1V57 | Genus

Total Genus 68

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	68
sequence length	229
structure length	229
Chain Sequence	ELPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCPYCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
source organism	Escherichia coli
publication title	Crystal structures of the DsbG disulfide isomerase reveal an unstable disulfide pubmed doi rcsb
molecule keywords	Thiol:disulfide interchange protein dsbG
total genus	68
structure length	229
sequence length	229
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2003-11-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13098	Thioredoxin_2	Thioredoxin-like domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.450.70	Alpha Beta	Roll	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal	1v57A01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1v57A03

2JSYA 2TRCP 1TU8A 4JR4A 1PQNA 3MWHA 2FUG2 2HZEB 2VL9A 4PNFA 3P7XA 4TR1A 4XS4B 4F0BA 2X99A 1ACVA 3GKMA 2CVDA 1A2MA 1SYXA 1XWGA 2DJKA 1S3CA 3TGZA 1GUKA 4RQXA 4MZCA 3WGXA 4MJBA 4ISDA 1F2EA 3U6VA 1GSQA 1TRWA 1PKZA 3A2VA 2IL3A 2O89A 2XPEA 3KIJA 1SKRB 1MD4A 4OFMA 1KEBA 2WFCA 2HRFA 3L78A 4MJEA 3GMFA 4I6XA 4ZBBA 3KJYA 3VLNA 2H1AA 5D96A 3VPTA 2V6OA 1Y6EA 1URMA 4V1Ag 5IOWA 1QGVA 3KH7A 2R3XA 4FO5A 3H1NA 3TOTA 4EKZA 1AAZA 1K3OA 4IGJA 5FWGA 2YWMA 4LMVA 1XIYA 2YOIA 1LBKA 2JZSA 5ECOB 5A4WA 1FVKA 2LEGA 2C4JA 3RPNA 2XBQA 4YAVA 2X8GA 4XTSA 2J9HA 1SK1A 2HI7A 2PU9C 4KSMA 4IN0A 3DEXA 3W8SA 5KN0A 2E7PA 4GLTA 2HLSA 2LV3A 1XWKA 4XHMA 1KTEA 5IIZA 2JU5A 2H0IA 1NHYA 1XOAA 4ECJA 3GX0A 3C1SA 1V2AA 1RQMA 7GSSA 5J5NA 4MP4A 2H6YA 1TI1A 4HDEA 2H01A 2YANA 4J57E 3F6DA 1SKWB 1Z7RA 5KEJA 5ECMB 1X0RA 2FGXA 2MBTA 5A4VA 3ZVJD 2CZ3A 3P8WA 1NW2A 1U87A 1EGRA 3HJPA 1A0FA 1X9MB 1SJIA 1PL1A 1Y25A 4IELA 3M9KA 2R37A 4GQCA 2LJRA 2YV7A 3DVXA 3ZITA 3NZNA 5KN1A 2TRXA 1GTAA 5AIVA 1OC9A 4O32A 2IMEA 4OWYA 3KD0A 1A0RP 4POMA 4HZ4A 4K9ZA 1YJ6A 2E2MA 3NOFA 5J9CA 3CRTA 2DJ1A 4TXOB 1TKDB 2YPMA 2WCIA 2X64A 5G1KA 2H6ZA 2LNTA 1OVNA 2WGRA 4H86A 4QL7A 4OO4A 1V9WA 3FY7A 3FK8A 1XBSA 1YF0A 4EDZA 2FA4A 6GSSA 4Q5NA 1QMVA 3GX8A 5IPGA 4PGTA 3D6IA 1I5GA 1OKTA 2KHPA 4HI7A 4I8BA 1K3YA 2QKEA 3A2WA 4BWQA 1LJRA 2G2QA 1O85A 4TR1B 1Q4JA 1M99A 3IA1A 3CXGA 1Z7PA 4FYCA 5J41A 2GSSA 5C00A 6GSUA 2YP6A 3I9V2 3L4NA 5E59A 3DYRA 4MF5A 4X1UA 3VFIA 5KN2A 3KMNA 1GTUA 4ILFA 1OE7A 5IOXA 1GSDA 4ML1A 1K3LA 2A4VA 2AB6A 3HVVA 2O85A 3UAPA 1G6WA 4WKWA 2KP1A 3HZ4A 3LYPA 2MMAA 4MH2A 5L71A 2VD0A 2VCWA 1O81A 1JLVA 1B4PA 5H5QA 4TR3A 4NXIA 2LJKA 5B8BA 1ERVA 5IMFA 3QD9A 2V32A 2WRTA 4GWRA 2ZCTA 1JLWA 1G0TA 1B48A 1BQ7A 5F05A 2HNLA 1X5CA 1WRYA 4JR6A 4ULXA 2FWFA 4K7IA 4MH3A 1ZCPA 3CTGA 5D73A 3EE2A 4ECCA 4I2UA 3IV4A 1M2DA 2GQKA 2C0DA 2H72A 3Q74A 2ES7A 1T4YA 3EU3A 2F51A 5DVBA 2DIZA 14GSA 1FAAA 2FHEA 1OE8A 1B9XC 1THOA 2H0GA 4KDUA 4EE0A 3GIXA 4DSSA 3L0HA 5IMDA 1A8LA 2IIYA 1Z6MA 4ML6A 3GSSA 1GUHA 3FKFA 3I69A 4K2DA 3TKSE 4AJ6A 1MEKA 3LORA 1T00A 2NPBA 3ZLPA 1G7OA 5D8IA 4PNGA 1WIKA 1NHOA 6GSXA 3ZYWA 2ZUPA 4DEJA 3ZFLA 3O3TA 2P0GA 4I2TA 4JRRA 1XW9A 3HVXA 1BG5A 1TOFA 1AUCA 1OC9B 2VM1A 2B6MA 4NPBA 2MMNA 3CMIA 4FIWA 2OA7A 2H71A 2H70A 1ERTA 4NAXA 1WJKA 4OD7A 3S9FA 1HNBA 3F63A 3FR3A 4WR4A 1QFNA 3FYGA 2K18A 2LS5A 2KP2A 3HZ8A 3GRXA 1GULA 5IMZA 2EIRA 1TRUA 3BCKA 6GSTA 1S3AA 1SL1B 1YKAA 3H93A 2YNXA 2HZFA 1GSUA 1USBA 4JZQA 3HJOA 1Z5YE 5D9VA 3VPQA 2QSIA 2WULA 2X8HA 4WETA 2AHEA 1M2AA 2H6XA 1AXDA 4XRAA 1AQVA 3P2AA 2VL3A 3LXTA 3WYWA 1PL2A 5JWOB 4HJ2A 2DJ3A 1IYHA 4LL1B 2GSRA 4BL7A 4KAEA 3TRPA 3IAS2 2K6VA 5DBQA 1QUWA 2JZTA 2VLTA 3D4TA 3G7IA 3QR6A 5B6NA 2AV4A 1ST9A 1GWCA 1HNCA 3BOAA 2X8CA 2FNOA 1CQGA 1UA5A 1GNEA 1JZDA 4L5LA 3UOMA 3WGDA 1WWJA 1YDKA 5JCWA 4L5OA 2LKUA 5CNWA 3Q19A 19GSA 5CREA 1RK4A 1BYEA 2CZ2A 4O92A 3J7Yk 2RLIA 1Z3EA 2LRCA 3E9JB 4L0UA 2IWTA 2EIQA 2R6KA 5B7CA 3UVHA 5GAND 1AQXA 3M3MA 4K7OA 1GP1A 1BEDA 4F9ZA 5DCHA 4DSSB 3WT1A 2L4CA 5EL8A 2VL2A 5AN1A 5G1LA 4BWSA 1EV4A 2YN1A 4IBPA 1XFLA 3ISOA 4V1Ap 1XVWA 3APOA 3N5OA 3GH9A 4YH2A 2MZCA 1PD21 2DSAA 2GTUA 2L6CA 4POLA 3VWUA 1TRSA 3QAVA 2CA8A 1DE2A 1M9AA 1SJ6A 3TJKA 1X9WB 2NDOA 2JSZA 3IE3A 4FH8A 1WPIA 1K0NA 4N11A 3D0ZA 2IJYA 4ZL8A 3BD2A 4EC0A 3JCML 4OFNA 3NIVA 1SKSB 1T1VA 4QQ7A 2H19A 2CQ9A 3LFLA 2E0QA 3RBTA 4HOJA 2B1LA 1DUGA 3FZAA 1S3DA 3ZREA 2V6KA 4EF0A 1FOVA 3QDNA 5G5FA 1K0CA 4ZXGA 2LNSA 4X0XA 3UBLA 2PERA 1GTBA 1ERUA 1XXUA 1T8EB 3UMAA 2HSHA 12GSA 2V41A 1ZOFA 1XW6A 3HVSA 4MK3A 4HQZA 5JCUA 5H5SA 2L57A 4YAPA 2DJ2A 4PURA 1ZYQB 2EIOA 4N10A 2FLSA 5DALA 1XOBA 4NHWA 5IMAA 4NWYA 4GSTA 1O8XA 4RI7A 5DDLA 5G31A 4WF5A 5D9XA 5DJLA 3U5RE 4XS1A 6GSVA 5D93A 2CX4A 2YWNA 3DRNA 2YJ7A 5HFGA 18GSA 1GLPA 2HT9A 5AISA 4K1FA 1B4QA 1YKCA 4EDYA 2O87A 1MTCA 3E3EA 3ZTLA 2GZYA 2I4AA 1PKWA 3F3RA 4IP1A 2M46A 3I43A 2LRTA 2XC2A 2B5EA 4I97A 4ZILA 3KZQA 2GSTA 1W4VA 3EURA 4MA9A 3M1GA 2OJLA 2R5GA 2ALBA 1VGLA 2WDUA 2LSTA 4DSRA 1UC7A 1SU9A 1E2YA 2VCZA 2GLRA 4EL1A 1U3IA 1TI3A 4PQ1A 2M72A 5A4UA 1OKDA 3G7YA 3ME7A 4AJ7A 4IQ1A 4XS6A 3TCOA 3Q6OA 4K8MA 3FZ9A 1HD2A 4MZBA 1PX7A 2GT6A 1TJDA 4IP6A 5J3RA 3LEFA 3PH9A 2JL4A 4ZB6A 2DIYA 3DWVA 3APSA 3PINA 3CRUA 1WE0A 1YF1A 3VK9A 4ZIJA 2C1YA 1TDIA 2NVLA 2PVQA 2REMA 1F37A 3GKKA 4ZBDA 3M9JA 4TKYA 2AJQB 2RM5A 1TW9A 2I81A 2MMZA 3M0FA 2KOKA 5ECHB 2H0HA 5JCGA 5CRDA 3A5WA 3KM6A 2GT5A 3MAKA 3RDWA 4G19A 4ZL7A 1THXA 2FD3A 1ZMAA 3FEUA 5ABRA 2PGTA 4DVCA 2AAWA 1EEMA 1GL8A 3VI5A 4BPYA 2GZZA 1M0UA 3G7JA 1WMJA 3TKRA 4PQIA 2OACA 4QL9A 3UIWA 5DALB 4IVFA 2RUEA 1OAZA 4TOPA 1HYUA 1YZXA 2K9FA 4K7NA 1MDJA 2F8AA 2GZPA 2VD1A 5IMCA 2CV4A 3IDVA 2KLXA 3D22A 3TJFA 2VCXA 3QFAC 2XHFA 4ECBA 1KNGA 2DMMA 4F0CA 17GSA 2JADA 5GZZB 3TKPA 3F4SA 2JACA 4BVYA 1EZKA 4ZB9A 3AY8A 3GN3A 3FZ5A 4IKHA 1TTZA 1AIUA 3FZ4A 5CYYA 3ERWA 4TN8A 1QXHA 3GL3A 9GSSA 5F8BA 3QOUA 2DJ0A 2Z9SA 3SBCA 3I6AA 4TXVA 2P5QA 3H79A 2YJHA 4PQHA 4HJMA 1R5PA 1M9BA 2F3MA 4YQUA 2YWOA 3IR4A 4RI6A 5HR1A 3R2QA 4V2MA 4L8EA 1WOUA 1OC3A 5CAXA 3WGEA 1YY7A 1F3BA 1FHEA 4F03A 3ERGA 3GNJA 1DE1A 2F9SA 2VCVA 1R4WA 3KH9A 5DCGA 3MNGA 3APQA 4GSNA 4O5RA 1U88A 1SD9A 2P31A 4KCAA 5ELGA 5HR3A 2BTOT 2LUSA 3L9UA 3F0IA 3DD3A 1A24A 3ZIVA 4JU5A 4WF4A 2HYXA 4AJ8A 1X5DA 3TJJA 2OE3A 2VOCA 1GNWA 5B8AA 1NM3A 3C1RA 2VCQA 4KA0A 1H75A 3GTUA 2VLUA 3K8NA 3TKSC 2L5OA 1C72A 2I9HA 1O8WA 1XW5A 4MMMA 3RAZA 2H66A 3QAGA 2H30A 2ZNMA 4OMVA 1ZGNA 2IPAA 1GUMA 2G0FA 5AGYA 1SL0B 2FWGA 3TOUA 4KW6A 2MBSA 3LXZA 1TU7A 3FW2A 1F9MA 2FCHA 4WBRD 3RHCA 2PWJA 3FR9A 1PRXA 1V98A 5DQSA 2VCTA 4NMUA 1TP9A 3UVTA 1TK5B 4XIHA 5ECQB 3ZVJA 2VLVA 2XPDA 2MMOA 2B5XA 4BA7A 1X9SB 3VI7A 2GGTA 3US3A 3IRAA 3O76A 2WS2A 3H8QA 3CYNA 1GSEA 3L9VA 4PUFC 3GHAA 4TVEA 1Z9HA 4GF0A 1T7PB 2H1BA 1ZL9A 4LL4B 4IS0A 2NBSA 2LTKA 1XWCA 1MDKA 3PGTA 4MF7A 2IN3A 4IJIA 3CSJA 5G2ZA 1F3AA 1XWAA 5DQYA 1FB6A 2HSYA 4MABA 2C8UA 4BVXA 3UARA 3WT2A 1SJZA 3IPZA 3QMXA 4AGSA 1JFUA 5IO0A 2YWIA 1YEPA 2ON5A 3TDGA 4EO3A 4GSSA 5KN3A 2J23A 2C0GA 3G9BA 1X5EA 2YZUA 3HKRA 3HJMA 3VWVA 3ZIJA 3A2XA 5G5EA 5IQYA 1OYJA 1JZOA 4L0WA 1GLQA 3W6GA 4HUAA 1WP0A 2IY2A 3KTBA 4FYBA 5C04A 1ERWA 4MJAA 1ABAA 3ED3A 2LJAA 1N2AA 3GL5A 4Q5RA 2KUCA 4ZB8A 1VF1A 3KP8A 4NV5A 2P5RA 6GSYA 1T3BA 1BJXA 4ECIA 4KH7A 2O8VB 3PR8A 2N5BA 3GH6A 3HD5A 3GURA 2C3TA 3ZFBA 5CO3A 2R2JA 4OO5A 4JE1A 2IYJA 3GTUB 3D4MA 4GQFA 3CBUA 4CHSA 5ECNB 5ELAA 1VF4A 5HR2A 2IMFA 1NSWA 1QQ2A 3N9JA 4YQVA 4D73A 3GUSA 1ZYEA 3E0UA 4WBJA 2NTOA 3J7Yb 4NV2A 2K8SA 1R26A 3TB2A 3EU4A 1XCCA 2WB9A 1SK2A 1K0MA 1JHBA 2DC5A 2B3SA 3UEMA 2RUFA 2TIRA 3LYKA 4E8HA 3EMPA 1HNAA 2B5YA 3DIEA 4I5QA 2ON7A 4Q5FA 3A3TA 3M8NA 3DVWA 2IFQA 4POKA 1KBNA 4WR5A 3P90A 5LD0A 3CTFA 4ZBAA 2OE0A 1GSSA 22GSA 3ERFA 3DGQA 3HCZA 4TW5A 4PUAA 4GCIA 1U6TA 3LWAA 4MPFA 2OADA 1E6BA 3O6TA 3TJGA 1BX9A 2QGVA 4MJCA 1PN9A 5EY6A 3EYTA 2B7KA 2FY6A 1K0OA 1EOGA 1A2JA 3EWLA 1ML6A 3SWLA 5ECPB 3IBHA 4X43A 3HXSA 2BMXA 2F8FA 1SK0A 3HA9A 2HE3A 2C0EA 2CT6A 2DLXA 5D9TA 1R7HA 2L6DA 4G10A 2A2RA 2V1MA 3KP9A 3HHVA 4RQRA 3C71A 3QPMA 3OR5A 5JWQB 4JEDA 4IW9A 2C0FA 4O7HA 3EC3A 4IHUA 2VAFA 3HY2A 3C7MA 1RW1A 2L5LA 3V1WA 1EWXA 1XPVA 1GSFA 1AQWA 2VM2A 2R4VA 2LQOA 4K0GA 1AW9A 1LU4A 3EMXA 3ZMLA 2H76A 2CAIA 4KSOA 1UN2A 2OKAA 1M2BA 4FYUA 3TKQA 4TR0A 4F2IA 4KE3A 2LQQA 5CP1A 2V2GA 4KDYA 1GH2A 3UJ1A 3GYKA 1G7EA 1GRXA 1O7UA 2N5AA 1MD3A 4CW9A 1M7TA 1UVZA 2HXKA 4V2NA 1PMTA 2CVKA 1YQ1A 3GSTA 5EVOA 2VO4A 1GTIA 5J4UA 3F4RA 2RIIA 4MDCA 4D73B 10GSA 1PX6A 2EC4A 4ACSA 2JZRA 2C3NA 1VF2A 4OFTA 1B8XA 1TK8B 1YEXA 5F07A 3RPPA 1U3AA 1SYRA 5ECIB 3UBKA 3CSHA 5CRWA 1G6YA 1I9DA 2L59A 3F4TA 3GKNA 1V40A 2PVOC 3UL3A 4TRXA 2H1GA 1A23A 3KEBA 4CDOA 3GFKA 3IC4A 4V2LA 2VIMA 3W8JA 5FT3A 2FWHA 4OCEA 1TRVA 5GAPD 1EP7A 4MPGA 4KGIA 2GSQA 4MF6A 2IFQB 2IMIA 2GQMA 1AC1A 4HZ2A 1MDIA 3KMOA 5J9BA 1J08A 4XRDA 3D5JA 1SENA 3KXOA 4EUYA 4EVMA 1J0FA 1H4OA 5HQPA 3HDCA 3GV1A 1K0DA 3LG6A 1JZWA 3C73A 3ZL5A 2LRNA 3KGKA 1K0AA 5FHIA 4KDXA 5AIXA 1F6MC 2PN8A 2CAQA 3KCMA 4Q5QA 2C80A 2I3YA 4K6XA 3Q18A 1DSBA 5EPFA 5H5RA 1ZZYA 4K0NA 4E8EA 3ZRDA 2DMLA 2GS3A 5CRGA 2H8LA 4YQMA 5ID2A 4N0ZA 3FRCA 3IHQA 3IXRA 1GSYA 4KCEA 5CRHA 4F82A 4AF2A 5IM9A 5LCZA 5ECSA 2N5FA 2AUVA 3ZMKA 3C8EA 3F3QA 4MCUA 1T4ZA 20GSA 2H75A 3QAWA 5ECKB 3CSIA 3DMLA 4XCSA 5JWRB 4RUVA 3LGCA 2IMKA 1ILOA 5HFIA 4HU9A 2M80A 2WJUA 3MSZA 2PUKC 5D9WA 4GXZA 2GDRA 5ECLB 3QFBC 3FHKA 3ME8A 3IOSA 2GQLA 3GKXA 3F6FA 1TXXA 2OBKA 2E2GA 5DAKA 4ID0A 2YV9A 2H74A 2VL2C 1FG4A 4POBA 3VWWA 4IQAA 5DJMA 2C3QA 4J56E 2RM6A 2O7KA 3QCPA 4JBBA 1K0BA 3MDKA 1SD8A 1R5AA 5F06A 1QK8A 1FB0A 4MZWA 4LMWA 4KB3A 5INYA 1N8JA 2MYGA 3LJRA 2HZEA 1V58A 1W89A 1J9BA 2H1DA 4XS4A 2WZ9A 2FA8A 2PBJA 3IAM2 4HEA2 1EP8A 2VUPA 5F0GA 5B6MA 2A2SA 4Z7XA 5G30A 3ZZXA 1VRSD 4EXJA 2B7JA 4OCFA 1XWBA 3BBYA 3GA4A 5HFKA 1SL2B 5ENUA 1EGOA 3TJBA 3H4KA 1PGTA 2YCDA 3TRQA 1OC8A 3BCIA 4PXOA 2B1KA 2K8VA 1TK0B 2CX3A 5IPHA 5HR0A 4HU7A 5ECRB 2YZHA 3DKSA 2IMDA 4HQSA 4KUNA 3RHBA 5A5KA 4GTUA 5COHA 3F9UA 3KTLA 1V57A 1EOHA 1VF3A 4LA1A 3TRXA 4LLRA 4KX4A 1ON4A 1Q98A 3HYPA 5GSTA 4HS1A 2DJJA 2PMTA 4ZL9A 2HFDA 3VWXA 4DSQA 2HRNA 1CQHA 13GSA 4N0VA 1Z6NA 2XBIA 1EEJA 4GRFA 2GVPA 3TUEA 2L4QA 4P3YB 5IMVA 2CVBA 1XZOA 2DBCA 5GSSA 1DBYA 1FW1A 1O73A 1A2LA 11GSA 1PA3A 4MLYA 1FO5A 3EVIA 1JZRA 4G9HA 3FR6A 4N30A 1BAYA 5ID2B 2OE1A 1IYIA 1PSQA 1FVJA 3LSZA 1EV9A 3D21A 3IK9A 2PPTA 1HQOA 4G2EA 4KNDA 2D2ZA 4IJ3A 4NHZA 3EINA 5LNKe 3TKSA 1XVQA 4WEYA 3BJ5A 2FWEA 2OBIA 1A8YA 16GSA 4TR4A 3LQ7A 2BJXA 3DXBA 1O6JA 8GSSA 1B9YC 2I1UA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4WXT A;  2AYT A;  4PX1 A;

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1V57A

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations