The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
47
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sequence length |
165
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structure length |
164
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Chain Sequence |
EMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDVASTLNKAKSIIGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVNFFKVINRKTYLNFDKAVFRINIVPDENYTIKDGFNLKANLSTNFNGQNTEINSRNFTRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of Clostridium Botulinum Neurotoxin Protease in a Product-Bound State: Evidence for Noncanonical Zinc Protease Activity
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Clostridium botulinum
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| molecule tags |
Hydrolase
|
| molecule keywords |
BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE A LIGHT CHAIN
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| total genus |
47
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| structure length |
164
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| sequence length |
165
|
| chains with identical sequence |
D
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.24.69: Bontoxilysin. |
| pdb deposition date | 2000-05-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 | ||
| Few Secondary Structures | Irregular | Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain fold | Clostridium neurotoxins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3K3Q C; 1E1H B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4H9P C; 1VOM A; 4HFC A; 4ILA A; 3ANW A; 1D1C A; 3UU6 A; 3I1A A; 4JI8 T; 4EYY R; 3C4Z A; 2J4G A; 2D0T A; 2E9X C; 5F3J A; 3UUM A; 5AQV B; 3IF8 B; 4HE8 A; 5HEU A; 4JI7 T; 3QUJ A; 3UU4 A; 2KMF A; 3AA7 B; 4X1I E; 2ZMA A; 3K3N A; 5JQG E; 2XQ6 A; 2AE9 A; 3P4Q A; 2CCQ A; 3EDU A; 4AKG A; 4HWF A; 5ABF A; 5F5W A; 2WAU A; 5LGU B; 1OED B; 5JDQ A; 5C3J A; 3N9L A; 4A97 A; 2LJL A; 5FY1 A; 4TN7 B; 2ACZ A; 1I6Z A; 4CXX A; 4JI4 T; 1S94 A; 5LHI B; 3OTO T; 4IDN A; 3Q5D A; 5AQN B; 3MXZ A; 3NWI A; 5CA0 E; 4LMK A; 4ZXL A; 2W0G A; 5LOV E; 2KLQ A; 1BR1 A; 2YIN A; 4I4T E; 3VRA A; 4EIW A; 1JNZ A; 4HFH A; 1MMA A; 1YD8 G; 4YJ3 E; 4AXP A; 4ILC A; 5LP6 E; 4PFO A; 4OHF A; 4DV1 T; 4AKH A; 4HFB A; 4JI6 T; 2XZE A; 2BVM A; 4GKJ T; 2UUC T; 4EZ4 A; 1WLX A; 3AED A; 4HWC A; 3RYI E; 5L2L A; 1HNZ T; 4YFS A; 1V9D A; 3EVY A; 5AQF B; 1JNR A; 4I55 E; 1EZ3 A; 2WSS V; 5EK4 A; 5JR9 B; 1OED E; 1XWM A; 4LF8 T; 2CBJ A; 3TLV A; 2J62 A; 2E9X A; 2N2N A; 2ODU A; 2BG9 A; 2X51 A; 2VVS A; 4O4I E; 3CPZ A; 2X9W A; 2CM0 A; 5BMV E; 4P0A A; 1D0X A; 2H7O A; 4P1N A; 2LT3 A; 4IT4 A; 4IE0 A; 3VU7 H; 4CN6 A; 1W9R A; 3A8Y C; 4AKL A; 5J2U E; 5LMU T; 4DBQ A; 4HEA A; 3EAB A; 3PUY F; 1KFY A; 4KHP T; 3NRX A; 5HWY A; 5J0Z A; 2PBI A; 4ZI7 E; 5L4E A; 2UXB T; 2BG9 C; 4GKK T; 3PJA A; 1VCT A; 3LJC A; 1XMQ T; 4YHH T; 2LSY A; 2HH7 A; 3PE0 A; 3PUX F; 4JBW F; 1X79 A; 4MFR A; 4UF0 B; 3FHN A; 3NZP A; 4FI5 A; 5DJQ C; 3ZKR A; 4X62 T; 4NXM T; 4DV4 T; 2V5C A; 5FL1 A; 2V6X A; 5LBM A; 1N34 T; 4JEU B; 2V7M A; 2XAF B; 3DP7 A; 4EED A; 4UEM A; 3L09 A; 4LF4 T; 3N9O A; 2LHN A; 4HN9 A; 3RQW A; 2E2A A; 2CLY C; 4ASK A; 1VCS A; 3ZMV B; 1LKX A; 3GA8 A; 3PUZ F; 1FIO A; 4G63 A; 2IUB A; 1UGO A; 5FY7 A; 3WAK A; 4O2B E; 1FMW A; 3NKZ A; 4A98 A; 4C91 A; 4Z90 A; 4EGW A; 4YXD A; 5IWA T; 2JQ9 A; 4A56 A; 4TX5 A; 1BR0 A; 3KDS E; 1LRZ A; 2I6H A; 2WCA A; 2JMH A; 3M3Z B; 4JEH B; 5AQU B; 5JRE A; 4UIG A; 4ZS3 A; 3OPC A; 5GON E; 5JVD E; 5LMN T; 5CGM A; 1T8B A; 4NIQ A; 2XQ4 A; 2XPK A; 4QXB B; 4GK5 E; 1HTJ F; 3TKL B; 4PFP A; 3UT5 E; 2J47 A; 4ILB A; 2XAG B; 2VL8 A; 5LBQ B; 4AQF C; 5HCM A; 4ZEY A; 2W00 A; 1D0Z A; 3N5L A; 2QRX A; 4HKA A; 5JRC B; 2X67 A; 4U7Y A; 4YJ2 E; 4EB6 E; 3S4U A; 5CFB A; 4ILU A; 4JI3 T; 5HXH A; 2M6I A; 2PG8 A; 2RP4 A; 3AE9 A; 3NRY A; 4BJM A; 4CI3 B; 1HG2 A; 2YN6 A; 3OJA A; 3N2G E; 3A7M A; 4GYR A; 4KHZ F; 4E7Z A; 2MPK A; 2BBH A; 3E08 A; 1BR2 A; 2NWB A; 3RC8 A; 2M6B A; 2NOX A; 2Q9Q A; 2VK9 A; 2Y48 B; 5JTG A; 5M4Y A; 1HX1 B; 3R6N A; 2MAW A; 3QNU A; 1ZP0 A; 3LK3 B; 3O1I A; 5JDL A; 4KBM B; 4LF7 T; 3JAF A; 2BS3 A; 1QSD A; 2X9X A; 3MAC A; 3E0Z A; 4WBN E; 1B7T A; 5H6Q B; 3PU3 A; 4KUM B; 4E7S A; 1IBL T; 5AQM B; 2RPA A; 2XQ9 A; 1WR0 A; 2YKS A; 1FMV A; 1UX5 A; 2FJA A; 3HKE E; 1SUM B; 4YSX A; 1WR6 A; 2XSA A; 2VQE T; 1D0Y A; 2A9U A; 3CML A; 1NEN A; 4U31 A; 1XNR T; 3N9M A; 2V7I A; 1T7S A; 3L39 A; 5L3F B; 1E7P A; 2Y8D A; 2MBG A; 1HFA A; 2NTX A; 3C50 A; 2OLT A; 2JQH A; 5F8P A; 3SWH A; 5LNK A; 5LHG B; 1KNZ A; 4QX7 B; 4TZ4 C; 3RIF A; 1ZHC A; 4IL9 A; 1T72 A; 4U72 A; 4Q25 A; 3SFE A; 2IC9 A; 3K3O A; 3A5X A; 3TLS A; 2G0U A; 2H88 A; 2X68 A; 2Z6E A; 3KBT A; 1MMD A; 1Z8U A; 2NR4 A; 3KIN B; 3P7I A; 5HEJ A; 3J7Y q; 4JLE A; 4TNW A; 2W63 A; 2BVL A; 2KSR A; 4NPP A; 2D2S A; 2NW7 A; 3FBZ A; 3MZK B; 4HWD A; 2IW5 B; 4AIU A; 2YDQ A; 2X0L B; 4I0U A; 4QH4 A; 1XMO T; 4YSZ A; 2QYW A; 1HX8 A; 3FZH B; 3UQ4 A; 5HCJ A; 2R6G F; 2XQY A; 3RYF E; 1KEY A; 2W62 A; 3FXE B; 3R84 B; 1KNR A; 4B3T T; 1SE7 A; 4U74 A; 5C8Y E; 5HXE A; 3AA0 B; 4HGA A; 2QGS A; 2CEA A; 4DUZ T; 2F4V T; 2AXD S; 3OBV E; 2CHN A; 3PUQ A; 2LSK A; 3AVR A; 4BA9 A; 1MIY A; 1O3X A; 1US7 B; 3AEA A; 3B57 A; 2C5K T; 4F6R C; 2VAS A; 2K5B B; 3P4S A; 2ES0 A; 5FL0 A; 2VUR A; 3WAJ A; 1IZN B; 1WRD A; 3ZJ1 A; 2JIW A; 2DL1 A; 2V8S V; 2CA5 A; 3IHR A; 4B6X A; 3RYC E; 1OED C; 3ETU A; 3BK9 A; 1YXR A; 3FZF B; 1N33 T; 4O8S A; 2IAK A; 3I9Y A; 3RRW A; 2XM2 A; 3VKH A; 3GMI A; 2X0H A; 3SRZ A; 4CQI A; 4X64 T; 3AE5 A; 1SHZ C; 2W4X A; 2XQ7 A; 2JJ9 A; 4H9N C; 3C51 A; 3IA3 A; 4HWI B; 2Y6X A; 5FKY A; 3RHW A; 5JR9 C; 2WS3 A; 2RA1 A; 3P50 A; 2H89 A; 2CBI A; 3AEE A; 3VR8 A; 3ZEF B; 4AQY T; 3UU8 A; 4Z91 A; 3LDQ B; 2H3R A; 2IML A; 1KNP A; 3B13 A; 3ONJ A; 2UUA T; 3QK6 A; 4ZI2 D; 2A3D A; 3FB2 A; 2K48 A; 5CB4 E; 1N32 T; 3AAE B; 4DUY T; 2K3W A; 4X65 T; 3UUN A; 4IE4 A; 4KMC A; 3D0T A; 4TWF A; 3T1Y T; 1CUN A; 1UX4 A; 3LK4 2; 2QVA A; 4OK0 A; 4ZI3 D; 2BBJ A; 2BG9 B; 2LKG A; 3EUH A; 3L8R A; 4L9I A; 2HN2 A; 5FVL A; 3P4P A; 2D0U A; 4JV5 T; 2A72 A; 4IDZ A; 4K0U A; 2HHH T; 2EHO C; 4OYK A; 3TLT A; 5AFU L; 3RF1 A; 2WY2 A; 3H3M A; 3H37 A; 3EDV A; 2LSG A; 3P8C D; 4PK5 A; 3F2E A; 5AQK B; 4COF A; 2D5U A; 4H63 H; 4UXN B; 3ZMS B; 1QUU A; 5FYM A; 2H7V C; 4H9Q C; 2XUE A; 3CX8 B; 5L3C B; 3U3I A; 3ZPO A; 3RRC A; 2KXP B; 3JC6 D; 3V5S A; 2LOP A; 2KT9 A; 3ZMT B; 2WZI A; 2VL0 A; 3FXD B; 4QX8 B; 2OA5 A; 4U2Y A; 3CX7 B; 4QH5 A; 3T1H T; 4LFB T; 2M67 A; 5J1G A; 1MIW A; 1LVF A; 4YLH A; 3N2K E; 4YSY A; 1X9B A; 4IDP A; 2XQ5 A; 3AVS A; 3GWH A; 4G2A A; 3ZYL A; 3O1H A; 4YT0 A; 2VVN A; 2YEV C; 4CI1 B; 1J5E T; 1KK7 A; 4PJM A; 4QWN B; 4WZX A; 5CJ5 A; 3SFD A; 3I9W A; 4GK0 E; 3KV5 A; 4IDQ A; 3ZC0 A; 4DR3 T; 2B76 A; 5LGT B; 3K8P C; 2IIU A; 3LK2 B; 1UK5 A; 4IE5 A; 3QC9 A; 4UV8 B; 3VHL A; 3ZN1 B; 4HFE A; 3FBL A; 1NEK A; 4H63 V; 4U2Z A; 2DHR A; 2ZM2 A; 5DQW A; 4A5X A; 2WZH A; 4ZZC A; 3ZMZ B; 4LF9 T; 3B5M A; 4HFI A; 2VKD A; 2WP9 A; 2FJD A; 4DO0 A; 3JAD A; 3AA6 B; 3HKC E; 4HFV A; 5HAX A; 4C90 A; 1U5P A; 5JDF A; 1OXZ A; 4EXT A; 4AI6 A; 2FUP A; 4IHJ E; 2V5D A; 2JQK A; 3N9N A; 4GIW A; 3PUG A; 3V5U A; 3WI3 A; 2MTQ A; 4IRE A; 1HG5 A; 5LG4 A; 4AKR B; 2LHR A; 2UXD T; 3PJA J; 1HNX T; 2DNX A; 3K1S A; 4QHO A; 2XJ7 A; 3Q5W A; 4MLK A; 4Z8X A; 5EZY E; 1HCI A; 3HR0 A; 4I50 E; 3CQC B; 5HEO A; 3RI5 A; 1UUR A; 2XAJ B; 3SS1 A; 3PTR B; 4L0R A; 4UV9 B; 4IGU A; 5KXJ A; 3I0O A; 2C0S A; 5AQG B; 5HXC A; 4CXY A; 5LJM A; 2HN1 A; 1M62 A; 1ZV4 X; 2YDS A; 1Y64 B; 5J2T E; 3CVR A; 1ZKE A; 5AQJ B; 4DMW A; 4HTE A; 4IE7 A; 5EK2 A; 5AQS B; 5JR9 A; 2ZM0 A; 1QLB A; 3Q5X A; 2VKH A; 4EV6 A; 2V26 A; 3GN5 B; 1J1J A; 3HKB E; 4JUY A; 5TAO A; 4DV3 T; 1WYC A; 2XHE B; 2IC6 A; 4PJL A; 4KI0 F; 3MJX A; 5AQH B; 2JMK A; 3UUX B; 2UXN B; 1OED A; 3VR9 A; 3JC6 C; 5LHH B; 3AEF A; 4DR1 T; 3ETV A; 4PJJ A; 4N78 D; 2B1E A; 2WDR A; 3JCF A; 4OYJ A; 1HR0 T; 3KFW X; 4DID B; 2VKJ A; 3AEC A; 4FJO A; 4DR5 T; 3O1J A; 4WNK A; 1CHU A; 3MK7 C; 2BKP A; 3IBP A; 2IDO B; 1U4Q A; 3C4W A; 4UVB B; 5DQV A; 3TLW A; 3UQ7 A; 1KF6 A; 4JI1 T; 4LFA T; 2E5L T; 4UF0 A; 2V6Y B; 4ZOL E; 3UFG A; 1HF8 A; 3P4R A; 2X9Y A; 3CIR A; 2CLY B; 4ZI3 C; 4X1K E; 3AE7 A; 5ABG A; 2C5I T; 2WMO A; 3CQX C; 3NVO A; 1UCU A; 4CN1 A; 3DJB A; 2CE7 A; 2I0M A; 3JAE A; 4PAG A; 5LXT E; 3RX6 A; 3PV0 F; 2N9D A; 1XDO A; 4P0B A; 4UEL A; 4EAH A; 1HNW T; 4CZZ B; 3FZK B; 3EHZ A; 3OVU A; 4O4H E; 1G8X A; 4XZC A; 4DV5 T; 3AE4 A; 4YTN A; 3RKO A; 3AE8 A; 4KP3 C; 4ERR A; 4AKI A; 3NBX X; 3CX6 B; 3HKD E; 4UR9 A; 4TWH A; 5BR8 T; 2V7K A; 1WYB A; 1T98 A; 4TWD A; 1N36 T; 3NZQ A; 3PU8 A; 3MA9 A; 4PJN A; 3FZL B; 3T8O A; 4B3S T; 3AXJ A; 2VWA A; 4H9R C; 3RLF F; 5JDN A; 4KX6 A; 3KV4 A; 5L4H A; 2VQF T; 3AAA B; 4LMJ A; 2I59 A; 2BKN A; 3CKD A; 1GQE A; 2CRB A; 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