5G1LA

A double mutant of dsbg engineered for denitrosylation
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
LPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCGPCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Sulfur Denitrosylation by an Engineered Trx-Like Dsbg Enzyme Identifies Nucleophilic Cysteine Hydrogen Bonds as Key Functional Determinant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN DSBG
molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
total genus 67
structure length 228
sequence length 228
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 5g1lA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5g1lA02
4JBBA 1TJDA 2F8AA 1SKSB 1DUGA 4TR1B 2I81A 5DQYA 1Y25A 3ERWA 1E2YA 4BVYA 5IMFA 3UMAA 1QGVA 1SENA 2K18A 4TXVA 2X99A 5CRGA 4FH8A 3DMLA 3QOUA 2GQLA 4YH2A 5CREA 2B7KA 4GQFA 1FO5A 2M72A 2WB9A 4F82A 1GTIA 2HRFA 4GSTA 4PQ1A 4GSNA 1U3AA 1GUHA 2EIQA 3DGQA 2CVKA 1EGRA 2C0GA 3W6GA 1MDKA 3V1WA 2JL4A 3NOFA 3M8NA 4E8HA 2FUG2 2QKEA 4TR0A 4OD7A 3GUSA 2JSYA 4TR3A 3IK7A 4TXOB 1GSUA 4HI7A 4EDYA 4V1Ag 2O85A 1HNAA 4WR4A 3I69A 2L6DA 4WF5A 2H70A 2V6KA 5F06A 2H74A 1NSWA 4I6XA 5CRDA 1GTAA 4KA0A 4KW6A 3N5OA 2BMXA 2DMLA 4MF7A 3HY2A 2VCVA 4DSSA 1OC9B 3KTBA 5JWQB 4KH7A 2C3QA 3A2WA 3ZIJA 4HEA2 1M9AA 3TJKA 4MH2A 1THXA 3FKFA 2PWJA 1OYJA 1YF1A 5D9TA 3ZFLA 4AF2A 5B7CA 3UVTA 1QXHA 2AYTA 4IVFA 2VAFA 3IE3A 3VI5A 5J4UA 2GZYA 3TKSE 1EOGA 1ON4A 1KEBA 2REMA 4DVCA 3F63A 4MPGA 1GL8A 1G7OA 3UVHA 4FYCA 3FR6A 1M9BA 4GF0A 1XXUA 2IN3A 2HZFA 4X43A 17GSA 2JZRA 1JLVA 1JZRA 2VD1A 2VCQA 5F05A 22GSA 2H72A 4MJEA 2DJKA 1RQMA 3PGTA 2RIIA 2H1BA 4ACSA 3GL5A 2E2GA 1XWBA 2DJ0A 5LCZA 4KX4A 1AAZA 1U88A 3TKSA 5A4UA 3QCPA 4WKWA 5IMZA 3A5WA 20GSA 1ERWA 1ACVA 3VWXA 2H0HA 1XOAA 4KSOA 3VURA 3GFKA 3LWAA 4BL7A 3GYKA 5FT3A 1TOFA 3L0HA 3EURA 2GZZA 5ENUA 2C4JA 2GVPA 3TOTA 4IELA 2AUVA 4XCSA 3CSJA 4Q5QA 5ELAA 4ML6A 2OJLA 3BBYA 2PGTA 3BD2A 4K0NA 2LJRA 2HYXA 3GA4A 3GSSA 3TKSC 4FYUA 5E59A 5AGYA 4MH3A 4MK3A 1A0RP 2MBTA 2LQQA 3J7Yk 3C7MA 5ID2A 3LFLA 4RQXA 5KEJA 4ECJA 5G1KA 4PX1A 5GSSA 5B6MA 4D73B 1H4OA 2H75A 2YWNA 2HI7A 2EIRA 1Z6NA 4F2IA 1BJXA 3IOSA 1N8JA 2OACA 2YPMA 3QAVA 2VM2A 2DJ2A 3IDVA 4JU5A 4PUAA 2H1AA 2ZUPA 2TRCP 1BX9A 5F8BA 2J9HA 3ISOA 1QFNA 3K8NA 5D93A 4DSRA 4NHWA 5EL8A 1K0CA 3UBLA 1NHYA 1JZOA 2XBQA 1SK1A 4ZL9A 3L9VA 3UJ1A 4V2NA 2YV9A 1FW1A 4L0WA 6GSUA 1GSSA 1SK2A 4YQUA 3VWWA 3PH9A 4G2EA 2N5FA 1K3YA 4AJ8A 3HVSA 3QAGA 3QFAC 4O5RA 3A2VA 5D9WA 2H1GA 2H6ZA 1WPIA 2O7KA 1M7TA 1TI1A 4POMA 3DXBA 3QAWA 4LMVA 1T1VA 2P31A 4QL9A 3DYRA 1JZDA 4TR1A 1I5GA 1GUKA 2F8FA 2KHPA 5IIZA 1F37A 2AV4A 3IAS2 16GSA 2CAQA 5HFKA 3ZZXA 3TKPA 1GLQA 4J57E 1V57A 1K3LA 5HR0A 1XBSA 3UAPA 2C3NA 2B1KA 2GSQA 3ZLPA 1W89A 1O8XA 3HZ8A 4WBRD 3WGDA 3EINA 5G2ZA 1RK4A 4K0GA 3G9BA 2FWGA 4BPYA 3LXTA 3WT1A 3F3RA 3UOMA 1ST9A 3KGKA 3KP8A 1YY7A 2OBIA 1ZL9A 3GL3A 4JE1A 4KAEA 2FHEA 5J5NA 1KNGA 2IPAA 1JHBA 1EV4A 3FY7A 4TXOA 3IHQA 3LYPA 1HD2A 2CX4A 3VPTA 3MWHA 3SWLA 4GTUA 4KGIA 4MJBA 5DJMA 4NXIA 4IW9A 2K8SA 1X0RA 2VCZA 1ZMAA 1O73A 2OE0A 4GQCA 3HXSA 1BG5A 2L57A 3WD6A 3IAM2 2C3TA 4K8MA 1OKTA 5CYYA 2DSAA 1OC9A 5AISA 1GSEA 2MMNA 4MF6A 2ALBA 2IMFA 3TJGA 4MJAA 4ZIJA 1TK5B 1W4VA 5J9BA 4OFNA 2CAIA 3P90A 2GS3A 3S9FA 2QC7A 3VI7A 4PQIA 3GKXA 3TJBA 1YQ1A 1AIUA 5HFGA 2RM6A 2WULA 4L5LA 4MZBA 3ED3A 2MMOA 3MAKA 6GSVA 4OO4A 1A23A 1GH2A 3P7XA 1MDIA 2WZ9A 4XHMA 3KD0A 1KBNA 4NAXA 5IO2A 2VLVA 1ZGNA 2E7PA 4X1UA 2C1YA 1LU4A 2ES7A 2B5EA 2F3MA 3F3QA 4LL1B 4CHSA 4AJ7A 3HJMA 4OFTA 1SYRA 2XHFA 1QQ2A 3M9KA 5HR3A 3RPNA 2H1DA 4BVXA 4KE3A 5G5EA 3IRAA 3GH6A 1UA5A 5LD0A 5A4WA 3D0ZA 1CQHA 5AN1A 4N11A 1V2AA 2C0FA 4GWRA 3H1NA 2WRTA 5IM9A 2AHEA 2OE1A 2IMKA 4WEYA 4EC0A 3KEBA 3GTUB 4MLYA 5IPHA 2IMEA 3KZQA 1ML6A 4K2DA 5KN2A 5D96A 4TW5A 1J9BA 3F8UA 4RUVA 4CW9A 2G2QA 2YWMA 4IBPA 4BA7A 3FYGA 6GSYA 2F51A 3M1GA 1FVJA 1GSYA 5ECHB 2GSTA 3HJOA 2H30A 3RBTA 2OKAA 1SD8A 3UEMA 4LLRA 1SYXA 4ZBAA 2R4VA 1UN2A 2PVOC 5J3RA 2JACA 4D73A 1PD21 3LXZA 3D4TA 4ZB8A 2A2RA 2ZNMA 1K3OA 5G31A 3VK9A 2YJ7A 5INYA 3TCOA 5B8BA 4K7IA 1G0TA 5CP1A 1R26A 2LRCA 3HJPA 2HFDA 1PKWA 1JLWA 1GNEA 3ZMLA 4XRDA 3HCZA 2EC4A 5DCGA 3APOA 4I2TA 5AIVA 2TIRA 5A5KA 1TKDB 6GSTA 3DIEA 3GHAA 3WT2A 3GKKA 2HSHA 5HR1A 1BEDA 3LSZA 5JWRB 3DWVA 2VCWA 3TDGA 4OCEA 4JR6A 5IMDA 2B7JA 4O92A 4MF5A 3TRQA 3BCIA 2KUCA 3RAZA 1THOA 4OWYA 5EVOA 2PBJA 3KMOA 1OE7A 5JCUA 1EOHA 3TOUA 1K0OA 5IOXA 3F6DA 3EU3A 5F07A 4EKZA 4GCIA 4N0VA 3HKRA 1WIKA 3CTGA 2VL9A 2VLTA 1Z7PA 2HZEB 5H5RA 3GX8A 1R5PA 2H0IA 1T4ZA 1XFLA 1WOUA 2VCXA 1AXDA 1O8WA 1OAZA 4I2UA 4Q5NA 1T00A 3O76A 1SJIA 1VF2A 5ABRA 2H73A 3MNGA 3ZIVA 3VFIA 3L78A 3TB2A 1PX6A 1ZZYA 1TRWA 2L5OA 2LJKA 2CVDA 5IQYA 2GDRA 4TN8A 3CSIA 3MSZA 3ERGA 2HSYA 5COHA 1GSQA 2FA4A 3EMPA 1TW9A 4IGJA 3KM6A 4KSMA 4LMWA 1LBKA 3TRPA 2H76A 4DEJA 2YWOA 4O7HA 2VM1A 4NMUA 1X9WB 3U6VA 2Z9SA 1XVQA 3E3EA 2YJHA 1AQXA 3G7YA 2WFCA 1EEMA 4KB3A 4PXOA 5F0GA 3DD3A 4KCAA 1G7EA 4TVEA 5CRWA 4TKYA 2IL3A 1SL1B 4JRRA 3QD9A 1GNWA 1ILOA 1R4WA 2DBCA 3LJRA 1V58A 4KDUA 3M0FA 3VLNA 3LEFA 2IWTA 5D8IA 1YJ6A 2LSTA 1T7PB 1TRVA 3MDKA 2V32A 1A24A 3Q18A 1PL1A 2EIOA 2GLRA 2LQOA 1FG4A 4I97A 1YEPA 5G1LA 4EUYA 3U5RE 5ECIB 1PQNA 3APSA 1QMVA 3P8WA 4WETA 2J23A 3EVIA 2PU9C 3CBUA 3GH9A 4HZ2A 4BWQA 2VL3A 3RHBA 2B1LA 2JZTA 5IMCA 1YZXA 4MP4A 3SBCA 4MZCA 1TRSA 12GSA 4H86A 2FD3A 2H6XA 3IBHA 1VRSD 3BOAA 4ECCA 3D21A 5GAND 8GSSA 2BTOT 1MD4A 4PNGA 3TGZA 1AQVA 9GSSA 3KH7A 2H8LA 1HYUA 3UARA 3ZITA 4KDYA 2WJUA 2OBKA 3F9UA 3KIJA 2L6CA 5DVBA 4JEDA 4HJMA 4NWYA 1V9WA 2LV3A 2YNXA 2MMZA 3ZYWA 1J0FA 4HQSA 5CNWA 2FA8A 3I43A 2R3XA 4RQRA 2GSSA 3LQ7A 4Z7XA 2HE3A 18GSA 1DSBA 5H5QA 1WJKA 2H66A 1ERUA 4IP1A 1U3IA 2MZCA 2YCDA 1G6YA 5AIXA 3KJYA 3GTUA 4F0CA 3H79A 2LRNA 3IXRA 1PN9A 2LS5A 3JCML 2R37A 5CO3A 1TP9A 4V2LA 1A2JA 3DVXA 2KP1A 1VGLA 5GAPD 1TTZA 2H0GA 1GRXA 5ECSA 1IYIA 2HNLA 1K0BA 4OFMA 3F4RA 4DSQA 2NVLA 2IY2A 1O6JA 2ON5A 1B8XA 1GSFA 1Z5YE 1A2MA 5ECMB 3D5JA 5HR2A 1TK0B 1K0AA 2B6MA 3FW2A 3ZMKA 1TU7A 3TJFA 4G10A 2OE3A 4L5OA 4QL7A 3GV1A 1SL2B 3WGXA 1F6MC 1SL0B 2CT6A 1U87A 4E8EA 3CRTA 6GSWA 3HVXA 4XTSA 3IPZA 2WGRA 3HDCA 1A8YA 1A8LA 2QGVA 1S3AA 4ZBDA 2WDUA 2R2JA 2NTOA 3FR9A 1Q4JA 2XPEA 3F6FA 2YV7A 4TOPA 5JCWA 5GZZB 4XS4B 2GZPA 2VO4A 4ZL8A 5G5FA 4JR4A 4I8BA 2GT6A 4GXZA 2PN8A 4ZILA 3ZVJD 3RDWA 4K7OA 2DJ3A 4AJ6A 2RUEA 2VL2A 2A4VA 2WS2A 3BJ5A 5ECNB 3HVVA 1K0MA 2P5QA 3CTFA 2HZEA 4HQZA 3FRCA 4HOJA 2HLSA 2YANA 4EO3A 1EEJA 1M2BA 3GRXA 3GMFA 3BCKA 4IN0A 4WF4A 1JZWA 4GRFA 4GLTA 1F3BA 4ZB9A 3FZ9A 1GLPA 2L5LA 1T3BA 3TRXA 1B48A 5ECRB 3F0IA 1OVNA 2GQKA 2GTUA 2YWIA 4Q5FA 1S3DA 3ZTLA 2AB6A 1OKDA 1PRXA 2MYGA 1FVKA 3J7Yb 1WMJA 1T4YA 3E0UA 4FO5A 2PUKC 1DE2A 4EVMA 4MJCA 1SU9A 1UC7A 14GSA 2IYJA 3I9V2 3D4MA 1X9MB 5JCGA 1A0FA 3TUEA 3D22A 1X5EA 3KXOA 2LNSA 2DC5A 1ZCPA 2O89A 2VLUA 1TDIA 4EF0A 3F4SA 1GULA 1O7UA 5D9VA 1FHEA 4K1FA 3H4KA 3Q74A 1K0DA 1PL2A 1V98A 1O81A 1PA3A 4G19A 4K9ZA 3CXGA 2FCHA 3ME7A 5HQPA 2YZUA 5ECLB 3H93A 4O32A 3HYPA 2IIYA 2V2GA 5HFIA 1RW1A 1XW5A 1F2EA 1ABAA 2LEGA 5DDLA 1FB6A 3G7JA 2GSRA 2AJQB 2LTKA 4POLA 2KP2A 3GURA 5ECOB 5KN3A 2CZ2A 1JFUA 3ZVJA 3W8SA 1SJZA 1HNBA 2VUPA 3ZL5A 13GSA 3E9JB 2YZHA 4HUAA 1E6BA 2GQMA 2B5XA 4RI6A 3KH9A 2PERA 1FAAA 1XZOA 4IQ1A 4PUFC 4HU7A 1FB0A 2IFQB 2JADA 2FY6A 2A2SA 1PGTA 2GT5A 4MA9A 1IYHA 3F4TA 3A2XA 1YKCA 2VCTA 2K8VA 4XS1A 2I4AA 2K6VA 2I1UA 3CMIA 1V40A 5ECQB 1J08A 6GSSA 2XBIA 3KMNA 1YKAA 3DKSA 4K6XA 1ERTA 1B4QA 4KCEA 3Q19A 2PMTA 5DAKB 1M0UA 4NV5A 2DLXA 2LJAA 4XS6A 4G9HA 2VD0A 2KOKA 3EMXA 3GKNA 1UVZA 3FEUA 4FYBA 4HU9A 1LJRA 3UL3A 4XRAA 4LA1A 2P0GA 1HQOA 2B3SA 3FK8A 4MCUA 1DE1A 5B8AA 1ZYEA 2M80A 2YP6A 1XPVA 2DIZA 4PQHA 4TR4A 4EE0A 4HZ4A 4ML1A 2H6YA 2F9SA 3IA1A 2VOCA 3N9JA 10GSA 5ECKB 2FLSA 5IMVA 3G7IA 2MBSA 1OC8A 2ON7A 4K7NA 4ILFA 2X8HA 1QUWA 2YOIA 4IJ3A 1PMTA 2LUSA 1GSDA 2R6KA 4HDEA 1YF0A 1AC1A 1XW9A 3ERFA 5D9XA 1AUCA 1QK8A 4WXTA 2V6OA 2C0EA 2DJJA 4FIWA 2DJ1A 1R7HA 1Z9HA 1NM3A 4PGTA 2FWEA 3FHKA 3LORA 5FHIA 4YAPA 1M99A 2NPBA 1BAYA 1HNCA 4KUNA 3KTLA 1GWCA 3I6AA 1USBA 2IMIA 5LNKe 3LGCA 5ELGA 4ULXA 4OCFA 3KCMA 5C00A 3TJJA 4MDCA 2RLIA 1YEXA 3W8JA 1N2AA 3C73A 2R5GA 2PPTA 2L59A 3FZ4A 1VF3A 1TU8A 3O3TA 7GSSA 1B9XC 4ZB6A 1Z7RA 3EE2A 3TKQA 3C71A 1XW6A 1WP0A 1S3CA 3CRUA 4IQAA 1ERVA 5DJLA 3VWVA 2MMAA 2N5BA 5EPFA 4NV2A 2C80A 4KDXA 2CZ3A 4XS4A 4AGSA 2I3YA 3L4NA 4RI7A 4Q5RA 1I9DA 3OR5A 4XIHA 1VF1A 4NHZA 1KTEA 2HT9A 3VPQA 3GKMA 2PVQA 2V41A 1EP7A 4EL1A 2YN1A 3Q6OA 4CDOA 3O6TA 4TRXA 4HJ2A 2C8UA 1VF4A 2D2ZA 2JU5A 1G6WA 1WWJA 2N5AA 2B5YA 3FR3A 2JSZA 5CRHA 2FNOA 1WE0A 1X9SB 3FZAA 1CQGA 1Z3EA 19GSA 2CX3A 5DBQA 1XWCA 2VIMA 2DMMA 5DALA 1PKZA 1X5CA 4POKA 4X0XA 1F9MA 2NDOA 2K9FA 3A3TA 4ISDA 4YQMA 4WBJA 3TKRA 2P5RA 3IR4A 4IP6A 2O8VB 3C1SA 3IC4A 6GSXA 5J9CA 4N0ZA 1X5DA 4GSSA 1Z6MA 4POBA 2M46A 2CV4A 1FOVA 2RM5A 5DCHA 5L71A 2H71A 1SK0A 1XVWA 4V1Ap 4ID0A 1B9YC 1BQ7A 2C0DA 1Q98A 3R2QA 2FWHA 2NBSA 3EWLA 1URMA 3M9JA 4L0UA 5G30A 5H5SA 2V1MA 3M3MA 1MTCA 3US3A 2G0FA 1K0NA 4DSSB 3L9UA 4YAVA 2H01A 4ZBBA 3PINA 4NPBA 3DEXA 1MD3A 2XPDA 1EZKA 2QSIA 1GP1A 2AAWA 1PX7A 3KP9A 5JWOB 5J41A 4N30A 4MMMA 1F3AA 1NW2A 1NHOA 1XWGA 1SKWB 3DVWA 5B6NA 4LL4B 3IV4A 2LRTA 1TK8B 4ECBA 1EP8A 3P2AA 4QQ7A 3HHVA 1MEKA 3PR8A 5ECPB 3WYWA 2H19A 3LG6A 2DIYA 5IMAA 3UBKA 1AW9A 1SJ6A 2L4QA 3QMXA 1WRYA 4BWSA 1XWAA 1EGOA 5IPGA 1DBYA 3C1RA 3L9SA 2IFQA 5KN0A 5EY6A 3QPMA 4V2MA 2KLXA 3H8QA 4IHUA 3HA9A 4MZWA 1T8EB 1MDJA 1OC3A 5IOWA 4N10A 2I9HA 2E2MA 2RUFA 4P3YB 3HD5A 4IS0A 1GTUA 1TRUA 2XC2A 2BJXA 1OE8A 2GGTA 4PNFA 5DAKA 1EV9A 2FWFA 4F0BA 4KNDA 3GNJA 1M2AA 4MPFA 2HXKA 2CA8A 4J56E 3HZ4A 4ZXGA 3UIWA 4JZQA 1SKRB 4PURA 3EC3A 1H75A 4ZL7A 4MABA 1ZYQB 1M2DA 1C72A 3EYTA 1XOBA 3QFBC 1GUMA 1YDKA 2CQ9A 3VWUA 4WR5A 1AQWA 3NIVA 3RPPA 3AY8A 4F9ZA 3GN3A 1PSQA 5C04A 3IK9A 1A2LA 2CVBA 1GTBA 1SD9A 3ZREA 5ID2B 1R5AA 5KN1A 5DQSA 5IO0A 2OADA 1TXXA 1TI3A 5DALB 4I5QA 1XCCA 2FGXA 2HRNA 2IJYA 2TRXA 5A4VA 3WGEA 4EXJA 3FZ5A 2IMDA 3APQA 1Y6EA 5E4WA 2ZCTA 2X8GA 3GX0A 1BYEA 2E0QA 3QDNA 2X64A 2VL2C 3NZNA 3EU4A 5D73A 1ZOFA 3ME8A 2L4CA 4ECIA 3RHCA 1XIYA 4IJIA 2WCIA 4EDZA 3CSHA 3DRNA 2LKUA 3D6IA 1XWKA 5CAXA 3GSTA 3QR6A 2LNTA 1U6TA 4YQVA 4L8EA 2JZSA 3GIXA 1EWXA 5GSTA 4F03A 4J2FA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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