2XSBA

Ogoga pugnac complex
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
435
structure length
424
Chain Sequence
MLTGVIEGFYGRDWRRDERATVMDWIAAAGMNTYIYGPKDDVHVRARWRVPYDAAGLARLTELRDAAAARGMVFYVSLAPCLDVTYSDPQDRAALLARVDQLARAGLRNLVLLFDDIPSVLPEADRFDSFAEAQADLSNMVLRHLRGAGHVVFCPTEYCGRMAGGDPRGSAYLQRLGSTLDPAIDIFWTGPEIVSEEIVAAHLAAVGEVLRRRPVIWDNFHANDYDIRRVFAGPLGGRSRDILPLVAGWITNPNNEAEANFPAIHTTGAYLADPDYAPERAIAAAVAAWQPRFRLAFGDGAVPSDLVALLCDLFWQPFALGPETTRILSALRAALTVPRPDPSDPAWRAALEDLRDLKRRINKLFTLMTEIENRDLFHTFHNYLWEAQEEVGHLVAYCDWLDEAPPPGAVFPARGFGVAVQDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords HYALURONOGLUCOSAMINIDASE
publication title Human Oga Binds Substrates in a Conserved Peptide Recognition Groove.
pubmed doi rcsb
source organism Oceanicola granulosus
total genus 164
structure length 424
sequence length 435
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2010-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.240 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 STAT; domain 1 2xsbA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xsbA01
4UFJA 3OLGA 4H2CA 3BAYA 1BSIA 3BLPX 3VD7A 2PWDA 1JDAA 2Y4SA 3SUTA 3II1A 1HL8A 1VFMA 3BGAA 4NRSA 2E0PA 1ZJBA 4JKKA 5FL0A 4UOZA 2JFEX 2HISA 4W8AA 1UD2A 3GNPA 1FFQA 3PTQA 4J3WA 4P8XA 4B9YA 5AC4A 1TR1A 5HOSA 3OA5A 4AZBA 2XUCA 3A47A 4MNKA 1JI1A 2EPKX 3UR7A 3CMGA 1VJZA 1OT2A 1E6PA 1ODZA 1EA9C 2JALA 1WP6A 1E73M 1QI5A 4HU8A 2OSWA 1VEPA 2XWDA 4WKHA 3AIEA 1O6IA 3APGA 4UQ9A 2D3NA 2E8ZA 3VUPA 2CBJA 4TOQA 3A4WA 4HZ8A 1JI2A 2QMKA 2WMGA 4W8LA 3NUKA 2YBUA 5A6AA 3VMPA 1JNEA 3U5YA 3M7SA 1QHPA 3SCTA 3DC0A 1VIWA 1GPFA 1AMYA 1HKKA 1JNDA 3AI0A 3F5KA 1E0WA 1EGZA 4QCEA 3SCUA 2BY0A 4DWSA 4H8HA 1BYBA 4GZEA 1CXKA 1UR1A 4OOUA 1D3CA 5M03A 5I3DA 3MS8A 4W7VA 1QI2A 3CZKA 1OT1A 1FH9A 1BFNA 5I79A 2J47A 2CKRA 1ESWA 1MQRA 4CKQA 4CVWA 3BH4A 2DSKA 3CUJA 4F8XA 2D2OA 3VX0A 3QHMA 3BLKA 2PF0A 5E09A 4MB4A 1V6XA 2J7HA 2XSAA 4Z2JA 3I3BA 3MKKA 1QBAA 4F66A 3SCRA 3CLWA 4PMRA 1TVPA 2PWGA 2JF7A 1CIUA 2ZX7A 3ZJKA 1FH8A 4M56A 3RM4A 4BCEA 1J0HA 1X6LA 3O9NA 2NSXA 3UEQA 2D3LA 3WN6A 4OJYA 4HPGA 3N9KA 2J4GA 1EDQA 1BG9A 3W82A 3WY1A 1UA7A 1H4PA 3AHZA 5I24A 1VAHA 1EXPA 4FF5A 4HMDA 2YL8A 1FA2A 2ZICA 4P8UA 1V08A 2FHFA 5EFFA 1BVNP 3VIHA 2D20A 1QNPA 1ISVA 1WZKA 3E1F1 4P7QA 1TFVA 4PCTA 2WHMA 1PEZA 3AS3A 4MNMA 3ZJ6A 5GNZA 1GHRA 1JYNA 3AZSA 3VMOA 4CU7A 3GXDA 3FHQA 3CUGA 4FLQA 1J18A 1W32A 1D7FA 4QLJA 3CH9A 3KL5A 4S3JA 3AXXA 3GH5A 4CU8A 4GIAA 4EANA 4WLCA 3WF4A 3IJ8A 3N18A 4NF7A 4XB3A 3RDKA 1UUSA 1E6QM 1Y7VA 1KQYA 1ZL1A 1XYFA 2ZOXA 1K6AA 3FY1A 1B90A 2B31A 2WK2A 1UR4A 3AYSA 3W4RA 1H1NA 3W28A 1E4IA 2BV9A 4CVUA 3EMCA 1PPIA 3MUIA 2DPEA 2GK1A 1MVYA 1MQPA 4AIOA 2YOCA 2VC9A 3VD9A 3WDHA 2WVVA 1NWUA 5CQ1A 3TONA 3VU2A 3THCA 2W91A 1VRXA 4L4OA 4OUEA 3T0AA 3EDEA 1V0NA 1MXGA 1GVIA 2RGMA 2VCAA 3TTQA 7A3HA 1WZMA 2WMHA 4WSKA 1M04A 1WDPA 1E4LA 5D9OA 2Z1SA 1E72M 1V3LA 3IAPA 5D8WA 1ZS2A 1W9BM 4GO8A 2CESA 2J7GA 4MTVA 3M46A 4C7DA 4HZ7A 3RILA 3K8MA 1HKMA 5LYRA 2J62A 4UOJA 5BRQA 1IZKA 4N42A 1HJUA 1CGVA 1JZ6A 2X05A 2WVSA 1ZU8A 2D1ZA 2YDSA 1NWRA 4MB5A 5BXRA 3CUIA 5A94A 2WSKA 2BY1A 3SIMA 3NSXA 1C92A 1ZJAA 3PTKA 4PTWA 2JF6A 2WKLA 5CLTA 4JL2A 3N13A 3ARXA 3N1AA 4W87A 3S6TA 1KR0A 1DWJM 2ZUMA 3PBGA 4TX8A 2VCBA 3VIPA 1JDDA 2ESCA 1AQ0A 4B15A 4TVUA 2YLLA 4JKMA 2ZWYA 3WNNA 4AD5A 2G8ZA 2EO7A 3RM9A 1UHVA 1L8NA 4ATDA 2JE8A 3WSUA 1AQMA 1GQLA 3WQWA 2YL9A 1NH6A 3PZUA 5E70A 1G94A 4HP5A 4IPLA 2WYSA 3LPOA 1OCQA 1WE5A 4CCCA 7CGTA 4OIFA 3K4DA 4U3AA 3GXMA 3MUAA 4PRWA 1ZBWA 4P8VA 2GDVA 3VDBA 2Y8KA 4PSRA 2E9LA 2F61A 4W8BA 3DYOA 1OD0A 2DQXA 1W1YA 2GUYA 1HNYA 3B9DA 3OLIA 1TUXA 1V3KA 4AISA 2VQTA 1EHNA 5I23A 3RO8A 3UG5A 1QW9A 4EAMA 2VTFA 1JXKA 3ARUA 2OSYA 5D9NA 3VDCA 2J7EA 4UQCA 4E2OA 3CPUA 3NDYA 3WH5A 2YA1A 1GORA 1V0MA 1LWJA 4AD4A 1OIMA 4P7NA 4KRUA 1JZ4A 1UD8A 1QNQA 3N04A 1OB0A 3WNOA 3DHUA 3UERA 5IFPA 4PMVA 2C8NA 2EXOA 1I1XA 1EQCA 2YIHA 4KGLA 3VGBA 2UY3A 3WL0A 3ARZA 3W81A 1J0KA 4JIEA 4GINA 3TTSA 4B3LA 5A95A 2QPUA 2WVUA 5HPCA 4PUEA 1CXHA 4LYQA 3AS1A 2VX4A 1EDTA 3A3HA 4YN5A 3ZT6A 2YDQA 4CD7A 4WJXA 3WMBA 3AIUA 1EOKA 2FH8A 3K8KA 3FNDA 2F2HA 1UKOA 4L4PA 1HJXA 2XWEA 1M03A 1A3HA 4U2ZA 4FLRA 1G5AA 3OG2A 4AYSA 1BQCA 3VGEA 2A3EA 7TAAA 3WBEA 3WFZA 6A3HA 3BXWA 2DH3A 4U5KA 1HP4A 1HXJA 1F4AA 2QHAA 3OLEA 2ZUVA 1DWHM 1PX3A 3SEPA 5I77A 3SUUA 2XHYA 4UFKA 2O9PA 1C8YA 2BNJA 2XFYA 2DIEA 5M3WA 3F4VA 5I0DA 3WQVA 5GQBA 1R85A 4J3TA 2X8RA 1HJVA 3GNOA 2ZUTA 1UKSA 4AC1X 1OGBA 2EBNA 1VJSA 2GJPA 1K9TA 5D9PA 4JFUA 3CZLA 5BRPA 2PB1A 5C70A 2BXZA 4F79A 1XSKA 3CZJA 1GNXA 4A4AA 2Z1KA 1MW1A 3WH8A 2FHCA 1B30A 2AAAA 5DEZA 3WNMA 1V02E 2PWHA 4AZCB 3AICA 1QHOA 4ZE4A 1MW2A 1X1NA 2VO5A 4JCLA 4AZGA 2G3NA 5HPOA 4JZ5A 5IFTA 3QGVA 1FFRA 2QV4A 3AYRA 2BHUA 1Q6EA 3L4UA 1W9VA 5HXMA 2GJXB 1W1VA 2GK1B 3KEHA 4H04A 2DT0A 2DGAA 4KMQA 2YDRA 2WMIB 2VJXA 5DMYA 1I1WA 5EB8A 4AZ6A 2EPNA 3TTOA 2OYLA 5IHRA 1DTUA 3AHVA 4D71A 2WNWA 1CNVA 2VNCA 2X2YA 2D24A 3QOKA 3DHPA 1OSEA 1HP5A 1TG7A 4LXFA 1AVAA 1X6NA 3FAXA 1XSJA 1V3IA 2WZIA 4J3SA 2XJ7A 3ZJ8A 3A4AA 3VINA 1SMDA 4Z2LA 3WMSA 1LL4A 1SFSA 1KXVA 3AZTA 3ZMRA 4U3CA 3W26A 3WNKA 1E71M 1UZ1A 3RJXA 4XX6A 2VR4A 5D9MA 4F9DA 4CD5A 1J11A 4Q22A 1NOUA 1XV8A 2VZOA 1BAGA 1U30A 1LL7A 4UFMA 1E1FA 5LA0A 1BHGA 5DT5A 1FHLA 3WD4A 1J0IA 3EDKA 2A3HA 2VCCA 1UUQA 3MUY1 4HOWA 5FL1A 3PZIA 1KCKA 2D0HA 1R8LA 1BG4A 2AMGA 1MXDA 3WIJA 3SCNA 3IK2A 1MWOA 4AZHA 2YA2A 1KR1A 3OZOA 5A8NA 3WF2A 1ISWA 1CPUA 3ARSA 4D1IA 5BYWA 3FW6A 1FOBA 5CJ5A 1EQPA 3VGHA 4ZFMA 2J7BA 3HN3A 1CGWA 3VIOA 2JEQA 1GCYA 3LPFA 2JEPA 3NIYA 1UQZA 3VM5A 4AXNA 1LG1A 2A3AA 4JFTA 2QPSA 3WMCA 4CCDA 1PZ3A 3ARTA 1NP0A 2WC7A 1VEMA 2J79A 1V6YA 4URIA 4UTFA 2OWCA 1MFVA 4AMCA 4XZWA 2VQUA 3CUFA 2XTKA 2CIPA 2A3BA 4LGXA 2JIWA 3NSMA 5GNYA 3GDBA 4RE3A 2E3ZA 4MJ4A 3WDIA 1GQIA 5JIWA 5BXSA 6TAAA 5A6BD 3D3AA 2WMFA 3S2CA 1UD3A 2VI0A 2XVGA 3RIKA 3CUHA 2D23A 4HA3A 1B3YA 1JFXA 4BZYA 3WDRA 2VX5A 4UZSA 4GKLA 1JYXA 1CZ1A 4DUVA 5AC5A 3OBAA 1J0YA 4E8CA 1KQZA 1MW0A 3WDQA 1GQJA 1H11A 1J0ZA 1ISYA 1CYGA 2ZXDA 2J7DA 3PZGA 3W53A 2WMJA 4BQ5A 1CXIA 3MSDA 1NM9A 4GZIA 3U7VA 4NSBA 2D0FA 4QP0A 3CMJA 1EOMA 1DP0A 3AFBA 4RE2A 3ZR6A 4BF7A 4V27A 3GYCA 4HU0A 3UESA 1VFUA 1H09A 3W29A 5GNXA 1W1TA 3L4ZA 3U7BA 1UWUA 1NWTA 3EBVA 1G1YA 1ECEA 2ZXBA 3AOFA 4TTUA 4J28A 1VFFA 4ZXLA 3WBAA 1UWIA 1ITXA 2E9BA 5EFDA 1E1EA 4C7GA 4W93A 3AS0A 2Y5EA 1LF1A 3WD3A 3F5JA 4JAWA 1LG2A 3K46A 1A47A 4W84A 3FHAA 3RMEA 3OB8A 5A2AA 3SCWA 2UY2A 1E6XM 1W2PA 4CD8A 3WENA 1ZB5A 4DM2A 2CEQA 2WANA 2XIBA 5IXEA 3AZRA 1JAKA 3CGTA 2EPMX 3ZM8A 3W27A 2WCSA 3BSGA 4AEEA 3SUVA 4WF7A 1VB9A 1OIFA 1UD5A 1UKTA 3KE0A 1WO2A 1R7AA 2DSWA 2CITA 1QNSA 2BY2A 1JAEA 1NARA 3CZ8A 3QHOA 3AROA 3T08A 1LJYA 4AZCA 1G0CA 2ZUNA 3MMUA 1UQYA 4LQ1A 1B3WA 5CLWA 3B9AA 1UR9A 1TCMA 5KEZA 2W4XA 2CERA 2GJXA 4PMXA 5A2CA 5FKYA 1NOFA 4IPNB 2XSBA 4UR9A 2WMIA 1C8XA 3LPPA 2VX7A 1GZJA 4Z2GA 4CN1A 1D2KA 1GOKA 2FH6A 1WZLA 2EPOA 1OBAA 5BROA 1E6SM 3GZAA 2NW0A 4ATLA 1CLXA 1B3ZA 5A6BA 1LQ0A 2UWFA 4RL3A 5BCAA 1SR0A 3VGDA 1R87A 4CCEA 4OBRA 4J3UA 1UWQA 1V3HA 1KBKA 3WD2A 4CN6A 4PMNA 3WH9A 2Y2WA 1MYRA 1B2YA 1BYDA 2F8QA 1Q6GA 4X9YA 1E40A 3SCSA 3WQ4A 4CGTA 1LWHA 4E8DA 2J25A 4PCSA 4KGJA 3OGVA 4PTVA 3AHTA 1GOWA 5HBFA 2DH2A 3FXYA 3VGGA 1CXLA 2FGZA 3ZJ7A 2XGBA 4AIUA 4OOZA 4QFUA 2X1IA 1BLIA 4S3KA 1HJWA 1HX0A 1E3ZA 5FD0A 1RP8A 3VX1A 5E6YA 4U31A 5I78A 1JYWA 1EIBA 1XH0A 1KGXA 2WBGA 1E15A 4ACZB 2CNCA 4QAWA 3L2MA 3SCQA 1HJSA 3BAJA 4W7WA 3MMWA 1XHGA 3W6MA 2QMJA 2QLYA 4PEEA 1FH7A 1SYTA 1JYVA 1SMAA 3W25A 2GVYA 3VD3A 1E70M 3PZTA 1JF6A 5E0FA 1W3KA 1PX4A 1PIGA 1PBGA 1J0JA 2MANA 1J12A 1C93A 3M6DA 2A3CA 4Q7NA 2XFFA 5E6ZA 5E9AA 2BXYA 2W66A 2ZXAA 3FAWA 4FMVA 3AMLA 5ABHA 1QNRA 5DT7A 1ODUA 1GOQA 3UCQA 2PBGA 4W89A 1UWSA 1BF2A 1OINA 2ZWZA 2VRJA 3WUBA 4H8UA 4UCFA 1WPCA 1UH3A 1US3A 2ZE0A 4Z2HA 5C71A 3MV11 3ARRA 1JZ8A 3GH4A 4PYSA 4JCMA 4K68A 5FOOA 3VTRA 4ATWA 1CENA 1CECA 1JIBA 1WAWA 3ECQA 1H3GA 4TTGA 3FN9A 1EO5A 3CZEA 4OKDA 1UR2A 3PTMA 2IUZA 1TVNA 1BTCA 1KWKA 2XIIA 1W3HA 4EE9A 4Z2IA 1US2A 1O7AA 4J27A 3IANA 1M53A 5M17A 1Q4NX 4FLOA 3CTTA 2PWFA 1IT0A 5JBFA 2J78A 4P8WA 2ZUUA 3WFLA 5GPRA 3BCFA 3LPGA 3T2QA 1JD7A 5CPSA 3QOMA 1E55A 4GI6A 5LA2A 2FHBA 3JUGA 4TXEA 1UOKA 5A1AA 1C7TA 1W91A 3EYPA 4WK9A 4JL1A 2E8YA 4PMOA 4YPJA 1XH2A 4J3XA 4W5UA 2ZUSA 1JG9A 3VIGA 4HPHA 1C91A 3GH7A 2CPUA 1GOIA 3IJ7A 1YQ2A 1VFOA 1GONA 1E5NA 3KZSA 3WH6A 1Q6DA 2ZUWA 3L2LA 4TVCA 4TVDA 4AEFA 4B3KA 3BAIA 3G6MA 2OYMA 5CGTA 1JL8A 5D8ZA 3ALFA 1UR8A 3B8SA 1E6ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1KGW A;  4DWS D;  1ZBK A;  8A3H A;  1QVB A;  3SCO A;  3VR8 A;  4NZJ A;  3BOL A;  3GFX A;  1H0I A;  3IJI A;  5BMW A;  3DTO A;  1F6Y A;  4ZQM A;  3VDG A;  3WQ6 A;  3UQ7 A;  3HGJ A;  1KM1 A;  1M62 A;  3VHL A;  3U57 A;  1CGU A;  3L9C A;  3S1U A;  4ASK A;  3C2F A;  1U5H A;  5DML A;  3UZY A;  3KBM A;  4O18 A;  2HDJ A;  1QOP A;  3AMD A;  1RQH A;  3EX3 A;  5HEH A;  2BY3 A;  1QI0 A;  4HZ6 A;  3MW7 A;  3UP8 A;  4JQ3 A;  3IRD A;  4GNV A;  1MMA A;  4AG0 A;  4MWA D;  2Z28 A;  2A3L A;  8CGT A;  4LF5 T;  4ZXO A;  2GVE A;  3PZV A;  3VPL A;  4KIE A;  1T40 A;  4Z90 A;  4PUK A;  3L0K A;  2PDU A;  4AH7 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 4UFJ A;  3OLG A;  4H2C A;  3BAY A;  1BSI A;  3BLP X;  3VD7 A;  2PWD A;  1JDA A;  2Y4S A;  3SUT A;  3II1 A;  1HL8 A;  1VFM A;  3BGA A;  4NRS A;  2E0P A;  1ZJB A;  4JKK A;  5FL0 A;  4UOZ A;  2JFE X;  2HIS A;  4W8A A;  1UD2 A;  3GNP A;  1FFQ A;  3PTQ A;  4J3W A;  4P8X A;  4B9Y A;  5AC4 A;  1TR1 A;  5HOS A;  3OA5 A;  4AZB A;  2XUC A;  3A47 A;  4MNK A;  1JI1 A;  2EPK X;  3UR7 A;  3CMG A;  1VJZ A;  1OT2 A;  1E6P A;  1ODZ A;  1EA9 C;  2JAL A;  1WP6 A;  1E73 M;  1QI5 A;  4HU8 A;  2OSW A;  1VEP A;  2XWD A;  4WKH A;  3AIE A;  1O6I A;  3APG A;  4UQ9 A;  2D3N A;  2E8Z A;  3VUP A;  2CBJ A;  4TOQ A;  3A4W A;  4HZ8 A;  1JI2 A;  2QMK A;  2WMG A;  4W8L A;  3NUK A;  2YBU A;  5A6A A;  3VMP A;  1JNE A;  3U5Y A;  3M7S A;  1QHP A;  3SCT A;  3DC0 A;  1VIW A;  1GPF A;  1AMY A;  1HKK A;  1JND A;  3AI0 A;  3F5K A;  1E0W A;  1EGZ A;  4QCE A;  3SCU A;  2BY0 A;  4DWS A;  4H8H A;  1BYB A;  4GZE A;  1CXK A;  1UR1 A;  4OOU A;  1D3C A;  5M03 A;  5I3D A;  3MS8 A;  4W7V A;  1QI2 A;  3CZK A;  1OT1 A;  1FH9 A;  1BFN A;  5I79 A; 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