4J8FA

Crystal structure of a fusion protein containing the nbd of hsp70 and the middle domain of hip
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
551
structure length
551
Chain Sequence
FMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGLESDLEIDNEGVIEADTDAPQEMGDENAEITEAMMDEANEKKGAAIDALNDGELQKAIDLFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFVKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAARDLALACKLDYDEDASAMLREVQPRAQKIAEHRRKYERKREE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and function of Hip, an attenuator of the Hsp70 chaperone cycle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B, Hsc70-interacting protein
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 183
structure length 551
sequence length 551
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.25.40.10 Mainly Alpha Alpha Horseshoe Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat 4j8fA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4j8fA03
5LCWJ 4HOQA 2FF6A 2W40A 3U8XA 1HX1A 5EX5A 1WAO1 5JLFA 2E2EA 1NGBA 2GWJA 5AQRA 1HH8A 4CGWA 2WPVA 2P9IA 3QB0A 4RG6A 2YHXA 3O8MA 2YHWA 4N5CA 3SF4A 4BRKA 5C1DA 2EWSA 1NGCA 3U9ZA 4GZ5A 1QQMA 3CV0A 1ZBSA 1QQOA 3LL3A 1YA0A 2L6JA 3BUZB 3QMLA 3VEXA 2E1ZA 5JICA 2IFUA 3VF6A 4EAHD 3BEEA 4BC4A 4BGAA 1GLEG 3MN5A 4YNDA 2P9IB 3MN6A 4FOIA 3LCAA 1MDUB 3TU5A 3DXMB 3MCPA 4IZ9A 3QFUA 1KT0A 2PAVA 3PE3A 4JHDA 3AS4A 3GYZA 4UQZA 2A3ZA 3SK3A 4B1XB 3GZ2A 2C2LA 4KYOB 2P9KA 4PL7A 1H1VA 2E88A 3A5MC 4CZHA 1NGDA 3Q47B 4NQ0A 4GYOA 2R5SA 3CJ7A 2YJEA 4BR5A 4LEUA 4C23A 2YJFA 1MWKA 3HSCA 2P9NA 2FEZA 5JJ7A 1GLLO 1NGAA 5BW8C 3D2FA 4EIAA 4JHDB 3M3ZA 4H7YA 2QWQA 4CZKA 5BT1A 3H46O 4H5NA 1GLCG 2P9KB 4QS8A 4BREA 2HF4A 5FZQA 4WNEA 1ATNA 1WOQA 1NBWA 3LDLA 2QWOA 1QZ6A 5AQNA 5FJYA 3ZX2A 2CH5A 3HTVA 2UY1A 3WXXA 4HOTA 1D4XA 4JNEA 4GY2B 4B1YB 2I7PA 3FZMA 4BRNA 5AQPA 3D2FB 4GYYA 4O6FA 3S7FA 2I7NA 4BGBA 5EVZA 3UKRA 4BR7A 2XGSA 2BUGA 3Q15A 3HBTA 2BUPA 3L6QA 3U4TA 3R8EA 4BRPA 5BRFA 3FZKA 4IJAA 3CI5A 1E96B 4GA2A 4H7XA 3WXIA 4UQYA 3U3WA 4IO8A 2ONDA 2UY1B 5G04C 3A5LC 4G24A 4GA1A 4YVQC 4H5RA 5AQWA 4B1ZA 2CGLA 5F2RA 1JCGA 4XEIA 1GLDG 3FR0A 1V4TA 3PDNA 3UKRB 1X3MA 4H03B 3EZWA 3EN9A 1HZ4A 4ME2A 4BT8A 4B94A 1NGIA 1HUXA 3KHYA 3M6GA 1P8ZA 3JXUA 4JL0A 5EKQD 3TG5A 2PL2A 2DBAA 3CVQA 5JJTA 3ENOA 5EX3A 3UPVA 2V51B 4WNDA 3ID8A 3CQYA 4APOA 2F9TA 3BF1A 5B8HA 3CVLA 3VEVA 3MV2B 2Q1NA 4FWMA 4H0OA 2Y4TA 1IG8A 4K25A 4PKIA 3ATUA 4H0TB 5AQIA 2UYTA 3ZN3A 4GZ6A 2GTDA 3BEXA 1DKGD 3A8YA 3DAWA 1NA0A 4BR0A 3P4IA 3VEZA 2J9QA 3WXKA 4AM6A 1QZ5A 1ZC6A 5CE3A 3I8BA 4EHTA 1OKJA 2P9PA 1EQYA 4WQ4C 4I2WA 2PBDA 4HWIA 4ISEA 3CJ9A 3ZETA 4AY6A 5FZRA 2FO7A 4RTFD 3FFKB 1BWFO 4CZGA 4FWRA 1IJJA 4U0UA 4W9RA 1XUPO 3R6MA 4BG8A 2P9SA 4H0PA 4MO4A 4WNFA 4ABNA 3B8AX 4G2VA 3SJHA 1Z6RA 4AIFA 3RSEB 5BRDA 1Z05A 3C0BA 2P9PB 5AQSA 3VESA 4M7XA 4H0YB 2QWNA 5JMVA 4XI0A 3QFPA 3F9MA 5BPLA 1ESVA 2ASOA 5FPNA 4G23A 2YHCA 4WUYA 4ISFA 3CJBA 3ZETB 4B1UB 1NLVA 1FCHA 4GA0A 4BRIA 1K8KA 4PL8A 2KHOA 4CD3A 4CZFA 4M63C 2P58C 3CHWA 4YDUA 5AFUH 3ZEUA 2GUPA 2P9SB 3UB5A 3UQ3A 3I33A 4BC3A 2A42A 4EHUA 5BN9A 4MLHA 2KCVA 3R9AB 2VCPA 4EQFA 4BRCA 3CK9A 3CVPA 1NGGA 5G05J 2KATA 4BRLA 2HO1A 3OHRA 3ZHEA 2V7YA 2W41A 1C0FA 3DXKB 2IVPA 3HM8A 5EY4A 5KPTA 1K8KB 1LOTB 2VSNA 4N39A 2ASMA 3VEOA 3ZPJA 2QWLA 3KS2A 4XI9A 4J8EA 3K9IA 5DIZA 3WUHA 3ZEUB 5KJKA 3WEEA 1NGFA 3DJCA 4GPKA 1OUVA 4CBUA 1GLAG 5AQFA 5HQ8A 2XGMA 3H1QA 3D7EO 1TUUA 4JD2A 5LCWC 3TG4A 3DWLA 3VTXA 4XH4A 4A2AA 1QHAA 2A41A 4RWTA 3CVNA 5AFUA 3LPZA 3MK6A 4I6MA 4BRHA 3MDQA 2FSNA 3QWVA 5BNWA 2QWMA 5BR9A 2YQ8A 3FFLA 1NMDA 4K43A 5AQZA 4FO0A 3AS5A 4HTLA 5AQUA 3O1BA 3VOVA 1JCEA 4GCOA 1KAZA 3ULQA 2P9UA 3URZA 4BC5A 2FF3B 1XNFA 2C0LA 2ZF5O 4G1TA 4M7YA 3RO2A 5LJVA 4I6MB 2Q97A 3CEQA 3A5NC 4FPAA 3CETA 4F9OA 4A1SA 2VYPA 1ZBPA 3ATVA 2QWRA 3W3DA 3O48A 2NLXA 1GLJO 3S41A 2VGXA 2YCHA 5KPZA 5CHEE 4BQZA 4BVOA 2P9UB 2P9NB 3ASHA 2MHKA 3VTYA 3TGOA 5F1XA 1HKCA 1SQKA 1T44A 3QBXA 1J6ZA 2ZGYA 3O6WA 5AQTA 4WYBA 3VEYA 3VEWA 2VYIA 5DBKA 1ELWA 1ZU2A 3EO3A 4J8FA 3MV3B 2Q31A 4FWNA 4KBOA 1HJOA 1BA0A 4MLEA 2IF4A 4U0ZA 4UI9J 2BTFA 5HI7A 4RG9A 2C0MA 4Y6CA 2P9LA 4IJNA 1NWKA 2XCBA 4JA9A 4QS7A 5FPDA 3JS6A 3QWPA 4DHYA 2FSKA 2CGJA 4DCHA 1ATRA 2PQNA 4WQ5A 5LY3A 4H5WA 2E2PA 2FSJA 1GLFO 2HYZA 3HI0A 3O4WA 5AQOA 4FWQA 4H0VB 5D0QD 5AQKA 3GE1A 3LYAA 4BTAA 1A17A 4HOSA 4U0SA 1ATSA 4G25A 1S22A 2WUSA 2XPIA 5KJNA 5FT9A 1PC2A 3AAQA 3AARA 5M72A 3IUCA 2P9LB 3CERA 4E1JA 2XCCA 2IVNA 2NRHA 5ELZA 5FTPA 3ENHA 3UKUA 4H5VA 4F3VA 3HYMB 2VGYA 4I9EA 3LKUA 2YI1A 5ARGA 5A7DB 4PKGA 3L4IA 1X3NA 1KXPA 2ZGZA 4A62A 4U07A 3SMSA 3VERA 3H1VX 5AQXA 3JYSA 4BRMA 3VGMA 3WXLA 1E4GT 1KAXA 2PQRA 4I9CA 3FP3A 5CCMA 2HOEA 4CGVA 4K42A 2AP1A 5CCLA 3R9PA 2FXUA 4YVOA 1KT1A 4GYWA 4HOUA 2Q2RA 4JN4A 2A5XA 5AQQA 3CK8A 3EDTB 2E2NA 4H5TA 3FZLA 2AA4A 2GWKA 2Q0RA 2HF3A 4DB3A 5AR0A 2JLBA 2ASPA 3S7DA 1KAYA 5JJ6A 1QZ2A 4WQ5C 5A6CA 1Y64A 4CDRA 3IEGA 3EL2A 5KQ8A 5JLHA 1ELRA 4G26A 4GCNA 2F9WA 5FPMA 4CBXA 1V4SA 3CQXA 5BPMA 4FSVA 2D0OA 3VPZA 3H45C 1HKGA 4JHRA 2E8AA 1DGKN 3CJCA 3QBWA 1BUPA 2KCKA 3ULEA 1WM5A 3KVGA 3LY8A 3H6EA 3MMVA 3CJ1A 1NZNA 4I17A 4Z94A 3OXFA 4U04A 1IYGA 3ZX0A 5LJWA 2WQHA 1E4FT 4B1WB 2DPNA 3LY7A 2YHYA 1P5QA 2FBNA 4BG9A 5EXWA 4CBWA 4XH1A 3J8AA 1MWMA 4BT9A 1X9JA 2CH6A 1SZ2A 1BU6O 1BDGA 1JCFA 2QWPA 3D2EA 2PZIA 3SLCA 5AYWD 4CZLA 1Q18A 2D1KA 4CD1A 5AQGA 2LNIA 3MN9A 1C0GA 3ULEB 3ZHEB 3CKCA 4XH5A 2GW1A 1HKBA 2VSYA 3MKRA 3DXMA 4IN3B 4BQLA 5KJLA 5KPRA 3IFRA 1YAGA 4B9QA 5G05C 3LY9A 3BP8A 4XIFA 4BTBA 3Q4AB 3WEEB 2VQ2A 2FF4A 2QXLA 3ZX3A 3D2EB 3O5BA 4FPBA 4IWVA 4JD2B 5AQJA 4RCHA 2OOEA 4JA7A 1WUAA 2E20A 3H3NO 3VF2A 3CKBA 1B89A 2E2OA 3LDNA 3TPQA 3LDPA 3ZGQA 4GZ3A 3MN7A 3VETA 3FGUA 3L0QA 4FWOA 4ISGA 4PKHA 4CZEA 3NF1A 3KD7A 3QKYA 5BPNA 4WNGA 4MO5A 3U4LA 4BVPA 1RGIA 3EKSA 3LM2A 3QICA 3RU0A 1RFQA 3LDQA 4QS9A 4BR9A 1TYQA 4LC9B 1U6ZA 5AQVA 2ITMA 4Y6WA 1T6CA 3GL1A 4KBQA 1BOTO 2Y4UA 4O8KA 4YDUC 5AQMA 2QFCA 5AZIA 4BC2A 3VENA 4AY5A 3Q49B 3CJAA 2I6HA 2CGKA 1NM1A 3S7BA 3HZ6A 1QQEA 4J0UA 4AM9A 1XQSC 3KAEA 4AM7A 4CZJA 1Y8MA 1RDWX 5D0OD 3C7NA 5ARFA 3S7JA 2OANA 1NGEA 1TYQB 3GBTA 2E1YA 3ASDA 5G04J 3FE1A 4Y0WA 3MA5A 1LCUA 5AZIB 4NB4A 2LSUA 2VGXB 4JAXA 4CJ7A 2A6AA 4I1AA 1CZAN 5ADXH 3VF4A 4A61A 4N2SA 1YVNA 3WQTA 1G99A 1BA1A 3QOUA 4N3BA 2A40A 2XGOA 4WQ4A 4CZIA 3KZBA 3C7NB 4BRAA 2GELA 3EKUA 4BRQA 5E26A 5BREA 4N3CA 3RKVA 3QDKA 3W0LA 3RO3A 1NGHA 5F0XA 2UWJG 3FZHA 4J8DA 1ZXOA 3CK7A 4FWLA 3ESKA 1SAZA 4N2QA 4N3AA 3GW4A 4A2BA 2FLOA 1QQNA 3MEKA 4UI9C 3A0IX 4FOEA 2NZTA 3AS8A 1S3XA 5EX0A 3VGKA 4B1VA 3OXLA 3BF3A 4BRDA 4DQ8A 5AQLA 1T6DA 3M1FA 1YUWA 3IDHA 1IHGA 5EOYA 5I9EB 1TJCA 1TUYA 1R59O 2QW9A 1W3BA 3A5OC 3FZFA 5ADXA 2FI7A 1MA9B 4BR2A 4EFHA 3FWVA 5KQDA 2Q36A 3SZ7A 2V7ZA 3UKUB 4K41A 3H3OB 3GG4A 2HR2A 4BWRA 5TKYA 2V52B 3RIBA 4CZMA 2KCLA 2NC9A 2HMPA 2ZWHA 3LDOA 2QM1A 3Q5MA 4KXKB 4L3QA 2Q7FA 2KC7A 1U2VA 2Q0UA 3AAPA 5AQHA 3UE5A 3FLCO 3WT0A 4GNIA 1BG3A 4FL9A 4NO7A 1BO5O 1HPMA 1NGJA 5BRHA 4NRHB 3ASGA 3CIPA 4IXCA 4I2ZA 4HORA 1HXIA 2XEVA 2AVPA 3RJVA 3GDQA 3TAXA 3RSEA 4BRFA 2V5FA 3UUXA 5AZJA 1DEJA 2J4RA 2LSVA 3OXGA 4O5FA 3GZ1A 5E84A 2VWBA 4UI9K 3VGLA 4BR4A 1U2VB 4FWKA 3QWWA 3IMXA 5FZSA 1NA3A 2H3GX 3AY9A 4H0XB 2D4WA 2GEMA 3GOIA 3N71A 3ZFWA 3U9DA 2D0PA 1GLBG 1XC3A 3O80A 5FPEA 1HLUA 2IVOA 4CI6A 5KJMA 3WXJA 4BROA 3QDNA 1KLXA 2E2QA 3SMPA 3O1WA 5AZJB 1YXQA 3WQUA 4FWSA 3DXKA 3LM9A 3O08A 3PE4A 5BN8A 3ASFA 3E4BA 2IIRA 4FWPA 3G25A 4UQXA 4BRGA 5AQYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LCWJ 4F2SA 4GV3A 2FF6A 2ZGDA 1HQUA 3U8XA 4M3WA 1HX1A 4WFAL 2YX6A 1Q86O 4HRMB 4GAAA 3R7QA 4EZJA 3VQ8A 3CCQN 1IKWA 4GTTA 4KHNA 1EDUA 4W5QA 4PH4B 4RG6A 2YHXA 4C8MA 3O8MA 1T05A 1TV6A 1SA5A 2YHWA 4NYNA 2IEJA 4TV3A 3U9ZA 2NRZA 4FJIA 4KMOA 1UN9A 3SI6A 2ETCA 3P38A 4DLOA 4DR3K 3NH0A 3QMLA 3FEXA 4BRLA 3CFRA 4AJWA 3ZYKA 4CEMA 1NKBA 2X6HA 3BEEA 1S5JA 1GLEG 1H2TC 5LP0A 1JWGA 3G0ZA 4BETA 2CFZA 1KT0A 3MJWA 2PAVA 4K8ZA 3WXMB 3PE3A 4JHDA 4KH4A 3AJIA 4PDXA 2G8VA 3V9UA 4GMJA 3OYMA 1ZBIA 1T3VA 2Y1IA 3Q9NC 2E88A 3A5MC 3DBSA 1J5EK 3VQ6A 3Q7AA 3PX6A 3Q47B 3SNNA 3JXJA 4CGHA 4GYOA 4GPMA 3CVVA 2WXMA 2YJEA 3NB2A 2E6MA 4LEUA 2Z1JA 2V5QC 1NJZA 4N41A 1GLLO 1NGAA 4JKCA 3MWPA 3PSFA 3KK3A 3AVHA 3CMEN 1E3MA 4H5NA 4HNAD 2P9KB 5CY4A 2HF4A 1XC9A 4LF6K 3ZW3A 1ATNA 2RPIA 2VGMA 3LDLA 3QIPA 1VQ9N 5AQNA 5FJYA 3ZX2A 3TXNA 1U3CA 2CH5A 3R7RA 3WXXA 3QO9A 4DSEA 2GX9A 4GY2B 1JLGA 3AO1A 4HB5A 3FZMA 3ENEA 3WNEA 4O6FA 4BGBA 1EWRA 3TSPA 1C0MA 3HJFA 4FJ5A 1IXVA 5LX8A 4G11A 3L8BA 2BUGA 5EDSA 3Q15A 2A1SA 2BUPA 1TJFA 3L6QA 3NHGA 1M1KO 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chains in the Genus database with same CATH topology
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 3O08 A;  3PE4 A;  5BN8 A;  3ASF A;  3E4B A;  2IIR A;  4FWP A;  3G25 A;  4UQX A;  4BRG A;  5AQY A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 5LCW J;  4F2S A;  4GV3 A;  2FF6 A;  2ZGD A;  1HQU A;  3U8X A;  4M3W A;  1HX1 A;  4WFA L;  2YX6 A;  1Q86 O;  4HRM B;  4GAA A;  3R7Q A;  4EZJ A;  3VQ8 A;  3CCQ N;  1IKW A;  4GTT A;  4KHN A;  1EDU A;  4W5Q A;  4PH4 B;  4RG6 A;  2YHX A;  4C8M A;  3O8M A;  1T05 A;  1TV6 A;  1SA5 A;  2YHW A;  4NYN A;  2IEJ A;  4TV3 A;  3U9Z A;  2NRZ A;  4FJI A;  4KMO A;  1UN9 A;  3SI6 A;  2ETC A;  3P38 A;  4DLO A;  4DR3 K;  3NH0 A;  3QML A;  3FEX A;  4BRL A;  3CFR A;  4AJW A;  3ZYK A;  4CEM A;  1NKB A;  2X6H A;  3BEE A;  1S5J A;  1GLE G;  1H2T C;  5LP0 A;  1JWG A;  3G0Z A;  4BET A;  2CFZ A;  1KT0 A;  3MJW A;  2PAV A;  4K8Z A;  3WXM B;  3PE3 A;  4JHD A;  4KH4 A;  3AJI A;  4PDX A;  2G8V A;  3V9U A;  4GMJ A;  3OYM A;  1ZBI A;  1T3V A;  2Y1I A;  3Q9N C;  2E88 A;  3A5M C;  3DBS A;  1J5E K;  3VQ6 A;  3Q7A A;  3PX6 A;  3Q47 B;  3SNN A;  3JXJ A;  4CGH A;  4GYO A;  4GPM A;  3CVV A;  2WXM A;  2YJE A;  3NB2 A;  2E6M A;  4LEU A;  2Z1J A;  2V5Q C;  1NJZ A;  4N41 A;  1GLL O;  1NGA A;  4JKC A;  3MWP A;  3PSF A;  3KK3 A;  3AVH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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