5G1LA

A double mutant of dsbg engineered for denitrosylation
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
LPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCGPCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
publication title Sulfur Denitrosylation by an Engineered Trx-Like Dsbg Enzyme Identifies Nucleophilic Cysteine Hydrogen Bonds as Key Functional Determinant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN DSBG
total genus 67
structure length 228
sequence length 228
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 5g1lA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5g1lA02
1ZMAA 3L9SA 1GUMA 2B7KA 1ERVA 4EUYA 1T7PB 2OE0A 3TGZA 2C3QA 2VLTA 4BVYA 2XBQA 3EC3A 1GNEA 2C4JA 3L78A 2WULA 3ZVJA 1PN9A 2K6VA 4LA1A 4KB3A 2PU9C 4TR1A 5IMFA 2O85A 2R6KA 3ZZXA 3PINA 3VPTA 2H71A 3HJPA 5A4WA 1MTCA 2H1GA 2TRXA 4WBJA 4KDYA 1GLQA 3GN3A 1FAAA 4ZILA 2GSTA 2AUVA 3TUEA 2LJAA 4MJCA 4XTSA 4V2LA 5IPGA 2GVPA 4YQMA 3CBUA 2ZUPA 4QL7A 4DEJA 1G7EA 4LMWA 1ZZYA 5IMVA 3BJ5A 4YAPA 1AAZA 3UL3A 1MEKA 4ECJA 4Q5RA 5IM9A 1R26A 5F8BA 4CW9A 5DVBA 3AY8A 2LRTA 5EPFA 3KH7A 4XCSA 5J5NA 4NWYA 1S3CA 2WZ9A 3P7XA 4PGTA 1TI3A 4L5LA 2LJKA 2EC4A 2VD1A 2PERA 5CP1A 2CZ2A 2CZ3A 4KSOA 4BWQA 2FHEA 4JRRA 2E7PA 2I3YA 3DYRA 2ALBA 2V41A 4ML1A 3C7MA 3UVHA 3HVSA 3RBTA 2K18A 3LQ7A 2PBJA 2IMEA 3MSZA 4MF5A 2AV4A 2C0FA 2HYXA 1ERWA 4OCFA 4IQAA 5CREA 4ZB9A 2YWOA 5EY6A 1WE0A 3D4MA 3M8NA 4JEDA 3GKMA 1GTAA 2BMXA 3D4TA 3FR6A 1HNAA 1EOHA 3GNJA 4LL4B 3I69A 3ED3A 1HNCA 2H6XA 2HZEB 4PQHA 3CTGA 2H30A 4HU9A 2LRNA 3FYGA 3WGDA 1OYJA 2GDRA 1R7HA 4MJBA 1SKRB 1YKCA 1OE8A 1TRWA 3CSHA 3MNGA 4IN0A 2MMOA 3DXBA 4POMA 1XPVA 2C80A 3GTUB 1G6YA 1OC8A 2GSQA 1GSSA 3O3TA 4TKYA 4TRXA 4OWYA 4MPGA 4NV2A 2JZTA 4N11A 2LQOA 3KCMA 2NBSA 4PX1A 3KTLA 1M2DA 3J7Yk 1IYIA 1LU4A 1WIKA 2OA7A 3A2XA 3UVTA 1A2MA 3DRNA 3HDCA 1RW1A 4IJIA 1ZCPA 1X9MB 3IRAA 2F51A 1PMTA 1KTEA 2M46A 4QQ7A 1R4WA 4PUFC 3KMNA 1SD9A 2F9SA 5F0GA 1K0OA 2OBIA 1U6TA 3M9KA 1TOFA 5IO2A 1B48A 1SJIA 1FG4A 2IL3A 2LNSA 3BCKA 3HZ8A 4FO5A 5C04A 3HD5A 4ZL7A 1Z6MA 1ZYEA 2RIIA 2N5FA 5E4WA 5IIZA 5DBQA 1T3BA 4TR4A 4MCUA 5ECOB 2VUPA 2DBCA 4K7IA 1WOUA 3IAS2 2RLIA 4EE0A 5D93A 4HDEA 3GKKA 2DSAA 3Q6OA 1NM3A 2V1MA 1ZOFA 1M99A 4G2EA 1SYRA 2FLSA 1BJXA 5CO3A 4JE1A 4D73B 3L9VA 3EMXA 4PUAA 3G7YA 4MF6A 4ID0A 4RI7A 2DJJA 3LXTA 2NDOA 4KAEA 13GSA 3QD9A 1WPIA 4ACSA 3IK9A 4JR6A 4MH2A 2YZUA 4AJ8A 4MZWA 1TDIA 1PX7A 5ECLB 3CRTA 4EC0A 1C72A 1DSBA 3HY2A 1I5GA 4KE3A 4DSSB 3MAKA 4LLRA 1VF4A 2L5LA 2LEGA 3JCML 1GNWA 3IHQA 3UOMA 1A0FA 4XS4B 3Q74A 3D21A 1ZGNA 4HI7A 1E6BA 5DCGA 2AAWA 5GSTA 3WT2A 1V40A 1U3AA 2REMA 3D5JA 1GRXA 2C8UA 1WP0A 1TU7A 3LYPA 4NMUA 2H0GA 1R5PA 5GAND 2VCZA 4I97A 2HRNA 3QAVA 5B7CA 3IK7A 2FWHA 2H73A 3M0FA 5A4VA 3IAM2 2FNOA 1KNGA 1FO5A 3KZQA 3GRXA 1NHOA 1IYHA 3RDWA 2HZEA 2YJ7A 1SJ6A 4JBBA 4BPYA 1BEDA 1PL1A 5J9BA 4K6XA 5GSSA 5CRDA 1R5AA 3IC4A 3GL5A 2OE1A 3QCPA 3QFAC 1GSDA 1K3LA 1B4QA 1LBKA 5CRWA 3TKRA 1KBNA 1OKDA 4K7NA 3F4RA 2OBKA 4IP1A 1QQ2A 4WBRD 3GTUA 2GQLA 3D22A 3TKQA 4OCEA 4AJ7A 3VURA 2MZCA 2LUSA 2GGTA 4J56E 4MA9A 4NHWA 3ZREA 3ZRDA 4AF2A 2VL3A 3F3RA 1JLWA 2E0QA 2YZHA 4H86A 4IBPA 2JSYA 3H1NA 5ECRB 1TTZA 2FGXA 1EWXA 2HI7A 1I9DA 1UVZA 1XOBA 4L8EA 3HJMA 12GSA 5H5QA 2X8GA 1Y6EA 4KDUA 2Z9SA 1H4OA 2DJKA 1OC3A 4X1UA 3KD0A 2F8AA 3O76A 3CYNA 4P3YB 1O73A 1DBYA 2FCHA 3PH9A 1K3YA 5JWRB 2JZSA 3F4SA 2R2JA 3IV4A 5KN0A 1AC1A 1J08A 1T8EB 1AQWA 1K0NA 4EO3A 3H8QA 3CSJA 17GSA 1XW5A 3APQA 4G9HA 1YZXA 2IMFA 1OKTA 5AIVA 1PX6A 3TOTA 1A23A 3HJOA 3VLNA 1FVKA 18GSA 1B9YC 4MDCA 3ZTLA 14GSA 1K0CA 4TOPA 4XHMA 3RHCA 3UBKA 2HT9A 2HSYA 4YQUA 3TRXA 16GSA 2A2SA 1ERUA 4TXVA 4D73A 5FWGA 1UA5A 4WETA 1JZWA 3L0HA 2B5XA 2R5GA 2YCDA 6GSXA 1ZYQB 1SL2B 3NIVA 2YN1A 5KN3A 2KOKA 6GSWA 1EZKA 4IS0A 2C3NA 5DQYA 2L6DA 3BD2A 3GL3A 2C0GA 1F6MC 2MMNA 3WGEA 2ZCTA 2GT6A 2GSRA 3LWAA 4MP4A 2DIYA 2DJ3A 1NHYA 5AISA 3EURA 4PURA 4DSSA 1ILOA 3FEUA 4HQSA 4F0BA 3IBHA 1X5EA 3EWLA 3QR6A 2E2MA 5C00A 4BA7A 3PGTA 3FW2A 4Q5QA 4XS4A 2G2QA 2H1AA 4POBA 2WDUA 2YJHA 2X64A 4F9ZA 4WF5A 2E2GA 3TJFA 1GSUA 5CRHA 4MLYA 1XIYA 4N30A 2CAQA 4EVMA 1H75A 2CVKA 3M3MA 3A3TA 9GSSA 1PKWA 2VCTA 4ULXA 1ML6A 2H66A 3QOUA 1EEJA 3WD6A 3C73A 5JCUA 2O87A 3TJBA 3ZFBA 4E8EA 1A24A 1G6WA 1V98A 2NTOA 3S9FA 2GT5A 1Z6NA 4MZCA 4WKWA 2DJ0A 1SJZA 2YOIA 2IY2A 2I4AA 3ERWA 4PQIA 3GV1A 5ECIB 4KCEA 4GXZA 1DE1A 1O81A 5KN2A 5J4UA 1UC7A 10GSA 5G5FA 4RUVA 4MABA 1XOAA 3HYPA 5EVOA 4TR0A 5AGYA 5LNKe 1ON4A 4IGJA 2GQKA 2JL4A 3ME7A 3GX8A 4F0CA 3FZ9A 5ENUA 1Z3EA 1OE7A 4ZB6A 4GF0A 1X5DA 4GCIA 5HR3A 2QKEA 1F2EA 1ZL9A 2D2ZA 4V2MA 5ECKB 2XPDA 2FY6A 3HHVA 5DCHA 1M0UA 2WJUA 3IOSA 3N9JA 1TI1A 4GSSA 4ILFA 1JZDA 3R2QA 2MMAA 4OFNA 3ZYWA 2I81A 3LG6A 1XW9A 2P5RA 3E9JB 4TXOB 2VCVA 2LSTA 2KHPA 2XPEA 1NW2A 1JLVA 2RUEA 1FB6A 1U88A 2L5OA 1T4ZA 2X8CA 1TU8A 1GSFA 3ZFLA 2BJXA 5LD0A 4RQRA 4MK3A 3UAPA 1WJKA 1Z7RA 3FR9A 1RQMA 3GKXA 3UARA 1YY7A 5ECSA 1JZOA 1G0TA 3QMXA 5D9XA 3FHKA 1EEMA 2QC7A 2CT6A 4EL1A 2H0IA 2ES7A 4KSMA 2TRCP 3F6FA 1XWGA 3TRQA 1SK1A 1EGRA 2O89A 2YPMA 2OACA 1LJRA 1QFNA 1MDIA 4XIHA 1SKSB 3F0IA 3NOFA 3Q18A 2MBSA 1GSYA 3I9V2 2WGRA 4XS6A 3P2AA 1ABAA 4F82A 1DUGA 3DVWA 2IIYA 2IJYA 3IDVA 2AHEA 4KW6A 4GSNA 3A5WA 2FUG2 2JU5A 3U6VA 4EF0A 2YWMA 1QXHA 3GMFA 1BX9A 3D6IA 3RHBA 5INYA 2LNTA 1XZOA 1KEBA 3LXZA 5B8AA 5IMAA 1M2AA 4OO5A 3H4KA 2LRCA 2K9FA 2H19A 3TDGA 4Q5NA 5ELGA 2VOCA 3Q19A 1TK5B 1GTBA 1M9BA 2VLUA 3ERGA 4DSQA 3GX0A 3GYKA 1F9MA 2LS5A 3VFIA 5F05A 1E2YA 4HUAA 3HKRA 5D96A 4RI6A 3F63A 3W6GA 3QAWA 4I2UA 3CMIA 3F3QA 5J9CA 1BQ7A 3WYWA 3UIWA 5B8BA 5EL8A 2B5YA 3KM6A 2H72A 5ECQB 2KP1A 1JHBA 2JADA 2GZPA 3BCIA 1GTIA 3GSSA 4JU5A 3TJKA 3IXRA 2L59A 1YQ1A 4HJMA 2HLSA 1RK4A 4HEA2 5DJLA 2YP6A 4PNFA 3O6TA 4CHSA 2OADA 2GTUA 2XBIA 1A2JA 1FOVA 3CTFA 1GL8A 2FWFA 1YJ6A 5J3RA 2R3XA 4K0GA 2CX4A 3GUSA 1T00A 2FD3A 2C3TA 4KH7A 1T1VA 5CRGA 4EDZA 1VF2A 2HSHA 2M72A 5G1KA 20GSA 3HA9A 4HS1A 2X99A 1XWBA 5B6NA 4E8HA 4V1Ag 2PPTA 4CDOA 4KDXA 3FR3A 4IQ1A 3MDKA 3L4NA 3F6DA 2PWJA 2G0FA 4K0NA 4J57E 1AQVA 4JR4A 2GSSA 3HVXA 2FWEA 4NAXA 5ABRA 4I6XA 3FZAA 4WR5A 1XFLA 3FKFA 1CQGA 1EP8A 5B6MA 1PL2A 4TXOA 3L9UA 4MMMA 4Q5FA 1O6JA 1XWKA 4XRDA 2OE3A 1Z5YE 3EU3A 2ON7A 1FW1A 5DQSA 1MDJA 3C1SA 1GLPA 2H01A 2H75A 2IMIA 3FK8A 5ECMB 1TK0B 7GSSA 2K8VA 1GWCA 2PMTA 3IR4A 4PQ1A 5IOWA 1F3AA 2JZRA 2H70A 5FT3A 3I6AA 2RM5A 4DVCA 4MPFA 1F3BA 3ME8A 1USBA 2TIRA 3GURA 1AXDA 2AJQB 3EINA 2F8FA 2PN8A 4OO4A 4ECIA 1TRUA 3D0ZA 3UJ1A 3M1GA 2A4VA 4ZL8A 2EIRA 4F03A 1XWAA 4FYCA 1PD21 4TR3A 3H93A 4YH2A 2GZYA 2V32A 3ISOA 4TN8A 1HYUA 3DD3A 4K8MA 2DC5A 3HCZA 3QPMA 2L4CA 3U5RE 4ZBBA 3ZMLA 3US3A 5HR0A 3BBYA 2VD0A 2GS3A 1GP1A 1FVJA 1O7UA 5IMZA 19GSA 1K0MA 2GQMA 3QAGA 1CQHA 3C8EA 3TKSE 2LJRA 2LTKA 2C0EA 4ZL9A 5L71A 4LMVA 4X43A 3DVXA 1M7TA 1O8WA 4PNGA 1XBSA 3G9BA 5KN1A 4HZ2A 1MDKA 3ERFA 1TJDA 3EVIA 3F9UA 1OC9B 2DJ1A 5D9WA 1XCCA 3LFLA 5G5EA 4KGIA 2YANA 4K9ZA 4NPBA 3UMAA 1OAZA 2HFDA 2OKAA 6GSSA 3IA1A 4ZBDA 3TKSC 2MYGA 1TRVA 2H6YA 3GIXA 5HQPA 3RPPA 3H79A 3VWUA 3NZNA 1AIUA 2VL9A 1A0RP 5F07A 4POKA 2H0HA 3TCOA 4L5OA 3LSZA 1VF3A 3M9JA 1A2LA 4HU7A 1PA3A 2N5BA 3FRCA 4GQFA 1HQOA 6GSUA 1GH2A 3EYTA 1MD4A 4AJ6A 2C1YA 2HRFA 2B7JA 3KEBA 3LEFA 3LJRA 3N5OA 5GAPD 5DAKB 1BG5A 3BOAA 4NV5A 4KA0A 3OR5A 3CSIA 2IWTA 4O92A 5HFGA 1FB0A 1VGLA 2VLVA 2YWIA 1GTUA 2DJ2A 5G2ZA 1PRXA 4WR4A 2H1BA 1B8XA 1AUCA 4ECCA 2B1KA 3V1WA 4OFTA 3TRPA 1URMA 2A2RA 4HZ4A 2VCWA 2XHFA 2B5EA 2IMKA 3KXOA 2CVBA 4WEYA 1YEXA 2DMLA 1GUKA 5J41A 4I5QA 1J9BA 3W8JA 3F4TA 1X9WB 2M80A 3GSTA 5IOXA 3TKPA 8GSSA 2GZZA 4IP6A 2B1LA 1S3AA 6GSTA 4L0UA 2VM2A 4AGSA 3KIJA 1XXUA 2L4QA 2HXKA 1EP7A 1J0FA 4GQCA 4K7OA 3WGXA 2NVLA 2XC2A 3IPZA 3I43A 4V1Ap 3GH6A 1SYXA 1V2AA 4I2TA 3QDNA 2IMDA 2JACA 1ST9A 3P90A 5FHIA 2C0DA 2DIZA 5IMCA 4TVEA 1TKDB 1A8YA 1B4PA 2VM1A 2RM6A 5CNWA 2CV4A 5CYYA 2O8VB 2WRTA 3ZIVA 5HR1A 3KH9A 3KTBA 4K1FA 1SK2A 1XVQA 2PVOC 2PVQA 2YV9A 4GSTA 1EV9A 5DALB 5LCZA 5GZZB 2WCIA 3RAZA 1FHEA 2CX3A 5ECPB 4J2FA 2L6CA 1QUWA 3UEMA 4KNDA 1N2AA 4RQXA 1Z9HA 4MF7A 3TB2A 1Z7PA 1OVNA 2B3SA 3SWLA 4I8BA 2FWGA 1ACVA 1BAYA 3WT1A 2VL2C 3FY7A 6GSVA 2NPBA 4DSRA 4JZQA 3A2VA 6GSYA 1XW6A 1WMJA 1OC9A 4WF4A 2QGVA 2JSZA 4N10A 2WFCA 3APSA 4FYBA 3HVVA 3HXSA 1M2BA 1SENA 3KMOA 4IW9A 4QL9A 3K8NA 2VCQA 1U87A 5IO0A 2MBTA 1THXA 3ZLPA 2H76A 1JZRA 2L57A 4Z7XA 2AB6A 3SBCA 3W8SA 1YKAA 3DKSA 1SKWB 1AW9A 4GRFA 2IN3A 5H5RA 4O7HA 1GSEA 2IYJA 1THOA 2H74A 3GHAA 5HR2A 5F06A 1B9XC 1X9SB 3IE3A 5DAKA 5E59A 3GFKA 3RPNA 4GWRA 1A8LA 1EOGA 3E3EA 2EIOA 5IMDA 2I9HA 2HE3A 4YAVA 4LL1B 4IHUA 1QMVA 4IVFA 4TW5A 4L0WA 4FH8A 1PKZA 1UN2A 2LKUA 4ISDA 5D9VA 1M9AA 4XRAA 2VAFA 3VWVA 3KP8A 2QSIA 1X0RA 4F2IA 2HZFA 1F37A 4O5RA 3EMPA 4O32A 2VCXA 3EU4A 1TK8B 1V57A 5IQYA 4FIWA 4EDYA 2J23A 1EV4A 2F3MA 1AQXA 2IPAA 3PR8A 1GULA 2BTOT 2V2GA 4X0XA 4KCAA 5JCGA 1W4VA 2IFQB 5G31A 5ELAA 2GLRA 3DMLA 2EIQA 1PQNA 1TXXA 2DMMA 1SK0A 4OFMA 1K0DA 2P5QA 4IJ3A 5ID2B 5JCWA 2H8LA 3MWHA 4N0ZA 2VIMA 3C71A 3TKSA 3DGQA 4G19A 4WXTA 5HFIA 1GSQA 3APOA 2CA8A 1DE2A 1BYEA 2B6MA 4KX4A 4PXOA 1VRSD 3P8WA 4MJAA 4N0VA 5HFKA 1SL0B 4K2DA 3QFBC 3GKNA 3VI5A 2ON5A 4GLTA 2VO4A 3LGCA 1O8XA 5ECNB 3UBLA 1V58A 5CAXA 1XWCA 2N5AA 2KLXA 4OD7A 2ZNMA 3G7JA 4TR1B 1YDKA 3FZ5A 5DALA 5COHA 11GSA 5AN1A 1HD2A 4EXJA 2LV3A 1K0BA 2FA4A 2YV7A 1WRYA 2CVDA 1SL1B 5G1LA 4ZB8A 1TP9A 3LYKA 3HZ4A 4MJEA 5D73A 1N8JA 2RUFA 1Y25A 5A5KA 3ZVJD 3F8UA 1JFUA 3DIEA 3ZIJA 5ECHB 3TOUA 4ML6A 1W89A 2X8HA 5D8IA 2YWNA 5JWOB 3ZITA 3G7IA 3GA4A 3GH9A 4ZIJA 3ZL5A 5KEJA 4MZBA 3CXGA 3DWVA 1NSWA 5DDLA 2CAIA 2FA8A 3A2WA 2K8SA 2OJLA 1QK8A 1Q98A 2MMZA 4HOJA 4IELA 3DEXA 3FZ4A 1VF1A 2H1DA 4BVXA 4GTUA 3KGKA 3VK9A 1YF0A 3KP9A 1WWJA 2KP2A 3VI7A 4ZBAA 5AIXA 2CQ9A 1TRSA 1PGTA 1QGVA 1XVWA 3ZMKA 2WS2A 2LQQA 5IPHA 2KUCA 3TJJA 2P0GA 1S3DA 4ZXGA 1HNBA 3VPQA 4FYUA 4OMVA 22GSA 2H6ZA 2R37A 3C1RA 4NHZA 1TW9A 1O85A 1PSQA 4POLA 4V2NA 1X5CA 2AYTA 1V9WA 2V6KA 1YF1A 2V6OA 1K3OA 4MH3A 2I1UA 2WB9A 3J7Yb 5D9TA 3E0UA 1YEPA 4HJ2A 1U3IA 4YQVA 1Q4JA 1SU9A 1G7OA 4HQZA 3CRUA 4NXIA 2J9HA 2HNLA 1MD3A 1SD8A 2IFQA 2VL2A 4XS1A 2YNXA 3VWXA 1K0AA 1ERTA 2PUKC 4ECBA 2DLXA 5ID2A 3TJGA 2PGTA 5G30A 4BL7A 5H5SA 2R4VA 2O7KA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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