2H0IA

Crystal structure of dsbg v216m mutant
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
ELPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCPYCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAMGLPDQKTLNIIMGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Short-circuiting divergent evolution: laboratory evolution of one disulfide isomerase to resemble another
rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbG
molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
total genus 65
structure length 229
sequence length 229
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 2h0iA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h0iA02
4ACSA 1PKZA 4GWRA 3PINA 1IYHA 1H75A 5EY6A 1XFLA 5AN1A 5IM9A 3NIVA 3ERFA 3QFBC 2GT6A 4JU5A 5IMZA 2H1BA 4MJEA 5CO3A 2CT6A 5DAKA 3SWLA 4OFMA 2YPMA 2TIRA 2FWGA 17GSA 4GSNA 2HSHA 1BEDA 1LJRA 1V58A 4L0UA 2TRCP 1QQ2A 3FZ4A 1WWJA 2CX4A 3GN3A 1Y6EA 4JE1A 2MMAA 3TOUA 3Q19A 2DJ3A 3M9KA 2WS2A 5J3RA 1EEMA 5A4VA 3VLNA 3IOSA 1DE1A 1F6MC 3HZ4A 1HD2A 2CAQA 4MMMA 1U87A 3LYKA 5ECHB 4L5OA 2HZEB 5HFKA 1GRXA 3L9VA 5CRDA 2HT9A 2GLRA 3ZZXA 1GSEA 2L59A 4IP1A 2JSZA 4I2UA 2NPBA 2FUG2 3CSHA 1TI3A 1BJXA 3A3TA 2OACA 3TKRA 4RI7A 4K6XA 2O8VB 2EIRA 2OADA 2H1GA 4KCEA 1JLVA 3ERGA 5D9XA 2KP1A 4NHWA 5FWGA 3LFLA 4XRDA 1OC3A 3LWAA 1G7EA 4GLTA 1XWKA 2H66A 5CYYA 4ZXGA 4EO3A 3TKQA 2KHPA 2OA7A 4XIHA 4JBBA 2PGTA 2ZUPA 5J9BA 4KAEA 3VURA 4MH2A 1GTIA 3IPZA 1SJIA 4WF5A 4MLYA 3CSJA 2EIOA 2IFQB 1TK5B 4J57E 4EKZA 3A2XA 1M2BA 3EVIA 1ABAA 5DJLA 4PGTA 4OO5A 1ZZYA 3UOMA 1TK8B 2M46A 1U3AA 2K8SA 1JZOA 1M2AA 2TRXA 4ZL9A 3FW2A 2GVPA 2H0IA 2VCWA 1B9YC 3W8SA 3VWXA 5IMCA 16GSA 4PURA 5IO2A 1SKWB 3UAPA 4MJBA 5G5EA 5ECKB 2ALBA 5JWRB 3EURA 3HYPA 5B8AA 2OJLA 1PMTA 2FA8A 5HR2A 5C00A 3GUSA 3CYNA 2A4VA 3H93A 3HXSA 2DIZA 2MZCA 3ME7A 4GXZA 1GLPA 3H8QA 3A5WA 2V2GA 1QXHA 4KSOA 5F0GA 3HKRA 5E59A 2DBCA 4MF6A 1W89A 4L5LA 1X5EA 2DJ2A 2FWFA 2YCDA 2DJJA 3C1RA 4FYBA 4F9ZA 4L0WA 1ST9A 4XS1A 1T4ZA 2AYTA 2VL9A 2C3NA 2IMKA 2OE1A 3EU4A 4TR1B 2V6KA 4IVFA 4D73B 3P2AA 2PPTA 1R7HA 5JCGA 4FYUA 13GSA 2CZ3A 3PH9A 2DJKA 3S9FA 1QK8A 5HFIA 3APOA 5DVBA 2GGTA 4JR6A 1OC9B 3HY2A 2X8CA 2MYGA 2ZCTA 1SL0B 4YH2A 3ZTLA 3ISOA 1LBKA 2GZPA 3I9V2 4TXVA 4ZB8A 3L78A 5F06A 5ECOB 5CRHA 4XS6A 3VWVA 5ELAA 5ECPB 5ECNB 1XW5A 4N30A 3MAKA 4WKWA 5AIVA 3TKSA 1G7OA 5HR1A 2C0FA 4HU9A 4RQXA 2N5AA 1N2AA 2REMA 2MMZA 3IRAA 3ZLPA 2PERA 1A0RP 3GH6A 4ISDA 1DE2A 2VCXA 1QUWA 2B5YA 2HZFA 3EMXA 1Y25A 3RHBA 3GFKA 3EE2A 4GTUA 1K3OA 4F03A 1A0FA 1FVJA 4J56E 4MZBA 6GSYA 4O5RA 1EGOA 4EVMA 1YF0A 4OFTA 5B8BA 3GSTA 5G1KA 2YWIA 1QFNA 3CRUA 1ERTA 1PX6A 2YNXA 4IN0A 4N0ZA 6GSVA 5EL8A 2DJ0A 2ON7A 3E3EA 4CHSA 4BWSA 1T8EB 3DVWA 3C71A 4MZCA 1SK0A 2RUFA 1V9WA 18GSA 5J41A 1GULA 4FH8A 4Q5QA 3HCZA 2LRTA 4K7OA 4E8HA 3KM6A 5GSSA 1YKCA 4K2DA 3WD6A 2VCVA 2R37A 4LLRA 1F2EA 4K8MA 1FB0A 5GAPD 4FYCA 4KDUA 1W4VA 4F2IA 6GSXA 5B6MA 5GZZB 2L57A 3QAVA 2CQ9A 1ZCPA 4LL1B 2GSQA 3RDWA 4YQUA 3DKSA 2KUCA 5D8IA 5DBQA 2LJKA 3TUEA 1F9MA 1VF1A 4POKA 3M1GA 2DC5A 5FHIA 4BA7A 2VD0A 2ON5A 3E0UA 4DSQA 2HE3A 1XWGA 4Z7XA 1TJDA 5J4UA 3ZFBA 2RM5A 2FD3A 3GURA 2IYJA 2VO4A 5LCZA 2OE3A 4JZQA 2X8HA 1OC8A 2XHFA 2HRFA 4KA0A 5G30A 2H1DA 1Q4JA 3O3TA 1EP7A 5B6NA 5DCHA 4IQ1A 5HR0A 4TR0A 1FOVA 3GL3A 3GKMA 3GL5A 2H74A 3DRNA 2GT5A 3GX8A 3LYPA 2R6KA 1YY7A 1MDJA 2R4VA 2VOCA 1BX9A 3HVXA 5D73A 2YWOA 2YN1A 4HQZA 1THXA 3LQ7A 2CVBA 4OFNA 3KTLA 3FR3A 1R5AA 1SYRA 3ZYWA 2FY6A 2E2GA 3P8WA 3IAM2 2LEGA 2DMMA 2MBSA 2GDRA 2LKUA 3QAWA 3U5RE 2YZUA 4V2NA 4K1FA 3E9JB 2E7PA 4IJ3A 2IWTA 2X99A 3RHCA 3UVHA 1DBYA 3D4TA 4N10A 2R2JA 2K18A 4MPFA 4ZIJA 1F3AA 3CBUA 4TR3A 4EXJA 1WRYA 4ZBBA 3TKSC 4ILFA 2PUKC 2EC4A 1S3CA 3ZVJA 1YEXA 2L4CA 3BJ5A 2WDUA 4KCAA 3VWUA 3LSZA 2IMFA 2EIQA 4G2EA 1RK4A 1Z9HA 3LXTA 2LV3A 6GSSA 3A2VA 4E8EA 3VPQA 3VK9A 1EGRA 4LL4B 5IIZA 3TJGA 4HU7A 4HQSA 5IOWA 2X64A 4CDOA 2FWHA 3G7IA 1SD9A 2FGXA 2B5EA 1AC1A 1EZKA 3N5OA 2PBJA 3F0IA 1K0AA 1VRSD 1Z6NA 5D9WA 4IHUA 1TDIA 1MEKA 5CRGA 4AJ8A 2QC7A 4NWYA 1XW9A 3IC4A 4FO5A 4ULXA 1ZGNA 4RQRA 3ZRDA 1X9MB 4OD7A 1WPIA 2VLTA 3LXZA 2CX3A 1GUKA 1S3DA 3FR9A 2HRNA 1E6BA 1FB6A 2JSYA 3RPNA 3M9JA 1R5PA 1ERVA 22GSA 5DALB 4N11A 3FR6A 3CRTA 5IMFA 5HR3A 4IJIA 2ES7A 10GSA 3L9SA 4F0CA 1B48A 2F3MA 2XPDA 4X1UA 3RAZA 3FZ9A 2LJAA 1HYUA 1XVWA 2LRNA 2O7KA 1WP0A 3F6DA 4WEYA 1E2YA 3GYKA 2IMIA 3H4KA 3HA9A 2GS3A 2NVLA 3GA4A 5F07A 2IJYA 1T3BA 3EU3A 1R26A 1YDKA 2LRCA 1HQOA 1K0OA 3PGTA 3QAGA 1J9BA 3EINA 2CAIA 1U88A 5EPFA 1PN9A 3O76A 4ZB6A 1TRUA 2VCQA 4DSRA 3DVXA 5FT3A 2FHEA 2GSRA 3KH9A 2L5OA 3L4NA 3KP8A 1OKTA 3IR4A 5ID2B 1EEJA 1Q98A 1XZOA 2AHEA 5H5RA 1VGLA 2CV4A 2B6MA 1EP8A 4IBPA 1KEBA 2WCIA 1GSDA 3KXOA 5IMVA 1FVKA 1G6WA 3HD5A 3H79A 4Q5RA 2A2RA 3UJ1A 5HFGA 4POLA 4DSSB 1ERWA 3TRPA 4MJAA 2LQOA 4EF0A 3APSA 2IMDA 1XVQA 3TJFA 2YV9A 1ZOFA 3CMIA 3US3A 3UVTA 1EOHA 3TKSE 2GQLA 4XHMA 3QFAC 1GH2A 1K0MA 1KTEA 1AUCA 1OAZA 4PNGA 2N5BA 5JCUA 4LA1A 3O6TA 2RM6A 3FEUA 3UBKA 2AJQB 2LQQA 2KLXA 5AIXA 4MK3A 2OBKA 5D96A 1ML6A 2F8FA 5CREA 4QL9A 4I97A 3TJKA 2C0EA 1GSSA 3VI5A 1MDKA 5DALA 2HZEA 5ECIB 5JWQB 3C8EA 3WYWA 3H1NA 5A4WA 4H86A 2OBIA 2YJHA 1UVZA 2MMNA 2VLUA 5DQYA 3WGXA 2R5GA 5KN1A 1ACVA 1GSUA 4MCUA 3KJYA 2I1UA 2IIYA 3GV1A 4TKYA 2GSTA 11GSA 2O85A 1GWCA 3V1WA 3WT1A 3GKNA 5ELGA 4IW9A 20GSA 2H19A 5JCWA 1GTBA 1T4YA 4O92A 3Q6OA 1A23A 1NHYA 1HNAA 3LG6A 5KEJA 2FWEA 1SL2B 5G2ZA 3KZQA 5CP1A 2F8AA 4XTSA 2DLXA 4AF2A 4KNDA 4K0GA 2WRTA 4MABA 2IFQA 1ERUA 2PN8A 1OE8A 3KD0A 4WR5A 5CRWA 2GQMA 3HJPA 4DSSA 2I3YA 5H5QA 3WGDA 2YZHA 3VI7A 2V41A 2FLSA 2VCZA 3TRXA 4TRXA 2XBIA 2H72A 2P5QA 5A4UA 4GF0A 1THOA 2G2QA 5F05A 4KDXA 1J0FA 1OVNA 4IS0A 1XCCA 3C73A 2PMTA 3QDNA 3TB2A 1WJKA 4HJMA 4BVYA 3MSZA 3UIWA 1NHOA 3QMXA 5IQYA 4KSMA 1TK0B 2DMLA 1YF1A 5GAND 5ECSA 4OO4A 9GSSA 4TXOB 1AQVA 1K3LA 1MTCA 2N5FA 3I6AA 2VL3A 1BYEA 2IMEA 1XWBA 14GSA 3MWHA 1GL8A 4IP6A 3KCMA 1ZYQB 1M9BA 2M72A 3P90A 4ECJA 3IXRA 5ECQB 5D9VA 3WGEA 5AISA 1O8WA 4WBJA 4G9HA 1WOUA 2GZYA 1TU7A 6GSTA 3VFIA 1ZMAA 2H1AA 4TR1A 3QOUA 3ME8A 2B1KA 3EYTA 3G7JA 4D73A 2I81A 2V32A 1JHBA 3BOAA 4HZ4A 3BD2A 3DIEA 1AAZA 4PQIA 5IMDA 1A8LA 2WULA 4HJ2A 3GH9A 3PR8A 1C72A 4IGJA 3ZITA 1JZWA 2H0HA 5DCGA 3EC3A 1JFUA 1OC9A 3HVSA 1CQGA 2B5XA 4YAPA 2VM1A 3R2QA 2GSSA 1PX7A 1FG4A 4KH7A 1FHEA 3F9UA 3RPPA 2C0GA 4NV2A 3D6IA 5G31A 5G5FA 5B7CA 5IOXA 1O85A 1MDIA 1J08A 1A2JA 2P31A 5ECRB 4EUYA 2OE0A 1SD8A 1V57A 4OWYA 2KP2A 1X0RA 3GIXA 1OKDA 1G6YA 4K7NA 4I6XA 4MPGA 2VD1A 1SU9A 4QL7A 2YANA 4EDZA 7GSSA 4YQMA 1SK2A 3J7Yb 2HNLA 4YAVA 2H30A 3F3RA 4O7HA 4PQ1A 1DUGA 1WIKA 3HJOA 1AIUA 1QGVA 3L0HA 3M0FA 1A2MA 4WF4A 1XWAA 2BJXA 2AB6A 4ZB9A 1PRXA 3BCIA 4KDYA 4NMUA 2IL3A 3IK7A 3KIJA 2NTOA 4GSSA 4BL7A 1SK1A 4ML6A 1M9AA 2DJ1A 3A2WA 4YQVA 3HDCA 3HZ8A 2LNSA 1TRVA 3F3QA 2DIYA 4P3YB 1X9SB 2VCTA 3LEFA 1B9XC 2WFCA 4GQCA 3BBYA 1RW1A 2X8GA 2JZTA 3D21A 5J9CA 1GP1A 4PXOA 1XPVA 3DWVA 1HNCA 2E0QA 1O7UA 2H70A 2K9FA 2C3TA 3TJJA 3DGQA 3KMOA 2E2MA 1GSYA 3D22A 2WZ9A 4MF5A 3HJMA 1A24A 1FO5A 1Z7RA 2J23A 4HS1A 4V1Ag 1VF2A 1K0DA 4TOPA 1YJ6A 1M99A 2JZSA 4ZBAA 1GUHA 3M8NA 2IY2A 1SENA 4KX4A 2B3SA 3NOFA 3QR6A 1PL1A 4POBA 2H6XA 4DEJA 4NV5A 3WT2A 4EC0A 1MD3A 2CZ2A 1DSBA 3D0ZA 3K8NA 1K0NA 1YQ1A 2VM2A 1TP9A 2PU9C 4TN8A 3APQA 3TRQA 4ECCA 4I2TA 2HSYA 3GKKA 3QCPA 3GTUB 1GTAA 2V1MA 3U6VA 3Q74A 1ON4A 5IMAA 2F9SA 1PA3A 1UA5A 1OYJA 2XBQA 1O6JA 4N0VA 3ZMKA 1SYXA 3IDVA 2H6YA 1M0UA 3D5JA 1XBSA 5CNWA 3HHVA 1NSWA 2XC2A 4KB3A 1VF3A 5JWOB 5LNKe 1M7TA 2C80A 4G10A 4MZWA 1GUMA 2K6VA 4EDYA 2LS5A 3UBLA 3G7YA 3CTFA 2HI7A 5ECMB 4HI7A 1F37A 1K0CA 1SKSB 1B4PA 3CXGA 1TW9A 3F63A 4LMVA 1KBNA 5GSTA 1OE7A 4V2LA 3JCML 4XCSA 2OKAA 2AV4A 1FAAA 5IPGA 3IK9A 4POMA 3DD3A 1O81A 4BVXA 1GTUA 3DEXA 1KNGA 3CTGA 1GNEA 4IELA 1JZRA 1Z6MA 2BMXA 3FZAA 2FNOA 1AXDA 1SL1B 2YV7A 2H73A 3RBTA 4J2FA 2QGVA 3ZIJA 1EOGA 4RI6A 4PX1A 4QQ7A 5DDLA 4I8BA 2K8VA 2IN3A 3ED3A 3ZIVA 1N8JA 3VWWA 3GKXA 1NW2A 1PGTA 5IPHA 1AW9A 3TGZA 1PL2A 2H71A 5AGYA 3UL3A 2BTOT 1IYIA 5KN3A 2L6DA 2I9HA 1JLWA 2JZRA 1SKRB 3GTUA 2O89A 2NDOA 4BPYA 3MNGA 2KOKA 2JU5A 2WGRA 3CSIA 1RQMA 3F6FA 5INYA 3ZREA 4F0BA 4MDCA 5IO0A 4GQFA 5C04A 1PD21 3GRXA 2VL2C 3EWLA 2JL4A 5DJMA 1LU4A 3W8JA 1H4OA 3IBHA 1A8YA 3FK8A 4RUVA 4ECIA 1X9WB 4OMVA 3MDKA 4XS4B 4EE0A 1T00A 3LJRA 1B8XA 4JR4A 2A2SA 2MMOA 5HQPA 2B7JA 1AQWA 2AAWA 1F3BA 2GQKA 2LUSA 3ZL5A 3F4RA 1ILOA 4V2MA 2YWMA 3M3MA 2F51A 4V1Ap 2HLSA 3ERWA 1ZYEA 2LTKA 1CQHA 2CVDA 4CW9A 3I43A 2PVQA 4ID0A 5H5SA 5EVOA 5ID2A 3J7Yk 1B4QA 1XOBA 3KP9A 3TKPA 1A2LA 4TVEA 2H75A 5KN0A 3D4MA 4JEDA 1GNWA 2G0FA 3IV4A 1SJZA 1V2AA 1EWXA 1HNBA 5D9TA 4GRFA 1MD4A 4Q5FA 2H76A 3FKFA 1T1VA 2L5LA 2L6CA 4F82A 4JRRA 5CAXA 4KUNA 4PUAA 3UMAA 1XWCA 4LMWA 4PQHA 3IA1A 3LORA 1BG5A 2FA4A 3DYRA 4K7IA 3N9JA 4TW5A 3GMFA 4I5QA 2B1LA 3FRCA 5F8BA 1K0BA 4K9ZA 2HXKA 3GNJA 4OCFA 1T7PB 2FCHA 3ZFLA 2WJUA 3KMNA 3F4TA 3HVVA 1O8XA 1TOFA 1I5GA 2PWJA 2QKEA 1R4WA 4KGIA 1TRSA 2JADA 5L71A 4HDEA 4WETA 3AY8A 4OCEA 1NM3A 1TXXA 5ECLB 2J9HA 4ML1A 4ZILA 2IPAA 2GZZA 2VUPA 3OR5A 5E4WA 5A5KA 4XS4A 2B7KA 3QD9A 3F8UA 4MH3A 4MF7A 2GTUA 2AUVA 1USBA 1XOAA 3UEMA 4K0NA 1PQNA 1S3AA 3KEBA 1GSFA 1M2DA 1O73A 3G9BA 2R3XA 4IKHA 3TJBA 5D93A 4WBRD 1TKDB 2CA8A 12GSA 1GSQA 2C4JA 6GSWA 4NPBA 1ZL9A 2C3QA 1Z7PA 1PSQA 1XIYA 1FW1A 4G19A 3TCOA 4AGSA 4GCIA 1BQ7A 3TOTA 1V40A 2O87A 1UN2A 1WE0A 1Z5YE 2P5RA 4HOJA 2V6OA 4X43A 2C1YA 1AQXA 1EV4A 3DXBA 3FY7A 6GSUA 3L9UA 3C1SA 4L8EA 19GSA 2NBSA 4WR4A 2HYXA 4WXTA 1EV9A 2C8UA 5ENUA 2LSTA 3DMLA 4IQAA 4NXIA 3UARA 2CVKA 4XRAA 1U3IA 4KE3A 3GX0A 1UC7A 2ZNMA 1QMVA 1G0TA 3ZMLA 5DQSA 1YZXA 2M80A 3F4SA 2XPEA 3SBCA 5DAKB 1V98A 1U6TA 3ZVJD 4O32A 1BAYA 5J5NA 3EMPA 4TR4A 2YJ7A 4ECBA 5KN2A 2H8LA 1WMJA 3P7XA 1XXUA 2L4QA 2YP6A 2P0GA 4TXOA 4ZL7A 4ZBDA 1JZDA 4EL1A 4MJCA 4ZL8A 1K3YA 1YEPA 3QPMA 2PVOC 2DSAA 1XW6A 1VF4A 2WB9A 1YKAA 2D2ZA 2MBTA 3IAS2 1X5CA 4HUAA 3KH7A 4NAXA 1X5DA 2HFDA 3Q18A 4MA9A 3KGKA 5G1LA 2Z9SA 1Z3EA 4GSTA 2LNTA 2JACA 4Q5NA 5ABRA 2VIMA 2RIIA 3GSSA 4AJ7A 3FHKA 4MP4A 5COHA 3NZNA 3LGCA 3C7MA 1TRWA 3GHAA 2VL2A 2VLVA 4DVCA 1SJ6A 2I4AA 2YOIA 4PNFA 3BCKA 4HZ2A 1I9DA 3IHQA 1TU8A 2H0GA 2C0DA 4HEA2 2RUEA 3TDGA 2LJRA 3W6GA 2YWNA 3KTBA 5LD0A 4AJ6A 4PUFC 2VAFA 3IE3A 1GLQA 1PKWA 2QSIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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