1T3BA

X-ray structure of dsbc from haemophilus influenzae
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
DAAIKRKLQSFNISNIVIKSSPISGIKTAVTDQGILYVSEDGKYLFEGKLYELTNNGPVDVAGKILVDKLNSYKDEMIVYPAKNEKHVVTVFMDITCHYCHLLHQQLKEYNDLGITVRYLAFPRAGMNNQTAKQMEAIWTAKDPVFALNEAEKGNLPKEVKTPNIVKKHYELGIQFGVRGTPSIVTSTGELIGGYLKPADLLRALEETA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Haemophilus influenzae
publication title Structure of DsbC from Haemophilus influenzae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbC
total genus 53
structure length 209
sequence length 209
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2004-04-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1t3bA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1t3bA02
2JU5A 4MH3A 1J0FA 3FRCA 2H6YA 4KDYA 3IE3A 3M1GA 1EGRA 4TXVA 4MJEA 2XHFA 2CQ9A 2EC4A 3GNJA 2DMMA 2X8GA 5F06A 3O3TA 1AAZA 1Z6MA 3FR9A 5EL8A 2N5FA 3IDVA 5F8BA 1KNGA 2WDUA 4HJMA 4JE1A 5CNWA 1XWAA 3GYKA 1A24A 2O89A 1SU9A 1OKDA 2I81A 3ZIJA 1AQVA 1CQHA 4JR4A 3LYKA 2YZHA 4RQXA 3EURA 4WETA 2VD1A 2KOKA 2C80A 1GTIA 2RUEA 3MSZA 5G1LA 3U5RE 2O8VB 4HZ4A 4BWSA 1EEJA 1GP1A 1V57A 2FWFA 2DMLA 4X43A 2C0FA 2VLTA 1FVKA 1NSWA 2CX4A 4NWYA 3DYRA 1SKWB 3VWXA 4FYCA 10GSA 4XIHA 5IPGA 4E8EA 2L59A 5CRDA 2O7KA 1GSQA 4F2IA 4IELA 1K0DA 3QMXA 3R2QA 3G7YA 3CYNA 1OVNA 1N8JA 2REMA 2VL9A 1K0MA 1PKWA 2KLXA 3E0UA 4IP1A 4TXOB 3QAVA 3LFLA 4RQRA 3GN3A 4OO4A 2OKAA 5ECNB 3WD6A 2DSAA 4GQFA 1TRVA 4ECJA 1YY7A 5ECRB 3RHCA 5J5NA 2HXKA 5EY6A 1Y25A 3KXOA 5GAND 2YV9A 2JZTA 3KMOA 3HJPA 2RM5A 4F82A 2GQMA 2GQKA 2EIRA 2PERA 2C8UA 4JEDA 1PA3A 2H0GA 1ERWA 5ABRA 1B9XC 3VI5A 4MZCA 1M2AA 1M99A 3NIVA 2DJ3A 2H75A 2IIYA 4WBRD 3APQA 1NW2A 3KP9A 5CREA 4PQ1A 3TJGA 16GSA 4D73A 3GH9A 1TP9A 1USBA 4PUAA 3HHVA 4HI7A 5ELAA 5ECMB 1ERTA 2IYJA 3HXSA 4EVMA 1XIYA 4IJ3A 5FHIA 2F9SA 4Q5QA 4QL9A 1EV4A 2KHPA 4TR1A 3TRPA 1TK8B 5COHA 4IBPA 4OMVA 4OFTA 2C1YA 3UMAA 4G9HA 2K6VA 2ZUPA 5H5SA 2OADA 4CHSA 4DSQA 3C7MA 4KA0A 1VF2A 2GDRA 4PQIA 5IQYA 4MJBA 4DVCA 4IS0A 2L6CA 1BYEA 1T4YA 4K7IA 5EVOA 1WPIA 2VL2A 2LUSA 4KDXA 4GSNA 1EGOA 2L4QA 3QDNA 4V2MA 2BJXA 3HYPA 4EKZA 1SJ6A 2FCHA 1M7TA 2XPEA 3LEFA 2M72A 3LJRA 3IAS2 1M2BA 1F9MA 4AJ6A 3D6IA 3KMNA 5FWGA 3TJBA 1FB6A 1MDIA 3C71A 3V1WA 1GNEA 6GSTA 2VCXA 2NTOA 3APOA 5D8IA 2KP2A 5A5KA 2FA4A 2H6XA 1I9DA 19GSA 1MD4A 2FD3A 2AAWA 1GTAA 1VF3A 3HVXA 3IRAA 3KD0A 3LGCA 3CSIA 4KB3A 3F6FA 2JACA 2VD0A 5HFIA 2IFQA 3WGXA 4YQMA 2JSYA 5IMCA 1W4VA 4HU7A 5CYYA 4ML6A 2WULA 3Q6OA 1PMTA 3LXZA 4JR6A 5IO0A 1XVWA 3L9UA 3TCOA 4YAVA 4ML1A 1M9BA 3EMXA 2WRTA 3RPNA 1VF4A 5IOWA 2E2MA 1GTBA 4YAPA 1GLQA 2K18A 4WKWA 1X5DA 1YQ1A 2H01A 3NOFA 3L9VA 5IMAA 5JWOB 4AJ7A 2YANA 3FYGA 5AIXA 4OO5A 3VWWA 1EWXA 4XS4A 3GTUA 5DAKA 4ECBA 4ZIJA 2FGXA 4P3YB 1PL1A 3EMPA 3IK7A 2VL2C 1EP8A 4ACSA 5HQPA 3BOAA 2ALBA 3K8NA 5B6MA 2R3XA 4L8EA 1QGVA 2HZEA 3KH9A 2YN1A 1QMVA 3TOUA 1ON4A 2PPTA 2YZUA 1U3IA 2YWIA 5F05A 4HEA2 2BMXA 1NHYA 3W8SA 1AW9A 3VWUA 1G7OA 5G30A 1OKTA 3ERGA 3HD5A 3ZTLA 3RDWA 4KH7A 5DVBA 4ID0A 1OE8A 3ZYWA 2EIQA 1G6WA 3DVWA 1GSDA 4K0NA 5H5QA 22GSA 4K2DA 1DBYA 4I5QA 2PVQA 3QD9A 4IN0A 2VCVA 2QKEA 4MPFA 2QSIA 4K7NA 2WJUA 2LRNA 2DJKA 1GUMA 1DE2A 1ERUA 2AJQB 1YZXA 3QOUA 4RI7A 2VM1A 2FHEA 3F4TA 3UJ1A 3P90A 4L0UA 4Q5RA 1EOHA 1ZL9A 1BG5A 1SL2B 2WCIA 2B7JA 4GLTA 4TRXA 1RK4A 1FW1A 2WFCA 3M9KA 5CRGA 3H79A 5D73A 2PUKC 3WGEA 3CRUA 1QXHA 5HR2A 6GSSA 2BTOT 5IMFA 3GHAA 2RIIA 1URMA 13GSA 2HNLA 4POLA 1WOUA 4G19A 1KBNA 2YJ7A 4TXOA 3BCKA 2R5GA 2PGTA 2H72A 2HLSA 2IFQB 2P5RA 1H75A 1YKAA 2H74A 3SWLA 5KN3A 3ISOA 2YWMA 2LNSA 2CV4A 2VL3A 2X8CA 3DKSA 1XFLA 3VLNA 2HZFA 1A0RP 1JHBA 1EV9A 1A2JA 2YV7A 1BEDA 4POKA 1T7PB 1CQGA 3HY2A 4NPBA 4JBBA 4IVFA 2CVDA 5ECIB 4K8MA 1YF0A 2FUG2 4MA9A 1PKZA 2JZRA 3E3EA 1X5CA 2YWNA 4GRFA 1FOVA 1PX6A 3EC3A 4XS4B 4ZB9A 1O81A 3RBTA 2P31A 3GTUB 5DAKB 4TKYA 1BX9A 1AUCA 3NZNA 1XBSA 1H4OA 4HQZA 3ZVJD 1MD3A 4HJ2A 3CRTA 4FYUA 4GXZA 8GSSA 2V32A 3ZFLA 1XOBA 2XBQA 2DJ1A 3F4RA 4BPYA 2N5BA 3CTGA 3IV4A 4PX1A 2N5AA 3BBYA 1JZRA 1ZGNA 5EPFA 1R5AA 2HZEB 2IMIA 1SJZA 3CBUA 3P7XA 4ZBAA 3FR3A 2A2RA 4Z7XA 3M8NA 3IPZA 3L0HA 2L6DA 3QR6A 3FHKA 3WT2A 3Q19A 1X9MB 3RHBA 1XWBA 2NPBA 1PRXA 4KNDA 3TB2A 1O73A 3I6AA 4KGIA 2GS3A 3ZMLA 6GSYA 2VO4A 3GL5A 3FY7A 4N30A 1OC8A 2HSYA 1FAAA 1K0AA 3KJYA 1KTEA 3TKRA 1A2MA 3FK8A 5DALB 1A0FA 2WS2A 1ZMAA 2B5YA 4HOJA 9GSSA 3DXBA 2R2JA 1GNWA 2K8VA 4XCSA 1X9SB 2MMZA 3GFKA 3TKPA 3G7IA 5J41A 2WZ9A 6GSWA 5JWRB 2GSQA 3EYTA 2HSHA 2XPDA 4OCFA 4ZBDA 1S3CA 4OD7A 4YQUA 2V41A 4N11A 3US3A 1OC9A 1B9YC 3LXTA 3CMIA 2B5XA 3P2AA 2C3TA 3HVVA 1R5PA 1XWKA 3GKXA 4MF6A 2B1KA 3F0IA 3KIJA 4XTSA 3GRXA 3LYPA 3IR4A 3O6TA 2IPAA 3ZITA 2B1LA 5KEJA 1WP0A 1NHOA 1WWJA 3LORA 4WXTA 3HJMA 1TI3A 1Z7PA 3EE2A 4PQHA 3C8EA 2HI7A 3AY8A 5E4WA 1K3OA 4LL1B 3PH9A 1YEXA 3UAPA 4TR4A 2ON5A 3ERWA 1QK8A 2OA7A 4X1UA 5GSSA 1S3DA 3HVSA 3KZQA 2B3SA 1DE1A 4J2FA 2IN3A 3HKRA 2C3QA 2NVLA 2PN8A 1JZDA 3DGQA 3FR6A 2HYXA 5AISA 2H1GA 4V2LA 2CT6A 2PWJA 2WGRA 2B5EA 2R37A 5CAXA 2GSTA 1TJDA 3BJ5A 3F6DA 3QPMA 2L57A 2DIZA 5CO3A 3HZ4A 2FA8A 1TDIA 2F51A 5B6NA 3EINA 1JFUA 1O6JA 2AHEA 5GZZB 4L5OA 5IMZA 3UVHA 3HA9A 4F0CA 3UBLA 1GL8A 3TUEA 1TW9A 2LEGA 2CVBA 4EDZA 4YH2A 2CX3A 3KM6A 1YKCA 4EDYA 4BWQA 4XRAA 1K0CA 4FYBA 5ID2B 4AF2A 2OE3A 3A2VA 1XWGA 2HRFA 2IWTA 12GSA 1SYXA 1K0BA 4JRRA 1V9WA 3ED3A 3GV1A 1ERVA 1DSBA 1THOA 2LJAA 2V2GA 2EIOA 4ZL7A 4EUYA 3UVTA 2M46A 1SKSB 1TTZA 4NV5A 1AC1A 2LJRA 4MZWA 4FH8A 2X99A 4TR0A 2O85A 1F37A 5DJLA 2DJJA 1OC9B 5F07A 3D22A 4ZL8A 2FNOA 3KH7A 4KSMA 2C0GA 4MLYA 4LLRA 2H66A 1XZOA 4IW9A 3A2WA 5IIZA 3QFBC 2DIYA 3VWVA 1XW9A 4HZ2A 2RUFA 3TGZA 4HUAA 5HFGA 5D9XA 4AGSA 3ZLPA 4ILFA 2RM6A 3F4SA 3ZVJA 4ECCA 2P0GA 1GSSA 1JLWA 5AIVA 1V40A 4KCAA 4POMA 4MMMA 5A4UA 4JZQA 3N9JA 3FZAA 3ERFA 1V98A 1MDKA 2H70A 3TOTA 2F8AA 1YF1A 1UVZA 2X8HA 2LRTA 3WT1A 2PMTA 1XCCA 2L4CA 4K1FA 2H0IA 3EVIA 4V1Ap 5DQSA 1DUGA 2JSZA 5HR0A 5ELGA 2YOIA 1QUWA 5A4WA 2B6MA 3HZ8A 2HFDA 1LU4A 4PXOA 5GSTA 2LJKA 5IMDA 2CVKA 2A2SA 2VCZA 4NHWA 5G5FA 5G2ZA 5HR3A 5DBQA 3BCIA 5KN2A 2FY6A 2HRNA 3FZ9A 4OFNA 3UL3A 2IY2A 1U6TA 1BQ7A 3GMFA 5KN1A 3VI7A 2VLVA 2YCDA 5B8BA 1UC7A 2GT6A 5J3RA 4KSOA 2R4VA 1GLPA 20GSA 3IOSA 1AQWA 1ZYEA 4KX4A 1YJ6A 4Q5NA 2DJ2A 3E9JB 1Z9HA 3LSZA 2E7PA 2FWHA 3TKSE 1GUHA 1TU8A 5DCGA 1O7UA 3CSJA 5AGYA 5DALA 2VLUA 1THXA 1V2AA 3TJJA 2DC5A 3GKMA 3VPTA 4ECIA 1XW5A 1HD2A 3TRQA 3G9BA 1BAYA 1PX7A 3ME7A 2JADA 4EL1A 1O8WA 3D21A 5ECHB 2ON7A 3D4TA 4EC0A 1M0UA 4NXIA 4MCUA 3QCPA 4MJCA 3ZZXA 4MDCA 3IHQA 2DJ0A 1UN2A 1UA5A 3VFIA 2TRXA 2LQOA 2QC7A 5D9VA 2H19A 1JZWA 2LV3A 3UEMA 1AQXA 1YEPA 5LD0A 2AB6A 3H93A 2YNXA 1S3AA 1N2AA 4E8HA 1ST9A 4H86A 2KUCA 4V2NA 5ECSA 2VIMA 2GLRA 3I69A 4I8BA 5F0GA 4I2UA 5J4UA 2CZ3A 4POBA 4MF5A 1TXXA 2CA8A 2H1BA 2Z9SA 4NAXA 1OC3A 3KEBA 1R26A 4CW9A 4ULXA 2L5OA 5ECQB 1FVJA 3O76A 2TRCP 4I2TA 2GSSA 1GSYA 1R4WA 1GSUA 3JCML 4WF5A 2GZPA 3UIWA 3IBHA 3IK9A 5IPHA 3F63A 5IO2A 1TU7A 1U87A 1GSEA 1JZOA 3FKFA 3VPQA 1MTCA 5G31A 3GSSA 4O92A 1PQNA 1OAZA 4GWRA 1A2LA 1V58A 5HR1A 3U6VA 1HNAA 4MZBA 3DVXA 4G2EA 1Q4JA 4BA7A 1MEKA 4RUVA 4IHUA 4ZILA 2VAFA 2VCTA 3TDGA 2H1AA 3KTLA 4J57E 4ZL9A 3GKNA 4N10A 4ZB6A 3MAKA 3GURA 2OBKA 3GA4A 1EP7A 4TN8A 2R6KA 3EU4A 1U3AA 2H76A 1HNBA 3GUSA 4GSSA 3GH6A 1M2DA 1E2YA 3W6GA 3L78A 4BVXA 4LL4B 5G5EA 3SBCA 4XRDA 1YDKA 1XVQA 1ACVA 3F8UA 2X64A 1ZCPA 2JZSA 1RQMA 3ZFBA 1JLVA 4XHMA 2VOCA 17GSA 3N5OA 4GCIA 1E6BA 1X0RA 2MYGA 2MZCA 1QFNA 1F3BA 4DSRA 1FG4A 3RAZA 5CP1A 1SK0A 2H30A 2GT5A 4PNGA 1WIKA 2PU9C 4MJAA 1SD9A 5ID2A 1G6YA 1ABAA 4ZBBA 2PVOC 5JCWA 1VF1A 1AIUA 4BL7A 1Y6EA 3LQ7A 4V1Ag 3PINA 2VCQA 3I9V2 4HS1A 4I6XA 5ENUA 1HYUA 1K3LA 3KCMA 3L9SA 1HNCA 1T4ZA 1GRXA 2I3YA 1A8LA 1QQ2A 3OR5A 4KE3A 4F0BA 1FHEA 5JWQB 2HT9A 4DSSB 4EO3A 1TRWA 2C3NA 2WB9A 4O7HA 4LMWA 1FB0A 1K0OA 2OBIA 4PNFA 3APSA 3CTFA 3J7Yk 1M9AA 4L0WA 2KP1A 3QFAC 3A5WA 5ECPB 4F03A 4OFMA 1O8XA 5IM9A 3VK9A 3ZRDA 1T00A 1A23A 2IMDA 3LG6A 1SENA 1X5EA 3F3RA 2HE3A 3GX0A 1R7HA 1B4PA 5LNKe 2V1MA 4PGTA 3TKSA 2H6ZA 5INYA 2DLXA 3J7Yb 5IMVA 1IYIA 3FW2A 3Q18A 3H1NA 4TOPA 4OWYA 1WMJA 3EU3A 1GTUA 1SL1B 1XOAA 1TI1A 4LMVA 4K7OA 3HCZA 5B7CA 1T1VA 1A8YA 3GIXA 4PUFC 3QAGA 1BJXA 2ZCTA 2G0FA 1G7EA 5LCZA 3WYWA 2VUPA 4LA1A 4ZB8A 1K0NA 2GVPA 1VGLA 4O5RA 1F6MC 5DJMA 1U88A 1W89A 4YQVA 4ZXGA 3PGTA 4WEYA 1EZKA 14GSA 2OE0A 2YJHA 4GTUA 4MPGA 3TJFA 1PN9A 4HU9A 2L5LA 2IMKA 5KN0A 1B4QA 5JCGA 4XS6A 2C0DA 3GL3A 3D4MA 4X0XA 3G7JA 3TKQA 1F3AA 2B7KA 1WRYA 6GSUA 1SL0B 3DWVA 5B8AA 1XPVA 2OACA 3CSHA 3WGDA 3MWHA 1LBKA 3GKKA 1T3BA 4L5LA 2GSRA 2LSTA 3FZ4A 3PR8A 4EXJA 2H8LA 1ZYQB 3TKSC 1GSFA 2O87A 1C72A 1GUKA 4MF7A 4MH2A 1MDJA 4IJIA 2OE1A 3TJKA 1PGTA 3FZ5A 5FT3A 4TR3A 3IXRA 3F3QA 1EOGA 1NM3A 4XS1A 1IYHA 2QGVA 3KTBA 3M3MA 3FEUA 2IL3A 2E0QA 1ILOA 4PURA 2H0HA 3ZREA 4WF4A 1T8EB 2C0EA 2A4VA 2I1UA 2OJLA 2NBSA 1KEBA 2J9HA 4MP4A 4GF0A 3A2XA 3IA1A 2GQLA 3UBKA 5D96A 3C1SA 4NHZA 2IMFA 1WE0A 3KP8A 4HDEA 5AN1A 1AXDA 3M0FA 4WBJA 3D0ZA 4NV2A 1XXUA 2IMEA 5DCHA 1SJIA 2MMAA 2ES7A 1XWCA 5J9BA 5GAPD 2LRCA 1Q98A 3DD3A 3DMLA 5D93A 2YPMA 5D9WA 4FIWA 18GSA 2FWEA 2CZ2A 4IQ1A 3H4KA 4MABA 1PSQA 2M80A 2ZNMA 3RPPA 2V6KA 3P8WA 4DEJA 1GWCA 1VRSD 2K8SA 4BVYA 2GZYA 5J9CA 2MBSA 5CRHA 4HQSA 1LJRA 4KW6A 1PL2A 4F9ZA 4KUNA 3DEXA 4CDOA 4K0GA 3L4NA 4N0VA 3HDCA 7GSSA 2K9FA 3I43A 5IOXA 1SD8A 5C04A 2AYTA 1ML6A 2IJYA 4QL7A 2H71A 4EE0A 4IP6A 2YP6A 4RI6A 2G2QA 4IGJA 5DDLA 3KGKA 3LWAA 3DRNA 1TK0B 4KCEA 4JU5A 1TK5B 4D73B 1B8XA 2V6OA 3C1RA 1Z7RA 5A4VA 1SK1A 1OE7A 3A3TA 5ECLB 4O32A 2H1DA 2P5QA 4I97A 5G1KA 1GULA 1SYRA 1J9BA 4ISDA 3IAM2 4FO5A 3ZIVA 2H73A 1ZZYA 2LKUA 1OYJA 4KDUA 1EEMA 4AJ8A 3ZL5A 3F9UA 4TR1B 5ECOB 4NMUA 2LNTA 2C4JA 2LQQA 2TIRA 1HQOA 1G0TA 1WJKA 2AV4A 1J08A 3EWLA 2VM2A 3HJOA 2LTKA 1TRSA 1Z6NA 1B48A 2XC2A 3CXGA 3ZMKA 5HFKA 4WR5A 1K3YA 1GH2A 1RW1A 2FLSA 4GSTA 4KAEA 3QAWA 2CAQA 2I4AA 4DSSA 2F3MA 5CRWA 2J23A 2E2GA 3DIEA 2GTUA 3Q74A 4IKHA 2LS5A 1PD21 3GSTA 2GZZA 2F8FA 2XBIA 3ME8A 3VURA 4J56E 4OCEA 4Q5FA 1TRUA 5C00A 6GSXA 3S9FA 5ECKB 4TVEA 1Z3EA 3MNGA 4QQ7A 2D2ZA 3GX8A 1ZOFA 3W8JA 1TKDB 4MK3A 2PBJA 2I9HA 4EF0A 2MBTA 5E59A 1SKRB 5JCUA 3H8QA 1X9WB 4WR4A 11GSA 2JL4A 2RLIA 6GSVA 2FWGA 3D5JA 1TOFA 1XW6A 1FO5A 3C73A 1F2EA 4K9ZA 5D9TA 4N0ZA 3BD2A 3M9JA 4GQCA 3MDKA 1SK2A 2YWOA 2CAIA 2MMOA 2NDOA 2AUVA 2MMNA 3IC4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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