4AISA

A complex structure of btgh84
Total Genus 243
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
243
sequence length
712
structure length
637
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMPLQVKANRVLISPVEIELDAIYPGENIQINAGLQKAPVKFVRQFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Metabolism of Vertebrate Amino Sugars with N-Glycolyl Groups: Intracellular Beta-O-Linked N-Glycolylglucosamine (Glcngc), Udp-Glcngc, and the Biochemical and Structural Rationale for the Substrate Tolerance of Beta-O-Linked Beta-N-Acetylglucosaminidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 243
structure length 637
sequence length 712
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2012-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 4aisA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4aisA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 4aisA01
1R7AA 2ZXBA 1W1VA 1KWKA 2EPOA 2XHYA 3VD7A 5E70A 1NM9A 3VINA 1W1PA 2YDSA 1UH3A 1AMYA 4TVDA 1TMQA 2WKGA 4EANA 2C0HA 1X6NA 3G6MA 3A4XA 4UZSA 3WUFA 5I23A 2VZVA 1E3ZA 1PZ2A 2WVUA 2B31A 4P7RA 1H41A 3FHAA 1JZ5A 2PI6A 2X8RA 2E9LA 2WCAA 2CCRA 4PTWA 2DQXA 1W2VA 3NUKA 1TVPA 2WK2A 3AXIA 4OOZA 1R7OA 1E9LA 2ZOXA 1CGXA 3WBAA 1Q6DA 3NCOA 1HP5A 2YL6A 3VD4A 2VZOA 3F4VA 3L2LA 4BCEA 3PTQA 1KFWA 3SCVA 4NZCA 4S3JA 4UFHA 1EOMA 4PYSA 5DT7A 1QBBA 1RH9A 1GUVA 1CGVA 2IXVA 1PPIA 2WBKA 4ZEPA 3N18A 2NT0A 3EYPA 3CUGA 1UQZA 3BXWA 1GVYA 1NP2A 1UH2A 1CXFA 3WNMA 5CPQA 2BY1A 4PSPA 2EBNA 1LQ0A 5DO8A 3EMZA 4PMQA 4R27A 3CHDA 3U5YA 2PWEA 1WO2A 2WHMA 3SURA 4JFUA 1GQIA 3CUFA 2DSUA 3ZOAA 3WH9A 3L4XA 4PMRA 3T08A 2Z1SA 4JAWA 4GZJA 5CLWA 1GOWA 2ZX9A 4CVWA 1V0MA 2JF7A 2V3FA 1UG6A 3RCNA 4ACZA 1U2YA 1H5VA 2CBJA 2FHFA 4CKQA 4PCSA 3GNPA 2FDMA 2PWFA 2VX7A 4TXEA 2VI0A 1E6SM 1CZ1A 2WVSA 1WP6A 1FP8A 5BROA 2CETA 1GW1A 2Y8KA 1NWRA 5CXPA 4UFKA 8CGTA 3M07A 1E4MM 1ESWA 2WANA 1V3LA 3POHA 2XSBA 1KGXA 3WELA 3VD3A 2XVNA 4P8UA 2VCBA 3WH6A 3FNDA 4AZCA 1MXGA 3EMCA 1M7XA 4CD7A 3VX1A 4KWUA 5BXSA 2VMFA 1HX0A 1W3LA 3AMGA 1OIFA 2QLYA 3IAQA 1E71M 2WC3A 3VUPA 4Q22A 1XYZA 1GOIA 4M24A 3ALGA 3M6DA 4IPNB 3WD3A 3K1DA 1UWQA 1XSKA 4QAWA 3O2LA 3BCDA 2YA0A 4AZIA 4OOUA 4PTXA 1E72M 4GXPA 1OD0A 3DYMA 4UOQA 1JNDA 1O7AA 5CZKA 3DYPA 4JL2A 3CMJA 4PTMA 3TTQA 3D5HA 4TOQA 4UQ9A 3PZGA 3NYDA 3MUAA 4AEFA 3DHPA 2J7FA 1E0WA 4NRSA 5HDRA 4IISA 4AIOA 5FOOA 3SCSA 5CSYA 3GXFA 1UD3A 1DWGM 2DIJA 5BCAA 1ISVA 1VB9A 1ITXA 1H0GA 1D3CA 2W67A 5DMYA 1R8LA 2J75A 5DEZA 1CBGA 3EDKA 2ZWYA 3NDYA 3VX0A 1GOOA 2YIHA 3ZO9A 2XPKA 2ZUMA 2YA1A 1BG4A 2J7EA 3CLWA 3POCA 3II1A 3T09A 4MJ4A 1GPFA 4F66A 4CU8A 3JUGA 3ARWA 4BQ4A 2D24A 3S6TA 2V3EA 1CGTA 3ZM8A 3OGSA 1GOMA 2YBTA 1D7FA 3J7HA 2A3BA 4W7VA 1NWSA 3U5UA 1BGGA 3BGAA 2EJ1A 2DSKA 2VO5A 2DH3A 2VTFA 1XCXA 1VAHA 3RM8A 2CBIA 4DUWA 2AAAA 5F7UA 1OSEA 2D3NA 1JYNA 1LF1A 3DECA 1MW0A 2E8YA 4D1JA 3AQUA 3ARZA 2G3IA 2QHAA 5A2AA 1XH2A 2VJXA 3WF2A 1E6QM 1UH4A 2BXYA 3U57A 1R85A 2UY3A 4QLKA 4FLOA 3L2MA 3TA9A 2GJPA 1EHAA 5FCZA 1V02A 4JCMA 4P8VA 3WNOA 1H49A 4MB3A 3L4VA 2CHNA 1CXIA 4DUVA 5BXPA 1E5JA 3VGDA 1WNOA 1C90A 1V6XA 4AC1X 4LYRA 1BPLB 1OGGA 1UA3A 5GPRA 3W6LA 2CERA 1JGIA 3M46A 3THDA 4HU0A 2W92A 2YA2A 4U3AA 4UNIA 3MUY1 1NOWA 3VDBA 3OZPA 2ESCA 2VCCA 5ABEA 2CKSA 1A3HA 2IUZA 1ZBVA 1HP4A 5JBFA 1XGZA 1QW8A 4J3UA 4E8CA 4QCFA 3WKZA 1W2PA 3OB8A 4W93A 1MWOA 4WSJA 4A3YA 3MANA 3QR3A 4D6CA 3IANA 4M56A 5KZ6A 3CPUA 4HMEA 1Q6FA 2MANA 3N17A 4RE4A 1E15A 4UFLA 2V3DA 2GFTA 1J0ZA 1I1WA 1E6PA 4JZ5A 3ARQA 4AZ7A 7TAAA 2BY0A 1XYFA 1HKIA 1J0KA 5M03A 5JIPA 1IZJA 3AICA 3CZ8A 2WVVB 1V3KA 3ARTA 1ZB5A 1U33A 1K6AA 1CNVA 3BAYA 5I5RA 2FGZA 3UESA 4M8UA 1JZ2A 5M17A 1BAGA 2OLHA 3WL0A 2YL5A 3RJYA 4J3VA 3OA5A 5CPTA 3QGVA 2QF8A 1CGWA 3CZJA 2XFYA 4FLSA 3SCUA 1LLOA 4RL3A 2X0HA 3W26A 3CZKA 2W5FA 5E6YA 4QLJA 1JF5A 1GVIA 1W91A 3UR7A 1E0VA 1UD4A 2DT3A 4IM4A 1CYGA 1VENA 3WDPP 4AD1A 3O9NA 1W3HA 2BVDA 3UG5A 3ZSSA 1WB0A 2BVYA 2WCGA 4JFVA 1Q6EA 4AISA 1B1YA 1LG2A 1HIZA 4OUEA 3B9DA 1DEDA 1VIWA 4PCTA 3WNPA 3PZUA 5D9MA 4D6IA 1PIGA 4JL1A 1FA2A 2XIBA 1WDRA 1RPKA 1QNPA 3MKKA 3T2PA 5A69A 1XSJA 1KBKA 4ACYA 2EPMX 3F5JA 1W1TA 1DWJM 2CESA 4HP5A 2WKLA 4DWSC 1NOFA 1TE1A 3N13A 1E6ZA 1UKPA 2TAAA 1ZU8A 1PBGA 3T2QA 3APGA 4DM1A 2VX6A 2OYLA 5AC5A 4M80A 3WH5A 1G01A 1C8XA 4D6JA 3VO0A 4TX8A 4BQ2A 4CN1A 4PMOA 2WZEA 4HPGA 1US3A 3W27A 2W61A 1BTCA 4PMDA 3OBAA 1E4IA 5D8WA 1KXVA 1W1YA 2XWDA 1HXJA 1VEMA 2ZUVA 1CTNA 2J25A 4MPKA 2WPGA 1W9DM 4M82A 2E8ZA 2PBOA 3W6MA 3AMCA 1WZLA 2WMJA 6CGTA 4Z2KA 3RIKA 1B3ZA 4JKLA 1I1XA 4J3WA 3SUVA 1JZ7A 1JG9A 3BSHA 2CYGA 1DTUA 2XTKA 4N0RA 5EFDA 5I77A 3SUWA 1BVZA 2EPNA 2QMJA 5D8ZA 3W81A 3CGTA 2J7BA 1JZ6A 3A4WA 1MYRA 1YHTA 3WENA 5I2UA 4MDPA 1W3JA 5LA0A 1K9EA 4LX4A 2VC9A 3TTOA 1NWUA 4MNKA 4JFSA 2DT2A 2YL9A 1UR0A 2J7GA 3VIHA 1MW2A 1E3XA 2JIWA 3S2CA 1C8QA 1ODZA 3WDHA 3AZSA 3THCA 2D1ZA 3ZMRA 1C7SA 1V6WA 1OWQA 3EDFA 3MU7A 2ZUWA 2ZX6A 3W25A 5A3HA 2F61A 4E8DA 4H2CA 5A6KA 2Y4SA 2J47A 3HN3A 1H3GA 3VIPA 1UKOA 1E6XM 2QMKA 1W3KA 3GNOA 3NJ3A 2V5CA 4U33A 3ZR6A 4AIUA 1EHNA 1BYCA 2AOSA 1J18A 2BS9A 3ZJ6A 3BLKA 3AIQA 1G9HA 3OZOA 4UZUA 1V03A 3MO4A 1GCYA 6A3HA 2Y8VA 4QFUA 2VQUA 4R5EA 1W9BM 5AY7A 4NRRA 3KL3A 3B9AA 1KXHA 1V3JA 1BLIA 1CXLA 2BVTA 2OSWA 2WVVA 3VGEA 4D6HA 1XSIA 1BGAA 4AD3A 3CHFA 2XYLA 3WIJA 1C3FA 1ZL1A 3N15A 3WF4A 3K46A 3ARPA 5IHRA 2J8GA 3SUTA 4KMQA 4EE9A 4UQBA 3N1AA 4J3SA 4A4AA 3W4RA 3UCQA 4J28A 3WD2A 4QCEA 1CEOA 2XWEA 1UQYA 1H4PA 2W91A 2J4GA 1JAKA 3CO4A 3EDJA 3FAWA 4W84A 4B3KA 1JFHA 1L8NA 3AHYA 3KEHA 4Q7NA 1JL8A 2A3HA 1VRXA 4BQ3A 3CIVA 1HVQA 3I3EA 5C71A 2CBVA 4RE2A 1OINA 1L0PA 2ZIDA 4C90A 3AS1A 4B15A 1US2A 2J7CA 3BCFA 2J8FA 1F4HA 5ABFB 5BXRA 5HPCA 4HTYA 3AJ7A 3OIHA 3RMEA 4L4PA 4MAVA 3L4TA 4JIEA 3SCOA 3CHCA 3WEOA 3WNKA 3WD0A 3DYOA 4W7UA 4P7QA 1QOXA 1HT6A 5FL1A 5C70A 1AVAA 5JBEA 1XCWA 5BYWA 4TVUA 3T0DA 3A3HA 4D6GA 4UFMA 1UKTA 1NARA 1JYWA 2WMKA 1ZBKA 2CKRA 4UOJA 1VF8A 4JKKA 4PN2A 1VBUA 3E1F1 5A2CA 3RJXA 4FMVA 1PJ9A 1MQPA 4OZOA 4H04A 1EO7A 5I79A 1J0IA 1E5NA 5TD4A 1S46A 4LXFA 3GH4A 1UZ4A 3DC0A 2V38A 3CUIA 4AYSA 1FOBA 3CZLA 1WAWA 2J7HA 1V6UA 1O6IA 2NW0A 3WMCA 2GJRA 3B8SA 3GDBA 4AZ6A 3ZJ7A 3WDIA 3T2OA 2EPLX 3LPOA 2DH2A 5JIWA 1GQJA 5I0DA 3N9KA 2GDUA 2VX5A 4W88A 4EK7A 2QPUA 3BLPX 1TFVA 1KGWA 3GH5A 5GNYA 3HU7A 3LPGA 4IPLA 2XFRA 1UOKA 1XC6A 1E55A 4CD5A 4HA1A 2E3ZA 4MDOA 1QHZA 4FLQA 1CXHA 2WAGA 3WNNA 1ISXA 4LQ1A 5ECUA 3MMDA 4D6DA 1JD7A 2XGIA 3W29A 1V6YA 3AMKA 4CGTA 3VIMA 1QPKA 2F8QA 1OT2A 3ALFA 4GIAA 2VRJA 1FH7A 1QI3A 3MMUA 1UHVA 2D2OA 1V3IA 2BV9A 1M01A 5M5DA 3K4DA 4HPHA 1GQKA 1SR0A 1UWIA 1MFUA 3WF1A 2CBUA 2O92A 4B9ZA 3VD5A 4M29A 4HOWA 1GZJA 4MJ2A 2CHOA 3AMLA 2VR5A 2PF0A 1UD5A 1CGYA 4XX6A 3CZEA 3VILA 1KR1A 2WMGA 3GBEA 1OIMA 3WQVA 4HOZA 5CQ1A 2D0HA 4W86A 2OSXA 1E56A 5AYBA 3SCNA 2OYKA 4HOXA 3QHNA 4PUEA 1UA7A 2J7DA 4J27A 3O6AA 4U31A 4D72A 3BAXA 3UEQA 5I3DA 4B3LA 4PUDA 4FK9A 3WY1A 3WQ4A 4PEEA 2ZUTA 1HKMA 2XGBA 1EH9A 4Y7EA 1C8YA 4P7LA 3HJEA 1WZAA 1RP8A 2JE8A 1QVBA 2DSVA 3DHUA 4GO9A 2BHZA 1FFQA 2BY2A 3TP4A 2PC8A 1B9ZA 1FHDA 1QNQA 1V6VA 4M1RA 3A6OA 1B0IA 1UWTA 5ABFA 2C8NA 4WLCA 1UD6A 3SCPA 4GZIA 3GBDA 3WUBA 1EQCA 4QDMA 1QHOA 5A6MA 4MNJA 5ABGA 4TX6A 3WEZA 1HJQA 3ZIZA 3I3DA 7CGTA 2DDXA 1BYAA 2F2HA 3GNRA 5FKYA 2XVKA 2ZUNA 2J77A 3TOPA 1J0JA 1UWSA 2EXOA 3QHOA 1PAMA 4HZ8A 3NIYA 4ML4A 1C7TA 4CUCA 2XG9A 3PTKA 4HU8A 1JXKA 4XUYA 4AWEA 4D1IA 1V0NA 4W85A 9CGTA 3VIFA 5ABHA 1QNSA 1Y7VA 3T0AA 1QI2A 4CN4A 1NH6A 4L4OA 4AIEA 4KRUA 1OCQA 3W38A 2WCSA 3BAJA 2WSKA 3AZRA 1XH0A 2WHKA 3L4WA 1KGUA 1AQHA 3FAXA 3VVGA 3IJ8A 1UD2A 5A1AA 1CECA 4Z2GA 1B3YA 1JZ8A 2WMIB 4U5IA 2WM0A 2JIEA 1LJYA 2BXZA 4W8AA 2WZHA 4H8UA 2WHLA 2YLAA 4EAMA 1W32A 3L4YA 3RDKA 4JHZA 4ZXLA 3GYCA 2FH6A 1DWFM 5A6LA 2BHYA 1XV8A 3ARXA 4CU6A 5E09A 3EMQA 4U2YA 1ZBCA 4UQEA 1PX3A 2NT1A 3IJ7A 1J0HA 3SUSA 2DPEA 3PZQA 1UWUA 2PWHA 2Q8XA 4HZ6A 2WSPA 1LL4A 3PTMA 1JYXA 2W63A 1P6WA 4AMCA 4HA3A 1TVNA 4P7NA 3MSGA 1JIBA 5AYIA 2IXUA 1NQ6A 3D3AA 4PMZA 5CJ5A 1Q6GA 3AISA 4FLRA 4V2XA 1ISZA 4WJXA 1JI1A 4V27A 1JZ4A 3W37A 3EDDA 3GH7A 4UQAA 3VPLA 2O9TA 1JDDA 4P7OA 1WDQA 3HMCA 3WD1A 2HVMA 1E43A 1MQRA 5EB8A 5GQBA 2CNCA 2OWXA 1J0YA 4PTVA 3SCTA 2YL8A 2VZTA 5I78A 4D71A 3LPPA 1CLVA 4LGXA 1V0KA 3AYSA 3AIWA 4WKHA 2YBUA 4U3CA 2Y2WA 4LYQA 3U7VA 1VJZA 1CENA 4AD0A 1QNRA 3ZR5A 3QHMA 4GINA 1J10A 1GNXA 4OKDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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