The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
102
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sequence length |
263
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structure length |
263
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Chain Sequence |
GSAVSKTVCKATTHEIMGPKKKHLDYLIQCTNEMNVNIPQLADSLFERTTNSSWVVVFKSLITTHHLMVYGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGLQGYDMSTFIRRYSRYLNEKAVSYRQVAFDFTKVKRGADGVMRTMNTEKLLKTVPIIQNQMDALLDFNVNSNELTNGVINAAFMLLFKDAIRLFAAYNEGIINLLEKYFDMKKNQCKEGLDIYKKFLTRMTRISEFLKVAEQVGIDRGDIPDLSQAPSSLLDALEQH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Clathrin
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| source organism |
Rattus norvegicus
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| publication title |
Simultaneous Binding of Ptdins(4,5)P2 and Clathrin by Ap180 in the Nucleation of Clathrin Lattices on Membranes
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CLATHRIN ASSEMBLY PROTEIN SHORT FORM
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| total genus |
102
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| structure length |
263
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| sequence length |
263
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-11-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07651 | ANTH | ANTH domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | ||
| Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4FU3 A; 3RRU A; 1UJJ A; 3D9M A; 2DCP A; 3ONK A; 1EDU A; 1JUQ A; 1XGW A; 4GZD A; 1MHQ A; 1JWG A; 3CLJ A; 1H0A A; 2QY7 A; 3G2U A; 3D9K A; 5CMW A; 3ZYL A; 4Q94 A; 2DIW A; 1SZ9 A; 2L0T B; 1HF8 A; 3D9L A; 3G2S A; 4Q96 A; 1EYH A; 4HFG A; 3ZYQ A; 1JWF A; 3ZYM A; 1LF8 A; 2KM4 A; 4GZC A; 5CMY A; 4AVX A; 3D9N A; 1HG5 A; 4JXT A; 4NAC A; 3ZYK A; 1HFA A; 1INZ A; 3G2V A; 3LDZ A; 1UJK A; 2V8S E; 3G2W A; 2MOW A; 4FLB A; 1HX8 A; 3ONL A; 3D9I A; 1DVP A; 1PY1 A; 2LO6 A; 1ELK A; 2L0I A; 1SZA A; 3G2T A; 3D9J A; 5LP0 A; 1VDY A; 2BF0 X; 3D9P A; 5J08 A; 1JPL A; 1X5B A; 5LOZ A; 1HG2 A; 3D9O A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3F6Q A; 2CE7 A; 4WNG A; 5T8I A; 1XDO A; 4WAF A; 3OTO T; 4L9I A; 1IKN D; 3NRY A; 2VGX B; 4ZEY A; 4TX5 A; 3Q73 A; 4OAU C; 1S63 A; 2HPJ A; 4GPM A; 1HF8 A; 3MZK B; 3V2O A; 1UG3 A; 4I0U A; 4GZC A; 3HL6 A; 1T72 A; 3AE8 A; 3P4W A; 2IO3 C; 2XS8 A; 1SE7 A; 3B5M A; 1W0A A; 2XUE A; 3Q5X A; 3P4S A; 4IGU A; 3LJ3 A; 3NZU A; 3TWU A; 2YU1 A; 3MA5 A; 5ENQ D; 2DWG A; 4ZI2 C; 4U8V D; 2X0H A; 3NOG D; 5JRC A; 3GWH A; 4Q94 A; 3B7T A; 3IKO B; 4GTT A; 3EDU A; 4DX1 A; 1Z8U A; 3FZK B; 4X62 T; 1K1B A; 2CFZ A; 3ZYM A; 3FUI A; 3FU3 A; 5AAR A; 4GTO A; 4K0U A; 4QKN A; 1UK5 A; 5FKY A; 3BQO A; 3QKY A; 1N4P A; 5CRU A; 3EDT B; 4O8S A; 4HS2 A; 3ZUV B; 3AEC A; 4GA0 A; 4ZFH A; 3FTV A; 2JPF A; 2YDQ A; 2XHE A; 2XPI A; 5AQQ B; 2BS4 A; 3KIN B; 4JW1 A; 3AEB A; 3PUW F; 4APO A; 3AEE A; 3C4Z A; 3O48 A; 3QUJ A; 2L8K A; 2OA5 A; 3LCA A; 1U2V G; 2WDQ A; 4AQF A; 1QNF A; 2PTF A; 4AKI A; 2CLY B; 5HXS A; 2X66 A; 1O3X A; 3Q47 B; 4BET A; 4E6H A; 2LM9 A; 4UEL A; 5G2N A; 4HB5 A; 3N9L A; 4C9B B; 2J9Q A; 3B13 A; 2MAW A; 3G2V A; 1Y8M A; 3V5U A; 1OWA A; 1NFI E; 3QOF A; 2FBW A; 4WBN E; 4YY3 T; 4B89 A; 3TJP A; 3VTY A; 3APF A; 3DJB A; 4IRE A; 2ZGD A; 5JJ7 A; 1KZO A; 4ANW A; 1OCC E; 3SRZ A; 3LK2 B; 1LF8 A; 5ENR D; 2W62 A; 3K3O A; 4QQI A; 1HFA A; 3CKD A; 3CST A; 3AB3 B; 3SBT B; 4ACL A; 3JC6 D; 5BNW A; 3TG4 A; 4FHJ A; 2JQ9 A; 5ENS D; 2OLT A; 4F3V A; 4M1P A; 4IHJ E; 4LF8 T; 1TR4 A; 3HRA A; 2A9U A; 4AIS A; 2Y48 B; 4NUR A; 4L9P A; 3ZKJ A; 3SD5 A; 5JDN A; 3EI0 A; 2XAS B; 2MYS A; 3G2S A; 2EIM E; 3ZN0 B; 2ZIS A; 1E8Y A; 4GTS A; 3Q15 A; 4LEU A; 3ZSS A; 3UMV A; 4LNU D; 1YA0 A; 3Q5E A; 1SA5 A; 2LAH A; 5EYL A; 2XHE B; 4LF6 T; 4K5C A; 3TXM A; 2ETC A; 1KNR A; 4RSY A; 2MBG A; 3N71 A; 3CVP A; 2XAJ B; 2LXM A; 3AU4 A; 4DV1 T; 2XQ7 A; 2IW5 B; 2CHW A; 4CN4 A; 3FXD B; 5LGT B; 1TN8 A; 3D9K A; 2IQC A; 3WI3 A; 4H9P C; 2XQ0 A; 2WS3 A; 5FZQ A; 3EIJ A; 5H6Q B; 3FEX A; 3KVA A; 4LF7 T; 3Q9N C; 4CCA A; 3UTK A; 4ILG A; 2H7O A; 4JI4 T; 4I1M A; 4L1B A; 3RU0 A; 4CDM A; 1E96 B; 2AXD S; 3F57 A; 3CV0 A; 3QDN A; 2CHX A; 5AQF B; 2VVS A; 2WBL A; 1WR6 A; 3OYX A; 3HXB A; 2B76 A; 3PV0 F; 4G24 A; 3D9M A; 4GU5 A; 3FTW A; 5FIN A; 3TLV A; 4O1P A; 4WZX A; 2XAF B; 4IN3 B; 4ILI A; 4PJJ A; 5CFB A; 4N5C A; 3A5X A; 5E76 A; 3E30 A; 4PDX A; 4HLE A; 1Z6T A; 3L17 A; 4WWO A; 2IOL A; 2VGE A; 1LD7 A; 1QQE A; 3N5L A; 4I4T E; 3QWW A; 4J8F A; 3VLD A; 3SNX A; 3UM3 A; 1HZ4 A; 3ZRH A; 4AIF A; 4D10 C; 3L39 A; 4JC8 A; 3IBP A; 4IIJ E; 4IE0 A; 3LPZ A; 3U66 A; 4F6R C; 1JPL A; 1T8B A; 2EIJ E; 2PQR A; 5LG3 A; 2IHR 1; 1TNU A; 1V54 E; 2LUH A; 2L9Q A; 2H6G A; 4UI9 C; 2SPC A; 4H9R C; 2EIL E; 4LSZ E; 4BFR A; 2BS2 A; 4UQZ A; 2DLR A; 3LY8 A; 2IML A; 4ILA A; 3ABV A; 3NB2 A; 1O1T A; 4LFB T; 4QXH B; 4FUL A; 2R17 C; 4O60 A; 2IY0 C; 4GCN A; 1R8I A; 3TXN A; 2CXD A; 4I6G A; 4UVA B; 4X20 E; 1WY6 A; 5LMU T; 3E08 A; 2BKO A; 3MYV A; 2XRY A; 5G05 C; 3D9H A; 3JQ1 A; 2DZN A; 3PU3 A; 3CHO A; 2E2E A; 2C0S A; 3RIA A; 1V55 E; 3OTN A; 2XAQ B; 2XSB A; 3UUX A; 2JQQ A; 2MPK A; 5KJL A; 4K0R A; 3ZEF A; 2K3W A; 2P9N G; 2XQ6 A; 3KD7 A; 4KX6 A; 1D0Z A; 4XAX B; 4GKJ T; 2X38 A; 3QWP A; 2OV8 A; 4XBF B; 2W61 A; 4P1N A; 1MX4 A; 4LUN U; 2L6B A; 2WXG A; 3KS2 A; 4QHO A; 2R6G F; 3ZT7 A; 3AG3 E; 3AS4 A; 3ASH A; 4UVC B; 1QLB A; 3Q4A B; 2P58 C; 5AQT B; 1MMN A; 4AY6 A; 3PZ4 A; 4U7E B; 4TWF A; 4V1A v; 4HRM B; 4IDP A; 3FHN A; 2V1D B; 1U5P A; 3S7F A; 5AEN A; 3PJA A; 3I4G A; 2OEV A; 4QH4 A; 2D5U A; 3ZMS B; 2B6C A; 3E4B A; 2F4V T; 3AAI A; 3DTO A; 4AKR B; 2GW1 A; 3EAM A; 4HWF A; 2XCC A; 3AEG A; 5JDH A; 2X6I A; 1OCR E; 3G06 A; 2LSI A; 2Y69 E; 2XPZ A; 5EDS A; 2DYS E; 4L0R A; 1I6Z A; 4HN9 A; 4O2A E; 2PBI A; 1WG0 A; 5L3B B; 1X81 A; 3RK6 A; 1IHB A; 5JDF A; 2DBA A; 4JXT A; 2KWI B; 2RA1 A; 3RYC E; 3Q49 B; 2WZH A; 3ZMZ B; 2FJA A; 2Y0B G; 1E7V A; 4LER A; 3FHE A; 3HKE E; 2E2A A; 1BI8 B; 2LOS A; 1VOM A; 1TNO A; 2HH7 A; 2IAK A; 3TWW A; 1OY3 D; 3E32 A; 4MBG A; 4AJW A; 3ENE A; 1WFD A; 4B93 B; 1MX2 A; 1VCS A; 2CG2 A; 2DHR A; 3FTY A; 4YND A; 2VGY A; 5KCM A; 2ODV A; 5FYM A; 3PZ2 A; 4EEB A; 5ABE A; 2B1E A; 4LFC T; 1J5W A; 1E8Z A; 4ILB A; 1HS6 A; 5FXX A; 3ZEF B; 5EK3 A; 2NOX A; 4OX9 T; 3W15 B; 4I6J A; 3RIB A; 2JEK A; 3IHY A; 2Y3A A; 3KEZ A; 2XZE A; 2QA7 A; 4IL4 A; 2WSS V; 3HXE A; 5CCM A; 1VDY A; 2AXU A; 3PUV F; 4HLL A; 2Q9Q C; 3W9F A; 4WWP A; 3RIU C; 2BDE A; 2WXF A; 3ONX A; 3SOL A; 2MRI A; 3ZCI A; 5A6C A; 4PFP A; 2WB2 A; 3OVU A; 2P9U G; 4UQY A; 2UUA T; 2X6K A; 4CDR A; 5HCM A; 4UQX A; 1N4R A; 5LGU B; 3TWR A; 1BLX B; 2UWJ G; 3RKO A; 2JJ9 A; 1KNZ A; 4N2Q A; 4A55 A; 1NEK A; 4NPP A; 3J9X 1; 2DI4 A; 5H7P A; 1XMO T; 3S7B A; 1QBQ A; 5CEA A; 2Y6X A; 4UV9 B; 4UWG A; 5FP3 A; 4ZS3 A; 3BK9 A; 1HH8 A; 4XE0 A; 3K3Q C; 3RHW A; 3PNT B; 5FQ6 A; 3QOU A; 2RFM A; 4DR1 T; 3EVY A; 1XWM A; 5AQS B; 2Y4U A; 4JA7 A; 3AE9 A; 4L5G A; 2X3M A; 4JI5 T; 2NC9 A; 3HXD A; 4EB6 E; 4WND A; 4BTB A; 2NW7 A; 4L2Y A; 5LP0 A; 3BU8 A; 2VB6 A; 2I6H A; 3RJV A; 4I6E A; 4C91 A; 4JEU A; 3ASO E; 4I9C A; 5AJL A; 2H6I A; 3SFZ A; 3CVX A; 3EUV A; 3LS8 A; 4JL0 A; 5AIJ A; 1TJF A; 4JEH A; 2PM6 A; 3LBX B; 1UCU A; 3C5R A; 3UUN A; 1IBL T; 4RVB A; 3N9Q A; 2CXF A; 2YDS A; 5L3F B; 4CI2 B; 3DPY A; 5ABH A; 3HR0 A; 4IT4 A; 3NWI A; 1U4Q A; 4KI0 F; 1KT1 A; 3MV2 B; 4I43 A; 5CER B; 4PJL A; 4LMJ A; 3WAJ A; 2J4G A; 4JI0 T; 2KCL A; 2P9I G; 3HIZ A; 4NQ0 A; 5JDM A; 5FXZ A; 4ANX A; 2W67 A; 1HG2 A; 2EIK E; 3M65 A; 2JQH A; 3FBL A; 2IOS A; 4U2Y A; 4UWF A; 2I59 A; 1BR0 A; 2RFA A; 4NXN T; 3AED A; 1H2V C; 1YXR A; 3Q78 A; 2HM8 A; 1HE8 A; 4DK5 A; 4HOU A; 2HN1 A; 2UXN B; 4DND A; 3RAU A; 2WXK A; 5BR8 T; 1EYH A; 2RG8 A; 3L82 A; 5B3S E; 4C48 B; 3VLF A; 2BKN A; 2CFU A; 1D0Y A; 3QK0 A; 3PUQ A; 3U78 A; 3EU5 A; 3UU4 A; 4OHF A; 1TN6 A; 2V5F A; 3CX8 B; 1HNZ T; 2Q9Q A; 4HNA D; 4V3I A; 4ZHB A; 3RIU A; 4QXB B; 5CED B; 5BV1 A; 2C0L A; 3R7R A; 4P09 A; 2E5V A; 5AQV B; 2YU2 A; 2CXL A; 3FWV A; 4G8L A; 1E8X A; 3EHM A; 4B3S T; 3NBN B; 5FZS A; 4JYA T; 1KT0 A; 1WLX A; 4EYY R; 2J4D A; 5HRY A; 3SZ7 A; 1O1S A; 3ZLI A; 1INZ A; 1W0B A; 4CXY A; 1N36 T; 1D1B A; 3ZKR A; 1M62 A; 2CLY C; 4QFV A; 4COF A; 4CYM D; 1DC2 A; 2CA5 A; 2WXJ A; 1MX6 A; 2XQ8 A; 2R02 A; 4JEU B; 3EIQ C; 4DX5 D; 5IUX A; 4NUU A; 3TG5 A; 3UKR G; 1ELW A; 1UX4 A; 3VLE A; 1KK7 A; 3B7B A; 5CMW A; 4GK5 E; 5C8Y E; 4JEH B; 2W66 A; 2K5B B; 1KPS B; 1MZC A; 3MZL B; 3RC3 A; 3LG7 A; 3PVL A; 5B1B E; 1S64 A; 4WWN A; 5AQU B; 3MXZ A; 3QB5 A; 2A5U A; 5LBM A; 3RC8 A; 4G2V A; 3SY2 A; 2V4H C; 3OKQ A; 3AXJ A; 4I43 B; 5EK2 A; 3UU5 A; 2GRR B; 4XEI G; 1OWP A; 4JUY A; 3RO2 A; 2WDR A; 2L0I A; 4F53 A; 4YHH T; 2NTY A; 3CWZ B; 4G8K A; 1JCS A; 1L5J A; 1UOH A; 2KT9 A; 2FUP A; 2XGM A; 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