The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
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sequence length |
111
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structure length |
111
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Chain Sequence |
MSQFEKQKEQGNSLFKQGLYREAVHCYDQLITAQPQNPVGYSNKAMALIKLGEYTQAIQMCQQGLRYTSTAEHVAIRSKLQYRLELAQGAVGSVQIPVVEVDELPEGYDRS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of minimal tetratricopeptide repeat domain protein Tah1 reveals mechanism of its interaction with Pih1 and Hsp90.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| molecule keywords |
TPR repeat-containing protein associated with Hsp90
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| total genus |
32
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| structure length |
111
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| sequence length |
111
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-11-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14559 | TPR_19 | Tetratricopeptide repeat |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5FZS A; 4AY5 A; 1W3B A; 1KLX A; 2P58 C; 3UQ3 A; 3LCA A; 3QKY A; 2PQN A; 5AYW D; 5FJY A; 5EKQ D; 4HOS A; 3CVL A; 4A1S A; 5BNW A; 5G04 C; 3GYZ A; 3N71 A; 5G04 J; 4H7Y A; 4GYY A; 5HQ8 A; 2XGM A; 2VQ2 A; 5LCW C; 5LCW J; 4KYO B; 3AS5 A; 1NZN A; 4XI9 A; 3AS8 A; 5M72 A; 3LY7 A; 2IF4 A; 4ME2 A; 2PZI A; 3LY8 A; 2KCV A; 3UUX A; 4N39 A; 3MA5 A; 2V5F A; 1WAO 1; 5DIZ A; 3RJV A; 3UPV A; 2OND A; 3CV0 A; 3GZ1 A; 2XGO A; 4APO A; 3MV3 B; 3CKB A; 1NA3 A; 3RIB A; 3KS2 A; 4WNE A; 3LY9 A; 4N2S A; 4U04 A; 2KCK A; 2YQ8 A; 3Q4A B; 4CGW A; 1QQE A; 4HOT A; 3KD7 A; 2MHK A; 3HYM B; 1FCH A; 4HOQ A; 4XI0 A; 2JLB A; 3S7B A; 3SZ7 A; 4GYW A; 2VSN A; 4UQY A; 3PDN A; 3O48 A; 3ASF A; 4LEU A; 4GZ5 A; 4N2Q A; 3GZ2 A; 3CVN A; 4GA0 A; 1PC2 A; 2HO1 A; 3Q5M A; 1HH8 A; 4GYO A; 3MEK A; 3Q47 B; 2FI7 A; 4NRH B; 4GZ3 A; 4U0Z A; 4KXK B; 2AVP A; 4UQX A; 5JJ6 A; 5A6C A; 1ZBP A; 5JJ7 A; 1XNF A; 4Y6W A; 3S7F A; 3BEE A; 3CEQ A; 1IYG A; 4H7X A; 5FT9 A; 4HOR A; 2VGY A; 2QFC A; 4I17 A; 4BTA A; 3ZHE A; 4U07 A; 3ASG A; 5CHE E; 3ASH A; 4GZ6 A; 4BT8 A; 4GA2 A; 3RKV A; 4WUY A; 3QWV A; 2E2E A; 3CVP A; 3U4T A; 3ULQ A; 5EX0 A; 2UY1 A; 3ZGQ A; 2XEV A; 2VGX A; 4F3V A; 4YVO A; 1OUV A; 2BUG A; 3LKU A; 3SF4 A; 1ZU2 A; 5CCM A; 5HI7 A; 1KT0 A; 3QWW A; 4N5C A; 2J9Q A; 5C1D A; 1Y8M A; 2XPI A; 1HZ4 A; 5JJT A; 3Q49 B; 3TGO A; 3EDT B; 1KT1 A; 5ARG A; 4AY6 A; 4RG6 A; 2IFU A; 1YA0 A; 2XCB A; 4G25 A; 2XGS A; 3JYS A; 3TAX A; 4BT9 A; 3ESK A; 3LYA A; 3PE4 A; 3VTX A; 4I2W A; 5KJN A; 4WNF A; 4JA9 A; 4BTB A; 5A7D B; 3CKC A; 4G24 A; 3S7J A; 3ZN3 A; 4JA7 A; 2UWJ G; 5EX3 A; 3ASD A; 3ZPJ A; 3CK9 A; 4G1T A; 4N3C A; 1B89 A; 5FTP A; 3OXF A; 3QWP A; 4UI9 K; 4U0S A; 2C0M A; 5BW8 C; 2OOE A; 3IEG A; 5G05 J; 5CCL A; 4JL0 A; 2L6J A; 4XIF A; 3CK7 A; 2C0L A; 2FF4 A; 1TJC A; 3TG5 A; 4RG9 A; 3K9I A; 3PE3 A; 4I9C A; 4UI9 J; 4J8D A; 4J8F A; 3MKR A; 5FZR A; 3NF1 A; 3WXX A; 3MV2 B; 3S7D A; 2VYI A; 4I1A A; 2LSV A; 4IN3 B; 3CVQ A; 4GA1 A; 1QZ2 A; 3RO3 A; 5D0O D; 1ELR A; 4EQF A; 2FEZ A; 4U0U A; 4J8E A; 2KCL A; 2XCC A; 3R9A B; 2Y4T A; 3RO2 A; 5KJM A; 1A17 A; 3LPZ A; 3FFL A; 3QDN A; 2R5S A; 2HYZ A; 3TG4 A; 2FBN A; 1NA0 A; 2DBA A; 4ABN A; 5D0Q D; 2PL2 A; 1E96 B; 2VSY A; 3U3W A; 2FO7 A; 4GCN A; 4WNG A; 3VTY A; 4KBQ A; 4UQZ A; 2LNI A; 2Y4U A; 5ARF A; 4N3A A; 4HOU A; 3CK8 A; 4B94 A; 1HXI A; 4BWR A; 4G26 A; 3URZ A; 5DBK A; 3Q15 A; 3ZFW A; 3OXL A; 4AM9 A; 4I2Z A; 3QOU A; 4Y6C A; 4O6F A; 3ZHE B; 3FWV A; 2Q7F A; 3AS4 A; 4JHR A; 5G05 C; 2KAT A; 3FP3 A; 5FZQ A; 2WQH A; 2LSU A; 4CDR A; 4AIF A; 4GPK A; 2PQR A; 4WND A; 4W9R A; 2UY1 B; 4YVQ C; 4NQ0 A; 2VGX B; 2YHC A; 3OXG A; 4G23 A; 4I9E A; 2GW1 A; 1ELW A; 3GW4 A; 2WPV A; 4J0U A; 3KAE A; 5KJK A; 4UI9 C; 2C2L A; 4GCO A; 4CGV A; 2HR2 A; 4N3B A; 4G2V A; 1WM5 A; 5BT1 A; 2I6H A; 2NC9 A; 5KJL A; 1P5Q A; 3E4B A; 2KC7 A; 3RU0 A; 4YND A; 1IHG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1NI1 A; 1KLX A; 3UQ3 A; 2GGF A; 5LP0 A; 2PQN A; 4ATG A; 5FJY A; 2R2L A; 1TJF A; 3T8M A; 4HOS A; 3HXB A; 3BU8 A; 4HI9 A; 1D9S A; 5G04 C; 4GTO A; 4H7Y A; 3BG1 B; 5HQ8 A; 4EEC A; 4A1G A; 5LCW C; 3FH8 A; 3PNT B; 3ENE A; 4BX9 A; 1NZN A; 4XI9 A; 4JW1 A; 3SBT B; 2IO2 C; 1DNP A; 4Q96 A; 4A55 A; 4ME2 A; 4EBA G; 3LY8 A; 4FP7 A; 3G2U A; 2RG8 A; 3CHP A; 2V5F A; 1WAO 1; 2ZU6 B; 4MRU A; 3RJV A; 2OND A; 4F1P A; 3TWS A; 2XGO A; 1K1A A; 5FIN A; 3CKB A; 2GRO B; 3PUJ A; 3KS2 A; 5FWQ A; 1U3C A; 3LY9 A; 4N2S A; 1QQE A; 3RAU A; 4JD2 G; 4TXP A; 4AXH A; 5T8I A; 3FU3 A; 4FLH A; 1WY6 A; 4ACK A; 3MGB A; 3SZ7 A; 5T4Y A; 3FUE A; 2PNN A; 2X6J A; 2VSN A; 4F7A A; 3MKQ B; 3DPD A; 2CHW A; 3ASF A; 4N2Q A; 3SO8 A; 3GZ2 A; 3CHR A; 3CVN A; 4GA0 A; 4DPR A; 2XRZ A; 2HO1 A; 1TNB A; 1BPO A; 3HG0 D; 3UX4 A; 2FI7 A; 4U0Z A; 1S0P A; 4KXK B; 2AVP A; 4UQX A; 2ZGD A; 5JJ6 A; 2RFA A; 1ZB1 A; 4Q94 A; 5JJ7 A; 3UM1 A; 4GML A; 4Y6W A; 3FH7 A; 1Z3X A; 4H7X A; 3FTU A; 4U8H A; 4L9P A; 4HOR A; 2QFC A; 4GPM A; 3ZHE A; 4U07 A; 5CHE E; 3I4R B; 1Z3Y A; 5FIO A; 2WQ7 A; 3J5Q B; 4YDO A; 4BEP A; 1DC2 A; 4WWP A; 1TNY A; 2H6G A; 5D66 A; 4C0E A; 2X6F A; 3ABL E; 3TJP A; 1O5M A; 1H6P A; 3PEU B; 3CST A; 2WQ6 A; 3NAW A; 4F3V A; 3APF A; 5ENT D; 5HI7 A; 5AQB A; 1KT0 A; 3L22 A; 1MQS A; 3RK6 A; 4HLL A; 2EIN E; 3B7S A; 2P9S G; 3FTW A; 2XPI A; 1HZ4 A; 1HFA A; 3CVU A; 4DX6 D; 3B7T A; 4RG6 A; 1PY1 A; 5CMW A; 1TYQ G; 2NXP A; 3FUK A; 3IXE A; 3JUE A; 4J6I A; 2RKK A; 3IBE A; 4U95 D; 3UIO C; 2ILR A; 4JC8 A; 4P29 A; 4ANW A; 4LNB A; 4WNF A; 4JA9 A; 1OCO E; 3D9O A; 4BTB A; 3CKC A; 1S63 A; 3FH5 A; 1LD7 A; 3LJN A; 3TWQ A; 3FU6 A; 4UWF A; 1RW2 A; 3PH0 C; 4JA7 A; 5T3R A; 4IYP A; 3ZPJ A; 2ETC A; 3LJ3 A; 3HXD A; 1OWP A; 4NUR A; 4N5Q A; 5FTP A; 4I6J A; 4AJW A; 5JHB A; 4K5A B; 3FTX A; 4LER A; 4U0S A; 2C0M A; 3TWR A; 3C5R A; 3L16 A; 2M63 A; 5G05 J; 2OVF A; 5CCL A; 5KBA A; 2L6J A; 3C3O A; 4E6H A; 4IUL A; 3PNL B; 3TG5 A; 2YIN A; 2V4H C; 4FJY A; 3K9I A; 3LS8 A; 1HF8 A; 1H6O A; 4K03 A; 3TXN A; 4U8V D; 4UI9 J; 3FTV A; 3ZYK A; 2EIJ E; 5EYP F; 1NL4 A; 4EHM A; 4DI3 A; 2DCP A; 2VYI A; 4I1A A; 4IN3 B; 4M7C A; 1EPU A; 1QZ2 A; 3MKQ A; 4LSZ E; 1H0A A; 2A4Z A; 2XPY A; 3FU5 A; 2WXF A; 4J8E A; 3P2B A; 3CVX A; 3EIJ A; 2KCL A; 3ESL A; 4HRN A; 3R9A B; 3RO2 A; 1A17 A; 3AAA C; 3QDN A; 2J4D A; 3T9K A; 3DXM G; 3D3M A; 4GMJ A; 3ZUV B; 2HYZ A; 3DBS A; 4EZK A; 4RSY A; 2FBN A; 4OVV A; 3EHM A; 4B89 A; 2PL2 A; 2VSY A; 1HE8 A; 3U3W A; 3JXJ A; 4WWO A; 1V54 E; 4I43 A; 2FO7 A; 3CVY A; 4U63 A; 1TR4 A; 4GTV A; 1MJ0 A; 1IXV A; 3SFZ A; 5BV1 A; 1N4R A; 3U66 A; 3EHN A; 1H19 A; 3LVR E; 3ZVV A; 3MZL B; 3BQO A; 3TWT A; 2ZXW E; 5KNH D; 3FDH A; 4JZY A; 2V4L A; 4DRX E; 2VGE A; 3DWL G; 4MS6 A; 1JCQ A; 4TRQ A; 5ENQ D; 2P9L G; 3AS4 A; 2I1J A; 1E7V A; 1WDY A; 4GZC A; 3T5X A; 3E37 A; 2LSU A; 3JXI A; 4AIF A; 3EU5 A; 4G8L A; 2IO3 C; 4GAA A; 1EF1 C; 3ZYQ A; 3DSW A; 1H2U A; 4ACL A; 2VGX B; 2J8S D; 3PEV B; 3MCX A; 3ISM C; 1ELW A; 2YNQ A; 3KAE A; 1O1S A; 3ZNG A; 3SFX A; 1KZP A; 3CHM A; 3Q79 A; 2LXL A; 2RFM A; 3EJN A; 3UKR G; 3I5P A; 2JAB A; 4TV3 A; 1JWG A; 4URK A; 3RU0 A; 4ILI A; 2AW6 A; 1IHG A; 4CRW A; 4C0M A; 3TL5 A; 3CVV A; 3LCA A; 2A5E A; 3JUI A; 4FAD A; 2J49 A; 2Y0B G; 4RLY A; 4E85 A; 3CVL A; 4K5C A; 4GZD A; 3GYZ A; 4NIK A; 2VQ2 A; 2FUL A; 3AS5 A; 5JA4 D; 3W9F A; 4CT4 A; 5M72 A; 3LY7 A; 5AQ9 A; 2KCV A; 3UUX A; 1SA4 A; 3ZYM A; 2QY7 A; 1SVX A; 3CVW A; 5DIZ A; 1DVP A; 3UPV A; 3GZ1 A; 5E76 A; 2JEK A; 4APO A; 3PVL A; 5HKP A; 4JEH A; 3SHF A; 2KZT B; 1PAQ A; 3G2V A; 2YQ8 A; 3D9N A; 2L0T B; 2MHK A; 1U2V G; 1U3D A; 1FCH A; 3Q9N C; 4HOQ A; 1OY3 D; 4XI0 A; 4OVU A; 4FLB A; 2NSZ A; 1N52 A; 2DIW A; 4AP2 A; 4I6G A; 1UN8 A; 4BY6 A; 3NQP A; 3PDN A; 1HS6 A; 3QJZ A; 3J5P A; 3O4Z A; 1FVF A; 1PC2 A; 2Y1L E; 4AEZ C; 2XEN A; 2LO6 A; 2MOW A; 4LNU D; 3L9T A; 3Q5M A; 3B7U X; 4GZ3 A; 5A6C A; 5ENR D; 1V55 E; 2LUH A; 3CLJ A; 1JWF A; 3R9M A; 3S7F A; 2ZIS A; 3BEE A; 3FUM A; 3CR3 A; 5B1A E; 1N0Q A; 4CCA A; 1OWM A; 3D9M A; 3B7R L; 3ONL A; 2V8S E; 2GRP B; 5E75 A; 3ASH A; 4BT8 A; 5IY5 E; 2H6H A; 4XEI G; 3RKV A; 3NZU A; 3UT4 A; 2QC9 A; 3NOC D; 5EIL A; 2CHZ A; 1HG2 A; 3QWV A; 4HXI A; 3ULQ A; 3S2A A; 3ZGQ A; 4DX7 D; 4EBA A; 2VGX A; 4YVO A; 1OUV A; 1N9A A; 3E30 A; 2VSO E; 3FEX A; 3QWW A; 3NBN B; 1FVH A; 3UI2 A; 2WM9 A; 1OCR E; 3U9W A; 5AEN A; 3EDT B; 3DST A; 3D9I A; 4AY6 A; 1YA0 A; 2XCB A; 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