1V58A

Crystal structure of the reduced protein disulfide bond isomerase dsbg
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
229
structure length
229
Chain Sequence
ELPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCPYCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the DsbG disulfide isomerase reveal an unstable disulfide
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Isomerase
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbG
total genus 64
structure length 229
sequence length 229
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1v58A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1v58A02
3L9UA 1JFUA 5G30A 1GL8A 2PBJA 2ON7A 1VF1A 2FHEA 2FD3A 2B1KA 1QK8A 4H86A 1Z3EA 1GNEA 2HZEA 1Y6EA 3LSZA 2WFCA 4OD7A 2L4QA 3HJMA 5LD0A 2Z9SA 5CRHA 3DRNA 1F3AA 3RHCA 2H1DA 1F9MA 4WR4A 1X9WB 1TRUA 5DDLA 2E7PA 3KTBA 3TJFA 4KW6A 3UVTA 1N2AA 3GA4A 5INYA 3DYRA 2FWHA 4TN8A 2N5AA 3FRCA 1NSWA 3U6VA 2GVPA 3WD6A 1FHEA 4DVCA 2YV7A 1J0FA 2H75A 3QMXA 1KTEA 4I2UA 3HVSA 1M2DA 4EDZA 3ED3A 1T00A 1G7OA 1PL1A 3TRQA 2BTOT 4WETA 2H66A 1ML6A 1N8JA 1SD9A 1BG5A 3CYNA 3UBKA 3DEXA 2FLSA 3IA1A 2L59A 2CT6A 1EOHA 3BCIA 3VK9A 3FYGA 3I6AA 4FYCA 1WOUA 4MDCA 4MMMA 4CHSA 2LNSA 1PA3A 1B4PA 1F6MC 3ERFA 1O85A 4GWRA 3MNGA 1HNBA 4MPFA 1BEDA 3GX0A 4I5QA 1ZMAA 4NHWA 3TCOA 2I81A 2F3MA 4XS4B 1IYHA 4Q5QA 3PGTA 4AJ7A 3M1GA 4KSMA 4J56E 1U3AA 2B1LA 4KCAA 2B7JA 3DVXA 4HJ2A 2VM2A 3FEUA 3HJPA 1BYEA 2MBTA 3P2AA 4ZBBA 2MBSA 2PGTA 1V57A 1Z6MA 4LMWA 2XPEA 4PNGA 3FHKA 4KB3A 4GCIA 2CVBA 5A4VA 2N5BA 3KM6A 4HZ4A 2MMNA 4ML1A 5ECRB 4WF5A 2GT6A 5KN0A 4MH3A 4PXOA 4Q5NA 3HKRA 2C80A 2RUEA 3C73A 3F8UA 1R7HA 4ZBAA 1A2MA 2V6KA 1M9AA 4XS6A 1XOBA 1XVWA 2HT9A 3QFBC 5JCGA 2P31A 3EU3A 4WR5A 1WPIA 4FYBA 2VL2A 4MJEA 4XIHA 5CRDA 3VWUA 2CQ9A 5ELAA 1NM3A 2H73A 3WYWA 1F3BA 5ECSA 2FA4A 4G19A 1FW1A 2XPDA 1AUCA 3DWVA 4F0CA 5DALA 4PUAA 2OACA 3UOMA 3IE3A 4XS4A 2F9SA 5ECPB 2R4VA 1XWAA 4POMA 1A8LA 4MZBA 4TRXA 5GAPD 1TU7A 2OBKA 1KEBA 2WRTA 5EVOA 1XIYA 4L5LA 4GSTA 2IY2A 2PWJA 3TKSC 2AB6A 1BX9A 4AF2A 2H19A 2HLSA 2NBSA 4HEA2 2DSAA 1TRWA 3LXTA 2XBQA 3GTUB 4D73B 3D5JA 3GKXA 4RUVA 4TR3A 4YH2A 4F9ZA 2JU5A 3G7IA 5DVBA 2LQQA 3TGZA 3GN3A 4LL4B 2O87A 3P7XA 3FKFA 3CRUA 3IR4A 3A2VA 2AAWA 2YNXA 3HZ8A 1IYIA 3SBCA 5KEJA 4MZCA 2KLXA 2PPTA 4OCEA 4IHUA 2WGRA 2A2SA 2AYTA 1VRSD 2V41A 2D2ZA 2B3SA 2X8GA 4KA0A 3D4MA 2LRNA 3L9VA 5H5SA 2M46A 2L57A 1XW6A 3LQ7A 1MDKA 4JU5A 1EGRA 5ECHB 4G10A 4E8EA 1SU9A 2VD0A 2VAFA 2DJ2A 1EGOA 1VF4A 2WB9A 5F06A 4GRFA 3IXRA 1V98A 2GGTA 2FWFA 1DSBA 1Z7RA 2B6MA 2YCDA 1AAZA 4JBBA 2P5RA 2N5FA 2IMDA 3M8NA 3H8QA 4HOJA 1K0OA 3TOTA 9GSSA 1HNAA 4EF0A 2IMFA 2NPBA 4TR0A 2JZTA 2X99A 3GTUA 5HFGA 1GTUA 2IFQB 2QKEA 4AJ8A 5DJLA 5DCGA 5JWQB 2GZYA 2IMKA 2HNLA 1J9BA 2ZUPA 3APSA 3VPQA 2YP6A 2HI7A 4PNFA 1MEKA 2OADA 2C0GA 3HY2A 2EIOA 1HNCA 4OFMA 4KNDA 4N10A 1H75A 3VPTA 4POLA 3VWXA 3FZ5A 4FH8A 3FW2A 3QD9A 4FYUA 2WJUA 14GSA 4ZIJA 2GS3A 3PR8A 1A23A 4NV2A 2B5EA 3FR3A 1F2EA 2VCQA 4MA9A 3FK8A 2VO4A 1F37A 2IWTA 2REMA 2VLTA 3IHQA 2AUVA 3RDWA 3QAVA 1K0BA 1WE0A 1G0TA 1GSFA 1QGVA 1DE2A 1QFNA 3GSSA 3L4NA 3HVXA 1TJDA 3QDNA 1EP8A 4L0UA 5B6MA 3IC4A 2HZEB 5J9CA 1I9DA 2WULA 3VURA 2ALBA 1B9YC 3EMXA 3DGQA 4ILFA 2R3XA 3H79A 5HFIA 4ZB9A 1SJIA 3QPMA 3EINA 5JCUA 1XCCA 4KDXA 2AV4A 1FOVA 3VFIA 2IMIA 19GSA 4IN0A 2LEGA 4RQXA 3VWVA 1ZZYA 2E2GA 2NTOA 2VIMA 5EPFA 1X5EA 3F4TA 4HQZA 5IMAA 6GSXA 4QL9A 2XC2A 1HYUA 2DMLA 4WXTA 3DVWA 3NOFA 2J9HA 3J7Yb 1U6TA 1EEJA 3C7MA 2HSYA 3D22A 4Q5RA 3HYPA 4PUFC 4NPBA 2YJHA 2BMXA 2GZZA 4ACSA 2C3NA 1XBSA 5L71A 1SYRA 4MP4A 2QSIA 1ILOA 3IK9A 3L78A 2L4CA 4ML6A 5ECKB 5DQSA 4QQ7A 1PKWA 2H0IA 4OFNA 1U3IA 1RW1A 3C71A 2L5LA 2IL3A 2DJ1A 3ZLPA 5D9TA 2R5GA 5AIVA 4TW5A 1WWJA 2I3YA 5ECMB 1GUKA 4MZWA 1YF0A 3UIWA 4MABA 1DUGA 1ON4A 4JRRA 5G31A 4XTSA 3F9UA 4J2FA 3F4RA 4TR4A 3GRXA 3LORA 2GTUA 1K0AA 2KHPA 2XHFA 4ZL7A 2TIRA 4TXOB 3EURA 3ZMLA 2LQOA 2E2MA 4K7NA 3CBUA 1OAZA 2WZ9A 4HS1A 2IPAA 3EC3A 5G2ZA 5HR3A 4Z7XA 5IO0A 4F0BA 1GTAA 3EYTA 3CTFA 2I1UA 3RBTA 3QOUA 1TP9A 1SL1B 2IMEA 4JE1A 4K9ZA 3S9FA 4K6XA 2FCHA 2O7KA 4N30A 3TUEA 3IPZA 2MZCA 1FVKA 1OC3A 3QAGA 3LEFA 1TK8B 3KTLA 1GWCA 2VD1A 1YF1A 4TXVA 5CO3A 3FR9A 3FY7A 4GQCA 2EC4A 5ABRA 3RPPA 1M7TA 1UC7A 2HXKA 4L5OA 5ECLB 1H4OA 4EE0A 2V1MA 5EL8A 3UMAA 4CDOA 1LU4A 3TJBA 5D9VA 1X9SB 2IIYA 2O8VB 1KBNA 3QAWA 3O76A 2LNTA 4K7OA 4LL1B 2VL9A 4JR4A 2VUPA 3KEBA 2YN1A 1YEXA 2A2RA 1NHOA 4KDUA 3APQA 3VLNA 3F3RA 3L9SA 3ZL5A 1S3DA 1W89A 1CQGA 1TRVA 2GQKA 2L6CA 1HD2A 4ID0A 4XS1A 4TXOA 3IAM2 2ZCTA 4MF6A 4IJ3A 4ECCA 1MTCA 3GKMA 3A2XA 1JZOA 3ZVJD 4I2TA 3GURA 3C1SA 2CA8A 3CXGA 3LFLA 1VGLA 5C04A 4L0WA 4RI6A 7GSSA 2H0GA 4HUAA 3CMIA 1XW5A 3F6DA 1GSYA 2RUFA 5E59A 1TTZA 5IIZA 1Y25A 1TOFA 4TR1B 3UL3A 5CRGA 2K8SA 1AIUA 3GFKA 3M9JA 1A0RP 1AQWA 1O73A 1ZYEA 2AHEA 1RQMA 1FB0A 3E0UA 3ZIVA 3KMNA 3IDVA 4IW9A 4ZL9A 3IK7A 1JZRA 5A4UA 5G5FA 3F3QA 4ECJA 3A3TA 3BOAA 3F4SA 3G9BA 1GTBA 4WBJA 1NHYA 3D6IA 4EDYA 1WIKA 1X0RA 2P0GA 1O8XA 12GSA 1GH2A 3US3A 1RK4A 2LSTA 4EXJA 1WRYA 5CP1A 4NMUA 3DXBA 5CAXA 1AQVA 4OWYA 2HRFA 3HD5A 4GXZA 5KN3A 4AGSA 1M2AA 5C00A 3GUSA 2L6DA 1B48A 3KXOA 2YWOA 2KP1A 1Q4JA 1R5PA 3CSJA 4O92A 3I69A 1TI3A 2DJJA 2K18A 1SD8A 2GSQA 4JEDA 1PL2A 5G5EA 4ZILA 2RM5A 4J57E 3TRPA 1XXUA 1E2YA 2O89A 3J7Yk 3Q19A 1E6BA 4TVEA 2OA7A 1AC1A 4MF7A 4BVYA 1PSQA 5JCWA 4WBRD 4V1Ag 1QMVA 2FNOA 1Z7PA 3VI5A 2LJRA 1WJKA 4NXIA 1TK5B 1GLQA 1O81A 5A4WA 3QR6A 2EIRA 1K3YA 3PH9A 1XWCA 2FUG2 1XWBA 6GSTA 3ZTLA 1Z6NA 4FIWA 3I9V2 6GSUA 1XZOA 2DJKA 1PX6A 2FWEA 4PQ1A 1GSDA 3P8WA 1PGTA 2B5YA 1AW9A 4WKWA 5D93A 2F8FA 1BAYA 4E8HA 5H5QA 2VL2C 3WT2A 3GL3A 1EV4A 3O6TA 1TI1A 5HR0A 4F82A 2K9FA 3MDKA 2VOCA 3DD3A 2H76A 3M3MA 4IVFA 3U5RE 5IMVA 1QUWA 4K0NA 2GQMA 1SJ6A 2FWGA 1X9MB 3E3EA 1ZYQB 4YAVA 1WP0A 2WDUA 4XCSA 2VL3A 1FB6A 5J3RA 4WF4A 4LMVA 1XFLA 3GYKA 3TDGA 5DQYA 5EY6A 1U87A 2H01A 3GSTA 3JCML 4BA7A 1FO5A 1A8YA 4PQIA 2VCWA 3WGDA 4ZXGA 2X8CA 4HJMA 3HJOA 4F2IA 3E9JB 4YAPA 2EIQA 1YDKA 1GNWA 2YWNA 4X1UA 1QQ2A 2I4AA 2H30A 3UBLA 2LUSA 3H4KA 1X5CA 2WS2A 2TRXA 2VCZA 2CX3A 1PRXA 2I9HA 4K1FA 3LYKA 4HU9A 5G1LA 4KSOA 3M9KA 1PMTA 1ST9A 2LKUA 5LNKe 1M9BA 3LG6A 5FWGA 2CVKA 4BPYA 2G2QA 1LJRA 2JACA 1R4WA 1B4QA 4OMVA 1ACVA 4XHMA 2B7KA 4V2NA 5IMZA 3C1RA 1TW9A 2OE3A 2DMMA 2PVOC 3Q6OA 3APOA 2YV9A 1NW2A 3VI7A 4X0XA 1YZXA 4O7HA 3UARA 3O3TA 1T4YA 2H1BA 3GMFA 22GSA 1PX7A 1MDJA 1GSSA 3UAPA 3FZ4A 1LBKA 3M0FA 4KUNA 1GUHA 2LS5A 1JZWA 3GX8A 3CSIA 5J4UA 4JZQA 3WGXA 1A24A 3LGCA 2VLVA 3NIVA 4EUYA 1GTIA 2K6VA 4MLYA 1YKAA 2JADA 3TJJA 5JWOB 3H1NA 1K0NA 1GLPA 2CZ3A 5AGYA 2KUCA 1FG4A 1R26A 2G0FA 1GUMA 1USBA 5F0GA 3KD0A 5J5NA 4MPGA 5AIXA 2TRCP 2YZHA 3CSHA 1PD21 3Q74A 1XWGA 3EMPA 2PN8A 2JL4A 3TOUA 3N9JA 2H70A 3KJYA 1GSQA 3EU4A 1K3OA 1TRSA 1ABAA 2H74A 2VLUA 4EL1A 1JHBA 4ECIA 1MDIA 3OR5A 2PU9C 1G6YA 1A2LA 1UN2A 1QXHA 3F0IA 3R2QA 3ZFLA 3DKSA 3LJRA 3MSZA 4PQHA 2LV3A 1PN9A 2GDRA 4RQRA 1SJZA 2H6ZA 5IOWA 4GSSA 1BJXA 2NDOA 4V2LA 5D9XA 3GHAA 2M80A 4IS0A 3K8NA 1T4ZA 2CAQA 4GF0A 5IOXA 4GQFA 2HYXA 13GSA 4GSNA 3F63A 1GSUA 5GAND 3HZ4A 2XBIA 4HQSA 4KCEA 4HI7A 1M2BA 1EV9A 3KMOA 4NAXA 4TR1A 2E0QA 5HR1A 2MMOA 3HVVA 3GL5A 1O7UA 3DMLA 3IRAA 2JZRA 3BCKA 4LA1A 1YEPA 2DJ0A 4DSSA 3SWLA 1V2AA 2OE0A 2BJXA 4EVMA 2CVDA 4KDYA 3D0ZA 2FY6A 2X64A 4IP6A 2IJYA 1G7EA 4IQAA 2R37A 4TOPA 1TDIA 1S3AA 1TXXA 3UVHA 1OKDA 3ZFBA 5GSTA 2VCXA 2H72A 2ZNMA 5DAKA 2LRCA 5CRWA 3AY8A 5ECOB 1CQHA 5B6NA 4RI7A 3RHBA 10GSA 2JZSA 4XRDA 4I8BA 5ID2B 2QC7A 4KAEA 1DBYA 2LTKA 4Q5FA 1T8EB 3GH6A 3TKQA 3D21A 6GSSA 4KE3A 4GTUA 3KP8A 4K8MA 2P5QA 1K3LA 1EEMA 1YQ1A 1FAAA 1DE1A 5A5KA 5AN1A 3GIXA 1T3BA 3HHVA 3I43A 2IN3A 5D73A 3GKKA 5J9BA 2KP2A 3KH7A 3G7YA 4POBA 1OC9A 4PURA 3EE2A 5IMFA 2PERA 2GLRA 3LWAA 4EKZA 1V40A 2KOKA 3ERGA 4X43A 1SK2A 3IOSA 2ES7A 1SL2B 1ERVA 4DSSB 8GSSA 1B8XA 1T1VA 6GSYA 1GRXA 4IKHA 3ME7A 3TRXA 1SYXA 2LJAA 3FZAA 4HZ2A 4N0VA 1G6WA 1JLWA 2C4JA 4WEYA 4K0GA 5DAKB 2M72A 5FHIA 4IELA 3ZREA 2R2JA 5D9WA 5B8AA 2VCVA 2CAIA 2F8AA 1TKDB 4DSQA 4MF5A 2HFDA 2H8LA 1M0UA 4V2MA 2YPMA 1OE7A 5ECNB 1ERUA 1ZL9A 2C3QA 3A2WA 4HU7A 2YWIA 5DJMA 1URMA 3MWHA 2YOIA 1MD4A 4L8EA 3WGEA 2HSHA 3ZVJA 3TKRA 3VWWA 2GSTA 4O5RA 3TJGA 1OC9B 1O8WA 2C0EA 1V58A 2LRTA 2OJLA 1TU8A 2HZFA 2IYJA 2ON5A 2CV4A 4V1Ap 2DC5A 3KH9A 5B8BA 3LXZA 4LLRA 5JWRB 5AISA 5KN1A 3A5WA 2VCTA 1EWXA 3IV4A 4YQUA 5E4WA 4HDEA 2RLIA 4MH2A 2C3TA 4BL7A 1OE8A 2DLXA 4KGIA 1A2JA 4OO5A 5ECIB 2FGXA 2A4VA 3RPNA 4N0ZA 1AXDA 3BJ5A 3F6FA 1Q98A 5FT3A 2R6KA 3P90A 2DIZA 6GSVA 6GSWA 1C72A 1OC8A 3IAS2 3ZITA 3TJKA 1S3CA 2JSZA 1XW9A 4I6XA 4F03A 1UA5A 1VF2A 3HDCA 3HA9A 2PUKC 4OO4A 2H1AA 3QFAC 5D96A 5IQYA 4OCFA 1K0CA 1O6JA 5HFKA 1XPVA 5IPHA 2OBIA 4BWSA 1ZOFA 1UVZA 5CREA 2FA8A 2QGVA 2YANA 3GH9A 1ERWA 4IP1A 3RAZA 1TK0B 3ZRDA 4QL7A 4EO3A 3IBHA 20GSA 3GKNA 4FO5A 5COHA 2MMAA 1EZKA 2C0FA 3HCZA 2RIIA 2GT5A 2GZPA 4ISDA 1JZDA 3BD2A 4G9HA 4YQVA 1XOAA 3WT1A 1HQOA 2B5XA 4OFTA 1XVQA 5CNWA 2RM6A 1I5GA 1GP1A 16GSA 3MAKA 4N11A 4G2EA 2MMZA 3KGKA 1YKCA 3KP9A 4POKA 3BBYA 3FZ9A 5IO2A 1J08A 2AJQB 2DJ3A 1U88A 4MCUA 3G7JA 4IQ1A 1ZCPA 3ME8A 4GLTA 4PGTA 5DALB 1JLVA 2WCIA 4EC0A 2YWMA 4K2DA 2LJKA 5IM9A 1B9XC 2GSRA 1SK1A 2V32A 4PX1A 1SL0B 2CX4A 4ECBA 1GULA 2K8VA 3LYPA 2DIYA 1ERTA 4KX4A 5B7CA 5ELGA 4NHZA 5F05A 4ZBDA 5G1KA 4K7IA 4D73A 2DBCA 4O32A 1SK0A 2HE3A 4ULXA 3W6GA 3ZMKA 4ZB8A 1OVNA 2H1GA 3UEMA 1GSEA 4ZB6A 1YY7A 3FR6A 3TB2A 5IPGA 1SENA 4CW9A 2X8HA 1THOA 1VF3A 2HRNA 2F51A 4KH7A 5D8IA 3PINA 4MK3A 4YQMA 3W8JA 5DCHA 5F07A 1XWKA 2H71A 2YJ7A 1AQXA 4BWQA 3CTGA 1W4VA 4ZL8A 4DEJA 2L5OA 1OYJA 4JR6A 3W8SA 4NV5A 1K0DA 5HQPA 1SKSB 3CRTA 5IMCA 3TKSE 3GV1A 1X5DA 3HXSA 2VM1A 3DIEA 4MJBA 2OE1A 3GNJA 2V6OA 1YJ6A 2OKAA 5ID2A 2JSYA 2H6YA 3C8EA 3H93A 3L0HA 3ZZXA 18GSA 2C8UA 3ZYWA 1OKTA 3N5OA 5KN2A 1WMJA 1A0FA 3QCPA 4AJ6A 2NVLA 1EP7A 4DSRA 3EWLA 3TKSA 4IJIA 1BQ7A 4P3YB 1T7PB 2C1YA 3ZIJA 4IBPA 5GZZB 1Z9HA 2PVQA 2PMTA 3NZNA 5ECQB 3KCMA 2IFQA 5GSSA 17GSA 5IMDA 3Q18A 3EVIA 1KNGA 2H0HA 5H5RA 3V1WA 1PQNA 2CZ2A 5J41A 2H6XA 2O85A 1V9WA 3ERWA 5DBQA 3KIJA 2MYGA 1THXA 2YZUA 5LCZA 1PKZA 3UJ1A 1MD3A 1EOGA 4MJCA 3ISOA 4XRAA 1ZGNA 4IGJA 3TKPA 4I97A 1R5AA 3D4TA 5ENUA 5HR2A 1M99A 2GQLA 11GSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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