The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
69
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structure length |
69
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Chain Sequence |
b'DDDDKKTNWLKRIYRVRPCVKCKVAPRNWKVKNKHLRIYNMCKTCFNNSIDIGDDTYHGHVDWLMYADS'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
ATP BINDING PROTEIN-D65V
|
| publication title |
Three-dimensional structures reveal multiple ADP/ATP binding modes for a synthetic class of artificial proteins.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Synthetic construct
|
| molecule tags |
De novo protein
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| total genus |
20
|
| structure length |
69
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| sequence length |
69
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-02-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, | Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3LT8 A; 3LTB A; 3LTC A; 1UW1 A; 3DGM A; 3LTD A; 2P05 A; 3DGL A; 3DGO A; 3LTA A; 3LT9 A; 2P0X A; 2P09 A; 3DGN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CME 3; 1TU5 A; 3EC9 A; 3CCQ 3; 1Z1S A; 3HX8 A; 1SAR A; 4HVN A; 1OHO A; 2XRX B; 6GSP A; 5KP1 A; 2ZDJ A; 1PFP A; 2CWU A; 1QAL A; 1EKM A; 1ASK A; 4Q53 A; 3CPW 2; 4AKZ A; 3HK4 A; 3AGO A; 1LNH A; 2L4V A; 2RBI A; 3EQQ B; 3LT9 A; 4QWT A; 3B4P A; 1BVI A; 2F4Y A; 1T2H A; 1B3S A; 3GSP A; 1RKY A; 1TRQ A; 4K90 B; 2K3D A; 3O8Y A; 1VQL 3; 3JUO A; 2OWP A; 3AHS A; 5BVB A; 1YIJ 3; 1AV4 A; 1GY7 A; 1SJW A; 1O7G B; 3ALA A; 2OQE A; 3MYT A; 3PS8 A; 2INX A; 1Q40 B; 2QA4 3; 1YNV X; 1BRK A; 4BTY A; 3JVC A; 2W56 A; 2O3O A; 1YJN 3; 1EQK A; 1VQ5 3; 1IVX A; 2HMM B; 3F8H A; 4XM4 A; 4KVH A; 2ZHX B; 1FYS A; 4XBT A; 5CLK A; 2QEX 3; 3CCM 3; 1I0V A; 1Q7Y 4; 5HGR A; 1DMM A; 3X42 A; 3OV4 A; 1I0X A; 2GXF A; 3KE7 A; 2JDI H; 5G1K A; 1QVF 2; 1RN7 A; 1SII A; 1UCK A; 1W2Z A; 3LH4 A; 1BRI A; 3K63 A; 2YFI B; 1NB3 I; 3G16 A; 3S28 A; 1OUN A; 1S72 3; 1JBR A; 2GEX A; 6STD A; 3SX1 A; 1O7H B; 5JPP A; 1EEJ A; 3EBY A; 4WYK B; 3G4S 3; 1RDS A; 8CHO A; 1UI7 A; 2BU4 A; 2E2V A; 1Q42 A; 1Q7H A; 3GZB A; 3Q2P A; 1K28 A; 2XH9 A; 4MMX B; 3WHO A; 3CC2 3; 1LOW A; 1BAN A; 4N6L A; 4KZ1 A; 3KSP A; 1UUW B; 4BTW A; 5BXQ A; 1IVU A; 5HOH A; 1BNF A; 1SPU A; 5LC7 A; 4K61 A; 5CF1 A; 2QGU A; 1E97 A; 4MMZ B; 1I2F A; 5LC6 A; 1I8V A; 1ULJ B; 3NV0 B; 5G1L A; 1TJD A; 4FR9 A; 1BAO A; 2KF5 A; 4XDW A; 2BMO B; 2CG0 A; 1G02 A; 1GMQ A; 4KFD A; 4X2H A; 1T2I A; 2J8X B; 2GEY A; 3KII A; 2F98 A; 5KP3 A; 1VZZ A; 4DKI A; 2LYX A; 1UI8 A; 4OK0 A; 5IER A; 4LSO A; 1GY6 A; 3U97 A; 4GL6 A; 5EEO A; 1FUW A; 5JPU A; 3LTA A; 3HZP A; 1LXE A; 2Z77 A; 3EJV A; 3X41 A; 1IU7 A; 1WNH A; 1I70 A; 2OTL 3; 1VQM 3; 3LYG A; 4AEQ A; 2KF6 A; 3BNC A; 2P05 A; 1GMR A; 3H3H A; 1W00 A; 1TIJ A; 1UCJ A; 2O9U X; 4ZM8 A; 1RGH A; 1GD4 A; 2XGN A; 3PXM A; 3CPO A; 2D1W A; 1UW1 A; 1VQ6 3; 1ROV A; 4G1M B; 4WWU C; 3KCH A; 2WOF A; 3CC7 3; 1DMN A; 1I3F A; 1JJ2 2; 3K0Z A; 1VQ9 3; 3CCS 3; 3BIR A; 2C11 A; 1YJW 3; 1NJI 4; 1K41 A; 2CX0 A; 2ML5 A; 3WDG B; 1RRL A; 4N6V 0; 5IG3 A; 3IMA B; 1DET A; 1I2E A; 2CFK A; 3G0K A; 1W2B 2; 4HYZ A; 3ROB A; 1OHS A; 1V57 A; 1M1X B; 2ML6 A; 1BUJ A; 1OCV A; 4L7K A; 3CNX A; 3UL5 A; 4LGQ A; 1R4C A; 4N6N B; 2CX1 A; 3AGN A; 3M8C A; 5D83 A; 1QAF A; 1STD A; 2C10 A; 2F99 A; 5AYR B; 4I4K A; 3DGO A; 3SXX A; 3UNL A; 5RNT A; 3F9S A; 1ZS7 A; 2QIY A; 2UX0 A; 1EG9 B; 3Q1C A; 1U5O A; 3VSY A; 1WQL B; 4CCV A; 3WA2 X; 1NWW A; 3S29 A; 2P0X A; 4HM0 B; 5IF6 A; 1VQO 3; 1B27 A; 2RGQ A; 5IEO A; 4BL2 A; 5IEP A; 2GU3 A; 3D9R A; 2FGT A; 3RDE A; 3CC4 3; 3CCV 3; 1RRH A; 4GB5 A; 2Z6B A; 1BSE A; 1YVS A; 5EVH A; 1ULI B; 1BNJ A; 1LOX A; 4R1K A; 9RNT A; 2KXG A; 2OTJ 3; 3D5I A; 3WOD G; 2RFR A; 1RN4 A; 5IG0 A; 3FF0 A; 1JB5 A; 1JN5 A; 2YFL B; 2K54 A; 1IQ8 A; 2CFL A; 5GSP A; 3CCJ 3; 1OH0 A; 3N9H A; 2W2C A; 1AY7 A; 3G71 3; 3NM2 A; 5TGN A; 1VQ4 3; 3HOH A; 3NXJ A; 3T8U A; 2XSO B; 1FA3 A; 2UUG C; 2Y74 A; 1BIR A; 2OQE C; 3FKA A; 4EW5 A; 2FXT A; 3X3X A; 7STD A; 3MG1 A; 3MPH A; 2BHM A; 3FH1 A; 4J9A A; 1IV9 A; 3LML A; 4FMB A; 1W6G A; 2BMQ B; 1CYU A; 3GZR A; 3JUN A; 5AI1 A; 5AII A; 3T8N A; 1JB4 A; 3PYJ A; 8RNT A; 1BRH A; 4XBX A; 3BLZ A; 3K5T A; 1YI2 3; 1JKG B; 1BRN L; 1A67 A; 4IIA A; 3OWU A; 3CU3 A; 1T3B A; 2HMN B; 3DMC A; 3I0Y A; 3CCU 3; 2W56 B; 3LZA A; 1MGR A; 1JKG A; 3NUV A; 1L5G B; 4HM4 B; 2XFT A; 5AYS C; 1VQP 3; 1IQX A; 1M9G A; 4WHA A; 1B20 A; 3QRD A; 1OF5 A; 3E99 A; 4N3V A; 1G96 A; 1FGQ A; 3FZW A; 1QMA A; 3NHX A; 3LTB A; 1BNS A; 4CDL A; 1BNR A; 1LOY A; 3URP A; 2M7O A; 2W9Q A; 2MF7 A; 4KFF A; 1ZGX A; 2P09 A; 1SIH A; 3EN8 A; 3NBB A; 4BL3 A; 1HU9 A; 4R9K A; 5A0O B; 7GSP A; 1MOL A; 2CK3 H; 4O8S A; 1LQM B; 1BRS A; 2W6J H; 3K7C A; 3KFQ C; 2CC3 A; 5FGO A; 3U1W A; 2XGL A; 3HI7 A; 3UJM A; 4HBR A; 1V58 A; 3FLJ A; 1W02 A; 1Y4K A; 3AHW A; 1R4Y A; 3MSO A; 2CHC A; 5AEW B; 2YFJ B; 1A2K A; 1LOV A; 2BIR A; 3X40 A; 3LTD A; 5AEU B; 2BO9 B; 2F86 B; 4LMI A; 5AIH A; 1NO3 A; 1OGX A; 2AAE A; 3K9M C; 1FGO A; 2Q07 A; 2KCD A; 4KT3 B; 1B2M A; 3SVA A; 2Z7A A; 2IY2 A; 1TUH A; 3GWR A; 5AIF A; 1DVD A; 4FMA A; 1BSD A; 3CNM A; 3MWZ A; 1MWU A; 1US1 A; 1GS3 A; 3MKI A; 3X3Y A; 1U8C B; 5CF2 A; 1AR0 A; 1GMP A; 3DM8 A; 3RGR A; 3ZG5 A; 1Q9E A; 1YJ9 3; 1BNE A; 5I97 A; 2F5W A; 4EYC A; 1FGT A; 4RBN A; 5D81 A; 1RJO A; 1M1K 4; 3MG2 A; 4EV5 A; 3WA3 A; 3MHE A; 4N6M A; 2CWV A; 1YIT 3; 3KSE D; 2RSX A; 1UDI I; 4LYL B; 2F5M A; 1OGZ A; 3NBJ A; 2YX9 A; 4OUQ A; 3WMD A; 2LQV A; 4L8O A; 1RGL A; 1X1X A; 3B7C A; 1IYY A; 3FSD A; 1GY5 A; 3DGL A; 3RGA A; 1RCL A; 1O7W B; 2KAA A; 4FCM A; 2D42 A; 3EHC A; 4HJL B; 1RGC A; 2XF3 A; 4J8T A; 2IUJ A; 3V98 A; 1JV2 B; 1N5H A; 2R4I A; 2IMJ A; 1IT7 A; 2E2T A; 4ILF A; 1JZD A; 1RGA A; 2IA7 A; 2HMK B; 7RNT A; 1IV7 A; 1EA2 A; 3CD6 3; 4O3V A; 3D79 A; 1JZO A; 1UUG B; 3LTC A; 3OX9 A; 4EBG A; 1OAC A; 1MGW A; 3DXO A; 1TFO A; 5IG4 A; 3VF1 A; 1QVG 2; 1E3R A; 3J7Y d; 1BU4 A; 3DZL A; 1EUI C; 3GRD A; 1YGE A; 4IT7 A; 1GOV A; 4K1V A; 2V1L A; 1JBT A; 5AIG A; 3CXC 2; 1KWI A; 1UCL A; 2OOV A; 2H0H A; 1I2G A; 2CIU A; 4HZB B; 1ZO2 A; 3FGY A; 1IK3 A; 4O2H A; 4RNY A; 1NU3 A; 3SED A; 1MWS A; 2CW9 A; 2E2U A; 3GZY B; 4NRE A; 3NBR A; 3SOA A; 4EXR A; 2CH9 A; 1OHP A; 1SQW A; 6RNT A; 1DYU A; 1ZX2 A; 1PYL A; 1VQK 3; 1B2S A; 1QJG A; 1BRG A; 2WGO A; 2C4B A; 4CPK A; 2Z76 A; 1RCK A; 5M1A A; 1G0T A; 3EBT A; 4XB5 A; 5CXO A; 1JN5 B; 1TP6 A; 5KP4 A; 3Q90 A; 1N5P A; 4AKY A; 3DGN A; 5M19 A; 1RGF A; 4JF8 A; 2ZL8 A; 5M18 A; 4J5G A; 1ROA A; 2FNQ A; 4JRF A; 5JBS A; 4EC6 A; 3BNB A; 3SOY A; 3A5E A; 1BRJ A; 3D4A A; 3L0R A; 1GOY A; 4LEH A; 3FCS B; 4N6O B; 1X1W A; 2P38 A; 1LRA A; 1UCI A; 2H0I A; 1IVW A; 4MEI A; 3EB8 A; 3F7X A; 1W6Y A; 2W0Q A; 4MJD A; 1JBS A; 4HKV B; 1FW7 A; 1W5Z A; 1UUV B; 1DVC A; 1RSN A; 3VGN A; 1F8N A; 1KQS 2; 1GYB A; 1VQQ A; 3AMO A; 3JUQ A; 3NQY A; 1TRP A; 4HAA A; 4KFE A; 2K0M A; 3KKG A; 4FMC A; 1LQG C; 5ELJ A; 1GSP A; 3MG3 A; 4N6T A; 2IYJ A; 1N8R 4; 1IQY A; 1MWR A; 3TDG A; 4GHO A; 3T0U A; 3LOY A; 1FUS A; 1OF5 B; 2PNC A; 1GOU A; 3N54 B; 3CCR 3; 1A90 A; 1RNT A; 1N8Q A; 3PZW A; 4EV2 A; 1Q81 4; 3CCE 3; 1YHQ 3; 1K73 4; 4HM2 B; 2CFW A; 3IPT A; 3N8B A; 2R41 A; 4PEJ A; 4U13 A; 4R4K A; 1CQS A; 1DE3 A; 1LVN A; 4HZ9 B; 4X2O A; 2XFS A; 1O7M B; 3F7S A; 1N9E A; 3B4O A; 3BND A; 1STF I; 2KF3 A; 4FCJ A; 2HML B; 5DRE A; 3I55 3; 1KD1 4; 1NDO B; 2XSH B; 3KN4 A; 1VQ7 3; 1UGH I; 3SYU A; 1BNG A; 1O7P B; 4FCZ A; 2GU1 A; 5G2G A; 1KC8 4; 4HM8 B; 1MNL A; 2MC8 A; 2KF4 A; 1B2U A; 3WR2 A; 4HM6 B; 3H51 A; 1KSI A; 1AQZ A; 1Q40 A; 3HII A; 4ORL A; 1RMS A; 1TTO A; 4HM7 B; 3F8X A; 3RNT A; 2BNG A; 1CEW I; 1RLS A; 5IG5 A; 3NQZ A; 3OWY A; 3B8L A; 1A2P A; 3SLU A; 4RZM A; 3LT8 A; 1FGM A; 2OCT A; 4IPB A; 1X1Y A; 2WGQ A; 1UGI A; 2ZA4 A; 3BNE A; 5D82 A; 3KZT A; 3A76 A; 1HZ1 A; 3PGB A; 3ER7 A; 1E3V A; 3ECF A; 3S27 A; 1VQN 3; 1J2B A; 1RHL A; 4XDV A; 4FMD A; 1HYF A; 2XEP A; 4O02 B; 1B21 A; 3UL6 A; 3G6E 3; 1NB5 I; 3CMA 3; 2GBX B; 5DRV A; 3S5C A; 1BSA A; 3STD A; 4K1U A; 1V74 A; 5BU4 A; 1K9M 4; 3OW2 2; 1N9J A; 1FGR A; 2RCD A; 3Q3F A; 1C54 A; 3PCR A; 4WYK A; 2SAR A; 3WOE B; 2CWT A; 2GSP A; 1RGE A; 1TFK A; 1IT8 A; 1W4N A; 1W01 A; 1IDP A; 3ZFZ A; 3DH2 A; 2CKF B; 3EN1 B; 1MWT A; 3OXA A; 4TX4 A; 1M90 4; 2CG1 A; 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5EQL A; 3D5G A; 4HM3 B; 1Q86 4; 1JB2 A; 2P0M A; 1QAK A; 4BIR A; 1W6C A; 1C7H A; 1WMP A; 2HOH A; 5CK6 A; 3I56 3; 1RNB A; 5BIR A; 4STD A; 3BU4 A; 1LNI A; 1PU4 A; 4WP5 A; 1BSB A; 4R80 A; 1BSC A; 2HMO B; 1RGG A; 3AMO B; 1JRQ A; 4WFO A; 3UB1 A; 5ELU A; 3FG1 A; 4RNT A; 1D6Y A; 3WOF B; 4H3U A; 1IVV A; 3DUK A; 2B24 B; 1T5Y A; #chains in the Genus database with same CATH homology 3CME 3; 1TU5 A; 3EC9 A; 3CCQ 3; 1Z1S A; 3HX8 A; 4HVN A; 1OHO A; 2XRX B; 5KP1 A; 2ZDJ A; 1PFP A; 2CWU A; 1QAL A; 1EKM A; 1ASK A; 4Q53 A; 3CPW 2; 4AKZ A; 3HK4 A; 1LNH A; 2L4V A; 3EQQ B; 3LT9 A; 4QWT A; 3B4P A; 1RKY A; 4K90 B; 3O8Y A; 1VQL 3; 3JUO A; 2OWP A; 5BVB A; 1YIJ 3; 1AV4 A; 1GY7 A; 1SJW A; 1O7G B; 3ALA A; 2OQE A; 3MYT A; 3PS8 A; 2INX A; 1Q40 B; 2QA4 3; 4BTY A; 3JVC A; 2W56 A; 2O3O A; 1YJN 3; 1EQK A; 1VQ5 3; 1IVX A; 2HMM B; 3F8H A; 4XM4 A; 4KVH A; 5CLK A; 2QEX 3; 4XBT A; 3CCM 3; 1Q7Y 4; 5HGR A; 1DMM A; 3X42 A; 3OV4 A; 2GXF A; 3KE7 A; 1QVF 2; 2JDI H; 1RN7 A; 1SII A; 1W2Z A; 3LH4 A; 3K63 A; 2YFI B; 1NB3 I; 3G16 A; 3S28 A; 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