4ILFA

Crystal structure of dsbc r125a from salmonella enterica serovar typhimurium
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
AMDPEFMDAAIRQSLAKLGVQSTEIQASPVAGMKTVLTHSGVLYVTDDGKHIIQGPMYDVSGAHPVNVTNKLLMSQLNALEKEMIVYKAPDEKHVITVFTDITCGYCHKLHEEMKDYNALGITVRYLAFPAQGLESQAEQDMKSIWCAKDKNKAFDDAMAGKGVKPASCDVNIADHYALGVQLGVSGTPAIVLSNGYVVPGYQGPKEMKAFLDEHQKQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbC
publication title Crystal structure of the periplasmic disulfide-bond isomerase DsbC from Salmonella enterica serovar Typhimurium and the mechanistic implications.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 69
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 4ilfA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ilfA02
2X8GA 3QMXA 4E8HA 4CDOA 1WE0A 5CP1A 1WOUA 4KNDA 5JWQB 6GSSA 3DRNA 3GHAA 3QDNA 4EKZA 4D73B 3HYPA 1GSUA 3M3MA 1IYIA 3F6DA 2YZUA 2E2MA 22GSA 3ZZXA 2VL2A 3TKRA 4PGTA 2NBSA 3UBKA 5IMDA 4MH2A 3UIWA 4NXIA 3D0ZA 4J2FA 3HVSA 5AIVA 1QGVA 1XOBA 2F51A 2WGRA 1A8YA 4LL1B 4XIHA 2LNTA 5ECHB 5AN1A 3GFKA 4CW9A 3GRXA 4MDCA 4MJBA 5G5FA 3VLNA 3ZTLA 3F4RA 5CREA 3TJGA 2R3XA 2HE3A 1J08A 2JZSA 2M46A 4MZCA 5IMFA 4IHUA 4KDXA 2LRCA 1ACVA 4YQVA 1K0MA 4IP6A 5ECMB 3D22A 3L4NA 4KCEA 1YQ1A 3ZVJD 2K9FA 4ZL9A 2CQ9A 2YN1A 3G9BA 4I2TA 1SKRB 1CQHA 3LYPA 1ZGNA 2WCIA 1R5PA 2QKEA 1ON4A 3WGXA 13GSA 2O85A 5IOXA 4ZL8A 3PH9A 3K8NA 2V32A 5D9VA 3TDGA 1BG5A 1TI1A 1EWXA 4OO4A 5D96A 2WZ9A 2RM6A 4EE0A 4N0VA 1PD21 3HJOA 5HR1A 1EV9A 1A24A 2LKUA 5J41A 4O92A 1PN9A 5IPGA 4MF7A 3LEFA 2H0GA 3WGEA 2MZCA 5AIXA 3C1SA 1TK8B 5D9TA 4OFTA 4GCIA 2K8VA 4Z7XA 4MZBA 3M8NA 3VWWA 3RHCA 3PR8A 3GL5A 2B1KA 3VFIA 1FAAA 4L0WA 2H0IA 1GUMA 1OC8A 3CSIA 5CRGA 2MMOA 4ECCA 1TRUA 4X0XA 4BWSA 4NV2A 4NHZA 2P5QA 3QAGA 5IMCA 3ZMLA 2OE1A 1MDKA 4EDZA 2C4JA 1ABAA 3KH7A 3EU4A 2FUG2 3RAZA 4EVMA 1PSQA 4V2NA 4PNGA 3KCMA 6GSTA 2HSHA 1THXA 4ACSA 1OKDA 3BOAA 1TI3A 3C73A 3NIVA 1NSWA 2CT6A 2IL3A 6GSWA 1Q98A 2C1YA 2GLRA 3F9UA 2JL4A 4F9ZA 5LCZA 2HXKA 2GQMA 1B4PA 4MPGA 3FR3A 5A4UA 3FZ9A 5ECPB 4KGIA 1FVJA 1VF2A 4IJIA 1O7UA 1B48A 2GSSA 1Z9HA 2F3MA 4O32A 4PUFC 4EL1A 5HR2A 3L9UA 1G0TA 1TOFA 5HFGA 2YJHA 3OR5A 4L8EA 2VM2A 2JZRA 3EURA 4PQIA 3F0IA 4JE1A 3GUSA 2VCWA 2VCVA 1VF3A 1F3BA 5B6NA 1E2YA 1PKWA 4I2UA 5EPFA 2H1BA 1T4ZA 2AUVA 3KTBA 1A2LA 2HZEA 2MBTA 2C3NA 2L6CA 3F63A 4OD7A 3IBHA 3WT2A 2HT9A 3GX8A 1HYUA 2C0FA 4N30A 3CTFA 3QOUA 2L59A 4TOPA 3UEMA 2H71A 4TW5A 1PRXA 4NWYA 1T1VA 2CVKA 3C71A 5HR3A 2CAIA 3SBCA 1YF1A 2R4VA 2TRXA 1OE7A 1C72A 4OFNA 3DVWA 4HJ2A 1ZL9A 2ZNMA 3EVIA 2J9HA 4TR1A 3TKQA 2IPAA 3KD0A 3F3RA 3GIXA 4OWYA 1FW1A 4EXJA 4P3YB 1SJZA 2WRTA 1AUCA 2DJKA 2PERA 2R6KA 2YP6A 1T00A 1M2BA 2OA7A 2O87A 4WKWA 3LGCA 1ERTA 1OKTA 5JWRB 4BA7A 5IMVA 1K3OA 2B7KA 5H5QA 1BEDA 1ZCPA 2OADA 2J23A 3HVVA 3KH9A 2LEGA 2G0FA 3ISOA 5DCHA 5JCUA 1AW9A 1YDKA 3VPQA 3DGQA 1M0UA 4ZL7A 1UC7A 4Q5NA 2DJJA 3WT1A 3V1WA 3G7JA 2OBIA 3FR9A 1TJDA 2VAFA 1VF1A 5CO3A 4BPYA 1GUHA 1N2AA 4NAXA 4ZBBA 1GTUA 2IFQA 4NMUA 2CX3A 3C1RA 3RHBA 6GSUA 1WIKA 3TRPA 4HEA2 1Z7RA 5ID2B 1K0OA 1U3IA 3CRTA 3W8SA 1U3AA 1PQNA 5A5KA 4KCAA 4PQ1A 4IP1A 1O85A 1U87A 2FD3A 1R7HA 1XZOA 7GSSA 1KBNA 5DJLA 4F0BA 2HI7A 4GRFA 1Z3EA 4PX1A 1OC9B 4POLA 2P0GA 4IJ3A 3PGTA 5IMAA 5HFKA 2HSYA 2L57A 2H70A 4DVCA 3TB2A 4JBBA 1SD9A 3PINA 3M0FA 2BTOT 4ML1A 2M72A 2I9HA 1CQGA 4K6XA 2YWIA 2P31A 3L9SA 4L5OA 2VCQA 2MMAA 2VM1A 4XRAA 3ZFBA 2HYXA 4AF2A 3I6AA 2OJLA 4JEDA 4JRRA 1YY7A 2X8HA 2CAQA 3FEUA 5DQYA 4V2MA 5DVBA 5A4VA 4K0GA 4ZXGA 3SWLA 1T3BA 3HY2A 5G5EA 4EO3A 2FWGA 3IR4A 2HLSA 1DSBA 3DMLA 3FZ4A 3GA4A 3F4SA 3Q6OA 5IM9A 1ZMAA 2IWTA 4J56E 1EP8A 2C3TA 1A2JA 1JZRA 2H1GA 3TKPA 4MA9A 3LXTA 1XIYA 2FY6A 4KSMA 4JR4A 2LV3A 4YAPA 1XW6A 2FA4A 3BCIA 2RIIA 4BWQA 2A2SA 4TR0A 2I1UA 2RLIA 4DEJA 3LORA 3FR6A 4HU7A 4PQHA 5JCGA 2H1AA 5E59A 5IQYA 3H1NA 5B8BA 2B3SA 3ERGA 2LNSA 5D9WA 3P8WA 4DSSB 3EE2A 4E8EA 1XVWA 3EC3A 5JWOB 2KUCA 3FZ5A 2YOIA 3MSZA 1T8EB 3C8EA 1M9BA 3GL3A 1J9BA 2GZZA 1X5CA 1N8JA 3CSJA 1MD4A 1S3CA 1HD2A 1SKWB 1XOAA 5DALA 4ZB8A 3BD2A 1QMVA 3G7YA 2IY2A 3KMOA 1V57A 1X5DA 2N5BA 1SKSB 1LJRA 3NZNA 2A2RA 4I8BA 4NV5A 2H74A 2XBQA 3VWUA 4KUNA 5F8BA 2DJ1A 2FLSA 2WDUA 4ML6A 2YCDA 3HZ8A 3Q18A 1QQ2A 3IV4A 2B6MA 2MYGA 1S3AA 5EY6A 4IVFA 1WWJA 3TUEA 1XBSA 1R5AA 2VCZA 1QFNA 1PKZA 2FWEA 2IYJA 3ME8A 14GSA 3QAVA 3US3A 1V58A 4HZ4A 4GWRA 1JLWA 4QQ7A 1NHOA 12GSA 1B9YC 1GSQA 1XCCA 4OCEA 1XWKA 3ZMKA 3TOTA 1WMJA 2WJUA 1MDJA 1YKAA 4GLTA 4TR4A 3GKMA 4WR4A 1YJ6A 2I4AA 1G7OA 4HS1A 2YV7A 4XS1A 4XS4A 2X99A 5IPHA 2MMZA 1USBA 1KTEA 1Y6EA 1M99A 4BVYA 4AJ8A 1OYJA 2YNXA 3GH6A 2QC7A 4WBRD 3ME7A 3DEXA 2WB9A 4XS6A 5FT3A 1WRYA 3EMXA 2FA8A 4WF5A 4RQXA 5KN1A 3LWAA 1ERVA 1GNEA 4KAEA 4QL7A 1F37A 1A0RP 1FB6A 3IC4A 3CXGA 1HNCA 4EC0A 16GSA 2VD1A 2GDRA 4TN8A 2C0GA 2V41A 3N5OA 3KP9A 3IDVA 1XXUA 1NW2A 3LYKA 1SD8A 1YF0A 2B5EA 2R2JA 4ECJA 3C7MA 2XPEA 2TIRA 4GXZA 1SU9A 2GS3A 3WYWA 1DE1A 3FK8A 5GSSA 1VF4A 1SJIA 3O3TA 2GQLA 2LTKA 4JR6A 3GV1A 1B4QA 2VUPA 4Q5FA 2DIZA 2C3QA 2AJQB 1TXXA 2VLVA 2LUSA 4MF5A 4F2IA 4TR3A 3ZREA 1BQ7A 1JHBA 1TP9A 3LQ7A 4MH3A 2PVOC 3I43A 4KB3A 4HZ2A 3IK9A 4XTSA 2N5FA 1V9WA 3H79A 3IPZA 3UOMA 1Z6MA 1EEJA 1YEXA 2LRTA 4LMVA 2VOCA 1GSSA 3GH9A 1SL0B 4PXOA 2JACA 4WEYA 4L5LA 1XW5A 2FHEA 3HZ4A 3UBLA 2HRNA 4TXOA 3CTGA 3KIJA 4G10A 10GSA 1W4VA 2NDOA 2ALBA 4HDEA 1RW1A 2H6ZA 3UL3A 4FYCA 3EWLA 1Q4JA 1XPVA 4G2EA 3I9V2 1BX9A 1GSEA 3CYNA 2JSZA 5G30A 4K7NA 1GL8A 2YJ7A 4MABA 4TVEA 4BVXA 5ECSA 2ON7A 2KHPA 3DD3A 4HQSA 5H5SA 4QL9A 1HNAA 5DQSA 4IGJA 4YQMA 1K0NA 3D4TA 1LU4A 2GSTA 2GSQA 5KN2A 3N9JA 2IMEA 2LRNA 3GN3A 4GSSA 1EGOA 5ECLB 3H8QA 2AV4A 3J7Yk 4POBA 4F82A 1GWCA 1U88A 2DJ3A 2QSIA 3D6IA 2HZEB 2PWJA 4X43A 4MP4A 2K6VA 2DLXA 5ENUA 2GZYA 4G19A 1XWCA 3TRXA 2PPTA 3LG6A 4G9HA 18GSA 1XW9A 1K0BA 3GTUA 4V1Ap 3ZFLA 3TCOA 2EIOA 3GSTA 2WULA 5HQPA 1GTAA 4LA1A 2WS2A 1AQWA 4IBPA 2IIYA 2TRCP 5AISA 2B5XA 1GSFA 3APSA 1THOA 1NM3A 4XCSA 2ZUPA 1XVQA 2FCHA 1MTCA 1AAZA 3DWVA 4IELA 1XWBA 1BJXA 5F05A 4KX4A 2LJRA 4ISDA 3QR6A 4TR1B 4LMWA 4O7HA 3A2VA 4RI6A 3CMIA 4PURA 4YAVA 4IS0A 4MZWA 1MEKA 2C8UA 2DJ0A 2VL2C 4GSNA 5INYA 2D2ZA 3R2QA 3VURA 5J9CA 3QD9A 4EDYA 1EOGA 1ML6A 4V1Ag 2H01A 2C0EA 2VCXA 3HXSA 3A5WA 3VWVA 2EIQA 3QCPA 20GSA 1XWGA 4PNFA 1RK4A 2GT6A 1B9XC 1GSDA 3HDCA 3H4KA 3EINA 5IMZA 2DMMA 3DVXA 5IO0A 1FG4A 3ERFA 4ZBDA 5FHIA 1EP7A 4L0UA 1S3DA 4OFMA 5G2ZA 2L5LA 2GVPA 1TDIA 1PL1A 2H6XA 1OE8A 3ZIJA 1GUKA 2OACA 2IFQB 2PUKC 3HVXA 6GSVA 2VLUA 2ES7A 1MD3A 2YZHA 6GSYA 3P90A 1KNGA 3FZAA 4K8MA 1QXHA 2KP1A 2XHFA 5HR0A 4ECIA 4POKA 1HQOA 2IMFA 2OKAA 2YV9A 1WPIA 5KEJA 5GAPD 4J57E 5D73A 1SYXA 5DCGA 2B1LA 1EEMA 3TJBA 1TK5B 2IMDA 3FW2A 3IAS2 3KMNA 1A23A 1YZXA 2RUEA 1F3AA 2BJXA 1ST9A 3RPPA 3Q74A 1EGRA 2CZ2A 4TXVA 1WP0A 1OVNA 1TRWA 5COHA 1V98A 1ZZYA 5L71A 3W6GA 3KTLA 2V6OA 1E6BA 5DAKA 5ELAA 1T4YA 1U6TA 1VGLA 4KDUA 4WXTA 4ECBA 2YWOA 4CHSA 2PN8A 1YEPA 2K18A 1GTIA 1MDIA 1EOHA 2K8SA 1NHYA 1I5GA 1TTZA 3APOA 1GTBA 1M2DA 3Q19A 3UAPA 4GTUA 3CRUA 4DSRA 3HCZA 4LL4B 5IOWA 2P5RA 4AJ6A 3QFBC 4K7IA 3NOFA 2EIRA 1A8LA 4IW9A 2MMNA 3MWHA 1JZDA 4FH8A 1H75A 2NPBA 3IRAA 4FYBA 5G1LA 4TKYA 2X8CA 5AGYA 4MJCA 5F0GA 1O6JA 4X1UA 1V2AA 3UVTA 4ZILA 3IHQA 4Q5QA 5ABRA 2V1MA 1X9SB 5J9BA 2AAWA 2KLXA 4D73A 5ECIB 3D4MA 5IO2A 1H4OA 3LJRA 2X64A 2E0QA 1QK8A 1TRSA 3ZLPA 2H30A 3TJJA 4K2DA 3L0HA 5LD0A 5ECRB 5GZZB 4N11A 4PUAA 3ED3A 3A2XA 1X0RA 3RPNA 4ZIJA 2DBCA 1PX7A 4OMVA 3S9FA 3GYKA 3F3QA 1SK0A 3E0UA 1LBKA 2IMIA 5C00A 1AQXA 5A4WA 3TRQA 2YPMA 4IN0A 4F0CA 4H86A 5DALB 1TU7A 1W89A 4BL7A 1O73A 4YQUA 2ZCTA 2DJ2A 4IQAA 1M9AA 2LQOA 4GQCA 1AIUA 9GSSA 1K0DA 1O81A 5ELGA 2XBIA 5CRHA 3O6TA 5ECOB 3RBTA 2B5YA 4OCFA 3GNJA 1J0FA 2H72A 1GH2A 5KN3A 1GP1A 4WBJA 1JLVA 1EV4A 4LLRA 4KA0A 3DYRA 3ZVJA 4GQFA 2MBSA 3ZITA 5CRDA 3IK7A 4YH2A 4K1FA 4I6XA 4HI7A 4IKHA 1SYRA 2GZPA 1PX6A 1K0AA 1SENA 2L5OA 5B8AA 4MMMA 4NPBA 5EVOA 2VL9A 3GSSA 2PMTA 4ULXA 4N10A 3WGDA 2LS5A 2NTOA 4NHWA 3TJFA 3WD6A 2FNOA 3M1GA 4WR5A 2N5AA 3F6FA 2XPDA 2C80A 4XS4B 3CSHA 1UA5A 1V40A 1DBYA 1SK2A 3UJ1A 1GLPA 1SL2B 5B6MA 2AHEA 1A0FA 1M7TA 5C04A 3ZIVA 1FO5A 3VI5A 5J4UA 3KJYA 3IAM2 3HA9A 5CYYA 5ECQB 2PVQA 2C0DA 2HRFA 3KXOA 3KP8A 3GKKA 3HHVA 1JZOA 3KM6A 2FWHA 3M9KA 3FRCA 1O8WA 2V6KA 1GLQA 2CVDA 3L9VA 2H76A 1XFLA 4EUYA 2GGTA 4V2LA 5IIZA 3ZL5A 3TKSE 2GTUA 3GX0A 3TJKA 3I69A 2CZ3A 4AJ7A 1UN2A 1GULA 1ILOA 2KOKA 1PMTA 4JZQA 2DIYA 3HD5A 2JZTA 3E3EA 2IN3A 2CV4A 2IJYA 4ID0A 4RI7A 2H1DA 4EF0A 1HNBA 2QGVA 1M2AA 2E7PA 4F03A 1BAYA 2HNLA 1PL2A 4FYUA 3EU3A 1SJ6A 2HZFA 3H93A 3VWXA 1GRXA 2O8VB 3GURA 3J7Yb 5DBQA 3QFAC 3E9JB 2BMXA 3A3TA 8GSSA 3VK9A 1AQVA 4MF6A 1TU8A 1BYEA 5GAND 1FVKA 1FB0A 3U5RE 2KP2A 4POMA 1JFUA 5JCWA 2Z9SA 3G7IA 1DUGA 2VCTA 5EL8A 5F07A 3BBYA 3TKSC 4DSQA 3EMPA 4ZBAA 3UARA 4TXOB 4K7OA 2H8LA 3FY7A 2VL3A 1F2EA 3W8JA 2I81A 1PA3A 2VD0A 1A2MA 4MJAA 4JU5A 4OO5A 4ZB6A 2DC5A 1OC3A 3BJ5A 1RQMA 3FHKA 1OAZA 3AY8A 5H5RA 3DKSA 17GSA 2LSTA 5D8IA 5G1KA 1EZKA 2A4VA 4KDYA 1Y25A 3IA1A 1O8XA 1DE2A 2H66A 2V2GA 1X9MB 2DMLA 4KH7A 2JU5A 2R5GA 2F8FA 4K0NA 3ZYWA 2DSAA 2H6YA 1ZYQB 2GSRA 11GSA 3A2WA 1ZOFA 3GTUB 5FWGA 4RQRA 2YWMA 1R4WA 1G6YA 2GT5A 2H19A 3F8UA 3RDWA 1F9MA 3VPTA 2GQKA 1GNWA 3HJPA 2G2QA 2L4CA 1PGTA 2OBKA 1Z6NA 2F8AA 2E2GA 2IMKA 2I3YA 1KEBA 5G31A 3CBUA 2PBJA 3KZQA 3L78A 3F4TA 2LJAA 5D93A 4FO5A 2CVBA 3MDKA 3FKFA 1SK1A 3GMFA 3UMAA 5ID2A 4MPFA 1TK0B 2OE0A 19GSA 1R26A 5F06A 3MAKA 3MNGA 2H75A 3JCML 5E4WA 1I9DA 5LNKe 3HKRA 2AB6A 5D9XA 1X5EA 2JSYA 3VI7A 5GSTA 1Z7PA 2LQQA 1OC9A 1QUWA 3LSZA 1IYHA 2FWFA 4HU9A 2YANA 2O7KA 4MLYA 4KW6A 5KN0A 3U6VA 4RUVA 3P2AA 1UVZA 1Z5YE 4MCUA 4IQ1A 4ZB9A 2H0HA 2NVLA 3D21A 5DDLA 1T7PB 3EYTA 3QPMA 2OE3A 1TKDB 1JZWA 3ZRDA 5CNWA 3IOSA 4I97A 2WFCA 2L4QA 3ERWA 3UVHA 2HFDA 5ECNB 4HQZA 2B7JA 4ILFA 4GF0A 3BCKA 1ERWA 3QAWA 2PU9C 2O89A 6GSXA 2PGTA 3TOUA 1AC1A 4KSOA 1F6MC 3GKXA 2CA8A 1X9WB 2RUFA 2VLTA 5ECKB 3O76A 3APQA 4HJMA 3IXRA 1K3YA 4K9ZA 5DJMA 2AYTA 3D5JA 3HJMA 4I5QA 4MK3A 4AGSA 3KEBA 1YKCA 1TRVA 1FOVA 1FHEA 3DIEA 1URMA 5B7CA 2H73A 3TKSA 1K0CA 2YWNA 2ON5A 5CRWA 3P7XA 4WETA 1G6WA 3GKNA 4GSTA 4HOJA 5HFIA 2CX4A 1SL1B 4MJEA 5J3RA 4WF4A 5DAKB 1XWAA 4XRDA 3KGKA 2VO4A 1VRSD 3LFLA 2RM5A 4TRXA 4XHMA 1B8XA 4DSSA 3IE3A 3TGZA 2FGXA 1G7EA 4HUAA 4FIWA 2XC2A 3LXZA 1ZYEA 4N0ZA 2R37A 2F9SA 3FYGA 4O5RA 1GSYA 3M9JA 2EC4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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