1T3BA

X-ray structure of dsbc from haemophilus influenzae
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
DAAIKRKLQSFNISNIVIKSSPISGIKTAVTDQGILYVSEDGKYLFEGKLYELTNNGPVDVAGKILVDKLNSYKDEMIVYPAKNEKHVVTVFMDITCHYCHLLHQQLKEYNDLGITVRYLAFPRAGMNNQTAKQMEAIWTAKDPVFALNEAEKGNLPKEVKTPNIVKKHYELGIQFGVRGTPSIVTSTGELIGGYLKPADLLRALEETA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbC
publication title Structure of DsbC from Haemophilus influenzae.
pubmed doi rcsb
source organism Haemophilus influenzae
molecule tags Isomerase
total genus 53
structure length 209
sequence length 209
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2004-04-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1t3bA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1t3bA02
3TJFA 4HEA2 4Z7XA 3D4TA 4EUYA 1ACVA 2OBKA 5G1KA 1O6JA 2K9FA 1HD2A 1TU8A 3TKSC 1AW9A 2P31A 4LMWA 3H79A 5IMCA 1B8XA 2CT6A 4WR5A 2JZSA 1TK8B 3EC3A 1YY7A 2DC5A 1Z3EA 1YJ6A 2AJQB 2DJ1A 2VL2A 1FB0A 5A4WA 4WR4A 1ZCPA 2LRCA 2FWFA 1B4QA 4TR1B 5L71A 3LWAA 2PERA 1BG5A 3P7XA 4GQFA 1G6YA 3EMXA 5ABRA 2L4QA 3HZ8A 2VL2C 2H1AA 5IIZA 1WE0A 2FNOA 4KSOA 4N10A 2WCIA 4BA7A 2AUVA 2ZCTA 1V57A 2DJKA 1U87A 4IP6A 4ZXGA 4KW6A 1K3OA 2OBIA 6GSUA 1M2DA 3GNJA 5A5KA 2HNLA 3UBLA 1M0UA 2K18A 4LL4B 3M1GA 5CP1A 1M9BA 4ZILA 5CRWA 1UN2A 1YKCA 5ECRB 1PRXA 4I8BA 2KLXA 2V2GA 3GURA 3GIXA 1SYXA 3DRNA 1XPVA 3CXGA 3FZ4A 3FRCA 2OJLA 3FZ5A 5IOXA 4I5QA 2YCDA 3M9KA 4GSSA 3QMXA 2LUSA 1PKZA 4AF2A 4KNDA 3R2QA 3KM6A 2YV7A 1PN9A 2RIIA 3FYGA 3BD2A 3W8JA 1JZRA 4P3YB 1AXDA 4Q5FA 2HLSA 4ACSA 4MJAA 2VM1A 14GSA 3D0ZA 5GAND 1WWJA 2VL9A 1ILOA 1SL2B 3ERGA 1QFNA 1ABAA 3TDGA 5IPHA 3NOFA 4HUAA 5IMAA 4I2TA 2VCTA 2P5RA 2H30A 1ZMAA 4TRXA 1OC9A 1EP7A 2DBCA 2A4VA 3EVIA 3ERWA 3F4TA 2IMDA 1S3DA 1XWBA 4HS1A 2B1KA 3GUSA 2R5GA 2LS5A 5AN1A 2GT6A 3APOA 3TKQA 1I9DA 2I9HA 4YAVA 5AGYA 3HCZA 2OE1A 2OA7A 5J9BA 4HZ4A 1URMA 2FWHA 5G5EA 1YDKA 2YN1A 5ECOB 2DJ3A 1F3AA 19GSA 1SJIA 2GS3A 4YH2A 3WT1A 3RPPA 3WGEA 2KP2A 1DSBA 4IVFA 1BYEA 5F07A 1ERUA 1A2MA 3GV1A 2YNXA 1TXXA 5DQSA 4KCAA 2LQQA 4ML1A 1X9WB 3VWWA 4FYUA 4TW5A 3US3A 1GLQA 4PURA 4JE1A 2X99A 4MCUA 4PUFC 2K6VA 3GKNA 1JZOA 1I5GA 2CX4A 2OKAA 1XOBA 2VCXA 4BVYA 1Z7PA 5GZZB 3QAWA 2GZPA 5DCHA 5ECQB 2ZNMA 4KDYA 2LNTA 3ZMLA 3CMIA 5G5FA 3BBYA 1WPIA 5IM9A 3IC4A 2HZEB 1YKAA 2GQMA 1DE2A 4I6XA 1QXHA 1VRSD 4K6XA 1F2EA 3ZRDA 4XS4A 1LBKA 3PINA 1K0OA 4L8EA 3MNGA 1UA5A 1TK0B 5ECIB 1XCCA 1QUWA 4KGIA 1WP0A 5A4VA 5B8BA 2FGXA 4J56E 2P0GA 3J7Yk 1DE1A 3QAGA 3QD9A 3NZNA 5HFIA 4XS1A 1TW9A 3WD6A 1K0CA 1PL2A 4IGJA 4MZWA 1BX9A 5JWRB 5GSSA 2GQKA 1YZXA 3RAZA 1S3CA 2YZHA 2HE3A 4TXVA 1GTBA 1ERVA 3TGZA 3M3MA 1PQNA 1F9MA 1TI1A 2CVBA 3CTFA 4V1Ag 2H71A 5C00A 4POKA 2MMAA 3APSA 4HU7A 4NV5A 3EMPA 2QGVA 1FHEA 1XVWA 3E0UA 2NVLA 2PWJA 1OYJA 3UVHA 4E8HA 4RUVA 3Q74A 2HRFA 1ERTA 1OKDA 2AHEA 3CSIA 3IA1A 1AIUA 3J7Yb 4WBJA 1HNBA 5IMZA 2HYXA 1X0RA 1X5EA 3IK7A 2MBSA 3WGDA 1KBNA 3P8WA 1TDIA 1IYIA 4NV2A 1XXUA 3DIEA 3JCML 2AYTA 3F6DA 4MZBA 3W6GA 4DSSA 2B5XA 3ZREA 4EDZA 3VWUA 1Z7RA 5EPFA 4FIWA 3KIJA 3D21A 5IO2A 1GULA 4K2DA 1A2JA 5IMDA 1J0FA 1WMJA 4ULXA 2VLTA 2EC4A 2CZ2A 1HNAA 4OO4A 3KMNA 4ZL9A 2TRXA 3G9BA 3I6AA 4IELA 4TN8A 4MPGA 2R37A 1PSQA 3HA9A 1T3BA 1ST9A 2YOIA 1THOA 5G1LA 3ERFA 5ELAA 4I97A 1XZOA 4MH2A 2MMZA 4EO3A 4CHSA 2E0QA 2YWNA 3UIWA 3GH6A 2MBTA 4TXOB 3GL3A 1JZWA 2XBQA 2C0DA 4CDOA 4Q5QA 3GH9A 2RLIA 2Z9SA 3FZAA 3VPTA 4PUAA 2I1UA 2OADA 5G30A 1XVQA 2LV3A 3G7IA 2HI7A 1X5DA 3VK9A 2IFQA 2L59A 2L5OA 4IQAA 5G31A 2QKEA 4JBBA 3VWXA 1GSDA 2LRNA 5ELGA 2HSHA 4GWRA 1MD4A 3EU4A 3GTUA 3DD3A 4N30A 4G9HA 2H19A 3GKXA 5KN0A 1A8YA 2H70A 5J3RA 2B3SA 1SJ6A 4IJIA 1V2AA 3IV4A 3GN3A 2YWMA 3LEFA 4WF5A 2QC7A 3ZIJA 2FHEA 4I2UA 1SK1A 11GSA 2F3MA 4NAXA 3I69A 2P5QA 3TJKA 3FK8A 2M72A 2LKUA 2F9SA 4HQZA 1THXA 1A8LA 2WRTA 3H1NA 3LQ7A 3D6IA 3KTBA 1MDJA 2IYJA 1XW9A 5GAPD 4IP1A 5B6NA 4OCFA 3KJYA 3ZFLA 1G7OA 4KA0A 2GSTA 2VOCA 3I9V2 1SD8A 3UBKA 3PGTA 5LD0A 1SU9A 3L9UA 3D5JA 3EWLA 4WEYA 2I3YA 5DAKA 1G0TA 3FR3A 4GRFA 4DEJA 3FY7A 1QGVA 1ERWA 4PQIA 5ECNB 2IIYA 4N0ZA 3RHCA 3UOMA 3FR6A 2ALBA 2JACA 1WOUA 2CV4A 2YJHA 1H75A 2NDOA 2E7PA 2O85A 5B8AA 1F3BA 5ECSA 5ENUA 3CTGA 4MF5A 1AUCA 3ZYWA 3GX0A 4MP4A 2VD0A 3ZVJA 5D9TA 4L5OA 4XCSA 3ZVJD 1SKWB 1X9MB 3HKRA 2C0EA 3M0FA 4YQUA 4ECCA 4IN0A 4AJ8A 2H0HA 2ON7A 1GUHA 2G0FA 4OFTA 3L9VA 3LXZA 4QQ7A 3S9FA 1A23A 1TKDB 2JSYA 2KHPA 5HQPA 2GGTA 2L57A 1MDKA 4BL7A 2GSQA 4K8MA 4KSMA 1OE8A 1WIKA 3CYNA 1A24A 3TJGA 2HRNA 2LJRA 3KZQA 3TOTA 3IK9A 5HFKA 2M46A 5F06A 1AC1A 4PXOA 3A3TA 3HYPA 4GSNA 1DBYA 1E2YA 5D9WA 3UVTA 9GSSA 5HR3A 4FYCA 1F37A 6GSXA 18GSA 1SL1B 2E2MA 1GLPA 3ZMKA 3H4KA 5IQYA 4TR1A 2H01A 3LYPA 5G2ZA 2VLVA 5ECPB 1R26A 4ZBDA 2RUFA 1OVNA 4RI7A 2B1LA 2C3NA 3EINA 2KP1A 1GTIA 1K0NA 2EIOA 1KNGA 3LYKA 3IAS2 2K8VA 3LORA 4EF0A 2C4JA 1GUMA 1N2AA 3TRXA 3GHAA 1EGOA 1F6MC 5ECKB 4K7IA 1PGTA 2QSIA 4X0XA 3TB2A 3C8EA 3TKSE 1FG4A 1A0RP 3H8QA 5DVBA 4XHMA 2PVOC 3CRUA 2PPTA 3F63A 2CAQA 1T00A 1EGRA 2IMFA 2XC2A 3D4MA 1V9WA 2XBIA 1NHYA 4MJCA 1E6BA 1M7TA 4MPFA 2CA8A 4PNFA 2B6MA 13GSA 3BCKA 1GTUA 4NHZA 4ECBA 3VI5A 4Q5NA 2LJAA 3ZIVA 5B6MA 6GSVA 2C80A 2WZ9A 4LLRA 17GSA 1TRUA 3SBCA 1GNEA 1IYHA 2G2QA 5AIXA 1ON4A 4ZBBA 4MH3A 4IBPA 1VF1A 3LJRA 1AQWA 4FYBA 1J08A 3HVSA 1PL1A 3VLNA 1MDIA 2H75A 1W4VA 3C71A 4TR0A 3FR9A 2IN3A 3IHQA 1J9BA 2GQLA 1T4YA 3WT2A 1ZOFA 3N9JA 4EVMA 4EDYA 1T4ZA 1DUGA 3M9JA 3C7MA 2XHFA 1G6WA 3N5OA 3A5WA 2N5BA 3ME7A 2B5YA 1HQOA 1B48A 3KXOA 1U88A 1QK8A 3DWVA 2C0GA 2DSAA 2FA4A 4HZ2A 5CRGA 3F8UA 1TI3A 1Y25A 5DQYA 3RPNA 1ZZYA 4HJ2A 1YF0A 4CW9A 1K0MA 4TR3A 1EV9A 2A2SA 1SKSB 3GX8A 3GYKA 10GSA 5JWQB 2VD1A 2R4VA 2CVDA 3EU3A 4MA9A 2HXKA 1M2AA 3GA4A 3F4SA 3UMAA 3VFIA 2JZTA 4KDXA 3A2VA 4JEDA 2PU9C 2B7KA 1A0FA 4TVEA 4IKHA 1WJKA 4TKYA 1RW1A 5CAXA 1OE7A 3U6VA 2O89A 5JCUA 2VUPA 2WB9A 1GRXA 1FVJA 2YWIA 5JWOB 3KGKA 4YAPA 3DKSA 1R5AA 3ED3A 2AV4A 5AISA 1RQMA 3ZFBA 2TIRA 5IO0A 5DALB 4ZIJA 1T8EB 1R5PA 4E8EA 2LNSA 2RM6A 2HZEA 1GH2A 2FLSA 1OAZA 2BTOT 3GSTA 4MABA 2YANA 4D73B 5B7CA 4PX1A 1MTCA 4PNGA 2M80A 3O3TA 2FUG2 2VLUA 2MYGA 1AQXA 1U6TA 3UAPA 2AAWA 3H93A 2YP6A 4MK3A 1T1VA 1K0DA 4OFMA 4BWQA 1B9XC 4EE0A 3DVWA 2YV9A 3L9SA 4GLTA 4F0CA 3G7JA 6GSWA 1C72A 2WDUA 4K9ZA 1KEBA 3A2XA 2GLRA 4GSTA 5ID2B 3ZLPA 4OMVA 4MDCA 3IBHA 2JU5A 5H5QA 2IL3A 2TRCP 3C1SA 4JZQA 4XS6A 4N0VA 1VF3A 3Q6OA 1PD21 1FAAA 3KD0A 3MAKA 1OKTA 2N5FA 5DJLA 7GSSA 2H76A 1M2BA 3DEXA 1NM3A 4QL7A 1K3LA 2IY2A 4O7HA 4FO5A 5KN1A 4G2EA 2DJ2A 5DDLA 3HD5A 2YWOA 4WBRD 3IDVA 2FWEA 3IAM2 1Q4JA 3WGXA 2XPDA 1BQ7A 3F3RA 3GKKA 16GSA 2JZRA 4KDUA 3CSJA 3L78A 2V32A 1XW6A 2VL3A 2H0IA 3BOAA 3KCMA 1M9AA 3TOUA 1H4OA 2PGTA 4ILFA 3GMFA 3L0HA 5ECLB 1XIYA 1BAYA 3HJOA 4EL1A 3VWVA 3LG6A 4V1Ap 2LTKA 2A2RA 5J5NA 5J9CA 4BWSA 5E4WA 1HYUA 4YQVA 4MLYA 3SWLA 4GCIA 3FHKA 2DLXA 4ID0A 5LCZA 3KMOA 4PQHA 4NMUA 1EZKA 3BCIA 5F0GA 4RI6A 2C8UA 3GFKA 2H6YA 4FH8A 2EIQA 2JL4A 3ISOA 4MJBA 3ME8A 2K8SA 4G19A 5CRDA 2HT9A 1W89A 3MWHA 1WRYA 2IJYA 4QL9A 4JU5A 3E3EA 2GDRA 1TK5B 2EIRA 3KTLA 4L5LA 3TCOA 4RQXA 3A2WA 3ZTLA 4AJ6A 4HOJA 4POLA 4TXOA 3P90A 2DMLA 4EC0A 3ZITA 1S3AA 1FB6A 5F8BA 5HR1A 4L0UA 4KCEA 2WGRA 3TRPA 1EP8A 4HJMA 5FHIA 3APQA 1R7HA 1VF2A 3CBUA 3KH7A 1NW2A 2VO4A 1FVKA 1B4PA 2KUCA 5GSTA 1YEXA 6GSTA 4K7OA 4KUNA 5D96A 3VURA 1EOGA 3I43A 4IHUA 2X8CA 5DBQA 5H5RA 4V2LA 4KX4A 2DJJA 1R4WA 2F8FA 3QAVA 1Q98A 2YZUA 1SL0B 1PMTA 2VCQA 4AJ7A 3MDKA 4Q5RA 5CYYA 2FWGA 1PX7A 2O7KA 3PH9A 1GSFA 2RM5A 4KH7A 3IOSA 4IJ3A 1XOAA 4WKWA 3M8NA 2L6CA 3F3QA 4OD7A 1ZYQB 2PUKC 5F05A 2OE3A 3O76A 3TKRA 4O32A 3GRXA 4NWYA 5C04A 1ZGNA 3RDWA 1QQ2A 2O8VB 3QFBC 5D73A 5IMVA 4XTSA 3AY8A 3HJPA 3DMLA 5IMFA 20GSA 1GUKA 2H66A 3NIVA 2J9HA 3IRAA 1GP1A 2DIYA 2REMA 2H0GA 2DMMA 4HDEA 1TTZA 3KH9A 3DVXA 1OC9B 2VM2A 4POMA 3FEUA 1EWXA 3IR4A 3O6TA 5CO3A 1Z9HA 4G10A 2KOKA 1GSUA 2AB6A 2F8AA 1Y6EA 1T7PB 3WYWA 2VCZA 3QDNA 1UVZA 1SENA 2JSZA 4WETA 2N5AA 4POBA 2C3QA 5EY6A 5HR0A 4F82A 4ECIA 1OC3A 1XW5A 4J2FA 1ZYEA 2GVPA 1EEJA 2MZCA 4TOPA 5KN3A 2H1DA 5CNWA 5IPGA 2H6XA 1TRSA 1PX6A 2IWTA 2V41A 2GZZA 1O85A 2VCWA 6GSYA 1GSSA 2PMTA 1TJDA 4X1UA 3UJ1A 4AGSA 3GKMA 3C73A 3U5RE 4IQ1A 2GSSA 1USBA 2PBJA 3TUEA 2H8LA 2IMIA 1ML6A 3GL5A 1U3IA 1EV4A 1GTAA 4WF4A 4MMMA 4LL1B 5HFGA 5J41A 5D8IA 5EL8A 2VIMA 4LMVA 4TR4A 1PKWA 4KAEA 3TJBA 4HI7A 2HSYA 3PR8A 3F4RA 1BJXA 5FT3A 1EOHA 2ZUPA 1JFUA 4DSRA 1SKRB 3BJ5A 1GWCA 1K3YA 1U3AA 3TRQA 4IW9A 5INYA 3HDCA 1RK4A 1V58A 4XS4B 3HHVA 2FD3A 1TRWA 3RHBA 2ES7A 2I4AA 5E59A 1GL8A 1B9YC 3KP9A 1XWKA 2WJUA 4V2NA 3QR6A 4F9ZA 1XFLA 3HJMA 4RQRA 1CQHA 1SD9A 2LEGA 2L4CA 3HZ4A 5AIVA 2JADA 4MJEA 1JZDA 2BJXA 1MEKA 5DJMA 3TJJA 3UL3A 3F9UA 1EEMA 2D2ZA 2FY6A 2E2GA 1PA3A 1NSWA 4N11A 2CQ9A 3MSZA 2NBSA 2YJ7A 1ZL9A 3Q19A 4KE3A 4O92A 5LNKe 2LRTA 1YF1A 3UARA 3GSSA 2GT5A 3VPQA 1QMVA 2R2JA 2LQOA 22GSA 4IS0A 5JCWA 1NHOA 2C0FA 3L4NA 2X8HA 5ECHB 3EURA 3EYTA 4K1FA 2WFCA 2CZ3A 5CREA 1LU4A 5D9XA 2HZFA 3KP8A 2O87A 1XWGA 2GZYA 4OWYA 3QOUA 2F51A 5KEJA 5A4UA 2NTOA 2R6KA 4PGTA 1SJZA 1V98A 2WULA 1YQ1A 1JLVA 2H74A 1XWCA 2H1BA 3LGCA 2MMNA 4GF0A 2B5EA 4V2MA 1JLWA 3CSHA 5D9VA 4DSSB 1GSQA 2RUEA 4XIHA 1AQVA 3P2AA 1JHBA 2PN8A 2DJ0A 1GNWA 5J4UA 1K0BA 3DGQA 4JRRA 4OCEA 3KEBA 2V6KA 2IMEA 2X8GA 1BEDA 2OE0A 1HNCA 4DSQA 1TOFA 5KN2A 3FZ9A 2V1MA 4F03A 3IXRA 3EE2A 4HU9A 5H5SA 2FCHA 6GSSA 2PVQA 1CQGA 2H1GA 2OACA 2CVKA 2H6ZA 8GSSA 3TKPA 4F0BA 2H72A 2CX3A 3C1RA 1SK2A 4H86A 4F2IA 2LSTA 4MF7A 1FOVA 3HY2A 4NPBA 3Q18A 1OC8A 4ZB6A 3LSZA 2ON5A 3HVXA 1O73A 4ISDA 4X43A 4ZB8A 5ECMB 4WXTA 4NHWA 1TRVA 4YQMA 1M99A 4BPYA 1GSEA 5D93A 1V40A 2FA8A 3K8NA 3IPZA 2IFQB 2NPBA 1SK0A 4HQSA 3OR5A 2L5LA 4GTUA 3LFLA 3D22A 1Z6MA 2LJKA 3UEMA 1LJRA 4JR4A 3F0IA 1XWAA 4ZL7A 2CAIA 12GSA 1FO5A 2I81A 3GTUB 5DALA 4GXZA 1O81A 1MD3A 2VCVA 2GSRA 1O8XA 2IMKA 3QFAC 3HVVA 4D73A 4JR6A 2B7JA 2HFDA 4BVXA 3FKFA 1K0AA 1XBSA 2XPEA 5JCGA 3E9JB 4EKZA 4MF6A 3W8SA 5COHA 4ECJA 3RBTA 2YPMA 3LXTA 4XRAA 1TU7A 4J57E 1G7EA 2C3TA 3QPMA 4OO5A 4ZBAA 5FWGA 4GQCA 3ZL5A 3FW2A 2WS2A 3ZZXA 4MZCA 3IE3A 4O5RA 3G7YA 1FW1A 4ML6A 2IPAA 3CRTA 1KTEA 4EXJA 2DIZA 5ID2A 2C1YA 4K0GA 5HR2A 4DVCA 5DAKB 4ZL8A 4KB3A 1N8JA 1Z5YE 3F6FA 4XRDA 3QCPA 1VGLA 2MMOA 3VI7A 5CRHA 1X5CA 2V6OA 1YEPA 4LA1A 1TP9A 3DXBA 1Z6NA 1UC7A 4K7NA 1O7UA 3HXSA 1A2LA 2J23A 4K0NA 4L0WA 4PQ1A 2L6DA 4ZB9A 1VF4A 5DCGA 3DYRA 2H73A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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