1EEJA

Crystal structure of the protein disulfide bond isomerase, dsbc, from escherichia coli
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
DDAAIQQTLAKMGIKSSDIQPAPVAGMKTVLTNSGVLYITDDGKHIIQGPMYDVSGTAPVNVTNKMLLKQLNALEKEMIVYKAPQEKHVITVFTDITCGYCHKLHEQMADYNALGITVRYLAFPRQGLDSDAEKEMKAIWCAKDKNKAFDDVMAGKSVAPASCDVDIADHYALGVQLGVSGTPAVVLSNGTLVPGYQPPKEMKEFLDEHQKMTSGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords THIOL:DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN
publication title Crystal structure of the protein disulfide bond isomerase, DsbC, from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Isomerase
total genus 68
structure length 216
sequence length 216
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2000-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1eejA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1eejA02
2C0EA 2XHFA 3VI5A 4F03A 2IMKA 1EGOA 2KP2A 2R6KA 1XIYA 5F8BA 3F9UA 1QFNA 1K0OA 4ZXGA 3G9BA 1GWCA 2HE3A 2FHEA 3UJ1A 1Z7RA 2ZUPA 5AGYA 4LMVA 1LBKA 3EINA 3VFIA 4PXOA 4KA0A 3IHQA 4MJAA 5ECIB 3QD9A 1V57A 4ILFA 3I9V2 1AW9A 3TDGA 1HYUA 1SK2A 4F9ZA 3MDKA 2IYJA 1ZYEA 4MLYA 16GSA 2JACA 3IK7A 4YQUA 4MP4A 2IMEA 3CYNA 4MK3A 3GSSA 1TRWA 5IOWA 1GTBA 4AF2A 1Z9HA 1Z7PA 1B4QA 1WE0A 4ZBAA 3TB2A 4POBA 1TI1A 4HJMA 3TKPA 1VF1A 3GTUA 2A2RA 3LYKA 1XWBA 2H8LA 3HVVA 2GZZA 1YZXA 1FOVA 1Z6NA 2ALBA 3HKRA 3QAVA 3C7MA 1ZL9A 1M9AA 4L5LA 1SK0A 1T4ZA 3WT1A 1O73A 3TKSC 1GRXA 3HCZA 5JWRB 5LD0A 4K1FA 2B1LA 2RIIA 3O6TA 2PPTA 2DIZA 3RPNA 4D73A 3CRTA 3BOAA 4LMWA 3VI7A 4P3YB 3D4TA 1K0DA 4MA9A 1A8LA 4GRFA 4POLA 1G7OA 2VLTA 2GZYA 2O87A 4WETA 2LNSA 4MZWA 2V2GA 3DYRA 1GUMA 2YCDA 4MDCA 1GSFA 2CAIA 1UVZA 2GDRA 1F9MA 4NV5A 1DUGA 4QL7A 5GSTA 2M72A 2DIYA 1FW1A 1O8XA 3FZ4A 4ZIJA 2ON7A 5J9CA 2OADA 1FB6A 2AYTA 1PD21 4K2DA 1T3BA 3Q74A 4PNGA 3CSIA 5H5QA 1F2EA 2AAWA 2H6XA 3WD6A 3Q6OA 4I8BA 2H70A 1ZGNA 2FWEA 3EWLA 4ZL9A 4HQZA 1RQMA 3W8SA 4KE3A 3L4NA 4F2IA 4K7NA 5A4UA 1TK8B 2BJXA 4WF5A 2NBSA 1M2BA 2DJ0A 5B6NA 2H1DA 4MJCA 3GURA 3KCMA 4NAXA 4CW9A 5D96A 3ZVJA 2R37A 1R5AA 5G5EA 2DMLA 2L57A 3L9SA 3DXBA 1K0NA 11GSA 3BD2A 2HYXA 5FHIA 4TOPA 2L5LA 4YQMA 3GTUB 3LEFA 4ISDA 1E2YA 1JHBA 4FYUA 1O8WA 4AJ6A 4F82A 2B1KA 4F0CA 1M0UA 3FY7A 2VAFA 12GSA 4YAPA 2DJJA 5KN2A 3V1WA 5ABRA 4ML6A 4NPBA 1U6TA 1RK4A 4PUAA 3F4TA 3EU3A 3LORA 1GSEA 3GKMA 5FWGA 2HRFA 2O7KA 4Q5NA 2YWOA 5ECSA 5B8BA 2VLVA 3ED3A 5D73A 4D73B 1DSBA 1T4YA 4FH8A 1Q98A 5DAKA 5ELAA 2KOKA 1TK0B 4K8MA 1DE2A 5G2ZA 3C1RA 3P7XA 1S3DA 2VM2A 3UOMA 4TXOA 3DMLA 2MBTA 1X9WB 2PGTA 2MMAA 2HSYA 4IVFA 7GSSA 5EY6A 2AB6A 1OC9A 1F3BA 1TJDA 1B9YC 5ECNB 3QDNA 1ZMAA 1DBYA 3GNJA 3LXTA 4KUNA 3BCKA 5IO2A 1N2AA 4I5QA 3VPTA 2L6DA 2V1MA 4G10A 4L0UA 3C73A 2F51A 4AGSA 2CAQA 4FO5A 1SYXA 3ERGA 4L5OA 3APOA 4HUAA 4L0WA 1XW9A 4MJEA 3D6IA 1WP0A 3CBUA 4JR6A 5GAND 2FY6A 1ON4A 2LTKA 3U6VA 3UBLA 1M2AA 3TJJA 1MDIA 5C04A 1ILOA 3CTGA 1VRSD 4I2TA 2L59A 3FYGA 4HOJA 2CX3A 1WWJA 4OCFA 4ZB8A 4RI6A 5J3RA 3J7Yb 2WULA 3HVSA 1VF2A 3PR8A 3W8JA 2R5GA 1XCCA 4V2MA 3KM6A 3QOUA 3KH7A 3QAWA 5DALA 3QFBC 5AISA 1PA3A 4E8EA 1A2JA 3DVWA 2C8UA 5KN1A 1XWGA 3GIXA 1XOAA 5G31A 3RPPA 2P31A 4NXIA 2LUSA 2KUCA 2H0HA 3L9VA 1EGRA 5E4WA 3F8UA 2H1BA 2WS2A 4G19A 4PQIA 3LG6A 2B5XA 4XRDA 4H86A 4MF7A 4K9ZA 4RI7A 3UL3A 2I1UA 5H5RA 3APQA 1UC7A 3QMXA 1GTAA 5DAKB 1O81A 4YAVA 4WXTA 3PH9A 4MF5A 1BEDA 4BA7A 2YNXA 5HQPA 2QC7A 4TXOB 4WBJA 2GQKA 2KHPA 3HZ4A 2VIMA 3CRUA 1OC9B 2LS5A 3HJOA 5ID2A 4X1UA 5F0GA 5CRDA 1T00A 5D9TA 2HRNA 2YV9A 4KAEA 5JWQB 4WR5A 4E8HA 1FVJA 2WB9A 3GA4A 1ERWA 4XS6A 2VCWA 2HXKA 3U5RE 3UEMA 2A2SA 2VCQA 2FNOA 1FB0A 3FEUA 1YF0A 1OC8A 4X0XA 2TIRA 3BBYA 5AN1A 4DSQA 1XVQA 5IM9A 5IMFA 2B5EA 3WT2A 3N5OA 2WGRA 2R2JA 3HYPA 2C3TA 5IMDA 3UARA 1UA5A 1GLQA 4DVCA 2ZCTA 17GSA 3IV4A 5DCGA 3ZFLA 13GSA 2H6YA 3IAS2 2K8SA 3AY8A 1J9BA 2I4AA 3E9JB 4N10A 1B9XC 1VF4A 2MMOA 2PVQA 2YPMA 1SL0B 3G7JA 3F3RA 5DALB 1OAZA 4JRRA 3P8WA 1LJRA 4ECJA 3LXZA 1DE1A 5JCUA 3QR6A 4YH2A 1A24A 1GSQA 3VLNA 4KH7A 1TXXA 1GP1A 4TR0A 1ACVA 5LNKe 2GS3A 4WR4A 3IA1A 3TGZA 2GQLA 3IK9A 3ISOA 4TR4A 2L4CA 2LRCA 3FW2A 1TW9A 1X5DA 2DJKA 4MZCA 2HT9A 4JZQA 5J5NA 3FR6A 3HXSA 1G0TA 3HA9A 3CXGA 3NIVA 1ST9A 1KNGA 2NDOA 1TDIA 1A2MA 4WF4A 5F05A 2X99A 1K0AA 2QSIA 4POMA 3GRXA 1WPIA 1XWKA 3FR9A 1THOA 5ID2B 2L6CA 2VCXA 2K6VA 2V32A 5B8AA 2DBCA 2FCHA 2H74A 3IBHA 1MD3A 2JZTA 2OJLA 2H72A 3EURA 2R3XA 2TRXA 4ECIA 2TRCP 1OC3A 1BX9A 3TCOA 3UVTA 2C0GA 2PMTA 1SK1A 2I3YA 1PX6A 3KH9A 1XVWA 2P5RA 3EMXA 4J56E 4XRAA 3D22A 1HNAA 2AV4A 4NWYA 5ENUA 2IWTA 3GFKA 3IE3A 3LFLA 3PINA 4KGIA 2EIOA 2X64A 4OO5A 4DSRA 4BWQA 2KP1A 1AC1A 1BG5A 1QK8A 2M46A 1JZWA 3LQ7A 4MPGA 2PU9C 1K3OA 4KCAA 2BMXA 5GAPD 1F37A 5KN3A 3FR3A 5ECQB 1HD2A 2I9HA 2XBQA 4TRXA 1PN9A 3IPZA 3JCML 3VWUA 2JSYA 4EXJA 3M1GA 2IMDA 1H75A 1URMA 4XTSA 4BVXA 2GT5A 1V40A 3J7Yk 5CO3A 2N5BA 3LWAA 1PKZA 3TKSE 4KCEA 5IOXA 2YP6A 3H4KA 1WRYA 3DRNA 4V1Ap 1TI3A 1I9DA 3HHVA 2J9HA 3FZ5A 4BL7A 4IP6A 3ZVJD 3RHBA 2X8HA 9GSSA 2WJUA 2IN3A 1WJKA 1EP7A 2GZPA 4IELA 1VGLA 3ZTLA 2H0IA 5DCHA 4KDUA 5EVOA 2OBIA 4CHSA 1AAZA 3GX8A 4GQFA 3O3TA 1MTCA 3CSJA 3GMFA 2L4QA 4V1Ag 5IO0A 2WCIA 4OWYA 2E2GA 2JADA 6GSSA 3HY2A 3PGTA 1A8YA 2AUVA 2LRNA 3HZ8A 1GNEA 4TR1A 4ZILA 1J0FA 2ON5A 3IC4A 2EIQA 1GUHA 1LU4A 2RLIA 4PX1A 6GSUA 1K0BA 4TXVA 2GSRA 4GSSA 1NSWA 2VD1A 1N8JA 1I5GA 4Q5FA 3M9KA 1SD8A 3VPQA 2XBIA 1SYRA 1ERTA 1ERVA 3GV1A 4LLRA 4J57E 2B3SA 3M8NA 1O6JA 2P5QA 3ZREA 2IIYA 4HU7A 5IPGA 3HD5A 3SWLA 3F3QA 2YOIA 3TOUA 1M7TA 1B48A 2YANA 5GZZB 1V2AA 2GSTA 2CVDA 4IP1A 2H1AA 4ZL8A 1AUCA 3KJYA 3GKNA 4DEJA 3DEXA 1EWXA 3FZ9A 1CQHA 3GH6A 4HS1A 1M9BA 1SU9A 3BJ5A 5B6MA 2ZNMA 2VD0A 1NM3A 3H79A 1GSDA 1JZDA 2B7JA 5E59A 3BCIA 1R4WA 4HQSA 4K7IA 4EKZA 2CZ2A 1SKSB 4JBBA 3TRPA 4J2FA 3N9JA 6GSVA 5HR0A 1XFLA 3NZNA 3FHKA 4DSSA 3ERWA 1SL1B 1J08A 1T1VA 2VL3A 4KSOA 3CTFA 1Y25A 5CREA 2YWIA 2K8VA 4I6XA 3KTBA 5ECHB 4Z7XA 3TKRA 19GSA 4AJ8A 1PKWA 2VO4A 5CNWA 3GKXA 4ID0A 3WYWA 1K0CA 4EE0A 1SJIA 4ZBDA 2H75A 4TR1B 1TOFA 3A2VA 5AIVA 1X9SB 2B5YA 1U87A 1R5PA 1RW1A 1MDJA 5F07A 1QXHA 3FK8A 3RBTA 2OBKA 2LKUA 2H73A 3A3TA 1Q4JA 1YEPA 2CA8A 1HNBA 1Y6EA 2D2ZA 4BPYA 2FD3A 2R4VA 4MF6A 1WOUA 1K0MA 2C4JA 2H1GA 4KSMA 4I97A 3IXRA 2NPBA 3ZZXA 1W4VA 3KZQA 4GTUA 4POKA 5IMAA 1Z3EA 2KLXA 5J4UA 5G5FA 1SJZA 2DJ3A 4GWRA 5IPHA 3EU4A 4GCIA 2A4VA 1EOHA 2HLSA 1YF1A 1TTZA 3D4MA 5HFGA 2WDUA 4JU5A 1E6BA 4IQ1A 3H1NA 1R26A 2JU5A 5LCZA 1YY7A 3ZMLA 4ML1A 1A23A 2IY2A 2AJQB 1YJ6A 4XS4A 2F8FA 3UIWA 4PUFC 1O85A 3ZMKA 4K7OA 18GSA 4HEA2 4RQRA 1U3IA 4O92A 5EL8A 2GT6A 2XPDA 4JE1A 3I43A 4HJ2A 2H30A 4DSSB 4MZBA 1HNCA 3GSTA 1EV9A 2B6MA 3APSA 2I81A 1TU8A 1CQGA 1NHYA 3L78A 3UVHA 2QKEA 1S3AA 3RDWA 2FA4A 1SD9A 1GSYA 2M80A 5B7CA 2V6OA 1USBA 2B7KA 4IKHA 2FWHA 5AIXA 3RHCA 1M99A 2OE0A 2FUG2 3TJFA 2CX4A 2F3MA 3QAGA 2H66A 2OKAA 3WGXA 4X43A 2CZ3A 2CT6A 4EUYA 2WFCA 1PL2A 5KN0A 1GUKA 2RUEA 3QCPA 1XWAA 5D9WA 3FKFA 4HI7A 3ZIVA 3ME8A 2LJAA 4ECBA 3IRAA 1F3AA 1FHEA 1OE7A 4RQXA 4F0BA 1F6MC 2GQMA 1BJXA 2GVPA 6GSTA 3GX0A 2E0QA 5INYA 1U3AA 4PGTA 2C0FA 4PNFA 2O8VB 1Z6MA 5ECPB 5HR3A 1C72A 2EC4A 4FIWA 4WBRD 3TRXA 1B8XA 2H19A 5D9VA 2HZFA 1AQXA 1WMJA 4ECCA 4OFMA 3A5WA 2LRTA 3DIEA 1PL1A 1SL2B 1TRUA 4EC0A 2EIRA 2O85A 3KIJA 2XPEA 3MSZA 3H8QA 1GTUA 4JR4A 1SENA 4K0NA 1XZOA 4QL9A 5CRGA 4KX4A 1TRVA 1TP9A 2GLRA 2HNLA 1X5CA 4EDZA 5D93A 3L0HA 1KEBA 2RUFA 4LL1B 1PGTA 1BYEA 4XS4B 1GULA 2MZCA 3KXOA 1A0RP 1YQ1A 2VL2A 5JCGA 3KEBA 5D8IA 4AJ7A 4N0VA 3KD0A 4IN0A 1JZRA 3GUSA 6GSYA 2PUKC 4EDYA 6GSXA 1S3CA 4YQVA 2LSTA 3HVXA 5C00A 3TJKA 2E2MA 3IDVA 2MMZA 3F63A 4GXZA 5JWOB 2VM1A 4O32A 4CDOA 4IW9A 4ZB6A 5ECLB 3O76A 4MH2A 2G0FA 2IFQA 3E3EA 1G6YA 2C3NA 5ECKB 3VURA 1ML6A 1UN2A 2DMMA 4LL4B 1IYIA 3R2QA 1PSQA 2E7PA 2NTOA 2OACA 4KDYA 3HJPA 5DDLA 4IJIA 3UAPA 5JCWA 4IS0A 3ME7A 1GL8A 1O7UA 3ZLPA 5CRWA 4TKYA 4WEYA 1JZOA 2H0GA 22GSA 4OO4A 3MNGA 2C80A 3C1SA 2PN8A 1G7EA 1ERUA 1XOBA 1KTEA 3Q18A 4QQ7A 2VCTA 2Z9SA 1OKTA 1U88A 5IMZA 4OD7A 4OFTA 1QGVA 1YKCA 4ZBBA 3H93A 2L5OA 2JZSA 1OKDA 3W6GA 2C0DA 1YDKA 2O89A 2XC2A 4KNDA 1NHOA 5ECRB 3D21A 2G2QA 3G7YA 4I2UA 2YJ7A 2H76A 3TRQA 1EEJA 1FO5A 3SBCA 4OMVA 4GSNA 3TKSA 1KBNA 1XXUA 3F4RA 3TJBA 3DWVA 1QQ2A 2JSZA 1A2LA 1BAYA 3KMOA 3HJMA 1V58A 1FG4A 2RM6A 1ABAA 1Z5YE 2LEGA 3VWXA 2VLUA 4O5RA 3WGDA 4KB3A 5CAXA 8GSSA 2DJ2A 1TK5B 2C1YA 2YZHA 3VK9A 2P0GA 2GSQA 2VCZA 3HDCA 2HFDA 4MMMA 2IMFA 3TJGA 2CQ9A 4JEDA 3FRCA 4IHUA 1T7PB 2LQOA 5CYYA 3P90A 2WRTA 5F06A 3WGEA 2CV4A 2GSSA 1H4OA 1AXDA 2MMNA 1FVKA 4MABA 1GSSA 2FGXA 1V98A 2RM5A 3ZRDA 4EVMA 3NOFA 3ZL5A 3C71A 4KW6A 5DJMA 4K0GA 2IFQB 5HR1A 2H6ZA 4N0ZA 3VWVA 1JFUA 1QMVA 3GL5A 3D0ZA 3ZIJA 4LA1A 3CSHA 1XW6A 3EMPA 1IYHA 1SKRB 1WIKA 1AQVA 2X8GA 1XWCA 2V6KA 1THXA 5KEJA 2PVOC 2HZEA 3UMAA 2C3QA 4EO3A 1HQOA 2OE3A 2VCVA 4XS1A 4OFNA 1ZOFA 3I69A 5J41A 2MBSA 2LV3A 4PQ1A 3Q19A 5EPFA 5HFIA 3K8NA 4EF0A 4GLTA 4NV2A 3MAKA 4EL1A 4XHMA 1PX7A 5DQSA 5A4VA 1TKDB 2DLXA 2DJ1A 2YN1A 4ACSA 3I6AA 2VL9A 1OE8A 3RAZA 10GSA 20GSA 4ZB9A 4L8EA 2LQQA 4G9HA 5A5KA 3FZAA 2IL3A 5ELGA 1AQWA 1X0RA 2CVBA 4IBPA 2OE1A 4WKWA 2FWFA 4FYCA 5IMCA 4V2NA 3VWWA 5FT3A 3EVIA 2J23A 2IPAA 1X9MB 1EV4A 1B4PA 3ZFBA 5G1KA 2N5FA 3F4SA 2WZ9A 1FAAA 3C8EA 1PQNA 5DVBA 5G30A 1GNWA 3TKQA 4HU9A 2IMIA 3IR4A 2YWMA 1ZYQB 3D5JA 3LSZA 3ZYWA 4PQHA 3QPMA 1GLPA 5CRHA 3ZITA 4MH3A 1K3YA 2FA8A 3LJRA 3P2AA 1ZZYA 1EZKA 1MDKA 3IOSA 4O7HA 2HI7A 3M9JA 1W89A 3KP8A 4TVEA 5A4WA 1MD4A 3DGQA 1NW2A 3E0UA 1OYJA 2VUPA 4Q5QA 4BWSA 1OVNA 3TOTA 4ULXA 3OR5A 4NMUA 2JZRA 5DJLA 2LNTA 1SJ6A 5D9XA 1EP8A 1QUWA 3GH9A 6GSWA 5IMVA 1M2DA 3A2WA 1XBSA 2CVKA 2HZEB 2MYGA 3S9FA 2LJKA 3TUEA 2OA7A 1MEKA 1EEMA 1R7HA 1K3LA 4N11A 5ECOB 1GTIA 3IAM2 2PWJA 2NVLA 2FLSA 2PERA 4TW5A 1XW5A 4BVYA 4GQCA 3US3A 4N30A 4MCUA 3L9UA 2GGTA 4PURA 3GYKA 3F6FA 4MPFA 4Q5RA 2FWGA 2YJHA 1ZCPA 4GSTA 1TRSA 2YV7A 2X8CA 4IJ3A 2BTOT 4KDXA 2LJRA 3M3MA 5DBQA 4MJBA 1GH2A 5H5SA 2H71A 2JL4A 3UBKA 3F0IA 2F9SA 3KTLA 5IIZA 3CMIA 3EYTA 4NHWA 1X5EA 3DVXA 2HSHA 1AIUA 2YWNA 3QFAC 4RUVA 4K6XA 3KGKA 4TN8A 5ECMB 5DQYA 3GN3A 1VF3A 3GKKA 1SKWB 4HDEA 5L71A 1XPVA 2ES7A 2DC5A 5CP1A 5HFKA 4GF0A 5IQYA 2N5AA 2DSAA 1G6WA 2PBJA 2H01A 1PRXA 4V2LA 5COHA 1BQ7A 2VOCA 2REMA 3GHAA 1JLWA 4HZ4A 1PMTA 3LYPA 1EOGA 4XCSA 5GSSA 3M0FA 3G7IA 4TR3A 14GSA 1TU7A 1JLVA 4XIHA 5HR2A 5G1LA 1A0FA 3LGCA 2YZUA 3EE2A 4FYBA 4ZL7A 5J9BA 4NHZA 2K18A 3KMNA 2F8AA 3DD3A 4HZ2A 2AHEA 4G2EA 3KP9A 1YEXA 1YKAA 3ERFA 1GSUA 2GTUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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