2XM1A

Btgh84 in complex with n-acetyl gluconolactam
Total Genus 244
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
244
sequence length
712
structure length
645
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKQSSKKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVERNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMLPLQVKANRVLISPEIELDAIYPGENIQINFLSAGLQKAPVKFVRFQFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibition of a Bacterial O-Glcnacase Homologue by Lactone and Lactam Derivatives: Structural, Kinetic and Thermodynamic Analyses.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 244
structure length 645
sequence length 712
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2010-07-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2xm1A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xm1A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2xm1A01
2C7FA 4B15A 3S2CA 1KXQA 1BGGA 4E2OA 4URIA 1JF5A 1W9VA 3WBAA 2DIJA 1BTCA 1U33A 1CGTA 3RCNA 2WWCA 3BAJA 3POHA 3AFBA 4Q22A 1IV8A 1J9YA 3EYPA 3O6AA 2B31A 2PF0A 3PZGA 2G3NA 3WQ5A 3ZJ8A 3HMCA 2J25A 3AMKA 4HOWA 2WLYA 3DYMA 1EQPA 1CENA 4BQ2A 1E9LA 1XH1A 3MKKA 2WM0A 1W3KA 4AZIA 2GK1B 3AIRA 3HJEA 2WCAA 4WKHA 4CCCA 5D9NA 4JAWA 1HP5A 2YDQA 2DDXA 2PBGA 3AJ7A 4P7NA 1XH2A 1E3ZA 2BY2A 1XD0A 2D24A 2IUZA 5AC4A 1JNEA 1NM9A 1FP9A 4CVWA 1RH9A 1J0ZA 4OUEA 3DYOA 1VRXA 3CZJA 3QHNA 1ISZA 3ZT7A 4X9YA 1OT2A 1E1FA 1B0IA 3WEMA 3WIJA 2FHFA 3A3HA 4P7RA 2GJXB 1ZBVA 5D9MA 2FHCA 1PX8A 4CKQA 5A6LA 4XUYA 3WQVA 2W63A 4UQEA 1C93A 3SURA 2WMFA 1E6SM 1H4PA 2G3MA 3T2OA 3AZRA 2BNJA 4HOXA 3FY1A 1VBUA 3BMVA 4CGTA 4C91A 2DEPA 4ZEPA 4CCDA 2FGLA 1C92A 3AROA 4MB1A 4CUCA 4QLLA 2WVSA 1JG9A 4OBSA 1UD8A 4CD5A 3M6DA 3TTYA 3MSGA 3UETA 1B30A 5CJ5A 1UWRA 4AD2A 5BWFA 4TTGA 1CGXA 3L4WA 1SMAA 1HL9A 3N04A 3ZJ6A 1K9DA 2QMJA 3AXHA 4MB5A 2VVNA 3AOFA 1QI4A 3IAPA 1E6RA 3ZQ9A 5ECUA 3WL1A 2JEPA 4AZ6A 1KQZA 2QV4A 1V3IA 1VJZA 2VI0A 1WDQA 3PZIA 3OGSA 5CQ1A 2J47A 3I3DA 2XFFA 2BVDA 1BAGA 5E09A 1G94A 4F79A 1C90A 1KBBA 4J3TA 4ZENA 1UQZA 2WCGA 4HA1A 5GNXA 3VD7A 1UQYA 3O2LA 1WE5A 4P7QA 1V6UA 4QCEA 1JD9A 2A3CA 5FIPA 1R7AA 4WSJA 1E0VA 5I6SA 2WXDM 2D0GA 3W81A 3VOCA 1FH9A 1B9ZA 1G9HA 4ATWA 1MW3A 1PZ3A 5A6MA 1NWUA 2BVYA 3SCSA 1XHGA 2CBUA 1V3KA 1HX0A 1WZAA 4GI6A 5ABGA 1G01A 1MXDA 3RIKA 5EFDA 4JL2A 2X8RA 5D4YA 2QPSA 3WD3A 1W1PA 1E4IA 3GH4A 1TVNA 2D22A 2O9PA 1J18A 3VO0A 4FLRA 1QI3A 3WDHA 5E0CA 1UKSA 2X2YA 2VOTA 2J7EA 5I3DA 1MVYA 1XYFA 2VX4A 3BC9A 3GXIA 2ZX7A 1RD6A 2CIPA 5CPTA 1E70M 2QLYA 4WJXA 3WD1A 3G6MA 4C7GA 2YDSA 3WD2A 5ABFA 3NUKA 1DWFM 5E6YA 2BXYA 1FOBA 3SEPA 3WNLA 1JYWA 3N9KA 4NF7A 1H09A 3PTMA 4W87A 1OIFA 4NRSA 1PIGA 3WNMA 3WF0A 1BVZA 4P7LA 5BXSA 2YDRA 1UR4A 4EK7A 1PX4A 1KXHA 1UR0A 2OYKA 3VGBA 2Y8VA 5A6BD 4X0NA 1UR9A 1ISXA 3VIJA 4HZ8A 1GQKA 2VR4A 1JF6A 3OBAA 5FOOA 1OCQA 2PI6A 2OWXA 3WF4A 2JIEA 4CN1A 4H8UA 1FFRA 3AMLA 3PZQA 4LGXA 3ZSSA 3AXIA 3VGHA 8A3HA 1F4HA 3CBWA 3WDIA 5IDIA 2C8NA 1HJUA 3BXWA 1NWTA 3I3EA 3CH9A 3DHUA 1NH6A 1ZL1A 2WHJA 5BRPA 1FH7A 3OIHA 3WUEA 2XSBA 1V6WA 2OSXA 3M46A 1QI2A 1UR2A 1GOOA 2BHUA 1R86A 3ZR5A 1HJXA 4MAZA 3BAWA 2DH3A 3VGFA 1QNQA 3T2QA 4P7OA 4PBGA 2WMGA 3AXXA 1CGYA 1FP8A 4KGJA 1TMQA 4FMVA 1LJYA 2D20A 4D1IA 1C8XA 5A8PA 1BLIA 2E9MA 1CGWA 3ZT6A 1MW1A 2XHYA 3VILA 2VURA 1QVBA 3ARRA 2GVYA 4HPHA 4TX6A 2J7GA 4CU7A 1V02E 3AS1A 4GO8A 4GIAA 4D6JA 1UWTA 3MU7A 4JIEA 4GZJA 4H8HA 2FH8A 2DH2A 1E0WA 2UY4A 3WN6A 1W1YA 1EDQA 2Y8KA 4U2YA 1UKPA 1MFUA 3W53A 1SYTA 1NQ6A 4PCSA 1JFHA 1BYDA 4J3UA 5DT7A 4E8DA 4K68A 1QW8A 1SR0A 1SFSA 3D5HA 3VDCA 1V3MA 1CGVA 3FAXA 2EBNA 1JZ6A 3F5JA 2XM2A 5CPQA 2WPGA 2DQXA 1GQJA 5I77A 1C8QA 1W3JA 3SCTA 4WKAA 5KEZA 1ZBCA 3ARWA 1US3A 1BGAA 2VR5A 1EO5A 4H04A 1K6AA 3AS3A 3VD4A 2VCAA 1VJSA 2XSAA 2YLLA 4J28A 4XZWA 6A3HA 4H41A 4Z2LA 3KE0A 1JYNA 4LYQA 4AEEA 1US2A 4ZFMA 5BXTA 2J8FA 2CPUA 3AZSA 3K8MA 1TA3B 4WF7A 1BFNA 4AZCA 5A6KA 2VZOA 4ACYA 4DWSB 3A47A 1UH2A 3CMGA 5AC5A 1UR1A 3W28A 2WANA 3KL0A 2F8QA 3RPMA 5M03A 3EBVA 1E56A 1VENA 9CGTA 4GINA 1GORA 2QHAA 1EXPA 2E8ZA 4F9DA 2CHNA 1BYAA 1JZ8A 2CYGA 3AHXA 3FW6A 2QMKA 2YA0A 2XYLA 4HZ7A 2PWFA 3RM8A 1P6WA 5AY7A 1NWRA 3CPUA 4XZBA 2IXUA 4ACZB 2DT0A 3CO4A 2G3IA 1NP0A 4UQ9A 1FFQA 1PAMA 2VX5A 3L4ZA 2EPLX 3WSUA 2OSYA 3GH7A 4M56A 2WKLA 3U7VA 3IAQA 4AWEA 1DWIM 5F7UA 5CXPA 4ZE4A 5JBDA 4HMCA 5HPOA 4D6HA 1QBAA 4UZSA 5FCZA 2VRKA 5I2UA 3IJ7A 3T0BA 4J3VA 1ZJAA 2ZUMA 2JIWA 3GNRA 3THDA 2UY3A 3W29A 4GZEA 1C8YA 2ZWZA 4JFVA 5DT5A 2DT2A 2ZUWA 3UCQA 3NSXA 2WC7A 4S3JA 5D8ZA 3WH8A 3AIQA 3WMCA 1WZMA 4MNKA 4B3LA 2WAGA 4CD7A 3UR7A 3B9AA 1JIBA 1CECA 3ALGA 3CZKA 1R8LA 5A8OA 3WEOA 1U2YA 1BPLB 3WD4A 3EDFA 2UY5A 4RE3A 3AI0A 5M5DA 4UFIA 3NCOA 2ESCA 3WF1A 2ZXBA 3N18A 3BLPX 4Y7EA 2FDMA 2XPKA 4AEFA 2WKGA 1E4LA 1JDDA 3RM4A 1J0JA 5ABHA 4JKLA 4IPLA 1UZ1A 4AD0A 1CBGA 1X1NA 4J3XA 3WQ6A 1QPKA 2AMGA 2CNCA 3SCNA 3N12A 3WNPA 2EQDA 1WDPA 1GW1A 4UOQA 1W9UA 1AQ0A 1XSKA 2EEXA 3MS8A 1EOMA 1XD1A 1JI1A 2YLAA 5I23A 4Z2IA 4IM4A 4MNLA 3APGA 3VDAA 1MQQA 3AS2A 1SMDA 3CZLA 1UKQA 3ARPA 5GNZA 4ACZA 1UH3A 3UEQA 2YL8A 5BCAA 1LF1A 4GI8A 4E4PA 1QNRA 1EA9C 2J75A 2YL9A 1W9DM 5I5RA 3S6TA 1XGZA 1V3HA 2BY1A 1J0KA 3GBEA 4GXPA 3WFLA 3W38A 2VT0A 1H3GA 1QOXA 5HBFA 5ABEA 5EMYA 2CKRA 3QHOA 4F66A 2EO7A 3SUSA 5DF0A 2J78A 1UD5A 3VIIA 4W7UA 2J74A 2YIHA 1DHKA 2EXOA 5E6ZA 1Q6GA 4QDMA 4DUVA 5HNNA 5M17A 5A8NA 3NDZA 2EPMX 1OD8A 2DT3A 4EKJA 3T2PA 1I75A 1EDGA 2OLHA 2EJ1A 4M82A 4PSPA 1BVNP 4HP5A 5A6BA 4MPKA 5BXPA 3NSMA 3N11A 1HVQA 5A1AA 3W24A 2AOSA 1CXLA 3ZR6A 1A47A 3TTOA 2BY0A 2D0FA 3FAWA 3VM7A 2CERA 5CG0A 1HKKA 2DIEA 2VVSA 3WDPP 2PWHA 3TOPA 2WCSA 4WKFA 3J7HA 1W2PA 1VF8A 3E1F1 4HZ6A 5E9AA 2YBUA 1F4AA 3BCFA 2DSZA 2WK2A 2J8GA 2VO5A 2VZTA 1M7XA 1JFXA 4W8LA 3AHVA 1E5NA 4TXEA 4PTMA 1CXKA 5ABFB 3PZTA 3IJ9A 3BGAA 1H0GA 2YJQA 2W4XA 4JL1A 1JZ3A 4HPGA 3POCA 1J01A 4KWUA 1GUVA 1UD6A 4GQRA 2UWFA 1JAEA 1V03A 2WMIA 1RP8A 2JE8A 5CSYA 2VX6A 3BMWA 3WF3A 3L4XA 5EFFA 1J10A 1CXIA 3WF2A 3AIWA 4IUGA 3ARUA 5A95A 2V38A 3T09A 2WHMA 1OGSA 1M03A 4AZHA 5I0DA 3L2LA 3WQ8A 1CLVA 4W8BA 1TVPA 1K9FA 5C71A 3L2MA 3WBEA 2WZHA 1PIFA 4V27A 2WB5A 1IT0A 1MW2A 2HVMA 1CEOA 4PUEA 5M3WA 1JI2A 1W1VA 1WPCA 2NT0A 1BF2A 2TAAA 2X05A 5EB8A 3K8KA 4YPJA 4OKDA 3K8LA 5HPCA 4PMNA 3D3AA 1GJUA 4W86A 2J4GA 4J7RA 2GUYA 2QF8A 3N17A 4NZCA 7A3HA 2O9TA 3A4AA 2V3FA 2ZXAA 5DO8A 4B9ZA 3M7SA 1LWHA 5E0FA 3BAKA 4BS0A 2A3BA 3ARVA 4GPNA 2CITA 5I78A 2DGAA 2ZXDA 3BH4A 1PX3A 3T08A 3SCOA 1KGUA 3WQ4A 3CMJA 2VZUA 3VIMA 4DUWA 3PTQA 1V0KA 3DHPA 2E4TA 2WMKA 2C0HA 2G8ZA 2D3NA 4PMVA 2CHOA 4J3WA 2J7BA 3CUIA 5A8QA 5BYWA 4AMCA 1DWHM 4RE4A 5LA2A 1HXJA 3CTTA 1EOKA 2OWCA 3A4XA 3UR8A 3KWXA 3N15A 2G3JA 1TR1A 4M81A 3VIKA 1ZJBA 3HN3A 1QNOA 1KXVA 1E6ZA 1WKYA 3EMZA 5HOSA 1OGGA 5GPRA 2VL4A 1RP9A 2VZVA 1VEMA 3W27A 4BF7A 1ESWA 5JIPA 1GOMA 1UD3A 4A3YA 3VGEA 2WWDA 4FK9A 2WVTA 2WHLA 3M07A 3FHAA 2ZUUA 2WMJA 4UFJA 2Y24A 2ZUTA 3CHCA 3BCDA 4PMZA 3ZM8A 4M29A 4OIFA 5FKYA 1TZ7A 4AZCB 4CD6A 2YBTA 4PMXA 2GSJA 2JF7A 3ARYA 4JZ5A 4UFMA 1M01A 2NT1A 2W61A 2VUYA 1E3XA 3UESA 3SIMA 1JDAA 2FHBA 1HJSA 4AD5A 3WD0A 3FNDA 5DEZA 1UYQA 5FL0A 3BLKA 3EDKA 5A6AA 5IFTA 2Y5EA 4W5ZA 3AIVA 3ARZA 3PHAA 3K4AA 8CGTA 4LYRA 2XUCA 1NOFA 5LA0A 1E0XA 4W7VA 1B2YA 1WO2A 4JCLA 3SCPA 1KFWA 2DSUA 4Q7NA 4P8VA 4W84A 3CZ8A 3RMEA 2X0YA 1GNXA 1H2JA 1M04A 4MB3A 2GJRA 1UA3A 1LL6A 3U57A 2PC8A 3VPLA 1CIUA 2J77A 1CXHA 2VNCA 2WC4A 1V0MA 4F8XA 3BAIA 4M8UA 3AHYA 4D6EA 5CLWA 1E43A 3CHDA 4FLQA 1E4NA 2JFEX 4D1JA 4EAMA 1AVAA 1ZU8A 3PBGA 1O7AA 4A4AA 3FN9A 3U5UA 1PEZA 1BYBA 5CSUA 1E6QM 2XVLA 1ODZA 3CUJA 3AZTA 3MUAA 2ZE0A 1UA7A 3AIBA 3GXMA 3WH7A 1WNOA 4HOZA 1C7TA 4BCEA 5IHSA 4MB4A 3MUY1 3CZEA 4RE2A 2J7CA 1V6XA 1MFVA 4P8WA 3RJYA 3WNOA 3VD9A 4GKLA 4NSBA 5E70A 1XSJA 1CLXA 1UH4A 3U5YA 2A3AA 2BY3A 1CPUA 2DSKA 1QI0A 1UR8A 5JUVA 4LX4A 4W85A 1V3LA 4UFKA 2X0HA 3OG2A 4AC1X 4HTYA 3ZMRA 5JIWA 3KZSA 2CBIA 4B16A 1QI5A 3ZIZA 3AYSA 3QOKA 1RPKA 1LQ0A 1J11A 3RO8A 1BYCA 3LPGA 1W9XA 3PZ9A 1KXTA 3GNOA 4GO9A 4DM1A 3W37A 1D2KA 1NARA 1C91A 4B9YA 5CGMA 1UZ4A 2DSWA 2GFTA 3LPOA 1CXEA 1CXFA 3ARTA 4QAWA 3LPPA 1KCKA 3OGVA 3EDEA 2GDVA 4FLOA 1TCMA 5I24A 3TTQA 4DM2A 3GH5A 5HDRA 3VKKA 4E8CA 2NSXA 3VMOA 3GYCA 4S3KA 2ZWYA 1QNSA 4FLSA 2CCRA 2AAAA 1J0YA 2V3EA 3U7BA 3DYPA 2VCCA 4UR9A 2YA2A 3UG5A 1DWGM 1DEDA 4EANA 1UWQA 4NRRA 4HU8A 1MXGA 2WVUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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