4ILFA

Crystal structure of dsbc r125a from salmonella enterica serovar typhimurium
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
AMDPEFMDAAIRQSLAKLGVQSTEIQASPVAGMKTVLTHSGVLYVTDDGKHIIQGPMYDVSGAHPVNVTNKLLMSQLNALEKEMIVYKAPDEKHVITVFTDITCGYCHKLHEEMKDYNALGITVRYLAFPAQGLESQAEQDMKSIWCAKDKNKAFDDAMAGKGVKPASCDVNIADHYALGVQLGVSGTPAIVLSNGYVVPGYQGPKEMKAFLDEHQKQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbC
publication title Crystal structure of the periplasmic disulfide-bond isomerase DsbC from Salmonella enterica serovar Typhimurium and the mechanistic implications.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
molecule tags Isomerase
total genus 69
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 4ilfA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ilfA02
2G2QA 3LYKA 3UBLA 1RK4A 4K0NA 3IXRA 4IVFA 1FAAA 3C73A 2H73A 2PUKC 4ZL7A 4ILFA 4Q5QA 3F3QA 2GVPA 1K0AA 1GTAA 2OBIA 3FR3A 2C80A 2LJRA 5D9TA 5LD0A 3IC4A 3TKSC 4GSTA 1USBA 4PNFA 4PQHA 2HYXA 5IQYA 2MMZA 1AW9A 1O85A 2V32A 3W8SA 1J9BA 2H1DA 4OFTA 3Q6OA 1Z6NA 1FB6A 1H75A 5JCGA 4OD7A 2AB6A 1A23A 3WGDA 2I4AA 3M3MA 4I2UA 4GTUA 5J5NA 1ABAA 1THOA 2HFDA 3HA9A 3GYKA 4TRXA 3GKMA 1LBKA 4HZ4A 2H19A 3IA1A 5LCZA 1QQ2A 4MZWA 2WFCA 4Q5FA 2RUFA 3TGZA 3U6VA 20GSA 2B3SA 2C3QA 3MNGA 2K8SA 1SD9A 1PKZA 3UIWA 1S3AA 1EOHA 3APOA 2OE3A 3EWLA 4TR1A 1RQMA 3D4MA 1TJDA 2N5FA 2L4QA 4PX1A 3F8UA 1NHYA 3VK9A 2FA4A 2JZSA 5EPFA 1EP8A 1SD8A 1R5PA 4ZILA 1WMJA 17GSA 1K0DA 2YCDA 1F9MA 1PKWA 3LXTA 3US3A 2MBTA 4F0BA 2V41A 4JRRA 2FGXA 2CX4A 3TB2A 4TW5A 2KP1A 2JACA 4HI7A 6GSTA 5CP1A 1XWGA 4NHWA 1PA3A 2H1GA 3LG6A 3BCIA 1PGTA 7GSSA 1GWCA 5CYYA 2V6KA 1X9WB 4HOJA 1CQGA 5INYA 3HVVA 2GSSA 1GSSA 1GSYA 5F06A 5ENUA 1TOFA 4L5LA 2CQ9A 4OO5A 1R26A 3RHCA 4N30A 3O6TA 4TXVA 5EVOA 1GLPA 4RQRA 5ECOB 4K1FA 3VI7A 3Q19A 3ERWA 5ID2B 3GRXA 3DKSA 3HYPA 3TDGA 3H8QA 1ERTA 5HFIA 3QMXA 3ERGA 5JWOB 3GKXA 3MAKA 4OMVA 1X5CA 2MMAA 2B1LA 1O6JA 4FYUA 1O7UA 1K0CA 2RIIA 2QC7A 3G7YA 2TIRA 1F3BA 2AAWA 5IPHA 3UJ1A 2OADA 3PGTA 4MPGA 5DALA 4IJIA 4IQ1A 3TJFA 1EV9A 1M7TA 2DJKA 3EU3A 1V2AA 3JCML 3D21A 4POKA 5F05A 1TK0B 1JHBA 1OKDA 5KN3A 3ZL5A 1EWXA 2VO4A 1TRWA 1ST9A 3VPTA 3FW2A 1U87A 3CXGA 3QAGA 4AJ8A 1AC1A 3QD9A 1T4ZA 1ZZYA 1ZL9A 4MJEA 1OE8A 2K9FA 3DEXA 1Z6MA 1VF3A 3HZ8A 1A24A 2EIQA 3IE3A 1M2BA 1OC3A 3IRAA 3UMAA 1JFUA 2XBQA 2DJ3A 4NMUA 3CSJA 3WD6A 1F37A 4IS0A 4TXOA 2IMDA 4QL9A 2C3TA 1TP9A 2NVLA 4MF5A 2ZCTA 4DSQA 4D73B 3VI5A 1GSFA 5G2ZA 3IHQA 2X99A 1G6YA 2JADA 1FO5A 2FA8A 2H74A 2H70A 3GH9A 2LNSA 5AISA 2HNLA 4IJ3A 1HYUA 2DSAA 1NW2A 2H71A 2IMKA 2IN3A 2EC4A 5HQPA 3HJPA 4Z7XA 3L78A 5KEJA 4JBBA 2VCQA 4WXTA 1SENA 2LJKA 1TRSA 1KTEA 1MDKA 1TU7A 3WGXA 3E3EA 3Q74A 3ME7A 2E7PA 8GSSA 2C0GA 1SL2B 3GSTA 2WDUA 5FHIA 1SKSB 4WEYA 2O8VB 2PBJA 5ECRB 5DBQA 3ZTLA 2B6MA 2PU9C 4XS4B 4HJ2A 1U88A 3BBYA 4HUAA 2HRNA 3ME8A 4DSSA 1XXUA 3GKNA 4WBRD 4IHUA 3NZNA 5IMZA 5KN0A 4IELA 2K6VA 1JLWA 2CVDA 1EV4A 5ABRA 2FCHA 4GF0A 3LFLA 2YOIA 3UARA 2L5OA 1VF4A 2VCWA 2YPMA 2YWOA 2HZEA 3AY8A 1UC7A 2LV3A 3VPQA 2M80A 1GUKA 2HSYA 1TI1A 3IDVA 1B8XA 5HFGA 2LUSA 1SK1A 2ON7A 2NDOA 3L9UA 3HJOA 1WWJA 2F51A 4F0CA 1W4VA 4MA9A 1K0MA 1XWCA 2GS3A 1MDJA 2YV7A 3KTLA 1BG5A 2LRTA 3CBUA 4ZB9A 4OWYA 2KUCA 4HJMA 3P7XA 1WOUA 2VCZA 4ID0A 1M0UA 1GNWA 4V2LA 4L0WA 2VCVA 3KMNA 10GSA 1V9WA 4WF4A 1DUGA 2PVOC 2F8FA 2BJXA 1T8EB 22GSA 1JZOA 3IAS2 1B9XC 3VFIA 3TRXA 2JSYA 4X43A 4HEA2 2A2SA 2GT5A 5J9BA 1F3AA 2YN1A 3MSZA 4FYBA 1AQWA 2CAIA 2QKEA 4YQMA 1CQHA 3M0FA 2FWGA 1E6BA 3KXOA 2AUVA 2R4VA 2VL9A 4XCSA 1PX7A 3CRUA 1EP7A 2O87A 4CDOA 1Q4JA 1UN2A 1Q98A 2B7KA 1HNCA 1ERWA 1YF1A 2CT6A 3O76A 4ZIJA 2LTKA 3DIEA 3FHKA 3UVHA 4XHMA 2AJQB 1R4WA 3LORA 4AF2A 1YF0A 1FB0A 1GTBA 4N10A 2BMXA 3L9VA 2C0DA 2ZNMA 2P5QA 4AJ7A 4NV2A 3VWUA 1XCCA 2FNOA 2YWIA 1MDIA 4TKYA 1YJ6A 4OFMA 2XBIA 2TRCP 3GFKA 2O85A 2L4CA 4OCFA 2P5RA 2VUPA 1XWAA 1WJKA 4LA1A 2F3MA 3HCZA 2RUEA 3K8NA 2ON5A 5L71A 4MZCA 3EE2A 3KGKA 1QGVA 1LJRA 1Z7PA 2JL4A 3FZ9A 1B48A 1PSQA 5KN2A 4KCEA 4JZQA 1ILOA 2L6DA 5B7CA 3RDWA 1TRUA 3DXBA 2MMNA 3EYTA 1DSBA 1GRXA 3ZMKA 2NPBA 5E4WA 2GQLA 4IN0A 3TKSE 2X8CA 1FHEA 3TOUA 1A0FA 4MMMA 2XPEA 1JZDA 3GHAA 2WGRA 1A2JA 4GQFA 2J9HA 1GTIA 3ZMLA 4GRFA 1DBYA 2H0IA 4POBA 1I5GA 4MJBA 3F6FA 4DSRA 4YH2A 3ZLPA 2HSHA 4MH3A 2LRNA 3EU4A 3J7Yb 4FYCA 5CRWA 5IMDA 4TR1B 2X64A 2YJHA 5D96A 3GNJA 3QOUA 3M1GA 4ECBA 1S3DA 4K7OA 2YJ7A 2PGTA 3O3TA 4L0UA 5CRHA 4CHSA 1X0RA 1JLVA 3UOMA 3N9JA 4KB3A 4AGSA 5B6NA 3QAWA 4HQSA 2H0GA 2LS5A 3GIXA 1GTUA 1K0NA 3C8EA 3FY7A 3QFAC 2OJLA 2DIYA 2PN8A 3EVIA 1B4PA 2YWMA 4XS1A 1QFNA 2E2GA 4RUVA 5IMVA 1C72A 1R7HA 1XPVA 3KH9A 1A2LA 1PN9A 2GSRA 3KZQA 1G7OA 1K3LA 2VD0A 1XVQA 5A4VA 19GSA 1T7PB 3TKPA 4BWQA 2LJAA 3QPMA 3C7MA 4ZL8A 2WRTA 1TRVA 2EIOA 3D0ZA 5IIZA 3IOSA 4KDUA 1ZMAA 4WF5A 1OC8A 4O7HA 1PRXA 3ZVJA 4ZB8A 2MZCA 4ECIA 5JCWA 5J3RA 3TUEA 4MF6A 3DRNA 3HVSA 3Q18A 2GSTA 2M72A 1I9DA 3C71A 3L0HA 1PD21 1R5AA 3OR5A 3APSA 2LEGA 1U6TA 4XS6A 3RBTA 4KH7A 4WR5A 5G1LA 4BA7A 5ECMB 1SL1B 3ED3A 3IBHA 5DAKA 4KCAA 5DALB 1U3IA 4I2TA 1YDKA 4RI7A 3G7JA 2MMOA 1Z9HA 3EMXA 2VL2C 2WS2A 4BPYA 3M8NA 1AXDA 2VD1A 4E8HA 1AUCA 1F2EA 4V2MA 2HRFA 2JZTA 1THXA 1UA5A 1KNGA 3NIVA 3PH9A 2FD3A 3KIJA 4Q5NA 2DJJA 4XIHA 1MEKA 2DMLA 3CMIA 5IMCA 4IKHA 3FEUA 3EURA 5CREA 1VRSD 4GSSA 2M46A 4Q5RA 1K3OA 2KOKA 3HVXA 1NSWA 1K0BA 2VM2A 3LEFA 5DQYA 1IYIA 1IYHA 1QUWA 2O7KA 1OKTA 2E0QA 4I97A 2H72A 4X0XA 4G19A 2IYJA 4J56E 3MWHA 4F03A 4TXOB 5D9VA 4ECJA 1EGRA 2CZ2A 5EY6A 5IO2A 4TR0A 1TW9A 4DVCA 1BJXA 4J2FA 2XC2A 3EC3A 4NXIA 2FUG2 4O92A 1JZRA 2H76A 6GSYA 2YZUA 5GAND 5AGYA 1ACVA 2FWFA 1Z7RA 1JZWA 2YWNA 2I9HA 4LMWA 5GAPD 2FWHA 3PR8A 2HT9A 1XWKA 3DD3A 3LSZA 3FZAA 4BVYA 4PQIA 4L5OA 3KJYA 4TOPA 2CA8A 4F82A 3ZFLA 1SK0A 5AIXA 5CRGA 2KP2A 3WT1A 2VLUA 2VCTA 1J08A 3EMPA 3F3RA 2LQOA 2PMTA 2YV9A 3P8WA 3KD0A 1DE2A 1XVWA 1X5EA 3CTGA 2H6ZA 6GSSA 4K2DA 1BQ7A 3D6IA 3BCKA 3HKRA 1AQVA 4V1Ag 5ECKB 2XHFA 3APQA 3IV4A 1EGOA 2RM6A 2ZUPA 4K9ZA 1YZXA 4IQAA 4NHZA 2E2MA 4HDEA 1GH2A 4V1Ap 1BX9A 3DYRA 4DSSB 4YQVA 1ON4A 3ZVJD 4KSMA 1GUMA 2C1YA 5COHA 2PVQA 2JSZA 2DC5A 2HZEB 4IP6A 2V6OA 4GXZA 2ALBA 3HZ4A 2VOCA 3FR9A 2HLSA 2P31A 3M9KA 1AQXA 1EZKA 1EEMA 1XFLA 1X5DA 3GL3A 3FRCA 5DQSA 2CZ3A 5IO0A 3W8JA 2IFQA 5B8BA 4RQXA 2F9SA 2TRXA 5IPGA 3BOAA 5ELGA 5IMAA 3HD5A 5IOWA 1URMA 5D93A 1SK2A 1YKCA 3HXSA 3HHVA 1A8YA 4LL1B 4TR4A 2IL3A 2QSIA 2DJ1A 3EINA 1X9MB 2H1AA 2WCIA 3GSSA 1EOGA 1Z5YE 1SKRB 1PX6A 4XTSA 2DJ0A 1YKAA 1V57A 3GURA 2IIYA 1GSDA 3LXZA 2H66A 2BTOT 2L6CA 5ECHB 4EXJA 1TKDB 3GA4A 4MJCA 4OFNA 1FG4A 2DJ2A 4TR3A 4MH2A 5H5SA 1PL2A 4EDYA 1LU4A 1SL0B 2HE3A 2IPAA 1VF1A 1MD3A 4PGTA 3UVTA 2B7JA 1OAZA 5ECPB 2VM1A 1U3AA 2VL2A 3TJGA 2H6YA 1VGLA 2K8VA 3F6DA 4XRDA 3RAZA 3KP9A 1HD2A 5H5RA 3KEBA 1G0TA 1BAYA 3KP8A 1GL8A 1ZOFA 4KE3A 1V40A 1F6MC 4ZBBA 3M9JA 1T4YA 1TU8A 1V98A 4YQUA 4EUYA 4K6XA 1SJZA 5ELAA 5D9WA 4POLA 4YAPA 3IK9A 1TK8B 6GSWA 2YNXA 2WULA 2D2ZA 4XRAA 1TI3A 1XOAA 3BD2A 3LJRA 1GNEA 2LQQA 3E0UA 2CVKA 4MCUA 2JZRA 1O73A 2L5LA 3A5WA 5CO3A 1DE1A 5JWQB 3GKKA 1ZYQB 5IOXA 4O5RA 3P2AA 4JR4A 5HR2A 3KH7A 4O32A 2H30A 1TXXA 1XIYA 3TJBA 4JE1A 1XW6A 2L59A 1SYXA 1M99A 1NM3A 3RHBA 2LSTA 2X8HA 3SBCA 4ULXA 2GSQA 4I6XA 2CAQA 4F9ZA 5ECNB 5FT3A 4DEJA 2XPDA 2FHEA 1XBSA 3QCPA 4ISDA 5HR3A 1GSQA 4FIWA 4WKWA 2YP6A 1FVKA 1S3CA 1J0FA 1KBNA 5JCUA 4TN8A 5CRDA 3F4RA 6GSVA 2LNTA 3TKQA 1QXHA 2H1BA 3ERFA 4GCIA 1EEJA 2DLXA 3CSIA 1WE0A 2B1KA 2OE0A 4KDXA 4KDYA 4LMVA 1HNBA 4I8BA 1FVJA 1GLQA 1M2AA 1A2MA 3UL3A 1XOBA 3LGCA 2PERA 3MDKA 6GSXA 5AIVA 5DJMA 4NAXA 5ECSA 12GSA 4PXOA 4TVEA 1KEBA 2G0FA 5F0GA 3D4TA 1BYEA 5DDLA 4QL7A 5J9CA 1YEPA 2WB9A 1N8JA 4GQCA 5AN1A 3FYGA 3TRQA 2MBSA 3A2XA 3A3TA 1A8LA 4ML6A 3FZ5A 2CVBA 3ZRDA 1WRYA 1SU9A 2AYTA 3PINA 4MP4A 2KLXA 2C3NA 2CX3A 2GZYA 5G5EA 1ZYEA 4V2NA 4G2EA 1T1VA 2OACA 4JEDA 3NOFA 1MTCA 2PWJA 3H79A 2IMFA 2VIMA 1XW9A 4ML1A 3LYPA 5D73A 3GMFA 2H01A 4KSOA 1N2AA 1PMTA 5GSTA 4EF0A 2HZFA 4AJ6A 4FH8A 3ZZXA 5DAKB 3VLNA 4MJAA 3GTUB 1OE7A 3IAM2 3HDCA 5G30A 3GV1A 4ZBDA 2C0FA 3KTBA 4P3YB 3ISOA 1WP0A 2N5BA 2HXKA 2IJYA 3QDNA 1YY7A 3HJMA 3TOTA 1B9YC 5DCHA 3WYWA 5A4WA 4KNDA 2QGVA 1SJ6A 3DWVA 3ZYWA 2WJUA 4HU7A 3J7Yk 3TCOA 4KA0A 4J57E 14GSA 4KX4A 1ERVA 2B5EA 3VWXA 3SWLA 2I3YA 1TK5B 3GTUA 5CNWA 2IY2A 2A4VA 5CAXA 3I69A 1M2DA 2OA7A 5HR1A 4ZBAA 1AAZA 3F9UA 1T3BA 2OE1A 1GULA 5DVBA 1YEXA 4E8EA 2IMIA 5B8AA 4IW9A 1T00A 4N0VA 4EE0A 4NV5A 13GSA 3N5OA 4LL4B 1NHOA 3HY2A 5B6MA 3FR6A 2VCXA 1ZGNA 3GUSA 4LLRA 4BL7A 4BWSA 4MLYA 2VLTA 5A5KA 1FOVA 3F4TA 2ES7A 1QMVA 5FWGA 3F4SA 5D9XA 5G31A 2GT6A 4EO3A 1K0OA 2FLSA 4I5QA 1TDIA 2IMEA 4KW6A 4HZ2A 9GSSA 5GZZB 4ACSA 4EL1A 2JU5A 5HFKA 4JU5A 1WPIA 3GX0A 4NWYA 3GH6A 5ID2A 3FZ4A 4HS1A 4WETA 4IGJA 3WGEA 2Z9SA 4G9HA 5DCGA 1XW5A 2P0GA 5EL8A 2GLRA 3RPNA 2REMA 3CTFA 2R3XA 4N0ZA 1X9SB 4MK3A 3V1WA 3WT2A 1GP1A 1K3YA 1V58A 2J23A 3C1SA 4N11A 4L8EA 4EDZA 3KM6A 4GSNA 2H0HA 3F63A 1ZCPA 1GSEA 1ML6A 3IK7A 3TKSA 2YANA 1OVNA 3W6GA 4MF7A 4IBPA 2PPTA 5G5FA 4MZBA 5ECIB 4HQZA 2GQMA 2FWEA 1HNAA 2A2RA 2AV4A 2H8LA 1G6WA 4ZL9A 3TKRA 1BEDA 2GGTA 4KUNA 2IFQB 2IWTA 3H4KA 1MD4A 3VWVA 3A2VA 2I81A 4F2IA 1PQNA 4PUAA 3ZFBA 4BVXA 1Z3EA 2HI7A 4GLTA 3ZREA 3BJ5A 2EIRA 1SKWB 3G9BA 1O8WA 1VF2A 5IM9A 3ZITA 2L57A 5F07A 3H1NA 5LNKe 1G7EA 3UEMA 1Y6EA 2H6XA 2F8AA 1SJIA 2AHEA 1TTZA 2RM5A 5A4UA 3I43A 5F8BA 2C4JA 2LRCA 4D73A 3UAPA 3DGQA 3L9SA 2LKUA 3S9FA 3QR6A 4G10A 2VAFA 3KMOA 4YAVA 3P90A 1OYJA 3QAVA 5E59A 2WZ9A 4PNGA 3F0IA 5JWRB 4EKZA 4PURA 4PUFC 5C00A 2V2GA 2I1UA 3CSHA 2NBSA 5J41A 3GN3A 4MPFA 1A0RP 5DJLA 3D22A 4GWRA 4KAEA 5HR0A 3G7IA 1M9BA 1E2YA 2MYGA 1M9AA 4OO4A 4FO5A 3U5RE 5ECLB 4HU9A 4RI6A 2B5XA 3E9JB 3ZIJA 2N5AA 2R2JA 2GTUA 4MABA 4XS4A 1UVZA 4K8MA 2OBKA 2CV4A 4OCEA 2R37A 5D8IA 4PQ1A 3QFBC 4ZXGA 2OKAA 4QQ7A 3DVXA 16GSA 2C0EA 1GSUA 3D5JA 3VWWA 1QK8A 5G1KA 4K0GA 1XWBA 3IPZA 1H4OA 5ECQB 2VL3A 2VLVA 1AIUA 3LWAA 4ZB6A 1SYRA 1FW1A 2R6KA 2FY6A 4MDCA 3DMLA 3FK8A 1WIKA 1OC9B 5KN1A 1XZOA 4H86A 1PL1A 2KHPA 6GSUA 2GQKA 1Y25A 3TJJA 3I9V2 2DBCA 3L4NA 1O8XA 4POMA 3TJKA 4NPBA 4JR6A 4IP1A 4K7NA 3CYNA 4X1UA 11GSA 3IR4A 5H5QA 2B5YA 3VURA 4WBJA 2O89A 1GUHA 3UBKA 3FKFA 3DVWA 1HQOA 2R5GA 2X8GA 3KCMA 2GZPA 2H75A 3I6AA 5GSSA 2C8UA 2NTOA 5J4UA 3H93A 3LQ7A 1OC9A 2DMMA 1ERUA 1O81A 3GX8A 2RLIA 3CRTA 3ZIVA 5IMFA 2GDRA 3A2WA 2K18A 4K7IA 2YZHA 1B4QA 1RW1A 3TRPA 4ECCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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