The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
39
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sequence length |
129
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structure length |
122
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Chain Sequence |
MKPQLLALKQFVQTEFEKVDFETFRQNFNRCLEREQSTLLIYEDDDYDDQSFFLKPMLSDAFFISSEVVKQLDLPKGDVKSCCQSFYEALTLFISALAITKGVDVGRYHQQLGKRFGVLTVY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of MPN423 from Mycoplasma pneumoniae
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical protein MG296 homolog
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Mycoplasma pneumoniae
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| total genus |
39
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| structure length |
122
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| sequence length |
129
|
| chains with identical sequence |
B, C
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-08-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF09644 | Mg296 | Mg296 protein |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | mg296 homolog like | ||
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | cAMP-dependent Protein Kinase, Chain A | mpn423 like domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3RSY A; 3S4D A; 3S4B A; 3QG0 A; 2CQS A; 3QFY A; 3AFJ A; 2I15 A; 2CQT A; 3ACT A; 3QFZ A; 3S4C A; 3ACS A; 3S4A A; 3QDE A; 3RRS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4CS9 C; 5HVZ A; 2EPM X; 3PMR A; 4D4N A; 4DBQ A; 5L0J A; 2AVK A; 1FR0 A; 4Z9I A; 5JP7 A; 5TJ5 E; 4YT2 A; 2W4B A; 1MQV A; 3GM2 A; 5JRA A; 4RTA A; 1N1C A; 5KYW B; 1JR8 A; 4FAP B; 4MVU A; 2TMV P; 2KQ9 A; 1H9T A; 1ZW2 A; 2L7A A; 4MQ9 F; 1JMW A; 1VLS A; 1D0X A; 1M6T A; 2R05 A; 1J8Y F; 1QVX A; 1RJ9 B; 1V4A A; 2IXM A; 3FAJ A; 3HNL A; 4W8K A; 4P9T A; 2A68 F; 3EFO A; 1TFO B; 2ETS A; 3SXK A; 5KYY A; 2CQS A; 5A6J A; 3WOD F; 4EBJ A; 3FDQ A; 2YLI A; 1LIH A; 2ASR A; 2A0B A; 2J46 A; 2OEX A; 2J0W A; 3AOU A; 2L6G A; 3DE9 A; 3ITF A; 4E18 A; 2XLH A; 3H65 A; 2IZY A; 2HJ3 A; 1OCC C; 1ORJ A; 4LLE A; 3VF0 A; 3ABK C; 3ATP A; 4MVQ A; 4QDL A; 3QMK A; 4B6I A; 2CB9 A; 256B A; 3GM3 A; 2PBE A; 1WAS A; 3TOM A; 2A6E F; 2B0J A; 4FES A; 4IAQ A; 3WAQ A; 3PMI A; 3C7J A; 3HKK A; 1NZE A; 2VCA A; 1I4Y A; 2C03 A; 1TWA A; 2OJQ A; 2QUP A; 3AG3 C; 3AGU A; 3EFO B; 2Q7R A; 5KYU B; 4O79 A; 5KYY B; 1VLT A; 4ZLD A; 1ST6 A; 5DQZ A; 3GWH A; 2P0N A; 1C03 A; 3NMK A; 3RF3 A; 5GPG B; 1T6U A; 4XEK A; 2XLO A; 2YKZ A; 3HTK C; 5L3Q A; 3A11 A; 2DB4 A; 1Y4C A; 1QSP A; 3DAF A; 3M15 A; 4E7S A; 2J0X A; 4Q5S F; 3LLK A; 1NFO A; 4JW1 A; 4IWB A; 3T6B A; 1M57 C; 3CZ6 A; 4MTG A; 4IGG A; 2OEV A; 3U3B A; 4FX5 A; 4U5G A; 1WTY A; 4U5C E; 3AFJ A; 2Q4F A; 3AGT A; 1YA7 O; 1R5I D; 3FXH A; 5FZT A; 3V7O A; 4BJ1 A; 2XM4 A; 3O55 A; 4JC7 A; 2K9Q A; 4ONS A; 1YVI A; 1TKN A; 2W45 A; 1AEP A; 2XS1 A; 2XLW A; 3CSK A; 3GM1 A; 3QVY A; 4OD4 A; 4JJF A; 1OW8 A; 2YHS A; 4U9E A; 2XSE A; 3DI5 A; 3DMD A; 3EG9 A; 3L8J A; 4ZLC A; 4Q4Z F; 3RVZ A; 1NLX A; 5E2Q A; 2Y3G A; 2GWW A; 3DM5 A; 3ABM C; 3UMI A; 2Z15 A; 5T3T A; 4BEM J; 4DRI B; 4C7O A; 4I44 A; 1O3U A; 3G50 A; 2LK4 A; 5BQG A; 2CNW A; 3QZC A; 2R7R A; 2CQT A; 2Q9B A; 5DVW A; 4F9K A; 4N06 A; 2KGO A; 2XL6 A; 4KNV A; 3EH2 A; 2PX3 A; 1YZA A; 3SP1 A; 1JOG A; 2PP4 A; 4XLP F; 2LSE A; 3DJU B; 4IAO A; 4KBL A; 1HMD A; 2EPL X; 2YRF A; 3IQT A; 2NG1 A; 3JCU Q; 4D4X A; 2Q9A A; 1YYJ A; 5L0F A; 4E0H A; 3EG9 B; 4AL0 A; 2R7V A; 3TQO A; 3IQ5 A; 5JUA A; 4LDR A; 1MMA A; 1JPN A; 3PHF 2; 4C7O B; 1M2V B; 3B29 A; 1QZX A; 1BBH A; 2AWY A; 2Q9C A; 1VOM A; 2XXA A; 1VMA A; 2QLA A; 3GWN A; 1R4T A; 4YL3 A; 3NKD A; 2I15 A; 3ASN C; 4I1M A; 3FVY A; 4PFO A; 5L0D A; 4N4W A; 3EHN A; 4CDA A; 3ZQV A; 1KU2 A; 2YWA A; 1D1C A; 3DAG A; 4OIN F; 4YT4 A; 3NMJ A; 4JZA A; 4MVR A; 1NU7 D; 1T5O A; 4JTC B; 3US6 A; 5BQH A; 3N24 A; 3GWL A; 3VM6 A; 2WL8 A; 5HSW A; 5KYN A; 4K7B A; 4MTO A; 2IXN A; 4CIH A; 4N6H A; 1E86 A; 4F4B A; 3GEI A; 4H4K C; 4A4A A; 3E9V A; 3JZ0 A; 2XXA B; 1SMY F; 1YJG A; 1S7Z A; 4QI0 A; 2R7S A; 2LFD A; 2QNL A; 2RQY A; 2NUT A; 1KNY A; 2HJM A; 3FOP A; 2YLD A; 2WZF A; 2LP4 A; 1JPJ A; 2KNH A; 3AG2 C; 3W2W A; 4DOZ A; 4PFP A; 5L0I A; 1D1B A; 1FFT C; 1FTS A; 1LPE A; 3GEE A; 3LEV A; 3MYI A; 3OA1 A; 2R9R B; 1MMG A; 4PJJ A; 1QQ3 A; 3TD7 A; 1LE2 A; 3KYJ A; 1CGO A; 3K66 A; 1O87 A; 2KC3 A; 3NRH A; 2CYD A; 3B71 A; 3WG7 C; 4EBB A; 4ULW A; 3FOO A; 5CIV A; 5KYW A; 5A69 A; 4IB4 A; 4WJ0 A; 4O6N A; 3DJN B; 2OU6 A; 2FAP B; 3HNK A; 3LLI A; 2J45 A; 3TOL A; 4RT4 A; 2LQG A; 4CS9 A; 3OEO A; 4CJG A; 2CCY A; 2V3C C; 1B68 A; 2R7O A; 2ZXO A; 4DXW A; 2HKV A; 1Q0G A; 1L3P A; 4WAB A; 3UMH A; 3QTH A; 2R7Q A; 3CQZ A; 2I8B A; 2R7X A; 3O39 A; 2Q3T A; 2Y39 A; 4JEA A; 2OOC A; 4MW8 A; 3SXZ A; 3ZTZ A; 3QW1 A; 4NQF A; 3BEH A; 4L6R A; 2E87 A; 3KKB A; 4U5E E; 3RKO F; 2HV7 A; 5KYX B; 3LS0 A; 2G62 A; 2DRN A; 2J8W A; 2G3V A; 4U5H A; 4AE4 A; 3U2M A; 3ACS A; 1SF8 A; 2EZW A; 2YEV A; 4JIO A; 1C02 A; 4XTK A; 1M56 C; 2P1A A; 4A2N B; 4XPX A; 1YLM A; 2Y3D A; 3MYF A; 2WZG A; 2ZPA A; 5KYU A; 1NSG B; 3LUT B; 2XLV A; 2HUJ A; 2JD3 A; 4OD5 A; 5L3V A; 1PD1 A; 5BQI A; 3JTL O; 4IAR A; 2OG2 A; 2PF4 E; 3N0T A; 2HMZ A; 1ZHZ A; 3ZTM A; 3IQC A; 3Q7L A; 1WGW A; 4KC9 A; 3RIP A; 1OR3 A; 3N2Z B; 3QDE A; 4XEV A; 1MNE A; 2QY9 A; 3UR3 C; 3KH2 A; 1SR2 A; 2XRH A; 1YYX A; 5A6K A; 4XEF A; 2R02 A; 4DRJ B; 4AE4 B; 1YDI A; 2KSF A; 3ZQY A; 4GYT A; 3GOR A; 3T9O A; 2WVN A; 3R7C A; 3H2V A; 2R7T A; 5E3C A; 3G36 A; 4ZP3 A; 5D91 A; 3C62 A; 2DYS C; 3IHU A; 5DLJ A; 4YJW A; 4U9D A; 1XZQ A; 5DS5 A; 2VAS A; 3AQB A; 3W8H A; 1OXK A; 4M63 A; 4NY3 A; 2H7V C; 1YZC A; 2IM8 A; 4JVS A; 4YN0 B; 1JAF A; 5JT4 A; 1NBB A; 3IM3 A; 3SXM A; 1I4Z A; 1EQ1 A; 4J7T A; 1OW7 A; 1TWC A; 1FMW A; 2YL1 A; 3QW0 A; 3VAY A; 3IQ6 A; 5HV9 A; 1A0B A; 2YL7 A; 2YVK A; 5AC5 A; 5JVE A; 1RMV A; 3UMK A; 1ORS C; 3Q6M A; 2VH3 A; 1FFH A; 2IXO A; 3SYN A; 2GFH A; 4W8P A; 4XPW A; 4BJT A; 3UGP A; 4OIP F; 2OUT A; 5COG A; 4G0H A; 1R2A A; 3L8I A; 1G5Z A; 4PK4 A; 3TJ5 A; 5BUO A; 1JRA A; 2VC9 A; 4C3D A; 1LM3 B; 2PFD A; 5L0C A; 4JCZ A; 4J30 B; 3X1O A; 4LLC A; 1M2V A; 2HFI A; 4HFK B; 3T6J A; 3ZG1 A; 3EGX B; 1L6E A; 3DKA A; 3GEH A; 3RQG A; 2BC5 A; 4G7Z F; 4HEA J; 1CGM E; 2L81 A; 3ZC4 A; 1YAR O; 1ZU5 A; 4H54 A; 5EHH A; 2MYS A; 2D5R B; 2H9R A; 3GAN A; 3M1C B; 3QFZ A; 2GAQ A; 4HFF B; 4CSA C; 1OW6 A; 2LFF A; 4O7G A; 4OIQ F; 1WOL A; 2Y3B A; 3SZR A; 4BJ5 C; 3LJB A; 3QG0 A; 1FAP B; 3E70 C; 1J8M F; 3PDM P; 1H9G A; 4CDY A; 2OQM A; 1M2O A; 1E84 A; 3NDB B; 5JSL A; 1LI7 A; 1QPU A; 2P6V A; 3JRM O; 3S84 A; 3U0C A; 2WZL A; 4WGY A; 2DGJ A; 1A41 A; 3KYI A; 3Q6N A; 2ZXP A; 4YT5 A; 1U6H A; 4XLN F; 4U5F E; 4OIR F; 1EA8 A; 2J9V A; 2XL4 A; 3DZA A; 1OCZ C; 1Y6D A; 1Z6A A; 2CDQ A; 1NG1 A; 4I3M A; 2L6H A; 3A9C A; 3ZWI A; 2X51 A; 1ZYR F; 2J7P D; 3EZI A; 5COF A; 1ZZP A; 2CBG A; 5E33 A; 3LEO A; 1IZM A; 2R7W A; 5B1B C; 3JYH A; 4YL1 A; 3RW0 A; 4JCH A; 3C8Z A; 4NTA A; 3K7D A; 2X0C A; 5L0H A; 1WN0 A; 4E7Z A; 3SEO A; 2DI3 A; 3ECS A; 2XS8 A; 1MMD A; 4K0D A; 2B0H A; 3MFN A; 3WHN A; 5CI9 A; 2NSF A; 2YL3 A; 1K04 A; 2J9U A; 3S0X A; 5A6A A; 5DS6 A; 1IW7 F; 3U3F A; 4LDK A; 5F5H A; 4MS2 A; 1WAT A; 3RQE A; 1K05 A; 3ACT A; 1GGQ A; 4JUR I; 1CGN A; 3SXY A; 4JJG A; 1E83 A; 2BE5 F; 2DYR C; 1OR2 A; 4XPY A; 1PD0 A; 3RVY A; 5KYX A; 4JTA B; 2YZS A; 4E17 A; 3AG4 C; 3L0I A; 4OIO F; 3KPH A; 3KL4 A; 5AGF A; 3S28 A; 3FMS A; 2KK1 A; 4C3B A; 3UGO A; 3POV A; 3GOD A; 4N6C A; 3C8G D; 5EK0 A; 5EGY A; 4LAC B; 1LS4 A; 1GQA A; 2WVQ A; 3H2U A; 3AQC A; 5B3I A; 1AVO B; 4NTF A; 3B0P A; 5A6B D; 2PX0 A; 2NSG A; 3EQL F; 1OQC A; 4BJ6 C; 1TQG A; 4PAC A; 1NU9 C; 3HNI A; 3HNJ A; 3I4U A; 3T6G B; 1E2X A; 1V55 C; 4G78 A; 1LE4 A; 4CS8 C; 2IYL D; 3I5Q A; 3W8I A; 4CIP A; 2NUP B; 4C3E A; 2XLE A; 1CPR A; 1ZW3 A; 2GA0 A; 3V5Z A; 2HS5 A; 3ABL C; 4ANJ A; 2A69 F; 3ASO C; 3JRT A; 2LCH A; 4G7H F; 2KJG A; 3HLZ A; 4Z9J A; 1Z3I X; 1ZHX A; 3K1H A; 4MTF A; 1RCP A; 5IY5 C; 3NYL A; 2UUH A; 3JYY A; 1T6I A; 4RD9 A; 3K6B A; 4ER9 A; 2EPO A; 2HZ8 A; 1UG7 A; 2CW0 F; 4RDA A; 1E85 A; 1G4U S; 4I1O B; 3S29 A; 1BZ4 A; 1SZI A; 4XQ1 A; 1PV3 A; 3U9M A; 2XM0 A; 1DOW A; 1PCX A; 2EIK C; 3DD7 A; 2J9W A; 2YQY A; 5B1A C; 1KTM A; 2XLD A; 3MBG A; 3L1M A; 2LIG A; 1Q0F A; 3K33 A; 1V54 C; 3EZH A; 4P9F A; 3J06 A; 1BDJ B; 4U5B E; 2M4E A; 1T01 A; 1A7E A; 2IBF A; 4LER A; 3O6X A; 4EBK A; 4YT8 A; 3AG1 C; 1L7C A; 1Z63 A; 3IEE A; 1BR2 A; 4YWQ A; 4RBN A; 1H7I A; 2A0U A; 4MND A; 3G4Z A; 4E0I A; 4PJM A; 2XL8 A; 4EUK B; 4EWC A; 1VK5 A; 2L9J A; 2J7P A; 4NCQ A; 3OWT A; 1Z7Q c; 3TK0 A; 3UNG C; 1EI7 A; 3S4A A; 2IOQ A; 4J7Y A; 4KNW A; 1EKY A; 1V74 B; 4JE9 A; 1HE1 A; 2Y69 C; 2AWC A; 1VTM P; 1OKK D; 1VYI A; 1Z23 A; 3PCV A; 3CEX A; 5CI8 A; 3EGX A; 2KNG A; 2R25 A; 1D1A A; 2WB7 A; 2G3K A; 3LNM B; 5E3A A; 2O9X A; 3C18 A; 2HSQ A; 3KMI A; 4DBR A; 5DS4 A; 2CGE A; 3EHM A; 1G4W R; 3K1I A; 5K0I A; 3S27 A; 4WGZ A; 5B3S C; 4IJJ A; 5F28 E; 1HW2 A; 1VB5 A; 1APC A; 1O5H A; 1SYQ A; 3L34 A; 3S4D A; 3C63 A; 3M4C A; 3W4Y A; 3K1I C; 3V5Y A; 5JLI A; 4PR9 A; 2M64 A; 3RH3 A; 4BEJ A; 1TR2 A; 1CPQ A; 2QTV A; 4UDV A; 4NC3 A; 2ZD9 A; 3EPV A; 4GEH A; 1ORY A; 4NTB A; 2HV6 A; 4G7O F; 3LS1 A; 1HW1 A; 3R2P A; 3FAP B; 2C04 A; 1T6Q A; 4BG0 A; 1OCR C; 2RD9 A; 3IPM O; 3LNR A; 4U5D E; 1ZHT A; 1ZU4 A; 3S4B A; 1TFK B; 2H8A A; 3C8G A; 3DWW A; 1MMN A; 4EKW A; 3V5X A; 4CSA A; 1H6G A; 4BJ5 A; 5T1D B; 2J9B A; 4XWJ A; 1UFB A; 1VYK A; 5A6B A; 3RRS A; 3MX3 A; 3NYJ A; 3G4X A; 1C17 M; 1Q0D A; 4JEB A; 4DVY P; 2EIL C; 1Z5Z A; 3ZVR A; 4DRH B; 3F47 A; 2VCB A; 2ZXW C; 1OCO C; 1GM5 A; 1AUE A; 1S05 A; 3QVZ A; 4R32 A; 2PNO A; 1U89 A; 2GDC A; 2ZXR A; 3LAY A; 1ZHW A; 3U2L A; 1QLE C; 2Y3H A; 1BR4 A; 1TWH A; 4MVZ A; 4PJL A; 5F5F A; 2YL0 A; 1GS9 A; 3M4B A; 2IXP A; 2QE9 A; 3C8G B; 3CAX A; 4YL0 A; 3MLG A; 4EIY A; 1G8X A; 2HSB A; 1HMO A; 2L6F A; 1D0Y A; 3AJM A; 2EPN A; 4MW3 A; 3RYL A; 3IM4 A; 1MND A; 2WVO A; 3LES A; 3JT1 A; 3U8V A; 5COM A; 1XWJ A; 1Q0K A; 2OCC C; 3VYW A; 3U8P A; 3EJN A; 1YA9 A; 1A7V A; 2F22 A; 3F46 A; 2EIM C; 2MWQ A; 5JS5 A; 3TUL A; 2W9Y A; 1TWG A; 4JTD B; 2NPU A; 4O6M A; 1U0B B; 4GQH A; 4YK5 A; 3HJC A; 1Q0M A; 2AP3 A; 1ZVZ A; 2KW3 C; 2V26 A; 2EPK X; 2KYH A; 2EIJ C; 1RKE A; 3NKE A; 3X2Q C; 2OJE D; 1FNT c; 4RIQ A; 2W4M A; 3QFY A; 2EIN C; 5T3W A; 2H7B A; 1W2W A; 3U9J A; 1RXQ A; 1XZP A; 1ZHY A; 2AU5 A; 1YAU O; 4PJN A; 4Q7C A; 4Z9H A; 2BL2 A; 2JX0 A; 3M79 A; 2XLM A; 4P6I C; 3ZIB A; 1T9K A; 3B9Q A; 1I5N A; 3S90 A; 3EH1 A; 4AK9 A; 2NUP A; 2FFH A; 1NFN A; 4MVO A; 3W2V A; 1WWP A; 4ULV A; 2A1D D; 4IRU A; 3ZSU A; 3O10 A; 1FMV A; 4DJ9 A; 1LS1 A; 1BR1 A; 1OXB A; 1HY5 A; 2P7V A; 2R03 A; 3NMI A; 4K1O A; 3RFY A; 5AC4 A; 3B0U X; 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