The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
43
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sequence length |
174
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structure length |
165
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Chain Sequence |
QDPTQQLEPFLKRFLASLDLLYTQSQPFPNVESYATQLGSNLKRSSAIIVNGQPIIPSPQEDCKLQFQKKWLQTPLSSHQLTSYDGHLIPGTGTFVVHFSAKVRFDQSGRNRLGESADLFQENNQRPIWGSWFGVDVNLVVDENVMQDGEIINSMDYRFTYVPND
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The mtr2-mex67 ntf2-like domain complex: Structural
insights into a dual role of MTR2 for yeast nuclear export
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Candida albicans
|
| molecule tags |
Translation
|
| molecule keywords |
MRNA TRANSPORT REGULATOR Mtr2
|
| total genus |
43
|
| structure length |
165
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| sequence length |
174
|
| chains with identical sequence |
C
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-08-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF10429 | Mtr2 | Nuclear pore RNA shuttling protein Mtr2 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, | Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4GB5 A; 4LMI A; 3EF8 A; 2XRX B; 3G0K A; 1W6Y A; 5DRE A; 2HML B; 2STD A; 3KZT A; 1JN5 A; 1O7W B; 3F8H A; 1EG9 B; 4XBX A; 5IER A; 3D9R A; 3FKA A; 3OWS A; 4HVN A; 3STD A; 1JN5 B; 3VGN A; 1VZZ A; 1CQS A; 1JKG B; 2GEY A; 3GZY B; 3G16 A; 4HZB B; 1OGZ A; 2BMQ B; 2XR8 B; 3EHC A; 4K1V A; 4RZM A; 5CF1 A; 1W02 A; 3FF2 A; 2Z77 A; 3NBR A; 3NV0 B; 3T8N A; 3VSY A; 4STD A; 1ISK A; 4XM4 A; 5AIG A; 1GY6 A; 3EC9 A; 4HM3 B; 1GYB A; 4K1U A; 5D83 A; 2HMJ B; 3JUO A; 3WMD A; 3HZP A; 3LZA A; 4FCM A; 4WYK B; 1O7G B; 1K41 A; 2Z76 A; 5G2G A; 1OH0 A; 3F40 A; 3SED A; 2GEX A; 7STD A; 2RCD A; 1OUN A; 3CNX A; 1UUV B; 2GBX B; 4X2O A; 1QMA A; 3H51 A; 3EQQ B; 1DMQ A; 3F7X A; 4WYK A; 3S5C A; 3GRD A; 4L7K A; 1W00 A; 3CU3 A; 3KSP A; 3KE7 A; 1OHS A; 3ECF A; 5IF6 A; 2HMO B; 2JQ5 A; 3DUK A; 4J8T A; 3CPO A; 4HZ9 B; 5IG0 A; 5IG3 A; 3DZL A; 3FLJ A; 5CF2 A; 4HM7 B; 5STD A; 3GZB A; 3B8L A; 4HM4 B; 1ZO2 A; 3FGY A; 1JB4 A; 2K54 A; 2RGQ A; 2YFL B; 3MG2 A; 3BB9 A; 4R9K A; 2INX A; 2YFI B; 4XB5 A; 5TGN A; 5AEW B; 1OCV A; 1O7H B; 1O7N B; 1OHO A; 3EN8 A; 3M8C A; 4HM6 B; 4IIA A; 1OHP A; 1EA2 A; 2YFJ B; 2XSO B; 1ULJ B; 2HMM B; 3Q90 A; 1C7H A; 5IEO A; 3UJM A; 5AII A; 1W01 A; 5FW5 A; 1NWW A; 2XSH B; 3MYT A; 3UNL A; 5AEU B; 5IG4 A; 1DMM A; 3NV0 A; 4FCJ A; 1Q40 B; 4MJD A; 5AI1 A; 4HJL B; 4HM8 B; 2CHC A; 3JUN A; 5D81 A; 5IG5 A; 3HX8 A; 3K0Z A; 1E3R A; 3DM8 A; 1QJG A; 2HMN B; 3B4P A; 3F8X A; 1OPY A; 1SJW A; 3DXO A; 5D82 A; 1HKX A; 1O7M B; 2OWP A; 1OF5 B; 3H3H A; 3K7C A; 3OX9 A; 1Q40 A; 4H3U A; 4J9A A; 4WWU C; 5HGR A; 2F98 A; 1NU3 A; 1TUH A; 4HM5 B; 2BMO B; 3MKI A; 4Q53 A; 4HM2 B; 5EVH A; 2QIY A; 5DRV A; 5IEP A; 5JPU A; 1ULI B; 5BVB A; 1AR0 A; 1GS3 A; 3EX9 A; 4ORL A; 2A15 A; 3NUV A; 1UUW B; 3IPT A; 4N3V A; 5CK6 A; 4CDL A; 3NM2 A; 1ZX2 A; 2W2C A; 3JUP A; 3LYG A; 4R1K A; 2R4I A; 4I4K A; 1DMN A; 3EBY A; 3I0Y A; 2F99 A; 4KVH A; 2GBW B; 3RGR A; 3JUQ A; 6STD A; 1E97 A; 4XDV A; 1ASK A; 1O7P B; 3EN1 B; 4HKV B; 1WQL B; 4HM0 B; 3JUM A; 1GY5 A; 3HK4 A; 3MHE A; 4LGQ A; 5AIF A; 2IMJ A; 4WP5 A; 4PEJ A; 3SOY A; 2PZV A; 2B1X B; 3DMC A; 3MG3 A; 1TP6 A; 2BNG A; 3B7C A; 3ROB A; 3F9S A; 5AIH A; 3GZR A; 3F14 A; 3FSD A; 3FH1 A; 3OWU A; 5KP1 A; 3MG1 A; 3FZW A; 3NXJ A; 3ER7 A; 1STD A; 2F86 B; 2GXF A; 3B4O A; 3GWR A; 3OXA A; 3OWY A; 2BMR B; 1JB2 A; 1JKG A; 1S5A A; 3A76 A; 2QGU A; 2CKF B; 3F7S A; 3G8Z A; 3GZX B; 3EBT A; 1E3V A; 4L8P A; 4LEH A; 4OVM A; 1OGX A; 2UX0 A; 2HMK B; 2B24 B; 1OF5 A; 3NHX A; 1NDO B; 2RFR A; 4X2H A; 5CLK A; 4U13 A; 5BXQ A; 5KP3 A; 3MSO A; 3EJV A; 1BUQ A; 4XDW A; 3KKG A; 5KP4 A; 1Q42 A; 3BLZ A; 3E99 A; 2I9W A; 3CNM A; 4L8O A; 5JPP A; 3FF0 A; 4R9L A; 4OUQ A; 4XBT A; 3SOA A; 1A2K A; 3OV4 A; 1U5O A; 2Z7A A; 5CXO A; 3RGA A; 1GY7 A; 4XBY A; 8CHO A; 5IEN A; 1JB5 A; 1Z1S A; 4HM1 B; 3T8U A; 1IDP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4GB5 A; 1V74 A; 7GSP A; 1A2V A; 5DRE A; 3KZT A; 4OK0 A; 1GMQ A; 5AYS C; 2F56 A; 1MGW A; 2CG0 A; 2OQE C; 2CFK A; 2XH9 A; 2Q07 A; 3NQY A; 1RCK A; 2QEX 3; 1MWU A; 2O9U X; 3OWS A; 1D6Y A; 3VGN A; 4EYC A; 4LYL B; 1BSB A; 3RDE A; 3NQZ A; 3S29 A; 1IT7 A; 3G16 A; 1YJN 3; 1OGZ A; 1LOY A; 2CWT A; 1PFP A; 3WOD G; 2CX0 A; 2CWU A; 4EV5 A; 1RGL A; 1X1W A; 2PNC A; 3VSY A; 4XM4 A; 4EBG A; 1I3F A; 3EC9 A; 2KAA A; 4HM3 B; 5A0O B; 1B21 A; 1RN7 A; 3LH4 A; 3ZG5 A; 2BIR A; 1SQW A; 2H0H A; 4O2H A; 2P05 A; 3PZW A; 1RDS A; 3EE1 A; 1O7G B; 1IV9 A; 1K41 A; 1QAK A; 1OH0 A; 2F5M A; 2Z76 A; 5G2G A; 1IK3 A; 1VQP 3; 3I55 3; 2GBX B; 1X1Y A; 2CK3 H; 3H51 A; 1VQM 3; 1VQ6 3; 1DMQ A; 1I0X A; 5IW9 A; 5AYR B; 4L7K A; 4FMD A; 1FGM A; 2ZA4 A; 3KSE D; 3SX1 A; 3N8B A; 1W2Z A; 5LC6 A; 2IY2 A; 3HOH A; 2GU1 A; 1RGK A; 3U1W A; 4I5Q A; 2V1L A; 3BNE A; 3A5E A; 2K54 A; 3BB9 A; 4H61 A; 1LNH A; 1OCV A; 1N9E A; 1AV4 A; 2XFT A; 3EN8 A; 4RNY A; 5I97 A; 1EA2 A; 4LZI A; 2XSO B; 1ULJ B; 4KFD A; 2WOF A; 1HYF A; 5AII A; 1YJW 3; 3UNL A; 5AEU B; 1D6Z A; 1UGH I; 1PY3 A; 4BU4 A; 1Q40 B; 1NO3 A; 1MOL A; 3HX8 A; 2BT3 A; 3K0Z A; 1LOW A; 1QJG A; 2HMN B; 3DM8 A; 2MC8 A; 1R4Y A; 2RSX A; 3K7C A; 1HU9 A; 2C4B A; 1FUS A; 2KF5 A; 3OX9 A; 4KFF A; 1NB5 I; 1NU3 A; 2UGI A; 4HM5 B; 5EVH A; 1WNH A; 1CEW I; 1KSI A; 1M1X B; 1ULI B; 2ZDJ A; 2CW9 A; 3S27 A; 1GS3 A; 5CK6 A; 1UUW B; 3IPT A; 4J5K A; 3CC2 3; 1MGR A; 3NM2 A; 1ZX2 A; 1WMO A; 3J7Y d; 1B2M A; 1RGH A; 2KCD A; 4I4K A; 1DMN A; 5M19 A; 2F99 A; 3MWZ A; 4KVH A; 3JUQ A; 6STD A; 4WWU C; 3EN1 B; 3EB8 A; 5AIF A; 2KF6 A; 1GY5 A; 3HK4 A; 2E2T A; 5ELJ A; 1UGI A; 4KZ1 A; 4BL2 A; 3DMC A; 5HOH A; 3AMO B; 2F5W A; 4MMX B; 4BL3 A; 2L4V A; 3FSD A; 3FH1 A; 3OWU A; 2AAE A; 4EC6 A; 1VQ5 3; 1BIR A; 3FZW A; 4GSP A; 2GXF A; 6RNT A; 3PS8 A; 1BRH A; 1N8R 4; 2BMR B; 2XFS A; 4L8P A; 3SYU A; 2QGU A; 2CKF B; 3EBT A; 4NRE A; 1FUW A; 1RGC A; 2F4Y A; 4AEQ A; 1BNI A; 1KQS 2; 3VF1 A; 1OF5 A; 1NDO B; 2XGL A; 1N5P A; 1UI8 A; 4IT7 A; 1IYY A; 4GL6 A; 2E2U A; 3MSO A; 1UW1 A; 3EJV A; 1MNL A; 1BUQ A; 4XDW A; 1GOY A; 3KKG A; 1Q42 A; 4J5G A; 4AKZ A; 3GAX A; 1I3I A; 1RCL A; 3L0R A; 2RNT A; 4K90 B; 5G1K A; 3SOA A; 3WA3 A; 1LOX A; 2Z7A A; 3K5T A; 5CXO A; 3RGA A; 2W6J H; 3PXM A; 1JB5 A; 4HM1 B; 4FMB A; 1FA3 A; 1BRG A; 2ML6 A; 4N6O B; 1W6Y A; 1N8Q A; 1RN1 A; 3URP A; 1F8N A; 1LXE A; 5GSP A; 1W2B 2; 4JF8 A; 5LC7 A; 4MMZ B; 4XBX A; 5IER A; 1YI2 3; 1YIJ 3; 3BNC A; 4FR9 A; 3D9R A; 3FKA A; 3STD A; 1QAL A; 1AVK A; 1RN4 A; 1UI7 A; 4KFE A; 4TX4 A; 3UL5 A; 4ZM8 A; 1JKG B; 2CWV A; 3SED A; 4HZB B; 1VQ7 3; 1STF I; 2CFL A; 4RZM A; 4FCZ A; 3NV0 B; 1BSC A; 3X3Y A; 1IQ8 A; 1ISK A; 1WTH A; 3SVA A; 1LQM B; 1X1U A; 1WMP A; 2W0Q A; 2HMJ B; 2ZHX B; 5D83 A; 1RGF A; 4FCM A; 3X41 A; 1RSN A; 4HYZ A; 1OUN A; 1UUV B; 2WGO A; 3CC7 3; 1ROV A; 3BU4 A; 1IV7 A; 3EQQ B; 3DY5 A; 3GSP A; 3FCS B; 3F7X A; 3CCV 3; 4WYK A; 1DVD A; 3G71 3; 1OHS A; 3BNB A; 1BRJ A; 2HMO B; 3DUK A; 3D5G A; 2BHM A; 2JDI H; 3LTA A; 4HAA A; 3FLJ A; 3U97 A; 2Z6B A; 1GMP A; 4HM7 B; 3CD6 3; 3TDG A; 1I0V A; 2YFL B; 3MG2 A; 4XB5 A; 2INX A; 2YFI B; 4WHA A; 1W4N A; 2MF7 A; 3FG3 A; 1JJ2 2; 1OHO A; 1YHQ 3; 1OHP A; 5KP4 A; 1RHL A; 2WO0 A; 2CG1 A; 1W01 A; 2BO9 B; 2UUG C; 5FW5 A; 3MYT A; 1Q7H A; 5EEO A; 2Y73 A; 1GOV A; 5IG4 A; 5M18 A; 3NV0 A; 1J2B A; 3N9H A; 4MJD A; 5AI1 A; 1EKM A; 4HM8 B; 5D81 A; 4DKI A; 2OCT A; 3F8X A; 3HIG A; 5EQL A; 3CCL 3; 5D82 A; 1O7M B; 2OWP A; 1EQK A; 1OF5 B; 2AAD A; 4H3U A; 1W7C A; 2F98 A; 1ROA A; 5IEP A; 4LSO A; 4Q53 A; 1IQY A; 2QIY A; 1G02 A; 2W56 B; 1RLS A; 5ELU A; 1Q9E A; 4CPK A; 3BIR A; 1PU4 A; 3EX9 A; 4ORL A; 3T0U A; 3V98 A; 2W2C A; 1GSP A; 2R4I A; 1ZS7 A; 3EBY A; 3V92 A; 1RJO A; 1G96 A; 2SAR A; 1I2E A; 5BIR A; 3AMO A; 1ASK A; 1O7P B; 5JPU A; 1TFO A; 4HM0 B; 3SOY A; 4WP5 A; 1EEJ A; 2GU3 A; 3S67 A; 4IPB A; 1L5G B; 1TP6 A; 3B7C A; 1S72 3; 1SIH A; 1AVL A; 5AIH A; 3GZR A; 3BND A; 5KP1 A; 1U8C B; 3MG1 A; 4R4K A; 3OXA A; 1YGW A; 1STD A; 3ER7 A; 3PCR A; 1LNI A; 3GWR A; 5IG3 A; 1TU5 A; 3GZX B; 3D79 A; 3LTC A; 4LEH A; 4OVM A; 1NB3 I; 2H0G A; 3D4A A; 1OGX A; 4R80 A; 1AQZ A; 1BNE A; 2HMK B; 1DYU A; 2CC3 A; 1I2G A; 3CC4 3; 1NNV A; 3K63 A; 1US1 A; 4EV2 A; 4U13 A; 5G1L A; 4ILF A; 1VQL 3; 2K3D A; 1YVS A; 3LXU X; 3CPW 2; 3D5I A; 2OTJ 3; 3E99 A; 1KD1 4; 2I9W A; 4L8O A; 1A90 A; 2RBI A; 1BRK A; 4XBT A; 1IU7 A; 2KXG A; 1BRS A; 1GY7 A; 1T3B A; 3FG1 A; 2KF3 A; 3NX0 A; 1MWT A; 4LMI A; 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