1V58 | Genus

Total Genus 64

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	64
sequence length	229
structure length	229
Chain Sequence	ELPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCPYCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structures of the DsbG disulfide isomerase reveal an unstable disulfide pubmed doi rcsb
molecule keywords	Thiol:disulfide interchange protein dsbG
molecule tags	Isomerase
source organism	Escherichia coli
total genus	64
structure length	229
sequence length	229
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2003-11-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13098	Thioredoxin_2	Thioredoxin-like domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.450.70	Alpha Beta	Roll	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal	1v58A01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1v58A02

4JRRA 3K8NA 2RIIA 3TKSA 3ZFLA 1WJKA 4PQIA 3IK7A 2DJJA 2YNXA 4DVCA 3KP9A 2E2MA 2K8VA 4GQCA 4ULXA 6GSVA 1FW1A 5IQYA 1QUWA 3HVVA 4EE0A 2H6ZA 1KTEA 4QL7A 4G19A 2I1UA 12GSA 2VUPA 1PKWA 1YDKA 3ZREA 4RUVA 3J7Yb 4WBJA 3FY7A 3ZLPA 1SL0B 3QOUA 1GL8A 2I9HA 5EL8A 5ECOB 1O7UA 1XW5A 2LJAA 4DSRA 2OKAA 3EVIA 4MPGA 1B8XA 5IMVA 3EYTA 3QAVA 3EWLA 2C0DA 4HS1A 3KP8A 3PH9A 3KZQA 2REMA 2C8UA 1XZOA 14GSA 4IQ1A 1QK8A 4MDCA 4EL1A 3O6TA 3HYPA 4MF5A 5ID2B 4MK3A 3Q18A 3TRQA 3VI5A 5L71A 3QD9A 4ZIJA 4FO5A 5G30A 3KCMA 3F4RA 1ZYQB 2IMFA 1ERUA 4NAXA 4FYUA 1KBNA 5HR3A 1VRSD 2CX4A 1SD8A 1XW9A 2M80A 2VOCA 3KIJA 2WRTA 4ECBA 1GSFA 2AB6A 4I5QA 1GSEA 3P90A 4H86A 2FNOA 4KE3A 3OR5A 5G5EA 2H01A 2YWMA 3GTUB 1NHYA 4ZXGA 4G9HA 4HI7A 1BAYA 1X5CA 3UAPA 4E8EA 3C7MA 2LJRA 3IA1A 1TDIA 3C73A 3I43A 2JZRA 3M9KA 1SKSB 3VWUA 3M9JA 5CREA 2GS3A 2HZFA 3ZFBA 2H73A 2L6DA 5CAXA 4LL4B 4BPYA 4HU9A 2GSRA 5LCZA 2E7PA 1GUHA 2K8SA 5J9CA 3GV1A 2FGXA 2DJ2A 2WS2A 3ZVJD 2VLTA 4PNFA 2RLIA 1EEMA 2J23A 3BCKA 5KN3A 3ZIJA 2HSHA 2OA7A 5FWGA 3CTFA 3HDCA 3LYPA 2YP6A 2C3QA 2F9SA 1QGVA 2OE0A 2X8GA 4QL9A 1BG5A 4AF2A 1M2AA 3RDWA 1KNGA 4HZ4A 2NDOA 5ECPB 1Z5YE 3FZ4A 3HY2A 1R5PA 4J2FA 1I9DA 3CMIA 3ZYWA 1XXUA 2CVKA 4N30A 1ON4A 2F3MA 2ES7A 1FAAA 1Y6EA 3FHKA 2FA8A 3GH9A 3HJOA 4CHSA 1Y25A 1PD21 2I4AA 3BD2A 3G7YA 2EIOA 3O3TA 2ZNMA 2KUCA 2FA4A 3QR6A 2HRFA 5CYYA 3G7JA 2VLVA 5GSTA 2VCXA 4OCFA 1ZYEA 2N5BA 4RQXA 2R6KA 1VF1A 4EF0A 3QAGA 2O8VB 2C3TA 4KAEA 5HQPA 1BQ7A 5ECRB 3QMXA 1AIUA 2HE3A 3QFBC 3TRXA 5IO0A 2GDRA 3H8QA 2IMIA 2YPMA 3IAS2 2VLUA 1EOHA 4Q5FA 4HQZA 1TI1A 1K3YA 1UVZA 5F05A 5G1LA 1R4WA 3EINA 4XHMA 4G10A 3TJFA 3VPTA 3IRAA 3GL3A 2LSTA 4Q5RA 9GSSA 3BOAA 3IXRA 2LS5A 5H5SA 5IM9A 2VL9A 4LLRA 2VCZA 3LQ7A 3W6GA 3E3EA 1ERWA 4V1Ap 1YEXA 4WR5A 5GSSA 3FZAA 4TN8A 1XVWA 1O73A 5B8BA 4LMVA 5LD0A 3HJMA 3GYKA 2VO4A 4NPBA 2GSTA 1R7HA 1V57A 2L5LA 3GURA 3F4TA 4MF7A 4EDZA 4TVEA 1F3BA 5ECNB 1M7TA 3GKKA 1PN9A 3GIXA 4OD7A 1J0FA 6GSXA 1X9WB 2ON5A 4HZ2A 1GH2A 4TR1B 2P0GA 2JZSA 4HOJA 3CSIA 3CRUA 4N10A 3VI7A 1DBYA 3APSA 4GXZA 3I9V2 4F2IA 3KH7A 2H76A 1S3AA 3C71A 2H70A 5E59A 3LG6A 1FVKA 4IBPA 5JWQB 5ELGA 3C1RA 1RK4A 4KGIA 4OFNA 4LL1B 3SWLA 2G2QA 1OC8A 4IQAA 5IMZA 1K0OA 1Z7RA 4GF0A 1WRYA 1TK0B 2M72A 1TJDA 2K18A 3HZ8A 4XRAA 3TKQA 2DBCA 1IYIA 8GSSA 2MMAA 1FB0A 2H74A 3UVTA 3HZ4A 5HR2A 2IPAA 5HFGA 4I2UA 1GLPA 4JR4A 2H66A 4BWSA 5AN1A 2BTOT 3TJBA 5D8IA 1AXDA 19GSA 4WF4A 4F0BA 3FR3A 4ISDA 4KNDA 1YZXA 4POBA 3M1GA 2HNLA 4NXIA 6GSUA 3CYNA 4XCSA 2H1BA 1RW1A 1FO5A 1G7EA 1JZRA 4GSNA 4WEYA 2B1LA 1O8XA 1LJRA 1HQOA 1X5DA 3UJ1A 3F6FA 3MNGA 2A4VA 2F8AA 1F6MC 2EIQA 1HYUA 2H0IA 4MLYA 7GSSA 2QKEA 5G2ZA 3RPNA 3FZ9A 1GSDA 1GTUA 2AAWA 2H72A 3A2VA 1A0FA 5A4WA 3GRXA 4ZB6A 4KA0A 1Z6MA 2DC5A 4XTSA 5IO2A 5INYA 3BCIA 4XRDA 3GMFA 4IVFA 3A3TA 1O85A 3EE2A 3TGZA 3MSZA 1OC3A 1A23A 1JLVA 4MMMA 4DSSA 3L0HA 1TXXA 4K9ZA 1K0CA 1Z7PA 1A8LA 2PERA 3D5JA 4TRXA 1LU4A 2OE1A 2WFCA 2HYXA 1FVJA 3TJJA 1U3AA 5DJLA 2L6CA 1T3BA 3APQA 1A2LA 2MMOA 4MH3A 2PUKC 1JZOA 3LGCA 2CAIA 4ZBDA 4WF5A 2DSAA 4DEJA 5B6NA 4TR3A 3SBCA 5J9BA 1O6JA 1XOAA 3ZRDA 1NM3A 2LJKA 3ME8A 2OBKA 3IPZA 3CXGA 22GSA 1AQXA 2X8CA 4K0NA 3UBLA 2V41A 5DVBA 2QSIA 2CV4A 4O32A 2AHEA 2O7KA 4IJIA 3H4KA 2GQLA 4PQ1A 1SJIA 2JSZA 4GWRA 5IMCA 1PKZA 1PX7A 2HZEB 2YZUA 3GSTA 3WYWA 1WWJA 5JCGA 1PL2A 2NPBA 3EMPA 1TP9A 5ELAA 2MBTA 3TCOA 5F06A 1FOVA 2BJXA 3TB2A 2IFQB 1GULA 3DEXA 4XS1A 3GN3A 3S9FA 2PWJA 2TRXA 2PVOC 1Z3EA 1PL1A 1MD3A 1UA5A 1XW6A 3LXZA 5J4UA 1ILOA 3I6AA 5ABRA 4BL7A 5DJMA 2CVBA 1V40A 3LEFA 2FWHA 4JBBA 3FW2A 5JCWA 3D4MA 2V2GA 3W8SA 2KOKA 5HFKA 3P8WA 5GAPD 1X0RA 1T1VA 1GSSA 5FT3A 5C04A 1K0DA 1Z6NA 5DDLA 3VWWA 3MDKA 1X9MB 5ECHB 3GNJA 4MZBA 1G0TA 4MH2A 3LSZA 5HFIA 2PMTA 3UOMA 4WETA 2IY2A 2L57A 2HFDA 3IE3A 3ZMLA 1A0RP 2C4JA 4FYBA 2GSSA 2PVQA 3NIVA 1YY7A 2MMNA 4DSSB 1M2BA 2VL2C 3GUSA 3CBUA 3F63A 1PSQA 1U87A 4TKYA 2A2SA 3AY8A 2WGRA 2OADA 2XBQA 4KX4A 4K1FA 1GTIA 1URMA 3HCZA 1GTAA 1SL1B 5B8AA 1ZMAA 1GUMA 2HXKA 3L78A 3UEMA 5JWRB 3KEBA 4NHZA 5G5FA 1GTBA 3D4TA 3D6IA 2F51A 3FKFA 4ZB8A 4GTUA 4I8BA 4KH7A 3O76A 2LKUA 1B4PA 1GUKA 2XBIA 3F4SA 4J56E 4XIHA 2HI7A 2N5FA 2H8LA 4TR1A 4V1Ag 4XS4A 4Z7XA 2IMKA 3TKSC 5AGYA 3QAWA 5D96A 2NVLA 5ECKB 4N0VA 5F8BA 2IWTA 2H1DA 2GT5A 3EU4A 1V2AA 1WIKA 1PGTA 2TIRA 2V32A 1VF3A 4TXVA 3D22A 4POKA 3ED3A 3HVXA 5CRHA 4OMVA 1GSQA 2L4CA 2J9HA 3ZL5A 2DIZA 5A4UA 4I97A 2JACA 1USBA 4ZL7A 1AC1A 1V9WA 2GZPA 3TDGA 3BJ5A 5EVOA 2YWNA 2MBSA 5DQSA 4ZILA 4ZBAA 2XPDA 4K8MA 5ECQB 1V58A 3WGEA 2PN8A 2B5XA 5GZZB 1KEBA 3H93A 2EIRA 1RQMA 3C8EA 1F37A 4X1UA 4TOPA 3DXBA 1GRXA 1XWBA 4NWYA 3L4NA 5CO3A 2C1YA 1K0MA 2GGTA 2H6XA 4PXOA 3FYGA 5EPFA 5DAKB 5AIXA 4KSMA 1YKCA 5DQYA 4PX1A 1O81A 2GQMA 3GA4A 4YAVA 5F07A 2LEGA 4RI7A 2ALBA 4JR6A 1SL2B 1TKDB 1MDIA 2C0EA 1SYRA 4L5LA 2PU9C 5IPGA 2YZHA 2JSYA 1S3CA 2VD1A 3RAZA 1FG4A 1XWCA 4FIWA 2E0QA 2VIMA 3I69A 2L59A 2FUG2 1S3DA 1X5EA 1U88A 3DRNA 4MCUA 2RM6A 4AJ8A 1U3IA 4F9ZA 3NOFA 5AISA 1A2JA 3P2AA 3L9SA 1XCCA 3DMLA 3DVXA 3FEUA 1GNEA 4TXOB 4XS4B 4JZQA 1EGOA 2G0FA 4NV2A 3R2QA 1ACVA 2E2GA 2DJ3A 4K7OA 5JWOB 2YJ7A 4GRFA 4FH8A 4IKHA 2FWGA 1PMTA 4X43A 4IS0A 4OFTA 5H5QA 10GSA 2Z9SA 1TU7A 5DALB 3MAKA 3PGTA 2H30A 4JE1A 4PQHA 1SENA 4TR0A 4E8HA 1HD2A 2HZEA 2YWOA 4YAPA 3EC3A 2NBSA 3LWAA 1SKWB 3NZNA 1PA3A 2XC2A 4MJAA 1SD9A 4NHWA 3ZTLA 4JU5A 2IFQA 1DE2A 2XHFA 2PGTA 2WJUA 2H1AA 4HJ2A 3V1WA 5EY6A 4V2LA 4ML1A 4WBRD 5KN0A 3GKXA 3HJPA 1K0NA 3PINA 1A2MA 1AUCA 3A5WA 4YQUA 1K3LA 1JLWA 1NW2A 2HRNA 2YV9A 5LNKe 4ECIA 2R3XA 2GVPA 2V6KA 1SK0A 4BVXA 4WR4A 4OCEA 4LA1A 3F3QA 1EWXA 2WB9A 1WE0A 2IN3A 3RHBA 1EOGA 3ME7A 3KXOA 2RM5A 1C72A 4IGJA 5D73A 3LFLA 2GZYA 1GWCA 1R5AA 2DMLA 2MMZA 3KD0A 1CQHA 3IV4A 1XIYA 4HDEA 1OYJA 3CSHA 1DUGA 1TW9A 4HEA2 2N5AA 1DSBA 1BJXA 3ZZXA 3DYRA 2H6YA 1MDKA 2IIYA 4CDOA 2WCIA 4MP4A 2H0GA 3L9VA 1R26A 2O85A 4G2EA 1HNCA 4X0XA 3CSJA 1YEPA 1XFLA 3TUEA 5CRGA 3C1SA 3IBHA 2KP1A 4ML6A 1N8JA 3BBYA 2KHPA 4EO3A 4KCAA 6GSWA 1YF0A 1TRSA 3IK9A 2OBIA 17GSA 4MZWA 1A8YA 2H19A 4MPFA 4ECJA 3FR9A 3HKRA 2YCDA 2QGVA 2C3NA 2X64A 3Q6OA 5C00A 4O92A 2JL4A 3ZVJA 1TTZA 2D2ZA 1MTCA 4NV5A 1SK2A 1F9MA 3FRCA 1PRXA 4PGTA 2CT6A 2LQOA 4KW6A 4PUAA 18GSA 1THXA 2VD0A 3A2XA 1SJZA 4ID0A 2GTUA 5G1KA 5IOWA 1ZZYA 1MDJA 2FCHA 5HR1A 2CAQA 4ACSA 1MEKA 3KTLA 1F3AA 4RI6A 2CA8A 3UL3A 2B7JA 2EC4A 3TJKA 3H79A 3TRPA 2IJYA 2R4VA 4NMUA 1Z9HA 2JADA 4ZB9A 3DGQA 4L5OA 1MD4A 4PNGA 2O89A 1EZKA 1B4QA 3LJRA 3IR4A 3N9JA 4POMA 4MZCA 4DSQA 2CVDA 1SU9A 3KH9A 5G31A 2WDUA 3QPMA 2LNTA 3CTGA 3JCML 3LYKA 1I5GA 5AIVA 4IW9A 1SKRB 2PPTA 2H71A 1B48A 2P5QA 1IYHA 1T4ZA 1NHOA 3DD3A 4XS6A 1ERVA 2P5RA 4EUYA 2CQ9A 2AJQB 2MZCA 2VCVA 5KEJA 3ISOA 1WP0A 4KCEA 4GSSA 5IMDA 3KMNA 4POLA 2ZCTA 4D73B 2R5GA 2YOIA 2FLSA 3D21A 4FYCA 5D9XA 4K2DA 1EP8A 2V6OA 4HUAA 1JHBA 3DKSA 4HQSA 5B6MA 3F9UA 1PQNA 4AJ6A 1AQVA 3GSSA 3L9UA 5DAKA 1TOFA 3RHCA 1XBSA 1XOBA 3KJYA 2L4QA 3VWXA 3IDVA 3P7XA 4V2NA 2X99A 5ENUA 1QQ2A 5IMFA 2LQQA 1GLQA 3M0FA 3HA9A 2QC7A 2VL3A 2VM2A 4L8EA 5B7CA 2DJKA 2R37A 2B5YA 1TK8B 4OFMA 3Q19A 1QXHA 1Q98A 3PR8A 2I3YA 2LUSA 3KM6A 4WKWA 4L0UA 1OC9B 2ON7A 2IMDA 1ML6A 1B9YC 2P31A 3GHAA 1FHEA 1K0BA 3WGXA 3GX8A 1M0UA 2MYGA 1DE1A 2R2JA 1OKDA 11GSA 3TKPA 3FK8A 4KDYA 1TRWA 4F82A 4PUFC 4BA7A 2AV4A 1SYXA 4TXOA 2YWIA 1WMJA 2B7KA 2VM1A 4MA9A 1G6YA 3N5OA 4TR4A 3M8NA 1PX6A 1ZCPA 4JEDA 3U6VA 3J7Yk 1M9BA 3F3RA 4I2TA 3HD5A 1SK1A 2XPEA 5COHA 2AYTA 4MJBA 3QDNA 4WXTA 5DALA 2VCWA 5IMAA 2CX3A 4OO4A 3VLNA 5A4VA 1GSYA 4KDUA 4OWYA 4I6XA 2YN1A 3GH6A 1HNAA 2OACA 3ERWA 2WULA 1ABAA 3Q74A 4TW5A 4OO5A 2FWFA 1JZDA 5CP1A 1Q4JA 3FZ5A 2VCTA 3UVHA 1QFNA 2FHEA 4GCIA 1ZL9A 1EV4A 1K3OA 4N11A 4MABA 4QQ7A 20GSA 5J5NA 2V1MA 1XVQA 4P3YB 1A24A 4ECCA 2CZ3A 4EXJA 2LRNA 1EGRA 3D0ZA 5GAND 1QMVA 2DLXA 1WOUA 4F0CA 2VCQA 2H1GA 1ZGNA 2WZ9A 3VWVA 1O8WA 5ECLB 1XWKA 1JFUA 1TK5B 4IJ3A 3HVSA 1TI3A 2BMXA 4HJMA 1W4VA 1THOA 1YKAA 2CZ2A 4IELA 4BVYA 2LRTA 3KGKA 3F8UA 4KUNA 3G7IA 4K0GA 5KN2A 3WD6A 2OJLA 4IHUA 3APOA 2LRCA 1GP1A 2F8FA 4F03A 4N0ZA 1FB6A 4AJ7A 1AAZA 2HSYA 1YQ1A 3VURA 3U5RE 2FY6A 2K9FA 5D9VA 1OVNA 1VGLA 2RUFA 3QFAC 4MF6A 1J08A 4K7IA 3TOTA 1XWGA 2K6VA 1BEDA 3MWHA 5DCHA 2KLXA 2LV3A 2YANA 2GT6A 2HT9A 1T00A 1V98A 3EURA 5IOXA 4EDYA 2H75A 2B1KA 1W89A 4YQMA 2X8HA 4ZL8A 1OE8A 2KP2A 3E9JB 3EU3A 4KDXA 3TKSE 3UIWA 1BX9A 2GLRA 3VFIA 1H4OA 3H1NA 1YJ6A 1HNBA 2H0HA 4LMWA 4CW9A 1SJ6A 2M46A 4IP6A 4GQFA 2C80A 1E2YA 3ZIVA 2GQKA 1ST9A 1U6TA 3VK9A 4O5RA 3IAM2 5CNWA 1JZWA 3ERFA 5CRDA 5DCGA 5D93A 3KTBA 3VPQA 3GFKA 2C0GA 1EV9A 1VF4A 1G6WA 4PURA 2O87A 4BWQA 2VAFA 5ECMB 4ZBBA 3IC4A 3KMOA 4ILFA 2IMEA 4ZL9A 3ZITA 3CRTA 2AUVA 3GL5A 2LTKA 2B6MA 4EKZA 4O7HA 1AQWA 2YJHA 5J41A 5D9TA 3UBKA 1OE7A 2FWEA 1F2EA 2YV7A 3WGDA 2PBJA 3DWVA 2JU5A 1X9SB 5ECIB 2DIYA 1ZOFA 1G7OA 2DJ0A 2LNSA 2JZTA 1M9AA 3LXTA 4K6XA 3FR6A 3WT1A 2HLSA 1AW9A 2FD3A 3RBTA 4D73A 1K0AA 4EVMA 2NTOA 4RQRA 3TOUA 3HXSA 1N2AA 1M99A 5HR0A 3HHVA 5H5RA 2DMMA 1T8EB 2B3SA 3F0IA 3UMAA 4GLTA 6GSSA 6GSTA 5IIZA 1LBKA 5J3RA 3IOSA 2A2RA 2GZZA 3DIEA 1VF2A 1E6BA 2L5OA 3F6DA 1OAZA 1EEJA 5ECSA 4MJEA 1TRUA 4Q5QA 1GNWA 1BYEA 1TRVA 5ID2A 2B5EA 4IP1A 1TU8A 4Q5NA 3US3A 2C0FA 4GSTA 4YQVA 5D9WA 2OE3A 4MJCA 1ERTA 1UC7A 5DBQA 3E0UA 1OC9A 1XWAA 3GX0A 3ZMKA 4YH2A 13GSA 5IPHA 1H75A 2RUEA 3G9BA 4K7NA 3GTUA 2VL2A 1NSWA 3LORA 1EP7A 1UN2A 3QCPA 3M3MA 4KSOA 2IYJA 3UARA 1B9XC 1J9BA 3A2WA 1YF1A 1T4YA 3RPPA 3IHQA 3WT2A 3W8JA 3TKRA 2DJ1A 4V2MA 3TJGA 4L0WA 3EMXA 1WPIA 4AGSA 1XPVA 1OKTA 3GKNA 5CRWA 5KN1A 3DVWA 1CQGA 4J57E 1T7PB 3GKMA 4KB3A 16GSA 2GSQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1V58A

Total Genus

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations