The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
161
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structure length |
161
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Chain Sequence |
MYKVPKGLEHYQKMFQKEVTVNDLKKYLIGSDKEYRITRRDSYMGDISDPEVILEYGVYPAFIKGYTQLKANIEEALLEMSNSGQALDIYQAVQTLNAENMLLNYYESLPFYLNRQSILANITKALKDAHIREAMAHYKLGEFAHYQDTMLDMVERTIETF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High-resolution crystal structure of Streptococcus pyogenes beta-NAD(+) glycohydrolase in complex with its endogenous inhibitor IFS reveals a highly water-rich interface
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Nicotine adenine dinucleotide glycohydrolase
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| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
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| source organism |
Streptococcus pyogenes
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| total genus |
56
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| structure length |
161
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| sequence length |
161
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-05-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF16718 | IFS | Immunity factor for SPN |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3PNT B; 4KT6 B; 3QB2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3U4T A; 3I5P A; 4ILH B; 5BPP A; 2YQ8 A; 3J5Q B; 2XQ0 A; 4U7E B; 1JWF A; 3CVL A; 2B6C A; 5FTP A; 3FUK A; 5EX3 A; 4FLB A; 3W9G A; 4R7L A; 3CVP A; 3AG3 E; 4HOU A; 2IU1 A; 5IY5 E; 3ZYQ A; 5FWQ A; 4CRW A; 3CGH A; 3HRA A; 5M72 A; 1YMP A; 4FJZ A; 3ZPJ A; 4GB9 A; 4IYP A; 2WM9 A; 3VLD A; 4JEH A; 2OCC E; 5E76 A; 1B89 A; 1ELR A; 3MEK A; 3O48 A; 5FQ6 A; 3QWP A; 1N0Q A; 4BEP A; 3D9P A; 2DCP A; 5HKP A; 4GAA A; 3UM3 A; 2L9B A; 1GW6 A; 4KVO A; 3D9N A; 1H6K A; 5G04 J; 3MKQ A; 3Q9N C; 3DSV A; 1RW2 A; 3FTZ A; 2J09 A; 3LCA A; 3TXN A; 3FU0 A; 5ANL A; 3CHO A; 3LEW A; 2AVP A; 4LNU D; 1E7U A; 3TAX A; 2QY7 A; 4HI9 A; 1OWL A; 3ABL E; 4G26 A; 5KCM A; 4A1G A; 2I6H A; 3GZS A; 3CVX A; 4BY6 A; 3TG4 A; 1BI7 B; 1KPS B; 4FP7 A; 1IHB A; 1UOH A; 4N39 A; 1MX2 A; 4DI3 A; 5B1B E; 2MOW A; 3C3Q A; 3U3W A; 4GTM A; 2CHW A; 4FAD A; 3FUH A; 3RO2 A; 4U8Y D; 4HS2 A; 3B7B A; 5CRU A; 3DWL G; 4Y6W A; 3ZGQ A; 4DLQ A; 3MZL B; 3V31 A; 3SF4 A; 2RFM A; 3D9M A; 3PS6 A; 2X6I A; 4GTQ A; 3P1U A; 5ARG A; 3SQV A; 2V4L A; 1K3Z D; 5KNH D; 1DNP A; 1WDY A; 3JXI A; 3OXG A; 4HOS A; 3MV2 B; 1TNB A; 4QQI A; 3UI2 A; 4AVX A; 2ILR A; 2VGX A; 3EHM A; 4L9P A; 3E37 A; 5AYW D; 4AV7 A; 2DYR E; 3Q79 A; 3RK6 A; 3KSQ A; 3ZKJ A; 3D9H A; 3AU4 A; 5D0O D; 4UWG A; 3LY9 A; 1HH8 A; 1OT8 A; 1OCO E; 5ENN A; 4EZK A; 4PS7 A; 4ANX A; 4HXI A; 4DK5 A; 2AXU A; 4J7W A; 5EDS A; 3UIN C; 3D9L A; 4BTA A; 4TUM A; 3TG5 A; 4QFV A; 4RG6 A; 2LXL A; 1ZU2 A; 1BU9 A; 3PZD A; 1N11 A; 2WPV A; 1RZ4 A; 3KAE A; 2YHC A; 3OXL A; 4PS3 A; 3SHF A; 1O5M A; 4LEU A; 3S2A A; 5HQ8 A; 2A5U A; 3CQC B; 3EHQ A; 3LJN A; 1S64 A; 3EIJ A; 4JL0 A; 4GTP A; 3D9K A; 1L5J A; 2P9U G; 4I1O B; 2XZT G; 3HIZ A; 2IQC A; 5JHB A; 4HB5 A; 3Q4A B; 2WQH A; 2QZA A; 3FH5 A; 3DPY A; 5CMY A; 2WXQ A; 1MQS A; 1OUV A; 2CG2 A; 3QOU A; 4U0U A; 4F1S A; 5G55 A; 5A7D B; 1V55 E; 2ZIS A; 3GZ1 A; 2XEN A; 2JAB A; 4AJW A; 4URK A; 2DVW A; 3FDH A; 1E8Y A; 2PM7 A; 4WAF A; 1E96 B; 3MJW A; 4UWF A; 2HM8 A; 4I1M A; 3ZRH A; 1DCE A; 4GZ5 A; 2I1J A; 1HU3 A; 2QYU A; 3AS8 A; 4APF A; 5BT1 A; 3JQ0 A; 2J4B A; 3AS5 A; 3C5R A; 1HFA A; 2IO3 C; 3FU6 A; 4I6J A; 1TNO A; 3FU3 A; 3T5V A; 4YVO A; 2VTB B; 4RLY A; 5BW8 C; 1N95 A; 2EIM E; 4FHK A; 5BNW A; 2IEJ A; 4U96 D; 4O1O A; 1KZP A; 3L13 A; 4TXP A; 3CV0 A; 4RVB A; 4DX6 D; 4DRX E; 4N2Q A; 4IUL A; 2DYS E; 3FH8 A; 3ZFW A; 4ZFH A; 1OWM A; 3V79 K; 3F6Q A; 1NZN A; 1TEZ A; 2OEV A; 4A1S A; 1EPU A; 2X6F A; 4GYO A; 4LNB A; 3I3N A; 4G1T A; 4Q69 A; 5KBA A; 4XE0 A; 3SY2 A; 4H7Y A; 5B3S E; 3JUE A; 2FI7 A; 5AJL A; 4B89 A; 4JC8 A; 3AU5 A; 2UY1 B; 4LER A; 5D0Q D; 3UT7 A; 2P9K G; 5J08 A; 4LSZ E; 3RRU A; 2PNN A; 1DCQ A; 4G8K A; 4JHK A; 3WG7 E; 3FU5 A; 4WND A; 2F37 A; 3E4B A; 4FHJ A; 4CYM D; 4J8F A; 3VTX A; 4I9C A; 1Y6I A; 5AN8 A; 3UMV A; 1K1B A; 1E8W A; 3ESK A; 3CLJ A; 1SQM A; 4J8S A; 1O1R A; 4WWN A; 3Q7A A; 4EZJ A; 3LS8 A; 2IOS A; 4BT9 A; 3TWS A; 2C0M A; 1YYH A; 4ATZ D; 4AY6 A; 4XKC A; 1HG5 A; 3ASD A; 3Q75 A; 3LDZ A; 1G3N B; 3RAU A; 3CVN A; 2IF4 A; 3BEE A; 4U04 A; 3FEY A; 3Q78 A; 2JEK A; 2P9L G; 2KXP C; 1KT1 A; 3RKV A; 3S7F A; 2OV8 A; 1D8E A; 1HX8 A; 4I6E A; 2A4Z A; 3C3R A; 3HXE A; 3ZW3 A; 3Q47 B; 2ETB A; 1OCZ E; 4K0R A; 4KYO B; 2LUH A; 1K1A A; 5J90 A; 4GPK A; 2RFA A; 2EIJ E; 3D9I A; 3MKQ B; 4UQY A; 3FFL A; 4WWO A; 1U2V G; 4Y6C A; 3ZXP A; 3FTX A; 4UI9 K; 2KM4 A; 3PE3 A; 3EHR A; 1SVX A; 3QWV A; 3Q7F A; 5ENP D; 3ENE A; 3PVL A; 3EIQ C; 2L0I A; 1FVH A; 2GRQ B; 3DEP A; 2C0L A; 3HXC A; 2WXN A; 1NL4 A; 4TXQ A; 4GZC A; 2WXK A; 2WXR A; 3D3M A; 2Y4U A; 5BV1 A; 3TGO A; 3HDX A; 2KBX A; 4N3A A; 4TRQ A; 4UI9 C; 1TNU A; 3IEG A; 1HO8 A; 3SBT B; 5EIB E; 5T4Y A; 2LXM A; 4V3I A; 4ZHB A; 2WXM A; 2KCK A; 3UT8 A; 3LXU X; 3PEV B; 3E34 A; 3QKY A; 4HNA D; 3SI5 A; 5HI7 A; 4CEM A; 2DZO A; 4H7X A; 5BUZ A; 4B94 A; 1OWO A; 5CBO A; 3Q49 B; 2KCV A; 2XPI A; 2WB2 A; 3N71 A; 5LCW C; 1PY1 A; 1EYH A; 3LVQ E; 4YVQ C; 4C48 B; 1QBQ A; 4GCN A; 5AQB A; 4M7C A; 4AP2 A; 4YDO A; 1IHG A; 1SA4 A; 4RSY A; 5AJD A; 1XNF A; 3V2X A; 1KT0 A; 2PL2 A; 3LKU A; 3FTW A; 1UN8 A; 3Q5M A; 2F8X K; 2LAI A; 2J9Q A; 4AIF A; 4DX1 A; 1TNZ A; 3CIA A; 5FIN A; 2L6B A; 5G04 C; 3EHN A; 3QK0 A; 3QWW A; 3RU0 A; 5HRY A; 3I4R B; 2P9I G; 3PUJ A; 2HE0 A; 3ONL A; 1Y8M A; 4L7T A; 2XEE A; 3CVV A; 4BWR A; 3B95 A; 3ASF A; 4GMR A; 1N4S A; 3K9I A; 3IXE A; 2FO7 A; 3PRE A; 2ZXW E; 3CEQ A; 3CVU A; 2X6J A; 4GPM A; 5AEN A; 1O1S A; 3MYV A; 4GTT A; 2RG8 A; 2GRN B; 4AM9 A; 1DC2 A; 3FUI A; 2H6F A; 4I17 A; 2UWJ G; 2NSZ A; 4LNG A; 3L17 A; 2Y69 E; 4C9B B; 5T8I A; 4EBA G; 4GML A; 3IV0 A; 4CGW A; 3G2S A; 3NOG D; 2WXO A; 5G2N A; 4KBQ A; 3CKC A; 3SZ7 A; 1BD8 A; 2B0O E; 2ION A; 1Z6T A; 5EYP F; 2EIN E; 4I1A A; 4JPS A; 2VQ2 A; 1HE8 A; 4NAC A; 5CCM A; 3DSX A; 1WAO 1; 3ZYL A; 3PZ3 A; 5EIL A; 1H19 A; 4PDX A; 5ANR A; 3PNT B; 3ZN3 A; 4J8D A; 4G23 A; 1FCH A; 1IQR A; 1U3D A; 3DXM G; 2GRO B; 3OAW A; 4F3V A; 4UWL A; 3LY8 A; 4MRU A; 4Q96 A; 4O1P A; 3NQP A; 3TWQ A; 3FTV A; 3SO8 A; 4JA9 A; 1OCR E; 1H2U A; 1FT2 A; 4Z68 A; 3FUD A; 3PDN A; 4DLO A; 1ELK A; 4BSZ B; 3FUL A; 3SFY A; 4U8H A; 4PUC A; 2KCL A; 2EIK E; 3LY7 A; 1JCQ A; 3PZ4 A; 5FIO A; 1LF8 A; 2NC9 A; 2P58 C; 4GA0 A; 1BLX B; 2HO1 A; 3SNX A; 3JQ1 A; 4L1B A; 3FUE A; 3UPV A; 2CHX A; 4XEI G; 2YHE A; 2MRI A; 3P2B A; 2XZD G; 1SZA A; 3MCX A; 3FTU A; 4JA7 A; 3X2Q E; 4HQD A; 1S63 A; 4J8Y A; 2XEH A; 2XRZ A; 4AEZ C; 2IJG X; 4OAV B; 1HG2 A; 2VGY A; 3LVR E; 1IQU A; 3VTY A; 4KVM A; 5ARF A; 2WXL A; 2X38 A; 3CHS A; 5LOZ A; 3CHM A; 5EKQ D; 2P2C P; 4IN3 B; 1WG0 A; 4U8V D; 4GA2 A; 4HOT A; 2V5F A; 2A5E A; 5JMN D; 4ME2 A; 3CR3 A; 3RIB A; 3ZHE A; 4GTS A; 3R9A B; 5D66 A; 5BV0 A; 3DST A; 4NRH B; 2XCB A; 1IYG A; 4APO A; 4KMO A; 4MKT A; 4KZ0 A; 3NAW A; 4HFG A; 4ABN A; 5KWD A; 2EIL E; 4I9E A; 5JJT A; 4RG9 A; 4N2S A; 1H2T C; 3ASO E; 2ETA A; 4G24 A; 4YDW A; 3IBE A; 5G05 C; 1QZ2 A; 4KXK B; 5C2Y A; 3VLE A; 3Q15 A; 5FQ8 A; 1EDU A; 4GZD A; 3J5P A; 2XHE A; 3WXX A; 2R2L A; 1LD7 A; 1A17 A; 4I2Z A; 2DIW A; 3DSW A; 4WNF A; 4J8E A; 1WM5 A; 1N0R A; 3D9J A; 1S70 B; 2WMN A; 4RQI A; 4EHM A; 4FLH A; 3BG0 B; 3DSU A; 3VLF A; 3U66 A; 4ANV A; 5D2M C; 1WY6 A; 5ITZ F; 1TN7 A; 3FUM A; 2I1K A; 4F53 A; 3S7D A; 5LX8 A; 5AAR A; 1TJC A; 3ULY A; 2QC9 A; 2V5Q C; 5CBN A; 4ILI A; 4LRZ A; 4XIF A; 3FUJ A; 1X5B A; 1LTX A; 1YCS B; 3PH0 C; 2LSU A; 3ASN E; 5EID A; 3D9O A; 1SZ9 A; 4CDR A; 2IO2 C; 2WXH A; 3PNL B; 3ZXS A; 3AG1 E; 4EQF A; 1IXV A; 3ZIM A; 4CT4 A; 3CST A; 4FUL A; 4O6F A; 1PC2 A; 4N3C A; 4XZ4 A; 2KZT A; 3KEZ A; 4U0S A; 5CER B; 3HHM A; 4E85 A; 1Z3X A; 2RD0 A; 3QC1 A; 3IKO B; 5CED B; 1NA0 A; 3NZU A; 3TWW A; 3KSL A; 4OVU A; 3SGH A; 2AXZ A; 4UWK A; 4CGV A; 5KNG A; 3CQG B; 2WQ7 A; 2BED A; 3CSF A; 2OVB A; 1OCC E; 4N5C A; 4EPZ A; 1Q2Z A; 2F8Y A; 4TXR A; 4HLE A; 3QAR A; 2X6K A; 3QB2 A; 2GGF A; 3UKR G; 3ZU7 B; 2WXJ A; 3APD A; 2J07 A; 1N4R A; 2CFZ A; 2J4D A; 4IRU A; 3UM2 A; 2H6I A; 1N94 A; 1W3B A; 2I2O A; 3ULE G; 2DWZ A; 3E32 A; 2JLB A; 1S0P A; 4HI8 A; 2LAH A; 3QAQ A; 3ML8 A; 4F7A A; 4DX5 D; 3QNK A; 4K5B A; 4FA6 A; 3L08 A; 4GYW A; 3NBN B; 4B0Z A; 1TYQ G; 4DX7 D; 4L2L A; 3L6A A; 2AWI A; 4ATG A; 2WXP A; 3BUA A; 4LG6 A; 3TWU A; 2Q7F A; 4CCA A; 4G11 A; 2LO6 A; 3TWV A; 3GW4 A; 4YDY A; 3JCK C; 3FTS A; 1AP7 A; 2BKG A; 3C3O A; 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2PM6 A; 2GRL A; 4AOF A; 2M63 A; 2H6H A; 4L23 A; 5E75 A; 3GZ2 A; 3URZ A; 4GU5 A; 3TJP A; 5T3R A; 2WXF A; 4AY5 A; 4FJY A; 1YA0 A; 1EF1 C; 4BER A; 4F6R D; 3DPD A; 4GTO A; 3S7J A; 4U07 A; 2QYJ A; 3B7S A; 4O60 A; 4D10 C; 3V30 A; 3AAA C; 4N5Q A; 2OND A; 2WXG A; 3GYZ A; 3CK9 A; 4HRN A; 1INZ A; 2Y1L E; 3E30 A; 1FT1 A; 4TV3 A; 5A23 A; 3RRM B; 4MS6 A; 1H0A A; 3BG1 B; 4E6H A; 4WNE A; 4M3O A; 4UQX A; 3NB2 A; 5A6C A; 4I43 A; 2H6G A; 3RRN B; 2XPZ A; 2XRY A; 4XI9 A; 1KZO A; 5CMW A; 3ML9 A; 3APC A; 3UM0 A; 2L6J A; 2PQR A; 3UUX A; 4HLL A; 3AJI A; 5JJ7 A; 4BET A; 4K5C A; 4GTV A; 3LPZ A; 2LSV A; 3W9F A; 2GW1 A; 3NOC D; 2VSX E; 2WXI A; 3EU9 A; 2GRM A; 3L22 A; 4JD2 G; 4A55 A; 1XGW A; 1Z3Y A; 2GRR B; 4BT8 A; 1KLX A; 3APF A; 5CRV A; 1U3C A; 4EBA A; 1SA5 A; 2VSO E; 3AG2 E; 5FQ4 A; 3ABK E; 3ZYM A; 3ESL A; 4NUR A; 5FZQ A; 5CHE E; 1MJ0 A; 3OXF A; 3NF1 A; 1HF8 A; 4NIK A; 3G2V A; 3FUN A; 3ZEF A; 1QNF A; 4N3B A; 2EQX A; 5FZS A; 1AWC B; 2BUG A; 5AAO A; 2NYJ A; 1QYM A; 4YND A; 2KZT B; 3KS2 A; 5ENT D; 2XS1 A; 3ABM E; 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