1V57 | Genus

Total Genus 68

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	68
sequence length	229
structure length	229
Chain Sequence	ELPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCPYCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	Thiol:disulfide interchange protein dsbG
publication title	Crystal structures of the DsbG disulfide isomerase reveal an unstable disulfide pubmed doi rcsb
source organism	Escherichia coli
molecule tags	Isomerase
total genus	68
structure length	229
sequence length	229
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2003-11-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13098	Thioredoxin_2	Thioredoxin-like domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.450.70	Alpha Beta	Roll	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal	1v57A01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1v57A03

5G31A 4HZ2A 3TKSC 5E59A 4KSMA 4XS1A 2O85A 5EPFA 1IYHA 1S3CA 5G1KA 2PBJA 3CRUA 4K9ZA 4L8EA 3P8WA 4LMVA 4I2UA 1SKWB 1VF4A 2RM6A 5A4WA 3F6DA 1PX6A 1PKWA 5IMCA 4AGSA 3GUSA 5IIZA 1H75A 4WR5A 3UJ1A 1V98A 1GSYA 2GSTA 2GVPA 2RLIA 2RM5A 4XCSA 2YNXA 1VF1A 1M9AA 4F9ZA 1LU4A 3GTUA 1GUMA 3QCPA 1BX9A 4ID0A 4ZIJA 4I8BA 4IGJA 4FYCA 1TOFA 5DQSA 4PX1A 3OR5A 3FZ9A 5IM9A 4TVEA 1GSQA 1EV9A 2GSRA 4WF5A 2M72A 3CSHA 5IMFA 2GSQA 2ZNMA 4EDYA 3DXBA 4V1Ag 2PN8A 3O6TA 2M46A 18GSA 4ECCA 4K7NA 4F0CA 1U87A 3O3TA 3W8SA 2OA7A 2JU5A 4K6XA 4K8MA 2HLSA 5D93A 3ZLPA 2CA8A 1BG5A 1XVQA 4WKWA 1QGVA 4EC0A 2IMDA 4IP6A 3KXOA 2PERA 2LQOA 4MH2A 3KZQA 3GL5A 4MA9A 5A4UA 5H5RA 1GSDA 4HQSA 3CRTA 3TKRA 1GP1A 12GSA 2MYGA 3PR8A 2V2GA 1OE7A 5CRWA 5ECIB 5F0GA 3VWUA 4HOJA 5F06A 5GAND 2CVKA 2H75A 3SWLA 3N5OA 2B5YA 4KCEA 4K1FA 2LJRA 2H1GA 3GSTA 3F3QA 3TOTA 1YQ1A 2DC5A 1S3AA 2CAQA 3GL3A 1WP0A 2HE3A 4POKA 4O92A 3IXRA 5IPGA 5GSTA 3KH9A 2I9HA 3KMOA 4PURA 2VO4A 4AF2A 2HNLA 5G30A 4K0NA 5IO0A 3QFBC 3WYWA 3F0IA 2PPTA 1ILOA 3IE3A 4GCIA 3MWHA 4L5OA 2AYTA 2H1AA 5ECRB 2H6XA 4IKHA 2IMIA 4GQCA 3QR6A 4JEDA 1Q98A 2O87A 3H1NA 2GQLA 2X8CA 2H71A 1Z9HA 3IDVA 4GSTA 6GSVA 2H76A 3GN3A 3WT2A 1TKDB 3MDKA 4YQVA 1V58A 4LMWA 4MF5A 1T00A 3FY7A 2F9SA 3KTBA 1KNGA 3ZYWA 4F03A 4RI6A 4QQ7A 1WIKA 1WPIA 4DSSB 2OKAA 2REMA 5DBQA 2L6DA 2VOCA 2CZ3A 3EWLA 3IOSA 3FW2A 2C0DA 2EIOA 1OC3A 2YV9A 4BPYA 5AIXA 1ACVA 1W89A 3HD5A 1XWAA 2FWFA 1SK0A 2HI7A 5FT3A 3WGXA 2B5EA 5IQYA 5ECKB 2H01A 3ZZXA 1XIYA 1THXA 1AW9A 3TKSA 3L9UA 4X43A 1XFLA 3HJOA 1EOHA 4BWSA 2R37A 4YQMA 1WJKA 2KUCA 2PUKC 2BMXA 2CQ9A 5D9TA 3DKSA 1OVNA 1F6MC 4MPFA 2OE3A 3L78A 4PXOA 4CHSA 2YWNA 3HA9A 3G9BA 2IFQB 5D8IA 2LUSA 1GNWA 3BBYA 1O7UA 2CT6A 2LRCA 3ZVJA 1FW1A 1K0DA 1RQMA 4NXIA 3ZMLA 3FZAA 2GSSA 2E0QA 1VF2A 3D21A 4PQ1A 2L59A 4ECJA 3V1WA 3RHBA 1T4YA 1TI3A 1N2AA 3LXZA 3H93A 2DMLA 1OKTA 2MMOA 5DQYA 4TN8A 2VAFA 6GSSA 3HJMA 1Z7PA 1PQNA 2VLTA 3G7YA 5EVOA 3QD9A 1JLVA 3GSSA 3KP9A 4IVFA 4FYUA 4TRXA 4Z7XA 1VGLA 2M80A 2O7KA 2O8VB 4BWQA 1XPVA 4J57E 3NZNA 2H73A 1NSWA 4DSSA 1ZMAA 1GLQA 3D5JA 2AHEA 1WMJA 4BVXA 1OC8A 2DSAA 3E3EA 3WD6A 2QGVA 3IV4A 4ILFA 2B7JA 1ERTA 3C7MA 4OFTA 2JL4A 4IJIA 5IOXA 3QAWA 4IP1A 4GSSA 3RPPA 2HSHA 4XHMA 1ON4A 3JCML 5HFIA 5FHIA 3APSA 1DE1A 3GA4A 4ISDA 4ACSA 2C3NA 4O5RA 1VF3A 2ON7A 4RQRA 4YAPA 3VI7A 3LQ7A 4L5LA 2IMEA 4KAEA 3F4RA 4NHWA 4KGIA 2DLXA 1TXXA 2HRNA 1YY7A 2WS2A 5DJLA 3I69A 4HS1A 2YCDA 2VCZA 1H4OA 2WJUA 3LG6A 2LEGA 2IFQA 1O8WA 1XW6A 5HFKA 1TK0B 4JU5A 3CSIA 3WT1A 5DVBA 1YF1A 3QMXA 4FH8A 1EP7A 2YN1A 2FA4A 3UVHA 19GSA 2QKEA 3VI5A 1T8EB 2RUFA 2I4AA 1Y6EA 4FO5A 3FR3A 2NDOA 2TIRA 3ZREA 3TKSE 4PNGA 13GSA 2NPBA 3HYPA 5EY6A 3IPZA 2ZUPA 1V40A 4TR1A 4EF0A 3LSZA 2A4VA 2HZEB 5F8BA 5JCGA 1OE8A 1M99A 1A8YA 1I9DA 1PN9A 5CYYA 4O7HA 1IYIA 3ERWA 3J7Yb 1FVJA 1G0TA 1YEPA 3U6VA 3HHVA 3Q74A 1J0FA 3GHAA 1DSBA 1NM3A 2XHFA 3G7JA 1M2AA 3K8NA 5IO2A 2OACA 3FEUA 2FGXA 1SK1A 1ST9A 4KA0A 2LNSA 4G19A 2VD1A 4V1Ap 1TK5B 2C4JA 4IW9A 3TJGA 3HVVA 5LCZA 4TXOA 3TGZA 2LNTA 2GZPA 2GTUA 5ELGA 2YOIA 1AQXA 5CRHA 4HJMA 4NPBA 4JRRA 3BCIA 2VCXA 1HYUA 3F3RA 2L4QA 2F8FA 3PH9A 2MMZA 2DJ2A 2AAWA 2VCQA 4KX4A 5IMVA 2XPEA 3TJJA 1PKZA 1SKRB 2B3SA 2B1LA 3FYGA 1F3AA 2V1MA 1Z6NA 4L0UA 1WE0A 3D0ZA 4MLYA 2B5XA 1FVKA 1A2MA 4IQAA 4FYBA 1JZWA 1PL2A 3VWWA 1YKAA 1X9WB 2R5GA 1EEMA 22GSA 3GX8A 10GSA 2CV4A 4N10A 1K3YA 2GGTA 4ZL8A 1WOUA 2VUPA 2N5FA 1DE2A 2YWOA 2C80A 4FIWA 4MDCA 4OCFA 5HR1A 3EE2A 2CAIA 1U88A 2Z9SA 5ECOB 3QOUA 2VCWA 3GKNA 5DJMA 4POLA 2V6KA 1BQ7A 1Z3EA 4HZ4A 2FNOA 3RDWA 1LBKA 1JZDA 2X8GA 3VWVA 1GLPA 1GUKA 1A0FA 4I2TA 2H0HA 5D9XA 1FB0A 3RPNA 1E6BA 1A23A 1U3AA 1GTIA 4ULXA 5KN3A 4HUAA 3RBTA 4ZBDA 4MF6A 4MZCA 2XBIA 4MABA 2HXKA 3HVSA 4EXJA 1UC7A 1SENA 4BL7A 2JZSA 1QUWA 4OFNA 3ZL5A 1JZRA 3HY2A 2IIYA 5AIVA 2OJLA 2G2QA 3D6IA 4E8HA 7GSSA 1MEKA 5D96A 3UVTA 2F51A 3GV1A 3VPQA 4PUAA 1RW1A 3GKXA 2OE1A 3C71A 4QL9A 5KEJA 1ZCPA 2YWIA 3KIJA 3KJYA 2XPDA 2DIZA 1TRWA 3G7IA 2PVQA 1F3BA 5IMZA 4YAVA 3KGKA 4MK3A 4NMUA 4Q5NA 4J2FA 3IR4A 1XWKA 4J56E 1ZOFA 2EIRA 4HU7A 1TU7A 3E9JB 4LA1A 4XTSA 3TDGA 1Z7RA 4EO3A 4XS4B 3LFLA 2LJKA 4PQHA 1R7HA 1UVZA 4HU9A 1QMVA 3KEBA 1X9SB 1G7OA 2RUEA 2YJHA 2C0EA 3TUEA 1AQVA 1PA3A 3ZFLA 1XOBA 5CRGA 4GQFA 1FAAA 9GSSA 1W4VA 1X5CA 2CVBA 4X1UA 1GSEA 16GSA 2VL2C 1CQGA 5ECQB 3FZ5A 3VPTA 4IN0A 5B8AA 3PGTA 1K0OA 4GTUA 4N0ZA 5JCWA 1A2JA 5IMAA 4RQXA 5D9VA 1SK2A 3H4KA 1R4WA 1XOAA 3DGQA 4JE1A 3GNJA 5AISA 2FLSA 5ABRA 1PL1A 4X0XA 1EGRA 2YWMA 4ZB8A 5DCGA 2XC2A 3W6GA 2IWTA 2WDUA 4ZILA 3DIEA 1ZZYA 4MJAA 4H86A 3DVWA 2YPMA 3HZ4A 5B6MA 1GL8A 1MDKA 2YJ7A 17GSA 2I3YA 2LS5A 2P5QA 2DMMA 1ERWA 1HNAA 1N8JA 3CMIA 3N9JA 4CDOA 4IBPA 4WBRD 4IELA 1ML6A 2QC7A 4TW5A 3C1SA 1BEDA 1SL0B 2NVLA 2OE0A 2LKUA 2H74A 2IL3A 4IS0A 2V41A 2H0GA 4BA7A 6GSTA 1GULA 1XW5A 4O32A 3RAZA 4HDEA 1AQWA 2WGRA 1TRVA 3I9V2 1EZKA 1S3DA 2E2MA 1EEJA 1SJIA 3IK7A 4XS4A 3MSZA 2VCVA 1TJDA 3I43A 2HYXA 4OMVA 5INYA 2K8SA 5CNWA 3UMAA 5ELAA 6GSUA 1U3IA 3TRQA 3ERFA 4ECIA 4MCUA 5AGYA 3HJPA 3M8NA 4MJBA 1KBNA 2C3TA 2C0FA 5ECHB 4AJ7A 1AXDA 4G10A 4EL1A 4WR4A 5J9CA 1DUGA 4I97A 3J7Yk 4NHZA 1O81A 1TTZA 1A0RP 4TR3A 2AB6A 4KDYA 1G6WA 4TXVA 2MBTA 2K6VA 4D73B 3I6AA 3HCZA 4POBA 3GURA 1EGOA 1YJ6A 4N30A 3TB2A 1YEXA 3FRCA 4MF7A 2C0GA 1ZYQB 3GIXA 4L0WA 2YZUA 1HNBA 2HT9A 1PSQA 4ZBBA 4TOPA 1PMTA 3DWVA 1X5DA 2CVDA 4AJ8A 1M7TA 2ON5A 4XS6A 4G2EA 3ZIVA 5LD0A 2DJ0A 4OD7A 3WGDA 2VCTA 5JWOB 3GKKA 3LEFA 2GT6A 2L57A 2PVOC 3C1RA 3VURA 2DBCA 5A5KA 2H70A 1F2EA 5ECPB 3EINA 4JZQA 3QFAC 2L6CA 1XWBA 4GXZA 1PD21 1V57A 2PU9C 2FUG2 3ME8A 3RHCA 3GH9A 2WZ9A 1B8XA 5F07A 4KDXA 1BYEA 4V2MA 2AJQB 1QQ2A 2VL9A 4TKYA 4GLTA 1TRUA 2QSIA 3U5RE 2FD3A 3QAVA 2L4CA 4CW9A 2VL2A 3KM6A 4GF0A 1JLWA 3LXTA 1F37A 4WXTA 1SJZA 1O73A 1B48A 3M1GA 1SU9A 2K8VA 20GSA 2J9HA 4POMA 8GSSA 4DVCA 3EMXA 4MJCA 3ZFBA 1X5EA 2DJ3A 1A2LA 4D73A 2LQQA 2GT5A 5HR3A 1T4ZA 1GWCA 3A3TA 3M9KA 5J41A 5AN1A 3BD2A 4EKZA 3NIVA 4E8EA 4WEYA 3DYRA 4ZL7A 4K0GA 2MZCA 3BCKA 4XIHA 4NV5A 3SBCA 3QPMA 2H72A 3KH7A 1SJ6A 5H5SA 3GMFA 3MAKA 3IA1A 1I5GA 1T7PB 1ZYEA 3VFIA 3IBHA 4I6XA 4ML1A 3GRXA 4PQIA 5GSSA 1TI1A 4DEJA 3C73A 5ECSA 3LJRA 3UIWA 3APOA 1C72A 1K0BA 4PGTA 5ECLB 5G2ZA 2IMKA 1GSSA 3TRXA 1THOA 1FG4A 3F4SA 2N5BA 5C00A 4QL7A 1JZOA 4MPGA 3TKQA 3F6FA 2OBIA 2A2RA 1MDJA 4PNFA 1GNEA 5HQPA 5L71A 1FHEA 2WRTA 2FA8A 3BOAA 2HFDA 5CP1A 2F8AA 2KP1A 1MD3A 2JZRA 3M0FA 3P2AA 3CXGA 1R5AA 3A2VA 4JR6A 2PMTA 4N0VA 1OC9B 1HQOA 3TJBA 2R3XA 4V2LA 1K0MA 3ZITA 1GSUA 4KW6A 2C8UA 2LJAA 1TP9A 2E2GA 1JFUA 2H30A 2J23A 2H6YA 3LORA 1A8LA 1GTBA 4Q5RA 2DJJA 3GYKA 1K0AA 2PGTA 4HQZA 2NTOA 3P90A 3UBKA 3CTFA 2HZEA 3F8UA 1YZXA 1ZGNA 1R26A 5CREA 2GZZA 1B9YC 2G0FA 3ME7A 3FZ4A 4KB3A 2V32A 1XZOA 5DCHA 1GTUA 3L0HA 3ZIJA 1M9BA 2JACA 1LJRA 1YKCA 2FY6A 3BJ5A 3PINA 1XCCA 4KSOA 4MH3A 3DD3A 4ZB9A 2H8LA 1USBA 1GUHA 2DIYA 3KTLA 1J08A 5J5NA 2YANA 1T3BA 2LV3A 3LYKA 1T1VA 3Q18A 2JSZA 5C04A 3M3MA 6GSWA 1K0CA 4F0BA 4TR4A 3D4MA 5CAXA 2D2ZA 2P0GA 4MZWA 2GQMA 1X9MB 3P7XA 2YP6A 1MDIA 4MMMA 2H0IA 2IY2A 1BAYA 4MJEA 1SL1B 3FKFA 1OKDA 1XWCA 2I1UA 2FWHA 5ENUA 5HR2A 3ED3A 2A2SA 3EYTA 4IJ3A 4LL1B 3L9SA 1TK8B 3ZMKA 4ECBA 1U6TA 1G6YA 14GSA 2JZTA 3IK9A 1OC9A 4P3YB 5J4UA 2DJKA 1ZL9A 3CTGA 2GS3A 3O76A 1UA5A 3A5WA 3CSJA 3TOUA 3TCOA 4HJ2A 1B9XC 3CYNA 1YDKA 3HKRA 2MBSA 3ZRDA 3KMNA 3IAM2 4GRFA 2OADA 1NHYA 5ID2B 3HZ8A 2TRXA 1Z5YE 2H1BA 4MZBA 3Q6OA 4EUYA 3L9VA 1BJXA 5H5QA 3M9JA 3ZVJD 1XW9A 1TDIA 3LWAA 2BTOT 3L4NA 2VLUA 2H6ZA 2R6KA 1VRSD 4K7OA 3S9FA 1FOVA 4XRAA 2WFCA 2FHEA 5F05A 1AUCA 1GH2A 2RIIA 4JR4A 1GSFA 3EU4A 1K3OA 1SYXA 1FB6A 1V2AA 2HSYA 1PX7A 3DRNA 4DSQA 3ERGA 4F2IA 5G1LA 3CBUA 3NOFA 1XWGA 4XRDA 2IJYA 1SL2B 1Q4JA 2AV4A 4K2DA 2R2JA 5DAKB 3FR6A 2C3QA 1G7EA 2LTKA 2CX3A 3D22A 1TRSA 2F3MA 3F63A 1K3LA 4NV2A 4OWYA 2I81A 4MP4A 2GQKA 2KOKA 1EWXA 3Q19A 3H8QA 4LL4B 1Y25A 2XBQA 5J9BA 2V6OA 1E2YA 4PUFC 2IPAA 5G5FA 3H79A 2OBKA 2YZHA 1AC1A 1FO5A 4G9HA 1R5PA 3VWXA 3A2WA 1ABAA 4HI7A 2KP2A 5IMDA 5LNKe 3FHKA 3UOMA 3KCMA 2IN3A 5DDLA 4Q5QA 2E7PA 1XXUA 2B1KA 1JHBA 2K18A 4KE3A 1XVWA 3QAGA 5ID2A 1CQHA 3EC3A 1SKSB 3APQA 2VD0A 2AUVA 5JWRB 1K0NA 3VLNA 5JWQB 1WWJA 1QK8A 4V2NA 3D4TA 5GZZB 3IAS2 1B4QA 3HVXA 3UEMA 4JBBA 3VK9A 1OYJA 3TJKA 3E0UA 4DSRA 3GFKA 5DALB 4K7IA 1V9WA 2DJ1A 1PRXA 3DEXA 4N11A 3W8JA 1F9MA 4HEA2 2YV7A 4KUNA 5COHA 3TKPA 4TR1B 1EV4A 1TU8A 4EVMA 3US3A 3GX0A 4GWRA 5IPHA 3IHQA 2MMNA 1QFNA 2GLRA 5E4WA 1SD9A 2IYJA 5KN1A 5J3RA 5DAKA 2N5AA 1X0RA 2B7KA 3EURA 5JCUA 3QDNA 4KNDA 2HRFA 5CRDA 5IOWA 4RUVA 3R2QA 2VM2A 1MD4A 4ZB6A 3HXSA 2EC4A 3ISOA 5B6NA 4OFMA 2P31A 3C8EA 1UN2A 2GDRA 2C1YA 3UBLA 3DVXA 1SYRA 5HFGA 2VIMA 3UARA 1AAZA 1HNCA 2LSTA 5KN0A 1KEBA 2VL3A 1M2DA 4Q5FA 4TXOB 3A2XA 4GSNA 4ZL9A 1GRXA 3KP8A 3GH6A 2CZ2A 3EU3A 2NBSA 2K9FA 4AJ6A 2ES7A 2PWJA 1WRYA 3F4TA 4NWYA 6GSXA 2VLVA 2CX4A 1SD8A 1MTCA 1GTAA 5B8BA 2ALBA 3ZTLA 1O8XA 1A24A 2VM1A 4WBJA 2TRCP 2BJXA 4WF4A 2H1DA 4F82A 1M2BA 1M0UA 1ERVA 2KHPA 2KLXA 2EIQA 5DALA 6GSYA 2WB9A 4ZXGA 3TRPA 1RK4A 2FCHA 2FWEA 2ZCTA 5ECNB 1DBYA 5G5EA 3HDCA 3EMPA 3LGCA 3MNGA 3AY8A 3IC4A 4OO5A 1TW9A 5A4VA 3EVIA 1HD2A 1PGTA 3DMLA 4KCAA 3UL3A 5D9WA 5B7CA 2H19A 5D73A 2GZYA 4IHUA 3GTUB 2P5RA 1O6JA 2O89A 5HR0A 4KH7A 3IRAA 2X64A 1NW2A 5GAPD 1KTEA 1QXHA 3TJFA 1EP8A 4TR0A 2LRTA 1OAZA 4IQ1A 2JSYA 1XBSA 4WETA 2LRNA 3KD0A 3WGEA 2X8HA 5FWGA 1NHOA 4YH2A 4BVYA 1J9BA 5KN2A 4ML6A 4ZBAA 4NAXA 2L5LA 3F9UA 2WCIA 2FWGA 2IMFA 3FR9A 1Z6MA 11GSA 4LLRA 4EE0A 1EOGA 2R4VA 4EDZA 1AIUA 2MMAA 3LYPA 3UAPA 3FK8A 4I5QA 4RI7A 5EL8A 3GKMA 4KDUA 4OCEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1V57A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations