4I5Q | Genus

Total Genus 65

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	65
sequence length	220
structure length	220
Chain Sequence	AMDPEFMDAAIRQSLAKLGVQSTEIQASPVAGMKTVLTHSGVLYVTDDGKHIIQGPMYDVSGAHPVNVTNKLLMSQLNALEKEMIVYKAPDEKHVITVFTDITCGYCHKLHEEMKDYNALGITVRYLAFPRQGLESQAEQDMKSIWCAKDKNKAFDDAMAGKGVKPASCDVNIADHYALGVQLGVSGTPAIVLSNGYVVPGYQGPKEMKAFLDEHQKQTS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of the periplasmic disulfide-bond isomerase DsbC from Salmonella enterica serovar Typhimurium and the mechanistic implications. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Thiol:disulfide interchange protein DsbC
molecule tags	Isomerase
source organism	Salmonella typhimurium
total genus	65
structure length	220
sequence length	220
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-11-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF10411	DsbC_N	Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A	PF13098	Thioredoxin_2	Thioredoxin-like domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.450.70	Alpha Beta	Roll	Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,	Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal	4i5qA01
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4i5qA02

2CX4A 1GLQA 3F8UA 2H1GA 3GX0A 3PR8A 3KH9A 2LSTA 3ERFA 3ZMLA 4YAVA 1EWXA 1U6TA 5AISA 2EC4A 1R4WA 2RM5A 1R5AA 2FHEA 2AUVA 2IFQA 2P31A 1B4QA 3FEUA 1V2AA 2OE0A 4K7NA 2H72A 3MSZA 1CQHA 2OBKA 2GT6A 2GTUA 3LEFA 4XS4A 3GKKA 1LBKA 2PERA 4J57E 3VWUA 2ZCTA 2HE3A 1LJRA 1T00A 2X64A 4MDCA 2IMKA 1J0FA 5JCWA 5JWQB 1M9BA 4WR5A 3E9JB 3GSTA 5B8BA 5HR2A 2R2JA 3TKPA 2O87A 2F8AA 4EE0A 4EUYA 2FD3A 4CHSA 13GSA 2VCXA 5FHIA 2BMXA 19GSA 4XIHA 1XVQA 1SK2A 2DSAA 1F9MA 2XBIA 4I6XA 1A8LA 1J08A 3IBHA 1TU8A 3TJBA 4AGSA 3IRAA 4MJBA 4PNFA 5D9VA 4J2FA 2WB9A 3GH6A 3QCPA 3GSSA 2CQ9A 1JZDA 4NV2A 1ILOA 2OACA 3F6DA 3IR4A 1XOBA 1DBYA 3ZFBA 5ECNB 4ZB8A 2C4JA 3RPPA 3C1SA 1ABAA 2C3TA 2IPAA 4HQZA 1T3BA 2C3NA 3HCZA 1VF2A 1XIYA 4PQHA 4NWYA 4ACSA 4ZBDA 1SJIA 5COHA 1G7EA 5B8AA 3RHBA 3VWXA 2VD1A 3ZFLA 1N8JA 1O81A 5HFKA 5EY6A 3IK7A 4MF6A 4HU9A 3KEBA 4RQRA 3TCOA 2DJ2A 3UVHA 2PVQA 2H71A 4PUAA 1PA3A 1QMVA 2J9HA 4KUNA 3IHQA 2CZ3A 2MBSA 2NDOA 1IYHA 3UVTA 3LXTA 3TJKA 4LMVA 3U5RE 3DWVA 1JZWA 5E4WA 1WPIA 2GLRA 5H5QA 2O7KA 3LSZA 4TXVA 4YAPA 1V58A 18GSA 3H4KA 3FZAA 2H75A 1U3AA 1MD4A 3G7JA 3MAKA 4RI7A 2BJXA 1K0CA 2OJLA 4TXOA 3KCMA 4NHWA 1OC8A 4BPYA 3CXGA 4PUFC 1X5DA 3IDVA 2ZNMA 4G10A 1G0TA 1TK0B 1J9BA 2XC2A 2FNOA 4FYUA 4OCFA 4XHMA 5GZZB 5CRDA 1BG5A 3GUSA 2VO4A 1SJ6A 1SK1A 2OE1A 1PQNA 1S3DA 4F2IA 1OYJA 2IMEA 4AJ7A 2FA8A 3LJRA 1U88A 2IY2A 5DAKB 2B6MA 1WOUA 2GZPA 2VCWA 3KTBA 1YZXA 2YZUA 3BBYA 3PH9A 5GAPD 1B8XA 5G5FA 2LJKA 1SKWB 5D9TA 2HZEB 3LQ7A 2GQKA 1AQVA 3F3RA 4WETA 2ALBA 5ECLB 3IC4A 2Z9SA 3O6TA 5ECSA 4YQUA 4HOJA 3M3MA 3P2AA 3EU4A 2O8VB 3E3EA 1TRWA 1UA5A 1VGLA 1GNEA 2LKUA 4FIWA 4L5LA 5J9BA 1A8YA 3GKXA 5J41A 2FUG2 3V1WA 5GSSA 2AB6A 5HR0A 3A2WA 3EMPA 3TKRA 3F6FA 1QUWA 1BEDA 1ERVA 1GSSA 2H0GA 4YQMA 4KNDA 2XPEA 3TJGA 6GSVA 3GKNA 1TDIA 2FWHA 5ECKB 1ST9A 1WMJA 4LA1A 5HR1A 2I9HA 3DRNA 1U87A 2E2MA 3UBLA 2LQOA 3A3TA 3QMXA 3CRTA 1WWJA 3GA4A 3MWHA 1X9WB 2VL9A 2R37A 5KN0A 3VWVA 3UAPA 3US3A 8GSSA 1KTEA 4DSRA 1A23A 5D93A 4HJ2A 1JHBA 1V98A 1Z6MA 4Q5RA 3KGKA 4F0CA 2RUFA 3MNGA 2I81A 3FR9A 2V6OA 1V9WA 3QAGA 3HA9A 1XBSA 1VF4A 1NM3A 2C8UA 3BCIA 1M9AA 4TR3A 3KMNA 1OKDA 1GSEA 1PGTA 2L6DA 2B1LA 1TRSA 3ZYWA 5HQPA 2VL2C 1TP9A 4GSSA 2I3YA 1TK5B 1V57A 4TKYA 3ZREA 4ID0A 2DJKA 1W4VA 1AUCA 2H66A 1XWCA 3TOUA 1WE0A 2VD0A 4I5QA 3DYRA 3UARA 1WIKA 1GTBA 4KX4A 1A2MA 2JADA 3HVVA 2VM1A 4F9ZA 4MK3A 5FWGA 1PN9A 3IXRA 4PNGA 4N10A 3GNJA 4DVCA 2QKEA 4ZIJA 4JEDA 2K9FA 5DALA 4MJAA 5IIZA 5F07A 2H0IA 2K8VA 3L9VA 3VK9A 4HQSA 4RQXA 1XVWA 4IW9A 4RI6A 1K0NA 3D22A 2PUKC 3HVXA 2H01A 2PN8A 2GSTA 4WF4A 3RBTA 1B48A 3ZMKA 4IS0A 1GSUA 2KP1A 3UL3A 5G1KA 3TOTA 2YWOA 1QXHA 1XW5A 4IVFA 2B1KA 3CSHA 1YKAA 5DALB 2VUPA 4EVMA 3IAS2 1JZRA 5IO0A 4OO4A 2V32A 3RPNA 1NHYA 3FR3A 2OADA 3ZITA 4O32A 16GSA 5ELGA 3H1NA 3FYGA 3FZ9A 3Q6OA 5LCZA 5EPFA 4O7HA 22GSA 2JZSA 3EVIA 17GSA 2CZ2A 4ISDA 4G9HA 1PD21 1A2JA 5CRWA 5ECHB 2AYTA 2OA7A 1C72A 4X43A 3FZ5A 4EL1A 1MD3A 1M2AA 3F4SA 3CTGA 3LXZA 1XWBA 3BCKA 2H73A 4V1Ag 4ZBAA 4WKWA 4ZB9A 3P7XA 1WP0A 4K6XA 1PMTA 4IHUA 4DSSB 3M0FA 2X8HA 1OC9B 4MF7A 3DGQA 1GSDA 3KD0A 4NMUA 4XS1A 1X5EA 3SBCA 3G7YA 4OMVA 1T4ZA 3M9KA 1BX9A 3HVSA 4ZL9A 3ERGA 2LJAA 3DMLA 4WXTA 1TW9A 4GSTA 2L57A 2G2QA 2H1DA 3F4RA 1Z7PA 2HSHA 2DJJA 2CVKA 5J5NA 4ML1A 3IK9A 1R7HA 3ZVJD 4QL7A 4Q5QA 5ID2A 1K0MA 4LMWA 5D96A 3FR6A 4TR4A 1M2DA 1SJZA 5GSTA 2V41A 1OE7A 1GTAA 1Q4JA 2H30A 3IA1A 6GSXA 1HNAA 2JL4A 3DVXA 2PU9C 1THOA 4PQ1A 1GL8A 4MLYA 1NSWA 1O85A 4EDZA 5F05A 4GWRA 1XOAA 1TRVA 4IELA 5ID2B 2JZTA 4TRXA 4IKHA 1ZYQB 1QFNA 3WYWA 5DBQA 2YWNA 2P0GA 2LV3A 1X9MB 4KCAA 3EU3A 1LU4A 3CMIA 2MMOA 4O5RA 4OCEA 1GSFA 4Z7XA 2MYGA 3AY8A 2AJQB 2F51A 2QGVA 3Q19A 3Q74A 5ENUA 1K0BA 1RW1A 4WR4A 2O85A 3KH7A 3DXBA 3HKRA 4GXZA 4AF2A 1XZOA 3EE2A 3FZ4A 1MDIA 4EO3A 1PL2A 4JR4A 4XS6A 4KDXA 4F82A 5J4UA 2YWIA 3IE3A 3CRUA 1W89A 2H1AA 4N30A 4POLA 1O73A 4K0GA 2K18A 3D6IA 4TR1B 1NW2A 3GX8A 5HFIA 3GN3A 4RUVA 5B7CA 3GH9A 1GUKA 5E59A 3N5OA 3QR6A 2IMFA 1WJKA 4NXIA 2CVBA 5C00A 4MJEA 2A2SA 3TKQA 1R5PA 2HXKA 2E0QA 2C0FA 1K3OA 5IMDA 4EXJA 2HFDA 1WRYA 2LRNA 3EURA 1GLPA 4FO5A 3D4TA 2D2ZA 5A4VA 1A24A 3LYKA 2KOKA 3A2XA 1EEJA 4BWQA 1FHEA 4MPGA 2RLIA 3TRXA 3LWAA 2E7PA 2LJRA 1TXXA 5D8IA 1QQ2A 2M46A 2GSQA 1SENA 1K0AA 4TW5A 1XWKA 5EVOA 5A5KA 2H0HA 5CNWA 2DJ0A 3BOAA 3C73A 3KM6A 4IN0A 4FH8A 1M99A 4K0NA 5ABRA 1PRXA 4JZQA 1BYEA 2FWFA 2XHFA 5DAKA 2PPTA 5EL8A 2ZUPA 2CVDA 2JU5A 5KN2A 5G30A 1PL1A 4K2DA 4XRAA 1Z9HA 2LRCA 5F0GA 3KJYA 1YQ1A 1BJXA 2HZEA 5A4WA 1O8WA 3C8EA 1G6WA 4XTSA 3RDWA 1DE1A 1GTIA 1XW9A 2HLSA 3WGXA 3EWLA 1ZL9A 4ECIA 3F9UA 4P3YB 1F3AA 3CBUA 1M7TA 5ECPB 1BQ7A 1GUMA 1SYRA 1ZOFA 2CT6A 3G7IA 2KLXA 4MF5A 4BVYA 1YEPA 2P5RA 11GSA 5IOWA 5DQYA 4PGTA 4HZ2A 3HHVA 5IO2A 3HJOA 4F0BA 3A5WA 4GSNA 1YEXA 3GV1A 3A2VA 3DKSA 1GSYA 1AQXA 2V6KA 3KP8A 2CAQA 2LTKA 2FWEA 4IGJA 1JZOA 3P90A 5IMAA 4HZ4A 2X8CA 3W8JA 3SWLA 1FO5A 5A4UA 1K3LA 4GQFA 2IN3A 2FCHA 1B4PA 1MTCA 1XPVA 1UVZA 2ES7A 3VLNA 3GYKA 5C04A 1V40A 5LD0A 2IMDA 2JZRA 2N5BA 4NAXA 2L5LA 2GQLA 3F4TA 2VCTA 1VF3A 2HRFA 4FYCA 3F3QA 1KNGA 3J7Yk 3VI5A 1B9XC 4ZILA 4ML6A 2PBJA 2NPBA 2YCDA 3I9V2 2DBCA 2IL3A 1R26A 2TRCP 3S9FA 1I9DA 2LRTA 2C0GA 1OC3A 5DDLA 4V1Ap 1Q98A 6GSYA 1HD2A 2YNXA 4QL9A 1USBA 1ZZYA 5IOXA 1OKTA 2YJ7A 1EV4A 5H5SA 1ERUA 3QOUA 4OO5A 5CRGA 1TI1A 4MJCA 2IIYA 5B6MA 4KGIA 2DMLA 2H74A 3GTUB 2PMTA 1TRUA 2MMNA 4TN8A 2ON5A 1FVJA 4Q5NA 3TDGA 1AC1A 2ON7A 4D73B 1A0RP 2B3SA 4POMA 1EOGA 1GNWA 3D21A 2RIIA 4V2LA 4JE1A 3C1RA 3ZL5A 4MZCA 4MMMA 5ECMB 3HYPA 3TJJA 2VL3A 2DLXA 1EOHA 4K7IA 1I5GA 1TOFA 3CYNA 4F03A 2A4VA 1FW1A 2N5AA 2BTOT 2YPMA 3KXOA 2HYXA 2EIQA 1K0DA 5F06A 4HU7A 3GFKA 3U6VA 2M80A 1PKZA 1SK0A 3GIXA 3H8QA 2VL2A 4G19A 3ZTLA 4K8MA 1FG4A 2YJHA 3EMXA 3GRXA 1PSQA 1KBNA 4AJ6A 5KN3A 3QD9A 1O7UA 1EZKA 4PQIA 3QPMA 1UC7A 4IQ1A 3EINA 2YZHA 3ZZXA 3QFBC 4EDYA 2N5FA 4JU5A 3IAM2 5F8BA 4IQAA 10GSA 1TJDA 4E8EA 1JFUA 2WDUA 1SKSB 3WT1A 2YOIA 1ML6A 2F8FA 1ZGNA 3P8WA 4E8HA 1SD9A 4DSSA 2PVOC 3K8NA 2H6XA 1OC9A 1TKDB 2E2GA 5G31A 4ECCA 1ERWA 4ZL8A 2B7KA 2GVPA 4OWYA 3GKMA 2FY6A 2B5YA 3M1GA 5DJMA 3GL3A 1F6MC 4EF0A 2LQQA 5AIVA 1XW6A 4V2NA 3QAWA 3KZQA 1XWGA 3PINA 2GSSA 4H86A 3F63A 4MH3A 1FOVA 3ZLPA 4NPBA 2CAIA 4MA9A 2KP2A 3OR5A 4GTUA 1VF1A 6GSWA 1QK8A 2PGTA 1GRXA 5IQYA 3VI7A 3D4MA 2CA8A 4KSMA 3TUEA 2TIRA 1ACVA 4KCEA 4G2EA 4GRFA 3FY7A 1DUGA 1MDKA 4KDUA 3FKFA 4LL4B 2A2RA 2OBIA 2OKAA 5CO3A 4MZBA 2K6VA 1S3CA 2C0DA 2LUSA 5JWRB 1PX6A 4L0WA 3C71A 1YKCA 4ZXGA 3L78A 4N0VA 5ECRB 2I1UA 20GSA 1N2AA 4IP1A 3H93A 4I97A 3LFLA 1NHOA 2L4CA 2H8LA 4X1UA 2NBSA 2VOCA 2XBQA 2MZCA 4HI7A 2DIYA 4CDOA 1SL2B 2IFQB 3GL5A 5H5RA 7GSSA 1O8XA 1Z7RA 2DMMA 9GSSA 1HNCA 1B9YC 1Y25A 1SU9A 4TR1A 4K7OA 3NOFA 2L5OA 1Z6NA 4XS4B 2B5EA 3ERWA 4GQCA 4AJ8A 4TVEA 3TB2A 4K1FA 2H6ZA 4DSQA 2HI7A 1OVNA 1X9SB 3J7Yb 1E2YA 3ME7A 4KH7A 3ZIVA 2WZ9A 1HNBA 3PGTA 2VIMA 3UIWA 2V1MA 2V2GA 2R5GA 1TU7A 3UBKA 5G2ZA 14GSA 2KUCA 2WS2A 2R6KA 5AN1A 2K8SA 1GUHA 4JBBA 5L71A 2J23A 4OFNA 1YY7A 2NVLA 2B7JA 4N0ZA 1ZMAA 1GH2A 3IV4A 2QSIA 4OFMA 2WRTA 1AW9A 2VCZA 3KTLA 5ELAA 2OE3A 1Z3EA 3NIVA 5ECQB 2GQMA 3ME8A 3E0UA 1AAZA 3VWWA 4I8BA 3CTFA 3UOMA 5LNKe 1A2LA 1X0RA 3LG6A 3ED3A 3Q18A 3I69A 4MH2A 2CV4A 4ILFA 2R4VA 3LYPA 4IJ3A 4PX1A 1IYIA 3TGZA 3WGEA 2MMZA 4BL7A 2XPDA 1G6YA 4BWSA 4O92A 4MP4A 1Z5YE 3QAVA 4L5OA 2I4AA 2YANA 2PWJA 3M9JA 3L0HA 3HD5A 3JCML 3QFAC 3TRQA 1EV9A 2IJYA 2F9SA 2TRXA 3WD6A 4IBPA 1EEMA 1GSQA 1RQMA 4CW9A 3CSJA 5DCGA 3DEXA 1YF0A 3GMFA 3N9JA 2H1BA 1F37A 2RUEA 3TKSE 2X99A 4IP6A 1JLWA 1VRSD 2GT5A 2JSZA 2CX3A 1T4YA 4WF5A 3DD3A 5CREA 2AAWA 4NHZA 1OAZA 5IMVA 4XCSA 1M2BA 3UJ1A 2LNSA 1T1VA 3FHKA 3C7MA 3VPQA 5D9WA 3HXSA 3L9UA 2C80A 2NTOA 2R3XA 1XFLA 3TKSC 1K0OA 3IPZA 3KMOA 4KE3A 5DJLA 6GSTA 4MZWA 4TXOB 3HJPA 5DQSA 1H4OA 1FB0A 5KEJA 3QDNA 2L59A 5CYYA 1OE8A 1URMA 3LGCA 4TOPA 4KAEA 2GZYA 3DIEA 5CP1A 2FA4A 2C1YA 3APOA 6GSSA 2JSYA 1EGRA 4YQVA 4MPFA 3FK8A 4MCUA 2EIOA 3W6GA 2MBTA 3HJMA 4I2UA 4PURA 5JCGA 4WEYA 3RAZA 4HUAA 5IMZA 1MEKA 2IYJA 2DC5A 2WULA 3TKSA 1EP8A 4JRRA 3G9BA 4OD7A 1AXDA 2YV7A 3HY2A 3ZIJA 3I43A 12GSA 2YV9A 1FVKA 2LNTA 4V2MA 5IPHA 3APQA 1ERTA 5G5EA 4L0UA 2L4QA 2B5XA 2O89A 3DVWA 2X8GA 4DEJA 5CAXA 6GSUA 4ECBA 4GCIA 4KB3A 3F0IA 1O6JA 1FB6A 3GHAA 3TRPA 1T8EB 3WGDA 4HDEA 5D73A 1RK4A 2VM2A 3GTUA 4ULXA 2HZFA 5ECOB 1PKWA 3D0ZA 4LL1B 1ON4A 4PXOA 3GURA 4D73A 1U3IA 2JACA 1ZCPA 1XXUA 2FWGA 3BD2A 3O3TA 2WCIA 4TR0A 3RHCA 5IM9A 1AQWA 2FGXA 4OFTA 4KW6A 3L4NA 2LEGA 3KIJA 4K9ZA 4EKZA 1SYXA 5D9XA 5HR3A 2EIRA 5HFGA 2WFCA 4X0XA 4LLRA 1UN2A 1T7PB 2HT9A 1X5CA 1AIUA 5CRHA 2WJUA 3ISOA 3WT2A 3ZVJA 5KN1A 3H79A 4ZBBA 3KP9A 2C0EA 1YF1A 1A0FA 5JWOB 3VPTA 2VCQA 2MMAA 1K3YA 5DCHA 5IMCA 4HS1A 3HDCA 1FAAA 2HNLA 1BAYA 1DSBA 1G7OA 3APSA 3W8SA 1MDJA 3MDKA 1GWCA 3I6AA 2DJ1A 2P5QA 4Q5FA 2AV4A 4WBRD 2F3MA 2H19A 5INYA 4BA7A 3VURA 4WBJA 2LS5A 4IJIA 2YP6A 1F3BA 4MABA 4JR6A 1M0UA 2H76A 1XCCA 1SL1B 2YWMA 5G1LA 4POKA 4POBA 5DVBA 3R2QA 3UEMA 1Y6EA 4I2TA 2IMIA 1KEBA 2L6CA 3O76A 4EC0A 1HYUA 2KHPA 4ECJA 3L9SA 4YH2A 2WGRA 2VCVA 2HRNA 5B6NA 1PX7A 3ZRDA 3UMAA 4ZL7A 2GZZA 2M72A 4KDYA 4J56E 2FLSA 1H75A 4QQ7A 1DE2A 2H70A 2DJ3A 3CSIA 3HZ8A 2QC7A 2GGTA 4NV5A 2VLTA 3LORA 2C3QA 2DIZA 2VLVA 1S3AA 2REMA 3IOSA 3D5JA 4KA0A 2RM6A 1F2EA 2GSRA 5IMFA 5ECIB 1E6BA 1GP1A 1SD8A 5AIXA 1TI3A 4XRDA 5JCUA 3EYTA 3EC3A 3M8NA 2GS3A 1TK8B 1SL0B 2HSYA 1YJ6A 2VLUA 4L8EA 3HZ4A 2IWTA 1HQOA 3FW2A 3NZNA 1CQGA 3TJFA 5AGYA 1QGVA 1THXA 2H6YA 3VFIA 5J9CA 1GTUA 2AHEA 4FYBA 1YDKA 1ZYEA 5GAND 1TTZA 4N11A 4GF0A 5J3RA 5IPGA 2VAFA 1EP7A 1SKRB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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 5FT3 A;  4HEA 2;  4GLT A;

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4I5QA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations