2DA 5F06A 2OKAA 4K7IA 3RHBA 1VF1A 1A2MA 5ECIB 2KUCA 1XWGA 4OWYA 5HR0A 3QAVA 1OC8A 4POBA 5ECQB 2H1DA 2L6DA 3F63A 4CW9A 2GTUA 3GKKA 4HZ2A 1XWAA 3IXRA 2V2GA 2P5QA 2X8GA 3UBKA 1SKRB 3ZMLA 4IELA 2PMTA 1NM3A 1J08A 1WJKA 6GSXA 2BTOT 3BD2A 4BVXA 2GVPA 2YWMA 1Q4JA 4OFMA 2VL3A 4ZL9A 1G6WA 3TRPA 4GQCA 4NPBA 1HD2A 1LJRA 3QOUA 4E8HA 2H8LA 4NHWA 1SL1B 4CDOA 3CRUA 5IMVA 3EINA 5IMCA 1Z5YE 1U88A 2H0GA 3ERFA 4FYBA 1A23A 4PUFC 2H6YA 5GSTA 2RM5A 2K6VA 4ID0A 3IRAA 1LBKA 2DMMA 1V98A 3ZZXA 3G7YA 2NTOA 4WR5A 3LXTA 1SK2A 3APQA 3BCKA 1PQNA 4IVFA 2H6ZA 3A5WA 2VLUA 2CT6A 4BVYA 3L9VA 3U5RE 1K0NA 4LMWA 1B8XA 5B6MA 4MZWA 4EUYA 1OVNA 1ST9A 3IOSA 1XVQA 5EY6A 3UEMA 1GSDA 5ENUA 3IE3A 2IYJA 1OE7A 3F8UA 4KCEA 5KN0A 3TJKA 4L0UA 3W8JA 4QL7A 5B8BA 2B5YA 2OBKA 3FYGA 4PQHA 5C04A 1B48A 1T7PB 3GHAA 3EE2A 2H66A 2C3TA 4HQZA 1PRXA 1XWCA 1QFNA 5JWQB 2OJLA 3HVXA 1Z6MA 3ZFLA 2B3SA 5A4WA 1V57A 5KN3A 4HUAA 2GZPA 1AAZA 2F8FA 5ECSA 5CYYA 1RK4A 2HFDA 3BOAA 3UAPA 3UOMA 1WE0A 1RW1A 5F07A 5J4UA 1QMVA 4GF0A 4WETA 3M1GA 2GSQA 1U3IA 3UARA 2BJXA 4YAVA 5J3RA 2VO4A 1V9WA 2VCWA 2LNTA 1JFUA 3QCPA 3I69A 4D73A 5CAXA 1DE2A 3NZNA 5A4UA 2WULA 1MDJA 1ML6A 3KH7A 1PN9A 4KH7A 2R5GA 5C00A 2IY2A 2GSTA 3GL3A 2HT9A 3FZAA 2P5RA 4ACSA 5IMDA 2AB6A 2LJRA 2J23A 4ZBDA 2RUEA 5LD0A 3WGEA 2E2GA 4J56E 3HCZA 4ECBA 3KD0A 2C1YA 4PQIA 2XPEA 3WGXA 4ISDA 1SK0A 5JCGA 1IYIA 2OE0A 4IQ1A 1OC9B 1Y6EA 2PUKC 3M0FA 1A8YA 1XXUA 1LU4A 4POLA 1Y25A 4KB3A 6GSSA 2R37A 5ELGA 2M80A 4BWSA 4G9HA 1V40A 1B4QA 1FG4A 3L4NA 3GFKA 3PINA 1M2DA 1SJ6A 5AIVA 3TRXA 2LV3A 2EIOA 2G2QA 1ON4A 3EMPA 4N0VA 5B6NA 2VUPA 4IHUA 1OKDA 1R26A 1A2LA 1WP0A 3RPPA 5GAND 1ZMAA 4GWRA 5FWGA 2OBIA 2LJAA 1UN2A 4I2UA 2YANA 2YJHA 4RI6A 5EVOA 3GSTA 4TXVA 1OAZA 3CSHA 1ZL9A 1UA5A 2CVBA 1GUMA 1PX6A 4O92A 2CZ3A 1R5PA 4K1FA 2F51A 5GZZB 2GSRA 4IP6A 1BJXA 3HVVA 1NHYA 2B1KA 3FR9A 4OMVA 2YJ7A 4JR6A 4HQSA 4QQ7A 2DJ3A 2L5OA 1YF1A 4EF0A 4MJBA 4HEA2 4ECIA 4K7NA 3A2VA 5JWOB 3CSIA 3EWLA 3PH9A 1B4PA 4TR1A 13GSA 5KN1A 3U6VA 2V1MA 5EL8A 4ECJA 4HJMA 1XOAA 4ZL7A 1ZOFA 3C8EA 5ECPB 1TK0B 3KP9A 3TDGA 3Q19A 4MMMA 3A2XA 1PSQA 2HZEB 3QR6A 5IPGA 5IPHA 1TW9A 4N10A 3ERGA 3RHCA 1VF4A 1TRVA 2FA4A 3C71A 4ZBAA 4L5OA 2RM6A 2GQKA 2IPAA 4MJCA 5G1LA 1X9WB 4LL4B 6GSYA 2VCXA 2VAFA 1DSBA 4POMA 1GTAA 4L5LA 3GURA 9GSSA 2V32A 4JBBA 2WZ9A 3IA1A 3Q74A 1HNBA 2ON7A 2FWHA 2VCZA 3HJMA 2VOCA 4OO5A 1K3YA 4HS1A 3L9SA 3QFAC 3VK9A 2WGRA 3LYKA 1OC3A 12GSA 4WEYA 3E0UA 3FR6A 2IMFA 4ZBBA 2H75A 4V1Ap 3L9UA 4GQFA 1R5AA 1OE8A 4XCSA 3WGDA 3FHKA 4MDCA 3JCML 2HRNA 1GSYA 4G2EA 4K7OA 2HYXA 3VURA 1ERUA 4HI7A 5G2ZA 2K8SA 3CBUA 1C72A 1M9BA 2HZEA 1GTUA 5COHA 2MBSA 2MMAA 6GSUA 3LEFA 1SKWB 5DVBA 5J5NA 1JLVA 2C0EA 1SL2B 18GSA 1XIYA 1Z7PA 5CRWA 3PGTA 2VL2C 4JU5A 1BEDA 1TRWA 4KDXA 4K6XA 1FHEA 3ZRDA 5G1KA 3EC3A 3GL5A 1XZOA 1DE1A 4XS6A 4KSOA 1WWJA 4FYUA 3IDVA 5AGYA 2O7KA 1FB6A 1SYRA 3P8WA 2GS3A 2VD0A 1JLWA 1KEBA 2YCDA 2DC5A 5D9VA 3D6IA 4LMVA 1EOHA 14GSA 4AF2A 4KCAA 1XWKA 4WBRD 1GSSA 5KEJA 1EV9A 1PKWA 2M72A 3WT1A 2RUFA 1GSEA 2I9HA 2LSTA 4JE1A 1A0FA 4TRXA 4IKHA 2LQOA 3GIXA 1GH2A 3D5JA 1YF0A 5CRHA 3F4TA 3GKNA 1F3AA 2N5FA 3I43A 6GSVA 1EWXA 2H6XA 1O8WA 2WDUA 4HDEA 1GWCA 2KP2A 4K9ZA 1GUKA 1M99A 1N8JA 5D93A 1QXHA 1Z9HA 5D8IA 2JACA 4KX4A 3KMNA 1GUHA 1AIUA 1JZRA 3EYTA 1FW1A 1EGRA 5JCUA 2QC7A 3Q6OA 3ZLPA 2H71A 3BCIA 1X9MB 3VI7A 1SK1A 4FO5A 4Q5NA 1O81A 3TJGA 2A2SA 1BYEA 4PQ1A 1VGLA 4OCFA 3KJYA 2F9SA 4DSSB 1JHBA 1NHOA 2REMA 3IK7A 1YY7A 5LCZA 1TKDB 1KBNA 1THOA 1EGOA 3H79A 2EC4A 3F3RA 4O7HA 3HVSA 5G31A 2FWFA 4J2FA 2L6CA 3EURA 4F0BA 4EKZA 5AN1A 2GZYA 1V2AA 2K8VA 4TR4A 2VLTA 4NAXA 2H1BA 4MF5A 2AV4A 3TKPA 2TIRA 1U3AA 1BQ7A 3KP8A 4L8EA 2MMNA 1F9MA 3CYNA 4XTSA 10GSA 1QUWA 1FVKA 2DIZA 2N5AA 3O76A 4IJ3A 1GL8A 1O8XA 4AGSA 4ULXA 1YZXA 3F6FA 2H01A 2RLIA 3OR5A 4EXJA 2B5EA 1FO5A 2ES7A 1ZGNA 2F3MA 4D73B 4MPFA 4TR3A 4KSMA 3LG6A 2WFCA 2WB9A 1AQXA 3HD5A 1NSWA 4OCEA 5CNWA 2H19A 4AJ6A 4MABA 1S3CA 4DSSA 2H1AA 4EC0A 1PGTA 5GAPD 4PNFA 3KCMA 3GA4A 4MCUA 2WJUA 16GSA 4MK3A 5LNKe 1X0RA 2PPTA 3HJPA 3HZ8A 2PERA 22GSA 4XRDA 4P3YB 2CQ9A 2L4CA 1GNEA 5F8BA 4HU7A 4ML1A 4IW9A 1TDIA 2PVOC 2RIIA 1ZZYA 2FWGA 2GSSA 3HZ4A 4NHZA 1M2AA 1PL2A 1TOFA 4K0NA 4TXOB 5FHIA 2YZHA 5ELAA 3CTFA 2R6KA 3HKRA 1T3BA 4HU9A 3GKXA 4XS1A 3N9JA 1PA3A 4V2NA 1GLPA 5B8AA 3LORA 1K3OA 2EIRA 1N2AA 3UL3A 2HSHA 4GSTA 4CHSA 1RQMA 2IMEA 1TU7A 4IS0A 2XBIA 1TTZA 3J7Yk 4YQUA 4PUAA 2C8UA 1NW2A 5INYA 17GSA 1O7UA 4PXOA 1KNGA 5G5EA 1AC1A 5CRGA 1TRUA 20GSA 2O87A 2YV7A 1ERWA 3DD3A 1GSQA 1ZYQB 3GN3A 2FHEA 1WOUA 3C7MA 4OD7A 2C3NA 5IOXA 3GX8A 2YV9A 3HY2A 2YZUA 2V6KA 2P0GA 2C80A 1GLQA 1A2JA 3D4TA 5E4WA 4POKA 1CQHA 4DEJA 3IAM2 1I5GA 4ZL8A 5G30A 3DIEA 4XRAA 1XWBA 3TOUA 2GT5A 2VCTA 2MMOA 3ME7A 3KTBA 3IPZA 4TXOA 2R3XA 1WRYA 4YAPA 4MJAA 3TJJA 3GH6A 1YKAA 4MZBA 4Q5RA 2IFQA 2VL9A 1CQGA 3ZVJA 2LJKA 4DSQA 3W8SA 2NVLA 4X43A 4TR1B 3F3QA 1M0UA 2L5LA 3HXSA 2QSIA 3FEUA 1G7OA 1ZCPA 4NV5A 3UMAA 4O32A 2GT6A 2MMZA 3D4MA 3F4RA 3LYPA 4OO4A 2VLVA 1E2YA 3W6GA 4WF5A 1TI1A 3FK8A 2VD1A 1GTBA 3VFIA 1HQOA 3H1NA 1K3LA 3DEXA 2B7JA 1AQWA 2HI7A 4FYCA 3GRXA 3APSA 3I9V2 4Q5QA 4KNDA 5J9BA 2WCIA 4X0XA 3UVTA 3VWXA 4DVCA 3F0IA 2X8CA 5ECMB 1MDKA 5IMZA 1R4WA 3TKSC 1K0AA 1XVWA 2K9FA 4MH2A 1BX9A 2YNXA 2B6MA 4NMUA 4WR4A 4TN8A 3KH9A 1GP1A 2JZRA 5D9WA 4JR4A 2X99A 1XPVA 1USBA 2LEGA 2DJJA 5F0GA 2WRTA 4F0CA 1SU9A 1ABAA 1H75A 2DJKA 4GTUA 4MLYA 1HNCA 1PKZA 2ZCTA 2VCVA 5AIXA 7GSSA 1UVZA 4MA9A 1V58A 3VI5A 4O5RA 2YOIA 1Q98A 5L71A 3WT2A 2BMXA 2OA7A 2PVQA 5HFGA 2AHEA 4E8EA 2IJYA 2C3QA 3LFLA 2AAWA 4F82A 2V41A 3RDWA 1S3DA 2CAQA 2QGVA 4H86A 4K8MA 1J0FA 1WPIA 4J57E 3GUSA 3V1WA 3EVIA 4PURA 4V2LA 1K0MA 4KDUA 1OKTA 4WXTA 3R2QA 1U87A 2R2JA 2H1GA 1IYHA 1SL0B 1I9DA 1JZDA 3TKRA 3G7IA 3CTGA 3D21A 3P2AA 3KTLA 5HFKA 5HFIA 5AISA 3KZQA 2A2RA 2LNSA 3IAS2 4RI7A 3ED3A 3UVHA 1AW9A 3WD6A 4GSNA 4ML6A 1K0OA 5H5RA 2JU5A 3GX0A 1YEXA 1R7HA 1FAAA 3N5OA 1A24A 2DJ2A 1TU8A 1QGVA 1TP9A 1BAYA 3FZ5A 1S3AA 11GSA 3HYPA 4GCIA 4KDYA 4I2TA 3RBTA 3DXBA 4EDZA 3CRTA 2FWEA 1HNAA 1G0TA 4BA7A 4Z7XA 3QFBC 1QQ2A 1XW5A 2XC2A 1T00A 3QPMA 2LRTA 2HRFA 2VL2A 3GV1A 4WKWA 3RPNA 2OADA 2CVKA 2LKUA 5HR2A 3HDCA 2H30A 2MBTA 3GYKA 4LL1B 2E0QA 1X5EA 3A3TA 3H93A 1Z7RA 4GRFA 2B1LA 1X5CA 3GKMA 1FB0A 2P31A 2H73A 1E6BA 4HJ2A 1W4VA 2LRCA 3S9FA 3ZTLA 2JL4A 5IQYA 1O85A 4OFNA 2K18A 3EU4A 5D9XA 1AXDA 3TKSE 3LJRA 4GXZA 2FNOA 4FIWA 3TJFA 4EE0A 2CX3A 6GSWA 2J9HA 2XPDA 2HNLA 1HYUA 4MF7A 5DBQA 5DJMA 5CREA 3MSZA 3ZFBA 5D73A 2I81A 1Z6NA 2H76A 3M9JA 1X5DA 2DLXA 5DALB 3QDNA 3P7XA 1O73A 3K8NA 4TOPA 5CRDA 1Z3EA 3UJ1A 4MZCA 2HE3A 4ZB8A 1PMTA 4DSRA 1B9YC 3O6TA 3GTUB 3LWAA 4MJEA 1GRXA 1J9BA 4I5QA 2LS5A 2VM1A 1A8LA 3VPTA 3DVWA 5IOWA 1T1VA 2NBSA 4RQRA 2PGTA 3MWHA 2IN3A 1O6JA 2HZFA 4RQXA 4G10A 3F6DA 5ECLB 5ID2A 2HXKA 1MD4A 2GDRA 3ZL5A 2FY6A 5DCHA 3C1RA 1VRSD 4L0WA 3GH9A 2KHPA 1AUCA 1MTCA 4ZILA 2KP1A 3DMLA 1XW6A 3GMFA 5IIZA 3ZMKA 5D96A 3CMIA 5GSSA 2LUSA 4I6XA 5B7CA 5DALA 3KGKA 8GSSA 2AJQB 4HOJA 4KAEA 1JZOA 2HSYA 1T4YA 3QMXA 4AJ8A 3US3A 4BPYA 2C0DA 4ECCA 1A0RP 2L57A 3GTUA 3MDKA 3AY8A 2YWNA 5KN2A 1TJDA 5D9TA 3SBCA 3Q18A 2H0HA 1ERVA 4YQMA 1ERTA 1THXA 3C73A 1AQVA 2JZSA 2CA8A 3DKSA 2I4AA 1SYXA 4Q5FA 4RUVA 2B7KA 6GSTA 1PX7A 2LQQA 1SENA 5A4VA 2E7PA 3GSSA 4TKYA 5IM9A 3FY7A 2IMDA 2GQMA 2D2ZA 1F3BA 4ZIJA 3QD9A 2ZUPA 1T8EB 5J41A 2AYTA 4YQVA 1WIKA 1K0DA 1FVJA 4ILFA 3LQ7A 2IFQB 1K0CA 4MPGA 1MEKA 2FD3A 2XBQA 1SD8A 4IBPA 3DWVA 2DMLA 5IO2A 3HJOA 2VCQA 3IC4A 2YP6A 3D22A 3BJ5A 4FH8A 1FOVA 5ABRA 3ZVJD 2DJ1A 2ALBA 2ZNMA 5H5SA 1DBYA 3FZ4A 3ZIJA 2V6OA 4IN0A 3IBHA 2NDOA 3NOFA 4F03A 2FA8A 1XOBA 2E2MA 3G9BA 2IMIA 5IMAA 3APOA 4OFTA 4PX1A 3KMOA 3TCOA 1TK5B 3DYRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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