1V57A

Crystal structure of the disulfide bond isomerase dsbg
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
b'ELPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCPYCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbG
publication title Crystal structures of the DsbG disulfide isomerase reveal an unstable disulfide
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Isomerase
total genus 68
structure length 229
sequence length 229
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1v57A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1v57A03
1FB6A 2G2QA 2VCXA 2MBSA 2PPTA 2ON7A 4XRAA 4POKA 4N30A 16GSA 1A0FA 3VWUA 3KZQA 2QGVA 2MMNA 1XBSA 4IQAA 3MNGA 2LSTA 4JRRA 1V40A 3TUEA 3WT2A 2JU5A 3NZNA 4KA0A 3TOUA 4L8EA 1TU7A 1A2LA 4WR5A 1TK8B 3J7Yk 4ECBA 3GNJA 19GSA 2IN3A 5COHA 2LRNA 2YPMA 1MDKA 4YQVA 2FWEA 2I4AA 2MZCA 4GTUA 4N11A 2GTUA 2CVDA 4KH7A 1K3OA 1U3IA 5ECQB 2OE1A 5EY6A 4IW9A 3LSZA 1H4OA 2I1UA 3G7JA 4NXIA 1N2AA 2X8GA 5JWQB 5GSTA 17GSA 5AN1A 1GSUA 3QMXA 4O5RA 4OFMA 5HR2A 4IJIA 2X99A 4XHMA 2H66A 2A2RA 3CBUA 1PGTA 5ECMB 3ZL5A 4OO5A 1G6WA 3QFAC 2VAFA 4JU5A 2LS5A 2OADA 1IYIA 3D5JA 1U6TA 3D6IA 4KUNA 3WGDA 12GSA 4TXOA 4XS6A 2HNLA 3M9JA 2JL4A 4X0XA 1SYRA 4KCEA 1AQVA 1OC3A 3TJBA 5DVBA 2JZTA 1PKWA 1A2JA 3APQA 5J9CA 1WP0A 2IMEA 5EPFA 1S3DA 1OC9A 2WRTA 3HXSA 3RAZA 1OAZA 2AV4A 2H0GA 5IOWA 3GL3A 4H86A 4WBRD 3L9UA 4G19A 4P3YB 4V1Ap 1QQ2A 4MDCA 2WZ9A 1WMJA 4GSSA 4MABA 5L71A 1SJZA 4GWRA 1K0MA 2E7PA 1TRVA 4GSNA 2RM5A 4MF5A 3Q18A 5IMDA 3LQ7A 3APOA 2I81A 2C0EA 4WKWA 4OCFA 3TJJA 5DALB 2R4VA 4J56E 1EGOA 5CREA 4IP1A 2HSHA 3GSSA 2LJRA 3ISOA 1XVWA 4L5LA 5CYYA 2RUFA 2OE3A 1O73A 4IS0A 4EO3A 4XS1A 3US3A 6GSTA 1FVKA 4KW6A 4TR3A 3FZ9A 3TJGA 3EC3A 6GSVA 3UL3A 1Q98A 3ZZXA 2DJKA 3FY7A 4DSRA 14GSA 2MMOA 4MA9A 11GSA 1RQMA 1K0AA 3M3MA 4YAPA 2DLXA 2PWJA 1GTBA 4JE1A 3RHBA 5CP1A 4AJ6A 1B4PA 3QDNA 4KNDA 1Z7PA 4TXOB 3GFKA 3MWHA 2F8AA 3HKRA 5E4WA 1PA3A 1GUKA 1BX9A 1BQ7A 4HDEA 6GSWA 2F8FA 4Z7XA 2H71A 5IPHA 4KSMA 3RDWA 3F4TA 1JHBA 1J0FA 3FR3A 2CZ2A 2JACA 3CRUA 4PURA 3I43A 4YQMA 3VWVA 3PGTA 2LNTA 1X5DA 2IMDA 3RPNA 5FT3A 3MDKA 2O89A 3M1GA 18GSA 2DC5A 5FWGA 1PX7A 3EMXA 5D73A 3HVSA 3TJKA 1PN9A 3UVHA 5A4UA 4MH2A 5EVOA 3O76A 3GKKA 1XW5A 2R2JA 1FAAA 5J9BA 1B9XC 2L59A 4ZB8A 4NV5A 1V58A 4ZILA 4POMA 3HJPA 5GSSA 4XCSA 3TKSE 4LLRA 1XFLA 2OKAA 3EE2A 4MP4A 4YH2A 4PUFC 2VO4A 4X43A 5FHIA 5A5KA 4QQ7A 1X9SB 2RIIA 5IOXA 3H1NA 4MJBA 2L4QA 5B6NA 3ZYWA 2H01A 1T00A 6GSYA 5HR3A 1T4ZA 2FGXA 3FZ5A 1G7OA 1Z9HA 2VLVA 3KP9A 4GLTA 4K9ZA 22GSA 1UN2A 2LJKA 2M72A 2H1GA 4NHWA 9GSSA 1EEMA 1GTIA 3IAM2 3KEBA 2FNOA 2H1BA 3EU4A 2IY2A 2VCWA 1JZWA 1FW1A 1WPIA 5ECOB 3GUSA 2EIRA 4PXOA 1U87A 4HZ2A 2GSQA 1FO5A 1B48A 2OACA 3C1RA 4N10A 5J5NA 5LCZA 3W6GA 4BL7A 4I5QA 5ELGA 2EIQA 3Q6OA 2GQLA 3LFLA 3O6TA 3LJRA 4FH8A 4ILFA 2IMIA 5D9XA 2GDRA 1XOAA 3QFBC 2QSIA 4PQ1A 3IRAA 1EWXA 3L0HA 3DMLA 2DSAA 4JR4A 4TKYA 5HFIA 1MD3A 3L9VA 5JCUA 3KXOA 1Z3EA 6GSSA 1C72A 4MF7A 1SD9A 1VF1A 4EUYA 3GKNA 5H5RA 3GA4A 2YWNA 1ZYQB 4O7HA 3LXTA 2H73A 3P8WA 4O92A 1CQHA 1K3YA 3TCOA 1F3AA 1T4YA 2LEGA 1YY7A 4F0CA 2L4CA 1TRSA 3V1WA 1R26A 4XS4A 1IYHA 1OE7A 1EV9A 3IA1A 4BWQA 3IR4A 2TIRA 2AJQB 2GZPA 1X9WB 2AAWA 3HHVA 2A4VA 2FUG2 3TOTA 1K0BA 3HYPA 1SK1A 3N5OA 1XXUA 3M0FA 3HJOA 2VCQA 5F05A 3VI7A 2YP6A 1U3AA 4L0WA 5G31A 3F0IA 4KCAA 3NOFA 3HVXA 1F6MC 4ZL7A 3FR6A 3U6VA 4BVYA 1NHOA 3TKSC 1OYJA 1YF1A 5ECLB 3GH9A 1TDIA 3WT1A 4F0BA 5ECIB 4ZBBA 2VD1A 3HA9A 3TRXA 3FK8A 3PR8A 2L5LA 2X64A 5DBQA 4L5OA 2B3SA 3C7MA 1OC8A 3KTLA 1VGLA 4KDXA 6GSUA 2P0GA 4TRXA 3PH9A 1YQ1A 1O8XA 4K7IA 1GP1A 1KEBA 2KP1A 5CO3A 3ERWA 1XW9A 2V6OA 1ERTA 2B6MA 4ECCA 3ERGA 1MD4A 4IGJA 2GGTA 2N5BA 1M9AA 4ULXA 3WD6A 4F9ZA 3CTGA 3GYKA 5IMAA 1TRUA 4K7NA 2V2GA 5LD0A 2DJ3A 2D2ZA 3LXZA 1XIYA 4EE0A 1SJ6A 2N5FA 3GX0A 1SENA 4GF0A 3WGEA 1YKAA 5G5EA 4EDZA 2ON5A 2XHFA 2G0FA 3UIWA 3MAKA 4XS4B 5IM9A 4L0UA 1TOFA 3FW2A 3A2VA 1Z6MA 1VRSD 1T7PB 3A2XA 3A5WA 1A24A 2VLUA 1GUMA 3TKPA 1W4VA 1KTEA 2H76A 1HD2A 2PN8A 4ML6A 2FLSA 4ZIJA 1ZYEA 4O32A 2C8UA 2IMFA 4MJAA 4EKZA 3C73A 4F03A 1V2AA 3E0UA 4HU9A 4POBA 5INYA 3ZTLA 1ZZYA 3FKFA 1SD8A 3LG6A 1THOA 3CSIA 3TKSA 3ZVJD 2DJ1A 1H75A 3HZ8A 2EIOA 3CXGA 2F9SA 5ID2A 3H93A 5JCGA 4MPFA 2HZFA 1PKZA 2YJHA 3G7IA 1BAYA 3G9BA 1GWCA 3P90A 5F06A 2EC4A 3UARA 3VFIA 1E2YA 4GCIA 2GT6A 1LU4A 4NPBA 1TJDA 4V1Ag 5KN3A 4DSSA 3CTFA 2K6VA 2YANA 1TK0B 4DSQA 4EF0A 1TI3A 3C71A 1T1VA 1HNCA 1R5AA 2GQMA 3EVIA 1B4QA 4PNFA 2IFQA 3ZIJA 5F07A 3GURA 1XWAA 2CAIA 5GZZB 2VCZA 1AC1A 3KH9A 3P2AA 5GAPD 3UJ1A 3VURA 2YV7A 1S3CA 5HFGA 2Z9SA 1ZOFA 3DD3A 5HQPA 2YCDA 5ENUA 2YNXA 5C04A 2CZ3A 1GULA 5KN1A 5DCHA 3IDVA 1XW6A 4HI7A 3RBTA 1OKDA 2GZYA 2KHPA 5AISA 2QC7A 1XOBA 1I9DA 2R37A 5KN0A 3U5RE 1HQOA 3NIVA 5C00A 4GQFA 1K0DA 1MDJA 1QK8A 3UOMA 2YZHA 4KE3A 4EL1A 2LUSA 3W8SA 2O87A 2ZNMA 2JADA 2PERA 1GH2A 1W89A 5IMZA 4TR1A 3IBHA 2HI7A 5A4VA 1TXXA 4G10A 13GSA 3LGCA 2WCIA 4NV2A 4NWYA 1YDKA 3E3EA 2MMZA 1GUHA 2B1LA 4N0ZA 3F8UA 3RHCA 1A2MA 1SKSB 4TW5A 5D9VA 3D4TA 5G5FA 4OD7A 2H70A 3I9V2 2B5XA 4KDUA 3LYKA 3ZFLA 1XCCA 3BCIA 1SJIA 2C3QA 2C1YA 2WULA 3EURA 5LNKe 4I8BA 1M0UA 1EP7A 3L78A 1M2AA 2P5QA 10GSA 4K6XA 5IPGA 2DJ0A 4WETA 4WBJA 4GXZA 4EXJA 2N5AA 2DBCA 4PNGA 1XWCA 3CSHA 2IFQB 2X8CA 3S9FA 1DSBA 2F51A 3APSA 1OC9B 4CDOA 3FHKA 1NSWA 4JZQA 3KIJA 4IP6A 3M9KA 2IL3A 3CSJA 4AGSA 2FA8A 2P31A 4BVXA 4KB3A 4LMWA 2OE0A 3QD9A 2HZEA 4OMVA 2YWMA 4I6XA 3KH7A 1Q4JA 1V98A 2C0FA 2A2SA 4ACSA 3DWVA 2MYGA 5DAKA 3KGKA 3KCMA 4FYUA 3GHAA 4I2TA 2V41A 4GSTA 1BYEA 3EINA 2L6CA 2NPBA 2PVQA 4TR1B 3HJMA 3D0ZA 3VI5A 1UA5A 5D9WA 3EU3A 4WXTA 4Q5FA 1S3AA 2TRXA 2RLIA 3PINA 1QUWA 2C0GA 4XIHA 2WDUA 1GNEA 1WE0A 1O85A 2K8SA 1GSEA 3TKRA 3KMOA 4HJMA 3TGZA 3F4SA 2XBIA 4NAXA 3BD2A 3BCKA 4V2LA 1RK4A 3VLNA 2H1AA 3H79A 2CVKA 2H19A 2LNSA 3GN3A 4LL4B 3SWLA 1X5EA 1MDIA 1K0NA 5IO0A 4WR4A 4TOPA 3FR9A 4WEYA 2H74A 3F9UA 5G1LA 3K8NA 1JZDA 5DCGA 5J4UA 2VL3A 2MBTA 3VK9A 2H6ZA 1SU9A 2I3YA 1ST9A 2F3MA 3M8NA 3BOAA 2YJ7A 1EOHA 1BG5A 1UVZA 3H4KA 1AUCA 5IMVA 3FYGA 3BBYA 3G7YA 5DQSA 1N8JA 2VL9A 4HUAA 4ISDA 1OE8A 2C3NA 3HDCA 1QMVA 3CMIA 1ERVA 4HS1A 3DIEA 4XTSA 5CRDA 2JZSA 2HZEB 3GRXA 1X9MB 5KN2A 1THXA 3N9JA 1QFNA 1TTZA 1ML6A 3WYWA 3DVXA 3DKSA 4OWYA 2H8LA 4EC0A 1U88A 2XPEA 2YOIA 2IWTA 2CAQA 1Y6EA 3TJFA 3KD0A 3GTUA 3L4NA 3HD5A 5E59A 1OVNA 3TRPA 3A2WA 1SKRB 1R5PA 2HRNA 3IK7A 1GSFA 2NBSA 1PL1A 4MZCA 3D4MA 5H5QA 1K0CA 3IPZA 2GZZA 5DJLA 2M80A 5DQYA 1CQGA 3KP8A 2VCVA 4JR6A 2GVPA 3ME8A 4JBBA 2MMAA 2LTKA 20GSA 4I97A 2R5GA 4IBPA 1A23A 3KM6A 5IMFA 8GSSA 1FG4A 4LL1B 2PBJA 3IC4A 2YWOA 1YJ6A 2FHEA 3ZRDA 1VF3A 2OBIA 4HOJA 2C80A 1WOUA 4PX1A 4AJ7A 1VF4A 2BJXA 2IMKA 5IMCA 3RPPA 1USBA 2HE3A 4WF4A 3WGXA 2B7JA 5HFKA 2H30A 3TDGA 3DYRA 3LYPA 2YN1A 1GTAA 1ZL9A 4MZWA 2I9HA 4IELA 2HYXA 3HY2A 2DMMA 1JZOA 2B5YA 5ECKB 2VUPA 3F63A 4OO4A 4ECJA 5ELAA 1WJKA 2YWIA 3FEUA 1AXDA 2FWFA 4EDYA 2C3TA 2OBKA 3Q19A 1F2EA 1GSSA 1QGVA 2HSYA 3F6DA 3SBCA 3DEXA 2KOKA 2IYJA 3DXBA 1AQXA 1YEXA 2L6DA 1Z5YE 5CNWA 2VL2C 5IQYA 3HCZA 3LORA 4ZBAA 4RI6A 5G1KA 4GQCA 1GRXA 1R4WA 3UBKA 4JEDA 2XC2A 4QL7A 1E6BA 1A8LA 2E2GA 5HR0A 3GV1A 1DUGA 1O8WA 2PMTA 1HNBA 3IK9A 3DGQA 2WGRA 1DBYA 4OCEA 5CRHA 3HVVA 4PUAA 1M99A 4E8HA 3TKQA 1JFUA 2GSTA 2VIMA 1TKDB 1YZXA 4ECIA 3QAWA 1SK0A 2H1DA 3I69A 4J57E 5GAND 2C0DA 4Q5NA 1SL1B 2LJAA 4POLA 4OFTA 1G6YA 1G7EA 2BTOT 4QL9A 2DJJA 3UEMA 1A8YA 1HYUA 5DALA 1RW1A 2O85A 4ML1A 4TR0A 3OR5A 2IIYA 2OA7A 1I5GA 3I6AA 5CRWA 5ECHB 1J08A 1JLVA 5IIZA 4ZL8A 1GTUA 3ZMKA 5B7CA 3C1SA 2FA4A 4ZXGA 3J7Yb 2V6KA 3QPMA 3VWXA 2AYTA 4Q5RA 2WS2A 3O3TA 2ES7A 1EZKA 1DE2A 4I2UA 3QCPA 1YEPA 3ERFA 2E2MA 4FYCA 5G30A 2H0HA 4V2NA 3C8EA 4FIWA 1GSYA 2LQQA 5J3RA 2VCTA 2VL2A 1EGRA 5EL8A 1F37A 2HRFA 1O81A 2LRTA 2IJYA 2FY6A 4HU7A 3TRQA 2DIZA 2PU9C 4ZBDA 3KJYA 2CQ9A 2PUKC 1PMTA 1PSQA 3CRTA 4YAVA 4EVMA 4K7OA 4IHUA 3FRCA 4RQRA 4CHSA 2WFCA 4KAEA 2BMXA 4RI7A 1B9YC 3W8JA 1UC7A 2GLRA 4MF6A 4K8MA 1HNAA 3EYTA 2AHEA 1SL2B 5ECPB 3ED3A 2CX4A 2XBQA 3GL5A 1TU8A 1GSQA 1PRXA 3ZFBA 1WIKA 4HJ2A 5ID2B 4AF2A 2CX3A 3IHQA 1WRYA 4MJEA 1AW9A 3ZMLA 1GLQA 2J23A 1O7UA 2LQOA 5DJMA 4KSOA 5ECNB 4K0GA 2KUCA 2V32A 1ERWA 2X8HA 1ZGNA 2CV4A 1XPVA 1ABAA 2CA8A 1ILOA 5D9TA 4DSSB 4RUVA 2J9HA 4MCUA 1EEJA 4IKHA 5D93A 5ABRA 1SK2A 2HFDA 2GSRA 1Z7RA 3KTBA 3LEFA 4MK3A 4MMMA 2CVBA 4IN0A 2FCHA 2WB9A 3IXRA 2ZUPA 3E9JB 4D73A 5B8BA 1QXHA 4HQZA 1SYXA 5IO2A 1TRWA 2V1MA 2M46A 2RM6A 5JCWA 2B5EA 3MSZA 3R2QA 1EOGA 3IOSA 3F3RA 2TRCP 4MLYA 2JSZA 3VPQA 1XVQA 4XRDA 3D22A 4PGTA 3QR6A 3A3TA 1X0RA 4V2MA 2P5RA 1PD21 3GSTA 2ALBA 3ME7A 5AIXA 1YF0A 4X1UA 1Y25A 4HZ4A 4F2IA 4FYBA 4TN8A 3KMNA 4MH3A 2RUEA 3D21A 4TXVA 2H72A 1ZCPA 1AAZA 2GS3A 2YV9A 1JLWA 3Q74A 4NMUA 2C4JA 3GH6A 2JZRA 1NM3A 3F4RA 5F8BA 1FOVA 1ZMAA 4BPYA 1O6JA 5D8IA 1ACVA 1KNGA 1URMA 1YKCA 2VLTA 4CW9A 5G2ZA 2ZCTA 1T8EB 3L9SA 4TVEA 1X5CA 5AIVA 5HR1A 4ZB6A 2E0QA 2L5OA 4IJ3A 2YZUA 3HZ4A 4G9HA 2FD3A 2H6XA 1GSDA 1MEKA 1F9MA 4GRFA 1KBNA 2K8VA 1SL0B 2DIYA 3FZAA 4PQHA 5F0GA 2R6KA 2GSSA 5JWRB 3DRNA 3QAVA 2JSYA 6GSXA 1BEDA 2O7KA 2FWHA 5D96A 3GMFA 4RQXA 3ZIVA 4D73B 2PVOC 3DVWA 1BJXA 2DMLA 3IV4A 3GKXA 5H5SA 1M2BA 2FWGA 2XPDA 1TK5B 2K18A 1FVJA 4HEA2 3VWWA 2LKUA 4E8EA 4N0VA 1XZOA 5ECRB 3H8QA 4IVFA 1B8XA 5JWOB 2LRCA 2VOCA 1TW9A 5DAKB 1LBKA 2O8VB 1AIUA 5KEJA 1Z6NA 1J9BA 4YQUA 1XWGA 2IPAA 4ID0A 1GLPA 3ZVJA 2B1KA 4DVCA 2REMA 2NDOA 4DEJA 2H0IA 2LV3A 1T3BA 2GQKA 4LA1A 2CT6A 1LJRA 4KGIA 3FZ4A 2NVLA 1G0TA 2HT9A 1FHEA 1ON4A 1AQWA 4LMVA 1NW2A 1DE1A 3LWAA 1F3BA 1M7TA 1PL2A 2H6YA 4K0NA 1EP8A 1TP9A 3EMPA 1JZRA 3CYNA 1FB0A 4MZBA 1MTCA 7GSSA 2QKEA 1SKWB 3VPTA 2AUVA 2DJ2A 2KLXA 4KDYA 4PQIA 3TB2A 1A0RP 4F82A 2OJLA 5AGYA 1K0OA 4OFNA 3ZITA 4NHZA 2VD0A 3P7XA 5DDLA 5B6MA 3EWLA 4BA7A 1M9BA 1PX6A 1NHYA 2B7KA 2WJUA 2VM2A 2K9FA 5CAXA 5CRGA 4TR4A 1GNWA 4MPGA 3GIXA 3UVTA 1GL8A 2L57A 1K3LA 3ZREA 5ECSA 3UBLA 1R7HA 4FO5A 2KP2A 2R3XA 4WF5A 1XWBA 3IE3A 3F3QA 3UMAA 2AB6A 3GX8A 4KX4A 4K1FA 1V57A 2VM1A 4K2DA 1VF2A 3BJ5A 3ZLPA 4HQSA 4ZL9A 1PQNA 4AJ8A 4Q5QA 4MJCA 1WWJA 2HXKA 1ERUA 4G2EA 2GT5A 3GKMA 5A4WA 1XWKA 4BWSA 1V9WA 2HLSA 4ZB9A 1OKTA 3QAGA 3JCML 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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