5G1KA

A triple mutant of dsbg engineered for denitrosylation
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
LPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCGPCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVMPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
publication title Sulfur Denitrosylation by an Engineered Trx-Like Dsbg Enzyme Identifies Nucleophilic Cysteine Hydrogen Bonds as Key Functional Determinant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN DSBG
total genus 67
structure length 228
sequence length 228
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 5g1kA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5g1kA02
4EUYA 5JWQB 1G7OA 3EMPA 4I6XA 1QK8A 3ZMKA 1EWXA 2RLIA 2VL2A 3GKKA 13GSA 2KP1A 2TRCP 2HT9A 5ABRA 3CRUA 2C3QA 2X8GA 2R5GA 3L78A 4EL1A 4BPYA 1DBYA 4GF0A 1XZOA 4OCEA 3LJRA 1LBKA 1SKSB 5FT3A 1YZXA 2HLSA 2VOCA 4HUAA 2FWEA 1DE1A 3D6IA 4DEJA 5IMFA 5HQPA 1Q98A 1XVWA 3M9JA 3CSIA 3KMOA 4WKWA 1V58A 1ZCPA 4IN0A 2GZZA 2CVKA 2GQMA 4RQXA 1S3AA 2R6KA 2YPMA 2IJYA 4KW6A 3F4TA 3M9KA 2CQ9A 5DDLA 5ECNB 4GXZA 2F8AA 4JRRA 5J41A 5ECMB 3AY8A 2MBTA 3KP8A 5KN1A 2PGTA 1PSQA 3DYRA 3ZREA 1X5CA 4JR6A 1QQ2A 4PGTA 3OR5A 2ZNMA 4WR4A 3LORA 1X5EA 3ZMLA 2P5RA 5G1KA 3LEFA 2FHEA 1V98A 4D73A 3BCKA 3HVSA 3FK8A 3CSJA 2H1BA 5D9XA 5ECPB 3KP9A 3WGDA 3GKMA 2A4VA 2GS3A 3TKQA 1BG5A 4K7OA 1LJRA 2C0FA 3GFKA 2JU5A 4K0GA 3K8NA 3LGCA 5FWGA 5IMCA 5IIZA 3HYPA 4MF5A 2B3SA 2OBIA 2IWTA 3ME7A 1ZZYA 1SYRA 2WGRA 5GSTA 3GHAA 3VWVA 2KHPA 2C1YA 3CRTA 2P31A 2VCZA 5D9WA 5B6MA 1O7UA 3C1RA 5EY6A 2E2GA 3TOTA 5IPHA 3QAGA 3GUSA 1MDIA 1SD9A 1JLWA 2YWMA 3UOMA 2KLXA 4KH7A 3EC3A 3GMFA 1MEKA 1YQ1A 5LCZA 4O7HA 1XFLA 2VO4A 5L71A 1V9WA 3QFBC 2X8HA 3FHKA 5AN1A 4ULXA 2B5YA 4F2IA 3QDNA 5DCHA 1XOAA 4HU7A 5G5EA 4POBA 1PA3A 4Q5NA 4G10A 3GH6A 4TR4A 4E8HA 3QAVA 5D73A 3TJGA 3V1WA 1DE2A 4OFNA 4HQZA 4ACSA 1TRSA 2WULA 3IR4A 3A3TA 3D4MA 2H0GA 1K0BA 4PUAA 3RDWA 4I2TA 4I2UA 5EVOA 2NVLA 3ZRDA 1ZMAA 4AJ8A 2CA8A 4WXTA 2CZ3A 2IN3A 2KOKA 3BD2A 14GSA 2R2JA 1NSWA 2C0GA 1KBNA 3TKSE 4O92A 2EIOA 3KZQA 3TOUA 2IMDA 2VD1A 3FW2A 5B8BA 1EP7A 3FZ4A 4J56E 2IFQA 2DMLA 4K9ZA 7GSSA 2P0GA 4D73B 5H5RA 1OC9A 5IM9A 5ECHB 2L59A 3QAWA 2FLSA 5F06A 3DXBA 4N11A 18GSA 1GP1A 1I5GA 1E2YA 1K0CA 3P90A 1ERVA 2GT5A 4ISDA 5DBQA 4PNFA 2PVQA 4TR1A 4WBJA 1M2BA 4FYCA 1TK5B 5E4WA 1SK1A 1RW1A 6GSXA 2F8FA 4L5OA 2ES7A 3L9UA 2YOIA 4P3YB 1A2JA 4ECJA 6GSWA 3TJFA 1M7TA 2ZCTA 3LG6A 3CBUA 2JZTA 1J08A 2CV4A 5ENUA 4HOJA 2AAWA 2LKUA 2E7PA 1F3BA 2EIQA 2GGTA 2AV4A 1JZWA 3A2XA 3W8JA 4WR5A 3BOAA 3D22A 3D5JA 2JL4A 4TOPA 1JZRA 5ECOB 2VCQA 3N5OA 2R3XA 4JE1A 2DLXA 5HFKA 1VF2A 5HR1A 1J0FA 1ZYQB 1C72A 1GNWA 1T3BA 5HR2A 2PERA 1GTAA 2VLVA 2M46A 3HZ4A 2IY2A 4RUVA 2OE3A 1IYIA 4IELA 2DIYA 3FRCA 3EWLA 1M99A 5CP1A 1UA5A 2EC4A 2GVPA 1N2AA 1M9BA 1SJIA 2YJ7A 3F0IA 1DUGA 5A4WA 1ZGNA 2DSAA 1A2MA 4EF0A 2C0EA 3MDKA 5A4UA 1HQOA 5E59A 1JZDA 3UIWA 4G19A 4HI7A 1M0UA 3HXSA 4K7IA 3CMIA 1O73A 3I69A 2H6YA 2MBSA 5IQYA 5IMDA 5ID2A 1PKWA 1UVZA 3HY2A 2WFCA 3VI7A 5G2ZA 4OCFA 1GSUA 3KCMA 3IOSA 4QL7A 3F8UA 5IMZA 5ECKB 2O87A 1YKAA 4EDZA 2RIIA 2VLTA 2IIYA 2LUSA 2NTOA 4KA0A 4WETA 4EE0A 1QFNA 2H01A 2IFQB 1ILOA 2BMXA 4ZBAA 1NW2A 3F4SA 4IP1A 5ELGA 1OC9B 4V2MA 2PUKC 1V40A 4XTSA 3LSZA 4KSMA 5J9CA 2DJKA 4Q5RA 4HS1A 1GTBA 1QMVA 1BJXA 2AHEA 4MH2A 1SYXA 3TJBA 5DAKA 2G0FA 2I81A 4LA1A 2DIZA 3IXRA 2N5FA 3P2AA 4JEDA 4PX1A 1AUCA 3M3MA 1VRSD 2OACA 2J9HA 4BA7A 1H75A 1OC8A 1S3DA 3FZ9A 2YZUA 1TW9A 1YDKA 3HKRA 1GTUA 1O8XA 3BBYA 4ZB9A 2CT6A 2X99A 2NPBA 4NHZA 1QUWA 1H4OA 5D93A 1SD8A 1TK8B 3EMXA 1XWCA 4HEA2 1G6WA 4YAPA 1F9MA 3IDVA 4QL9A 3TCOA 4L8EA 1SJZA 3HVXA 1YJ6A 5AIXA 4AF2A 6GSTA 4G9HA 3VPTA 2I4AA 4PQIA 5HR0A 5EPFA 4WF5A 5DVBA 3E9JB 2JZRA 4FIWA 3M1GA 4MJBA 1YEXA 2H66A 4KAEA 3L9SA 2GQKA 3ISOA 5ECQB 2H30A 4WBRD 1OVNA 5INYA 3ZZXA 5CRGA 3LXZA 1DSBA 4LL1B 4I8BA 1F3AA 2I9HA 4IVFA 3ZTLA 5ELAA 5LD0A 4NXIA 3DRNA 4GCIA 4OFTA 2M72A 3UVTA 2WS2A 1CQHA 1TTZA 2H73A 2CVBA 2CX3A 5IO0A 3TGZA 1V57A 1GSQA 1USBA 1AQWA 4X43A 3EE2A 1WOUA 1R26A 4ML1A 1UN2A 1QGVA 3UBLA 2O8VB 5CAXA 2V1MA 2H1GA 4KCEA 5CRDA 2J23A 4MF7A 1JFUA 1EEMA 1W4VA 1B9XC 3VURA 4QQ7A 5AISA 1GTIA 2LV3A 3U6VA 1OKTA 3S9FA 2CVDA 3IRAA 3CYNA 2YWIA 2LNSA 2FGXA 4ECCA 3Q19A 5IPGA 1WRYA 3CXGA 3G7YA 5DAKB 2REMA 4PXOA 1XWBA 3P7XA 3H8QA 3FYGA 1U88A 3FR6A 4K0NA 1FO5A 1PQNA 2YN1A 2FWFA 2O85A 3W6GA 6GSYA 1WIKA 3QD9A 4MJEA 5KN0A 2GZYA 1K0OA 2H19A 2HXKA 1T4YA 4MMMA 2OADA 2AYTA 4IQAA 3UAPA 2VCTA 1FB0A 2QC7A 4O32A 1WMJA 1MDJA 3KTLA 2XC2A 1Z9HA 4IS0A 2FA4A 5JCGA 2LJRA 5D9VA 1ERUA 2C4JA 5A5KA 4KNDA 3SBCA 2N5BA 1EGRA 3ME8A 3G7IA 1ST9A 3J7Yb 4GQFA 4Q5QA 4IJ3A 3RPPA 3GIXA 2LNTA 4HQSA 4IBPA 1YEPA 3RAZA 3WD6A 1GWCA 1FB6A 3C8EA 8GSSA 2MMNA 4CDOA 5DJMA 2H6ZA 2ALBA 2FWGA 2PVOC 2BTOT 3UVHA 4N0ZA 4MABA 5CO3A 2L4QA 1BX9A 3NIVA 2WZ9A 4TN8A 3GA4A 5IOWA 4XIHA 1PN9A 2WDUA 1O85A 3WT1A 5DJLA 1S3CA 2HZEB 2JACA 1HYUA 3MNGA 2LJKA 5IOXA 3HJMA 3ERGA 1GULA 2DJ3A 2H6XA 3FR9A 2YP6A 2DJ1A 2FCHA 2HYXA 3KTBA 2PWJA 1OE7A 3E0UA 2OE0A 1TRUA 2VCWA 5F07A 3GH9A 3J7Yk 1J9BA 1X9MB 1X9WB 3H4KA 2M80A 3DVWA 6GSUA 2RM6A 1URMA 2LEGA 5ECRB 3GSSA 3FZAA 3N9JA 2OE1A 3CTFA 4GSTA 5H5QA 2YJHA 3F3RA 4KB3A 2B5EA 3PH9A 1GSEA 4K7NA 3IAM2 3TDGA 1JZOA 4KUNA 2JSZA 2RUFA 9GSSA 1R4WA 1EEJA 2L6DA 1O81A 1OYJA 4MCUA 3L9VA 3EU3A 1ZOFA 2H1AA 3TRXA 5GAND 2R37A 4N0VA 2HNLA 2H74A 1FG4A 1GLQA 4OD7A 2IMFA 1A8YA 3GV1A 5HFIA 1U87A 2YANA 4ECBA 2QSIA 3F9UA 4EXJA 1SK0A 2F9SA 3G7JA 4MPFA 4RI6A 2YWOA 1SK2A 1XW5A 4GSNA 3MWHA 1PD21 1TKDB 2PU9C 2LTKA 5KEJA 1SKWB 1OE8A 4LMWA 4IW9A 3IC4A 2LQOA 3QCPA 2IYJA 2H75A 2XHFA 1A0FA 3DD3A 1R5PA 2GZPA 2VLUA 4NMUA 3FKFA 2MMAA 2JADA 2I3YA 1PRXA 3WYWA 4TW5A 5J3RA 3FZ5A 3UBKA 3H93A 4IQ1A 4X1UA 1M2AA 1Q4JA 2B1KA 2L57A 3ERFA 5DCGA 3DWVA 1K3YA 4J2FA 5GAPD 2CAIA 3HJPA 5HFGA 3IPZA 2QKEA 1JLVA 3I9V2 5B7CA 2VM1A 1K3LA 1FAAA 3KD0A 2BJXA 2F3MA 4GLTA 12GSA 2VCXA 2K18A 2VL9A 1U6TA 2L4CA 4HU9A 5CNWA 4ZL9A 4DSSA 5LNKe 2AB6A 4AGSA 4HJ2A 2ON5A 2N5AA 1QXHA 5DALA 3MSZA 1AIUA 2AJQB 2GSSA 4MLYA 2IMEA 2PBJA 2K6VA 2LJAA 1FVKA 1GSFA 3I43A 3RPNA 1ON4A 2XPDA 1HNAA 5J5NA 1VF3A 1T1VA 1VF1A 3F3QA 5G31A 1EOHA 4OFMA 5JCUA 4JR4A 4XRDA 1YF0A 3FEUA 1T8EB 3I6AA 2H8LA 1ERTA 1XW9A 2K9FA 3QMXA 3APQA 1Z3EA 1Z5YE 2O89A 3TRPA 2H70A 1AQVA 4JBBA 2GT6A 3D4TA 2V2GA 4OWYA 2NBSA 1GSYA 2VCVA 3APOA 4EDYA 3HVVA 3KM6A 4XCSA 3KH7A 6GSVA 1SL2B 3QPMA 3D0ZA 3GL5A 1MDKA 3NOFA 2WRTA 1GRXA 3UL3A 4F82A 1TU8A 3HCZA 4ZBDA 1XWGA 4HDEA 3ZIVA 1ML6A 4E8EA 3ZIJA 4XS1A 3KJYA 4KCAA 2QGVA 5CRWA 5AGYA 1G0TA 1ABAA 3NZNA 1WE0A 1BAYA 1WPIA 3EURA 1Y25A 4OO4A 5F05A 2K8VA 2RM5A 1AAZA 1SU9A 2JSYA 1THXA 4PQHA 5AIVA 4TKYA 4XS4B 4GQCA 4K1FA 2ON7A 2V32A 5G5FA 3RBTA 4KDXA 17GSA 5ECLB 1NHYA 4BL7A 3VPQA 1TP9A 4F0BA 2DC5A 5F8BA 2HE3A 1EV9A 4FH8A 2IMIA 1AC1A 3US3A 4TR0A 1XCCA 4YQUA 2HRNA 1LU4A 4ZL8A 1U3AA 2YWNA 2H76A 4KDUA 4DSSB 3MAKA 2C3NA 4HZ4A 4MJCA 1ZL9A 5DALB 4ZL7A 4N30A 3HHVA 2TRXA 3UJ1A 4PURA 3GN3A 3R2QA 5DQYA 4LL4B 5B6NA 3FY7A 1B48A 1KTEA 2V41A 3CTGA 2IMKA 1K0NA 3KEBA 4V1Ag 1KEBA 3GTUB 2MMOA 2C3TA 2XPEA 2HZEA 3GX0A 1HD2A 4TXOA 3P8WA 1TRWA 5G30A 1AW9A 1VF4A 3F63A 4MPGA 1T00A 4K6XA 3TUEA 2LQQA 2C0DA 5HR3A 2PMTA 1UC7A 2PN8A 1WWJA 3PR8A 2V6KA 3KH9A 3Q18A 4AJ6A 3ZVJD 1ZYEA 2VL3A 2FY6A 4IHUA 2KP2A 1E6BA 3ED3A 3GX8A 4XRAA 4IJIA 1GLPA 1FW1A 3IA1A 5IMAA 1FHEA 2HSYA 2C80A 3IBHA 3KXOA 1TK0B 4TVEA 3C1SA 4G2EA 3JCML 3WGXA 4K2DA 3ZVJA 16GSA 2NDOA 4GRFA 1BEDA 3TKPA 3U5RE 1OKDA 2G2QA 4DVCA 5CYYA 2GSRA 3LQ7A 2KUCA 1MTCA 2AUVA 4L0UA 3GYKA 1XIYA 4POKA 1CQGA 1FOVA 3DVXA 4H86A 1HNCA 2DJJA 3QFAC 2YV9A 5ECSA 4GWRA 3LYKA 2H72A 1K0DA 3KIJA 1PKZA 2VIMA 3F6DA 4I97A 3DMLA 4ID0A 1V2AA 2DJ0A 1K0AA 1F2EA 2ZUPA 3IK7A 1PGTA 1TOFA 1TXXA 2YZHA 2H71A 4ILFA 2V6OA 1O6JA 3UMAA 2GQLA 4DSRA 3L4NA 2WJUA 1GUMA 2L5LA 4PQ1A 4WF4A 4EO3A 5IO2A 2B7KA 4TXOB 5C00A 2GLRA 3GL3A 4O5RA 1OAZA 4ZIJA 22GSA 3GKNA 4NHWA 1A0RP 1TRVA 3FR3A 3TKSC 3LWAA 2L5OA 2X8CA 4JZQA 4AJ7A 4EKZA 1SJ6A 1A23A 1Z7RA 3HA9A 3RHBA 4GTUA 4CHSA 1B4QA 1XWAA 3ZLPA 4IP6A 4L0WA 3G9BA 5JWOB 2LRTA 1A24A 3PGTA 2FD3A 4POLA 3KMNA 3DKSA 2IPAA 2I1UA 3F4RA 4ML6A 4KE3A 1TI3A 3BCIA 4ZILA 2Z9SA 2VM2A 3Q6OA 2RUEA 5COHA 4FYBA 4BVYA 4KX4A 3D21A 4JU5A 2K8SA 1GUKA 3TKRA 4CW9A 1BQ7A 3VWWA 1MD4A 1TJDA 2GDRA 4MH3A 3A2WA 1EV4A 2A2SA 3UEMA 1I9DA 5J9BA 4BWSA 5D9TA 4FO5A 1ERWA 3BJ5A 2WCIA 1XOBA 4FYUA 1W89A 1GSDA 1EOGA 5A4VA 6GSSA 3M0FA 3W8SA 5H5SA 3ZFBA 2IL3A 4NWYA 2H0HA 2R4VA 3VI5A 3WGEA 4EC0A 5JCWA 4MZWA 1NHOA 3PINA 3C71A 2HI7A 1U3IA 2WB9A 20GSA 1SL1B 1M9AA 4PUFC 4HJMA 2OJLA 1GSSA 4ZXGA 5KN3A 1ACVA 4MZBA 2GTUA 3E3EA 4NPBA 4V2NA 5J4UA 5CRHA 3EYTA 4V2LA 3DIEA 3GKXA 4F9ZA 5DQSA 4XHMA 5GZZB 1A8LA 1B4PA 5C04A 10GSA 1KNGA 4TXVA 1PX6A 1WP0A 4EVMA 3HZ8A 3IE3A 4XS4A 3GURA 1XWKA 5ECIB 1RQMA 4MF6A 4RI7A 3RHCA 3TKSA 1AQXA 3M8NA 4N10A 4X0XA 1XBSA 4K8MA 4KGIA 1PL2A 1BYEA 2FUG2 2DBCA 4Z7XA 4PNGA 2MMZA 2GSTA 2O7KA 3ZL5A 4YAVA 3QR6A 4OO5A 3EU4A 1IYHA 3LYPA 3DEXA 1YF1A 1T4ZA 5FHIA 2OKAA 1M2DA 2HRFA 5D96A 4MDCA 3GNJA 1B9YC 4YH2A 1PMTA 1EZKA 4XS6A 4WEYA 1GH2A 3C7MA 3ERWA 3TB2A 1Z7PA 5B8AA 1AXDA 3VWUA 2OBKA 4YQVA 2JZSA 2FNOA 11GSA 3HDCA 5JWRB 2PPTA 2YCDA 4I5QA 4KDYA 2P5QA 2XBIA 4NV5A 2A2RA 2L6CA 3C73A 3EVIA 1SKRB 3VWXA 1Y6EA 3GTUA 1O8WA 1B8XA 2LRCA 3LFLA 1Z6NA 2VD0A 1X0RA 2B6MA 1X5DA 3HJOA 3VFIA 1G7EA 2VAFA 2D2ZA 4TR3A 2LSTA 2OA7A 3SWLA 3O76A 1PL1A 4YQMA 4IKHA 3WT2A 1Z6MA 3O6TA 2HZFA 3IAS2 3KGKA 3QOUA 1YKCA 4J57E 3LXTA 1OC3A 2E2MA 1A2LA 2VL2C 2F51A 3L0HA 2MZCA 1THOA 1SENA 1EGOA 2B7JA 1PX7A 3H1NA 3H79A 1GUHA 4HZ2A 3F6FA 1F6MC 3CSHA 4ZBBA 4MP4A 2B1LA 4V1Ap 2FWHA 4TR1B 2EIRA 4ZB6A 4LLRA 2H0IA 1GL8A 3TJKA 3IV4A 2HFDA 19GSA 4KSOA 3ZFLA 1K0MA 2TIRA 2FA8A 1TDIA 3GRXA 2MYGA 4MA9A 1TI1A 1MD3A 3Q74A 2C8UA 1FVJA 2HSHA 1X9SB 5D8IA 2DMMA 4ECIA 1TU7A 2GSQA 4Q5FA 5F0GA 2LRNA 1GNEA 2CZ2A 5GSSA 1VGLA 4ZB8A 3GSTA 3VK9A 4RQRA 1XPVA 1YY7A 2DJ2A 1K3OA 1F37A 3EINA 4MJAA 1EP8A 3APSA 1XW6A 2CX4A 2E0QA 3A5WA 3TRQA 4L5LA 1T7PB 1JHBA 3DGQA 4BWQA 5CREA 2CAQA 2X64A 1R7HA 2YNXA 3ZYWA 5EL8A 3VLNA 4DSQA 4OMVA 4BVXA 4F0CA 4GSSA 4F03A 1WJKA 4MZCA 4POMA 4IGJA 3O3TA 1SL0B 3IK9A 5IMVA 1RK4A 2B5XA 2VUPA 1HNBA 5ID2B 4LMVA 5G1LA 3TJJA 4MK3A 3UARA 3A2VA 2H1DA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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