1JZO | Genus

Total Genus 67

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	67
sequence length	215
structure length	215
Chain Sequence	DDAAIQQTLAKMGIKSSDIQPAPVAGMKTVLTNSGVLYITDDGKHIIQGPMYDVSGTAPVNVTNKMLLKQLNALEKEMIVYKAPQEKHVITVFTDITCGYSHKLHEQMADYNALGITVRYLAFPRQGLDSDAEKEMKAIWCAKDKNKAFDDVMAGKSVAPASCDVDIADHYALGVQLGVSGTPAVVLSNGTLVPGYQPPKEMKEFLDEHQKMTSG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The Disulfide Bond Isomerase DsbC is Activated by an Immunoglobulin-fold Thiol Oxidoreductase: Crystal Structure of the DsbC-DsbDalpha complex. pubmed doi rcsb
molecule keywords	THIOL:DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN DSBC
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Escherichia coli
total genus	67
structure length	215
sequence length	215
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2001-09-17

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF10411	DsbC_N	Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A	PF13098	Thioredoxin_2	Thioredoxin-like domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.450.70	Alpha Beta	Roll	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal	1jzoA01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1jzoA02

2YJ7A 1GTUA 2B5XA 5CYYA 3TKSC 5CO3A 3A2VA 1TP9A 4IJ3A 2XBQA 3IBHA 3GTUA 1R4WA 1V9WA 3M9KA 4TR1A 1A8YA 3EINA 3O3TA 2JU5A 1K0DA 2WJUA 5IQYA 1UVZA 2MBTA 5H5SA 1O8XA 3DVXA 2EIOA 1XXUA 3BJ5A 4KH7A 2IMKA 3LGCA 3AY8A 5IO2A 1SKSB 3VWUA 1GNWA 3EU4A 1PX6A 1PX7A 1K3OA 1XOBA 5F07A 1PRXA 3QOUA 3C71A 4RUVA 4KNDA 1FOVA 4MF5A 1SKRB 2A2RA 5DCHA 2ALBA 5HR3A 6GSXA 4MJBA 20GSA 2FUG2 2H1BA 1OAZA 3RHBA 3TOTA 1O6JA 4I2UA 4POBA 3IA1A 2WS2A 2A4VA 5ECRB 1USBA 3ZL5A 1M9AA 3FZAA 3H4KA 3HZ8A 1GUHA 2JSZA 1ML6A 4KCAA 4FYUA 3DEXA 3I43A 2KUCA 1BX9A 2JZTA 3P7XA 1G7EA 3F3RA 4ZILA 3GV1A 4CW9A 4KDYA 3RPPA 4YQVA 4X1UA 1MD4A 3HY2A 3CSIA 3C1RA 2H0HA 4MH3A 1M7TA 2VM1A 19GSA 3UVHA 1N2AA 1A2JA 1GSSA 4ML6A 5G2ZA 4ULXA 4V2LA 1M0UA 4OO4A 3I6AA 3IPZA 2NPBA 3IHQA 3LXTA 11GSA 1MEKA 1U3AA 1URMA 1THXA 2L6CA 1SK2A 1XW6A 1VF3A 3US3A 4N30A 3W8JA 5H5QA 5DDLA 1SJIA 2VCTA 4LL4B 2X8GA 5IMZA 1PL1A 14GSA 1EEMA 3DKSA 1AQVA 1V2AA 3VPQA 3GN3A 4MJEA 1EV9A 3NZNA 1HQOA 4KAEA 2H6XA 2K9FA 2FLSA 6GSVA 3ME8A 3F4RA 4OWYA 2H75A 1JZRA 3DYRA 2MMAA 3FEUA 2K6VA 4BL7A 3APSA 4ZIJA 3P2AA 1WIKA 1OC3A 1V98A 2B5EA 2LUSA 1LBKA 3ZITA 3QDNA 6GSUA 3KP8A 5F8BA 1W4VA 4V1Ap 2YP6A 2HZEB 4F82A 5COHA 2YWMA 1WJKA 2OE0A 3L4NA 3UARA 4MA9A 5IOWA 1CQGA 1PMTA 4KGIA 3A2XA 4HS1A 1IYIA 1X9SB 5ECMB 4WBJA 1LU4A 4J56E 2PMTA 2RUFA 3UJ1A 4AF2A 2VL9A 1GH2A 3Q19A 17GSA 1ZYEA 5EPFA 1J9BA 3GURA 2C80A 1K0CA 1GLPA 2R3XA 3HA9A 1WOUA 3C1SA 3TRQA 1B9XC 5D8IA 4NWYA 2GSSA 1SU9A 2E2GA 1X0RA 4HJMA 1AUCA 4GQCA 2H74A 1XPVA 2LS5A 2B7JA 2H71A 4KE3A 1ZL9A 3ZFLA 2M80A 3TKSE 5CRGA 1F3AA 1OC8A 5DQYA 5IMDA 3TKQA 1YEXA 1DE2A 2HT9A 4MJAA 1HYUA 5AIXA 4O7HA 2O89A 3QD9A 3IR4A 3WGEA 5CNWA 2LSTA 4EUYA 5L71A 5ELAA 2QGVA 1TK0B 3HHVA 5JCGA 1GSDA 1GSQA 3TJFA 5CAXA 2WDUA 1VF1A 4Q5RA 3FW2A 1ERUA 3H8QA 1O8WA 5C04A 4PX1A 3O76A 4RQRA 4GQFA 1Z7RA 1V58A 2CAIA 2R6KA 2ZNMA 2REMA 4AJ8A 3F6DA 4J2FA 5AN1A 5GZZB 4EKZA 4K0GA 2XHFA 2C4JA 4WEYA 2FA4A 5A4WA 2O87A 2GT6A 1ERVA 3KTBA 4G2EA 1F9MA 5EL8A 2KOKA 5B8AA 3DRNA 4MPFA 1EV4A 1SD9A 1XOAA 3EU3A 2O7KA 3GA4A 3QMXA 3F9UA 1QFNA 5IMVA 4WETA 3H79A 1XWAA 1A24A 1K0AA 4OFMA 4DSSA 2RLIA 5IIZA 2TRXA 4HZ2A 5IM9A 3GX0A 2TIRA 1PN9A 2OE3A 4O92A 2BJXA 2H01A 1AQWA 3H93A 5ABRA 5F05A 3VPTA 4XTSA 1GSYA 4OFNA 1PSQA 2VD0A 3JCML 5CRHA 3UBLA 3ZLPA 5J3RA 2XPDA 3KIJA 3QFBC 2GTUA 4OD7A 5IMCA 3GSTA 3ED3A 3G9BA 2V1MA 3QAGA 3IRAA 1XWBA 4Z7XA 3WT1A 3KH9A 5DJMA 3ZYWA 3EMPA 3HD5A 3ZIVA 3TJBA 4KSMA 3VLNA 5FWGA 3TRXA 1GSFA 2WGRA 4POMA 2FWEA 4MLYA 4GTUA 1UN2A 4I6XA 4KDXA 5DVBA 4TVEA 3GIXA 5IPHA 3WYWA 2F51A 1XWCA 2IMDA 1T00A 1DUGA 5F06A 3VI5A 3U5RE 4IHUA 3C7MA 1NHYA 2P31A 2KHPA 5G30A 1OC9B 2JL4A 1J08A 1T7PB 2NVLA 3LWAA 2YN1A 3F4TA 4EE0A 3FY7A 1YEPA 1GTAA 4LLRA 3WGXA 4ZB6A 2YPMA 3KEBA 1GSEA 1OE7A 3G7YA 1AQXA 2XC2A 3DVWA 3F8UA 4YAPA 3QAWA 3UMAA 3BD2A 5A4UA 4BWSA 5ENUA 2YOIA 1G0TA 5EY6A 3GH6A 4FH8A 2FA8A 2VLVA 4FYCA 4K9ZA 3ZMLA 3ZVJD 3BBYA 2LKUA 3IC4A 1BQ7A 2M46A 3IAM2 5DALA 1RK4A 4DEJA 3ISOA 2LQOA 4NHZA 2GQMA 3FHKA 1K0MA 4O5RA 5J4UA 4GSNA 3R2QA 3TJGA 5KN0A 1JLWA 1TRUA 2OKAA 3UVTA 1LJRA 2YZUA 1SK0A 4EL1A 2PVOC 3GNJA 2E2MA 1GNEA 3F4SA 3IV4A 2LJKA 3L9UA 4TXOA 2H0GA 3M1GA 3VWXA 4MZWA 2DJ2A 3CYNA 4YQMA 1AIUA 2YV9A 5HFKA 4EF0A 2LNTA 1JLVA 2WB9A 2LNSA 4YH2A 1MD3A 1PD21 3PINA 2VL2A 1EP7A 2GSQA 2TRCP 2PERA 2DC5A 3H1NA 3QCPA 5D9XA 3MDKA 3VURA 4HOJA 4OCEA 1M2DA 1WWJA 4H86A 4HDEA 3M9JA 4DVCA 5IMAA 2K18A 2AJQB 1GP1A 1RW1A 2B5YA 3D0ZA 16GSA 2OJLA 4PQIA 2CZ3A 4EO3A 2GT5A 3EURA 5JWRB 4NXIA 5KN2A 1B9YC 5FT3A 3FR3A 4HU7A 3MWHA 3C73A 2CQ9A 1C72A 2O8VB 3ZMKA 1FO5A 2E0QA 4GSTA 5ECIB 3KXOA 3M0FA 4OO5A 1G6WA 3ERWA 4TR3A 4F03A 5CP1A 5ECLB 4V1Ag 4V2MA 1SL2B 3HCZA 1JZDA 3QR6A 1EOHA 2LQQA 1EZKA 2MMNA 4BA7A 4HU9A 1CQHA 1T8EB 3S9FA 3D21A 2MZCA 5B6MA 4KB3A 2H0IA 4PUAA 3KM6A 3RBTA 2R5GA 3TGZA 1B4PA 2LRNA 1TOFA 2VAFA 4ECCA 5D93A 4D73B 2PPTA 3EE2A 3EMXA 2HXKA 2VL2C 1WMJA 2X8HA 2X64A 2C1YA 1K3LA 2H1DA 5HFGA 2GZZA 4MDCA 4MMMA 3W6GA 5ELGA 3ZIJA 4XS6A 3GRXA 1DE1A 2ON5A 2CAQA 4JR6A 5KN3A 5DAKB 3EWLA 3VFIA 4MK3A 2OE1A 2DJJA 2VL3A 4RQXA 3TUEA 1V57A 3D4TA 4XIHA 3TCOA 4ZL8A 1NM3A 4K7IA 5ID2B 2WCIA 3VWWA 5G31A 1ZGNA 5B7CA 2JSYA 2J23A 1Z6NA 2IPAA 4O32A 1BYEA 4LMWA 4G19A 4PQHA 1HNAA 2H70A 2H1GA 2VCZA 3UOMA 2OBIA 3GKXA 2ZCTA 5G1KA 4PNGA 6GSYA 4F9ZA 2IFQB 1KTEA 5DJLA 1ZOFA 2R4VA 4I8BA 1M2BA 4BVYA 3KD0A 4POKA 1HD2A 4I5QA 2CZ2A 4GLTA 4NAXA 4K7NA 2YWNA 4IBPA 4MPGA 4QQ7A 4AJ6A 1TK5B 4GSSA 4L8EA 4YQUA 3E3EA 2QC7A 5IPGA 3A3TA 3FK8A 3D6IA 2ZUPA 1GWCA 4MF7A 5A5KA 3EC3A 1MDJA 2VIMA 2PVQA 2N5FA 2F3MA 3V1WA 2K8VA 1WP0A 4EDZA 3J7Yb 2L5LA 3GL3A 4G9HA 2BTOT 1GL8A 3L78A 3KZQA 1TK8B 3BOAA 4XS4B 3RAZA 2DJ1A 4NV2A 1O7UA 3HVSA 4YAVA 4ECJA 5D9WA 3E9JB 1XW9A 2MMOA 3TRPA 4IP1A 4L0WA 2EIQA 2WZ9A 3LEFA 2HSHA 4KA0A 3KGKA 1DSBA 1NSWA 1OKTA 3EVIA 2VM2A 3DWVA 1WE0A 2IN3A 1O73A 2DJKA 2GS3A 4P3YB 5D9TA 3FR9A 4EC0A 1KEBA 4ECBA 4JE1A 2FY6A 3Q74A 4L0UA 3G7IA 4ACSA 1XWGA 4PURA 2VD1A 1SK1A 1SL0B 2LRTA 1B48A 3FZ9A 4ZL9A 2R37A 3GSSA 1XVWA 5E59A 3F6FA 2QKEA 4K0NA 1QUWA 3IK7A 4LL1B 1HNCA 3QAVA 3F3QA 2ES7A 4ILFA 2V2GA 2VCVA 4ZL7A 2HSYA 3GYKA 4IVFA 4IS0A 5LD0A 3GKNA 1XWKA 2YANA 2IYJA 2C3QA 1TU8A 4HQZA 3FZ4A 1T3BA 1FW1A 1XFLA 2DIYA 4JEDA 4HQSA 3M8NA 3KMNA 4K6XA 3HVVA 5KN1A 4WF4A 1O85A 3LFLA 1I5GA 3GTUB 3CBUA 3GMFA 3ZVJA 2V6KA 4TR1B 3N5OA 1Z3EA 1AC1A 1FHEA 1E6BA 1ERTA 2HZEA 4LMVA 4WR5A 1U6TA 1PA3A 2WULA 3E0UA 1QGVA 2K8SA 3SWLA 3A2WA 3LYPA 4KW6A 2B7KA 3FR6A 1SJZA 2B3SA 1EP8A 2NDOA 1WPIA 3VWVA 3F63A 1ILOA 2FD3A 2AAWA 2V41A 2FNOA 5IMFA 2L6DA 1JZWA 3A5WA 5F0GA 3WD6A 5GSSA 4JZQA 4FYBA 2I1UA 4OCFA 4PUFC 1A8LA 3LXZA 1JFUA 2GSRA 3LYKA 2HE3A 3WGDA 2GGTA 4WXTA 2LV3A 4ZBBA 1T4ZA 2YNXA 2LJRA 1ERWA 1X5EA 4ZXGA 2F8FA 1J0FA 3F0IA 2L5OA 2H1AA 2RUEA 1TRWA 2VCWA 3HXSA 4IQAA 2C0FA 3IE3A 1R7HA 4I97A 5JCUA 4E8HA 5D96A 4IJIA 3RHCA 4NHWA 4IN0A 1ZMAA 2IIYA 1Z6MA 2GZPA 3L0HA 1XZOA 2MBSA 1F3BA 1FAAA 1A23A 4PXOA 3TJJA 2JADA 12GSA 2C0EA 2PGTA 2H76A 4EVMA 1B8XA 4CHSA 1GTIA 1B4QA 2DMLA 2HRFA 4CDOA 4L5OA 4MZCA 2IMIA 4NPBA 3APOA 1TTZA 1XW5A 4MF6A 4ISDA 4XRDA 1OYJA 2I81A 5GSTA 2XBIA 1VF2A 1X5DA 1K0NA 1TU7A 3GHAA 4MCUA 5ECOB 3D4MA 3ZRDA 1GUMA 2MMZA 3RPNA 4XS1A 5CREA 4L5LA 5KEJA 1Y6EA 3UBKA 1R26A 2H8LA 2OACA 2JACA 1R5PA 1MTCA 3TDGA 2DJ3A 1SYXA 4TN8A 5E4WA 3UIWA 5HR2A 1A0FA 3SBCA 4NMUA 1A2LA 4GF0A 2FWGA 5AISA 3BCIA 4BVXA 3I9V2 3ZFBA 1K0BA 2L57A 4AJ7A 1M2AA 7GSSA 2HI7A 3CSJA 1BEDA 1H4OA 1VGLA 2H66A 2C3NA 4XHMA 4DSRA 3GH9A 3G7JA 4N11A 4RI6A 2ON7A 1FVJA 3LG6A 2GSTA 2IWTA 3DGQA 2H30A 2C0GA 4WBRD 2I9HA 1U87A 4I2TA 1TW9A 3D5JA 1VF4A 4QL7A 1FB0A 3HYPA 4F0CA 4PNFA 4EDYA 1XVQA 4ZB8A 3UAPA 2PWJA 3D22A 5D9VA 2IL3A 1F2EA 3LSZA 5HR1A 1YQ1A 1O81A 2RIIA 1THOA 1GULA 2MYGA 3GL5A 10GSA 2OADA 1Q98A 1GUKA 2C8UA 2WFCA 1XIYA 4IGJA 5AIVA 1Z7PA 5J5NA 6GSSA 5B6NA 4WF5A 5JCWA 2FWFA 1QK8A 1QMVA 4K7OA 1KNGA 4XRAA 2PN8A 5IOXA 4TR4A 3LJRA 2GQKA 4NV5A 1T1VA 3FKFA 4ID0A 9GSSA 2P0GA 2GQLA 6GSWA 5LCZA 1Y25A 1OC9A 2P5RA 2AB6A 5AGYA 2DIZA 5ECKB 1X9WB 3TJKA 3FRCA 4TR0A 1S3DA 3DMLA 4GWRA 3TOUA 4E8EA 3GX8A 2F8AA 4TOPA 4EXJA 2BMXA 1H75A 2CA8A 2VLTA 2RM5A 3GKMA 1NHOA 5JWQB 3W8SA 5INYA 4JR4A 4TKYA 5J9CA 5ECNB 5ECHB 1W89A 4HZ4A 2I4AA 3HDCA 4ZB9A 1FG4A 2G0FA 3ZREA 1WRYA 4OFTA 1YF0A 2CVKA 2AUVA 2C3TA 5FHIA 2M72A 1TDIA 1GRXA 2GZYA 2IY2A 5CRWA 5HR0A 4ML1A 3VK9A 1YKCA 2PUKC 1I9DA 2HFDA 4GRFA 1Z9HA 1SD8A 3CXGA 3CTGA 3GFKA 4RI7A 2OBKA 2X99A 2YZHA 2NTOA 3ERFA 1YZXA 1EEJA 4IQ1A 3J7Yk 1M99A 2VO4A 5ECSA 4DSSB 2HLSA 3ME7A 2DJ0A 1BJXA 5G5EA 1KBNA 3MSZA 2IJYA 3ZTLA 2PU9C 2B1LA 3L9VA 1ACVA 1R5AA 5DBQA 4J57E 4HUAA 1YDKA 3HZ4A 3KTLA 2NBSA 3I69A 1TI3A 1EGRA 2LJAA 4WR4A 2H19A 3DXBA 3FZ5A 2L59A 2YWIA 4BPYA 3IK9A 4FIWA 2R2JA 4MH2A 5DQSA 1HNBA 2CVDA 3TKRA 2H73A 5G1LA 2XPEA 3CMIA 1EOGA 4N0ZA 1JZOA 2Z9SA 1YJ6A 1ABAA 6GSTA 1GTBA 2I3YA 4F2IA 1ST9A 4K2DA 22GSA 1N8JA 1A2MA 2RM6A 3GKKA 4IELA 4MABA 1E2YA 2HZFA 4F0BA 1GLQA 2H6YA 2CV4A 2YCDA 2CVBA 1OVNA 1PQNA 2QSIA 4WKWA 3HVXA 3KCMA 1VRSD 3IAS2 1TXXA 2IMFA 2EIRA 1G6YA 1TI1A 2LEGA 4KDUA 1JHBA 3Q18A 2C0DA 2L4CA 4ECIA 3ZZXA 2JZSA 2VCXA 2N5AA 4Q5NA 1FB6A 1MDIA 2F9SA 1XBSA 4TW5A 1SENA 1RQMA 1AAZA 2KP1A 3M3MA 3APQA 5A4VA 4D73A 2CT6A 1UA5A 1ZZYA 1OE8A 4KUNA 2HYXA 1PGTA 8GSSA 1MDKA 4ZBDA 4IKHA 4QL9A 2X8CA 4PQ1A 3KMOA 2O85A 4IW9A 2FCHA 5JWOB 1K3YA 2DMMA 3PGTA 1PL2A 4POLA 3HJPA 5DAKA 1X9MB 2YV7A 5HFIA 1SL1B 1XCCA 5H5RA 2GVPA 2L4QA 3GUSA 1AXDA 5DALB 1FVKA 1EWXA 2OA7A 4Q5FA 1SJ6A 1U88A 2H72A 2P5QA 1SYRA 2GLRA 1M9BA 5ID2A 3CSHA 3FYGA 2VLUA 1Q4JA 4KCEA 3CRTA 2HNLA 1YF1A 2LTKA 3WT2A 1TRSA 3NOFA 3OR5A 2IMEA 4HI7A 1TRVA 4MP4A 2JZRA 3P90A 4DSQA 4HEA2 1SKWB 3TKPA 1ZCPA 2IFQA 4TRXA 2YJHA 1YKAA 1U3IA 2AYTA 3HKRA 4TXOB 2E7PA 5J9BA 1X5CA 1BG5A 4IP6A 3KP9A 1ON4A 1G7OA 4X43A 3CTFA 2YWOA 2CX3A 5IO0A 3HJMA 3C8EA 3U6VA 5G5FA 1IYHA 2J9HA 3MNGA 5J41A 1Z5YE 4GXZA 2B6MA 4N0VA 3TB2A 2FGXA 2KLXA 3LQ7A 2PBJA 1S3AA 4ZBAA 3QPMA 1NW2A 3K8NA 1TKDB 3O6TA 4HJ2A 1OKDA 18GSA 4V2NA 4XCSA 2FHEA 4JU5A 1GSUA 2N5BA 3RDWA 3PR8A 4PGTA 2CX4A 3IOSA 13GSA 1DBYA 3TKSA 2DSAA 3DIEA 4FO5A 4JRRA 4XS4A 1QQ2A 4X0XA 1YY7A 3IDVA 5B8BA 4N10A 4AGSA 2LRCA 4K1FA 3LORA 4G10A 5GAND 3N9JA 3EYTA 5DCGA 3UEMA 3ERGA 3UL3A 1TJDA 1UC7A 3L9SA 1AW9A 2V6OA 4OMVA 1A0RP 2FWHA 2VOCA 4JBBA 2A2SA 2H6ZA 5D73A 1ZYQB 4GCIA 1T4YA 1K0OA 3QFAC 4BWQA 5HQPA 5GAPD 4MJCA 2G2QA 3P8WA 4LA1A 2EC4A 3PH9A 3BCKA 5EVOA 5ECQB 2WRTA 3HJOA 1V40A 2KP2A 3CRUA 1F37A 3KH7A 2DLXA 2VUPA 3MAKA 5LNKe 4Q5QA 1S3CA 3IXRA 1PKZA 2AV4A 2D2ZA 3NIVA 3KJYA 2GDRA 3VI7A 2AHEA 2VCQA 4KSOA 4MZBA 1EGOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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 2DBC A;  5ECP B;  3Q6O A;

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1JZOA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations