1TJD | Genus

Total Genus 70

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	70
sequence length	216
structure length	216
Chain Sequence	DDAAIQQTLAKMGIKSSDIQPAPVAGMKTVLTNSGVLYITDDGKHIIQGPMYDVSGTAPVNVTNKMLLKQLNALEKEMIVYKAPQEKHVITVFTDITCGYCHKLHEQMADYNALGITVRYLAFPRQGLDSDAEKEMKAIWCAKDKNKAFDDVMAGKSVAPASCDVDIADHYALGVQLGVSGTPAVVLSNGTLVPGYQPPKEMKEFLDEHQKMTSGK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	Thiol:disulfide interchange protein dsbC
publication title	Structure of the reduced disulfide-bond isomerase DsbC from Escherichia coli. pubmed doi rcsb
source organism	Escherichia coli
molecule tags	Isomerase
total genus	70
structure length	216
sequence length	216
ec nomenclature	ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date	2004-06-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF10411	DsbC_N	Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A	PF13098	Thioredoxin_2	Thioredoxin-like domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.450.70	Alpha Beta	Roll	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal	1tjdA01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1tjdA02

1GRXA 4YAVA 2C0FA 2KHPA 3EC3A 4DSRA 1DBYA 1Z7RA 2MBTA 4EVMA 3LEFA 2H01A 5KN1A 3KXOA 5J41A 1OKDA 4WKWA 1O8WA 4LLRA 4K9ZA 1K0CA 2JU5A 4XS6A 2LTKA 1AC1A 4N0ZA 2DJJA 5IO0A 3UBLA 1ZCPA 2L59A 1J0FA 2DMLA 1JLVA 1K0BA 1BJXA 3G7IA 3FK8A 4JR6A 6GSXA 2H71A 5F06A 1MTCA 2DIYA 1NSWA 5EPFA 2CVDA 3HHVA 3H1NA 3BCIA 1G7EA 5ECQB 1J9BA 2HSYA 2CX4A 1YDKA 3CSJA 1R5PA 1GTBA 1UVZA 5A4WA 1JZRA 2VLUA 4KCEA 3GTUA 4ZBDA 5F0GA 3VPQA 3VLNA 1MEKA 5F07A 4MA9A 1MDIA 3TRPA 4ZIJA 1UN2A 1ZL9A 5B7CA 3KTBA 2P5RA 3FEUA 2H76A 2LRNA 1AUCA 3ZIJA 1R5AA 3HZ8A 2FLSA 3TUEA 6GSVA 4AF2A 3GFKA 2MYGA 3IA1A 2NPBA 3UARA 1XZOA 3UOMA 1M2AA 3IHQA 2V32A 2B5YA 5FT3A 3I6AA 1PD21 1DE1A 3MDKA 4MF7A 2DJ1A 2CZ2A 4Q5FA 2ON5A 3E3EA 3DGQA 2PUKC 4PNGA 1T1VA 1SK1A 1XVQA 4HDEA 1NHOA 3VI5A 2YWMA 2BJXA 3KGKA 4LL1B 2YWOA 1G6WA 4MH2A 1BG5A 1GSEA 2O7KA 2E0QA 5IPGA 2DLXA 3DMLA 3ZZXA 4XRDA 2MMZA 1KTEA 2WFCA 1EP8A 2IN3A 2H1AA 1V2AA 3TKSC 2RM5A 1ERVA 3Q6OA 4WBJA 5CRHA 8GSSA 1VRSD 5AISA 4V1Ap 5HR2A 4L0WA 2MZCA 4KUNA 1HQOA 1FB0A 3VK9A 5B6MA 3C1SA 3ME7A 5ECOB 4NWYA 4TVEA 3GX0A 1AIUA 5A4UA 3D0ZA 1M99A 2AHEA 5ID2B 2IYJA 1OC9B 4PUAA 4K0NA 5DAKB 1V58A 1X0RA 3LFLA 2OA7A 1RW1A 3HJPA 1C72A 1RK4A 4YAPA 2RLIA 2WS2A 5ECKB 2H8LA 5G5EA 3HCZA 4TXOB 3QAWA 4K7OA 2LNTA 1TK8B 1RQMA 1B9XC 4MABA 3BBYA 5G30A 2MMNA 3KZQA 1YKAA 3QFBC 2JADA 3CSHA 2H1DA 4KX4A 4HZ4A 6GSYA 1X9WB 3HJMA 4J56E 2VCTA 2C0DA 1FB6A 3L78A 2HZFA 4L0UA 2XPDA 4MJBA 2VLVA 3KMNA 4MPFA 1K0DA 4XS1A 2X99A 3KH7A 1USBA 2N5BA 1O85A 1OC8A 5JWQB 2TRXA 3GMFA 1GL8A 3G7YA 1Z9HA 2C3TA 4XS4A 2GSRA 1F9MA 3ERGA 1TDIA 3GH9A 3BOAA 1XWGA 5G1KA 1GUHA 4OFTA 2VIMA 2CVBA 2IFQA 2BMXA 4KSOA 2L4QA 2X8HA 3FKFA 5D96A 1A2JA 1JLWA 2TIRA 3ZIVA 1PKWA 2FWHA 3LORA 20GSA 5ENUA 1G0TA 5DALA 1E6BA 3IV4A 4G19A 2K18A 2V2GA 3FRCA 4WXTA 1AQWA 3A5WA 5G5FA 1GSSA 2N5AA 4N11A 2C8UA 3HZ4A 1EV4A 4FO5A 5KN0A 2L6CA 3FZ5A 5J9CA 3U5RE 1B4QA 2IMEA 2I81A 1V57A 3FYGA 4EL1A 5FWGA 3TJJA 3ZLPA 2IMDA 3F4RA 3LGCA 2DBCA 1BYEA 3EU4A 4KNDA 2L4CA 2V6OA 2YV7A 1TRWA 3ZREA 3CYNA 2GTUA 3F4SA 1FVKA 1QQ2A 3C71A 1DSBA 1PL1A 2FWEA 3WGXA 2C80A 3P2AA 4EXJA 3EINA 2XC2A 1XVWA 4FYCA 1M2BA 2GZPA 5CRDA 1TU8A 5JCUA 3QAVA 3PH9A 3EURA 1QGVA 2C3QA 2YJ7A 1CQGA 1PN9A 2YP6A 2LQOA 4NV2A 3V1WA 4F2IA 5AIVA 2B1LA 4OO5A 3DVWA 2PWJA 1BX9A 3D6IA 1PMTA 4OCEA 3J7Yb 2L5LA 2V6KA 3G7JA 2KLXA 4IBPA 4IJIA 5CAXA 2CAQA 4POBA 3EMXA 4J57E 4HQSA 2KOKA 1LJRA 1SENA 4WR4A 3NOFA 1YY7A 3TGZA 1YJ6A 1Z5YE 2O85A 4XTSA 1MD3A 1GSUA 3RHBA 3TKPA 2F9SA 3Q74A 1T3BA 3ZYWA 2AAWA 4IKHA 1Y6EA 4F9ZA 5L71A 3RHCA 4ECJA 3CMIA 1MDJA 1V40A 5INYA 4ECIA 3VURA 1YZXA 3LYPA 5F8BA 3M9JA 5D9XA 1GSFA 4L8EA 1A8YA 2CZ3A 4POLA 2B5EA 1UA5A 2K6VA 4BA7A 2VM1A 5F05A 2YN1A 1QMVA 1ACVA 2DJKA 2H75A 4BWSA 1ZZYA 3ZMLA 3C1RA 2H1GA 5GAPD 1FO5A 2VLTA 4GTUA 5HR1A 2GSSA 3FY7A 4P3YB 3CSIA 5A5KA 2PMTA 1Z3EA 1EZKA 3GKMA 4KW6A 3F4TA 1M2DA 1FVJA 4EE0A 2H0GA 2VCVA 1ERTA 3HA9A 3AY8A 4GF0A 2WB9A 4KE3A 4HJ2A 3LJRA 3IR4A 4K0GA 2PVQA 6GSUA 1TRUA 4WF5A 4IELA 3C73A 3I69A 1GP1A 2IL3A 5H5SA 3KTLA 2RUEA 1TI1A 3O3TA 1X9SB 1YKCA 2WZ9A 3KD0A 3APSA 2I9HA 1EGOA 1WE0A 2HI7A 1T7PB 4PGTA 3NIVA 1PA3A 3FR6A 4NHZA 2HRNA 4QQ7A 1OE8A 2VL2A 10GSA 2X8GA 3H4KA 1U87A 4K6XA 3WT1A 4K1FA 1T00A 4N0VA 1R4WA 5IPHA 5DVBA 3GV1A 5CRGA 2XPEA 1S3AA 3F9UA 3GUSA 1AXDA 5KEJA 3Q18A 3F3QA 3G9BA 3N9JA 4HU7A 3L9SA 1X5DA 2PGTA 4ZILA 4IS0A 4FYBA 5DQYA 5HFGA 2VL3A 3OR5A 3QFAC 3R2QA 2A2SA 3IAS2 1SD9A 2O87A 4MF6A 2GT5A 3ZFBA 3KIJA 1WPIA 1YEXA 1O7UA 1ST9A 1GH2A 1Q4JA 2DSAA 3TRXA 1AW9A 3ME8A 5D8IA 1SK2A 3CXGA 3US3A 4EF0A 4JRRA 1SJIA 2FGXA 2KP2A 1TU7A 1ZYQB 4TR0A 3FZ4A 3LXTA 4PQHA 3KJYA 2ZCTA 3DXBA 3A2XA 4YQVA 1ABAA 4ZL7A 3GH6A 5IMAA 2VAFA 2JZTA 3ZTLA 5IO2A 4MK3A 5DJLA 2REMA 3GA4A 16GSA 3TOTA 1GTUA 2CX3A 6GSWA 3DEXA 4MCUA 4JZQA 3TKQA 1GNEA 2VCXA 2IMKA 3U6VA 1EOHA 4MDCA 3ZL5A 4AJ6A 3TJBA 2X8CA 4MP4A 3FHKA 4GCIA 5LNKe 1PGTA 2ZNMA 2RIIA 4OO4A 4GSNA 3TRQA 2YWIA 3QOUA 1GLQA 4YH2A 2HSHA 3PINA 1THXA 2CVKA 13GSA 1PX6A 1S3CA 3EMPA 1V9WA 3D4MA 1ZGNA 3J7Yk 2LS5A 2GS3A 3APQA 1JZWA 4MJAA 2YZHA 2N5FA 4MLYA 2OACA 4HU9A 4TR4A 1TW9A 1X9MB 5D73A 2ZUPA 6GSTA 1SK0A 2WULA 4AGSA 4F0BA 3UJ1A 2K9FA 4ZB6A 3DYRA 3VFIA 2MBSA 3H79A 2RUFA 1SJ6A 1F6MC 4I6XA 4WR5A 5J9BA 1G6YA 1NW2A 1ML6A 3IE3A 3LXZA 4RQXA 1TK0B 14GSA 2C4JA 4GRFA 4PURA 3UEMA 1SYXA 4EDZA 1GSYA 5CRWA 1JFUA 1BEDA 4WEYA 4PQ1A 2G2QA 3QDNA 4ZBBA 2WDUA 5HQPA 3IK9A 2PBJA 4Q5NA 1B9YC 5KN3A 2GGTA 2LNSA 4BVXA 5D9VA 3N5OA 2F8AA 5IOXA 1GNWA 4HQZA 1A23A 5H5RA 2EIOA 3D4TA 4RI6A 2PVOC 5J4UA 5DALB 3EE2A 4IP1A 3W8JA 2HRFA 2B5XA 2P0GA 5ID2A 3WGEA 3KMOA 3FW2A 1OC9A 3GSTA 5DAKA 4G2EA 2TRCP 2LSTA 3F3RA 5E4WA 2J9HA 1W4VA 3P90A 3TJFA 1SKSB 1K0AA 1U3IA 2NBSA 3FZ9A 3ZVJA 1OAZA 1EWXA 3BJ5A 3KM6A 2LEGA 4TXOA 2OBIA 3ED3A 2IWTA 1TXXA 5JWOB 2WGRA 2V1MA 4K7IA 4POMA 4PQIA 3GKKA 2B6MA 1EP7A 5AIXA 4DSQA 3D21A 3SBCA 1A0RP 4NPBA 1ZOFA 4FYUA 2O8VB 5ECMB 2H6XA 2R37A 3APOA 1YQ1A 1GLPA 2XBQA 4CDOA 1XWCA 4GLTA 2LRCA 3WD6A 5IMVA 1SJZA 3A2WA 4EUYA 1XCCA 2OADA 3Q19A 2HNLA 1O8XA 5IOWA 2IPAA 2VUPA 4L5LA 4F0CA 2FA8A 2L57A 3GL3A 4DVCA 3P8WA 4HS1A 3H8QA 3EYTA 2E2GA 4D73A 4WF4A 3VPTA 2MMAA 2HYXA 4DEJA 4FH8A 4MPGA 5DBQA 4IJ3A 5GAND 2PERA 1AQXA 3TKRA 2FD3A 4MZWA 1QUWA 2JL4A 4HUAA 3KP8A 5JCWA 2LJRA 1SL1B 2E7PA 1SYRA 1M9AA 4ZBAA 2OBKA 1HD2A 7GSSA 3TB2A 4IVFA 1OC3A 2GSQA 2PN8A 4TR1A 1TP9A 3CTGA 1I9DA 1N2AA 3IAM2 4F03A 2GZZA 4KA0A 3QD9A 3RAZA 3EWLA 9GSSA 2H73A 1B8XA 4G10A 4I2TA 2MMOA 5ELAA 1Z6NA 2OE1A 1KEBA 3UAPA 2IY2A 2KUCA 3RPPA 1H4OA 4HEA2 2BTOT 3RBTA 3FR9A 2FNOA 5HR3A 2C1YA 2H66A 1FAAA 5C04A 5DJMA 1W89A 4EDYA 2Z9SA 2B1KA 2M80A 3HXSA 2CT6A 5ECPB 1XFLA 5CREA 2DJ3A 4AJ8A 4PUFC 3HY2A 2AJQB 3HVXA 4ACSA 4JU5A 4RI7A 1PSQA 1GUKA 3RPNA 2YV9A 3PR8A 4YQMA 2L6DA 1KBNA 3MWHA 2YWNA 5G2ZA 1VGLA 3E0UA 1JHBA 4V1Ag 1SL0B 1GUMA 4GWRA 2LRTA 4TXVA 3A3TA 2AYTA 1XWAA 2YANA 1NHYA 2EIRA 1XXUA 5AN1A 5HFIA 3QMXA 3RDWA 3ZMKA 3LWAA 5GSTA 3TDGA 2OE0A 4KH7A 3M1GA 1T4ZA 1U88A 1X5EA 2FWGA 5ECRB 4ZXGA 1R26A 2I3YA 4JBBA 3I9V2 4XHMA 3A2VA 1HYUA 2VCZA 1SKWB 1XIYA 2FY6A 4HI7A 2VD0A 3DKSA 2JZSA 1HNAA 3W8SA 1I5GA 1GWCA 2PPTA 11GSA 1WIKA 1A0FA 1T8EB 4K7NA 2L5OA 4N10A 3BD2A 4HZ2A 2YOIA 4ULXA 5JCGA 3PGTA 1J08A 2VM2A 3DRNA 1Q98A 3ZITA 1M9BA 2CA8A 2WCIA 2YJHA 4ISDA 2H0HA 4ZL8A 1XWBA 5LCZA 1T4YA 3IRAA 3I43A 4OD7A 4WETA 1H75A 2QKEA 3GX8A 2B7KA 1MD4A 1EEJA 2EC4A 5GZZB 4E8HA 5EY6A 1TKDB 1M0UA 1DUGA 3M8NA 3GTUB 3C7MA 4E8EA 1QFNA 5EL8A 3L9VA 2GQKA 4XIHA 3O76A 2X64A 1AQVA 1B48A 2IMIA 1K3OA 4DSSA 1VF1A 4GQCA 3IXRA 5JWRB 1Y25A 1O6JA 2WJUA 3WGDA 2EIQA 4O92A 5AGYA 1EGRA 4IQ1A 2HZEA 4PXOA 4EO3A 5ECNB 1HNBA 4KAEA 4KGIA 3F6FA 1K0OA 3ISOA 1TRSA 4X1UA 3SWLA 2R4VA 4KB3A 2E2MA 4PNFA 2GT6A 4LMVA 2VOCA 1IYIA 4I5QA 4MJEA 4O7HA 4XCSA 1QXHA 4HJMA 3VWUA 4KCAA 4IW9A 4TN8A 1F3BA 2A2RA 3GKXA 1AAZA 3F0IA 4O32A 1TRVA 2M72A 4TKYA 1GULA 4BPYA 3NZNA 1Z6MA 3DVXA 2CV4A 3VWXA 2FUG2 2R6KA 1TTZA 4X0XA 3GURA 5J5NA 4JEDA 5ABRA 2H0IA 22GSA 5IMFA 3KEBA 3GRXA 1S3DA 4FIWA 4MH3A 2K8SA 1F37A 4ILFA 2HFDA 1WRYA 1Z7PA 1LBKA 2GQLA 2JSYA 2XBIA 2GLRA 2QSIA 3F63A 2HLSA 4HOJA 5ECHB 1V98A 4KDUA 1URMA 1A24A 5IM9A 3HYPA 6GSSA 2C3NA 2G0FA 2H70A 4ZB9A 3HKRA 5COHA 4QL9A 5CP1A 1WJKA 1TOFA 3L0HA 1MDKA 5ECLB 2M46A 5ELGA 4V2MA 5CO3A 3IK7A 4IGJA 1ZMAA 5G1LA 4LA1A 4EC0A 1FOVA 2ALBA 4NXIA 3GN3A 5D93A 3CRUA 5EVOA 1F2EA 2V41A 4I97A 2AB6A 4GXZA 1UC7A 2GZYA 2VD1A 3S9FA 4OFMA 2H6ZA 3C8EA 1OKTA 2PU9C 4NAXA 4ECCA 2R5GA 3LQ7A 2VO4A 3GSSA 2GSTA 3CTFA 2H72A 2CAIA 1FG4A 3K8NA 4BVYA 5B6NA 4RUVA 1YF0A 1JZDA 2VL9A 2XHFA 1XPVA 4TRXA 4TW5A 4QL7A 4OCFA 4K8MA 1GTIA 5CYYA 4KDXA 1OE7A 1THOA 5IQYA 5E59A 4ML1A 1M7TA 3QCPA 2DMMA 2YZUA 1PL2A 2O89A 1XW6A 1TI3A 2GQMA 3HVVA 5CNWA 4XS4B 3UIWA 3D5JA 3F6DA 3HDCA 2DC5A 4WBRD 4AJ7A 4NHWA 4ZB8A 1KNGA 2A4VA 3FR3A 4IN0A 1LU4A 2NVLA 4POKA 4GSSA 4MF5A 1EV9A 4V2NA 2KP1A 2IFQB 3ZFLA 1O73A 3IPZA 1XW5A 1GSQA 1PRXA 2WRTA 4I8BA 4OWYA 3TJGA 4BL7A 5IMCA 1ON4A 4G9HA 3GIXA 1N8JA 1JZOA 4TOPA 1OVNA 5A4VA 3UMAA 1A8LA 2RM6A 1ZYEA 1F3AA 1GSDA 2DJ2A 5ECIB 1VF4A 3DD3A 3D22A 2F51A 3W6GA 4ID0A 1FW1A 5HFKA 1BAYA 3O6TA 2H1BA 5C00A 19GSA 5DQSA 2P31A 1BQ7A 3BCKA 3WYWA 3LSZA 5IIZA 3HVSA 5ECSA 2ON7A 3TOUA 1VF3A 1HNCA 3MAKA 2QC7A 3KH9A 1WMJA 2YCDA 1WOUA 4D73B 2VL2C 3ZVJD 2F3MA 3EU3A 3UBKA 3H93A 1QK8A 3P7XA 4GQFA 1SL2B 5D9TA 2C0EA 2B3SA 3WT2A 1PX7A 1ERUA 2DIZA 4CW9A 5B8AA 1A2MA 3VWWA 4OMVA 4JE1A 3IDVA 3E9JB 1A2LA 2K8VA 3GKNA 5GSSA 1XOAA 5G31A 1K0NA 2J23A 4JR4A 2FWFA 2HE3A 4TR1B 4Q5RA 2LUSA 4NMUA 1XBSA 2NDOA 2LV3A 3GYKA 4N30A 1SD8A 1WP0A 1K0MA 12GSA 2LJAA 3M0FA 4OFNA 4XRAA 4I2UA 5B8BA 3EVIA 2AV4A 3F8UA 2C0GA 3ERWA 5J3RA 2LQQA 4NV5A 1B4PA 1PQNA 1XW9A 3MNGA 4RQRA 3TKSE 1DE2A 1U6TA 3KP9A 3CBUA 3L9UA 2LJKA 1PKZA 3DIEA 1R7HA 2P5QA 17GSA 2GVPA 2GDRA 1O81A 1EEMA 2H30A 4MZBA 4KSMA 4H86A 3ERFA 3LG6A 3GL5A 2DJ0A 3HD5A 4Z7XA 1G7OA 1ERWA 3MSZA 2JZRA 1TK5B 3IC4A 1XWKA 4MJCA 1VF2A 2FCHA 2YPMA 4IHUA 1X5CA 2H74A 3TKSA 3UVHA 2IMFA 5IMZA 5DDLA 2CQ9A 1CQHA 3QAGA 2FHEA 4IQAA 3GNJA 2D2ZA 2IJYA 5H5QA 2H19A 4K2DA 2R3XA 2R2JA 2AUVA 3M3MA 3JCML 1E2YA 4EKZA 1FHEA 1TJDA 2IIYA 2VCWA 3UL3A 4Q5QA 3TCOA 4ML6A 1IYHA 2I1UA 3IBHA 3KCMA 1U3AA 4ZL9A 1YF1A 3LYKA 2F8FA 4TR3A 4X43A 1ILOA 1K3YA 5D9WA 2OJLA 3ZRDA 3GHAA 2JACA 2H6YA 2OKAA 2YNXA 3L4NA 1YEPA 3CRTA 5FHIA 3IOSA 4O5RA 4PX1A 3DWVA 1SU9A 4V2LA 4ECBA 3HJOA 1GTAA 2I4AA 4DSSB 4GSTA 4YQUA 2HXKA 5DCHA 4LMWA 4L5OA 1K3LA 2QGVA 2LKUA 2NTOA 3QPMA 4LL4B 2VCQA 18GSA 1XOBA 3M9KA 4KDYA 2HZEB 3UVTA 1WWJA 5LD0A 1NM3A 5KN2A 3VI7A 4BWQA 4J2FA 5DCGA 5HR0A 1OYJA 2JSZA 3FZAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1TJDA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations