5FL0A

Structure of a hydrolase with an inhibitor
Total Genus 241
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
241
sequence length
712
structure length
668
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKQSSKKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMISKNLPLQVKANRVLISPANEVEIELDAIYPGENIQINLEISTDGKEWKTVDLLSAGLQKAPVKFVRFQFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
publication title Analysis of transition state mimicry by tight binding aminothiazoline inhibitors provides insight into catalysis by humanO-GlcNAcase.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron
total genus 241
structure length 668
sequence length 712
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2015-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 5fl0A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5fl0A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 5fl0A01
1SYTA 1G94A 1HT6A 2WB5A 3K1DA 4ATWA 5E6YA 5A6MA 1KB3A 2BY0A 1JAKA 1RP9A 2DSKA 3RILA 4WKHA 5I77A 1XD0A 5IFPA 1UKQA 3BXWA 2CBJA 1FH7A 1B3XA 3SCOA 4WKFA 1IZJA 1EQPA 1Z32X 5C8BB 4XX6A 3L4VA 1WZLA 5TD4A 3GXFA 1HP4A 1ZJAA 4UFMA 3CUFA 1AMYA 4TTGA 3SUSA 2OYLA 1U2YA 1K9TA 3M7SA 2YKKA 2VZUA 1X6NA 3DECA 1OM0A 1TFVA 1JXJA 1CLVA 4A3HA 3PZUA 1W3LA 2C8NA 3WD0A 5AY7A 2VMFA 3K4AA 1HVQA 3OIHA 1H2JA 1E55A 4E4PA 3PBGA 3ZT6A 2DDXA 4FLSA 1SR0A 4HP5A 3AISA 4NI3A 5D4YA 4LPCA 3VIGA 3CUGA 2XGBA 4CN6A 2VX5A 2W62A 4PMRA 5A6KA 4D6CA 3LPOA 3UETA 3L2LA 3VTRA 5HBFA 3WH9A 2XFRA 3HJEA 1K9FA 4BA0A 2CYGA 3RPMA 3L2MA 3RJYA 2VQUA 3PZMA 1A3HA 2V3EA 2YL8A 2WCSA 3BC9A 3VDBA 3WEZA 1BGGA 1QW8A 1VFUA 4AZGA 4U33A 1G0CA 1GOQA 3N15A 1MXDA 5I5RA 2CETA 5C70A 1V0NA 2E0PA 2PF0A 3ZT7A 1VEPA 4PMQA 1UD3A 4UCFA 1W2PA 1VF8A 4UFHA 1V3IA 3NDYA 1E4IA 4AZ6A 3SEPA 2PI6A 3QOMA 1PX3A 1W9UA 4CKQA 4YN5A 3ZSTA 1B3ZA 2DT0A 3L4YA 4DWSB 3NSNA 4GI9A 2EPKX 3MUY1 1WB0A 3AXIA 3KL3A 1QVBA 2PB1A 3GYCA 2C0HA 3NIYA 2J79A 3WN6A 4PMXA 2XJ7A 2JIWA 6A3HA 3WUBA 1UH2A 1E4LA 2VI0A 4W5UA 2WC3A 4ML4A 1IZKA 1ZL1A 2J7DA 1NWUA 2F61A 1HJWA 2ZE0A 2Y2WA 1AQMA 1E6XM 1TVNA 1WP6A 1B9ZA 3VDAA 1UD2A 3PZNA 3QHNA 4MNJA 1V3KA 5EFDA 3FAWA 2Z1KA 4AEEA 3WFZA 3BMVA 1BPLB 4KRTA 1CLXA 5F7UA 4JFWA 1GOWA 3SCPA 3WF2A 1LJYA 4M82A 3RJXA 2FGLA 2AOSA 1CXHA 2GUYA 3KE0A 4B9YA 2YDQA 1GQJA 4JFTA 1O6IA 4TVCA 2BVYA 3CHDA 3A4AA 2F8QA 5HPCA 5DMYA 1V6YA 2W91A 1QBBA 7TAAA 1H0GA 1US3A 1XRVA 1BTCA 1B2YA 1BF2A 1GOMA 1QBAA 4JCMA 1EDGA 2J7GA 4UNIA 4C91A 1GQIA 1KCKA 2JIEA 3AHYA 4GI6A 1J0IA 1CXLA 3VM5A 4GZIA 2ZX7A 1LL7A 4PMDA 4P7OA 3SCUA 3DC0A 1LQ0A 2XGIA 2Y8VA 1C8YA 1XH1A 2VT0A 3F5JA 4LGXA 3T0DA 3SCNA 3WFLA 4GIAA 4ZENA 3QHMA 1HN1A 1V3MA 4NRSA 3MSDA 3VGDA 5FIPA 1R86A 1KFWA 3RM4A 2RGMA 2FH6A 3WD2A 3TTSA 1E1EA 4W89A 1KBKA 3F4VA 4ACYA 2WVTA 5GQBA 1A47A 2XPKA 5BXPA 2CITA 2CNCA 4LX4A 3ARXA 3ALGA 5M03A 1GUVA 3WKZA 5CPTA 4ZE4A 4C7GA 2VO5A 1B3VA 3N04A 1TE1A 1V3JA 4P7LA 3VIPA 5DO8A 3N17A 4CCEA 4EE9A 2BY3A 4MADA 3BCFA 1EO5A 1P6WA 3ZJ7A 2XFFA 3VGEA 3M6DA 3UR7A 1CBGA 2DQXA 3J7HA 1CGUA 1XGZA 4YPJA 1G1YA 4FLQA 3VD3A 4MDPA 5A8QA 1WZMA 4LQ1A 1PX4A 1UH3A 2J7BA 3TP4A 5ECUA 2NW0A 3CHCA 3GDBA 3CGTA 4FF5A 2O9TA 4LXFA 3W26A 1U30A 3L4ZA 2YOCA 3AXXA 2X0HA 2D23A 1JF5A 4DWSA 1E73M 4MNLA 3GM8A 3CUIA 2WVSA 1NARA 4PTWA 1EQCA 3BGAA 3FHAA 3K8KA 4PMVA 1SMDA 2VQTA 1CXEA 5ABFB 1B3WA 1GJUA 5A1AA 5A2AA 3ARYA 2GK1B 1QNOA 3L4WA 1BYDA 4TX8A 1D7FA 3ARUA 3BLKA 3ZT5A 4WIWA 3GNRA 3CZKA 1N82A 5AYBA 5BROA 3WH5A 1GCYA 2NSXA 4ZEPA 3ZJKA 1EDQA 4OJYA 1UD5A 1PIFA 4MAZA 4AD3A 1MQRA 3A3HA 4KGLA 5D9MA 3L4XA 4JKLA 2G3MA 2DT3A 2JFEX 4H7VA 3WELA 4GKLA 1E6RA 3VILA 1UG6A 1UR4A 1QNSA 2QV4A 4MNMA 3U57A 3AMCA 1E6ZA 3SCVA 2XM2A 3CZEA 2VL4A 4BCEA 2J75A 3VGBA 5CG0A 2VTFA 2WMIB 3VIKA 1QPKA 2J7FA 3MU7A 4UFLA 4L4OA 4EKJA 3CO4A 1OT2A 5AC4A 4H41A 2DH2A 3W29A 1HKIA 3AROA 4LYQA 2ZX6A 1B31A 4P7QA 1ZBWA 2VX6A 4UZUA 2G3JA 3W81A 1CWYA 2WKGA 1ITCA 2XVGA 3A6OA 4HOXA 4P7NA 4D6EA 1ISXA 3WD3A 4GINA 3VPLA 3K4DA 1GPFA 4D71A 2CKSA 5A8NA 3UR8A 3K8MA 4M8UA 4PEEA 1JAEA 4S3JA 1H3GA 1OWQA 1CGYA 3L4UA 4OUEA 4CD8A 4UFIA 1I75A 2W61A 3RDKA 3WNLA 3N9KA 1MYRA 1C7TA 1QHZA 1HJXA 3BAIA 1NWSA 3CTTA 3WENA 4W84A 2WLZA 3K8LA 4BS0A 2VR4A 5D9NA 1JDDA 1KXQA 2VRKA 3PZOA 1JFHA 3ZOAA 4HA3A 4KH2A 2FGZA 1CGWA 4AIOA 1L0PA 4IISA 4E2OA 4Z2KA 1UKPA 3ARQA 1HJQA 3AZSA 4BZYA 4JL1A 1KBBA 1MQQA 1X1NA 1LWHA 5A8MA 5A3HA 3B9AA 3WQWA 4W88A 1PIGA 1TA3A 4J3SA 3VD5A 1VEMA 3VNYA 1U33A 1UD6A 3AIVA 4P8WA 1C8QA 2GVYA 4PSPA 4PMOA 4OZOA 3TA9A 4ATDA 1ZBVA 4BQ4A 3W53A 3CPUA 3DYOA 1HIZA 5BCAA 1HKMA 4UZSA 4ZXLA 4C7FA 1ESWA 1MWOA 3CBWA 1WZAA 5ABFA 1UR8A 4F9JA 3T2QA 3ZJ8A 1DWAM 1F4AA 2C7FA 2EBNA 3PZ9A 1UWIA 5A6AA 1L8NA 3WMSA 1CXFA 1DWGM 1BVNP 2GK1A 4M81A 4MB5A 3VGHA 5CXPA 5DT7A 1BAGA 4AXNA 1CGVA 3MMWA 1ZBKA 2GJXB 1PAMA 3CZLA 5FD0A 1H11A 2HISA 2YIHA 3OLGA 2E3ZA 2G41A 1EIBA 2VURA 1H4PA 2UWFA 3NJ3A 1VJSA 1LG1A 1XCXA 2V3GA 3EBVA 4OBRA 1TMQA 3OZPA 4D1JA 5I2UA 4AD1A 4B9ZA 4CD7A 4V28A 1E6PA 4JL2A 3TTYA 3CMJA 3OGSA 2WPGA 8CGTA 5FOOA 3WDPP 3PTQA 4CVUA 1DTUA 4V27A 5JIPA 3AZTA 2G3NA 4W85A 2YLLA 4WF7A 3AIWA 4DUWA 4UOQA 2ZXBA 5GNXA 3SCWA 5BXSA 1VAHA 3VOCA 4AZHA 4WLCA 2F2HA 3THCA 1JYXA 4UFKA 1W32A 5AYIA 4D6IA 4WKAA 1CNVA 1UA7A 4UTFA 4E8DA 2A3EA 3WNNA 2EPMX 3AMDA 1WCGA 1W9XA 2PBGA 5HOSA 2E8ZA 1BGAA 1DWIM 3CZ8A 3VD7A 1FFQA 2A3BA 4AW7A 4J3UA 1HL9A 1I1XA 4CN4A 4H2CA 3FXYA 1W3KA 3W82A 5BYWA 4M29A 4B3KA 1V03A 2D20A 2ESCA 3SCTA 5CGMA 2WANA 3AS3A 4B3LA 2DSWA 3FNDA 3LPGA 1FP8A 4AD0A 4IPLA 4M1RA 2UY4A 1W1VA 4MDOA 3WNPA 3MS8A 3ARTA 3VX1A 5CQ1A 1ODZA 2OSWA 4A3YA 4CU6A 1HP5A 4U2YA 1FOBA 3AMLA 4HA1A 1QHPA 4QLLA 4UQCA 2WKLA 2QF8A 5CSYA 1X6LA 2DGAA 2W63A 2YLAA 2ZUMA 3ALFA 1EGZA 1H49A 1JGIA 4QCFA 2EJ1A 5BRQA 2GSJA 2BVTA 3F5LA 4P8VA 4HZ6A 3LMYA 3VIHA 1W2VA 1KQZA 4GXPA 3T08A 4KGJA 1MVYA 3AHVA 1W9VA 2OSXA 5IXEA 1TUXA 2PC8A 4RE3A 5IFTA 4AC1X 4J3XA 1HJVA 2B31A 1WDRA 1KWGA 1KXVA 4WJXA 4GZEA 2BY1A 4BQ3A 2CHOA 3EMZA 1UD4A 1UR1A 3G6MA 3PZGA 4QP0A 2OWCA 3OLDA 2NT0A 1GQKA 4B15A 2JEPA 2W66A 2WM0A 2XUCA 2G4FA 2DH3A 4J3WA 1R85A 2GJXA 3EDJA 3WH6A 2G3IA 2GJRA 3SUVA 4UOZA 1JZ8A 1HNYA 4ACZB 4DUVA 2XYLA 3VUPA 2YL5A 3HN3A 4JFUA 2CKRA 4CCDA 3VMOA 4AISA 1QNQA 3ZMRA 3ARZA 1GVYA 4W86A 3ZO9A 5CLWA 1JD9A 1QW9A 2XTKA 5E0FA 5A2BA 4BQ5A 5DFAA 1E3ZA 2YA1A 4MB4A 2WHJA 5JIWA 1UR9A 2J7CA 3AICA 3N12A 2UY2A 2BHYA 2A3CA 2BS9A 2FHBA 5JBEA 5E6ZA 2X2YA 4F9DA 2V5DA 4DWSC 3MUIA 3VMNA 1CZ1A 2WZEA 2VZTA 3A47A 1GORA 3T2PA 4U5IA 1RP8A 1C7SA 4HA4A 2ZX9A 4TX6A 1ECEA 1CXIA 3VDHA 1FA2A 3ZR6A 5IHRA 3AIUA 1MW2A 3NDZA 3UG4A 4HOZA 1VRXA 1LLOA 2CBVA 4H8VA 1WAWA 2RGLA 2WLYA 1RH9A 4ATLA 3BAXA 4DWSD 3MO4A 3I3DA 5CPQA 1GVIA 1W1PA 1CIUA 3OB8A 1C3FA 1DEDA 3AIBA 4Q22A 5IHSA 3MUZ1 1R7AA 2J25A 4KMQA 1Q6FA 4HZ8A 5ABGA 2CESA 4JFVA 3POCA 3SCSA 3IAQA 3NCOA 4Z2JA 2ZOXA 3WDJA 3DYMA 3CHEA 3IK2A 3ZR5A 1JFXA 3VKKA 1KGUA 5ABEA 3WH7A 1E9LA 4X9YA 2WWCA 4HMCA 3NSMA 4P7RA 1K9EA 1UWUA 4OKDA 1DWJM 4PSRA 1UWSA 4NSBA 1F4HA 2E9MA 3ZQ9A 3CHFA 1H5VA 4M80A 3E1F1 1XH0A 5LA1A 2BY2A 4D6JA 2AMGA 2WK2A 3GBEA 1C92A 1Y7VA 3MSGA 1CXKA 1UKOA 2VRQA 2WC7A 2CBUA 4WSJA 1PBGA 2VVSA 1D3CA 1DWHM 4AIEA 4FLRA 4IM4A 3WF0A 4D6FA 1EHAA 3TTQA 1W3HA 1HL8A 2DEPA 3IAPA 3VGFA 1PX8A 4D6GA 2O9PA 4PMYA 3VINA 4WSKA 4PTMA 3VIJA 1M7XA 1BG4A 1OINA 2J8GA 1UD8A 1XCWA 1J18A 3SCRA 4B16A 1EH9A 2V38A 4OIFA 4QAWA 3OLIA 3WUEA 1UA3A 1XSKA 3NUKA 5EMYA 4C90A 3OGVA 1B3YA 1ODUA 3IJ9A 5DEZA 2IXVA 3KEHA 3B9EA 1UR0A 4PMZA 3OLEA 3WF4A 4ACZA 3A4WA 5I6SA 2BV9A 4F8XA 5EFFA 4AZCB 3FN9A 1LF1A 3CH9A 4R5EA 2FDMA 1WO2A 1NOFA 5I3DA 2DSZA 5FCZA 1J01A 3JUGA 1VFMA 4AZ5A 2WMGA 4AZBA 4Z2HA 1DP0A 3VIOA 3B9DA 2YDSA 2PWDA 2WVVB 4XZBA 3WD1A 3AIRA 3AI0A 3W0KA 4JFSA 1M53A 1RD6A 1XHGA 2ZX5A 4W87A 1WDPA 3ARRA 1GOIA 1W1YA 2A3HA 5A6BA 4HPGA 4EAMA 2WHMA 3UCQA 1UWRA 4FLOA 4IPNB 1NP2A 3T09A 1JI1A 1QI2A 2Y5EA 1UQZA 1E70M 4AWEA 3GXIA 1J12A 4Y7EA 2V3DA 1ZJBA 3PTMA 2XIIA 1UR2A 2W67A 1V02E 1V02A 3WQVA 3WNOA 3VX0A 3RO8A 4J3TA 4P8XA 2OWWA 4TVUA 1DHKA 3I3EA 1ISVA 2VOTA 2EEXA 4CVWA 1WDQA 2CPUA 2VUYA 3UEQA 9CGTA 1HKJA 3CZJA 3MV01 3ARWA 4D1IA 3FY1A 2EXOA 1J0KA 2E40A 2Q8XA 1YHTA 3MV11 2X09A 5D8WA 3EYPA 3AFBA 4F79A 1JNEA 4W8BA 1J9YA 1K9DA 4RE4A 1BVZA 1EXPA 1NQ6A 1EO7A 5D8ZA 2X05A 1KGXA 3VMPA 3EDKA 1EA9C 1E43A 1BYAA 2ZXAA 3APGA 3GH4A 3A4XA 3F5KA 2WZIA 3PZTA 1CECA 1JD7A 1J0HA 3CUJA 3VVGA 4MPKA 4XV0A 4JHOA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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