5G1KA

A triple mutant of dsbg engineered for denitrosylation
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
LPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCGPCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVMPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Sulfur Denitrosylation by an Engineered Trx-Like Dsbg Enzyme Identifies Nucleophilic Cysteine Hydrogen Bonds as Key Functional Determinant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN DSBG
molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
total genus 67
structure length 228
sequence length 228
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 5g1kA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5g1kA02
1YEPA 3EC3A 4ULXA 2MMNA 2H71A 3ERWA 3KP8A 5D9VA 2IMEA 2CX3A 1K0BA 4MJCA 3F3RA 2O8VB 4OWYA 3KP9A 3TJBA 3F4TA 3MDKA 2CZ2A 1GL8A 1TRVA 4I97A 3ZMLA 2QGVA 3HKRA 4O7HA 9GSSA 3TJJA 4O5RA 2J9HA 4PQIA 4WBRD 2GZZA 8GSSA 1FB6A 3FW2A 5L71A 2CV4A 5C04A 5GAPD 3G7IA 2VLTA 4ZB9A 1AQVA 4MZWA 4MDCA 3IPZA 4CW9A 1SK1A 1GUHA 4K7NA 1YF0A 3DYRA 2OA7A 1GSDA 1X0RA 2K8SA 5ELAA 1O81A 4F03A 2N5AA 2C0FA 4KH7A 1J9BA 1A8LA 2H6YA 1OKDA 2YWOA 4ECJA 4BA7A 3F3QA 1VF4A 3ZRDA 2DJ3A 3M9KA 1XW6A 5CRHA 4PURA 2NVLA 1BG5A 5EY6A 3ZMKA 4YAVA 5DALA 1PKZA 4EXJA 2ALBA 1PX6A 3KZQA 2H1DA 4QL7A 3HDCA 3FZ4A 1RW1A 1Y25A 2C4JA 4BL7A 3HHVA 2VM1A 1OVNA 2H76A 3GURA 1WOUA 1QQ2A 1Y6EA 4YQUA 3GL5A 4IVFA 5COHA 1R5AA 2C3TA 2GQKA 1XWBA 4HOJA 2JU5A 2C3QA 1M7TA 3KTLA 4V2MA 1EOGA 3FEUA 18GSA 4G10A 4NHZA 3WT2A 4J57E 2I3YA 4GLTA 1SENA 1GTIA 3LGCA 1XVQA 5ECSA 2TRCP 4ECIA 2XBQA 5ECKB 2HT9A 3M0FA 4NAXA 1VF3A 3HA9A 3IHQA 2QSIA 2P5QA 3FY7A 5D8IA 1B48A 4BWQA 2FNOA 4RI7A 13GSA 2WDUA 1GSUA 4PX1A 5J41A 4RQXA 1PX7A 5CRDA 1Z5YE 4EUYA 2H74A 2HSHA 1G6YA 4Q5NA 2GTUA 3TCOA 3H8QA 4IHUA 3HXSA 1S3CA 3HD5A 3UVTA 2P31A 3WGXA 5IMFA 3EWLA 4BVYA 1SJ6A 2VD0A 5J9CA 4KX4A 5DBQA 3ZIJA 2VL2C 2REMA 4J56E 1TXXA 5G31A 1Q4JA 3UVHA 4HZ2A 5HFGA 4OCEA 2YWMA 4GQFA 1XCCA 1GLQA 5IMCA 4N11A 5FWGA 2O89A 3NZNA 5JCWA 4GQCA 3E3EA 2NDOA 6GSSA 1K0OA 4K8MA 4N30A 3I43A 5HR3A 4EF0A 2AHEA 3FR6A 3D22A 2VL2A 3VFIA 3TRPA 5ID2A 2G0FA 4HU7A 2RIIA 4GXZA 3D4TA 2WFCA 2K18A 1WRYA 1SL1B 1W4VA 1AAZA 3ZLPA 5IMVA 2XHFA 1URMA 5DQSA 4DSSB 1MTCA 4GCIA 4POLA 3QAWA 4MJAA 3TKQA 4MZBA 1V98A 2WJUA 2DJ1A 4TVEA 3DVWA 5FT3A 2N5BA 4IW9A 5HFKA 3CMIA 1TK0B 4XS1A 1O8XA 3ZITA 1GLPA 3A2WA 1PRXA 4KW6A 2GVPA 1A2JA 1PD21 4N10A 3ZZXA 3Q6OA 3KMOA 4IGJA 3I6AA 4BPYA 1M2AA 1DE1A 4J2FA 4TR4A 3CTGA 2HRFA 3UJ1A 1Z6MA 4GTUA 2GZYA 2VCWA 3FZ9A 1SK0A 3DEXA 4JU5A 4PQHA 1JZWA 2GDRA 1NHOA 2BMXA 2M46A 4MF6A 2KUCA 1XPVA 3IC4A 3F4RA 3AY8A 2GQMA 3BBYA 1M2BA 2YP6A 4NXIA 3KD0A 5KN1A 2R6KA 1XW9A 4XRAA 2XPEA 3RPPA 2LKUA 4XHMA 3DD3A 5AGYA 4TXOB 3KM6A 1BJXA 1M9AA 1WPIA 1TKDB 4HQSA 1BQ7A 2H01A 3JCML 4GF0A 1DBYA 1SU9A 2V1MA 1A2LA 4I2TA 1ERVA 1X9SB 2B3SA 1K3YA 2VOCA 4ZB6A 3L0HA 1R5PA 4HI7A 1WP0A 5DCHA 3VPQA 2BTOT 2OADA 3VWWA 2HE3A 3P2AA 1CQGA 1YQ1A 12GSA 1TTZA 3RPNA 3HVVA 3ERFA 1J0FA 1B4PA 2A2SA 4WEYA 2NPBA 5ECPB 1F3AA 5DAKA 4F9ZA 5ELGA 2J23A 1AQWA 4JEDA 1F3BA 5ECRB 3SBCA 3K8NA 2A2RA 3VWUA 1DUGA 1X9MB 5F07A 2DJJA 3G9BA 4F82A 2LTKA 1N2AA 1M9BA 1A8YA 3C7MA 1Q98A 4HZ4A 2B1LA 4RQRA 3UBKA 2YV9A 2O85A 3IR4A 1FAAA 2YZHA 2K6VA 3GYKA 4FO5A 3VI7A 3ZFLA 4MCUA 5CRGA 1U6TA 2K9FA 3U6VA 2VUPA 1OAZA 4L8EA 1PA3A 2MBSA 1ERWA 1UA5A 1S3AA 3MWHA 4QL9A 4XS4B 3FKFA 2X8GA 4HJ2A 4ZB8A 3VPTA 3ZREA 1O6JA 4F0CA 4TW5A 3KGKA 2HRNA 2AYTA 4BVXA 3IAS2 5AISA 1PL2A 5JCGA 1NHYA 4FH8A 4MA9A 3J7Yk 1EGOA 2R2JA 3CXGA 1K3OA 3IK9A 1GTUA 2FA8A 1VRSD 2KLXA 2L5OA 1TP9A 3IV4A 3WGDA 2K8VA 3RHBA 2H66A 4IBPA 4Z7XA 1OC3A 2M72A 1ZGNA 2VL3A 4ACSA 3VWXA 2B5YA 4AJ8A 1V57A 2GSTA 2LNTA 4KCEA 4X1UA 3KH9A 5A4UA 1YDKA 2IFQB 1EOHA 4OD7A 2DBCA 1ZCPA 5D73A 2L4QA 2DIYA 2HZFA 1BYEA 3O3TA 2IYJA 2HXKA 1GTAA 3DXBA 2HNLA 2OKAA 2VAFA 3EMPA 1HNCA 3ME8A 1ZYQB 5CAXA 3QCPA 4ZILA 1N8JA 2IMIA 3I69A 1EWXA 4IP1A 4ZBBA 4LL4B 2DJ0A 2G2QA 2PUKC 5DCGA 4WKWA 3RDWA 5GZZB 1XW5A 3PR8A 1ERUA 5D93A 1YF1A 3F6FA 4WETA 5JCUA 2V2GA 3APOA 4G19A 4MF5A 4WBJA 1FHEA 5EVOA 3LJRA 2YZUA 4EDZA 2RM6A 2YNXA 2DLXA 1FOVA 1KNGA 2PGTA 1U3IA 4PQ1A 4X0XA 1TRWA 2ES7A 2GGTA 4JE1A 3TOUA 2VCTA 3TKPA 4RI6A 5E59A 2VCXA 4K2DA 1V9WA 1PQNA 1K0MA 1LJRA 4KAEA 3GKNA 4TOPA 4K1FA 4O92A 2CAQA 2RUEA 2IMDA 2LSTA 1XWGA 4ECCA 1YJ6A 2YANA 5ECMB 4V1Ap 4KDYA 2ON7A 4YQMA 1G6WA 2HYXA 1GSFA 4XRDA 5B8BA 4G2EA 1JZDA 1A2MA 2VD1A 3F6DA 3QFBC 1AXDA 1O8WA 2DMLA 2CT6A 3Q18A 4JBBA 2E2MA 5D9XA 4ML1A 2HZEA 2R4VA 1TK8B 3HJMA 3O6TA 1XOAA 1IYHA 5ECLB 5J3RA 2P0GA 4MK3A 3FK8A 4MF7A 2L6DA 3P7XA 4G9HA 3LFLA 5IQYA 2MMOA 6GSYA 1FW1A 5E4WA 3F63A 1JZOA 3US3A 4FIWA 5IMDA 5J5NA 5EPFA 2PERA 4OFMA 3UMAA 4JRRA 3QDNA 2V41A 2PMTA 4KB3A 1HQOA 2DMMA 4NWYA 1A24A 3J7Yb 4D73B 1B9XC 2YPMA 4HEA2 2FD3A 3VLNA 4HQZA 2IJYA 5F06A 4ID0A 2LQQA 2CQ9A 4DEJA 2AB6A 5D9WA 4ZBDA 1TOFA 3TKRA 3F0IA 2YV7A 1USBA 2X99A 1XBSA 2F8AA 1PMTA 4PNFA 3C1RA 1WE0A 3I9V2 1J08A 4MP4A 2VIMA 4IELA 2GT5A 3ZFBA 1OKTA 2FLSA 3TJFA 5KN2A 5IM9A 2X64A 2YWNA 1TW9A 4PNGA 2WZ9A 4F0BA 4PGTA 1FVJA 4TKYA 1KTEA 1YZXA 4MPGA 3GMFA 4OMVA 4HUAA 4I6XA 4GSSA 2AAWA 5H5QA 1I9DA 2C0GA 4FYBA 3H4KA 1BEDA 3DGQA 3KH7A 2C1YA 3BJ5A 7GSSA 1JZRA 5B7CA 2E0QA 1GP1A 1JLWA 4N0VA 1TI1A 2O87A 1GNWA 3C71A 3N9JA 4IKHA 1G0TA 3GKKA 3IE3A 2DSAA 1AUCA 5H5SA 1XWCA 5HR0A 1TU8A 3HZ4A 4MPFA 1X5EA 4OFTA 3TB2A 3TKSC 3GFKA 1M2DA 2YOIA 1LU4A 4DSSA 2M80A 2L57A 4KCAA 1ST9A 4AGSA 2FGXA 2IL3A 2MMAA 4RUVA 1F2EA 2H72A 1SJIA 2PWJA 1WJKA 1B9YC 4KA0A 3GIXA 3HJPA 4IJIA 2TIRA 3A3TA 3TKSA 2LV3A 1AQXA 2DC5A 1ILOA 3D0ZA 2H73A 1GTBA 3GKMA 1ZYEA 3RHCA 5ID2B 2JACA 1SKWB 2FWGA 2L6CA 2HI7A 3TGZA 3TJGA 4K6XA 2IPAA 3D6IA 1K0NA 1FVKA 3QPMA 3CTFA 2ZCTA 19GSA 2H75A 2CVKA 3GA4A 2OACA 3GRXA 3GH6A 1EV9A 1Z3EA 3QAGA 2XPDA 1HNBA 3HJOA 4L5LA 2H0HA 1W89A 5D9TA 4TXOA 3M8NA 4V2NA 2GS3A 1M99A 4TR3A 2P5RA 1GULA 4PXOA 2OJLA 3DMLA 4ZXGA 1G7EA 3VI5A 2YWIA 4IN0A 4E8EA 4Q5QA 3GX8A 5FHIA 3TKSE 2C8UA 2V6KA 3ZTLA 4GSNA 1UN2A 1TU7A 20GSA 2KHPA 1F9MA 3VURA 1XOBA 1QMVA 3GTUA 2F51A 3GX0A 1E2YA 3KIJA 2V32A 4PUAA 3QOUA 1EP8A 2OE0A 3GHAA 5IIZA 3PGTA 4MLYA 4TN8A 3P90A 3PH9A 1XWKA 2WGRA 2HSYA 2OE1A 1FG4A 2HFDA 2AV4A 3D4MA 4X43A 3E9JB 3BCIA 3G7YA 1XFLA 1NM3A 1OC9B 3G7JA 2L4CA 4K7IA 3KXOA 3KCMA 2GT6A 4LLRA 3QMXA 1ZOFA 3L9SA 3DKSA 4TR1B 1GRXA 3W8JA 1C72A 4OO4A 2QKEA 3L78A 4IJ3A 4WXTA 2PVQA 1AIUA 4WR5A 1PKWA 1V40A 3GL3A 4ISDA 1I5GA 4YH2A 1PL1A 4H86A 1R7HA 3CBUA 6GSVA 1ZZYA 3GV1A 2WCIA 2H1BA 5KN3A 2V6OA 5C00A 2B5EA 5B6MA 4I2UA 3W6GA 4JZQA 3E0UA 1ACVA 5JWRB 4EL1A 1EZKA 1YKCA 1PGTA 2FHEA 4MH2A 4L5OA 2I9HA 3TRQA 3EVIA 2XC2A 3LXTA 5CNWA 3VWVA 4HJMA 4ZL8A 1IYIA 3GSTA 2YCDA 4MMMA 4AJ7A 1GUMA 5CYYA 1S3DA 1XXUA 3BOAA 2PN8A 3HVSA 3ZVJD 1R26A 6GSTA 3NOFA 5ENUA 1GH2A 4NMUA 1GSQA 2AUVA 3GNJA 2FWFA 2IFQA 4JR4A 3EE2A 1HNAA 4IQAA 5A4VA 1EV4A 1XIYA 1T3BA 5B6NA 2H6XA 4XCSA 5HR1A 4K7OA 5LNKe 2OBKA 4AF2A 5J9BA 2E2GA 1G7OA 5ABRA 1K3LA 3FZAA 4OCFA 1SD9A 2I4AA 3O76A 3F4SA 2ON5A 4IP6A 3EU4A 1OC8A 2IY2A 4AJ6A 5J4UA 1THXA 1V2AA 4XS6A 5HR2A 3GUSA 1SL2B 2RM5A 2C0EA 5CREA 3APSA 1RK4A 2IIYA 1AC1A 3EMXA 4LL1B 4K0NA 2FY6A 3CSJA 4EKZA 1R4WA 2F8FA 3NIVA 3ED3A 1UVZA 1VF2A 2H0IA 2TRXA 3W8SA 4POKA 1MD4A 3L9VA 3LORA 2LRCA 1BX9A 2IMFA 2IMKA 1ON4A 2GLRA 1SD8A 3HVXA 3IDVA 4KDUA 2FWHA 1Z7PA 1V58A 3F8UA 1DE2A 2KP2A 3TRXA 4TRXA 4E8HA 3H1NA 2VM2A 2LJAA 5IO2A 3LWAA 5D96A 2EC4A 2XBIA 1LBKA 1TDIA 3LG6A 4ZL7A 3IA1A 1U3AA 3ME7A 5F8BA 3H79A 2LNSA 2QC7A 2GSSA 4BWSA 4EC0A 1JHBA 3TOTA 2VCZA 4EO3A 1NSWA 1H75A 2X8CA 3DVXA 5KN0A 1EEMA 5AIXA 4KUNA 2B7JA 16GSA 1EP7A 3UARA 4OO5A 2PU9C 2OE3A 4KDXA 1VGLA 2KOKA 4MABA 1RQMA 2MBTA 4IS0A 3Q74A 2VO4A 2NBSA 3CRUA 1O73A 2GSQA 4D73A 3OR5A 2H0GA 2EIRA 2EIOA 4KSMA 2WRTA 5DJLA 4F2IA 2LRTA 4QQ7A 3M9JA 1BAYA 2L5LA 5DALB 2PBJA 1MDJA 2DJ2A 1PN9A 2KP1A 2HZEB 4Q5RA 11GSA 2VL9A 1A0FA 4XTSA 4I5QA 3CSHA 2BJXA 3D5JA 3A5WA 4HU9A 4I8BA 2JSZA 5LCZA 3ZIVA 3M1GA 1PSQA 3ZVJA 5DDLA 4K9ZA 4NPBA 2EIQA 2D2ZA 5ECOB 5JWQB 3HZ8A 4L0UA 4YQVA 3QR6A 1K0AA 3H93A 2JSYA 3FR3A 5LD0A 4MZCA 5ECHB 3UL3A 3GKXA 2JZTA 2B5XA 1B8XA 1Z9HA 2PPTA 1EEJA 4MJEA 3HCZA 1SJZA 4WR4A 1THOA 3A2XA 2JL4A 4WF5A 3CSIA 4ZBAA 2CA8A 1SYXA 1X9WB 2I81A 3ISOA 5JWOB 3UAPA 1XVWA 3L9UA 3IRAA 4POMA 4MH3A 2H8LA 1MEKA 1ZMAA 2H6ZA 1FO5A 1K0DA 2MZCA 2YJ7A 1TRSA 1EGRA 3FRCA 1GSEA 2JZRA 2LS5A 2GQLA 2ZUPA 5KEJA 5EL8A 4NHWA 1CQHA 4ZL9A 4POBA 1U88A 3DWVA 4EE0A 1OYJA 3N5OA 2C0DA 3BD2A 4CDOA 3SWLA 17GSA 1GSYA 1XWAA 1E6BA 3ZL5A 3MNGA 1K0CA 3RBTA 2RLIA 2MYGA 1VF1A 3VK9A 4EVMA 4NV2A 2E7PA 6GSUA 2LJRA 1TJDA 4ILFA 3WT1A 1HYUA 1TI3A 2VCQA 2IWTA 5HFIA 5GSTA 3EURA 4KSOA 4DSRA 3WYWA 4IQ1A 3UOMA 5IMZA 5IO0A 6GSXA 5F0GA 1T7PB 2LRNA 2R3XA 2H1GA 4WF4A 2DIZA 1Z7RA 3MAKA 3D21A 3U5RE 1QUWA 5G5EA 4KGIA 2JADA 3LSZA 1H4OA 1SKSB 3DRNA 1AW9A 3GN3A 3GH9A 4LA1A 4ZIJA 4ECBA 3A2VA 1NW2A 1HD2A 1KBNA 2LQOA 6GSWA 5IMAA 3WD6A 3FZ5A 2B7KA 5DJMA 1X5CA 5F05A 2VLUA 4O32A 1GNEA 2Z9SA 4K0GA 5G1LA 4MJBA 1GWCA 3FR9A 2DJKA 3TUEA 2O7KA 3FHKA 1YY7A 3IK7A 1FB0A 2WULA 3IBHA 2L59A 5CO3A 5IOXA 2LUSA 1T4ZA 3CRTA 5IPHA 1QXHA 3TJKA 3IAM2 1OC9A 2C80A 2LEGA 3L4NA 3CYNA 2H1AA 3S9FA 3R2QA 2MMZA 3EYTA 1SKRB 1MDIA 4N0ZA 14GSA 3C73A 3TDGA 2A4VA 4TR1A 1WWJA 1DSBA 4L0WA 2N5FA 3ZYWA 3GTUB 4CHSA 3FYGA 5G5FA 4HDEA 1ZL9A 2YJHA 5H5RA 1OE7A 3RAZA 3KEBA 5HQPA 1XZOA 1Z6NA 1T1VA 2WB9A 3WGEA 2CAIA 4FYCA 1MDKA 4GWRA 5ECQB 4LMWA 3IXRA 4ML6A 2F3MA 10GSA 2CVDA 3KJYA 2IN3A 4TXVA 1OE8A 5G1KA 3EU3A 3QFAC 2NTOA 5DAKB 3UIWA 1JLVA 2RUFA 4XS4A 2AJQB 1JFUA 3F9UA 3PINA 3LXZA 1M0UA 5INYA 2FWEA 4YAPA 4XIHA 1KEBA 3UEMA 1TK5B 5G2ZA 1O7UA 5DVBA 3UBLA 3C1SA 1UC7A 1MD3A 1T00A 1QGVA 1QK8A 1B4QA 1ERTA 2C3NA 5G30A 4NV5A 2LJKA 2R37A 4EDYA 2FCHA 3HY2A 1ABAA 4HS1A 2HLSA 4LMVA 2X8HA 4GRFA 3P8WA 2YN1A 5IOWA 3LQ7A 4DSQA 4Q5FA 1QFNA 5CRWA 2ZNMA 5AN1A 5ECNB 3KMNA 2B1KA 1F37A 1A0RP 4V2LA 2B6MA 1YEXA 2FUG2 2F9SA 3QAVA 5A5KA 5GAND 5A4WA 1GUKA 3ERGA 2CVBA 5DQYA 1A23A 3KTBA 3LEFA 1ML6A 5B8AA 1WIKA 5GSSA 2PVOC 4KE3A 4KNDA 2VLVA 2CX4A 1O85A 4OFNA 3LYPA 4JR6A 3LYKA 3BCKA 2WS2A 2GSRA 4FYUA 2CZ3A 1U87A 3Q19A 2H30A 1SYRA 2VCVA 3DIEA 1F6MC 3C8EA 3HYPA 4PUFC 2R5GA 3M3MA 3GSSA 4DVCA 3MSZA 1WMJA 2OBIA 1GSSA 5CP1A 4GSTA 4V1Ag 1YKAA 2JZSA 22GSA 1T8EB 3V1WA 3EINA 3APQA 4P3YB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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