The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
43
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sequence length |
143
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structure length |
136
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Chain Sequence |
ARFRKVDVGEYDENKFVDEAGPDEGEVDSCLRQGNMTAALQAALKNPPINTKSQAVKDRAGSIVLKVLISFKANDIEKAVQSLDKNGVDLLMKYIYKGFESPSDNSSAVLLQWHEKALAAGGVGSIVRVLTARKTV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural characterization and computer-aided optimization of a small-molecule inhibitor of the Arp2/3 complex, a key regulator of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
Actin-related protein 3
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| total genus |
43
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| structure length |
136
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| sequence length |
143
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-11-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| G | PF04699 | P16-Arc | ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc) |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2P9N G; 2P9K G; 3UKU G; 3DWL G; 2P9I G; 3DXK G; 2P9U G; 3RSE G; 3ULE G; 4XEI G; 1U2V G; 2P9S G; 1K8K G; 3UKR G; 4JD2 G; 1TYQ G; 2P9P G; 2P9L G; 3DXM G; #chains in the Genus database with same CATH topology 1U3C A; 3L82 A; 4BT8 A; 5G55 A; 4LNU D; 2P58 C; 2OEV A; 4OAU C; 4TXR A; 1OWP A; 3R7R A; 3U9W A; 2KBX A; 3HRA A; 5G05 C; 3SFX A; 5BV0 A; 3FU5 A; 4GZ5 A; 4J8E A; 4UWF A; 2NYJ A; 2FF4 A; 4O1P A; 2P9L G; 2V0P A; 5KJN A; 4APO A; 3EHQ A; 2KCK A; 3ZEF A; 4ILI A; 2CHZ A; 3TWX A; 3E4B A; 2I6H A; 4DX1 A; 1S63 A; 3UI2 A; 3CK9 A; 3FTV A; 5KWD A; 1ZBP A; 3CHM A; 5EYL A; 4RG9 A; 3JCK C; 3TWT A; 4J7W A; 1D8D A; 2L0T B; 3CVX A; 5D66 A; 4AIF A; 2I1J A; 2GRP B; 3AS5 A; 2KCL A; 1N4S A; 1H6O A; 3S7B A; 4CRW A; 3SNX A; 3LKU A; 4W9R A; 2DZN A; 2WB2 A; 4B93 B; 2PZI A; 4GTS A; 3RRN B; 4HRL A; 4BER A; 4GYO A; 4GU5 A; 3TXM A; 4HOT A; 3NOG D; 5JMN D; 4G8L A; 2GW1 A; 5DIZ A; 3W9F A; 5ENP D; 3UM3 A; 3U66 A; 3FTU A; 3DSV A; 2FO1 E; 5EN5 D; 3W9G A; 4HQD A; 3OXL A; 2PNN A; 1TYQ G; 3FH7 A; 4B0Z A; 3QWP A; 5E75 A; 4YDO A; 1U3D A; 4KVM A; 4HVB A; 3KD7 A; 2YNQ A; 1AWC B; 3CEQ A; 2X6I A; 3CGH A; 3DSX A; 3CVQ A; 5HI7 A; 3FWV A; 3FH8 A; 1QYM A; 3RK6 A; 2XEV A; 3UUX A; 3Q73 A; 4U0U A; 5J90 A; 2WXR A; 4RSY A; 3D9H A; 4ZHB A; 2LAH A; 4B8C B; 4B94 A; 2CHX A; 1O1S A; 4F53 A; 2FBN A; 5LOZ A; 1TNB A; 4WND A; 1BI8 B; 2P9I G; 3CQG B; 2ETB A; 3ZIM A; 3Q47 B; 4HI8 A; 4XX5 A; 4OAV B; 3DSU A; 3CLJ A; 2DCP A; 4GB9 A; 3G2U A; 3JUI A; 3R7Q A; 3LY9 A; 2VGX B; 3E30 A; 4JZY A; 2BED A; 3QB2 A; 4GTV A; 4M7C A; 1OY3 D; 3B7R L; 3ASF A; 5AN8 A; 1PY1 A; 4ACL A; 2NC9 A; 5JA4 D; 5A7D B; 4Z68 A; 4Y6C A; 2CG2 A; 4K5C A; 1G3N B; 3PDN A; 1H2U A; 5J08 A; 1GW6 A; 2LSV A; 4EEC A; 2Q7F A; 4BES A; 4PH4 B; 4J0U A; 4LER A; 2ZIR A; 3FP3 A; 1PC2 A; 5BNW A; 3KAE A; 2ILR A; 2R5S A; 2R2L A; 3JUE A; 4LRZ A; 4GZC A; 4FC8 A; 1FVF A; 3PH0 C; 3FU0 A; 3ABL E; 1OWL A; 2HM8 A; 3ZHE B; 5ENS D; 2R59 A; 1UN9 A; 4AV7 A; 1OWO A; 3ZPJ A; 3C3Q A; 4V3I A; 3QWW A; 1FT2 A; 1HF8 A; 3RSE G; 2EIJ E; 1K8K G; 4ZFH A; 1Y8M A; 4HOQ A; 4GTR A; 3JYS A; 1LD8 A; 4UI9 J; 2ZGG A; 2X38 A; 4NUR A; 3CVW A; 4N39 A; 4C9B B; 4B8A A; 1KT0 A; 2YIN A; 2GRR B; 3OXG A; 1ZU2 A; 4BX9 A; 3DPY A; 1U2V G; 2XZT G; 3MKQ B; 3JQ0 A; 1LTX A; 4GA2 A; 1N54 A; 5LP0 A; 4C48 B; 1HH8 A; 3CQC B; 3IXE A; 4EZK A; 1DC2 A; 2WXK A; 1TNY A; 2CFU A; 3I3N A; 2XQ0 A; 4NAC A; 2OOE A; 1JCQ A; 3EHN A; 3CHR A; 3ESK A; 2DBA A; 4EHM A; 3BEE A; 5CEA A; 1UJK A; 1IHG A; 3VLE A; 4Q96 A; 2IOL A; 3L6A A; 1AP7 A; 3EHM A; 1ELR A; 3IEG A; 2WXP A; 3ZVV A; 3PVL A; 4APF A; 3CVP A; 3KEA A; 5KCM A; 3FH5 A; 1HE8 A; 3QOU A; 3DST A; 1SW6 A; 3ZXP A; 1Z3X A; 2Y4T A; 3GW4 A; 3FTZ A; 3KEZ A; 2DVW A; 1KZO A; 4G26 A; 3ULQ A; 3RIB A; 1OT8 A; 4CZ2 D; 2EQX A; 2LSU A; 4CDR A; 5KJL A; 4CDN A; 4JB8 P; 2J07 A; 3PS6 A; 3Q7F A; 5FZQ A; 3EIQ C; 4ANX A; 5JHB A; 3ZGQ A; 2VYI A; 1S64 A; 1FT1 A; 4JC8 A; 1OCC E; 5KNG A; 3ULY A; 2KXP C; 3VLF A; 1N11 A; 4FP7 A; 1TJC A; 5EX0 A; 3EU5 A; 4AP2 A; 3E32 A; 1IHB A; 1JCS A; 2EIL E; 2WXH A; 5ANL A; 3Q4A B; 3EUV A; 4QQI A; 5FWQ A; 2WQ7 A; 4CDM A; 2J49 A; 3F6Q A; 5AQ9 A; 3AU4 A; 2Y3A A; 4N5C A; 4N2S A; 3I4G A; 4A1G A; 2MOW A; 1UN8 A; 2WXF A; 3FUF A; 2DWZ A; 2ZGD A; 3DSS A; 4ABN A; 4U8H A; 3Q7A A; 1QNF A; 4AXH A; 4AM9 A; 4Q94 A; 2V4H C; 3RKV A; 1E8Y A; 2RG8 A; 3GZ2 A; 4TXQ A; 2RKK A; 2HE0 A; 5CEC B; 4DX2 A; 4KT6 B; 4JXT A; 3UM1 A; 5CCL A; 4GZ3 A; 4XZ4 A; 4GTP A; 3B7U X; 1SQM A; 5EKQ D; 5LFA A; 1Q2Z A; 2XGS A; 4UQZ A; 1O1R A; 1E8X A; 4F3V A; 2MHK A; 2FI7 A; 4HOR A; 4UWK A; 3UTM A; 2VGX A; 4K0R A; 4CGW A; 3DBS A; 3QJZ A; 4RVB A; 2GGF A; 2PQN A; 3OAW A; 5FJY A; 5FIO A; 4XI9 A; 1PAQ A; 1IQU A; 2XGM A; 4GPK A; 1E7U A; 4HLL A; 1RZ4 A; 4WUY A; 1TEZ A; 3LVQ E; 4GAA A; 2WMO A; 2WXO A; 3APD A; 4GZ6 A; 2R17 C; 5CBO A; 4MRU A; 1MX4 A; 4GMJ A; 3OTN A; 5B3S E; 3FTY A; 2WM9 A; 3NBN B; 5EIB E; 1DNP A; 3ML9 A; 2H6H A; 3RRU A; 3AJI A; 5FQ7 A; 3ZRH A; 2HR2 A; 4YDY A; 3MEK A; 3D9I A; 2KC7 A; 1EPU A; 1DVP A; 2VQ2 A; 4DX6 D; 4TXP A; 1QQE A; 1IXV A; 4DI4 A; 5BT1 A; 2PQR A; 3D9N A; 4I1O B; 3RJV A; 3TWV A; 5T3R A; 2L9B A; 3ESL A; 2OCC E; 1E8W A; 5CRU A; 2IY0 C; 5CCM A; 3HVE B; 1JWG A; 1V54 E; 5ARG A; 3NOC D; 3FUJ A; 2F8Y A; 1BD8 A; 4I43 A; 4BT9 A; 4U96 D; 3C72 A; 3L13 A; 3X2Q E; 3AG1 E; 2JAB A; 4EBA G; 2L6B A; 4GTQ A; 3IKO B; 3LDZ A; 2XRY A; 5EDS A; 5JJT A; 4EPZ A; 2X6J A; 4L9P A; 3PE3 A; 4TUU A; 3MKQ A; 3QKY A; 1SA4 A; 3MJW A; 2OVB A; 1Z3Y A; 3L9T A; 4NQ0 A; 5EID A; 2B0O E; 1K3Z D; 3KS2 A; 2DIW A; 2FUL A; 3UQ3 A; 4EBA A; 1TNO A; 5AQ7 A; 5CMW A; 1D8E A; 4DI3 A; 3LYA A; 4KMO A; 4G11 A; 4CGV A; 2C2L A; 1UW4 B; 3PNT B; 4NRH B; 3URZ A; 3JXI A; 1Z5S C; 3C98 A; 3C3O A; 3JQ1 A; 2C0M A; 1S0P A; 2GRM A; 5C1D A; 3ZYQ A; 3ABM E; 3U3W A; 4BET A; 1TNZ A; 3T5V A; 2WXN A; 4UWH A; 4U8V D; 3ZYK A; 3SY2 A; 3L22 A; 4ILG A; 2WPV A; 4U63 A; 4IUL A; 1HO8 A; 4BWR A; 2P9K G; 3UIN C; 4IRU A; 3L08 A; 4FHJ A; 4G23 A; 2OVF A; 4BSZ B; 1N0R A; 5A23 A; 3TG5 A; 3E37 A; 4X8Q A; 2H6F A; 2EIN E; 4F7A A; 4G25 A; 3MKR A; 2IQC A; 1MYO A; 5KJK A; 1OWM A; 1TR4 A; 3D9J A; 2FO7 A; 2KZT A; 4A1S A; 2VTB A; 1O5M A; 2NXP A; 3ZXS A; 3TXN A; 5EIL A; 5JJ6 A; 2R02 A; 5IY5 E; 2LUH A; 3G2V A; 4KVO A; 3V79 K; 4RQI A; 3Q49 B; 4DX5 D; 3LPZ A; 4RG6 A; 2ZU6 B; 3L54 A; 3V2O A; 4MLP A; 3ZU7 B; 1JUQ A; 4WNF A; 4C0E A; 1IKN D; 4JA9 A; 3KSQ A; 5EX3 A; 1SZA A; 2UY1 B; 2XEN A; 4G1T A; 3MZL B; 4XI0 A; 1KPS B; 2QC9 A; 1UOH A; 3VTY A; 2ION A; 4HNA D; 3RO3 A; 3SI5 A; 1V55 E; 3TL5 A; 1H19 A; 3FU6 A; 3I5P A; 2OEW A; 3B13 A; 3Q9N C; 5CBN A; 3T8M A; 3DXM G; 1WG0 A; 4HFG A; 3DRA A; 3D9K A; 2WXI A; 4OVU A; 4U7E B; 4LCT A; 2KCV A; 2GRQ B; 3AS4 A; 4GTO A; 2X6H A; 3ZUV B; 3ISM C; 4UQX A; 2XPI A; 2I2O A; 2XS8 A; 3FEY A; 3ZFW A; 4DUI A; 4A55 A; 3AS8 A; 4BFR A; 4I6G A; 2X6K A; 5CMY A; 1ELK A; 3LEW A; 5AJL A; 2J8S D; 3CHS A; 5AEN A; 1A5E A; 4AOF A; 1TNU A; 4JHR A; 5HRY A; 4HS2 A; 4I17 A; 2I1K A; 3HHM A; 4GYW A; 3PUJ A; 5FTP A; 2YHE A; 3J5P A; 3FDH A; 3GZ1 A; 5AYW D; 1YA0 A; 3RU0 A; 2QY7 A; 5KBA A; 4EZJ A; 4GTT A; 1TN8 A; 1E8Z A; 1H6P A; 4K03 A; 2A4Z A; 4HI9 A; 1YYH A; 3L17 A; 3NQP A; 2J9Q A; 2DZO A; 4K5B A; 3MGB A; 1HZ4 A; 2PL2 A; 3MA5 A; 3ONK A; 4AY6 A; 3UT7 A; 2H6I A; 1NI1 A; 3HXD A; 5HQ8 A; 4FA6 A; 3Q78 A; 2OND A; 2VSO E; 4WWP A; 3PZ4 A; 3FUH A; 4N5Q A; 3IHY A; 3UPV A; 4FU3 A; 1WM5 A; 3QDN A; 3L16 A; 3LJN A; 4UQY A; 3S2A A; 4L7T A; 1MQS A; 4XIF A; 4MKT A; 5BPP A; 3LJ3 A; 1UJJ A; 4J8F A; 1X81 A; 1E96 B; 5FZR A; 4P29 A; 3TGO A; 2F37 A; 3QNK A; 3LVR E; 4XE0 A; 2A5E A; 4GML A; 4LSZ E; 1NA0 A; 3FTX A; 4BY6 A; 4YVQ C; 4E85 A; 3RAU A; 3TJP A; 4UI9 C; 3C5R A; 2L6J A; 2P9P G; 3HDX A; 4CT4 A; 3CHP A; 1N4R A; 5ENR D; 3D9O A; 3ABK E; 1HFA A; 3CVL A; 1D9S A; 2HYZ A; 3UKU G; 1B89 A; 4FHK A; 3Q9U C; 5G04 J; 3FUL A; 2XEE A; 3ZYL A; 4I2Z A; 3I4R B; 3S7D A; 2OV8 A; 5AAR A; 2GRL A; 2WQH A; 3FY4 A; 4JW1 A; 3OXF A; 4L1B A; 1UG3 A; 1S70 B; 4F1P A; 5ENO D; 4YDW A; 4JPS A; 1N9A A; 2BTD A; 5AIJ A; 4PS7 A; 3CST A; 4J6I A; 2QZA A; 3FEX A; 4R7L A; 4HXI A; 2R05 A; 3N71 A; 3VTX A; 3ASG A; 1EF1 C; 1YMP A; 1N0Q A; 1DCE A; 3FHE A; 4JHJ A; 4HRM B; 1IYG A; 3EDT B; 4UI9 K; 1JPL A; 3R9A B; 2NSZ A; 1BU9 A; 3UM0 A; 3B7S A; 3SBS A; 2XPY A; 3J5Q B; 2LAI A; 2AJA A; 3O4Z A; 4HLE A; 3DSW A; 3UX4 A; 4K5A B; 3LY7 A; 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