The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
DTPENVLQMLEAHMQSYKGNDPLGEWERYIQWVEENFPENKEYLITLLEHLMKEFLDKKKYHNDPRFISYCLKFAEYNSDLHQFFEFLYNHGIGTLSSPLYIAWAGHLEAQGELQHASAVLQRGIQNQAEPREFLQQQYRLFQTRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Analysis Reveals Features of the Spindle Checkpoint Kinase Bub1-Kinetochore Subunit Knl1 Interaction.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Cell cycle
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
MITOTIC CHECKPOINT SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE BUB1
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| total genus |
62
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2011-09-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF08311 | Mad3_BUB1_I | Mad3/BUB1 homology region 1 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4AEZ C; 4A1G A; 2WVI A; 2LAH A; 3SI5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5BPP A; 5FJY A; 3B7T A; 4OYS A; 3IHV A; 2KCL A; 3HHM A; 4UWF A; 4WWN A; 5BXU A; 2IY0 C; 2CG2 A; 3CR3 A; 4U0S A; 1H6O A; 3MGB A; 1X5B A; 4JA7 A; 3Q79 A; 2I9C A; 3HG0 D; 4IN3 B; 3CVV A; 1SA5 A; 2X6I A; 5CED B; 2M63 A; 3PEV B; 5G05 J; 2P9S G; 2YHC A; 3ASN E; 3CVL A; 1JCR A; 1E8Y A; 4NUR A; 4ANV A; 1INZ A; 3NZU A; 3D9J A; 3PZ2 A; 3SNX A; 2P9I G; 2WQ7 A; 3KAE A; 1TN8 A; 2CG3 A; 4GCO A; 1MZC A; 3FTV A; 3HXB A; 2XZT G; 1E90 A; 4JVS A; 5EX0 A; 3CKC A; 3ZVV A; 2I6H A; 3HXD A; 2A5U A; 2R59 A; 1HG5 A; 1K1A A; 2CFU A; 4GMR A; 5E75 A; 5JJ6 A; 4AV7 A; 4MLP A; 1MX4 A; 5B1B E; 3IBE A; 4AP2 A; 3C98 A; 2VSO E; 2IFU A; 4APF A; 4MS6 A; 1ZBP A; 2PQR A; 3JUE A; 2KCK A; 1KT0 A; 5JA4 D; 2F8X K; 1U3D A; 4GPK A; 1OCR E; 2WMO A; 3S2A A; 4UI9 J; 5FQ7 A; 4Q94 A; 4UI9 C; 2AVP A; 3NAW A; 3MV3 B; 1HE8 A; 1BI7 B; 1NFI E; 4FJY A; 1Z3X A; 1EDU A; 5DIZ A; 3NF1 A; 2R5S A; 3O48 A; 1B89 A; 3U66 A; 3CEQ A; 3FUF A; 4WAF A; 2PM6 A; 2P9U G; 2KZT A; 3SFY A; 4ANX A; 2C0M A; 4XIF A; 1E8X A; 3PNL B; 1HZ4 A; 3EHM A; 3CK9 A; 4CDR A; 4ILI A; 3SD5 A; 3AS8 A; 1HU3 A; 5AQB A; 5BT1 A; 2FO7 A; 3FDH A; 2DZO A; 2VGX B; 2J08 A; 2Q7F A; 3LY9 A; 2WXJ A; 2WXF A; 2H6H A; 4QQI A; 3R7R A; 1N4S A; 1MX6 A; 4NIK A; 5D2M C; 2GRN B; 3S7D A; 3G2W A; 5G55 A; 2P9K G; 2Y4T A; 1TYQ G; 5EN5 D; 2F0Y A; 4V3I A; 2WQ6 A; 4G8L A; 4E6H A; 2EIN E; 4FA6 A; 3UT7 A; 2VGX A; 3Q7A A; 5BV0 A; 1EYH A; 3ZHE B; 3MZL B; 5EYL A; 3RKV A; 3EIQ C; 2GRP B; 3Q7F A; 4YND A; 5HI7 A; 4DX1 A; 2J4D A; 1Y6I A; 3AU4 A; 4C0M A; 3CK8 A; 3ASO E; 1HFA A; 2ZIR A; 4IUL A; 2H6G A; 3TG4 A; 2WXK A; 4JA9 A; 1TN6 A; 5ENP D; 4Q96 A; 2DIW A; 3ZHE A; 5CMY A; 3TWU A; 3DXK G; 5CRV A; 3UM1 A; 2X6K A; 3FUI A; 3ZKJ A; 4CYM D; 2XPI A; 2MOW A; 1N4R A; 2KCV A; 4J6I A; 4BTB A; 1AP7 A; 2DCP A; 3DSV A; 3T5X A; 4B0Z A; 2X6F A; 1O1R A; 3QAR A; 4G11 A; 4G25 A; 2OV8 A; 1O1T A; 3KSL A; 3AS5 A; 3FU3 A; 4YDE A; 4CDN A; 5AYW D; 2Y69 E; 3I5P A; 4TXQ A; 3UT4 A; 3FU6 A; 3BUA A; 2WXQ A; 3D9P A; 2AXU A; 4G2V A; 5KJN A; 4AY6 A; 3ZGQ A; 5ENS D; 3EHQ A; 5T4Y A; 3NQP A; 3URZ A; 2WXN A; 1SVX A; 3R9M A; 3CLJ A; 3T9K A; 2QC9 A; 4Y6C A; 4N3A A; 1XNF A; 4LRZ A; 2I2O A; 1N9A A; 1OCO E; 2EIK E; 4LUN U; 1DCQ A; 4MBG A; 1OXJ A; 4WUY A; 5AQ7 A; 3SBT B; 1ELK A; 2BUG A; 2IO2 C; 3RIB A; 5ANR A; 4JW1 A; 2XZD G; 4I43 A; 1H2U A; 3D9K A; 4AM9 A; 3APC A; 2XHE A; 4EBA G; 2B0O E; 3PVL A; 2XS8 A; 3I4R B; 3RO3 A; 2KAT A; 2WXO A; 1TNY A; 4I6G A; 4BT9 A; 3PZD A; 4I9C A; 4BWR A; 4ACK A; 3FTY A; 2H6I A; 1FCH A; 2DVW A; 3IKO B; 3PE3 A; 3Q9N C; 3ASD A; 4DLQ A; 2NSZ A; 4P29 A; 1A17 A; 4JXT A; 2VTB A; 3IHY A; 2BKK B; 5E76 A; 1SW6 A; 4U8Y D; 5AQ9 A; 5HKP A; 2XGO A; 4RG9 A; 3GW4 A; 3KD7 A; 5BV1 A; 2OVB A; 4KZC A; 3UIN C; 1WY6 A; 2QYJ A; 3B7B A; 3ZPJ A; 3D9O A; 2ZGD A; 3RJV A; 2V5Q C; 4IYP A; 1MHQ A; 2LSU A; 3U64 A; 4YVO A; 4CRW A; 2L9B A; 1SA4 A; 4HLL A; 3SFZ A; 3CVU A; 4AOF A; 4HQD A; 4TRQ A; 5CER B; 1NZN A; 2JLB A; 2KC7 A; 3RSE G; 5LOZ A; 3UXG A; 3UX4 A; 2NXP A; 4L2Y A; 4LG6 A; 5KJK A; 4PS7 A; 5CHE E; 4DK5 A; 1OWN A; 4G23 A; 2EIJ E; 4W9R A; 1N0Q A; 2YNQ A; 4F53 A; 4BET A; 2XEN A; 4EHM A; 3AS4 A; 3TAX A; 4HOU A; 3FTS A; 2J4B A; 4NAC A; 1MQS A; 2CFZ A; 1FVH A; 5JMN D; 2DZN A; 2RG8 A; 2J9Q A; 1TJC A; 3PS6 A; 4QFV A; 3Q9U C; 1EPU A; 3APD A; 4F3V A; 3TWR A; 1TR4 A; 3FUD A; 4A1G A; 3FHE A; 4I2Z A; 4LNU D; 1HG2 A; 1IQR A; 4G1T A; 3LS8 A; 3C3R A; 4JB8 P; 4OVU A; 2X38 A; 3FTX A; 4CGV A; 4N3C A; 2IO3 C; 4K03 A; 5ENQ D; 3Q49 B; 2LSV A; 3FUE A; 3ENE A; 3VTX A; 4YVQ C; 1GW6 A; 1MYO A; 1OCC E; 2CHX A; 2OND A; 4I6E A; 4JHJ A; 4XI0 A; 4KXK B; 3Q47 B; 4L9P A; 4I9E A; 4JPS A; 4U96 D; 1BPO A; 5KNG A; 3PDN A; 1IKN D; 3SO8 A; 3DEP A; 1SZ9 A; 3Q5M A; 4ACL A; 4NRH B; 4JD2 G; 2ZGG A; 4GU5 A; 5ARF A; 2XS1 A; 4YDO A; 2XCC A; 2VSY A; 4N2Q A; 3ULQ A; 3BG0 B; 3DEO A; 3SFX A; 2P9N G; 1D9S A; 1XGW A; 4ME2 A; 3RRU A; 5CCM A; 3SF4 A; 5KJM A; 1KT1 A; 2L0I A; 2QY7 A; 3LVQ E; 5FZS A; 2LAI A; 3U9W A; 1BD8 A; 5EIL A; 4X8Q A; 4BT8 A; 3GYZ A; 4B8C B; 3E32 A; 4OVV A; 5ENT D; 2RKK A; 1ELR A; 4FJZ A; 5B1A E; 3V30 A; 3MKR A; 5EIB E; 4U0U A; 3RU0 A; 2F37 A; 1Y8M A; 4A1S A; 2EIL E; 4FLB A; 2MYO A; 4CEM A; 3FU5 A; 3ONL A; 2BF0 X; 3QAQ A; 1JPL A; 3L54 A; 3ZW3 A; 4HI8 A; 2UY1 A; 1NA0 A; 2V8S E; 3UTM A; 4PUC A; 4CCA A; 4JZY A; 4HLE A; 3ZNG A; 1LF8 A; 1WAO 1; 2HO1 A; 5J90 A; 4HNA D; 3BQO A; 3MX3 A; 4U95 D; 4U7E B; 2FI7 A; 2YHE A; 1TEZ A; 2EQX A; 5G05 C; 4Y6W A; 5KBA A; 4HOS A; 4L23 A; 3UM2 A; 5HS0 A; 3AG3 E; 4U04 A; 2P2C P; 4RSY A; 2E0I A; 2I1J A; 4GA2 A; 5FTP A; 4FC8 A; 3ZN3 A; 4UWK A; 4O6F A; 1SQM A; 4DI3 A; 1SZA A; 1PAQ A; 3TG5 A; 1U3C A; 2FUL A; 4J7W A; 1KZO A; 3ZYQ A; 3OTN A; 3PNT B; 4WNF A; 3FUN A; 3QOU A; 1BU9 A; 3QB2 A; 3FFL A; 3G2U A; 4UQY A; 1KPS B; 1PY1 A; 5ITZ F; 5KJL A; 4GB9 A; 4LSZ E; 4Z68 A; 3B7U X; 2AXZ A; 4DPR A; 3APF A; 5DBK A; 1ZB1 A; 2WQH A; 4I6J A; 2X3M A; 3WXX A; 2KZT B; 1S0P A; 3EJN A; 3TWV A; 1LTX A; 2KXP C; 3P1U A; 4GMJ A; 2RD0 A; 4O1P A; 3R7Q A; 1N95 A; 3B13 A; 1FPP A; 3AAA C; 2DYR E; 3TXN A; 4KT6 B; 4HBD A; 1OWM A; 5BW8 C; 3CVX A; 3BU8 A; 2KM4 A; 4OAU C; 3JYS A; 4J8S A; 4LEU A; 5AQA A; 4KVO A; 3NZS A; 2MRI A; 5CMW A; 4I1O B; 4GTO A; 2I1K A; 4KYO B; 5FQ6 A; 1E8W A; 3ESK A; 3L6A A; 4JHK A; 3CV0 A; 5CBN A; 2E2E A; 4RQI A; 4WNG A; 3T5V A; 3U4T A; 3UUX A; 1TN7 A; 4B93 B; 3FTZ A; 4APO A; 4AEZ C; 1ZU2 A; 4WNE A; 4XX5 A; 4GTP A; 3BEE A; 3CHS A; 5KCM A; 3GZS A; 4BX9 A; 3Q15 A; 2YIN A; 1IXV A; 1DC2 A; 5CBO A; 2VGE A; 3QDN A; 4B8A A; 2XPZ A; 1JCS A; 2LNI A; 4I17 A; 4YDW A; 3TGO A; 1RW2 A; 1BLX B; 5H7P A; 5M72 A; 4PS3 A; 4TXR A; 4U0Z A; 1O5M A; 3TJP A; 3L16 A; 4JHR A; 1Z6T A; 3FEX A; 2DBA A; 4HVB A; 1TNO A; 3E33 A; 3ASF A; 3LJ3 A; 3L9T A; 5ENO D; 3EHN A; 1OCZ E; 4EBA A; 3W9G A; 5C1D A; 1H6P A; 4JC8 A; 4HFG A; 3ML8 A; 5CCL A; 3CKB A; 3OXG A; 4BES A; 5ENN A; 3DSX A; 1W3B A; 3G2T A; 3QNK A; 5EDS A; 2QYU A; 2XCB A; 3KS2 A; 3PUK A; 1PC2 A; 3V79 K; 3HVE B; 4FP7 A; 3RRN B; 4ANU A; 5A6C A; 4U8V D; 3ULE G; 5JJ7 A; 2J8S D; 3ZRH A; 4XEI G; 3MYV A; 3D3M A; 3LEW A; 3Q73 A; 3QWW A; 3CHR A; 4UQX A; 1FVF A; 3RK6 A; 3WG7 E; 3ZFW A; 3CVW A; 3HVE A; 3N71 A; 2WM9 A; 3DBS A; 3TWX A; 4G26 A; 5C2Y A; 3SI5 A; 4CT4 A; 3QK0 A; 2DWZ A; 1LD7 A; 3QWP A; 2XGM A; 3R9A B; 3ZXP A; 3DWL G; 2J07 A; 3RO2 A; 2VTB B; 4ATZ D; 5FZR A; 4GA0 A; 3FH5 A; 3MKQ A; 1IYG A; 2IOS A; 4JL0 A; 3JUI A; 4BSZ B; 1S64 A; 1OWL A; 1H19 A; 3DPD A; 4EZJ A; 4J8Y A; 4JEH A; 5EX3 A; 3L13 A; 3D9H A; 3C3Q A; 2V4L A; 1NL4 A; 4EZL A; 3IEG A; 1DVP A; 5A7D B; 3DST A; 3HXC A; 4TUM A; 3IXE A; 3UM3 A; 5FQ4 A; 1TNB A; 5AEN A; 3Q4A B; 1L5J A; 3B7S A; 3V31 A; 1Q2Z A; 4K0R A; 2H6F A; 3UKU G; 2XEH A; 3O4Z A; 5CEC B; 1H2V C; 2OCC E; 3LKU A; 4DX7 D; 4RVB A; 3D9N A; 3OXL A; 5FWQ A; 2AJA A; 4UWG A; 2J09 A; 2JEK A; 1QYM A; 2NYJ A; 4UI9 K; 4KMO A; 2VSX E; 2IF4 A; 4XZ4 A; 4KZ0 A; 1JUQ A; 5BXO A; 4N5Q A; 1WG0 A; 3PUJ A; 3U3W A; 3CHQ A; 1S63 A; 4GTR A; 4ZFH A; 4BY6 A; 3UIO C; 2R03 A; 3NBN B; 5LX8 A; 3OXF A; 4GA1 A; 2ETB A; 4LNG A; 3V2X A; 3P2B A; 2HR2 A; 4WND A; 4FAD A; 3UT8 A; 4H7X A; 3Q75 A; 2XRZ A; 4DRX E; 3ZUV B; 2GRR B; 2YQ8 A; 5LCW J; 5LCW C; 3ESL A; 4GZ5 A; 2LO6 A; 3PRZ A; 3UMV A; 4PS8 A; 5JJT A; 5LP0 A; 2J49 A; 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