5G1LA

A double mutant of dsbg engineered for denitrosylation
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
LPAPVKAIEKQGITIIKTFDAPGGMKGYLGKYQDMGVTIYLTPDGKHAISGYMYNEKGENLSNTLIEKEIYAPAGREMWQRMEQSHWLLDGKKDAPVIVYVFADPFCGPCKQFWQQARPWVDSGKVQLRTLLVGVIKPESPATAAAILASKDPAKTWQQYEASGGKLKLNVPANVSTEQMKVLSDNEKLMDDLGANVTPAIYYMSKENTLQQAVGLPDQKTLNIIMGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords THIOL DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN DSBG
publication title Sulfur Denitrosylation by an Engineered Trx-Like Dsbg Enzyme Identifies Nucleophilic Cysteine Hydrogen Bonds as Key Functional Determinant.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Isomerase
total genus 67
structure length 228
sequence length 228
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 5g1lA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5g1lA02
1ACVA 4JEDA 3C1SA 3D21A 3H93A 3Q19A 4DSQA 2XBIA 2LQQA 4J56E 5ECPB 1SENA 1AQWA 9GSSA 3CBUA 4V2NA 4K1FA 1S3AA 1AXDA 4AGSA 1OE7A 3HJOA 1EOHA 4IHUA 1M9BA 4L5OA 2N5FA 1T4YA 3C8EA 1AQXA 1NHYA 2DC5A 3TJKA 4XRDA 2HFDA 2H74A 1XW6A 1QGVA 5JCGA 4ZBDA 2YV9A 3GH9A 2YJHA 22GSA 4GQFA 5F06A 4OMVA 2GT5A 3ZYWA 3EVIA 3ED3A 3EMPA 5HR0A 3PINA 4ISDA 2RM6A 3F6FA 1YKCA 4N11A 5EVOA 5ID2A 4JU5A 4JZQA 3WYWA 2GVPA 3A2XA 1BQ7A 4YAVA 5GSTA 3WT1A 1T1VA 3ZVJD 2CX3A 4ZIJA 1AAZA 4YH2A 4F0BA 2FWEA 1G7OA 5F05A 4KGIA 1WMJA 5KN3A 1I9DA 1UVZA 4X43A 3ME7A 3GH6A 5ECKB 1M2AA 1O8XA 3H4KA 3A2WA 1HNBA 2J9HA 2VM1A 3BBYA 4XS1A 2H75A 2H0HA 2M46A 3GURA 3KP9A 1T8EB 6GSXA 4N10A 1SKRB 1SD8A 3EE2A 1MTCA 1CQHA 4Z7XA 4D73B 1XWAA 16GSA 3F3RA 2CAIA 3HVVA 1VRSD 4O92A 3FW2A 2C80A 2B1LA 1IYIA 2WRTA 2LTKA 4TOPA 1AIUA 3CTGA 4XHMA 2OADA 1VF4A 4EDZA 4PQIA 13GSA 4MA9A 4IQ1A 2YJ7A 3HDCA 2V32A 5DAKB 1TP9A 5D9XA 2DJ2A 1SU9A 3O3TA 2LJRA 1XIYA 3U6VA 4IP6A 5CO3A 3NZNA 4LL4B 2C4JA 1XWKA 4OD7A 1ST9A 3GN3A 1A2MA 2REMA 3M9KA 4EE0A 3GSTA 5B6NA 1YDKA 4X1UA 2LJAA 1A2JA 1O7UA 1S3CA 3TKPA 3GKXA 2O89A 2H1GA 2VM2A 5IMAA 2M80A 2FNOA 5IMFA 3L0HA 3QAVA 4J57E 4MJCA 2ZCTA 5B6MA 4LL1B 2GQMA 3O76A 3TKSC 4K6XA 4G2EA 2IN3A 2QKEA 3QD9A 2RLIA 1B4QA 4LMWA 3NOFA 3ZMLA 2VLVA 4GXZA 3RDWA 5CRHA 3PH9A 4OO5A 3KXOA 3FEUA 3GIXA 1U3AA 5CREA 4I97A 5HR3A 3VFIA 3CRTA 4OWYA 1XVWA 1X0RA 2VD1A 4EKZA 2L4CA 2FWFA 2TIRA 1GSUA 3EU4A 1TK0B 2VL2A 2C0GA 1QFNA 1YZXA 3QCPA 1V2AA 3KIJA 2FLSA 1V58A 4DSSB 2P0GA 1TI3A 4GTUA 4OO4A 2I9HA 5EL8A 1DBYA 1Z6MA 2OBKA 4BL7A 2I4AA 1I5GA 4K8MA 4IVFA 3EC3A 4RI6A 3DMLA 5D9VA 4PNGA 1X9SB 4HJ2A 1PX6A 4ZILA 2IIYA 3LG6A 3LFLA 2K8VA 3ZZXA 4V2MA 2PPTA 5J4UA 1SYXA 5EPFA 2YPMA 2LNTA 1OYJA 1PGTA 2WFCA 1ERVA 4KW6A 4GSTA 1TJDA 3V1WA 1H4OA 1GH2A 3G7YA 5IMDA 1USBA 3UL3A 4BA7A 2V41A 1J0FA 3ZFBA 2IMIA 2Z9SA 2MMZA 3LEFA 1GSFA 3TDGA 1DE2A 2OA7A 3J7Yk 3IPZA 3D4MA 3HJMA 3F4SA 4HJMA 2OJLA 2WB9A 2AYTA 4MPGA 3W8SA 2H66A 3CSIA 1O6JA 3LSZA 4BWQA 1FHEA 1JFUA 2AB6A 3DEXA 4KDXA 4KSOA 4NPBA 1M99A 2VCXA 3GX8A 4KH7A 3H1NA 4ACSA 3RHCA 1WJKA 4HS1A 1G6YA 2FA4A 1F3AA 4WETA 3AY8A 3BOAA 1YF1A 4Q5RA 1B48A 3E3EA 1TXXA 1B4PA 4NAXA 2GSQA 3S9FA 4I2TA 4I2UA 5B8BA 2B5XA 3M8NA 4D73A 1FB6A 2OACA 4O5RA 4L0UA 2GS3A 2C3QA 4OCEA 1OKDA 1XW9A 4HU7A 1LJRA 2H0GA 4DEJA 4K0NA 1TDIA 3TKQA 4PNFA 3IHQA 2PWJA 4RQRA 2IYJA 2YWIA 2H6ZA 5ELAA 1G7EA 3APOA 1U87A 3G9BA 2L6CA 2TRXA 2FD3A 3ZRDA 1V98A 1ZYQB 3GKMA 2QC7A 3HKRA 4K7IA 3MWHA 4N0ZA 5DAKA 4ECBA 4MDCA 2GT6A 3HCZA 2CVDA 1SJZA 2XHFA 1PD21 1GSQA 4EDYA 2RUEA 1YEPA 2HSHA 1FOVA 2WJUA 4EVMA 3LXTA 1K3YA 2AUVA 3ZTLA 1T4ZA 3MSZA 4V2LA 4XS4B 1GUMA 2DMMA 2VLUA 5IMZA 3EINA 1NSWA 2MMNA 4PX1A 2V2GA 2B6MA 4K0GA 1B9YC 1EWXA 2IMEA 2JZRA 3L9SA 2IMDA 2CAQA 4TR4A 2DJ3A 2G0FA 2R5GA 3F4TA 5GSSA 1K0DA 5D96A 1BYEA 2WZ9A 3IE3A 2BTOT 2H6XA 1O73A 3ZL5A 2VOCA 3UJ1A 2H71A 1U6TA 5AN1A 2VCWA 4ILFA 4MMMA 1A8LA 3O6TA 2GSSA 4O32A 3VPTA 3EWLA 2V6KA 4LLRA 5ECNB 4WKWA 1N2AA 1ZZYA 5AGYA 3C73A 4DSSA 3DXBA 2R2JA 2H70A 1GTUA 5DJMA 2JZSA 1U88A 3HXSA 4QL7A 3EURA 5IO0A 1R4WA 4IQAA 1A23A 1GTAA 2GQLA 5J9CA 1ZGNA 2PVOC 3KGKA 1EP7A 3FZ9A 1G0TA 1B8XA 4HU9A 2A4VA 5IPGA 2F8AA 1XCCA 1GTIA 4RI7A 3IAM2 2L4QA 2WDUA 5H5QA 1GSEA 3IAS2 3EU3A 1TK5B 2XPDA 1AQVA 2CT6A 1GULA 3EMXA 4LA1A 4KDUA 3FKFA 1PQNA 5KN1A 4OFMA 3CSHA 5ABRA 2C3TA 3I6AA 2PVQA 3GFKA 1EEMA 2YANA 4JRRA 5DALB 2F9SA 4HUAA 3GA4A 1W89A 3TCOA 3ME8A 3CMIA 5IMCA 2K8SA 3W8JA 3FR9A 3VLNA 1BEDA 4G10A 4PUAA 3P2AA 1T7PB 4RUVA 3N9JA 5L71A 3GKNA 2WCIA 2DJ0A 4AJ6A 1YJ6A 5DDLA 3ZFLA 2K18A 3M3MA 3RHBA 2B7KA 3KZQA 3TKSA 1O85A 2XC2A 5GAPD 3L78A 1YKAA 3VK9A 2WGRA 4I5QA 2HXKA 3M1GA 4KA0A 4HI7A 1Q98A 1Y6EA 2I81A 1JZOA 4MH3A 1FVKA 3A5WA 3KD0A 4FIWA 1PKWA 2VCZA 4MZWA 2ALBA 1UN2A 2MMAA 5JWQB 4ECCA 6GSTA 3TOUA 4NV5A 1FW1A 2HYXA 1X5EA 4KSMA 1S3DA 1X5DA 3WGEA 2H72A 1Y25A 1NHOA 3HY2A 5KN2A 3TJGA 2RIIA 3BCIA 3VI7A 3ERFA 3E9JB 3IXRA 1EGOA 5H5SA 2JSZA 4WR5A 5C04A 2JZTA 1J9BA 5INYA 4XS4A 1HQOA 4WXTA 1NM3A 3TRPA 1K0BA 5IM9A 4KCAA 1LBKA 1PL2A 4BVXA 3TJFA 2N5AA 1FO5A 3D0ZA 5ECMB 3D6IA 4G19A 1SL1B 5JCWA 3UARA 3MNGA 19GSA 3JCML 1K0OA 4L5LA 2R4VA 3D5JA 3SBCA 3IK9A 1TKDB 2C3NA 4P3YB 3CYNA 2LV3A 2IMFA 3FYGA 3C7MA 4L8EA 1PRXA 2E0QA 3ISOA 3HYPA 3KEBA 1HD2A 2OE3A 3GSSA 1OAZA 3QFBC 2GGTA 2GLRA 3UMAA 4Q5NA 3F8UA 2CA8A 4ID0A 3MDKA 4IKHA 18GSA 5DQSA 2VCTA 4MJAA 5A4UA 5IQYA 4OCFA 1SD9A 3VI5A 4NWYA 3M0FA 4Q5FA 2GZPA 5DCHA 2J23A 5HQPA 3G7IA 5G5EA 4TR1B 3ZLPA 1Z5YE 1RW1A 2NDOA 2FY6A 1DUGA 1GUKA 3BD2A 6GSVA 2H1AA 3HZ4A 1TU8A 3VWXA 2LRCA 1ILOA 3G7JA 2IMKA 2B7JA 2ON7A 2C1YA 2N5BA 4N30A 4MK3A 5F8BA 3WGDA 3VPQA 4GF0A 1M2BA 5H5RA 5B8AA 2XBQA 4F9ZA 3CSJA 2QGVA 6GSSA 3SWLA 2NTOA 4IS0A 1PL1A 3HVXA 5LCZA 1GSSA 4NMUA 4WR4A 1N8JA 3F6DA 2PUKC 4DSRA 1GNWA 3HVSA 2E7PA 4MCUA 4ZL7A 1SKWB 2CZ2A 5DALA 2R37A 4IP1A 4QQ7A 1W4VA 2ZUPA 4KUNA 3KH7A 4I8BA 3A2VA 3DRNA 3UBLA 1OKTA 4XTSA 1YEXA 2PGTA 1BG5A 3ZIVA 1A0FA 4E8HA 12GSA 2NBSA 4MH2A 3US3A 3LWAA 2V6OA 2CQ9A 2DIZA 4CW9A 1Q4JA 1TU7A 1VF2A 3IK7A 5IPHA 2JADA 1XWCA 3HJPA 5GZZB 2EIQA 2B5YA 3TKRA 1Z6NA 3BJ5A 3C71A 3KH9A 5ECSA 5B7CA 1OVNA 3FR3A 2D2ZA 2ZNMA 2GQKA 5A4WA 4ZB9A 2LJKA 3K8NA 2PERA 1X9WB 5IMVA 3GX0A 3F4RA 1EEJA 1OC8A 4G9HA 2YOIA 2GZZA 4ZL8A 4AJ7A 4JR6A 2AAWA 3GHAA 1FB0A 4GLTA 2H8LA 6GSYA 1Z7RA 1FVJA 3LYKA 2A2SA 1YF0A 2A2RA 3FHKA 1XWGA 2GSTA 5GAND 3ERGA 4KCEA 1XVQA 2YP6A 3D4TA 2FA8A 1ON4A 1OC3A 2H01A 3CRUA 2JL4A 5ECIB 4XIHA 1EGRA 2LRTA 2VCQA 2VLTA 3LGCA 2IL3A 1ERUA 1GP1A 4IW9A 3J7Yb 1V9WA 3L9VA 1A0RP 2LEGA 4ZL9A 8GSSA 2FGXA 2GDRA 2VL2C 2PU9C 3N5OA 1V40A 1M0UA 1GLPA 5A5KA 3D22A 2C0EA 3KJYA 1K0AA 4V1Ag 1OC9B 1TRWA 1UA5A 2YZHA 4MLYA 1A2LA 2OE1A 2H19A 4KDYA 2VO4A 3IA1A 4ECJA 1A24A 2HRFA 1EV4A 4AJ8A 3QOUA 1BX9A 3APQA 2LS5A 1GUHA 3GYKA 4MZCA 2ON5A 4PQ1A 2IFQB 3CXGA 3ZMKA 5D9TA 2O87A 3F9UA 1FG4A 1WP0A 1KNGA 1YQ1A 1GL8A 4K2DA 1ABAA 1A8YA 4QL9A 4WBJA 4BVYA 1F37A 4FO5A 1QQ2A 4I6XA 3LYPA 2L59A 3H8QA 5DCGA 1R5PA 1K3OA 2I1UA 1X5CA 2B1KA 1K3LA 4FYUA 5HFIA 4TR1A 4MP4A 1XZOA 4YQUA 4WF5A 2PBJA 2VCVA 1ZL9A 4NV2A 1MDJA 5F0GA 4TR3A 2B5EA 3ZVJA 3PR8A 2B3SA 2BMXA 4KE3A 4RQXA 1KTEA 4K9ZA 3OR5A 4ZBBA 2VL3A 4TKYA 1MD4A 2GSRA 3DKSA 4FH8A 2MBSA 1Z3EA 3UVHA 3RPPA 1DSBA 1T00A 4WBRD 1XOBA 2LQOA 3UIWA 1VF3A 2XPEA 2HLSA 5LD0A 1F2EA 5HFGA 2YV7A 3TUEA 4F82A 5ENUA 2F51A 1SL0B 5J41A 3UBKA 2H6YA 2LUSA 1THXA 3CTFA 3H79A 11GSA 4TR0A 2MBTA 2DSAA 5D93A 2BJXA 2K6VA 4IELA 4DVCA 1R5AA 5JCUA 5CRGA 2NVLA 5J9BA 3TGZA 1FAAA 3FZ5A 1G6WA 2KP2A 1URMA 2KLXA 5DBQA 4TVEA 2JU5A 4K7NA 1WOUA 2E2MA 3KP8A 3QR6A 4FYCA 4PXOA 2RM5A 2FUG2 5CP1A 2V1MA 1E6BA 4YQMA 5HFKA 1WIKA 1F9MA 4F03A 2X64A 2CVKA 3GL3A 3UAPA 3GV1A 5J5NA 5G1KA 4PGTA 1R26A 3RAZA 3DD3A 3RPNA 1XPVA 1PMTA 3GNJA 3QPMA 4IBPA 1GLQA 1HNAA 3P90A 4IJIA 3HA9A 4TXOB 2LKUA 4XRAA 3TJJA 1JLVA 2FHEA 4XCSA 2HZEB 4ZB6A 1QXHA 3R2QA 2F8FA 1TI1A 4FYBA 5G1LA 3ZREA 2H76A 2MYGA 2JACA 2YNXA 5IOXA 2PN8A 2RUFA 3F3QA 1SYRA 3TKSE 2HZFA 5HR2A 1MDKA 5A4VA 4TW5A 3IR4A 3PGTA 2HNLA 2O7KA 1IYHA 4EXJA 1AUCA 3C1RA 4GWRA 2QSIA 1HYUA 1QUWA 1GNEA 4MJEA 4O7HA 3P7XA 4CDOA 5IIZA 4YAPA 1WPIA 3HD5A 10GSA 1ZCPA 1Z9HA 7GSSA 1M9AA 2K9FA 1R7HA 4EUYA 2OBIA 3APSA 3DGQA 3GL5A 4PURA 1PN9A 1EV9A 2H0IA 1XXUA 4GCIA 1C72A 5CAXA 5D73A 2LSTA 1OC9A 2KUCA 2I3YA 3FY7A 4KNDA 1WE0A 5JWOB 1MEKA 2M72A 1TK8B 3IC4A 1WRYA 3DWVA 2L57A 3TB2A 2FWGA 5D8IA 1XFLA 2IFQA 2DBCA 1BJXA 2GTUA 2C0DA 2H30A 6GSWA 2F3MA 4MF7A 3M9JA 2LNSA 3Q6OA 3GUSA 3GTUB 4POBA 1RK4A 4MJBA 2FWHA 4KAEA 2EIRA 2DJ1A 1F6MC 4H86A 2DIYA 1ML6A 3QAWA 5E59A 4MZBA 2R3XA 5D9WA 3ZIJA 1TRUA 3IV4A 3KM6A 5E4WA 3IDVA 4X0XA 5G5FA 2P31A 2C8UA 5EY6A 4EO3A 2YZUA 3ERWA 4KB3A 1PX7A 1M2DA 2WS2A 2AV4A 1LU4A 4GSSA 4YQVA 2DLXA 2CZ3A 3VWUA 3FRCA 3UEMA 4HZ2A 3UVTA 4CHSA 2P5QA 3LORA 3BCKA 3HHVA 1ZOFA 3IBHA 5ECLB 2L5OA 2H73A 1V57A 17GSA 3FR6A 2KOKA 3MAKA 4NHZA 4BWSA 4EC0A 3QFAC 3U5RE 3LJRA 5JWRB 3RBTA 3KMOA 4ECIA 1GSDA 3E0UA 3FK8A 2C0FA 4BPYA 1VGLA 3UOMA 5AIVA 3GMFA 5COHA 3WT2A 3KTLA 2H1DA 1TRVA 1ERWA 1AC1A 2VIMA 4K7OA 3GRXA 4WEYA 3KCMA 2TRCP 5ELGA 5F07A 2KP1A 1O8WA 1GTBA 2X8CA 4HZ4A 5DJLA 3VWVA 1GWCA 1QMVA 1TOFA 5G30A 4POKA 1KBNA 3FZ4A 5FWGA 1SK2A 1BAYA 3IOSA 1M7TA 3L4NA 4WF4A 4TXOA 2CV4A 1MD3A 4MF6A 1F3BA 2HZEA 3FZAA 3IRAA 2HT9A 5CNWA 3P8WA 4ML6A 2VAFA 1ERTA 2GZYA 2G2QA 4MPFA 4HEA2 2MMOA 4MABA 2YN1A 4ZBAA 1VF1A 1JLWA 2L6DA 4E8EA 4ML1A 3QAGA 2L5LA 2KHPA 2WULA 1PKZA 3DVXA 2P5RA 2H1BA 4TRXA 1X9MB 3DVWA 4F0CA 1B9XC 3EYTA 1JHBA 5ECOB 3GKKA 2PMTA 1K0MA 1CQGA 4JE1A 1HNCA 1MDIA 1RQMA 5G31A 3TJBA 3I69A 4TN8A 2AHEA 1TRSA 3L9UA 4HQZA 1YY7A 1GSYA 5ID2B 3LQ7A 4L0WA 1KEBA 1E2YA 2ES7A 1NW2A 5ECRB 3VURA 2X8GA 1U3IA 2YCDA 4POLA 4OFTA 1T3BA 2YWMA 3QMXA 4Q5QA 5CRDA 2HI7A 1TTZA 2O8VB 1K0NA 1XOAA 2MZCA 1PA3A 1J08A 5KN0A 1SKSB 3A3TA 1O81A 14GSA 4NXIA 4PUFC 5IO2A 1Z7PA 1AW9A 2CVBA 2E2GA 3GTUA 1WWJA 5AIXA 4IGJA 2YWNA 1TW9A 1QK8A 5IOWA 4TXVA 4GRFA 5G2ZA 1GRXA 3Q18A 1UC7A 1ZYEA 2EC4A 2EIOA 1EOGA 4PQHA 4HDEA 2X8HA 4JBBA 5FHIA 3NIVA 3ZITA 1H75A 1PSQA 2IPAA 3TOTA 2CX4A 4GQCA 1EZKA 3I43A 2DJJA 3DYRA 4EF0A 4HQSA 4EL1A 1THOA 5C00A 5ECHB 1SJIA 4J2FA 3KMNA 2IJYA 2HRNA 2DMLA 4N0VA 2R6KA 20GSA 1SJ6A 2IY2A 2JSYA 6GSUA 4F2IA 4LMVA 3F63A 3WD6A 2AJQB 5J3RA 4MF5A 4IN0A 2VL9A 1OE8A 2DJKA 1XWBA 5FT3A 3LXZA 5CYYA 4HOJA 2VUPA 5DVBA 2OE0A 5KEJA 1XBSA 4ZB8A 3TRXA 2X99A 3KTBA 4XS6A 3QDNA 3I9V2 5DQYA 1SL2B 3TRQA 2FCHA 1K0CA 2VD0A 5LNKe 1JZDA 1JZRA 1ZMAA 1EP8A 1SK0A 2IWTA 3VWWA 5AISA 5CRWA 3W6GA 1XW5A 3F0IA 4OFNA 1DE1A 5ECQB 4ULXA 1JZWA 2NPBA 4AF2A 4ZXGA 3Q74A 4NHWA 2HE3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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