1V58 | Genus

Total Genus 64

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	64
sequence length	229
structure length	229
Chain Sequence	ELPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCPYCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structures of the DsbG disulfide isomerase reveal an unstable disulfide pubmed doi rcsb
source organism	Escherichia coli
molecule tags	Isomerase
molecule keywords	Thiol:disulfide interchange protein dsbG
total genus	64
structure length	229
sequence length	229
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2003-11-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13098	Thioredoxin_2	Thioredoxin-like domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.450.70	Alpha Beta	Roll	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal	1v58A01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1v58A02

5DQYA 1TW9A 1A8YA 1GUKA 1EZKA 2HZEA 3CXGA 3LG6A 1SD8A 1DBYA 4BWQA 4MJAA 3TOUA 2RM5A 2OA7A 5J41A 2OJLA 2LEGA 1UVZA 2HLSA 4YAPA 4Q5QA 3RAZA 1M2AA 3D4MA 4MK3A 4ZL7A 1GWCA 3TKQA 3TJGA 3F6DA 4QL9A 2RM6A 3CRTA 2AV4A 1F37A 3Q74A 1ST9A 3N9JA 2PGTA 4QQ7A 1GUMA 2KLXA 1V58A 3ZVJD 2C4JA 1B4QA 1GSEA 3P90A 1GL8A 4IVFA 4MPFA 2H0HA 2H1AA 3QMXA 1DE2A 2FCHA 2YOIA 4MZWA 1TJDA 1LU4A 3F3QA 2GGTA 2REMA 4ISDA 3F9UA 1BJXA 3QFAC 3D6IA 4XCSA 2AUVA 3FRCA 3GKNA 4V2NA 4K8MA 1SKRB 3KTLA 2PBJA 4DSQA 2IJYA 1ERUA 3TRXA 20GSA 3VK9A 1TK0B 1A2LA 2FWEA 2CZ3A 3EU4A 4MP4A 1Z9HA 5IMFA 2CT6A 3GRXA 3LJRA 4TOPA 2H75A 3WGEA 2HRNA 1JLWA 5AGYA 3HDCA 1JZRA 3EC3A 1GP1A 4XS4B 2FWHA 4ZBBA 4WBRD 1KTEA 2FUG2 5KEJA 3CSHA 3HJOA 2GSTA 3F8UA 4PXOA 2FHEA 1NSWA 2QSIA 1GH2A 2V1MA 1M2DA 4NV2A 4ACSA 2MMNA 1T1VA 2BJXA 2HE3A 4KAEA 2NTOA 1O7UA 1LJRA 1AAZA 5DJMA 2GQMA 2L4CA 1UN2A 1VGLA 5GSTA 4ILFA 3D21A 5A4UA 3VURA 2YNXA 4XS4A 1BQ7A 3HKRA 2WDUA 2YZHA 4GSSA 1XOBA 1XW9A 1OAZA 5CREA 2F8FA 1GTBA 5DALB 3KMNA 3FHKA 2JADA 4O5RA 4TR1A 4MF6A 2F3MA 1TK5B 4F03A 3TKSA 1YQ1A 6GSTA 4DSSA 4POLA 1OC8A 3GSSA 4X1UA 1EGOA 5ECIB 3KEBA 4PQHA 1X9SB 4V1Ag 3W8JA 2V6OA 2L6DA 1ABAA 2H19A 3DVXA 5ECSA 2DLXA 1A0FA 4KW6A 1Y25A 4G19A 3HZ4A 1V98A 5HR0A 4OFMA 16GSA 4XHMA 4AJ6A 4KNDA 2WULA 4D73A 3IOSA 3KGKA 3ZFLA 1B4PA 5C00A 2MBTA 2CVBA 5H5QA 2XPEA 2D2ZA 3IK7A 4TR4A 2V32A 2GZZA 4P3YB 3CSIA 1U3IA 1OKDA 1UA5A 3BD2A 3EMPA 4FYBA 1T00A 2C8UA 4K6XA 4J2FA 4ECCA 3M0FA 1O85A 3UMAA 1OKTA 2K18A 3GTUB 1AUCA 2C0EA 1H4OA 2IMEA 3GH6A 1WRYA 1PMTA 2IMKA 3O3TA 1JFUA 5JCWA 1SKWB 1ZMAA 3TKPA 4GWRA 3IXRA 2PU9C 3W6GA 3U6VA 3A2WA 2FA8A 5JWQB 5DCGA 3ZMLA 2DIZA 1U87A 4O7HA 4LMWA 5DCHA 1J0FA 3W8SA 5ECRB 1IYHA 2EIRA 3IRAA 3E9JB 4IN0A 2JZTA 2KP2A 4MLYA 2BMXA 4KSMA 2YWOA 3HZ8A 3LWAA 5CRGA 1EV4A 1EGRA 1A24A 3M3MA 4TVEA 4TXOB 1VF1A 2RLIA 3FZAA 1B8XA 5CYYA 5J5NA 4AGSA 4ZL9A 4MH3A 4KH7A 4X0XA 1YF1A 4KGIA 3SWLA 4LL1B 1ZCPA 2HSYA 3EE2A 2E2MA 2P5RA 2VCXA 4GTUA 3TJKA 3PINA 4K0NA 2GS3A 17GSA 2O8VB 3GA4A 3FR9A 2EIQA 3GH9A 2IN3A 4RQRA 5IIZA 4IBPA 2IL3A 2PUKC 2MZCA 2WCIA 2MMOA 1NW2A 1PRXA 2H73A 4KDYA 1TK8B 3QAWA 3GX0A 5IMZA 4MZCA 2LTKA 2OACA 4CW9A 3JCML 2TRCP 1EEJA 1V57A 2X64A 2LNSA 3KH7A 2CV4A 1AW9A 2OE0A 5A4WA 2L59A 1EV9A 1BX9A 2FD3A 2LRCA 2DJ3A 3CTGA 1Z5YE 4MDCA 3WT1A 2HFDA 2VCTA 2C0FA 3US3A 2I1UA 3ZITA 3ZIJA 1SK0A 3GX8A 3IC4A 5DBQA 4KX4A 2DJKA 2RUFA 1BAYA 2E2GA 2CZ2A 3I6AA 4ECJA 4TXOA 4Q5NA 3CBUA 1K0OA 4J57E 4IQ1A 2B6MA 1EP7A 1ERVA 3F4SA 1PA3A 1PL2A 3APQA 3HYPA 4OFTA 2HYXA 4WBJA 1PGTA 1A0RP 1TU7A 1MD4A 2MBSA 3IAS2 3Q6OA 4N10A 4EO3A 4YAVA 4KCAA 3GMFA 4MJEA 3LGCA 2M46A 2LRNA 3OR5A 2IMIA 1T4YA 2C80A 3GURA 3N5OA 2LQOA 3J7Yk 3LXZA 1TRUA 3LSZA 3RHBA 5KN1A 4DSRA 1YDKA 4XIHA 3GV1A 3K8NA 2QC7A 1T7PB 4KDXA 1Z6MA 2DIYA 3QDNA 1GTIA 4EL1A 3VFIA 4JR6A 2C0GA 3IA1A 3VWVA 2RUEA 4F82A 2EC4A 3A5WA 1QMVA 2HRFA 2N5FA 2GQKA 2H71A 1U3AA 1AQWA 1G7OA 2H1DA 3AY8A 2HSHA 4WETA 3CTFA 1XWAA 4JR4A 3G7IA 4PNGA 3APOA 4HDEA 4MABA 5H5RA 4MF5A 2GLRA 2B1LA 3A2VA 3BCIA 4LLRA 3TUEA 1C72A 3F3RA 1G7EA 1GSDA 3D0ZA 6GSYA 2YWMA 1YF0A 3WGXA 5E59A 1F9MA 1DSBA 1HNAA 3G7YA 3CYNA 2JU5A 4OMVA 1A2JA 4O92A 3FK8A 5HFIA 1CQGA 3C1SA 2DJ2A 3ME7A 4O32A 3FZ4A 3UBKA 1YY7A 1BYEA 1RW1A 4EE0A 1URMA 3DWVA 2ES7A 1FB0A 3DKSA 1R4WA 4K0GA 4MCUA 1XWKA 1EP8A 1NHYA 2H66A 3G9BA 2LSTA 3HVSA 1Q98A 4IQAA 3H93A 2H01A 3IHQA 3E3EA 1Z7PA 3D22A 1GUHA 3C71A 4E8EA 5IOWA 1NM3A 4KUNA 2GT5A 18GSA 4GSNA 1XFLA 1ZGNA 1X5CA 4G9HA 3C73A 3H79A 3VPQA 4EUYA 2G0FA 5IMDA 1TP9A 3UOMA 4ZB9A 1HNCA 2HT9A 3M1GA 3UARA 2VLTA 2V2GA 4KA0A 4XS1A 5G5FA 4MF7A 4WR5A 4EKZA 3MAKA 5ID2A 1M9AA 1GSFA 1K0NA 5JWRB 1SU9A 2KOKA 4H86A 3WGDA 2L5OA 2DJJA 2VL2A 4IP6A 2B5YA 2YV9A 1KEBA 3BCKA 4DVCA 4K7IA 3TKSE 1T3BA 4RQXA 1ILOA 1I5GA 2VCWA 5EVOA 1O73A 2K8VA 2LJRA 3IAM2 1E2YA 3I9V2 2XHFA 3LFLA 7GSSA 3LORA 4LMVA 4EC0A 1HD2A 2K8SA 2VCZA 2OE1A 4IW9A 3GHAA 3L4NA 2HZFA 5CRHA 2FNOA 4V2LA 2C0DA 1FVKA 2HXKA 3GKMA 5DAKA 1X9MB 4JBBA 2AAWA 4GSTA 1S3DA 5D96A 1OC3A 1DE1A 2LV3A 5JCGA 3KCMA 4F0BA 2OBIA 4GF0A 2VM1A 1EEMA 1BG5A 4G2EA 4POMA 3TKSC 4Q5RA 1G6YA 2C1YA 2VLUA 5B8BA 1GSUA 1Q4JA 2F51A 3IE3A 3FYGA 2H30A 1THOA 5IOXA 3L9VA 5IPGA 3FW2A 1MD3A 2OADA 4EDZA 1XPVA 1A23A 2VL9A 4NAXA 1VRSD 3HY2A 4EVMA 1GSSA 4MZBA 1PN9A 2XBIA 4NHWA 3M9KA 2PWJA 3GFKA 3TKRA 13GSA 2IIYA 1FB6A 4XRAA 1XVQA 6GSUA 2IMFA 3QPMA 2HZEB 4RUVA 4DEJA 4TKYA 2FY6A 4ZB6A 3LXTA 3A3TA 3VI5A 2OBKA 2P0GA 3VWUA 1V2AA 4YQVA 4HZ2A 2MYGA 3ED3A 5F8BA 1IYIA 2M80A 5DAKB 2IMDA 4BWSA 2H76A 2VL2C 1V9WA 4L5LA 3GTUA 1R7HA 5C04A 1TKDB 1OVNA 3P8WA 3TJFA 1G0TA 3DIEA 2PMTA 4MJBA 2VL3A 4XS6A 3MDKA 5E4WA 3D5JA 2O89A 3GNJA 4TXVA 2YANA 2R2JA 2VM2A 4JU5A 2I81A 1K0CA 5HFKA 2V6KA 2VLVA 3RHCA 1PX6A 3G7JA 4WF4A 2YWIA 1SL2B 5ECQB 1K0BA 1SYXA 1K3OA 1YKCA 1AQXA 2CVKA 3RDWA 2B7JA 5ECNB 3LYPA 4V1Ap 3WD6A 4WKWA 4E8HA 1M7TA 3HJPA 2H70A 2VD0A 5D8IA 1J08A 1DUGA 2ZNMA 2JL4A 4GQCA 4XTSA 4N0ZA 2VAFA 1USBA 4RI6A 3ZZXA 1TU8A 1PX7A 1J9BA 3L78A 5AIXA 4CDOA 4ZBAA 1JLVA 5CRDA 1XCCA 4ZXGA 2AJQB 3ERGA 1JZOA 3WYWA 1QGVA 4PGTA 4HQSA 3ZVJA 3NIVA 3UAPA 5KN0A 4BVYA 5IQYA 3NOFA 1GTUA 4PX1A 2H0GA 1GNWA 4TN8A 1R26A 1O6JA 4K7NA 2HNLA 3L0HA 3VLNA 5IO2A 4I5QA 5IO0A 1GTAA 4ECBA 4NV5A 1TRSA 2H6YA 1XIYA 4KSOA 3SBCA 4NHZA 3O6TA 2HI7A 1U6TA 2R6KA 3FKFA 3HXSA 4HJMA 4ZILA 2DJ1A 1PKZA 3KH9A 4F2IA 5DALA 1O8WA 1PD21 3MNGA 1OC9A 5JCUA 5KN2A 1MTCA 4IGJA 4ZL8A 4TR1B 3GKXA 4OO4A 4YH2A 4Z7XA 1B9YC 1WP0A 3UJ1A 4K1FA 1FHEA 1R5AA 2PVOC 5LNKe 1U88A 2C3TA 3R2QA 3KZQA 2WB9A 4PQIA 2CQ9A 1N8JA 5J9CA 2H6XA 1XWCA 5F0GA 1MDKA 2KHPA 3CMIA 10GSA 2LRTA 4V2MA 1AXDA 3LYKA 5A5KA 3GSTA 2G2QA 4NMUA 1SKSB 1ZYQB 3GN3A 3FR3A 1THXA 1WJKA 3FY7A 3HCZA 5ID2B 3ISOA 5GZZB 3HHVA 3IBHA 2H6ZA 2I4AA 3EINA 4WEYA 2B7KA 3D4TA 4PURA 5EL8A 2ON7A 5G31A 1TI3A 2DSAA 2TIRA 1YJ6A 5ABRA 4HZ4A 5DJLA 5ECPB 1XW5A 3KJYA 2P5QA 1JHBA 2VO4A 1Z7RA 3C8EA 3QOUA 4I6XA 4EF0A 2MMAA 3MWHA 4NWYA 1S3AA 4HUAA 1X9WB 5ECLB 4MMMA 1QQ2A 3IPZA 3KM6A 4L0UA 5EPFA 1X0RA 2CX3A 1HNBA 2A2RA 1GNEA 3A2XA 1KBNA 2C3NA 2JACA 4IHUA 4J56E 2X99A 2ZUPA 6GSSA 5IM9A 3FZ9A 2H74A 1XOAA 5INYA 2EIOA 1EOGA 4F0CA 2Z9SA 3DYRA 3KTBA 2RIIA 2C3QA 4K2DA 3LEFA 3KIJA 2O7KA 3ME8A 2NDOA 3CRUA 2CAIA 1TRVA 2WS2A 2TRXA 5DVBA 5G5EA 1ZOFA 2GZYA 2BTOT 4ULXA 4BVXA 4GCIA 2YWNA 1T4ZA 2N5BA 4FYUA 4GRFA 4IS0A 1JZWA 4I2TA 2J23A 1YZXA 5KN3A 5HR2A 5LCZA 5AISA 2XBQA 4POBA 4PNFA 5IMAA 5G30A 4MJCA 1SD9A 5COHA 4F9ZA 4MH2A 3RPNA 2LQQA 1XWGA 4L8EA 2FGXA 22GSA 2CVDA 2IWTA 8GSSA 2QGVA 2GTUA 2K6VA 3VPTA 1SK2A 1B48A 3UVHA 1EOHA 3F0IA 3FZ5A 6GSXA 1AIUA 3VWWA 1A2MA 3ZLPA 4HU7A 1XXUA 4HQZA 1SL1B 3DMLA 4DSSB 1E6BA 6GSVA 2LKUA 2V41A 4KCEA 2B5EA 3ZTLA 4IJIA 4TR3A 3PH9A 1PKWA 3IV4A 2LS5A 5ELGA 9GSSA 3TJBA 3O76A 2X8GA 1V40A 3ZYWA 4I97A 1I9DA 4OO5A 4IP1A 1K0MA 2KUCA 4YQMA 1ML6A 1O81A 3H8QA 2H1GA 4HU9A 1F2EA 4TRXA 3KP8A 2ON5A 2H1BA 1MDJA 1K0AA 2YN1A 1SJIA 1MEKA 2VD1A 4JE1A 4ECIA 5JWOB 2R3XA 1QXHA 5HR1A 3L9SA 1F3AA 4HS1A 3TB2A 5D73A 1B9XC 1ERWA 4MA9A 2J9HA 3RBTA 3TRPA 1XZOA 5FHIA 1RQMA 3HJMA 4WXTA 3P7XA 2GQLA 1YKAA 3F6FA 5L71A 4XRDA 1XW6A 5GAPD 6GSWA 3UIWA 3FEUA 3ERFA 1OE8A 2P31A 3EURA 3DRNA 2DJ0A 2WGRA 1UC7A 1M2BA 2VCQA 3EU3A 5D9XA 4ML1A 1TDIA 3QFBC 1NHOA 4EDYA 3IR4A 4G10A 5CP1A 1CQHA 5D9WA 4HOJA 3C1RA 1OC9B 5DDLA 2GSSA 1GSQA 3DXBA 3DEXA 3RPPA 2WZ9A 4ID0A 3ZFBA 3UEMA 3F4RA 1H75A 2I3YA 2LJAA 4NXIA 3L9UA 2PVQA 4WF5A 2VUPA 1WIKA 1YEXA 1XVWA 5B6NA 4LL4B 1F3BA 3EYTA 1XBSA 5D9TA 3VWXA 2IFQA 4YQUA 2GZPA 1HQOA 2LJKA 1HYUA 4GXZA 2MMZA 4EXJA 3EVIA 3I69A 4AJ8A 3GYKA 2A2SA 2M72A 4JRRA 1S3CA 2FA4A 1PSQA 3J7Yb 1SYRA 5FWGA 1GRXA 2NVLA 2VOCA 5IPHA 1TRWA 5ECKB 3U5RE 3WT2A 4FYCA 4IELA 3Q18A 1SK1A 1K3LA 3M8NA 4HJ2A 5B8AA 2YPMA 2L6CA 1GULA 2L4QA 2GVPA 3DD3A 2NPBA 3KP9A 4N0VA 2YJ7A 3UBLA 3ZRDA 2AB6A 3QCPA 5F05A 1M0UA 4GLTA 1FW1A 2O85A 2IYJA 1VF3A 4BL7A 2O87A 2X8CA 2JZRA 2L57A 2IFQB 2ALBA 2H0IA 4N30A 1QK8A 2CA8A 2DC5A 4LA1A 2H8LA 3H1NA 19GSA 2F9SA 5IMVA 3KXOA 1GSYA 4KDUA 1X5EA 2A4VA 3TGZA 1VF2A 3LQ7A 2R5GA 1FO5A 3KMOA 2KP1A 2VCVA 3HVVA 2JSYA 3BBYA 3QR6A 5A4VA 2IPAA 2CX4A 3HD5A 3GL3A 1N2AA 3I43A 5G2ZA 5IMCA 1M9BA 4QL7A 2YV7A 4PUAA 2JSZA 3Q19A 4D73B 3GIXA 5D93A 1FOVA 4FH8A 4CHSA 1O8XA 5B6MA 3QAGA 3APSA 1PQNA 5J3RA 2YP6A 5J9BA 1OE7A 1RK4A 1K3YA 14GSA 3ERWA 1SL0B 4ZIJA 2DMMA 1W89A 3VI7A 3KD0A 3NZNA 1K0DA 2H72A 4OCFA 2B3SA 3V1WA 1FAAA 3E0UA 4TW5A 1F6MC 3P2AA 1QFNA 1XWBA 2FWGA 3BJ5A 4K7OA 4FIWA 3UL3A 5B7CA 1Z6NA 3BOAA 11GSA 4HEA2 4IKHA 2PPTA 5G1LA 4HI7A 1W4VA 4RI7A 2AHEA 2XC2A 2VIMA 3UVTA 4BA7A 3PR8A 4X43A 5FT3A 2PN8A 2OKAA 5ELAA 2JZSA 2PERA 1GLPA 1ON4A 1ZL9A 3S9FA 2DBCA 3QD9A 4I2UA 4ZB8A 4L0WA 2WFCA 5AIVA 3H4KA 1G6WA 5G1KA 2GSRA 5ECOB 1SJZA 4AF2A 5GAND 5D9VA 2WJUA 2I9HA 3EWLA 1WPIA 1ACVA 2ZCTA 1WWJA 4ZBDA 3TCOA 4MPGA 1TI1A 5HFGA 3GL5A 1SENA 1YEPA 5ECMB 2YCDA 5AN1A 5ECHB 1ERTA 2DMLA 4POKA 4OCEA 4K9ZA 5LD0A 1VF4A 3IK9A 1WE0A 2E0QA 1EWXA 5GSSA 5ENUA 4I8BA 2LNTA 3M9JA 4OD7A 1M99A 5DQSA 3ZIVA 1MDIA 2L5LA 1ZZYA 3HA9A 4JZQA 1AQVA 5CNWA 3C7MA 1PL1A 2X8HA 4KE3A 4Q5FA 1GLQA 1FVJA 1TXXA 5CO3A 1FG4A 1T8EB 4NPBA 4TR0A 1AC1A 2YJHA 2R4VA 3TJJA 5CRWA 3F4TA 1OYJA 4N11A 3IDVA 4WR4A 3ZL5A 1A8LA 3DVWA 1SJ6A 2LUSA 1Y6EA 2N5AA 5F06A 2OE3A 5HR3A 4JEDA 3HVXA 1ZYEA 3TOTA 4AJ7A 1QUWA 2FLSA 2YZUA 4FO5A 2B1KA 5CAXA 5HQPA 1JZDA 4PQ1A 3ZMKA 2GT6A 2B5XA 2QKEA 3FR6A 5J4UA 4BPYA 4PUFC 1Z3EA 1TOFA 4L5OA 1WOUA 3EMXA 1BEDA 5EY6A 3GKKA 5H5SA 4KB3A 2K9FA 3CSJA 2F8AA 3TDGA 3F63A 2E7PA 2GSQA 3MSZA 1WMJA 1KNGA 1R5PA 4ML6A 2WRTA 4OFNA 2XPDA 2NBSA 2IY2A 1X5DA 3QAVA 4GQFA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1TTZ A;  4OWY A;  1LBK A;

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1V58A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations