1EEJA

Crystal structure of the protein disulfide bond isomerase, dsbc, from escherichia coli
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
DDAAIQQTLAKMGIKSSDIQPAPVAGMKTVLTNSGVLYITDDGKHIIQGPMYDVSGTAPVNVTNKMLLKQLNALEKEMIVYKAPQEKHVITVFTDITCGYCHKLHEQMADYNALGITVRYLAFPRQGLDSDAEKEMKAIWCAKDKNKAFDDVMAGKSVAPASCDVDIADHYALGVQLGVSGTPAVVLSNGTLVPGYQPPKEMKEFLDEHQKMTSGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the protein disulfide bond isomerase, DsbC, from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL:DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN
molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
total genus 68
structure length 216
sequence length 216
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2000-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1eejA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1eejA02
2VOCA 2A2SA 4YQVA 1V58A 3VWUA 1B9XC 5H5RA 1B9YC 5JCGA 4P3YB 2DJ0A 2H70A 3DD3A 3F3RA 1WIKA 3S9FA 1ABAA 5KN2A 2H73A 5F0GA 2O87A 4IN0A 2YN1A 1SJZA 2KP1A 3BOAA 2I1UA 1WJKA 3NIVA 1FVJA 2KUCA 2PN8A 2VM2A 3TKSA 2N5BA 5CAXA 1X9MB 4QL9A 5A4UA 4BWQA 2EIRA 2H76A 4JE1A 2HSYA 4K8MA 1XWKA 2FWEA 2PU9C 3TOUA 3IXRA 4TXVA 5GAND 5D9TA 2VL2C 4IP1A 2XBQA 5ID2A 5IOXA 2LSTA 2CV4A 5ECOB 2B3SA 3APOA 3UVTA 2WRTA 3D4TA 3HDCA 2LNSA 1H4OA 2DJ2A 3GMFA 3CTGA 2RM5A 2PVOC 4X1UA 3FKFA 2VCTA 2IN3A 1B4PA 14GSA 1GULA 2H1DA 1XOAA 3LSZA 1ERTA 1GRXA 1VGLA 1R5AA 2VUPA 1K0DA 2H74A 2JSZA 4TVEA 2VAFA 2Z9SA 5J4UA 3Q6OA 2LJKA 1XZOA 3CSJA 2RUFA 2YOIA 5CP1A 4AJ7A 4GSNA 1TJDA 3C71A 5FT3A 3LWAA 5J9BA 1ZCPA 5FWGA 3GN3A 4QL7A 5J5NA 1SKRB 1OKDA 1GNEA 2WDUA 1ERUA 1A0RP 1ERWA 1GLPA 5J41A 3FK8A 4KNDA 3L4NA 3EU3A 3ZTLA 1EZKA 4EKZA 3LJRA 2C3NA 4V2NA 3DGQA 2QC7A 2H6XA 4JR4A 4KCAA 2HRNA 3L9SA 1EOHA 3GL3A 3GTUB 2ES7A 4ACSA 2C3TA 4TR3A 2GVPA 4NV2A 2O85A 3DMLA 2L6DA 2H6YA 6GSUA 2YCDA 2IMKA 1QGVA 4PNGA 2TIRA 3D21A 2IPAA 2L57A 4G2EA 5GSSA 4GQFA 4N11A 3VLNA 1X5CA 4PQHA 2VD1A 5HFKA 4WXTA 2P0GA 1EWXA 4F9ZA 3FZ4A 2WB9A 1LBKA 2GT6A 3DXBA 1X9WB 4KSOA 5ECLB 4JBBA 2X8HA 2MMZA 5JCUA 2A2RA 4PGTA 2MYGA 3KMNA 9GSSA 1VF3A 5IPHA 2XHFA 2I4AA 3P8WA 1HYUA 2GQKA 3GSTA 4OFTA 4AF2A 1EV9A 1LJRA 3K8NA 2E2GA 3IV4A 4K7IA 4GLTA 1LU4A 4BA7A 1TDIA 3C1SA 1BJXA 5LD0A 1KTEA 1T4YA 3WT2A 2CT6A 4XS6A 3N9JA 1HNCA 3F4RA 2A4VA 2LRNA 2TRCP 1GSUA 2AV4A 2H75A 4ZBDA 5G1LA 2L5LA 1TKDB 4ZL8A 1MD3A 5C04A 1WOUA 4O5RA 4KW6A 20GSA 3RAZA 2JZTA 2FNOA 3HXSA 3QDNA 4JEDA 4MF5A 3LEFA 4I5QA 3GKNA 4GWRA 1MDKA 1SJIA 1OVNA 2KHPA 3U6VA 3C8EA 5IMAA 1V57A 1GUMA 5DJLA 4WKWA 4HJMA 3GYKA 1JHBA 3P90A 4GRFA 1QQ2A 1EP8A 3EE2A 6GSWA 3P2AA 1R7HA 1O7UA 3KZQA 3IPZA 4EDZA 4WBJA 3UAPA 1X5DA 4JZQA 3TUEA 4I97A 4HZ2A 4MPFA 3D22A 1PD21 1GSEA 2QKEA 3KH7A 2DJ1A 2VLTA 2JSYA 4BVXA 2WGRA 5AIVA 3HJMA 4ECJA 4WR5A 5IMDA 2CAQA 2GSSA 4PNFA 3UOMA 1Z9HA 5CRDA 2R2JA 3QAVA 2J23A 1Z7RA 1TXXA 5ECMB 4HJ2A 2HNLA 1FB0A 2YPMA 3CRUA 3M9KA 1W89A 4XTSA 1NW2A 4MZCA 1WPIA 1IYHA 3HA9A 5IIZA 3KGKA 4MF6A 3GSSA 2H19A 4MLYA 4RQRA 3TRPA 4XRAA 3Q74A 4G10A 1UC7A 4FIWA 1ON4A 3Q18A 4MH2A 5AISA 4HUAA 5DBQA 1M99A 4HOJA 1TK8B 3UARA 1K0OA 1PQNA 2LUSA 2RM6A 5GAPD 5B7CA 3HJOA 5DVBA 3FW2A 4YAPA 1CQGA 4ISDA 3ZREA 4X43A 2M80A 2M46A 4IW9A 3IE3A 4ML6A 4OCEA 2JACA 4LMVA 2YZHA 2YP6A 5EY6A 3A5WA 1G0TA 1DUGA 3US3A 5HR2A 3D6IA 3WGXA 4ZB6A 19GSA 5HQPA 1N2AA 2F9SA 2IFQA 3FY7A 5IMCA 3ZYWA 4N0ZA 3GX8A 5ECRB 2GTUA 2LV3A 1G6WA 2V6KA 4XS4A 1Z7PA 4IGJA 1H75A 1RQMA 1T3BA 2B5XA 4EF0A 4OMVA 4KDUA 3DIEA 1B48A 2F3MA 2V32A 4F03A 1MEKA 3UBKA 6GSTA 4J57E 2K9FA 5G2ZA 3BD2A 4CW9A 4TRXA 2DJJA 1PA3A 2H1GA 1Z5YE 3ZITA 2WZ9A 2VL3A 4WBRD 1XVWA 3RBTA 5G31A 4O92A 3LORA 1GSDA 1EEMA 3ISOA 4FYUA 3ZIJA 1YKCA 3TKSC 5KN0A 2F8AA 2FA8A 1MDIA 3F63A 3P7XA 1VF1A 4Q5QA 3C73A 2VLUA 2FWFA 4TR1B 2VLVA 3F4SA 3L78A 2IL3A 3G7JA 3GX0A 2IMEA 1T00A 4HQSA 2LRTA 5ECIB 1GSFA 1XW9A 3QPMA 4ZBAA 2G0FA 2DJ3A 2MMNA 1HQOA 1XCCA 3H8QA 7GSSA 2WS2A 1DBYA 1OC8A 1XWBA 2X8GA 10GSA 2B5EA 3IK9A 1WP0A 5DQSA 5CYYA 1K0AA 4E8HA 2R37A 1F2EA 2FWGA 5DALB 4MMMA 5ECPB 1Y25A 4PQIA 4L0UA 2HZEA 3RHBA 3M9JA 1EEJA 5DAKB 3CXGA 2EC4A 1GUKA 1SL1B 1USBA 2LJRA 3RHCA 4ZIJA 1W4VA 3GKMA 4I6XA 2IJYA 3FR6A 3A2XA 4V1Ap 1ZL9A 2AB6A 3DVXA 3PINA 3CTFA 2YANA 2C4JA 3HVSA 3L9VA 22GSA 2AAWA 1AIUA 4IQ1A 4MZWA 5F8BA 5GSTA 2OKAA 2IYJA 4BWSA 4L8EA 1G6YA 1XPVA 5J3RA 4MJEA 5G5FA 5G1KA 4L5OA 1SK1A 4ZXGA 1ZMAA 1SKSB 1S3DA 4KDYA 3L0HA 2YWOA 4ECIA 4YQUA 5A5KA 3TKSE 1GL8A 1AW9A 3GKXA 1WE0A 2PGTA 4MH3A 3ERWA 1AQXA 2H0GA 5ENUA 1PN9A 1PRXA 2KLXA 4HU7A 4PXOA 3IHQA 2PERA 3ZIVA 5L71A 3GA4A 4ZILA 2OE1A 4HQZA 2VCWA 4FYBA 2HLSA 4GSTA 2TRXA 3BCIA 3EMPA 1OE8A 4CHSA 2J9HA 1BYEA 1T1VA 3ZLPA 4ZBBA 2GLRA 5DQYA 3IC4A 4POMA 1GP1A 1I9DA 3NZNA 2OE3A 4NHZA 2N5FA 4XRDA 2OACA 4OCFA 3WT1A 1GNWA 2VCXA 1XBSA 2EIQA 1FAAA 3LXZA 4KGIA 3M8NA 4MDCA 5IM9A 5DJMA 1ZYQB 2G2QA 2GZYA 4PX1A 3W6GA 2K8SA 4DSSA 3F6FA 1F6MC 5LCZA 2B7JA 3ZFLA 3ME8A 4HU9A 4TXOA 1XOBA 3FZAA 2PVQA 4GQCA 5CO3A 2NDOA 3VPTA 3DYRA 4HDEA 1Z6NA 1O73A 2RUEA 3TJGA 2H71A 3ZL5A 2OJLA 2CQ9A 1M2DA 2GSRA 2M72A 3IAS2 2YNXA 2DJKA 1OYJA 2BMXA 2E0QA 2K6VA 3H79A 1C72A 1SL0B 4RI6A 4PUAA 5B6MA 4AJ6A 1B8XA 1FO5A 3IK7A 2AUVA 1PX6A 13GSA 2VM1A 1SL2B 4OO5A 4NPBA 3O3TA 2V1MA 2FY6A 1HNBA 1AQVA 1PKWA 1R5PA 4GF0A 3TKPA 6GSVA 1V9WA 1GTIA 2R3XA 3QOUA 3BJ5A 2CX3A 1XXUA 5GZZB 2H8LA 3FZ9A 5A4VA 4JU5A 4ZL9A 1URMA 2HRFA 5HR3A 1T7PB 4NMUA 5D93A 3LYKA 3I9V2 5F07A 5ABRA 1BX9A 4F82A 3G9BA 3KTBA 5B8BA 4D73A 1KNGA 1MDJA 5LNKe 1JZOA 4O7HA 1GLQA 1Q4JA 2ZNMA 3IBHA 1SENA 4GTUA 2IMFA 1V98A 1U6TA 2ALBA 3LFLA 4K7OA 3PH9A 2YWMA 4H86A 1O6JA 2OADA 3TRXA 4TN8A 3ZMKA 3ERFA 2YWNA 5JWQB 3QMXA 4NV5A 1TU7A 2DMMA 4POBA 1WRYA 1F9MA 2WULA 3CSIA 3I69A 1O81A 1V2AA 1S3CA 1PL2A 1K0MA 2FHEA 2OE0A 2I3YA 1NHYA 3KP8A 4WF4A 2NTOA 3EYTA 4GSSA 4WETA 1OC9A 4IP6A 4J2FA 1A8YA 3EINA 18GSA 1J08A 3D0ZA 3EVIA 1K3YA 4EO3A 4O32A 4WEYA 4MJCA 4XHMA 1JZRA 2MMAA 3CBUA 4ML1A 1GTBA 1K0CA 3ZRDA 2E2MA 4MJBA 1TI3A 1NM3A 2H1AA 2PBJA 1O85A 2MBTA 1THOA 4OD7A 1K3LA 1YEPA 2C8UA 1JZWA 2OBIA 1HNAA 5ID2B 3E0UA 1PX7A 2VL9A 3DEXA 5AGYA 2GT5A 1YJ6A 2B1KA 1OKTA 4I2UA 2ZCTA 1A24A 1GSQA 3HKRA 1RK4A 3KM6A 6GSXA 5DCHA 2DMLA 5IO0A 5HR0A 4I2TA 3UIWA 1VF2A 3GFKA 5IQYA 2O8VB 5CNWA 4ECCA 4KCEA 5DDLA 2DSAA 3I43A 2AHEA 3HJPA 4K1FA 2H66A 4EDYA 3GH6A 2RIIA 4YH2A 4KDXA 5D9VA 3F4TA 4BVYA 3FHKA 2XBIA 5JWOB 1ZYEA 3GKKA 2IMIA 1QFNA 4LMWA 2H30A 4YAVA 4KH7A 1THXA 3HCZA 5ELAA 5FHIA 3CMIA 3WD6A 5F05A 2LTKA 3MWHA 1M9BA 1G7OA 2LNTA 4F0CA 3TRQA 1XFLA 1PKZA 5KEJA 2BJXA 2L5OA 2VCZA 3NOFA 2CZ3A 8GSSA 4QQ7A 1ZGNA 1R26A 4BPYA 3VK9A 1UVZA 2CZ2A 3MAKA 1OAZA 2P5RA 4IVFA 1SU9A 2CX4A 16GSA 1TP9A 4K0NA 4KB3A 4KSMA 3TGZA 4GXZA 2P5QA 4PURA 2DIZA 4E8EA 1E2YA 4ZL7A 3FRCA 1WWJA 3PGTA 1M9AA 4N10A 3M3MA 3HVXA 1A2LA 1VF4A 1Q98A 1ML6A 2BTOT 2GSTA 2D2ZA 2ZUPA 1TI1A 3GTUA 1YF1A 1SJ6A 1TRSA 2X99A 2GZZA 1G7EA 2H0IA 5HR1A 4KX4A 1FB6A 1XVQA 2QGVA 2C3QA 3IDVA 1J0FA 4OFMA 5G5EA 4MA9A 3A2VA 2L4CA 2X8CA 4K6XA 1M7TA 3UEMA 4HEA2 4RUVA 5EVOA 1XW5A 3VPQA 2HYXA 4LA1A 1K3OA 2GQMA 1TW9A 2KP2A 5JCWA 4EUYA 11GSA 5AN1A 1SYRA 2VD0A 3ZZXA 2PPTA 3KTLA 4PQ1A 1DE1A 3GURA 1K0NA 2FA4A 2VO4A 3TJJA 5KN1A 2CAIA 2P31A 2JZRA 3HZ8A 2H72A 5ECNB 3GL5A 2DLXA 3LYPA 1J9BA 2GQLA 1U88A 1YQ1A 2FGXA 2RLIA 1QMVA 1A8LA 5IMZA 4HS1A 3IR4A 5E4WA 3H4KA 1FHEA 3AY8A 4ULXA 1A23A 3EU4A 4KE3A 3V1WA 1KBNA 2L4QA 2O89A 3QFAC 4EVMA 4MPGA 2YV9A 1U87A 2YZUA 2C0EA 5ELGA 2XC2A 1S3AA 1XW6A 2XPDA 3ZFBA 2MZCA 2O7KA 3VI7A 4LL4B 4YQMA 1XWAA 3LGCA 1JLVA 4FYCA 1BQ7A 3E3EA 5ECKB 2IWTA 2K18A 3GV1A 3J7Yb 4EXJA 4IELA 2R5GA 2EIOA 1A0FA 1QK8A 2X64A 17GSA 2F51A 2PUKC 3KIJA 2CVBA 4DSRA 1SKWB 4Q5RA 2VIMA 1SYXA 4KUNA 1GSYA 2GSQA 3TKRA 3WGEA 1JZDA 5IO2A 3TJBA 4MK3A 2C80A 5ECQB 2V6OA 2LKUA 3KXOA 3HD5A 2WJUA 4K9ZA 3GRXA 1ZZYA 2YV7A 1M0UA 2B1LA 2B7KA 3EC3A 4F0BA 5D96A 2VCVA 3HZ4A 5F06A 3LXTA 3QR6A 2IIYA 1GTAA 1VRSD 2LS5A 4DSQA 2ON7A 5H5SA 1Z6MA 2IMDA 1ERVA 1QXHA 4TW5A 1TRUA 4ID0A 3PR8A 1FVKA 4N0VA 2LEGA 1YKAA 3ZMLA 4WF5A 1I5GA 6GSYA 3LQ7A 2HZFA 1GH2A 2MMOA 2K8VA 2CVKA 2MBSA 3SWLA 2I9HA 3LG6A 4IJ3A 4MABA 3GNJA 3N5OA 5EPFA 1GSSA 4POLA 4K2DA 4GCIA 2C0FA 4IBPA 3KCMA 5A4WA 2LQOA 1Z3EA 2F8FA 5KN3A 4FH8A 12GSA 1SD9A 1FG4A 2IFQB 4POKA 3DWVA 2PWJA 4L5LA 3SBCA 4IS0A 3BCKA 3HHVA 4JR6A 3RPPA 1GTUA 4XS4B 2B5YA 2FWHA 3J7Yk 4JRRA 3FEUA 1GUHA 3EMXA 4DVCA 2LJAA 4TR0A 4IQAA 2VL2A 3GHAA 2JL4A 4G9HA 3KP9A 1DSBA 1TRVA 3TOTA 5JWRB 4NXIA 3F3QA 2H01A 5CRWA 1TRWA 2N5AA 2V2GA 1B4QA 3OR5A 3C7MA 3VFIA 3APSA 4RI7A 5EL8A 3RDWA 1TOFA 5CRGA 4IJIA 3TKQA 3GUSA 4WR4A 1PSQA 3C1RA 1YDKA 1TTZA 3TB2A 2CA8A 4TR1A 3F0IA 3FR9A 1PMTA 1XIYA 3VWXA 1U3IA 1YF0A 4N30A 3D4MA 3I6AA 3QD9A 3KD0A 4ZB8A 2B6MA 3MSZA 4NHWA 4MCUA 3CRTA 5HFGA 3QCPA 3QFBC 3IAM2 3TJFA 5G30A 2E7PA 2HZEB 4K0GA 3HYPA 1KEBA 2ON5A 3MDKA 1JLWA 3IOSA 4EL1A 1ILOA 1M2BA 1F3AA 2AJQB 5CRHA 3O6TA 5DALA 1ZOFA 4MP4A 5CREA 2DBCA 3G7IA 3HVVA 2QSIA 1BG5A 4AGSA 1YEXA 5DAKA 1HD2A 4KA0A 3W8JA 5DCGA 1EV4A 2I81A 3F8UA 3MNGA 5D9WA 2FLSA 1AAZA 2HE3A 4F2IA 3FYGA 3FZ5A 3DRNA 2C0GA 4MF7A 4V1Ag 3KMOA 3QAWA 3TCOA 1NHOA 5B6NA 3VWWA 3APQA 1TK5B 1NSWA 2OA7A 3RPNA 3R2QA 1YY7A 1EGOA 3VI5A 4XS1A 3E9JB 1FW1A 1RW1A 2JU5A 1K0BA 1WMJA 4TOPA 4XCSA 4HZ4A 2H6ZA 1AXDA 4L0WA 3GH9A 4LLRA 1R4WA 4IKHA 2L59A 3IRAA 3A3TA 4OFNA 1QUWA 1OE7A 4CDOA 1A2JA 3ERGA 2NPBA 4Z7XA 3KEBA 3L9UA 2H1BA 2OBKA 1CQHA 2NBSA 2IY2A 2DC5A 2PMTA 2GS3A 2REMA 4TKYA 4ECBA 1ACVA 3BBYA 1X9SB 1OC3A 1EOGA 3UVHA 5IOWA 3HY2A 3CSHA 3D5JA 2DIYA 3ZVJD 5J9CA 4K7NA 3ED3A 1F3BA 2FUG2 4G19A 1M2AA 4MJAA 3KJYA 1O8WA 2FD3A 2FCHA 2C0DA 4OO4A 3WYWA 2CVDA 3O76A 4DSSB 3ME7A 1IYIA 1T4ZA 4IHUA 3H1NA 1UN2A 4TXOB 2R4VA 2GGTA 5INYA 5B8AA 3F9UA 3A2WA 1F37A 1PGTA 3DVWA 5C00A 2GDRA 1XWCA 3GIXA 1YZXA 2KOKA 1U3AA 2YJ7A 1PL1A 4RQXA 2L6CA 3G7YA 2HSHA 4J56E 4TR4A 1AC1A 5IMVA 1AQWA 2HI7A 4XIHA 5COHA 1A2MA 1V40A 2R6KA 1SK0A 4NAXA 1SK2A 4NWYA 2HT9A 2AYTA 5D73A 3VWVA 3CYNA 4MZBA 1UA5A 4I8BA 5IPGA 3KH9A 3Q19A 4KAEA 2V41A 2LQQA 1BAYA 2JADA 1XWGA 4BL7A 4DEJA 1O8XA 1JFUA 3JCML 5HFIA 2HFDA 4Q5NA 4V2LA 2HXKA 4OWYA 4PUFC 3W8SA 1DE2A 5D9XA 4ILFA 3FR3A 4EC0A 5ECSA 1AUCA 3TDGA 2YWIA 4D73B 2WFCA 1T8EB 3H93A 1X5EA 3M1GA 1SD8A 2H0HA 3U5RE 3WGDA 1GWCA 5AIXA 1Y6EA 2NVLA 1EGRA 4AJ8A 1TU8A 5ECHB 3UMAA 4LL1B 2JZSA 3ZVJA 1ST9A 2LRCA 4FO5A 3EWLA 2WCIA 2VCQA 1FOVA 3VURA 1MD4A 3TJKA 1X0RA 1E6BA 5H5QA 3M0FA 1N8JA 3F6DA 2XPEA 1EP7A 1BEDA 1MTCA 2YJHA 3QAGA 4HI7A 3UBLA 4Q5FA 4X0XA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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