2H0IA

Crystal structure of dsbg v216m mutant
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
ELPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCPYCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAMGLPDQKTLNIIMGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Short-circuiting divergent evolution: laboratory evolution of one disulfide isomerase to resemble another
rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbG
molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
total genus 65
structure length 229
sequence length 229
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 2h0iA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h0iA02
5LNKe 3FR9A 1HNBA 5ECQB 4ECJA 3KMOA 5ABRA 5A4WA 1GSYA 2F3MA 5DDLA 3TOUA 3IPZA 3IR4A 1PD21 4GXZA 3HHVA 1TK8B 1AIUA 5CP1A 1V2AA 3KCMA 1A0FA 1M2DA 1SYXA 3ZREA 2DMLA 5DBQA 3QCPA 2VCZA 5IPHA 2P5QA 3QFBC 2IFQA 3VWUA 2H01A 4DSSA 2VLUA 4EF0A 4K9ZA 1GNEA 2H75A 1ILOA 2LS5A 2YZUA 4ZL7A 2V1MA 1JFUA 1YJ6A 1GTUA 3ZYWA 1FHEA 4IP1A 4NXIA 4WF4A 3RPNA 2FUG2 3ME7A 3VLNA 4EC0A 3OR5A 3MWHA 1GP1A 2JL4A 2AYTA 2F9SA 1GH2A 2I1UA 3TKRA 1IYHA 4MA9A 3EINA 2J9HA 2QSIA 3GNJA 3IRAA 1PL1A 1XW5A 2Z9SA 1Y6EA 2H1GA 3US3A 3GRXA 4PNGA 1K3YA 5GSSA 2O7KA 3GKXA 3W8JA 2LNSA 3E9JB 5KN1A 5FT3A 5IQYA 1YEXA 4JZQA 4OFTA 1B48A 2IWTA 2PWJA 2HLSA 1QK8A 4TR4A 2H74A 3LFLA 4EL1A 5G1KA 1GUHA 2FWHA 2B5XA 4FYBA 2J23A 3TJFA 5G2ZA 3TB2A 4I6XA 1T8EB 3F6FA 1XW6A 4KDUA 4TR0A 1Z7RA 3LG6A 3W8SA 2F8AA 4LMVA 2R37A 2KUCA 4GWRA 2GZZA 3TRPA 3GFKA 5IO0A 5JWRB 5LCZA 2DJ0A 4K0NA 3BOAA 1T1VA 2YCDA 4YQVA 4WBRD 2E7PA 1ZYEA 2JZTA 2DJ3A 3KJYA 2C4JA 3H79A 1TK5B 1K3OA 3GKKA 4MJCA 3O3TA 1WRYA 2L6DA 1E2YA 5HFGA 4D73B 3ZL5A 1SU9A 5ECIB 3ZFBA 4V2MA 4MF6A 2CAQA 3HKRA 2TIRA 3DKSA 2F51A 1H75A 4L5OA 1B8XA 2QGVA 3L78A 1BQ7A 3HA9A 1XZOA 2H1AA 1DSBA 2VCQA 3KEBA 1ON4A 3ZIVA 5C00A 3FKFA 1SKWB 2B3SA 5JWQB 4OMVA 3U5RE 4K1FA 2L6CA 5IMVA 1Q4JA 2WFCA 5B6NA 2BJXA 1E6BA 3GHAA 2FA8A 4KH7A 4GSSA 2G2QA 5IMDA 2FY6A 1TU7A 4MZBA 4AF2A 2VM2A 5ELGA 1GUMA 1MEKA 4KUNA 1O81A 2DIZA 2AAWA 2LSTA 2JZRA 3VK9A 1UVZA 3G7IA 1DE2A 5KN3A 2FWEA 4LMWA 3P2AA 3MSZA 2PVQA 2KLXA 1Z5YE 4I5QA 1T7PB 2IMFA 2VL9A 4HUAA 3EURA 2RUFA 3K8NA 4F03A 3I9V2 2HNLA 1OC3A 3EMPA 1EP7A 4YAVA 4Z7XA 2OKAA 3TDGA 4GQCA 3L4NA 5ID2A 5D9XA 4KA0A 2I81A 2JACA 1WMJA 2FNOA 1PN9A 1SYRA 1TRUA 3WGEA 4XRAA 4PXOA 2ON7A 2WB9A 4WR4A 2WGRA 2HSYA 2EIRA 2HI7A 4MCUA 5JCWA 2R6KA 4ECBA 2DIYA 3KGKA 3ZIJA 2ZNMA 3LORA 1S3AA 6GSTA 4NWYA 3QAWA 2WZ9A 4TKYA 3ZLPA 3DIEA 1ZOFA 3CRUA 1QGVA 2X8CA 1KBNA 1M99A 2K8SA 3E3EA 3E0UA 3QMXA 4I2TA 4RQRA 1K0AA 3TRXA 4ZL8A 3ERGA 2WS2A 3GH9A 3APSA 3HVVA 4CDOA 5B7CA 3GUSA 2C0FA 1X5EA 2VL2C 3QOUA 1LJRA 3I69A 2CVDA 3H1NA 5D96A 2OBKA 2VIMA 4N0VA 4ZBAA 4I8BA 4WKWA 5EY6A 3C1SA 4POMA 4WF5A 3RHBA 2TRCP 5EVOA 4KDXA 5JCUA 2IYJA 3ED3A 4K0GA 3J7Yk 3HJMA 4GQFA 3ME8A 1RW1A 2A4VA 5KN2A 5J41A 2R3XA 3F4TA 3SWLA 1BJXA 4IW9A 1XWBA 2HRFA 4KX4A 4Q5RA 3FY7A 3J7Yb 1GSDA 1VF2A 4KB3A 2LJAA 4DEJA 5F05A 4LLRA 2PERA 19GSA 1OVNA 1ABAA 1HNAA 3Q6OA 4MLYA 2IJYA 2ZUPA 3ZVJD 2DJKA 1PKWA 4HJ2A 1O8XA 1MTCA 5FHIA 3TUEA 2IMDA 4ULXA 4MP4A 2OE3A 3GA4A 3LQ7A 3ZMLA 3HXSA 5DJLA 4L8EA 1ZCPA 1BEDA 4ILFA 5D9TA 2YWOA 2P31A 1O73A 1B9YC 3F6DA 4JU5A 2LEGA 3GX0A 5HR1A 4BWQA 5ECPB 3DXBA 3KP8A 3TKPA 3HJOA 5B8BA 2GSRA 3RPPA 3FZ9A 5D93A 1G7OA 3GYKA 2GSTA 5DJMA 2ZCTA 4NV2A 5HR3A 3R2QA 1M0UA 2X8HA 2KHPA 3TCOA 2CA8A 4D73A 3WT1A 2C80A 2C3QA 4KAEA 4AJ8A 1FOVA 3TKSE 2XHFA 4POLA 4K8MA 1OYJA 4PQIA 3H93A 3IE3A 5ENUA 4X43A 3FHKA 2LKUA 1U3IA 5AISA 1LU4A 2H0HA 1SD9A 2MMAA 3RDWA 3RBTA 3RAZA 1G7EA 5CNWA 2XPEA 4FYCA 5JCGA 3GX8A 3D4MA 3Q74A 3LXZA 5DALB 2D2ZA 1SKRB 1EEJA 3FYGA 5CO3A 1BG5A 1PQNA 5E59A 1ERWA 1GTIA 3I6AA 1EOGA 2GGTA 2E2MA 4KDYA 4LL4B 3HZ8A 2IY2A 4EE0A 3ERFA 3FZ4A 3QD9A 3GKMA 4JBBA 2M46A 4XS6A 4TXOB 1Q98A 1X9WB 5ELAA 3P8WA 3TJKA 1R26A 2A2RA 2IPAA 5D73A 2JSYA 5ECNB 3TKSA 1M7TA 2GS3A 4NHZA 5INYA 5F8BA 1EV4A 2YOIA 3L0HA 4J2FA 1SK2A 3ZRDA 1VGLA 2JSZA 4OCFA 1FO5A 2OE0A 1YZXA 1T00A 3KM6A 1A24A 1AQVA 2BTOT 2DJ1A 3F3QA 1M2AA 2C1YA 1Z6NA 4O7HA 4F2IA 2YWIA 2YPMA 1SENA 4F82A 4TN8A 4OFNA 4OWYA 4L0WA 4V2LA 2GT5A 5AN1A 2B6MA 1SK0A 3TKSC 6GSUA 1VRSD 1UC7A 1FVJA 3EVIA 1M2BA 3CTGA 4KW6A 4PUFC 3N9JA 3BD2A 4ACSA 1XFLA 1HYUA 1RQMA 1EWXA 1K0CA 2V6OA 2CV4A 6GSVA 4YQUA 1EP8A 2GZPA 4LL1B 4RI7A 5D9VA 1OE7A 3PGTA 3VWWA 2CZ3A 3ZFLA 1YQ1A 1YF0A 4O32A 4ML1A 5ECRB 1V40A 1JZWA 3HVXA 2LQQA 2LNTA 1JHBA 2IMIA 1MDIA 3ZITA 3IBHA 2HXKA 2L5OA 2IMEA 2RLIA 3FR3A 3KXOA 1B4PA 2N5AA 3QDNA 1K0OA 3IC4A 1V98A 2JADA 5CRWA 1Z6MA 4MH3A 5FWGA 2DJ2A 3QPMA 2LUSA 4L0UA 4NAXA 2VCXA 1OKTA 4OFMA 1T4ZA 2YANA 1TJDA 5DVBA 2TRXA 1GTBA 4AJ6A 3C8EA 1YDKA 4KCAA 3VI5A 3IA1A 1QUWA 4J57E 3HY2A 4MZCA 1A8YA 5GSTA 1G0TA 1SJ6A 4ZL9A 2R5GA 5DQSA 3CBUA 3IXRA 4N30A 1FB0A 5CYYA 1SL1B 2H19A 4CW9A 1URMA 2LQOA 4PNFA 5CRDA 3IV4A 3D6IA 1AQXA 1X5DA 2I3YA 2CT6A 3VWVA 1PKZA 4GF0A 5ECLB 2E2GA 4K2DA 1F9MA 1GSSA 3Q18A 3DVXA 2GTUA 5G5EA 2HFDA 1V9WA 1Z7PA 3DGQA 3UAPA 2C3NA 3U6VA 1DBYA 5G30A 4ECIA 1F37A 1TDIA 3WD6A 3D4TA 4EDYA 4PQHA 2YWMA 3C1RA 1GRXA 1TI3A 1HNCA 3GH6A 2DBCA 4H86A 3FW2A 1VF4A 3DEXA 1XXUA 5A5KA 5ECOB 2H6XA 1SD8A 3IHQA 3DRNA 4MJAA 6GSXA 4WBJA 4Q5QA 3BJ5A 3F9UA 4N11A 2GDRA 3VI7A 1AQWA 1AW9A 1F3BA 3UVTA 4ISDA 1JZDA 5D8IA 1GSEA 1TTZA 4DSQA 3BCKA 1XWKA 4JR6A 1TU8A 5IMZA 4BVXA 4IJIA 4IQ1A 2YNXA 1B4QA 4X0XA 3QAGA 2VL3A 4RUVA 22GSA 1ERUA 1I9DA 4HI7A 4TR3A 2N5BA 1TW9A 1XWAA 4N10A 1AAZA 2H73A 2R2JA 5HFIA 3LWAA 1YEPA 4V1Ap 4YAPA 3ZMKA 2H8LA 5J3RA 4HU7A 3DVWA 2YZHA 2GVPA 2PU9C 2JU5A 4O5RA 4KCEA 9GSSA 1Y25A 2PBJA 5IPGA 3LXTA 3O6TA 1ZYQB 5G1LA 5H5RA 20GSA 1WPIA 4PX1A 3Q19A 1S3CA 5DALA 5AGYA 1R7HA 1OAZA 4ZB8A 2VOCA 5EPFA 1U88A 2OA7A 2H70A 1A2LA 1N8JA 1PRXA 3WT2A 1OE8A 3G7YA 2H6YA 4V1Ag 1XCCA 3H8QA 2K18A 2B1KA 2E0QA 2C0EA 1PSQA 5HR0A 1FAAA 1KNGA 4DSRA 4X1UA 18GSA 1A8LA 4TXOA 3EMXA 4ZB9A 3LYKA 2WJUA 4P3YB 2GLRA 2H0IA 2O85A 4XS4A 2LJKA 1GLPA 1PX7A 2KP2A 3UMAA 5ECMB 1NW2A 1O6JA 1W4VA 2HE3A 4KGIA 3UEMA 4V2NA 5AIXA 3VURA 3HZ4A 1R4WA 4K7IA 2HZFA 4G19A 3H4KA 3HCZA 3MNGA 3P7XA 4OO5A 5KEJA 2WDUA 1G6YA 5GAND 2VCWA 3M1GA 2FCHA 3I43A 2MBSA 3FEUA 1ST9A 4IQAA 3BBYA 5IOWA 1J08A 1V57A 3WYWA 3ZZXA 2NDOA 3TOTA 2OACA 4EDZA 2EC4A 1GL8A 2MMZA 2V6KA 2PGTA 2GSQA 2PN8A 5J5NA 2AHEA 2NBSA 2P5RA 5H5SA 1HQOA 4ECCA 2YN1A 4HQZA 3UBKA 1TI1A 4RI6A 5GAPD 2HRNA 1WOUA 5D9WA 2IMKA 3EYTA 3PH9A 3NIVA 4XHMA 1OKDA 5DCGA 1WP0A 4HDEA 4O92A 2FWGA 3DD3A 4FIWA 4DVCA 3D5JA 3RHCA 4EO3A 3LGCA 2NPBA 3G7JA 5KN0A 2MZCA 1GLQA 4MJEA 4QL7A 5L71A 2K8VA 1W89A 1TKDB 4TOPA 2RIIA 2OJLA 2YV7A 2PPTA 2I4AA 4QL9A 2PVOC 4IBPA 4RQXA 3FZAA 1U3AA 4ZIJA 3D22A 1K0BA 4KSMA 2HSHA 2G0FA 2IIYA 4F0CA 2LV3A 4MPGA 6GSYA 2PUKC 4YQMA 4OCEA 3LEFA 3HJPA 3DYRA 4PURA 3ZVJA 1XVWA 3IK9A 4WEYA 1GSUA 4E8HA 5DAKB 1X9SB 2RUEA 3M3MA 3EU3A 2N5FA 4XS1A 2NVLA 1V58A 2O8VB 13GSA 1SK1A 2DLXA 3GSSA 4HJMA 2HZEA 5J9BA 1Z3EA 2VCTA 4EXJA 4IKHA 1XVQA 3IK7A 2B1LA 1PMTA 1U87A 1F6MC 5IMAA 4ID0A 4IHUA 2B5EA 2GQMA 3UVHA 2FWFA 1O7UA 3SBCA 1PX6A 4FH8A 2VUPA 3TRQA 3APOA 1OC8A 1F2EA 2V41A 2M80A 4IJ3A 4G9HA 4PGTA 1BAYA 3PR8A 2C0GA 2LRTA 2A2SA 2XBQA 2H76A 3A2VA 3GKNA 2FLSA 4XS4B 2CAIA 3NOFA 3CRTA 4HZ2A 5IM9A 2LJRA 4CHSA 1SJIA 5COHA 1PA3A 3A2XA 1GULA 1K3LA 1F3AA 1ERTA 1ZL9A 4Q5NA 4HEA2 5HQPA 4GLTA 4POKA 1MD3A 3QFAC 3P90A 1YKCA 2HYXA 2C0DA 1OC9A 1B9XC 2YWNA 1FW1A 3GURA 2X64A 2L57A 3AY8A 3VPQA 1WE0A 1NM3A 1NHYA 3EE2A 2MBTA 4EKZA 2KP1A 2VD1A 4IELA 2O87A 8GSSA 4IVFA 5F07A 1XOBA 5F06A 4GSNA 2EIOA 2VD0A 1S3DA 2X8GA 2ON5A 3MAKA 4OD7A 1PL2A 3CYNA 3A5WA 2B5YA 3LJRA 1I5GA 3IOSA 1PGTA 3EC3A 1EOHA 4LA1A 4EUYA 1ZZYA 1XOAA 1K0DA 2H72A 5B8AA 6GSWA 4NMUA 3TGZA 1MD4A 1IYIA 4HOJA 3L9UA 4MK3A 3PINA 5J4UA 1VF3A 2FA4A 3KZQA 2R4VA 1A0RP 3VPTA 3TJGA 4NV5A 3KP9A 2VO4A 4IGJA 4XTSA 1DE1A 3C73A 1ACVA 4HU9A 4BWSA 2OE1A 4XCSA 2CZ2A 5IIZA 2H1DA 2KOKA 1JZRA 4KSOA 3GTUB 2H66A 1HD2A 1EGOA 2YV9A 5CAXA 2M72A 4PUAA 1DUGA 5F0GA 3GL5A 4TR1B 1BYEA 2C3TA 1THXA 1YY7A 2WULA 1TRVA 1R5PA 3TKQA 2WRTA 2P0GA 1SL2B 3F8UA 2VLTA 1GTAA 3LYPA 4MABA 3IDVA 4MMMA 10GSA 2CQ9A 1Z9HA 2FHEA 4Q5FA 4ZXGA 2VM1A 4MPFA 1NHOA 2QC7A 3C7MA 4J56E 3A2WA 3CMIA 3GMFA 3KTBA 1LBKA 1XPVA 4ZB6A 5IO2A 4MDCA 4K7OA 4TVEA 3MDKA 5IMFA 3A3TA 4AGSA 1K0MA 3KD0A 3WGXA 4ZBDA 5B6MA 1TP9A 4OO4A 5ECKB 2LTKA 2DSAA 1XW9A 3C71A 3FRCA 3O76A 2HZEB 3W6GA 3ERWA 3FR6A 3CTFA 1JLWA 2RM6A 1T3BA 1QFNA 2MMNA 4XRDA 1X5CA 5GZZB 4XIHA 3UIWA 1K0NA 2XPDA 4KE3A 4TW5A 4GRFA 2CVBA 3KH9A 2PMTA 3M0FA 5A4UA 4BPYA 1JLVA 4I97A 4POBA 4IN0A 3UBLA 3M8NA 14GSA 3L9SA 1CQHA 3F0IA 1GSQA 3CSIA 4YH2A 5H5QA 3DMLA 4ML6A 3FZ5A 4MH2A 2FD3A 3EWLA 3TJJA 3EU4A 2F8FA 1FG4A 3M9JA 5G31A 2XC2A 1KEBA 4L5LA 1OC9B 4ZBBA 6GSSA 1SKSB 1X9MB 1WIKA 2HT9A 1AC1A 2EIQA 2IFQB 4KNDA 3V1WA 5HFKA 4DSSB 3HD5A 4K7NA 1O85A 2H30A 5DAKA 2DMMA 2K6VA 2DC5A 4G2EA 1QXHA 3LSZA 1WWJA 4QQ7A 5DQYA 3ISOA 2V2GA 2B7JA 2REMA 1MDKA 1TRSA 4HQSA 3L9VA 2FGXA 4IS0A 1KTEA 3F4SA 1ML6A 3UJ1A 4WXTA 3KTLA 1USBA 3KIJA 1XIYA 3DWVA 2GSSA 3D0ZA 4BVYA 1M9BA 1QMVA 3F63A 1ERVA 4FYUA 17GSA 3N5OA 1EGRA 1RK4A 1M9AA 2K9FA 2L59A 5A4VA 4ZILA 2VL2A 2O89A 2YP6A 4BL7A 4F9ZA 1UA5A 2YJ7A 1XWGA 2ES7A 2V32A 3HYPA 3F4RA 1ZGNA 4MF5A 2BMXA 2CX4A 2VCVA 4JR4A 3UARA 2MMOA 5G5FA 3GV1A 1MDJA 1JZOA 1GNWA 4MF7A 4GTUA 3GN3A 5ECSA 3CXGA 11GSA 3GIXA 3IAS2 5JWOB 4TRXA 2GQLA 1XWCA 4F0BA 4I2UA 2XBIA 3ZTLA 4HZ4A 2CX3A 2QKEA 4EVMA 2ALBA 3HVSA 1TK0B 1TXXA 2AB6A 3GSTA 1GWCA 1H4OA 5CRGA 2YJHA 1FVKA 1AXDA 5CRHA 2GZYA 1WJKA 4FO5A 1ZMAA 1X0RA 4JRRA 1J0FA 3JCML 2DJJA 3NZNA 5EL8A 3KMNA 2B7KA 3CSHA 4AJ7A 2OADA 2H71A 4E8EA 2AV4A 1J9BA 1EEMA 1GUKA 2L4QA 2JZSA 1THOA 1U6TA 2C8UA 2IL3A 1SL0B 2OBIA 3VWXA 1XBSA 1AUCA 4GCIA 4NPBA 4N0ZA 5HR2A 2H1BA 3UOMA 3GTUA 4JE1A 5ECHB 5AIVA 1QQ2A 3QR6A 2LRCA 3KH7A 4TR1A 4K6XA 1C72A 5J9CA 4PQ1A 3CSJA 1N2AA 1BX9A 4BA7A 1TOFA 2H6ZA 3UL3A 2LRNA 2WCIA 4HS1A 2H0GA 1UN2A 3M9KA 4MJBA 5C04A 2L4CA 1TRWA 3BCIA 2IN3A 2GT6A 1A2MA 3APQA 5IMCA 3HDCA 5E4WA 2AUVA 2CVKA 4IP6A 1G6WA 3F3RA 3VFIA 2GQKA 3WGDA 3G9BA 1YF1A 1FB6A 1NSWA 2X99A 3QAVA 1GSFA 2I9HA 2L5LA 1R5AA 3IAM2 4WETA 3GL3A 1O8WA 4NHWA 1VF1A 12GSA 1CQGA 4MZWA 4TXVA 2AJQB 5CREA 4G10A 1T4YA 1EV9A 4JEDA 4WR5A 2MYGA 2VLVA 1A2JA 3D21A 5IOXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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