4J8FA

Crystal structure of a fusion protein containing the nbd of hsp70 and the middle domain of hip
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
551
structure length
551
Chain Sequence
FMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGLESDLEIDNEGVIEADTDAPQEMGDENAEITEAMMDEANEKKGAAIDALNDGELQKAIDLFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFVKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAARDLALACKLDYDEDASAMLREVQPRAQKIAEHRRKYERKREE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and function of Hip, an attenuator of the Hsp70 chaperone cycle.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B, Hsc70-interacting protein
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 183
structure length 551
sequence length 551
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.25.40.10 Mainly Alpha Alpha Horseshoe Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat 4j8fA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4j8fA01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4j8fA03
3LM2A 3WEEB 3VF4A 3LYAA 1NGGA 5M72A 3DXMA 3MN7A 1ELWA 4IJNA 3CEQA 1NGBA 3VENA 4WYBA 5BNWA 4RWTA 1YUWA 5AQTA 4GA2A 3WXJA 5AQZA 2DBAA 3OHRA 4J0UA 4H0PA 4JA7A 3H3OB 5ARFA 4BRCA 3QDKA 4U0UA 4H5TA 4I1AA 5KPRA 2YQ8A 3GYZA 2GEMA 3ASGA 2HMPA 4NB4A 1JCFA 3CQYA 5B8HA 1GLLO 3GZ2A 1GLCG 2VYPA 4CD1A 3ULEB 4GA1A 3BEEA 3WT0A 1NLVA 3ATUA 5ARGA 1XC3A 4ISEA 2HO1A 1E4FT 4CZFA 1HUXA 3LPZA 2KATA 3L0QA 3QICA 3IMXA 4HOSA 3R6MA 2KCLA 1YXQA 4IZ9A 2C0LA 3U4TA 1ZU2A 2Y4TA 1HKGA 2IVPA 5BRHA 2KCVA 4YDUC 5KQDA 4XEIA 3WQTA 1G99A 5JLFA 2CH6A 2VWBA 3L6QA 4WQ5A 5G04C 1P5QA 3Q5MA 2E2EA 4M7YA 3TGOA 4YVOA 3H3NO 5AZJB 1KAXA 4BR5A 4HOQA 3SJHA 1WAO1 4LC9B 3MK6A 4H5WA 4AY6A 5G05C 4BRGA 3ZN3A 2IVOA 2FLOA 2QXLA 3D7EO 1BA1A 1ZBSA 4PL7A 1OKJA 3O1BA 2F9TA 2FXUA 4ISGA 3OXLA 1U2VB 1OUVA 4JD2B 2A6AA 2VGXA 5BRDA 3K9IA 3S7JA 1NWKA 2J4RA 3EZWA 3U8XA 4XH4A 3VGMA 2V7ZA 4AM6A 3LDPA 1HJOA 4DB3A 1QZ6A 4DQ8A 3S41A 4JAXA 2Q36A 4UQYA 3CVPA 4KYOB 2PBDA 4BRMA 3FZMA 3ASFA 4M7XA 4BR0A 3UUXA 3U3WA 5G04J 3JYSA 4BG8A 2AA4A 3C7NA 3H1VX 1DEJA 4YVQC 4EAHD 4A2AA 5JLHA 3WUHA 4I6MB 3VGKA 2FI7A 1HZ4A 3CKBA 5D0QD 3H46O 4MLEA 4QS9A 3ID8A 5AQIA 1GLJO 3ZX0A 3FWVA 3MV2B 5FJYA 4BC3A 4B1UB 3UKUB 1KLXA 2P9LB 3ATVA 3BF3A 2E1ZA 3J8AA 4KBQA 4GY2B 4K41A 1U6ZA 3AAQA 5A6CA 4MLHA 4RG9A 1JCGA 1GLDG 3UB5A 3DXKB 2P9SB 5LCWJ 2JLBA 5AFUH 2ITMA 1T44A 5ADXA 3VF2A 4CZLA 5AZJA 4CGVA 4H0OA 3DJCA 2P9IB 4U0SA 4G1TA 3LM9A 4XI9A 5BW8C 4PKIA 1QQMA 3SMSA 3IFRA 2FBNA 3VOVA 4WNDA 4A2BA 3ZETB 2ZGYA 3UKRB 5FPDA 3JXUA 3G25A 1YA0A 4BVPA 1QZ2A 4BTBA 2C0MA 4CBUA 4BRLA 5CE3A 4M63C 2C2LA 1C0GA 2CGKA 1QQNA 5FT9A 4FPAA 2W41A 5E84A 5LY3A 1NGFA 3H6EA 3MCPA 5BRFA 4CDRA 4BRPA 3CJBA 3LDLA 1GLEG 1NMDA 2CGJA 5AQHA 4FSVA 3E4BA 5AZIB 3WXXA 3FZHA 4BRIA 4JHRA 4H0XB 3RSEB 3GL1A 5BN8A 1X3MA 3Q49B 1MWMA 3O6WA 3R9AB 4GYYA 3RKVA 1T6DA 4MO5A 4WUYA 1BDGA 2A40A 3Q47B 5KJNA 3CI5A 3W3DA 1WUAA 3EN9A 4AM7A 2YHWA 4BROA 4FWRA 1NGEA 3CVQA 4QS8A 2HOEA 2ASMA 2E88A 3D2FA 4EHUA 3ZHEB 2P9PA 2ZWHA 3CETA 2E20A 1E96B 3VESA 1S22A 1BUPA 5EY4A 2P9KB 2F9WA 2XGMA 3DXKA 5C1DA 2P9SA 4H0VB 4AIFA 4KBOA 4BC5A 5EX5A 2AP1A 2UYTA 5AQLA 2BUPA 2D1KA 4O8KA 2WPVA 3VEVA 3ZPJA 4BRFA 3GZ1A 4IJAA 1JCEA 2UWJG 3GG4A 3MKRA 2E2NA 3QKYA 2YJEA 4FL9A 4FOEA 3RIBA 3VERA 4GA0A 2DPNA 3CV0A 2D0PA 4LEUA 1NA3A 5KJLA 2CGLA 2P9NB 4FWLA 3UKRA 3ZETA 3Q4AB 1HH8A 2I7PA 3HTVA 3FZFA 2W40A 5AQVA 4BR4A 5FTPA 4F9OA 4Y0WA 3KHYA 1P8ZA 2YI1A 5BREA 4U04A 1KT1A 3ASHA 3AS4A 3GOIA 3R9PA 3VTXA 1ATNA 2FEZA 5BPMA 2Q2RA 3O5BA 4HWIA 3DAWA 4FWMA 4J8EA 1Z6RA 3H45C 3ENOA 3I8BA 3IDHA 3EKUA 4FWOA 4ISFA 3QWWA 3SF4A 5FZRA 4JHDB 2VYIA 1TUUA 2GELA 3CJ9A 3CJAA 5AQFA 4JN4A 1RDWX 1TYQA 4GPKA 3FZKA 1NGCA 5FZSA 2D0OA 3BF1A 3DWLA 3P4IA 1TJCA 3VF6A 5BN9A 3QOUA 1SZ2A 2A5XA 1DGKN 3TU5A 4J8FA 3WXLA 4AY5A 1IG8A 4L3QA 4DCHA 1KAYA 3I33A 3HI0A 3UE5A 4G24A 3IUCA 2QWQA 2FSNA 2EWSA 3UQ3A 4B1YB 3TPQA 4E1JA 3LY9A 2ZF5O 2IFUA 3FR0A 5LCWC 1NZNA 2P9KA 3WEEA 4HORA 4B94A 3M6GA 5AQYA 2FF3B 2GUPA 3OXGA 4BT8A 3HM8A 3MDQA 5AQRA 4BGAA 3OXFA 3AY9A 2XEVA 3AS8A 1ATRA 3A5NC 5TKYA 4HOUA 5KJKA 2H3GX 1ZXOA 5JJ7A 4CZEA 1GLFO 2QWLA 5AQUA 2P9UB 4YDUA 4UI9K 3IEGA 2P9NA 1HX1A 3ULEA 2VSNA 3O48A 5FPEA 3HBTA 2GWKA 4KXKB 4B9QA 3AS5A 3VTYA 3BEXA 4FWQA 4YNDA 3QMLA 3S7BA 3CHWA 2A41A 4JNEA 3MN6A 5AQXA 4PKGA 1SQKA 4BQZA 3GDQA 3KZBA 3CJ7A 5A7DB 2R5SA 4IXCA 4ABNA 4EQFA 5JMVA 4EFHA 4FWKA 5CCMA 1T6CA 3LY7A 5KPTA 5LJWA 4JHDA 5D0OD 2E2PA 2XGSA 2AVPA 3LDQA 4CD3A 4FWPA 1XNFA 4UQXA 3A5LC 2WUSA 4GCOA 1R59O 3VEOA 2LSUA 5CHEE 3N71A 4H0YB 4GNIA 5BR9A 3FLCO 5AFUA 2D4WA 1QQOA 5AR0A 3SMPA 4BR2A 2GW1A 5FZQA 3PE3A 4BRHA 4CZHA 2V5FA 4HOTA 4K42A 1Y64A 1IJJA 1ATSA 4AM9A 1KAZA 5ELZA 4BRKA 5KPZA 2VGYA 3CVLA 4UI9J 4N3AA 3LDOA 3ULQA 2XCBA 3Q15A 1IHGA 2LSVA 1V4TA 1K8KB 1U2VA 2ASOA 4A61A 4G2VA 4JD2A 5BT1A 3DXMB 4MO4A 4I9EA 5F0XA 4Y6WA 3AAPA 3VGLA 5DIZA 1V4SA 4BC2A 3QWVA 3R8EA 1MDUB 2FO7A 3S7FA 3RJVA 5I9EB 3PE4A 3WXKA 1NBWA 3ZX3A 1GLAG 2MHKA 1HPMA 2WQHA 1SAZA 3ZGQA 4BR7A 4U07A 4O6FA 4F3VA 2PAVA 2Q31A 2NZTA 5KQ8A 3B8AX 4IWVA 4EIAA 4I6MA 1WM5A 2A42A 3ZX2A 2OANA 1D4XA 4BRQA 4O5FA 5AQOA 1MA9B 2HYZA 4H03B 1DKGD 4XH1A 3UKUA 2P9LA 3CKCA 4I2WA 2KCKA 5AQGA 5LJVA 3CVNA 2E1YA 2PZIA 4U0ZA 4IO8A 2HR2A 5CCLA 2GTDA 2YHYA 5AQSA 5AQQA 3HYMB 3U9DA 3GW4A 2P9IA 2I6HA 3L4IA 2GWJA 5KJMA 2A3ZA 2E2QA 4H0TB 3VETA 4GZ5A 4WNFA 5EX3A 4FO0A 4GZ3A 3CJ1A 2Q7FA 2Q1NA 4G25A 1TUYA 2HF3A 4JL0A 2Y4UA 1NA0A 1BO5O 3O1WA 5AQNA 2ASPA 4WQ5C 4FWNA 2UY1B 2VGXB 5FPMA 4CBXA 3SZ7A 1BG3A 1W3BA 1QZ5A 2LNIA 3A8YA 5AQKA 3QWPA 4BT9A 3TAXA 1PC2A 5HQ8A 4CJ7A 4GZ6A 3ZFWA 2QW9A 5AZIA 4N39A 4I2ZA 3QDNA 4J8DA 3KVGA 3CK9A 1H1VA 3MN9A 2XCCA 1YVNA 4N3CA 1GLBG 1LCUA 1HKBA 5AQMA 3RSEA 3CQXA 5EX0A 1ZBPA 3FZLA 3TG4A 1BU6O 3NF1A 1HLUA 2VQ2A 3SK3A 3C7NB 4GYWA 3KAEA 4FPBA 5AQWA 5DBKA 4K43A 5F2RA 5JJTA 2FF4A 3LDNA 4XIFA 2QWNA 4PL8A 4H5RA 4DHYA 4IN3B 4RG6A 4CGWA 1KXPA 3A0IX 5AQPA 4NQ0A 5BPLA 3D2EB 3ESKA 3ZHEA 3CJCA 3ASDA 5HI7A 3UPVA 1X9JA 1ZC6A 3LL3A 5EKQD 1NM1A 2E8AA 1BOTO 4JA9A 1EQYA 1NGDA 2QWMA 1ELRA 1C0FA 3ZEUB 2KHOA 2I7NA 2QM1A 3U9ZA 2XPIA 3CK8A 4N2SA 3PDNA 2YJFA 4WQ4C 4BRDA 3QBWA 2V51B 1HKCA 2VCPA 3LKUA 5AYWD 4FOIA 2XGOA 3URZA 4ME2A 2Q0RA 2E2OA 2IVNA 4RCHA 3C0BA 4UI9C 4RTFD 3BP8A 4BC4A 2QWPA 1LOTB 4I17A 4FWSA 3BUZB 1MWKA 2UY1A 2V52B 2NC9A 4H5VA 1Z05A 4NO7A 3A5MC 4B1WB 2YHXA 4W9RA 3MA5A 4BVOA 1RGIA 3KS2A 3HSCA 4WNGA 4B1ZA 3EDTB 4BREA 3JS6A 3O08A 3VEXA 2QWOA 3FFLA 3RO2A 1YAGA 2BTFA 4A1SA 4BR9A 1QQEA 3VEYA 2FSJA 1HXIA 1NGIA 1FCHA 4B1XB 5EXWA 3W0LA 4CZIA 1A17A 4WQ4A 1B89A 2BUGA 5G05J 3D2FB 4WNEA 3F9MA 1NGJA 2P9PB 4XI0A 5EOYA 1Y8MA 2FSKA 3TG5A 3D2EA 3CIPA 4GYOA 3VPZA 4CI6A 5ADXH 4K25A 4BWRA 3LY8A 1CZAN 1WOQA 3LCAA 3MN5A 4CZKA 5BPNA 4APOA 1IYGA 3AARA 4B1VA 2P58C 3FFKB 3ZEUA 2HF4A 2NRHA 3QFUA 5F1XA 3CK7A 5JICA 1BA0A 5AQJA 1ESVA 3GBTA 3GE1A 2QFCA 1J6ZA 3VEWA 2Q97A 4H7XA 4XH5A 3QFPA 4BRNA 2IF4A 2PQRA 4N5CA 1X3NA 2ZGZA 3WXIA 2P9UA 3H1QA 3QB0A 2PQNA 2YCHA 4Z94A 2KC7A 3WQUA 3M1FA 2NLXA 4G23A 3MEKA 2CH5A 5JJ6A 3MMVA 3O80A 2Q0UA 3QBXA 4G26A 3EO3A 2OOEA 1XUPO 4CZMA 4H7YA 1NGHA 4N3BA 1QHAA 2PL2A 4NRHB 4BTAA 3FGUA 4BGBA 4CZGA 1RFQA 4A62A 4I9CA 3M3ZA 1KT0A 3MV3B 2J9QA 4C23A 2VSYA 4CBWA 3VEZA 3EL2A 3O8MA 2ONDA 2IIRA 2YHCA 4GCNA 1BWFO 1TYQB 1XQSC 4EHTA 5FPNA 4UQZA 3RU0A 3U4LA 5EVZA 2L6JA 1NGAA 3FE1A 3KD7A 3SLCA 2FF6A 2QWRA 3EKSA 4BRAA 3RO3A 3O4WA 5E26A 4BG9A 1Q18A 3S7DA 4HTLA 3HZ6A 4N2QA 4Y6CA 4CZJA 1E4GT 4QS7A 2V7YA 4PKHA 4H5NA 3ENHA 3A5OC 3FP3A 3CERA 1K8KA 1S3XA 4BQLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KSLA 5ENSD 3UXGA 2RE2A 3LYAA 3DXMA 2P9PG 3ABME 3MN7A 1WB9A 4JI7K 1H6KA 5GADP 4IJNA 5M1KA 4UWGA 2UUCK 3CCSN 3FUIA 2UXDK 3CHRA 3VENA 4OKKA 4ZHRA 5BNWA 3U6FA 5A23A 3V1RA 5AQZA 3DSSA 3OHRA 4TXQA 3L17A 1D8DA 3HP6A 1YJNN 4U0UA 4ILHB 4H5TA 1J5EK 4KHWA 1BLXB 4KHSA 3H08A 4A3VA 2J4BA 3CQGB 1GLLO 4HS2A 2VYPA 4CD1A 3BDPA 2ZU6B 3CFOA 1S1VA 1GW6A 1NLVA 1S0PA 1Q81O 3ZT1A 2B6CA 4CZFA 1HUXA 4FZZA 3TSUA 3IMXA 3T19A 2L0IA 2KCLA 3CGHA 5C12A 4OPKA 4DQRA 2Y4TA 3WXMB 3QNOA 4J8SA 2IVPA 1G99A 3BZKA 2AJQA 3CQ8A 1P5QA 3LP3A 4M7YA 4YVOA 4JB8P 3H3NO 4CDNA 3RMDA 1VSKA 1TNZA 4CGGA 3KK3A 1Z3XA 3ZIMA 1HU3A 2IVOA 2I2OA 2FLOA 1QSYA 3D7EO 1BA1A 2DZOA 1BI4B 2IC3A 3CPEA 3I5PA 4FCYA 1U45A 3JCKC 1LWFA 2A6AA 5BRDA 3CCEN 3S7JA 2J4RA 3EZWA 3OYHA 4EECA 1HJOA 2O8EA 3CQCB 2ETBA 4DSIA 1OT8A 2ATQA 3T69A 3CVPA 3AG2E 3W9GA 3RMBA 4B9VA 4FJIA 3FZMA 3QETA 1VQ8N 3ML8A 4GMJA 2OPPA 3UUXA 4IG3A 4CJWA 5G04J 2AA4A 3NCIA 4DFMA 3DSWA 5CEAA 3DEPA 5AJDA 5D0QD 2WONA 4QS9A 1UG3A 4KRFA 1MJ0A 4H8KA 4BC3A 4B1UB 3UKUB 3CD6N 2E1ZA 3J8AA 4KBQA 1MZCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4QS7 A;  2V7Y A;  4PKH A;  4H5N A;  3ENH A;  3A5O C;  3FP3 A;  3CER A;  1K8K A;  1S3X A;  4BQL A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3KSL A;  5ENS D;  3UXG A;  2RE2 A;  3LYA A;  3DXM A;  2P9P G;  3ABM E;  3MN7 A;  1WB9 A;  4JI7 K;  1H6K A;  5GAD P;  4IJN A;  5M1K A;  4UWG A;  2UUC K;  3CCS N;  3FUI A;  2UXD K;  3CHR A;  3VEN A;  4OKK A;  4ZHR A;  5BNW A;  3U6F A;  5A23 A;  3V1R A;  5AQZ A;  3DSS A;  3OHR A;  4TXQ A;  3L17 A;  1D8D A;  3HP6 A;  1YJN N;  4U0U A;  4ILH B;  4H5T A;  1J5E K;  4KHW A;  1BLX B;  4KHS A;  3H08 A;  4A3V A;  2J4B A;  3CQG B;  1GLL O;  4HS2 A;  2VYP A;  4CD1 A;  3BDP A;  2ZU6 B;  3CFO A;  1S1V A;  1GW6 A;  1NLV A;  1S0P A;  1Q81 O;  3ZT1 A;  2B6C A;  4CZF A;  1HUX A;  4FZZ A;  3TSU A;  3IMX A;  3T19 A;  2L0I A;  2KCL A;  3CGH A;  5C12 A;  4OPK A;  4DQR A;  2Y4T A;  3WXM B;  3QNO A;  4J8S A;  2IVP A;  1G99 A;  3BZK A;  2AJQ A;  3CQ8 A;  1P5Q A;  3LP3 A;  4M7Y A;  4YVO A;  4JB8 P;  3H3N O;  4CDN A;  3RMD A;  1VSK A;  1TNZ A;  4CGG A;  3KK3 A;  1Z3X A;  3ZIM A;  1HU3 A;  2IVO A;  2I2O A;  2FLO A;  1QSY A;  3D7E O;  1BA1 A;  2DZO A;  1BI4 B;  2IC3 A;  3CPE A;  3I5P A;  4FCY A;  1U45 A;  3JCK C;  1LWF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2RE2 A;  3LYA A;  3DXM A;  3MN7 A;  1H6K A;  5GAD P;  4IJN A;  5M1K A;  4UWG A;  3CCS N;  3FUI A;  3CHR A;  3VEN A;  5BNW A;  5A23 A;  5AQZ A;  3OHR A;  3L17 A;  1YJN N;  4U0U A;  4ILH B;  4H5T A;  4A3V A;  2J4B A;  3CQG B;  1GLL O;  4HS2 A;  2VYP A;  4CD1 A;  2ZU6 B;  1GW6 A;  1NLV A;  1S0P A;  1Q81 O;  4CZF A;  1HUX A;  3TSU A;  3IMX A;  2L0I A;  2KCL A;  3CGH A;  5C12 A;  2Y4T A;  3WXM B;  4J8S A;  2IVP A;  1G99 A;  1P5Q A;  4M7Y A;  4YVO A;  3H3N O;  4CDN A;  1Z3X A;  3ZIM A;  1HU3 A;  2IVO A;  2I2O A;  2FLO A;  3D7E O;  1BA1 A;  3CPE A;  3I5P A;  3JCK C;  2A6A A;  5BRD A;  3CCE N;  3S7J A;  2J4R A;  3EZW A;  4EEC A;  1HJO A;  3CQC B;  3T69 A;  3CVP A;  3FZM A;  1VQ8 N;  3ML8 A;  4GMJ A;  3UUX A;  5G04 J;  2AA4 A;  5AJD A;  5D0Q D;  4QS9 A;  1UG3 A;  4BC3 A;  4B1U B;  3UKU B;  3CD6 N;  2E1Z A;  3J8A A;  4KBQ A;  3C98 A;  1JCG A;  1GLD G;  3DXK B;  2P9S B;  5AFU H;  4U8H A;  3ZXS A;  2ITM A;  1T44 A;  3VF2 A;  4CZL A;  3PRE A;  3LM9 A;  4GV3 A;  3CMA N;  2FBN A;  2ZGY A;  5FPD A;  3NQP A; 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