2XSBA

Ogoga pugnac complex
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
435
structure length
424
Chain Sequence
MLTGVIEGFYGRDWRRDERATVMDWIAAAGMNTYIYGPKDDVHVRARWRVPYDAAGLARLTELRDAAAARGMVFYVSLAPCLDVTYSDPQDRAALLARVDQLARAGLRNLVLLFDDIPSVLPEADRFDSFAEAQADLSNMVLRHLRGAGHVVFCPTEYCGRMAGGDPRGSAYLQRLGSTLDPAIDIFWTGPEIVSEEIVAAHLAAVGEVLRRRPVIWDNFHANDYDIRRVFAGPLGGRSRDILPLVAGWITNPNNEAEANFPAIHTTGAYLADPDYAPERAIAAAVAAWQPRFRLAFGDGAVPSDLVALLCDLFWQPFALGPETTRILSALRAALTVPRPDPSDPAWRAALEDLRDLKRRINKLFTLMTEIENRDLFHTFHNYLWEAQEEVGHLVAYCDWLDEAPPPGAVFPARGFGVAVQDIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Oceanicola granulosus
publication title Human Oga Binds Substrates in a Conserved Peptide Recognition Groove.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HYALURONOGLUCOSAMINIDASE
total genus 164
structure length 424
sequence length 435
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2010-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.240 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 STAT; domain 1 2xsbA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xsbA01
1WDPA 1SMAA 2RGMA 6TAAA 1E56A 1KXTA 1JNDA 3II1A 4HA3A 3WDQA 3WH8A 1V3MA 3GYCA 3ARZA 3B9DA 3WD2A 5JIWA 1V6VA 3RCNA 1E5JA 3MUZ1 3CPUA 1SYTA 1EH9A 1H5VA 4W7VA 5EFDA 3BH4A 4W87A 1HJSA 3WNOA 4HOXA 4HPHA 4LX4A 5FD0A 3WDRA 2WMIA 4FF5A 1VRXA 1V3HA 2WAGA 4KGLA 1TVPA 3ARPA 2X09A 3BAXA 1C7SA 3MMWA 1VBRA 4CN1A 3SCPA 3BGAA 1WO2A 3K46A 3RPMA 1QI2A 1KCLA 3VGFA 5CGMA 1V3KA 1UUQA 1HJQA 4J3XA 5HXMA 1EQCA 4P8VA 3AIRA 3MUIA 3APGA 3K8KA 5A6KA 4QP0A 1Y7VA 2QLYA 1UH4A 1NARA 1WKYA 2J25A 1LQ0A 1HVXA 5A8NA 3OGVA 1RD6A 3CUHA 5JBDA 4J3TA 1J0YA 3WQ6A 3WH7A 1RPKA 1CXEA 3D3AA 4CVWA 4U3AA 3ZJ8A 4MNJA 4WKHA 2FHBA 3T2OA 3WEOA 3ARTA 2VJXA 3NUKA 2WKLA 1XCXA 1TG7A 1LF1A 3CO4A 5HDRA 4P8XA 1PBGA 1OD8A 2NT1A 2G3NA 2VR4A 1M01A 1DWIM 4QCFA 3AHXA 3MU7A 3KWXA 6CGTA 1L0PA 4H8HA 3T0AA 2J7EA 1JAKA 2DQXA 2XIIA 5DO8A 4Z2GA 1SMDA 3VM5A 1GW1A 4UCFA 3PTQA 4OZOA 4MB5A 2VVSA 2YDRA 3WQ4A 2D0FA 2WSKA 1CEOA 2Y8VA 1LLOA 1XGZA 1G1YA 1Q6CA 3VD9A 3WFLA 2ZUSA 4KWUA 4X9YA 2WZHA 7A3HA 2YDSA 1E6PA 5M03A 2GVYA 1E3ZA 2PWFA 1OB0A 1W9XA 5CG0A 3UR8A 3ALFA 4D1IA 1UA3A 2EJ1A 3HMCA 1XRVA 4H41A 3ZT6A 1OGSA 2BVTA 1QNSA 1TZ7A 3OBAA 3AHTA 2HISA 4NZCA 3F4VA 4PSPA 3ZOAA 2J79A 3BXWA 2QPUA 5JBFA 2VMFA 1E6ZA 4J3UA 4PTMA 5GPRA 3CUJA 2YKKA 1E3XA 1FFQA 1KWGA 4W88A 1JG9A 3PZOA 2J8FA 4AEFA 7TAAA 1HIZA 2BY3A 1C90A 1R7AA 4ZEPA 1JZ4A 3VDHA 5HNNA 2WNWA 4UOZA 2W92A 2UY4A 2V38A 5BRQA 2OYLA 1SFSA 4W85A 2VX7A 3WDPP 2VVNA 2J7BA 4AY1A 3EDDA 3EMQA 3UR7A 1CECA 5I6SA 5A8OA 3WF3A 2XYLA 1UD4A 4W7WA 3W26A 1V02E 2W91A 4D71A 4AW7A 3KL0A 4LYRA 3L4WA 5AYBA 3RILA 4U2YA 5A6SA 1B3VA 1EGZA 4PMOA 4JCMA 4WIWA 4W93A 4HOWA 5IFTA 1CLVA 1JDAA 3QOMA 3AIEA 4P7LA 2WVUA 1ISXA 4B9YA 4CUCA 3L4YA 3GZAA 5KZ6A 4AYSA 1UH2A 3VGBA 1I75A 1OINA 2Z1SA 1DHKA 4GINA 2WC3A 3AHVA 3ZJKA 3UG4A 5D8ZA 4PSRA 4AZIA 1ZBKA 3WH6A 3DYPA 1M7XA 2W4XA 1ZBWA 2QHAA 4CD5A 4HTYA 3PZTA 1ZJAA 3PN8A 3U57A 4F9JA 3SIMA 4F66A 3N18A 3CLWA 3WMCA 2YBUA 3CIVA 2WBKA 2V5CA 3VNZA 1TFVA 4AISA 1XH1A 3WNMA 4ML4A 4JL2A 4MAVA 3ZR5A 3MO4A 4MNLA 4BQ2A 1HKKA 4J28A 1CIUA 1J01A 3QR3A 1R87A 4H8VA 2IUZA 2WB5A 2WCAA 4YHEA 1FFRA 3L4UA 4UTFA 5CXPA 2YLLA 3WEZA 5BYWA 2WC4A 2DSZA 4YHGA 5D9MA 2CXGA 1JI2A 3PZIA 3ZM8A 1JYXA 2OWWA 2JALA 2WW5A 1W3JA 4CD7A 1F4HA 1VEMA 3MSDA 5I0DA 1OD0A 4X0NA 1CPUA 1WDQA 3TOPA 2QV4A 4HU8A 3EDEA 1VEPA 5GNYA 1XV8A 5CLWA 3AZRA 5I77A 2B31A 5ECUA 3NSNA 2WMIB 3CUFA 2F2HA 2Y5EA 2YOCA 1OIMA 4PTXA 2DH2A 1JYVA 3WQWA 1CDGA 4MB4A 1HP5A 2WCSA 1CGUA 3F5JA 4OOZA 2XSAA 4M81A 4GZEA 5IHRA 4OJYA 3PZGA 3WH5A 2VZSA 1ECEA 2CESA 2XJ7A 4M1RA 3MUY1 3BAJA 1GONA 2XVLA 4AD1A 2BS9A 3NCOA 1J12A 1G94A 4MB3A 3RJXA 3VIHA 3WMBA 5IHSA 1VB9A 4J27A 1IV8A 3MKKA 3WFZA 4EE9A 8A3HA 2PI6A 2OLHA 3RMEA 3WNPA 4XX6A 4AD0A 3AMLA 2EEXA 4WSJA 5DMYA 1H0IA 1QNOA 2EPKX 1V6YA 2J4GA 2XSBA 2OSWA 4E2OA 4E8CA 2C8NA 2PBOA 1WNOA 3DYOA 5D9PA 2FGLA 5GQBA 1E6RA 3FXYA 4JHZA 4BCEA 3AXHA 4IISA 1LL4A 3AXXA 1Q6GA 2XVNA 4W8LA 3POCA 1H1NA 5DFAA 4DWSA 4MJ2A 1GUVA 2J74A 4X0VA 4UQAA 1W1PA 2AOSA 2OSYA 1UURA 5CSUA 4LXFA 1WZMA 5A2CA 1J0KA 1XHGA 2O9TA 1QOXA 3CHDA 2E8YA 4JFUA 3GNOA 4WF7A 2Y4SA 1GOMA 1ZU8A 3N17A 5CSYA 2W61A 4EK7A 4QLLA 3SCNA 1ISWA 3DECA 2DSKA 5CQ1A 2BHUA 3MV01 1J9YA 1HXJA 4PYSA 3PZ9A 2E9BA 1OM0A 1C7TA 3VNYA 1CGWA 4CCCA 4GZIA 3U7BA 4TVCA 1PZ2A 4QLJA 3UEQA 2X0YA 2XVKA 5A2AA 3BAKA 1Z32X 4IPLA 2F8QA 4AZ5A 2WZEA 1X1NA 4DUWA 3WEMA 4B3KA 1UWIA 3AMDA 1L8NA 4GQRA 3WQ8A 1TA3A 2ZE0A 2J7HA 2J7DA 1ISZA 2WHKA 3U7VA 4AZ7A 1MVYA 1K6AA 1MWOA 4GQQA 4HZ6A 5I78A 4QAWA 3OA5A 1W91A 4MPKA 3FN9A 3RM9A 5JIPA 3SCUA 3ZO9A 1IZJA 4M80A 2GDUA 2VQTA 1V3IA 1UD2A 4P7RA 3VD7A 2F61A 4U33A 1BAGA 2ZUNA 1ZS2A 1DP0A 1BG9A 1WB0A 4MB1A 4PUDA 1W3KA 1YHTA 3VGDA 2WYSA 5D9OA 5A6BA 1HT6A 1JXKA 3W27A 4GZJA 2WVVA 1E40A 1JF5A 1OCQA 2VR5A 3L4TA 3L4ZA 2XFFA 4NSBA 3QHOA 2ZWZA 3ZMRA 1R86A 4NRSA 3AHYA 1LL6A 2ZX8A 3RDKA 2X1IA 4F9DA 3VIJA 3SURA 2VX4A 1CLXA 1JYNA 1JL8A 3GM8A 4CU6A 1R7OA 1UD8A 3RJYA 3AMKA 4AMCA 1WZAA 1JGIA 3AOFA 4RL3A 2QMJA 2D0HA 2YL8A 1JZ6A 1GOWA 4U5KA 3WN6A 1VFUA 1EXPA 3MS8A 3T2QA 1UR9A 2ZXBA 4D6FA 1CENA 2XWDA 2NSXA 1V08A 3VIPA 3AYSA 4P7NA 4EANA 2JF6A 4C7DA 1VAHA 2WWDA 3GXFA 1FHLA 2J7GA 4DUXA 1WP6A 2CITA 4S3KA 4IPNB 7CGTA 2JF7A 4ZXOA 1JZ7A 1MW2A 1E6SM 4CCEA 2J7CA 1W9VA 3N13A 2D22A 4KH2A 5DT5A 4AC1X 2E40A 4D1JA 1UHVA 2DSUA 1VJSA 4ZFMA 1HL8A 3L2LA 1V3JA 4N0RA 5LA1A 1O7AA 4W8AA 3OLDA 3EMZA 5A69A 3BLPX 3KZSA 4W5UA 4AD2A 3WH9A 3WD4A 3WF4A 1UD3A 3F5LA 3F5KA 2X05A 2AMGA 2YDQA 1HP4A 2A3AA 4FLSA 2XGIA 3CH9A 1EA9C 1JNEA 5EBAA 1QW9A 4W8BA 5HPOA 1E72M 1CGTA 1QI3A 3ZT7A 4XZWA 2BFGA 4AIEA 3VIMA 5IFPA 1UR8A 3A4AA 3WF0A 3OLGA 2D0GA 3TP4A 1E15A 3EDJA 3MV11 4CCDA 6A3HA 2CKSA 1KXQA 1UH3A 1GORA 1GOOA 1PX3A 1GCYA 5ABFB 3WF1A 1WDSA 3VMNA 1GQIA 3BCDA 1CBGA 1NWTA 3W6MA 3BMVA 1QNRA 3PZMA 1BVZA 2YBTA 1DWFM 4W86A 3WNKA 4UQEA 1G5AA 4AZ6A 5ABHA 5D8WA 1C8YA 2DT2A 1K9TA 1D2KA 4JL1A 1JYWA 4Q7NA 3VINA 1XCWA 1VEOA 1JAEA 1E0WA 1CGYA 3ARVA 2G3IA 4UFJA 3VKKA 2XUCA 4JIEA 1DWGM 4JFVA 1KQZA 1NWRA 1VENA 5LA0A 2GFTA 2WHMA 3N9KA 1KXHA 3RO8A 1E70M 1M53A 4ATLA 3GXMA 1HVQA 1JI1A 4PMXA 1H3GA 3UERA 1Q6DA 2V3GA 5E6YA 2J47A 2NT0A 2DT3A 4E4PA 4GXPA 3VIIA 4CD6A 1JZ8A 1H11A 5C70A 1HJVA 1KR1A 2G41A 3CTTA 2CHOA 3N15A 3IANA 2VL4A 3O9NA 1WE5A 4UFIA 2BY0A 5A94A 4CVUA 1EQPA 3ZQ9A 1K9DA 1PX4A 1OT2A 2Y8KA 3RIKA 3LPPA 1US2A 1CZ1A 1QI4A 3S6TA 1GOQA 5GNZA 1GHSA 1VFFA 4MADA 1UKQA 3WUGA 1V0LA 4U31A 2O92A 3I3EA 3WL0A 1PIFA 1NH6A 1UKSA 1GQKA 1HL9A 3EYPA 2VRJA 1JZ5A 1W2VA 2YLAA 4HMEA 4AIOA 3K1DA 3TONA 3U5UA 2UY5A 4PMZA 5IDIA 3FY1A 3N12A 2E9LA 3LMYA 5M17A 4Q22A 1KGUA 4CU8A 4CD4A 1UKOA 1TA3B 2ZOXA 3VILA 3SCTA 3SUTA 2W66A 2CBJA 2J62A 5BROA 3GXIA 2OYKA 4GKLA 4LQ1A 1W2PA 5I79A 3DC0A 5ABGA 1WZLA 3AIBA 2FH8A 4Z2HA 2VX5A 2BY1A 1U2YA 4HA1A 3VO0A 3WD1A 3NSMA 1JF6A 5EB8A 4UFMA 1KBBA 3WDJA 1BYBA 1RP8A 2WVSA 3G6LA 1QW8A 1B90A 4KGJA 4URIA 4PMYA 2VCCA 3AHZA 4ACYA 1US3A 4D6CA 2WLYA 5A1AA 4UOQA 3W24A 2W62A 5A6AA 3BMWA 1QBBA 2E4TA 2EPNA 3VMOA 3ZJ6A 2WVVB 5E70A 2W67A 2WPGA 2VNCA 1C8QA 2ZUVA 4HZ7A 4FK9A 5BWFA 3NYDA 4P8UA 1E4LA 4HMCA 4AZBA 4CD8A 4C7GA 2VOTA 3WUEA 3VGGA 3SEPA 4JKKA 4B15A 1K9EA 1PX8A 4OBRA 4PMDA 1LL7A 4QFUA 3U5YA 5A8PA 1QNQA 3B8SA 1H4PA 1HNYA 3LPOA 5LA2A 2VCBA 2ZUTA 4JFTA 2V3EA 2CIPA 1XD1A 1HKJA 3HN3A 3VDAA 3ARRA 5FL1A 1UA7A 1X6LA 1XYZA 1FP8A 5FKYA 3CZ8A 1ODUA 1EO5A 4N42A 4AIUA 3AZSA 3OZPA 5LYRA 3BSGA 1UOKA 1E73M 4M24A 3VX0A 1CWYA 3WSUA 2ESCA 2J8GA 4D6IA 1H49A 3S2CA 5HOSA 5GNXA 3SCOA 2PF0A 2FHCA 4GO8A 1KFWA 5DF0A 1KBKA 4UZSA 1GVIA 2WWCA 5E0CA 2CBUA 3D5HA 4Z2JA 3N04A 4MNKA 2ZX6A 3WNNA 2DSWA 2E9MA 5A2BA 3POHA 2IXVA 2XFRA 5E9AA 1VFOA 3THDA 1B1YA 1JD7A 5I24A 3AFBA 3W29A 1W1VA 3SCVA 3W28A 2XVGA 2ZX7A 2WMFA 1E6QM 3MSGA 5BXTA 2OWXA 4MNMA 2GJXA 5BXSA 2VZOA 4ACZA 2BHZA 2MANA 2VZVA 5A8MA 2OSXA 4JKLA 1GPFA 1UR4A 1GOIA 3T08A 1GVYA 3ARWA 3W6LA 3NDZA 1O6IA 3WL1A 2GSJA 8CGTA 3VIFA 2O9PA 4M8UA 1W9PA 1CXKA 3ECQA 2ZUWA 5A6MA 1QPKA 1PAMA 4J7RA 2DEPA 1AMYA 1V0KA 2ZUMA 4TVUA 4TTGA 2EQDA 3IJ9A 3AI0A 1J0HA 2V5DA 1ZJBA 1MXDA 4V27A 3SCQA 1Q4NX 1E6NA 3CHCA 3VX1A 1AQ0A 1TVNA 4V28A 4DM2A 1EDGA 2ZXQA 3WNLA 1UD5A 3L4VA 3ZR6A 1QI0A 3CZEA 4W7UA 1GOKA 5AC4A 4NRRA 4Y7EA 1W9DM 5DEZA 2ZX5A 4AEEA 3B9EA 3IK2A 1X6NA 3AZTA 1GQJA 2HVMA 1KB3A 1E9LA 4HMDA 2J7FA 3CMJA 4UQDA 4ATDA 4PN2A 3CUGA 4MDPA 3AS0A 3NIYA 4WKAA 1KGWA 4JAWA 4H8UA 2VRQA 2VCAA 4EAMA 4YPJA 4FMVA 2Z1KA 3IAPA 3QOKA 5I5RA 2QMKA 3L4XA 4GPNA 1UQYA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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