2WB5A

Glcnacstatins are nanomolar inhibitors of human o-glcnacase inducing cellular hyper-o-glcnacylation
Total Genus 227
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
227
sequence length
585
structure length
584
Chain Sequence
QVLVPNLNPTPENLEVVGDGFKITSSINLVGEEEADENAVNALREFLTANNIEINSENDPNSTTLIIGEVDDDIPELDEALNGTTAENLKEEGYALVSNDGKIAIEGKDGDGTFYGVQTFKQLVKESNIPEVNITDYPTVSARGIVEGFYGTPWTHQDRLDQIKFYGENKLNTYIYAPKDDPYHREKWREPYPESEMQRMQELINASAENKVDFVFGISPGIDIRFDGDAGEEDFNHLITKAESLYDMGVRSFAIYWDDIQDKSAAKHAQVLNRFNEEFVKAKGDVKPLITVPTEYDTGAMVSNGQPRAYTRIFAETVDPSIEVMWTGPGVVTNEIPLSDAQLISGIYDRNMAVWWNYPVTDYFKGKLALGPMHGLDKGLNQYVDFFTVNPMEHAELSKISIHTAADYSWNMDNYDYDKAWNRAIDMLYGDLAEDMKVFANHSTRMDNKTWAKSGREDAPELRAKMDELWNKLSSKEDASALIEELYGEFARMEEACNNLKANLPEVALEECSRQLDELITLAQGDKASLDMIVALNEDTEAYESAKEIAQNKLNTALSSFAVISEKVAQSFIQEALSFDLTLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Glcnacstatins are Nanomolar Inhibitors of Human O-Glcnacase Inducing Cellular Hyper-O-Glcnacylation
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE NAGJ
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium perfringens
total genus 227
structure length 584
sequence length 585
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2009-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2wb5A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2wb5A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2wb5A01
2WC4A 5D9NA 3VGGA 5A6KA 1LL7A 4AD0A 3WY1A 4W5UA 4DWSB 1G01A 1B30A 3AMLA 1W32A 3WSUA 3WIJA 5AY7A 1OIFA 2F2HA 2YOCA 1UKQA 4JKMA 1S46A 5BRQA 3EDJA 4GKLA 2J7FA 3AIQA 4WKFA 1KXHA 1CPUA 2YL8A 3F5LA 2WANA 5BXPA 2VVNA 3CGTA 1GOKA 3SCQA 1XH0A 2EPOA 5A6BD 9CGTA 1HN1A 2YIHA 4UQEA 3SUUA 1KWGA 3T0AA 4W89A 3WF0A 3U7BA 5GNXA 3B8SA 1AQHA 3VIMA 3EMZA 2XGBA 1UHVA 2J7CA 2AOSA 4EAMA 1OGBA 2XVLA 2VVSA 2G3JA 4R5EA 1M04A 2PF0A 4GO9A 1BF2A 3VVGA 4W7VA 4ATWA 3PZIA 3W6LA 1UZ4A 1WB0A 2QHAA 1JZ2A 5EFFA 4QLJA 1ZBVA 4BZYA 1JF6A 1GQIA 2XPKA 1J12A 1EIBA 2CBJA 3ZR6A 4NSBA 2J7GA 1ITCA 3QHMA 2BVYA 1WDQA 1CDGA 4UFMA 1UD8A 1XSJA 1PX8A 1B31A 3PZVA 5A8NA 4OOZA 1H5VA 4ZENA 4J3SA 2OYMA 1V02A 3ZSSA 4FMVA 1HL9A 3WMCA 3VMPA 1Q4NX 1Q6EA 5HPOA 1CGYA 2G3NA 1EQPA 4PN2A 1G5AA 3ALGA 2CITA 2J78A 2ZUNA 3AMGA 4PMXA 2WW5A 4F9JA 3O2LA 1UD5A 4B15A 4CD7A 1DEDA 1JIBA 2WVVB 1GOOA 3WD0A 3ZJ8A 4MDPA 5CSYA 4GI6A 3MO4A 1ISVA 1V0LA 1BTCA 1LLOA 2GK1B 4J28A 4HPHA 1KWKA 1DWIM 2Y5EA 3RMEA 2F8QA 2WC7A 3A47A 3VD7A 4D1IA 4M80A 3VIHA 1XCWA 2JF7A 3LPGA 1MWOA 6A3HA 3U5UA 1J0IA 3KWXA 3VIOA 3I3DA 2UY5A 3POHA 1B3YA 4OOUA 4RL3A 2RGMA 1ZB5A 3CZKA 3A4AA 1KXQA 3OZPA 2MANA 1G9HA 1OGSA 1JI2A 2YA2A 3FHAA 4TUFA 1CLXA 1U33A 4AIUA 4HA1A 1TG7A 1UG6A 2QMJA 4KH2A 2VX7A 2V3DA 4M1RA 1OD8A 1EQCA 1XH1A 1ZBCA 1MQQA 4ZFMA 2QV4A 1HF6A 1A3HA 1GVYA 4UFKA 5M17A 4ZE5A 4Z2HA 2J7BA 4PTVA 2G41A 2IXVA 1XD1A 2W63A 3AXXA 4J3TA 3VPLA 1GW1A 2VZUA 5A2CA 3ARTA 3ARRA 2DIEA 1V6WA 1H2JA 3W4RA 1CXIA 4GZIA 1CYGA 3MMWA 5CGMA 1WCGA 3WH7A 1GORA 2WMGA 2JALA 1R85A 4JAWA 1RPKA 5I6SA 4ZEPA 4MB1A 3UR7A 1HJVA 2YA1A 3I3BA 1HKJA 5BXTA 4FLQA 3ARVA 4F8XA 1DWAM 3UETA 2YDRA 1E4IA 2WZIA 1HJUA 3N11A 1VFMA 2VX6A 2WMJA 4BS0A 1B3WA 2CBVA 1NWSA 1FP8A 4P7RA 1W9DM 2VX4A 3L4ZA 3APGA 2GJRA 2VQUA 1OD0A 3AIRA 1XGZA 3SCWA 2ZOXA 2BY1A 2DT3A 1V3JA 4UFJA 1CGUA 1UD6A 1L0PA 2XYLA 3QOMA 1UWTA 3L4WA 5LYRA 2XUCA 3BAKA 2TAAA 3EDKA 1JDAA 3W38A 2VNCA 1C93A 2NW0A 3KEHA 4HOXA 3NDYA 4TXEA 2D22A 2FGZA 4IUGA 3GH5A 5E9AA 1TR1A 2WPGA 3SUTA 1BYDA 5A2AA 5LA1A 3UR8A 4U33A 2WLYA 2D3NA 3AIEA 1VFOA 2WVUA 1E3XA 2E9BA 3A4XA 4HU0A 3UG3A 5I23A 3AXHA 3TTOA 1CZ1A 4GINA 3BSHA 2YLAA 3ZT6A 1OT2A 1UH3A 1Q6FA 3WENA 3BCFA 1PX3A 2V5DA 2BHZA 1XSIA 4WJXA 1E6PA 4Z2KA 1KR1A 2HISA 5E70A 4AIOA 4F79A 4RE2A 2CBIA 4MTVA 1E71M 1FFQA 1I1XA 4MADA 2PWFA 2W61A 1HXJA 2ZUTA 2EJ1A 1E4NA 1O7AA 4IISA 3KL0A 2G3IA 3WMSA 1GCYA 3EBVA 3GDBA 4GZEA 1KCLA 1CLVA 4C7GA 1E5NA 2O9TA 4QCFA 2C7FA 4KRUA 2HVMA 4CVWA 3CMJA 4CKQA 4W5ZA 5DF0A 1JGIA 2YBUA 4MNKA 3WFZA 3N18A 2XHYA 4GQRA 3DHUA 1KGWA 1UR0A 5FL1A 1KXTA 4D1JA 1E6XM 4C91A 3IAPA 2GFTA 3PTKA 4KMQA 3UEQA 1W9BM 1BYCA 1JG9A 3MMUA 1JZ6A 1YQ2A 1VRXA 1VJSA 1MQRA 2VL4A 1V3IA 1J0ZA 3UG5A 4UQCA 2VZTA 2J7HA 1YHTA 2XWDA 3VIJA 5BXRA 1H0IA 4LYQA 4HOZA 4W7WA 5CPSA 1K9FA 3FY1A 3CZEA 3WF3A 1V3HA 1JYXA 4D6GA 3GNRA 3L4YA 3W6MA 2WKGA 2A3HA 7CGTA 4URIA 3PZ9A 2XVNA 3AS3A 4PUEA 1O6IA 3WBAA 4TVCA 1N82A 1EGZA 2XIBA 4TVDA 2WHMA 1DWHM 3GXIA 4MNMA 1J0HA 3K4AA 3EMQA 2ZIDA 4W88A 2CETA 4YPJA 3L4UA 4HMDA 1QI4A 3AS0A 3MUY1 4AD4A 4LPCA 3VOCA 1UA7A 1H09A 5A6BA 1MW1A 4QCEA 3F5JA 4PTXA 4RE4A 3WEMA 3ZR5A 5A8OA 3AZSA 4LYPA 1QNQA 2ZICA 4PMYA 3WQ4A 5HOSA 1H49A 3AZTA 1EDGA 4CD5A 2ZX9A 2XVPA 3CUIA 1GVIA 1V03A 4RE3A 3VIFA 1JFXA 1KBBA 3AYRA 3VUPA 1VIWA 3K46A 7TAAA 4LYRA 4PMRA 3VX1A 2X1IA 4A3HA 1V02E 3VDHA 4OUEA 1GJUA 1K9DA 3B9AA 3TP4A 3IAQA 1GQJA 2F61A 1JZ5A 1XYFA 1OB0A 1EDTA 4E8DA 2ZUWA 3N9KA 2EQDA 4UTFA 2W67A 1G94A 2FDMA 1K6AA 2G3MA 2W62A 3D5HA 1TZ7A 1CTNA 3RDKA 3WF4A 1GOQA 1MW0A 4FLSA 3VGDA 2WCSA 3MSGA 3AHTA 2WXDM 4ML4A 1C7SA 5JUVA 1HIZA 4U2ZA 4DUWA 2J7DA 2VR5A 4Q7NA 4WK9A 1C8QA 5E6ZA 3NSMA 2D0HA 3CHEA 1KCKA 4CCDA 5A3HA 2GSJA 2DSUA 3VU2A 4TX6A 1P6WA 5AC5A 1PIFA 4C7FA 4WSJA 2VJXA 1XH2A 4Z2GA 4UOQA 5BRPA 2WYSA 2Q8XA 2VCCA 3OBAA 4CN4A 1E1FA 2WB5A 1LL4A 2PB1A 2QPUA 2WVVA 3WKZA 4NZCA 5D8ZA 2Z1SA 4H2CA 3HJEA 2J8GA 1G0CA 1EHAA 1W1YA 1IT0A 1AQMA 1EHNA 4BQ3A 4JCLA 1CXHA 5JBFA 3II1A 3WDRA 2BHYA 3M6DA 2Y8KA 1FOBA 1CXEA 2WNWA 4V2XA 3IK2A 1VAHA 6CGTA 1C3FA 5HDRA 3N12A 1BGAA 2VI0A 1KQYA 1KXVA 3NIYA 1MW2A 4FK9A 1H0GA 2Z1KA 2JEPA 3BSGA 4L4PA 3ARQA 4ACZB 5CLWA 1QHOA 2QLYA 4PMZA 1ZJBA 3BAJA 4MNLA 3VM7A 2WHKA 3AHXA 3CLWA 4WSKA 4L4OA 1JFHA 1BQCA 3AQUA 4DWSC 1TVNA 4J27A 3WF1A 3NDZA 1WZKA 5CG0A 1GQKA 4W8LA 1UA3A 2DGAA 4J3XA 2WHJA 2XM2A 3VKKA 1E73M 3U5YA 1ZS2A 1W3LA 3N04A 4AZ6A 3WL0A 1BYBA 5A69A 1JZ4A 3K8MA 2J25A 1M7XA 2PWDA 5D8WA 1ODZA 1QBBA 2ZXDA 4AEEA 1W2VA 2EBNA 3AFBA 3EDEA 1UD2A 1C90A 1VEPA 1KBKA 2J79A 2WHLA 4JCMA 2ZXBA 1BG4A 4X0VA 5I2UA 1QI3A 4UZSA 1XD0A 4D6IA 1UOKA 1B1YA 1QVBA 3PZGA 2VUYA 2UY4A 8CGTA 3LPOA 4DUVA 3L4TA 4U3AA 5LA2A 3K8LA 2WMIA 3WD1A 1IZJA 3BAWA 3UESA 4AD5A 1XRVA 2OWXA 1SMAA 2GDUA 1LWHA 2WC3A 4B3LA 1J0JA 3SCVA 4JL2A 4D72A 3CTTA 4AW7A 2J7EA 4HZ6A 2EXOA 5A95A 5CLTA 3L4VA 4U2YA 1V3KA 2V5CA 1PZ2A 4UR9A 3B9DA 2UY2A 1VJZA 1GPFA 4UFHA 4W87A 3AMKA 3CUJA 2J75A 1SFSA 3VD4A 2VRQA 2GVYA 2DT1A 5KEZA 3CH9A 4H04A 4CGTA 1JL8A 4R27A 4PTWA 1TE1A 3AMDA 5E6YA 3WDQA 1WO2A 1E9LA 1E1EA 5BCAA 3OZOA 4PCSA 2D0GA 5M5DA 1PEZA 2VT0A 4HPGA 2ZUVA 3L2LA 1FFRA 4M81A 2WMKA 1JYVA 1ISXA 3VIIA 3O6AA 4IM4A 3WH8A 4PMQA 2VURA 3MUZ1 2XSBA 1QI0A 4KGLA 1Q6GA 2EPMX 1IZKA 4AD2A 3WQWA 4AISA 4UQAA 3GZAA 4WLCA 3AIWA 3WQ8A 4FLRA 1NARA 2CIPA 4AWEA 3TA9A 3ZSTA 2DH3A 1UZ1A 1R7OA 4DM1A 3ARYA 3VIPA 3UERA 1QHPA 4QFUA 5KZ6A 3ARZA 2OYLA 2VTFA 3QOKA 4PYSA 2CNCA 2XFFA 3OG2A 3VTRA 5JIWA 2D24A 2DH2A 2QF8A 3FXYA 2DEPA 3S6TA 1JNDA 2J8FA 4P8WA 4A4AA 4P8UA 3AS1A 1OIMA 3SCNA 3WBEA 4ATDA 1D2KA 1CXFA 1R7AA 1ECEA 1KB3A 1NOUA 1RH9A 3ARUA 1KGUA 2WBGA 3AIBA 1J10A 3VNYA 4CU7A 4LXFA 5GQBA 2GJXB 4AD1A 4LX4A 1OINA 1U2YA 4MAZA 3ZJ6A 2O9RA 3BC9A 2J74A 1UH2A 5BROA 3WD2A 3BMVA 3AISA 5BYWA 1DTUA 3AIVA 4GPNA 3HN3A 3WNOA 2QMKA 3WFLA 4HZ7A 2WMIB 3PN8A 3OLIA 2E8ZA 4JKLA 4W8BA 1J11A 2D0FA 5FCZA 3ARSA 3NSXA 1SR0A 3SCOA 3AMCA 3ZIZA 2UY3A 3ZJ7A 2PC8A 1QPKA 5HPCA 1JXJA 2G4FA 2VX5A 1W2PA 1TCMA 4CVUA 4C90A 3PTMA 3RIKA 2JIWA 2BY3A 1HNYA 5I3DA 4PTMA 3OGRA 1ESWA 4N42A 1D3CA 3VDBA 4BCEA 2D23A 3BLPX 2NT1A 2ZWYA 2X05A 1FP9A 3FHQA 2YA0A 1W1TA 4GZJA 1QNSA 3CUHA 2XSAA 1GHSA 2W92A 3TTSA 1KGXA 3MUAA 1VFUA 2XWEA 3CZGA 5IFTA 1GZJA 1KQZA 4W84A 4JFUA 3JUGA 4HP5A 5I77A 2PI6A 3E1F1 1R86A 5A8QA 5DT5A 3DYPA 2PWGA 2ZX8A 3FN9A 3SUWA 1KR0A 1ZL1A 4V27A 2E8YA 2FH8A 4WKHA 1XC6A 3MUIA 1W1PA 4J7RA 4WIWA 3ZMRA 4LGXA 4FLOA 3AIUA 4Q22A 5DO8A 1FH8A 5FOOA 2JIEA 2RGLA 2FH6A 1OT1A 3M46A 5A94A 1GOIA 1W9VA 3T2OA 1W9PA 2EO7A 1ISYA 4CU6A 3F4VA 2E4TA 4J3UA 2CEQA 3WMBA 2VZOA 3CO4A 2QPSA 1M53A 4PBGA 3O9NA 3KL3A 1JDDA 1FA2A 1E15A 1MXGA 4PMUA 1TUXA 2B31A 1J9YA 3ZOAA 3W81A 4UOJA 5DFAA 4MB5A 4HZ8A 1TA3A 1QHZA 5A2BA 1E4MM 3WUGA 2CHOA 1QOXA 5A6LA 3CHFA 3GYCA 1Y7VA 1BVZA 4UQDA 1CGWA 2ZXAA 4AZCB 1DWGM 4GIAA 3SUVA 1WDSA 1VEMA 4IPLA 2FGLA 4ACZA 2VR4A 4AYSA 5IDIA 1G1YA 5A6MA 3AROA 2WLZA 4P7QA 2VCBA 4AZ5A 4P8XA 2GUYA 1X1NA 1H4PA 1B2YA 5ABEA 4D6JA 2WVTA 4UFIA 2ZX7A 3WNPA 1BGGA 2BXYA 3NSNA 1EO7A 3GBEA 3EDDA 3M07A 2XFRA 2VRKA 2UWFA 3ARWA 1PJ9A 2WK2A 3MV11 3THDA 2V3EA 4QP0A 2VMFA 4X0NA 5JBDA 1B3XA 2XIIA 3K4DA 1R87A 2OYKA 1ZU8A 1XSKA 1E3ZA 4JL1A 3L2MA 4XZBA 3VMNA 3KE0A 3PHAA 1CNVA 3QGVA 4U5IA 2WCAA 1V6VA 3ECQA 5FD0A 5I24A 1XYZA 1EOMA 5FL0A 1JD9A 1V3MA 4A3YA 1HP5A 2X0YA 5D4YA 4AEFA 1JF5A 1UWIA 2WZHA 3CIVA 1US2A 3BMWA 4GXPA 3WNNA 1WDRA 2OWCA 5CJ5A 4JIEA 4QLLA 2YL5A 4W8AA 4M29A 1NOWA 4H7VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2WC4 A;  5D9N A;  3VGG A;  5A6K A;  1LL7 A;  4AD0 A;  3WY1 A;  4W5U A;  4DWS B;  1G01 A;  1B30 A;  3AML A;  1W32 A;  3WSU A;  3WIJ A;  5AY7 A;  1OIF A;  2F2H A;  2YOC A;  1UKQ A;  4JKM A;  1S46 A;  5BRQ A;  3EDJ A;  4GKL A;  2J7F A;  3AIQ A;  4WKF A;  1KXH A;  1CPU A;  2YL8 A;  3F5L A;  2WAN A;  5BXP A;  2VVN A;  3CGT A;  1GOK A;  3SCQ A;  1XH0 A;  2EPO A;  5A6B D;  9CGT A;  1HN1 A;  2YIH A;  4UQE A;  3SUU A;  1KWG A;  3T0A A;  4W89 A;  3WF0 A;  3U7B A;  5GNX A;  3B8S A;  1AQH A;  3VIM A;  3EMZ A;  2XGB A;  1UHV A;  2J7C A;  2AOS A;  4EAM A;  1OGB A;  2XVL A;  2VVS A;  2G3J A;  4R5E A;  1M04 A;  2PF0 A;  4GO9 A;  1BF2 A;  3VVG A;  4W7V A;  4ATW A;  3PZI A;  3W6L A;  1UZ4 A;  1WB0 A;  2QHA A;  1JZ2 A;  5EFF A;  4QLJ A;  1ZBV A;  4BZY A;  1JF6 A;  1GQI A;  2XPK A;  1J12 A;  1EIB A;  2CBJ A;  3ZR6 A;  4NSB A;  2J7G A;  1ITC A;  3QHM A;  2BVY A;  1WDQ A;  1CDG A;  4UFM A;  1UD8 A;  1XSJ A;  1PX8 A;  1B31 A;  3PZV A;  5A8N A;  4OOZ A;  1H5V A;  4ZEN A;  4J3S A;  2OYM A;  1V02 A;  3ZSS A;  4FMV A; 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