The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
46
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sequence length |
193
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structure length |
193
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Chain Sequence |
PLALLLDSSLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDEGITALHNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGWTPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKCEEMEEGYTQCSQFLYGVQEKMGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLNDKEGYVPRNLLGLYP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Structure of the p53 tumor suppressor bound to the ankyrin and SH3 domains of 53BP2.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Complex (anti-oncogene/ankyrin repeats)
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source organism |
Homo sapiens
|
molecule keywords |
P53
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total genus |
46
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structure length |
193
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sequence length |
193
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 1996-09-30 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
B | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
B | PF00023 | Ank | Ankyrin repeat |
B | PF13606 | Ank_3 | Ankyrin repeat |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Ankyrin repeat-containing domain | ||
Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K7A A; 4IIO A; 1K76 A; 1MV0 B; 3LJN A; 2ENM A; 2KRN A; 2LP5 A; 4DX1 A; 2J05 A; 2J7I A; 1FYN A; 2CT3 A; 4Z88 A; 1AP7 A; 2J6O A; 3HG0 D; 3O5Z A; 2ZGG A; 5AQ9 A; 1AZE A; 5EC7 A; 2YUN A; 1GBR A; 2RFA A; 1DC2 A; 2JMC A; 3R6N A; 3B95 A; 5GJW B; 4K5B A; 1BK2 A; 1GL5 A; 1WFW A; 3EG1 A; 2LJ1 A; 4AFU C; 1CSK A; 3JUE A; 1UG1 A; 4J9I A; 2JW4 A; 1VYV A; 3ZU7 B; 2QDL A; 3IXE A; 4LUE A; 2FPD A; 4RUG A; 3H0F A; 2XEN A; 2LCS A; 1N5Z A; 2LNH B; 2KBX A; 1RLQ C; 2X3X D; 1JO8 A; 2YUP A; 3TWX A; 1SRM A; 4WCI A; 1PRL C; 2YUQ A; 5CEC B; 1AWO A; 2QC9 A; 1VYU A; 1HD3 A; 4U8V D; 5CEA A; 2J6F A; 2KXD A; 2JAB A; 5IHK A; 1QKW A; 3NPF A; 1PKT A; 3DEO A; 4O1P A; 2EKH A; 2L0A A; 1BI8 B; 1JU5 C; 2EVR A; 1YN8 A; 2O88 A; 3PE0 A; 1J3T A; 2X3W D; 1GCP A; 2VWF A; 1HSQ A; 1PKS A; 1QWE A; 2BZX A; 3TWT A; 2JXB A; 4YDW A; 1WXB A; 4AFS C; 1QLY A; 1CKB A; 1UGV A; 4HVV A; 1X69 A; 1B3Q A; 3ULR B; 1T0J A; 3RBB B; 2IIM A; 1IO6 A; 2G6F X; 4GBQ A; 5HS0 A; 5KNG A; 2DJQ A; 1UE9 A; 1ABO A; 2K9G A; 2DNU A; 4HCK A; 1YP5 A; 4GPM A; 3SO8 A; 2DL7 A; 3AJI A; 1KIK A; 4HBD A; 1TUD A; 1WYX A; 2JT4 A; 1K3Z D; 4HRN A; 4ESR A; 2KRO A; 4OMN A; 1GRI A; 2CH4 W; 3JV3 A; 4R0K A; 4ZNX A; 4OMP A; 2OAW A; 4HVU A; 2GBQ A; 2VKN A; 2J06 A; 2ETB A; 1GFD A; 4U95 D; 5I22 A; 1UHC A; 4OMQ A; 1JXM A; 1G3N B; 2W0Z A; 1UDL A; 2EYZ A; 1UFF A; 2F8Y A; 3M0P A; 1SEM A; 4LE9 A; 1SPK A; 1IXV A; 2RN8 A; 2DIL A; 4J7W A; 2JS2 A; 2F2X A; 2KRS A; 1NLP C; 2RMO A; 4O60 A; 1OY3 D; 1AOJ A; 1SHG A; 5AQA A; 4LNP A; 3D9H A; 1GCQ C; 1Y0M A; 1TR4 A; 3H41 A; 2DRM A; 2DX1 A; 5HKP A; 2EW3 A; 2XMF A; 1SW6 A; 4YDY A; 1MX6 A; 1UOH A; 4DUI A; 1JXO A; 1MX2 A; 5AQB A; 5CBN A; 3AAA C; 2ABL A; 1QWF A; 4LN2 A; 1BB9 A; 3ZNG A; 1RI9 A; 3QWY A; 5CBO A; 2DRK A; 2ESW A; 4RTU A; 4CC7 A; 2F37 A; 5CER B; 2A08 A; 3TWQ A; 3EU9 A; 4TUM A; 4ZHB A; 2D8J A; 2ECZ A; 5ITZ F; 4JB8 P; 2YUO A; 2AJA A; 1S1N A; 4F1P A; 1ZSG A; 3TSZ A; 2O9V A; 4G8K A; 4J9B A; 4HB5 A; 3EG0 A; 2BKG A; 4U96 D; 4CC2 A; 4Z89 A; 2EGC A; 1K1A A; 2L3S A; 4X1V A; 1WX6 A; 2A5E A; 1WA7 A; 1G83 A; 2PTK A; 3UA6 A; 2DVJ A; 2MOX A; 2AK5 A; 1E6G A; 4HXJ A; 1UEC A; 1AD5 A; 4J9H A; 5HCK A; 1AWX A; 4BES A; 1OOT A; 2K6D A; 3VS0 A; 2KYM A; 1T3S A; 1N0Q A; 5IXF A; 1NYG A; 2DA9 A; 2KE9 A; 1YYH A; 4HNA D; 3NOG D; 1EFN A; 2DM1 A; 2VGE A; 1WG0 A; 1YWP A; 2ETA A; 4HLL A; 4J9E A; 1BI7 B; 1D9S A; 5ENS D; 2Y0B G; 1BBZ A; 3T9K A; 5EN5 D; 1ABQ A; 2EQI A; 5AAO A; 2MYO A; 2JM9 A; 1E7O A; 2AKL A; 4D8D A; 4A63 B; 1SHF A; 4BSZ B; 1N11 A; 4AG1 C; 2RQV A; 2ZGD A; 1DCQ A; 4FSS A; 5KBA A; 2KXP C; 1IHB A; 4OML A; 1PWT A; 3H0H A; 1Z9Z A; 3GBQ A; 1AEY A; 2D8H A; 2KBT A; 1YWO A; 2K79 A; 2DF6 A; 1UJY A; 4CYM D; 4EIK A; 1RLP C; 1NFI E; 3KFV A; 5ENR D; 3NGP A; 1AWW A; 3SEM A; 1T0H A; 4OAU C; 2B86 A; 1U5S A; 2FPF A; 3VS2 A; 2AZS A; 1WXU A; 4DX7 D; 1OV3 A; 4JJB A; 4JZ4 A; 3ZUV B; 1W70 A; 2W10 A; 2V5Q C; 5IXB A; 1LCK A; 4RTW A; 1NM7 A; 4D8K A; 3NHN A; 2L6B A; 1MJ0 A; 2L3Q A; 2D1X A; 2ROT A; 2XZD G; 2DWZ A; 5BXO A; 2C0I A; 5FIN A; 4DRX E; 1M3C A; 2RFM A; 2LQW A; 3TVT A; 3V79 K; 1AWC B; 3T8K A; 2OJ2 A; 2HBW A; 5FIO A; 2EYY A; 3RNJ A; 2L3P A; 3ZKJ A; 1M3A A; 1VA7 A; 2SRC A; 4LUD A; 1OT8 A; 2B0O E; 1SSH A; 2GQI A; 2GTJ A; 1UJ0 A; 4F16 A; 2YSQ A; 4K11 A; 5FWC A; 1QYM A; 3J5P A; 1ZX6 A; 1W1F A; 1X27 A; 4ATZ D; 2FRW A; 1JEG A; 3TWR A; 3H0I A; 3EHR A; 2KT8 A; 5EIL A; 2F2W A; 2KT1 A; 4J9D A; 2F2V A; 1MUZ A; 3TWV A; 2JS0 A; 2XZT G; 2BZY A; 3EG3 A; 2NYJ A; 2DL4 A; 4J9G A; 4RTZ A; 1G2B A; 2HCK A; 3J5Q B; 1GFC A; 2KGT A; 1OPL A; 5AQ7 A; 5ENO D; 2O31 A; 2ETC A; 1M30 A; 2LX7 A; 3CQT A; 4RLY A; 2RQW A; 1SRL A; 5BXU A; 4NIK A; 5EIB E; 3NMZ C; 1M8M A; 5FW9 A; 4ORZ A; 1QCF A; 1TUC A; 3VS6 A; 1NG2 A; 2PNI A; 2DVW A; 3V2X A; 1U3O A; 1YMP A; 1WXT A; 2O2O A; 1I07 A; 2EYW A; 1H92 A; 3EHQ A; 2EGA A; 4OAV B; 3UF4 A; 3KEA A; 4HVW A; 2KR3 A; 2MIO A; 2V4H C; 4F6R D; 5ECA A; 2CRE A; 2V1R A; 1PHT A; 1NLO C; 1E6H A; 4KRT A; 3I9Q A; 1ZLM A; 1NEB A; 2H8H A; 5KNH D; 1KSW A; 1FMK A; 5ENT D; 1SVX A; 3A98 A; 4CC4 B; 1K0S A; 2OI3 A; 2DMO A; 4RTT A; 5JMN D; 3TWS A; 3Q9U C; 3I5R A; 3PVL A; 1K1B A; 2F8X K; 1BD8 A; 2QYJ A; 1Z9Q A; 2DBM A; 2V1Q A; 2KNB B; 4DX2 A; 3M0U A; 1MX4 A; 5AN8 A; 3F6Q A; 2P4R A; 5GJV B; 3EG2 A; 2FPE A; 4CC3 A; 2RF0 A; 2A36 A; 4E6R A; 3M0Q A; 3UAT A; 1GBQ A; 3TWU A; 1RUW A; 3C0C A; 3REB B; 2DE0 X; 2VVK A; 5ENP D; 4QT7 A; 3IQL A; 1YCS B; 2HEQ A; 3C5R A; 4LNU D; 1XOV A; 2I0N A; 1AVZ C; 3VS4 A; 5KWD A; 1UTI A; 3PVQ A; 4AFZ C; 3NOC D; 1WI7 A; 3VS7 A; 5IH2 A; 2ROL A; 4HRL A; 1BU9 A; 4RTV A; 4F17 A; 1BU1 A; 3VS1 A; 1K9A A; 4HI9 A; 2YT6 A; 2J8S D; 2RQU A; 2YDL A; 4DX6 D; 2CSQ A; 1NYF A; 1UUE A; 2AZV A; 2DL3 A; 2FRY A; 2GGR A; 2GNC A; 2XEH A; 2FEI A; 1MV3 A; 4ZFH A; 1U06 A; 3UI2 A; 2CDT A; 2PNN A; 2DZO A; 4BER A; 3V30 A; 2PZ1 A; 3I5S A; 1N0R A; 3U23 A; 1X6B A; 4CZ2 D; 2LJ3 A; 2KXC A; 2ED1 A; 2HDA A; 2C0O A; 1I0C A; 4DX5 D; 2A37 A; 2HE0 A; 3JXI A; 5EID A; 3THK A; 5ENQ D; 4F14 A; 4DEX A; 2BKK B; 5IHN A; 1X2K A; 3TSW A; 1X43 A; 1K4U S; 1IKN D; 3I35 A; 2RNA A; 3VRY A; 3VS3 A; 2DZN A; 4B93 B; 1K0X A; 2Y1L E; 2M51 A; 4J9F A; 1BLX B; 4LSZ E; 4GMR A; 1UHF A; 4HQD A; 1A5E A; 1T3L A; 4Z68 A; 1QKX A; 4N5Q A; 2LMJ A; 5D66 A; 3M0R A; 5EYP F; 1W6X A; 2E5K A; 2KRM A; 2LZ6 B; 2KEA A; 2BTT A; 2EGE A; 3M0S A; 2JMA A; 3V2O A; 3TWW A; 2FO0 A; 5CED B; 1B07 A; 4RTY A; 1WLP B; 3LH5 A; 4AG2 C; 2GTO A; 4Z8A A; 1V1C A; 4Y92 A; 2FG0 A; 3B7B A; 1KJW A; 2LQN A; 4BET A; 3V31 A; 4JZ3 A; 3VS5 A; 2DLP A; 4OMM A; 4K5C A; 1Y57 A; 1AZG B; 2BZ8 A; 2MCN A; 2EPD A; 2FO1 E; 4QQI A; 1JQQ A; 1CKA A; 5AAR A; 3FJ5 A; 1MYO A; 3JXJ A; 2P2C P; 4AFQ C; 1S70 B; 2NWM A; 4M4Z A; 4HRM B; 2NUZ A; 2JTE A; 3QWX X; 4K5A B; 3UA7 A; 2LJ0 A; 3NBN B; 4JJC A; 2J6K A; 4O1O A; 3Q9N C; 1ZUK A; 5FWB A; 1WDX A; 1PNJ A; 3SHW A; 4C48 B; 2RQT A; 1M27 C; 1KFZ A; 3UXG A; 1WIE A; 3EGU A; 5EYL A; 1PRM C; 4IIM A; 2DL5 A; 4DEY A; 1ZUY A; 2EYX A; 2CSI A; 5I11 A; 4QFV A; 2JM8 A; 2CUD A; 1X2Q A; 2CH4 A; 2RQR A; 5HRY A; 1H8K A; 3W9F A; 3W9G A; 1OPK A; 2CT4 A; 3REA B; 2K2M A; 1VYT A; 2K3B A; 2M0Y A; 2RPN A; 4G8L A; 4J8Y A; 4RTX A; 4HI8 A; 5IHI A; 3DEP A; 4J9C A; 5JA4 D; 2EBP A; 2KYB A; 1X6G A; 2DYB A; 1GCQ A; 3HRA A; 1AWJ A; 1K1Z A; 3UTM A; 4JPB W; 2DBK A; 2C0T A; 1YNZ A; 2ED0 A; 4GLM A; 3ZL7 C; 1ZBJ A; 3VRZ A; 2CUB A; 3M0T A; 2A28 A; 1WDY A; 4LG6 A; 2L2P A; 1TG0 A; 1NEG A; 1ZUU A; 4OMO A; 2XEE A; 5L23 A; 4BEP A; 4JJD A; 2HSP A; 2DL8 A; 1H3H A; 2D0N A; 4UUC A; 2SEM A; 2O9S A; 1OEB A; 1I1J A; 1M3B A; 1ARK A; 1A0N B; 1HJD A; 4U8Y D; 2AKK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EIQ C; 2LCL A; 5I21 A; 1ZSZ C; 1K76 A; 3L16 A; 4HA8 A; 5KJM A; 5CHE E; 2ENM A; 4BDZ A; 3VLD A; 4KYO B; 4DQ2 A; 2VGX A; 2ZGG A; 3IKO B; 3CSF A; 8ATC B; 1VQ4 Q; 1NZN A; 1DC2 A; 3R6N A; 3B95 A; 3SFY A; 1H6P A; 1BK2 A; 2DXB A; 4FYX B; 2LJ1 A; 1N4P A; 2VSN A; 3SWN A; 4KT0 E; 3CCE A; 1CSK A; 1G3W A; 5KYX A; 3JUE A; 4QVZ A; 2JW4 A; 3V7R A; 3OSS C; 3A8M B; 3OYY A; 1PD0 A; 3H0F A; 2XEN A; 4J7I A; 3VUZ A; 2EQJ A; 1K8A C; 4M78 C; 5KYU A; 3FTX A; 2LXM A; 2X3X D; 1X01 A; 1VQL A; 4WCI A; 2EWN A; 1VYU A; 5FT9 A; 3OS0 A; 3JCM b; 5CEA A; 4N2Q A; 3UX4 A; 2FZC B; 2CZ0 B; 3UKR G; 2MMP A; 1K73 C; 1JU5 C; 4RMO A; 2O88 A; 4WNG A; 2C0L A; 3CR3 A; 4JPS A; 4TRQ A; 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