The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
207
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sequence length |
647
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structure length |
572
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Chain Sequence |
MVLETLKQGLDSSQIHEALIQLDSYPREPVDLDASMVLIKFVIPVYPSLPERSKVILRRLASKSFTFLCQIVTFSRTIGLQEIRIYQEILEDIISFEPGCLTFYLKASTTSKADRDSIKALFFGSKLFNVLANRIDMAKYLGYLRLQWKFLLESNETDPPGFLGEWLVSSFLLNPVLAADMLLGELFLLKESYFFSFQKIISASSLIDQKRLIAKFLLPYIQVIVTLENLNDVRKILRRFDLDKIISLSVLFEIQSLPLKEVIVRLMSNHSSTKFVSALVSKFADFTDEEVDTKTCELLVLFAVHNLNHSQREEIAHDERFLNGVTKHLGSNEREARERAMFIAKLLSGGHLKYESDFKINIPNVKSDDKIIDFQSLKREIVKRIVFLKDLMKEYEKSRKAPLIPLLKQTVKLIRQKAFQLEVGYYAQGILSSIVCLNNEFDEPLFEQWRINALTSILVVLPEKVNGAINILFNSELSLQQRMSLLSALGLSARELRGLDTQNRFRKYAGLFFYPLAHGWLNGIQLFKSHYLTTLRIIYSCANPVHDFESMTELMNHIISSAIEEGISLNKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Tel2 structure and function in the Hsp90-dependent maturation of mTOR and ATR complexes.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Telomere length regulation protein TEL2
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| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
207
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| structure length |
572
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| sequence length |
647
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF10193 | Telomere_reg-2 | Telomere length regulation protein |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3O4Z A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5AJL A; 5JJ7 A; 4APF A; 5T4Y A; 5FIN A; 3RIB A; 2F8X K; 2XEV A; 2R17 C; 2IF4 A; 5AQ9 A; 1H2V C; 3UPV A; 3ZN3 A; 3AG1 E; 3FEY A; 4JZY A; 4YVO A; 2GGF A; 4EZK A; 1UJK A; 5ANR A; 1N95 A; 4U8V D; 1OXJ A; 4Y6C A; 4XIF A; 3UIN C; 2OOE A; 4DI3 A; 4K03 A; 3UMV A; 4LER A; 2YQ8 A; 4U63 A; 4LNU D; 3L08 A; 5FZS A; 4GML A; 3OXL A; 2QZA A; 4ACK A; 3Q47 B; 2HE0 A; 4WNG A; 3FFL A; 1DNP A; 3Q49 B; 1TNZ A; 3TWQ A; 3G2W A; 1Y8M A; 3CQG B; 2PM7 A; 3FUK A; 2HYZ A; 3T8M A; 5AAR A; 4UI9 K; 4XX5 A; 3Q7A A; 1TJC A; 4JEH A; 4F53 A; 2DWZ A; 4DX5 D; 4U0U A; 2J9Q A; 5A7D B; 4NUR A; 3Q4A B; 1BPO A; 3R9A B; 3KSQ A; 1OT8 A; 4Y6W A; 1INZ A; 4WND A; 1HH8 A; 5AAO A; 5AN8 A; 3NOG D; 1E7U A; 3QNK A; 4I6E A; 2VJ8 A; 3EHR A; 3RJV A; 5B1A E; 4ACL A; 4I1A A; 4HOU A; 4A1G A; 2I2O A; 4AOF A; 5J90 A; 3ZPJ A; 2J09 A; 4U07 A; 4BTB A; 1H0A A; 3RRU A; 2PQN A; 4MBG A; 4O60 A; 5G04 J; 1OWN A; 3CVL A; 2R05 A; 1N0R A; 3CVX A; 1EYH A; 5E76 A; 1WM5 A; 2BKK B; 2QYU A; 2NXP A; 3K9I A; 4N3C A; 4PS8 A; 1N54 A; 4HVB A; 4L23 A; 2WXR A; 5JHB A; 2VGX A; 1UN9 A; 1H6K A; 5EIB E; 1K1A A; 4Q69 A; 2OCC E; 4CEM A; 2GW1 A; 5J08 A; 4J8E A; 2H6H A; 4N39 A; 5BXO A; 3ASN E; 4DI4 A; 5EIL A; 2WXH A; 2V5F A; 5T3R A; 2HO1 A; 3SD5 A; 2Y1L E; 2DZN A; 2VSN A; 2KAT A; 5CRV A; 1HFA A; 5EX3 A; 2XHE A; 4C0E A; 1P5Q A; 3MKQ A; 3LCA A; 5AYW D; 5A23 A; 3EJN A; 3D9K A; 1IXV A; 3NF1 A; 1D9S A; 3DSS A; 3EHQ A; 1YYH A; 2GRN B; 4TXR A; 4AXH A; 4GZD A; 4GZ5 A; 4WAF A; 3ZU7 B; 4EBA G; 1TN8 A; 2XPI A; 4WNF A; 3EU9 A; 3I3N A; 1OUV A; 2XEN A; 4G2V A; 4EPZ A; 2AXZ A; 2CHW A; 4CGW A; 5AJD A; 1E8Z A; 2F37 A; 4LNG A; 4IN3 B; 3ESL A; 4B93 B; 3QAQ A; 3CK8 A; 4TRQ A; 2E0I A; 3CR3 A; 4MRU A; 5ANL A; 2P9N G; 3PZ1 A; 3Q9U C; 4KYO B; 1N4S A; 4TUU A; 3D9N A; 5G2N A; 3KEA A; 4HB5 A; 5EYP F; 4CDM A; 2WMN A; 1ZU2 A; 3J5Q B; 2LXM A; 2NSZ A; 3R9M A; 4ATZ D; 2WXN A; 5G04 C; 4HQD A; 1KZP A; 2X6K A; 3G2U A; 3QKY A; 3FUM A; 5ENN A; 2IO3 C; 5FZQ A; 5ENQ D; 1IKN D; 1OCZ E; 2ZIS A; 4OAV B; 2WQ7 A; 1Z5S C; 3U9W A; 3UIO C; 1FT2 A; 4LSZ E; 3D9J A; 4B89 A; 4GZ6 A; 1A5E A; 2P2C P; 2DVW A; 4URK A; 1SZ9 A; 4H7X A; 3Q5M A; 5G05 C; 4DX7 D; 4FJZ A; 4APO A; 4HI9 A; 4GTQ A; 3OXF A; 4U96 D; 2I9C A; 2OVF A; 3LVQ E; 4BWR A; 4FHJ A; 2P58 C; 1S64 A; 3TAX A; 3TWS A; 2IY0 C; 5ENO D; 3RSE G; 3VLD A; 1YCS B; 3IV0 A; 2VQ2 A; 4FP7 A; 2RD0 A; 2LXL A; 3JYS A; 4FU3 A; 2VSY A; 5AQB A; 2XZD G; 1KPS B; 1OWL A; 4DRX E; 1TNB A; 3E34 A; 4BTA A; 4ILH B; 3BEE A; 5KJN A; 3PUJ A; 2GRL A; 4B0Z A; 3FTY A; 2IEJ A; 3MGB A; 4I1O B; 2EIK E; 1TN7 A; 4HXI A; 3AS8 A; 4U0S A; 3FUE A; 4DUI A; 1UN8 A; 3S7F A; 1X5B A; 3L54 A; 3UM3 A; 2ZGD A; 4JHR A; 4ANV A; 1N4P A; 3PNL B; 4L1B A; 5LX8 A; 1E90 A; 1O1R A; 4O1O A; 1HU3 A; 3L13 A; 4BY6 A; 4JA9 A; 3TXN A; 3QAR A; 2BTD A; 4DJA A; 5KJM A; 3D9H A; 3NAW A; 4EZL A; 1RW2 A; 3CHS A; 3AG4 E; 4HOR A; 3DWL G; 4WWN A; 3ABM E; 3UKR G; 3ASD A; 4KZ0 A; 1FPP A; 1PY1 A; 4BSZ B; 4F7A A; 4C0M A; 4C9B B; 4YDE A; 5BW8 C; 1MYO A; 3DSW A; 3FHE A; 2KCV A; 3R7Q A; 4J8S A; 2XRY A; 1GW6 A; 2X6I A; 4CCA A; 2Y69 E; 4OVV A; 5A6C A; 1YMP A; 1V55 E; 5EYL A; 2P9U G; 1KT0 A; 3LXU X; 3AS5 A; 2XPY A; 4Q96 A; 4EZJ A; 4FHK A; 4AJW A; 5HS0 A; 3LY9 A; 3FTX A; 4BX8 A; 3UT4 A; 1WAO 1; 3S7J A; 2P9I G; 2MOW A; 1JPL A; 4EEC A; 1HF8 A; 3UM1 A; 2LNI A; 3LYA A; 1SQM A; 2UY1 B; 4HS2 A; 3MV3 B; 4CDN A; 1IQU A; 3ZEF A; 2RKK A; 1LD8 A; 5BUZ A; 3RKV A; 2FO1 E; 3SQV A; 4GMR A; 2RFM A; 3VLE A; 4PS3 A; 4CT4 A; 5FIO A; 1XNF A; 5CMY A; 2WXI A; 4JB8 P; 2CFZ A; 4GCN A; 1SA5 A; 1JWG A; 4U8Y D; 3FTU A; 2WQH A; 4I9E A; 1K1B A; 4JA7 A; 3ZNG A; 4FJY A; 2V5Q C; 3BU8 A; 3UXG A; 5KNH D; 4A1S A; 1UG3 A; 3P2B A; 3PEU B; 3JCK C; 3Q9N C; 2WXM A; 3SF4 A; 4KBQ A; 3D9L A; 4K5C A; 4BEP A; 5C2Y A; 3LPZ A; 3HVE A; 2R59 A; 4ILI A; 3IKO B; 4LEU A; 3HG0 D; 5ENT D; 3FTV A; 2PL2 A; 2KZT A; 4GTP A; 1H6P A; 5D0O D; 4AP2 A; 3FUL A; 3CV0 A; 5BV1 A; 1OCR E; 3FTW A; 5CCL A; 1DC2 A; 4TV3 A; 4WUY A; 4K0R A; 3TL5 A; 3UTM A; 3AU4 A; 4TUM A; 1ELW A; 3ULY A; 2UWJ G; 4CT0 A; 1QQE A; 2RG8 A; 2J07 A; 3ZW3 A; 2Y0B G; 3BQO A; 3ABL E; 2CHX A; 1HZ4 A; 5KJL A; 3PRZ A; 2XCC A; 3HXD A; 3LY7 A; 5BT1 A; 2MYO A; 2V8S E; 2ZXW E; 5CHE E; 4JC8 A; 2WB2 A; 4RLY A; 1N4Q A; 4UI9 C; 3CHO A; 2FI7 A; 3CVN A; 5CRU A; 2GRP B; 4GTO A; 4E85 A; 2L6J A; 3SFY A; 3FEX A; 1MJ0 A; 1JCS A; 4V3I A; 3CHR A; 5HRY A; 2I1J A; 3GZS A; 3TWX A; 1FVF A; 1Q2Z A; 1H6O A; 2DYR E; 3Q78 A; 2ION A; 3APF A; 3CVY A; 3ZYM A; 2I6H A; 2X38 A; 5KBA A; 4H7Y A; 4XI9 A; 2QY7 A; 5CEC B; 2FUL A; 1ELR A; 3FTZ A; 1QYM A; 2GRQ B; 4A63 B; 5LCW C; 2JEK A; 2H6F A; 2MHK A; 3ML8 A; 2B0O E; 3Q79 A; 2EIM E; 3CVV A; 2I1K A; 4G25 A; 3P1U A; 3GZ2 A; 4BET A; 3SGH A; 2X6F A; 1MQS A; 3CHQ A; 3IBE A; 4QFV A; 4AEZ C; 3UM0 A; 5ARG A; 3PNT B; 4O6F A; 4JEU A; 3CLJ A; 4L9P A; 5B1B E; 3JXI A; 4GZC A; 3FH7 A; 1DCE A; 5G05 J; 3L17 A; 3URZ A; 3D9M A; 4OYS A; 1VDY A; 3RO3 A; 2XGS A; 2UY1 A; 4HRM B; 3I5P A; 2ILR A; 4GTR A; 1EPU A; 4J0U A; 3HXE A; 4E6H A; 2VGE A; 4OAU C; 2B6C A; 2WXJ A; 4UWF A; 2A5U A; 3UX4 A; 2XGO A; 2WXL A; 4DLO A; 1KT1 A; 2IFU A; 5BNW A; 3PDN A; 5CCM A; 1UOH A; 1TNU A; 3L16 A; 4CYM D; 2EIJ E; 4R7L A; 3ZKJ A; 1O1S A; 3JQ1 A; 4PUC A; 3KAE A; 1JUQ A; 3LVR E; 3IHY A; 4LRZ A; 4I9C A; 3VTX A; 2XGM A; 4GA0 A; 4CGV A; 4B8C B; 3MCX A; 2WXO A; 3FWV A; 3QDN A; 1NL4 A; 3ABK E; 1Z3Y A; 4YDY A; 3PZ2 A; 1SW6 A; 3HHM A; 3WXX A; 2L6B A; 3OAW A; 3GW4 A; 1FT1 A; 1OWO A; 3DSV A; 3QOU A; 4RSY A; 3ZYK A; 4ATG A; 5FZR A; 5HKP A; 5CER B; 2HM8 A; 3PUK A; 3UM2 A; 1BI7 B; 1N11 A; 4GYY A; 5CBN A; 4GCO A; 1H2T C; 2J8S D; 1JWF A; 3PH0 C; 3CST A; 2PQR A; 4ILG A; 2P9S G; 4J8Y A; 3SZ7 A; 5CEA A; 3UUX A; 2AXU A; 1NA0 A; 3ONL A; 3AJI A; 1WDY A; 3CQC B; 3FUH A; 4FA6 A; 3LDZ A; 4XKC A; 3HVE B; 2BUG A; 4LNB A; 4HNA D; 3EUV A; 2WM9 A; 3RRN B; 1DCQ A; 1B89 A; 3G2V A; 5JJT A; 1N52 A; 3DST A; 4U04 A; 2H6I A; 2KZT B; 3MYV A; 1UW4 B; 4PDX A; 1QBQ A; 1RZ4 A; 4KVO A; 2QYJ A; 4F1S A; 2LSV A; 2R5S A; 2L9B A; 3QWW A; 5D2M C; 3UT7 A; 4YVQ C; 2FO7 A; 3Q7F A; 4EHM A; 3ASF A; 5D66 A; 3TWR A; 3UI2 A; 4NAC A; 2WXG A; 4BT8 A; 4HI8 A; 3DPD A; 5LFA A; 1HO8 A; 2FEZ A; 3G2T A; 5HQ8 A; 2FF4 A; 1AP7 A; 1FCH A; 2KCL A; 4A3V A; 3CVU A; 5CED B; 4HLE A; 3TGO A; 4I2W A; 2IJG X; 4GA2 A; 2AXV A; 2GRO B; 5JMN D; 3I4G A; 1E7V A; 2QFC A; 2XEH A; 3JUI A; 1U2V G; 1KZO A; 3CKB A; 4IRU A; 2C0M A; 3V31 A; 2HR2 A; 4JVS A; 1EDU A; 1OWM A; 1OCC E; 1TR4 A; 4KXK B; 2WXP A; 2GRM A; 3ZXS A; 2X6J A; 3B13 A; 1OY3 D; 1HXI A; 4XKB A; 4EQF A; 3LY8 A; 4DX6 D; 1SA4 A; 3U4T A; 3CVW A; 4G23 A; 3L82 A; 3GYZ A; 1H2U A; 5FQ6 A; 3FUJ A; 5JJ6 A; 3APC A; 3L9T A; 4LG6 A; 4K5B A; 2DZO A; 4JHK A; 2OVB A; 1BD8 A; 5ENS D; 4F1P A; 3T8K A; 1E8W A; 3MKR A; 2WXK A; 3HXB A; 2PNN A; 3W9F A; 4O1P A; 1TNO A; 2LAI A; 3SY2 A; 4HOQ A; 3C3O A; 4Q94 A; 2LO6 A; 4UWL A; 1FVH A; 4B8A A; 3IXE A; 4FLB A; 2AJA A; 3DRA A; 4DX1 A; 4CRW A; 2WPV A; 5LP0 A; 4RG6 A; 4JW1 A; 2XQ0 A; 3C5R A; 5FQ7 A; 2L0T B; 3QWP A; 3FDH A; 3ZHE A; 1WY6 A; 1NI1 A; 3B95 A; 4PH4 B; 4DK5 A; 5DBK A; 3S7D A; 5EKQ D; 2VTB A; 3PE3 A; 5EID A; 4G1T A; 3FP3 A; 3LS8 A; 5JA4 D; 4EBA A; 1V54 E; 3MZL B; 3SO8 A; 4GPM A; 4I17 A; 4G11 A; 4A55 A; 3U64 A; 3E37 A; 1N9A A; 2L0I A; 3UT8 A; 3C3Q A; 3SFX A; 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