2W62A

Saccharomyces cerevisiae gas2p in complex with laminaripentaose
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
461
structure length
436
Chain Sequence
SFEKTPAIKIVGNKFFDSESGEQFFIKGIAYQLQRSGAFETSYIDALADPKICLRDIPFLKMLGVNTLRVYAIDPTKSHDICMEALSAEGMYVLLDLSEPDISINRENPSWDVHIFERYKSVIDAMSSFPNLLGYFAGNEVTNDHTNTFASPFVKAAIRDAKEYISHSNHRKIPVGYSTNDDAMTRDNLARYFVCGDVKADFYGINMYEWCGYSTYGTSGYRERTKEFEGYPIPVFFSEFGCNLVRPRPFTEVSALYGNKMSSVWSGGLAYMYFEEENEYGVVKINDNDGVDILPDFKNLKKEFAKADPKGITEEEYLTESVECPHIAVGVWEANEKLPETPDRSKCACLDEILPCEIVPFGKYEEYFSYLCSKVDCSDILANGKTGEYGEFSDCSVEQKLSLQLSKLYCKIGANDRHCPLNDKNVYFNLESLQPC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular Mechanisms of Yeast Cell Wall Glucan Remodeling.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLYCOLIPID-ANCHORED SURFACE PROTEIN 2
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 162
structure length 436
sequence length 461
ec nomenclature ec 2.4.1.-:
pdb deposition date 2008-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03198 Glyco_hydro_72 Glucanosyltransferase
A PF07983 X8 X8 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.1040 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 2w62A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2w62A01
3NJ3A 5M03A 3VDBA 2YA1A 5A8NA 4UFJA 5AC5A 1CGUA 1UH2A 4HZ7A 1V3MA 2VRKA 4PMVA 4J3XA 2DH3A 1UR8A 3BAYA 3PZMA 1VB9A 4AIEA 2DT3A 2YA0A 5A8PA 5HPCA 4GXPA 3L4XA 3ZIZA 3W37A 3ZT6A 2WLZA 1ESWA 1H49A 1NP0A 4GO8A 2WCAA 2BHZA 5IXEA 4F8XA 1B1YA 4PN2A 1V3LA 1VEPA 1JL8A 1UQYA 1HF6A 4AD2A 2QMKA 5A6KA 2XWDA 2XM1A 5D4YA 1WKYA 3AMDA 4LYRA 4LYQA 2WSKA 1X1NA 2DGAA 2W5FA 2D22A 3BCDA 3MMDA 3MUAA 1C8QA 3WUBA 1OINA 1IV8A 3MSGA 2B31A 2WC3A 1E6QM 4PYSA 3SCQA 4X0NA 2F2HA 4Z2JA 4Y7EA 4LPCA 4GIAA 3WNOA 6TAAA 3IAQA 1M03A 5E09A 5CZKA 3VILA 2GJXA 4PMNA 3CUJA 2JE8A 1PJ9A 2DH2A 1BYAA 1GQKA 2WMJA 3GTNA 4M81A 1V0MA 1UZ4A 3L4WA 1HIZA 3AS1A 1JG9A 4JHOA 1CGYA 3WEMA 1KQZA 1QW9A 4E2OA 2D3NA 4FLRA 4HU8A 1K9FA 1MFVA 4N42A 2EO7A 3VIJA 4JFUA 1H5VA 1WNOA 4OZOA 3WL1A 3WNNA 4UFKA 3AQUA 1GJUA 2J8FA 3RJYA 1KB3A 2XSAA 4MDOA 1TMQA 1PAMA 4DM2A 2JIEA 2VR5A 3MMWA 3RM9A 3WQ5A 1US2A 5BXTA 2ZX8A 1EXPA 3AHZA 2W66A 1B3YA 3L2MA 4M29A 4JHZA 4H8UA 5A3HA 4EE9A 4MAVA 1BYDA 4NF7A 2XVKA 3KL5A 5ABHA 3W27A 3W53A 2IUZA 4KGLA 4QCFA 1Q6EA 5CSYA 1CGVA 4AIUA 1AQMA 1FP9A 2VJXA 3BMWA 4PTMA 1BF2A 1E4MM 5IHSA 1EOMA 2D1ZA 3BAKA 4GINA 3RM4A 5ABFB 3CZJA 2XSBA 1GOQA 1MYRA 3N12A 2V5CA 3ZJ7A 3D5HA 1VBRA 2YL6A 1LJYA 5HOSA 1JFHA 4M8UA 4TTUA 3U7VA 5BXSA 1NOWA 1B3ZA 1FHDA 1W2PA 2GJPA 3W0KA 5KEZA 3N9KA 1ZL1A 1X6LA 4ZXLA 3SEPA 3AXIA 2X1IA 3GH7A 5FL0A 3VIGA 3TTQA 4GKLA 1XH0A 5C71A 2ESCA 1V6XA 1SYTA 1UWUA 3ARWA 1J10A 4FLSA 1MW1A 1TVNA 1V3IA 1NWRA 3CTTA 1BGGA 2EPOA 3BH4A 1OGBA 1HVXA 4C7GA 1UD3A 1I75A 2ZXBA 4HOZA 1EHNA 1HP5A 1VFMA 2FHFA 3N18A 5HBFA 4Z2KA 1H11A 4ZE4A 5GPRA 1O6IA 4JFSA 2GSJA 1HKJA 4GPNA 3BC9A 4D71A 3IJ9A 1UR9A 1LF1A 1C91A 2GDUA 1CLXA 1W3HA 2OYMA 4PSPA 3WD2A 3BSGA 1RPKA 3AXHA 3WD3A 1XH2A 3GDBA 4BQ2A 3AYSA 4F79A 4M80A 5AYIA 1UD8A 1PIGA 2WCGA 4YN5A 4MTVA 4HA4A 1V08A 4MNKA 1C93A 2OLHA 1CGTA 1GJWA 2TAAA 2V5DA 1FFQA 4GI8A 1R7OA 3ZJ6A 1ZJAA 3CBWA 1GVYA 4BA0A 3VM7A 1XD0A 1KBKA 2EXOA 4RL3A 4P8XA 5I78A 5CPSA 2Y4SA 1B3WA 1JZ2A 1QI0A 3PZIA 3N17A 4D6IA 4ZENA 2XVGA 4MNJA 4NZCA 1JD7A 4CD4A 1G01A 5LA2A 3MU7A 1MXGA 1KR1A 4KMQA 3RIKA 3VIOA 4WLCA 5FIPA 3AZTA 4W84A 1HXJA 3AHVA 4BCEA 1TZ7A 1GHSA 4W5ZA 1CTNA 5BYWA 3UESA 5IDIA 4UFHA 5BROA 4URIA 3U5UA 1J0IA 1JZ3A 1XHGA 3TTYA 3LPOA 1VFFA 2J77A 5M3WA 2WKLA 3VIIA 3VDCA 2C8NA 1XSKA 4W89A 2VC9A 1W9UA 5DMYA 1QNRA 1E70M 2NW0A 2VX4A 1E3ZA 2XFFA 2VX6A 1DEDA 1BG9A 1XD1A 2CNCA 3CPUA 3WELA 3RO8A 1UZ1A 4FLQA 1VJZA 3AS3A 1V0NA 3LPFA 4ATLA 4MNLA 3NSXA 4Q22A 4S3KA 4JIEA 2WKGA 1W9BM 3VM5A 3AS0A 2PBOA 2F61A 1E6RA 4RE4A 4W5UA 3POHA 5GNXA 4D6EA 2JF7A 2RGLA 2ZICA 1BQCA 2OYKA 1W9VA 2AMGA 2O92A 4EKJA 1VRXA 1WPCA 4ML4A 2JFEX 3CHCA 3MUY1 5I3DA 2J75A 4GZJA 2E0PA 4LXFA 4TX6A 4J7RA 2ZOXA 4HP5A 2UY5A 2ZX7A 5ABGA 2ZUWA 3WDRA 4JFVA 5BXPA 1U30A 4D6DA 1MXDA 3VGBA 2YL8A 1BVZA 5AYBA 4TXEA 1XRVA 2WVSA 1E6SM 4U3CA 2ZX6A 3BLKA 3W25A 2D24A 1WZKA 2ZWZA 2X8RA 1D2KA 2A3CA 1UR1A 4H04A 4IM4A 3AISA 4ATDA 3S6TA 1W1YA 4UOJA 1LWHA 3PZOA 3N15A 1SMDA 1XYZA 2WBKA 4HA3A 1DWIM 4PUEA 4UCFA 2BY2A 1JF5A 1TE1A 4BS0A 4W7UA 3OLIA 4AW7A 1BFNA 3IAPA 2WVVB 4KRTA 3CZEA 3RDKA 3WQ8A 5JBEA 4UZSA 1RD6A 4TTGA 1B9ZA 3GXDA 3SIMA 1UD2A 3ECQA 3NCOA 3BMVA 3SCSA 4R5EA 4D6JA 4D6FA 1OD8A 3OLGA 5A6AA 4ATWA 1HJVA 3SUWA 4HOWA 3NDYA 3TONA 3L4YA 1XH1A 2EPMX 2PB1A 4PRWA 1D3CA 3ARVA 3WBAA 4DUVA 2BY3A 4U5KA 3O6AA 2QF8A 3WQ6A 2ZUNA 3ZMRA 2ZUVA 4YHGA 2G3JA 1KWGA 5E70A 1C90A 1VEOA 2YA2A 4P7LA 2UY3A 1EO5A 4UNIA 3VOCA 4AEEA 3II1A 2DSVA 2WZHA 4MJ2A 2HISA 5JUVA 5I6SA 3F5KA 4KWUA 1PX4A 2XG9A 1KXHA 2ZXQA 1DWFM 4OOUA 2QPUA 1M7XA 2BV9A 3ZR5A 2WHKA 1IZJA 2JF6A 1US3A 3OG2A 1RP8A 2VURA 4XV0A 1WCGA 3EDEA 1PZ3A 3HMCA 3GBEA 5E9AA 5AC4A 1HNYA 3AJ7A 4OBRA 2VCBA 1PX3A 2VOTA 1BPLB 2XJ7A 3AIUA 2WZIA 3WD4A 2X05A 1OT1A 2F8QA 2IXUA 2WNWA 3GH4A 1JD9A 1E6ZA 1B2YA 2FH8A 3K8KA 1TFVA 5M5DA 3U5YA 2W63A 1QNOA 3ARTA 2CERA 2VCAA 2XM2A 3KEHA 1EA9C 5DF0A 2FHBA 3A4AA 4QP0A 3PZQA 3VNYA 4QDMA 1Z32X 3GNRA 1K9EA 3O2LA 1KGUA 1H0IA 2YL9A 4PMUA 1UR4A 2DIJA 2DSWA 3CHFA 2J7BA 3OBAA 1OGSA 1EHAA 3AFBA 1V6YA 4CN4A 1XGZA 4UFMA 3CZLA 3GNPA 2VTFA 3SUVA 2ZE0A 3EBVA 4HPHA 3AIWA 2O9PA 2WYSA 1GQLA 1LG1A 1UQZA 3ARRA 4XZBA 3ARYA 1HL9A 3M07A 2XHYA 2PWHA 3WQ4A 2GK1A 1B31A 2G8ZA 1CXLA 1BYCA 1NOUA 4FF5A 1L0PA 1J0ZA 2D23A 4CKQA 4LQ1A 3ARZA 1E56A 3W26A 1HL8A 2CPUA 1SFSA 5BRPA 1XYFA 4W85A 2C7FA 2QMJA 3ZJKA 3WH7A 2XVLA 1QNPA 2ZXAA 4UQDA 3WEZA 2BNJA 2D0HA 3CGTA 3WDPP 2J7EA 3PTMA 2VMFA 2YLLA 1HX0A 1AVAA 3PTKA 3KZSA 5A6BD 5BWFA 2V3EA 2VZOA 2VR4A 4P7NA 1EDGA 2Y2WA 3J7HA 1VF8A 2W91A 4QCEA 1QNSA 3CUGA 3OZPA 5I24A 1GHRA 3SURA 2ZUMA 1QI3A 4AZIA 1V02A 3WQVA 4W86A 3MUIA 1ZJBA 4ACZA 3OIHA 1TA3A 2VX5A 1ISVA 3MV01 3WEOA 4W8LA 4WKFA 3THDA 1NWUA 2E8ZA 2G41A 3PHAA 1KXQA 1GOOA 2UY2A 2ZUTA 2XIIA 5A6SA 4HMDA 4H8VA 1CYGA 3DYPA 4BQ4A 4GI9A 2J4GA 4YHEA 3VGGA 2CYGA 3O9NA 3TOPA 3VIHA 1E5NA 4R27A 4PMDA 4AZ5A 4DM1A 1GQIA 1D7FA 4MB5A 5F7UA 1JDDA 2CBJA 1UOKA 2VVNA 2VZSA 2WC4A 2YBUA 4TUFA 1KWKA 4GZIA 3FAWA 4PMQA 7A3HA 6CGTA 3F5JA 2YJQA 1Q6CA 1C7SA 3GXIA 2Q8XA 1GUVA 3SUTA 3FHQA 1JYXA 3AXXA 4LGXA 2OWWA 4Z2IA 2E9BA 2VRQA 3L4TA 3OGVA 3MKKA 4DWSC 1EDTA 1E4LA 2W67A 1E1EA 1WZLA 4PCSA 4F9DA 3W82A 3D3AA 1LL4A 1XSJA 4IISA 2NT1A 2FHCA 4B15A 4AD3A 5FL1A 1NWTA 4CD8A 4D6HA 3KWXA 4BF7A 3GZAA 3K46A 3FY1A 1UKTA 4L4OA 1BVNP 1ITXA 2BVTA 1LL6A 4DWSA 2X09A 3K8MA 1H1NA 4CD6A 5A69A 2PWDA 4AC1X 3WDIA 5ECUA 2BHYA 1MWOA 3CHEA 3AOFA 3WUEA 3CZ8A 4TVDA 1UH4A 3BSHA 4W8BA 4EAMA 3WNMA 2J47A 1VENA 1EO7A 3FHAA 1Q4NX 1JXJA 4TVUA 4JCLA 3VPLA 1LL7A 7TAAA 1PEZA 3PZ9A 1R87A 5I5RA 1E72M 1JFXA 2GJRA 1PBGA 4PMXA 1NWSA 1JNEA 1RH9A 3PZTA 1DWAM 1X6NA 5M17A 3AROA 5A6LA 3ZO9A 2Y24A 2O9RA 1E3XA 3BCFA 2WWCA 1N82A 2NT0A 3AI0A 3RPMA 4GI6A 1W9PA 3W38A 4UQEA 1ECEA 5JBDA 1V03A 3AHXA 4DWSD 1GOKA 4D1JA 1VJSA 1GOMA 3AIBA 4MPKA 1J0KA 1WDRA 2WMHA 4AISA 5JIPA 3B9AA 3WKZA 1CENA 3I3DA 2ZX9A 1H3GA 2MANA 2VL4A 2DPEA 2EEXA 3F5LA 2VVSA 1WDSA 1J0JA 2WBGA 3DHUA 1RP9A 1VBUA 3CLWA 1EIBA 1H0GA 2BS9A 2XUCA 3SCRA 3WMSA 4MDPA 3WF1A 3A4WA 4NRSA 3UETA 4B3LA 3IJ7A 3ZJ8A 3ZQ9A 4J3VA 3ZR6A 2JEPA 3FAXA 4Z2LA 4D6CA 4XUYA 3UR8A 1OSEA 3WL0A 1UYQA 2WVUA 3WBEA 5CJ5A 4W7WA 1CNVA 3A47A 2UWFA 4AZCB 3L4UA 4PTVA 5CPQA 2J7HA 3WNPA 3NUKA 1HN1A 1V3JA 3W28A 4A3HA 4QLJA 4WSKA 4HTYA 3VVGA 3BXWA 1KQYA 5D9MA 5A8OA 4HMEA 1H41A 2G3MA 3WMBA 2JALA 4LYPA 4Q7NA 3PZVA 1ZBKA 1LLOA 1A3HA 4PMYA 1FH7A 1MW2A 4UTFA 3TP4A 1V6UA 2UY4A 2QV4A 4PMRA 2XYLA 3CO4A 2J78A 1V3HA 2WHMA 4GQQA 4ACYA 4N0RA 2CHNA 3SCVA 2XGIA 5HPOA 2VI0A 5A2CA 1UG6A 1W91A 3PN8A 3B8SA 1W9XA 4D1IA 5A1AA 2GFTA 3WF4A 4QLKA 4E8DA 2DDXA 4J3WA 3DC0A 3M6DA 1W1VA 4AEFA 5A8QA 1W3LA 4AZHA 2QLYA 2ZX5A 5DFAA 2E3ZA 5EBAA 5DT5A 4M1RA 3RMEA 4WIWA 1QOXA 4FK9A 2YOCA 5ABFA 1C92A 4F66A 4B9ZA 4MJ4A 4NI3A 2GDVA 3E1F1 1IT0A 5D9PA 1F4HA 1TVPA 1V0KA 3IJ8A 2Z1KA 4M56A 1QHPA 1NOFA 4U33A 4PTXA 3WUFA 4PEEA 4PUDA 1JIBA 2ZXDA 3T0BA 2XGBA 4C7FA 1W9DM 2WMIB 2WK2A 4W8AA 1P6WA 1FHLA 3AMKA 4AMCA 4P7OA 3N04A 1JDCA 2ZUUA 3WMCA 5CGTA 4AD4A 1M53A 2AAAA 4WSJA 3WY1A 3M46A 1K6AA 2V3FA 4GO9A 1FFRA 3THCA 1GONA 1GNXA 2DEPA 1CECA 1WDPA 1NARA 5EMYA 2D0FA 3ARXA 3GXFA 1C7TA 2WHJA 4WK9A 5KZ6A 3VIMA 5BCAA 1JI1A 2OWCA 4GQRA 1JNDA 1W32A 2DT1A 4AZ7A 1C3FA 3GH5A 4LX4A 5A6JA 3VMNA 3SCTA 1GW1A 5FOOA 3K4DA 1BAGA 1HT6A 2E40A 1JZ8A 3WD0A 2WW5A 5EFFA 4WKHA 3RM8A 2EPKX 2G3IA 1M04A 4OKDA 4UQCA 4XX6A 4H41A 1WP6A 3AHYA 1JYWA 4PSRA 2EJ1A 3WIJA 4BZYA 4E8CA 2E9MA 3K1DA 4WKAA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5C2X A;  3RRA A;  3VIJ A;  1H5V A;  2REQ B;  1EPX A;  1WNO A;  4JTS A;  2QCD B;  2YCI X;  1ZJI A;  3H2M A;  4OZO A;  1DHP A;  3W7D A;  3WL1 A;  4V1A v;  1GJU A;  5JRC A;  2J8F A;  3GDK A;  3RJY A;  1TMQ A;  1PAM A;  3CQH A;  4DM2 A;  3MMW A;  3WQ5 A;  4HHH A;  3AXJ A;  5BXT A;  1EXP A;  2ZZ3 A;  3AHZ A;  3U6W A;  4B91 A;  4EP8 C;  1CCW B;  5K2Z A;  2ISW A;  2XVK A;  3KL5 A;  4O4W A;  5TQL A;  4WUI A;  3JCF A;  4QR6 A;  3W75 A;  4QCF A;  3L67 A;  4AIU A;  2X0L B;  4O13 A;  3BMW A;  4PTM A;  5HYA A;  1BF2 A;  4HN8 A;  3ONX A;  3DBN A;  5CCZ A;  4YJ2 E;  5IHS A;  2JPF A;  1KO0 A;  5FXZ A;  2PDK A;  3CZJ A;  3M0V A;  2P9B A;  2V30 A;  1MYR A;  3CEP A;  4OK0 A;  1NEK A;  4AXP A;  2LM9 A;  3BZJ A;  3IJD A;  4M8U A;  3E9A A;  3DXI A;  3LLX A;  5BXS A;  4GGB A;  1NOW A;  1B3Z A;  2GJP A;  2Y62 A;  3N34 A;  4ZXL A;  3AXI A;  6ENL A;  3FLU A;  3CT2 A;  3L3P A;  5FL0 A;  2V6A A;  3GH7 A;  3VIG A;  3TTQ A;  3CQK A;  1XH0 A;  1R3W A;  3FJL A;  3TAO A;  5I07 A;  3CQI A;  4NL1 A;  1V6X A;  1SYT A;  1XKY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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