The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
109
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structure length |
109
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Chain Sequence |
MTLELQLKHYITNLFNLPKDEKWECESIEEIADDILPDQYVRLGALSNKILQTYTYYSDTLHESNIYPFILYYQKQLIAIGYIDENHDMDFLYLHNTIMPLLDQRYLLT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Uracil-DNA glycosylase
|
| publication title |
Using structural-based protein engineering to modulate the differential inhibition effects of SAUGI on human and HSV uracil DNA glycosylase.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Hydrolase inhibitor
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| total genus |
28
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| structure length |
109
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| sequence length |
109
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-09-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF06106 | SAUGI | S. aureus uracil DNA glycosylase inhibitor |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, | Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KCD A; 5AYS C; 3WDG B; 5AYR B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2CWU A; 2CHC A; 3B7C A; 3RNT A; 4HM3 B; 1AQZ A; 3E99 A; 3GWR A; 8RNT A; 5CF1 A; 4XB5 A; 3LH4 A; 2XF3 A; 4O2H A; 3CCQ 3; 1YJW 3; 2OTL 3; 1K28 A; 1IVW A; 3RGR A; 4X2O A; 1BSD A; 5CF2 A; 1N5H A; 3LTC A; 1LOY A; 2UGI A; 3NV0 A; 2MC8 A; 2H0I A; 1WQL B; 4HM6 B; 4BTW A; 1JKG A; 4BL2 A; 1UCK A; 5JBS A; 3GRD A; 5GSP A; 1ROA A; 2QIY A; 1BNE A; 3NBJ A; 1LNH A; 3LOY A; 4HJL B; 3ZG5 A; 4WYK B; 2XFT A; 2ZL8 A; 1Q9E A; 1X1W A; 1T3B A; 1GY5 A; 5AI1 A; 2HOH A; 5HOH A; 4JRF A; 2P09 A; 2F5W A; 1UGH I; 4LZI A; 2XSH B; 3AGO A; 2BHM A; 1IQ8 A; 1I8V A; 3FGY A; 1BRG A; 3HI7 A; 1EUI C; 1OAC A; 2Z77 A; 5JPU A; 1PFP A; 3UL6 A; 1FUS A; 1MWS A; 3FG4 A; 3ZFZ A; 1GYB A; 3NX0 A; 4EBG A; 3OX9 A; 2F4Y A; 1RTU A; 2MF7 A; 1QAK A; 4FMD A; 1QJG A; 2KRT A; 2UUG C; 5G1K A; 9RNT A; 1BUJ A; 1BNR A; 2F86 B; 1RJO A; 4HYZ A; 3X40 A; 5KP1 A; 3SED A; 1SQW A; 2XEP A; 3KSE D; 4HM5 B; 1WTH A; 2YFJ B; 3DGO A; 1DE3 A; 5JPP A; 1RKY A; 2W6J H; 1I2F A; 3LYG A; 3S28 A; 1VQ9 3; 4QWT A; 2QEX 3; 4MEI A; 3U97 A; 4N6V 0; 2KXG A; 1JJ2 2; 1MWR A; 1YGE A; 1V74 A; 4N6L A; 3SOY A; 2OOV A; 5STD A; 1W5Z A; 1LQM B; 3PZW A; 1AVK A; 1RCL A; 3LXU X; 2P0M A; 2BO9 B; 1UCI A; 4CPK A; 1Q40 A; 4N6O B; 1K9M 4; 3LTB A; 2KCD A; 2W9Q A; 4O8S A; 1AVL A; 1IVU A; 3UNL A; 4BTY A; 6GSP A; 1MWU A; 2INX A; 1LQG C; 4STD A; 4HM2 B; 1G02 A; 1VQM 3; 3D9R A; 1TU5 A; 1B21 A; 1C54 A; 1V58 A; 3F40 A; 1RRH A; 1Z1S A; 1RN4 A; 2FGT A; 5CLK A; 3RGA A; 1I0V A; 1JBR A; 2CG0 A; 1TUH A; 5AEW B; 1GOV A; 1HU9 A; 1RSN A; 3LT9 A; 1T2H A; 3NM7 A; 2XRX B; 1UCJ A; 2ZDJ A; 1JB5 A; 3PCS A; 3MSO A; 1BRK A; 1N9E A; 2GBW B; 2GU1 A; 1YJN 3; 3A5E A; 1IVX A; 1EKM A; 1RCK A; 4G1M B; 4HM1 B; 4ZM8 A; 4N6N B; 1BRH A; 3STD A; 1IK3 A; 3BNE A; 3FLJ A; 1YNV X; 3U1W A; 2ML5 A; 1OGX A; 3NM2 A; 3HZP A; 1Q86 4; 3MG3 A; 2JDI H; 1VQP 3; 1BRJ A; 1BNI A; 4WP5 A; 1PY3 A; 4I4K A; 5IG3 A; 1W2B 2; 1B2S A; 1G0T A; 3S67 A; 1BSC A; 2RBI A; 4LYL B; 4FCM A; 5D81 A; 4MMY B; 1BNF A; 3EHC A; 5IEO A; 1T2I A; 5RNT A; 1B3S A; 1MWT A; 1D6Z A; 3MHE A; 1MOL A; 4J8T A; 3LTD A; 5M1A A; 1J2B A; 2IY2 A; 2WGO A; 1BSB A; 2BU4 A; 3MG1 A; 3MYT A; 3QRD A; 1JNQ A; 1OH0 A; 5BVB A; 1I0X A; 5BU4 A; 3OW2 2; 2V1L A; 8CHO A; 3N8B A; 5IG5 A; 1YGW A; 1PYL A; 1GS3 A; 1LOW A; 4K1V A; 1ZX2 A; 2AAE A; 1JBS A; 2O9U X; 1LRA A; 1RGL A; 5G1L A; 3D3L A; 2B24 B; 4J5K A; 1I3F A; 2ML6 A; 3S5C A; 3GZY B; 4HZB B; 2SBL A; 1UI7 A; 3KCH A; 1I2E A; 1W02 A; 3VGN A; 3CME 3; 1QMA A; 2BMO B; 1VQQ A; 1G96 A; 1RGK A; 3WMD A; 1VQ7 3; 3URP A; 1N8Q A; 1OUN A; 1GY6 A; 1A2K A; 1MGW A; 1O7W B; 4R80 A; 3CC7 3; 1FGT A; 3CU3 A; 3G8Z A; 3FG3 A; 4RNZ A; 3G6E 3; 3ECF A; 4K90 B; 4AKY A; 1GSP A; 1UUV B; 1W01 A; 5I97 A; 1VQ4 3; 3EBY A; 1Q82 4; 3K5T A; 4KZ1 A; 1LNI A; 2XR8 B; 3ZG0 A; 1I70 A; 1RLS A; 1LOX A; 5M19 A; 4R4K A; 4RBN A; 1CH0 A; 1YIJ 3; 2GXF A; 1UDI I; 5ELU A; 1VQN 3; 3FF0 A; 4FCJ A; 1VQ8 3; 3B4O A; 3HK4 A; 1RNT A; 2HMK B; 1YVB I; 1RGG A; 4XM4 A; 1D6U A; 2HMJ B; 1CYU A; 2W03 A; 3FH1 A; 1NB3 I; 1BNS A; 3JUN A; 1RN1 A; 2BNG A; 3OWU A; 3CXC 2; 3T8U A; 3HII A; 2CWT A; 5LC6 A; 1N5P A; 3B8L A; 5AII A; 4KVH A; 2OQE A; 2KAA A; 3KZT A; 2PNC A; 2CFD A; 1R4Y A; 1TTO A; 2STD A; 1B20 A; 2F98 A; 4MJD A; 3HX8 A; 4MMX B; 3WOF B; 3AMO B; 2GU3 A; 3L0R A; 4NHF A; 2YFL B; 1S5A A; 1B2X A; 3EX9 A; 3F14 A; 5IG0 A; 1M1K 4; 4N3V A; 1BNG A; 2D1W A; 2W56 B; 4HM8 B; 1K8A 4; 1RGH A; 1BIR A; 5AIG A; 3V92 A; 3CCE 3; 3BNC A; 3MKI A; 5FW5 A; 1E97 A; 3I0Y A; 3F8H A; 1X1Y A; 3ALA A; 2FNQ A; 1W6C A; 4RNY A; 1AR0 A; 4XBX A; 5AIF A; 1TRQ A; 2Y73 A; 1JB2 A; 1RN7 A; 2F56 A; 2IUJ A; 4BU4 A; 1BRI A; 3D5G A; 4OK0 A; 1ULI B; 2IMJ A; 1CYV A; 4FMB A; 3EQQ B; 4HOH A; 3FG1 A; 3N9H A; 4H61 A; 3WA3 A; 1NU3 A; 1OHS A; 2WO0 A; 1NO3 A; 3K63 A; 4KFE A; 1BNJ A; 2Q07 A; 3CPW 2; 2E2T A; 3DY5 A; 1GD4 A; 3M8C A; 3CMA 3; 4IT7 A; 4FR9 A; 3KE7 A; 1EEJ A; 1W2Z A; 2BMR B; 2YX9 A; 2Z7A A; 1K73 4; 1O7G B; 3Q90 A; 3NBB A; 1Q42 A; 5BIR A; 3PGB A; 3UB1 A; 3F8X A; 3CC4 3; 3GAX A; 4LGQ A; 2H0H A; 5G2G A; 1NJI 4; 1RGA A; 3SXX A; 1STD A; 1O7P B; 2CFG A; 2IA7 A; 4GL6 A; 7GSP A; 1MGR A; 1C7H A; 1VQO 3; 1JN5 B; 1IT8 A; 1VQ5 3; 4CDL A; 1BUQ A; 3CNM A; 3V98 A; 2R4I A; 2CX0 A; 1ISK A; 1TJD A; 3B4P A; 4X2H A; 1A90 A; 1YVS A; 1B27 A; 1HZ1 A; 1TRP A; 3CCS 3; 2C4B A; 1JB4 A; 1EG9 B; 4HAA A; 2A15 A; 1YI2 3; 1CEW I; 4K61 A; 5EQL A; 1U8C B; 1NB5 I; 5IG4 A; 3DUK A; 3NV0 B; 1E3R A; 2UX0 A; 1Y4K A; 2D42 A; 3N54 B; 1SJW A; 1Q7H A; 1JKG B; 1X1U A; 3OWY A; 1YHQ 3; 1TP6 A; 3WOE B; 2PZV A; 2W04 A; 2P0X A; 1U5O A; 3X41 A; 3VSY A; 2AAD A; 1A2V A; 3OXA A; 4JF8 A; 4RNT A; 1K41 A; 4HVN A; 1BGS A; 4L7K A; 5M18 A; 1A67 A; 1ZO2 A; 3AHW A; 4EV2 A; 2QA4 3; 1WMO A; 2RNT A; 3EBT A; 2BT3 A; 3DMC A; 3F7S A; 1IQX A; 3KN4 A; 4O02 B; 3S29 A; 1UGI A; 4HM7 B; 2J8X B; 1S72 3; 5IW9 A; 2RSX A; 1FGQ A; 1OHO A; 4XDV A; 2M7O A; 3NQY A; 4WYK A; 6STD A; 2I9W A; 4OUQ A; 1YIT 3; 3G16 A; 3WDG B; 1GOU A; 1UI8 A; 2KF4 A; 1RMS A; 2RGQ A; 3D79 A; 3H3H A; 3IMA B; 4XDW A; 3EN8 A; 1KWI A; 4AKZ A; 4EC6 A; 3CCR 3; 1IQY A; 1M1X B; 2GEY A; 4KT3 B; 1ASK A; 1OHP A; 3GZB A; 4IPB A; 1FA3 A; 3X3Y A; 2KF5 A; 5AYR B; 3LT8 A; 1WNH A; 1O7N B; 3DGM A; 1NDO B; 1SAR A; 5EEO A; 1B2M A; 2QGU A; 3AHS A; 1GD3 A; 3RDE A; 2JQ5 A; 3WA2 X; 3DGL A; 2HMM B; 2CIU A; 2XGN A; 1LVN A; 1M9G A; 3JUQ A; 4LMI A; 4U13 A; 1B2Z A; 4HM0 B; 2WOF A; 3KSP A; 2OTJ 3; 3MG2 A; 3SYU A; 1VQ6 3; 4HKV B; 1BRS A; 1NNV A; 3CPO A; 1GMR A; 4N6U A; 3KKG A; 1FUT A; 3I55 3; 1I3I A; 4RZM A; 2CKF B; 3SOA A; 2CG1 A; 1TFO A; 2OOV C; 3WOD G; 1T5Y A; 4KFD A; 1Q40 B; 3SVA A; 1PU4 A; 1KQS 2; 1QAL A; 3BIR A; 1D6Y A; 3F7X A; 2Z76 A; 3FZW A; 3K7C A; 2R41 A; 1VQL 3; 1MNL A; 3JVC A; 2CK3 H; 5EVH A; 1VQK 3; 1FGM A; 2YFI B; 5IF6 A; 1OF5 A; 3SLU A; 3HOH A; 4HBR A; 2E2U A; 5DRV A; 5HGR A; 1FYS A; 2W0Q A; 3BNB A; 5DRE A; 1Q7Y 4; 1UCL A; 4WWU C; 3MPH A; 5IEN A; 1GMQ A; 1QVG 2; 4CJN A; 3EC9 A; 5A0O B; 3LZA A; 2Y74 A; 1B2U A; 1W6G A; 1WMP A; 1US1 A; 2XH9 A; 4N6M A; 4R1K A; 4GB5 A; 4ILF A; 1W7C A; 1SPU A; 3AGN A; 5D83 A; 3WHO A; 4BIR A; 2E2V A; 1UW1 A; 1IDP A; 1O7M B; 4WFO A; 2O3O A; 1E3V A; 1FZU A; 2ZA4 A; 2CX1 A; 3A76 A; 4OVM A; 2KF6 A; 1ROV A; 1JZO A; 1DMQ A; 4I5Q A; 1HKX A; 1AV4 A; 2BMQ B; 1BSA A; 1YJ9 3; 3Q2P A; 1X1X A; 3CNX A; 5TGN A; 2IUK A; 1KSI A; 1F8N A; 1DMM A; 2GSP A; 1DET A; 3HIG A; 5ELJ A; 1QVF 2; 4H3U A; 1LOV A; 1W00 A; 2CC3 A; 4LSO A; 2RCD A; 2BIR A; 4LEH A; 3X3X A; 3G4S 3; 1V57 A; 2C11 A; 1EA2 A; 4N6T A; 1BVI A; 3J7Y d; 5CK6 A; 1JV2 B; 3CD6 3; 2HML B; 6RNT A; 1RGC A; 3BB9 A; 2W2C A; 3K0Z A; 1O7H B; 2LYX A; 4BL3 A; 3IPT A; 2XGL A; 3JUM A; 5CXO A; 1DVD A; 1TIJ A; 1IVV A; 3KFQ C; 4MMZ B; 3TDG A; 1KD1 4; 3IJE B; 2RFR A; 3EB8 A; 3GSP A; 1R4C A; 1ULJ B; 1IV7 A; 4FMA A; 3JUO A; 3VF1 A; 1GMP A; 3ER7 A; 3K9M C; 5BXQ A; 1ZGX A; 3O8Y A; 3G71 3; 4TX4 A; 3CCM 3; 3CCU 3; 1HYF A; 2OWP A; 3ROB A; 3DXO A; 2CW9 A; 1RDS A; 4KFF A; 7STD A; 2P05 A; 2CFK A; 1FW7 A; 3FCS B; 1N9J A; 3WR2 A; 5IEP A; 3EJV A; 4XBT A; 3CCJ 3; 1EQK A; 3BND A; 3JUP A; 1RGF A; 5AIH A; 1IYY A; 4L8O A; 5AYS C; 1RNB A; 3FF2 A; 1GY7 A; 1CQS A; 1OF5 B; 5IER A; 4HZ9 B; 3UJM A; 3X42 A; 1STF I; 4AEQ A; 1NWW A; 4EYC A; 1UUW B; 2WOH A; 1IT7 A; 5KP3 A; 1BU4 A; 1BSE A; 1W6Y A; 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