The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
111
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structure length |
109
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Chain Sequence |
FGGYSERHQANPEFLNLAHYATSTWSAQQPGKTHFDTVAEVVKVETQVVAGTNYRLTLKVAESTCELTSTYNKDTCLPKADAAHRTCTTVVFENLQGDKSVSPFECEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The crystal structures of two salivary cystatins from the tick Ixodes scapularis and the effect of these inhibitors on the establishment of Borrelia burgdorferi infection in a murine model.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Putative secreted cystatin
|
| molecule tags |
Hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Ixodes scapularis
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| total genus |
13
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| structure length |
109
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| sequence length |
111
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00031 | Cystatin | Cystatin domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, | Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GD4 A; 1IV9 A; 3IMA B; 3PYJ A; 1PFP A; 1N5P A; 1M9G A; 2O9U X; 1A90 A; 1G96 A; 2W9P A; 3KSE D; 1FUW A; 3K9M C; 1R4C A; 1TIJ A; 1N9J A; 3GAX A; 3SVA A; 1MNL A; 4N6T A; 4ZM8 A; 4LZI A; 1YVB I; 1GD3 A; 1LXE A; 1EQK A; 1DVC A; 3Q2P A; 1A67 A; 5LC6 A; 3UL6 A; 5LC7 A; 4N6L A; 3MWZ A; 3L0R A; 5EQL A; 3LH4 A; 1NB3 I; 2CH9 A; 1MOL A; 2BO9 B; 3NX0 A; 5ELJ A; 4EYC A; 4CCV A; 1KWI A; 5ELU A; 4N6M A; 4IT7 A; 1IV7 A; 3UL5 A; 1NB5 I; 2W9Q A; 3PS8 A; 1CYU A; 2KXG A; 3PXM A; 5A0O B; 1ROA A; 1DVD A; 4N6N B; 4TX4 A; 1STF I; 1N5H A; 1CEW I; 3S67 A; 2OCT A; 1FA3 A; 3KFQ C; 1RN7 A; 3QRD A; 4N6V 0; 4N6O B; 1WNH A; 1CYV A; 4N6U A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Q81 4; 3JUO A; 4L8P A; 1VQ4 3; 1GD4 A; 1IV9 A; 3ER7 A; 2J8X B; 3A5E A; 3LML A; 1Q40 B; 1L5G B; 2D1W A; 2IMJ A; 2KF4 A; 3NUV A; 1W02 A; 1VQN 3; 2AAE A; 2CWV A; 3D5G A; 1TFK A; 4O02 B; 3I56 3; 3NBR A; 4WWU C; 1ASK A; 2OTJ 3; 2GEX A; 1EKM A; 4H3U A; 2BT3 A; 2CFL A; 1BNE A; 3Q3F A; 3J7Y d; 1G0T A; 5IW9 A; 3KSE D; 1FW7 A; 3V98 A; 1DMM A; 3LOY A; 1RCL A; 4HM5 B; 1TIJ A; 1YHQ 3; 3PCR A; 1OH0 A; 4FCJ A; 4KFE A; 1I0V A; 2KF3 A; 2WOF A; 2GEY A; 1LRA A; 2W0Q A; 4HAA A; 3SYU A; 4Q53 A; 3M8C A; 1VQM 3; 3S29 A; 2KCD A; 1X1U A; 3WA2 X; 1BSD A; 1KQS 2; 1NU3 A; 3AGO A; 3LYG A; 4N6T A; 1RGF A; 4RNY A; 1UCK A; 1RMS A; 2P09 A; 2QA4 3; 1EQK A; 1AV4 A; 3HIG A; 2CX0 A; 5G1K A; 3AGN A; 4HVN A; 3CD6 3; 1A67 A; 1UUW B; 1BNR A; 3GRD A; 2LYX A; 1UUV B; 3GSP A; 3UL6 A; 5LC7 A; 1BNS A; 3T0U A; 4FCM A; 2IA7 A; 3N8B A; 3URP A; 2CFK A; 1Q82 4; 4KFD A; 3IPT A; 3RGR A; 1RLS A; 4WP5 A; 4DKI A; 4K1V A; 4FCZ A; 3NBB A; 6GSP A; 2JDI H; 4WHA A; 2P0M A; 1I3F A; 3X3Y A; 1BUQ A; 3D4A A; 1RKY A; 4X2O A; 1OHP A; 1X1W A; 3KKG A; 1UCJ A; 2BIR A; 4LSO A; 4HM7 B; 2CWT A; 3UJM A; 3G4S 3; 1TRQ A; 4WYK B; 1IQ8 A; 3CCJ 3; 5G2G A; 1KWI A; 1W01 A; 3HZP A; 2K3D A; 1RGA A; 4EW5 A; 3HK4 A; 3JUQ A; 1WMP A; 3UL5 A; 2W9Q A; 4HZ9 B; 2XF3 A; 1E97 A; 3DM8 A; 3HX8 A; 1I0X A; 5STD A; 1ISK A; 1CYU A; 1YI2 3; 3G8Z A; 1BSE A; 1OF5 A; 1JB5 A; 3FF0 A; 2JQ5 A; 3PXM A; 1ROA A; 2YFL B; 3MSO A; 2UUG C; 3MPH A; 2F4Y A; 1LOW A; 1DVD A; 3KE7 A; 2HMJ B; 5AYS C; 1IVW A; 5JPU A; 3K7C A; 4OK0 A; 1K8A 4; 2SAR A; 3FG3 A; 1RNB A; 2L1S A; 1GSP A; 2Z77 A; 1CEW I; 3S67 A; 1W6Y A; 1EG9 B; 1SQW A; 4HM3 B; 1YGW A; 1JB2 A; 1IK3 A; 1B2Z A; 2BMO B; 3CC7 3; 1UCL A; 1BNJ A; 1T5Y A; 3NQY A; 4I5Q A; 1IVX A; 1YJ9 3; 1LQM B; 1NNV A; 1HU9 A; 1SII A; 2QEX 3; 3NQZ A; 3KFQ C; 1GY5 A; 1EEJ A; 3JUM A; 2KRT A; 2ML6 A; 4QWT A; 4WFO A; 7STD A; 1D6Z A; 5EEO A; 2F5W A; 1I2G A; 1T3B A; 5JPP A; 1WNH A; 4XBY A; 3WR2 A; 1CYV A; 3NV0 A; 1OHO A; 3F8H A; 3T8U A; 1RTU A; 1JN5 B; 1YVS A; 3KSP A; 5AIH A; 5CF1 A; 1AQZ A; 1LNH A; 4J5G A; 3UNL A; 1BRG A; 2RSX A; 1RGE A; 3AMO A; 4IIA A; 2Y74 A; 1UW1 A; 2CKF B; 4FMA A; 1PFP A; 3F9S A; 1BSC A; 4HYZ A; 1RHL A; 1DE3 A; 9RNT A; 2YX9 A; 5CXO A; 5HOH A; 3FG4 A; 3G16 A; 4GB5 A; 1YIT 3; 2CG1 A; 1E3V A; 1A90 A; 5BVB A; 2D42 A; 1W2Z A; 2W6J H; 3DZL A; 2STD A; 1FUS A; 2XFS A; 3JUP A; 4HOH A; 5AII A; 2PNC A; 2C11 A; 4HBR A; 2XGL A; 5I97 A; 3X41 A; 1KD1 4; 1MGW A; 3FLJ A; 3GZR A; 4HM2 B; 3WHO A; 1JBR A; 3K9M C; 4HZB B; 1R4C A; 1O7M B; 3DUK A; 1N9E A; 3OWY A; 1AR0 A; 3V99 A; 1UUG B; 4HKV B; 1IVV A; 3CCR 3; 1I70 A; 1YIJ 3; 1EA2 A; 3GAX A; 1DYU A; 3EBT A; 1AVK A; 5AI1 A; 4KVH A; 4BTY A; 2HMN B; 5IF6 A; 4RNZ A; 5D83 A; 3WMD A; 1X1Y A; 3DGO A; 2MF7 A; 1MNL A; 3CU3 A; 1RGH A; 1VQP 3; 1GOV A; 1GY7 A; 1Q40 A; 3LTA A; 1GD3 A; 2IY2 A; 4BL2 A; 1BOX A; 3F8X A; 1LOX A; 5HGR A; 1DVC A; 3Q2P A; 1OHS A; 3G6E 3; 3CNM A; 1BNF A; 3NM2 A; 1WTH A; 1ZGX A; 1A2P A; 4GSP A; 1B3S A; 3DGY A; 3EHC A; 5BU4 A; 3OW2 2; 1DET A; 1Q42 A; 1JBT A; 3V92 A; 2CHC A; 2L4V A; 2P38 A; 2W03 A; 3FF2 A; 4O8S A; 1I2F A; 2BHM A; 1GOY A; 3ZG5 A; 1YGE A; 4AKZ A; 1B20 A; 2YFI B; 1RNT A; 3CCS 3; 4BTW A; 3VSY A; 1VQO 3; 2H0I A; 1NJI 4; 3CCM 3; 3CCV 3; 1OPY A; 5CF2 A; 1QAK A; 1RGK A; 1DMQ A; 3E99 A; 5ELJ A; 1JZD A; 3D3L A; 1QMA A; 3WA3 A; 2XR8 B; 7RNT A; 4MMX B; 3EE1 A; 1O7G B; 1VQ8 3; 2OTL 3; 1A2K A; 1JRQ A; 4GHO A; 4N6M A; 2WGO A; 4IPB A; 1IU7 A; 2WO0 A; 1FGT A; 3D5I A; 4CPK A; 1VQL 3; 5EVH A; 1K9M 4; 1AY7 A; 3WDG B; 3NXJ A; 5IG3 A; 3ROB A; 3DGM A; 2UGI A; 3F14 A; 1PY3 A; 2CIU A; 1BRI A; 4JRF A; 4KFF A; 2CG0 A; 1ZX2 A; 1KSI A; 1CH0 A; 3JUN A; 3SOA A; 4RBN A; 6RNT A; 1ULJ B; 3NBJ A; 1BRN L; 2HMK B; 3CPO A; 1N8R 4; 2Y73 A; 3X42 A; 3BNB A; 1STD A; 1W6C A; 2AAD A; 3EN1 B; 4U13 A; 7GSP A; 3CCE 3; 3EQQ B; 1QAL A; 4K61 A; 2CC3 A; 4R4K A; 1JNQ A; 5G1L A; 4EC6 A; 1TFO A; 1UGH I; 5TGN A; 1BUJ A; 2MC8 A; 3MKI A; 1RN4 A; 3X3X A; 4WYK A; 2F98 A; 3CCL 3; 1VQK 3; 2B24 B; 1RN7 A; 3QRD A; 4N6V 0; 2OOV A; 3KII A; 1O7H B; 4NPB A; 1SIH A; 3FZW A; 1J2B A; 5M1A A; 1RRL A; 3MHE A; 2K54 A; 4N6U A; 3U97 A; 1VQ9 3; 2C4B A; 4H61 A; 2HML B; 1C7H A; 3N54 B; 1BRH A; 1TJD A; 1BVI A; 3IMA B; 3X40 A; 1VQ6 3; 3N9H A; 4KZ1 A; 1W00 A; 1BNI A; 1N5P A; 2WGQ A; 1O7N B; 1M9G A; 4R1K A; 2F99 A; 5KP3 A; 1PU4 A; 4CJN A; 3LT9 A; 3LZA A; 2BMR B; 2O9U X; 3S28 A; 1V58 A; 3MYT A; 1VQQ A; 4FMD A; 2XEP A; 2XGN A; 3CME 3; 4G1M B; 1JKG B; 2K0M A; 1LOY A; 3S5C A; 1M1K 4; 1U5O A; 3SLU A; 1G02 A; 2W9P A; 1B27 A; 2OQE A; 1FGQ A; 3MG2 A; 2ZA4 A; 6STD A; 3EB8 A; 1Q7Y 4; 1FUW A; 1ULI B; 3CCQ 3; 3IJE B; 5IEO A; 3MG1 A; 2O3O A; 1N9J A; 1I8V A; 1SPU A; 1IVU A; 3DGL A; 1T2H A; 2W56 B; 2INX A; 3LT8 A; 3OXA A; 1JN5 A; 1HYF A; 2GU1 A; 1B2S A; 3HI7 A; 3LTC A; 1RGC A; 1US1 A; 4BIR A; 3VF1 A; 3CPW 2; 4LGQ A; 4ZM8 A; 1ROV A; 1FGR A; 4LZI A; 1RRH A; 1YVB I; 1BSA A; 2KF6 A; 4XB5 A; 2GBW B; 1LVN A; 3ZFZ A; 3T8N A; 3BU4 A; 1IQY A; 1W4N A; 2HMO B; 2FGT A; 1RJO A; 4CDL A; 3MWZ A; 5BIR A; 1LQG C; 4R9L A; 1JJ2 2; 3U1W A; 1VQ5 3; 1Q86 4; 3L0R A; 5GSP A; 1UDI I; 1GOU A; 2HOH A; 5BXQ A; 3GZB A; 3KCH A; 1KC8 4; 4L7K A; 1GY6 A; 1OUN A; 1ZO2 A; 2XSO B; 3KN4 A; 1RN1 A; 2CWU A; 3HOH A; 3PCS A; 1E3R A; 4LYL B; 4MMY B; 3BLZ A; 3F7X A; 3EJV A; 3GZX B; 4EBG A; 3CC4 3; 1Q7H A; 1NB3 I; 2CH9 A; 2PZV A; 2ZDJ A; 1MOL A; 2H0H A; 3RGA A; 1FUT A; 2Q07 A; 2W2C A; 1BRS A; 3LTB A; 1UCI A; 4FMC A; 3HII A; 4EYC A; 2CFW A; 4O3V A; 1EUI C; 3CXC 2; 1WMO A; 5ELU A; 4IT7 A; 2SBL A; 1AVL A; 2RNT A; 1IT7 A; 1RGL A; 5AIG A; 1BRJ A; 3I55 3; 2P05 A; 1BU4 A; 1R4Y A; 2LQV A; 1SJW A; 1OGX A; 3ALA A; 3STD A; 4R80 A; 3WOD G; 2XRX B; 4BTX A; 1IQX A; 2KXG A; 3DY5 A; 5D82 A; 1SAR A; 1UGI A; 1YJN 3; 1Q9E A; 1X1X A; 1A2V A; 1BRK A; 1IYY A; 3D9R A; 3OX9 A; 4TX4 A; 1STF I; 1RDS A; 3BB9 A; 1O7P B; 1TTO A; 3H3H A; 5IEP A; 1VZZ A; 3FGY A; 3BNE A; 1N5H A; 4J8T A; 5RNT A; 4OUQ A; 4NRE A; 1RGG A; 4ORL A; 4EV2 A; 5IG0 A; 3BIR A; 2E2V A; 1UI7 A; 3CC2 3; 1FZU A; 1QJG A; 4EXR A; 2Z7A A; 1D6U A; 1VQ7 3; 3O8Y A; 2H0G A; 2IUJ A; 4AEQ A; 1Y4K A; 4JF8 A; 3B4O A; 1GMQ A; 2YFJ B; 3S27 A; 1BNG A; 3AHS A; 4N6O B; 4HM1 B; 2C10 A; 3KZT A; 2OOV C; 2R4I A; 4N3V A; 1TU5 A; 1FGM A; 3DMC A; 2E2U A; 2F5M A; 1B2M A; 2ZHX B; 2I9W A; 3PYJ A; 5DRE A; 2CFG A; 3CMA 3; 2BMQ B; 1RCK A; 3TDG A; 2GBX B; 3B7C A; 3BNC A; 1LOV A; 4OVM A; 2XFT A; 3F40 A; 8CHO A; 1D6Y A; 3EBY A; 4K1U A; 2Z76 A; 3SXX A; 3K63 A; 3NM7 A; 1JZO A; 4BL3 A; 5CK6 A; 1G96 A; 3RDE A; 3I0Y A; 2A15 A; 1QVF 2; 4LMI A; 1OGZ A; 1HZ1 A; 5IG4 A; 1WMN A; 3K0Z A; 1HKX A; 5IG5 A; 5KP1 A; 3F7S A; 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